4YZNA

Humanized roco4 bound to compound 19
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
274
structure length
269
Chain Sequence
PTLADNEIEYEKQIGKGGFGLVHKGRLVKDKSVVAIKSLILETEMIEKFQEFQREVFIMSNLNHPNIVKLYGLMHNPPRMVMELVPCGDLYHRLLDKAHPIKWSVKLRLMLDIALGIEYMQNQNPPIVHRDLRSPNILLQSLDENAPVCAKVADFGLSQQSVHSVSGLLGNFQWMAPETIGAEEESYTEKADTYSFAMILYTILTGEGPFDEYSYGKIKFINMIREEGLRPTIPEDCPPRLRNVIELCWSGDPKKRPHFSYIVKELSEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Probable serine/threonine-protein kinase roco4
publication title Structural Characterization of LRRK2 Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Dictyostelium discoideum
total genus 84
structure length 269
sequence length 274
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4yznA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4yznA01
1OKZA 2GS7A 4UMUA 5BVKA 4NU1A 2HXQA 4R78A 3RNIA 1H1WA 4FV4A 5IF1A 5JGBA 3ZLWA 2WTIA 2PVHA 1PKDA 5JT2A 4GVAA 3H0YA 3GNIB 1QCFA 4G3EA 4QT1A 3IDPA 4YGAA 2VWVA 1PJKA 1Q61A 4H05A 5G1XA 2Z02A 2CGUA 1YHWA 1ZYSA 3BX5A 4QOXA 4IW0A 3QX2A 5HG9A 3G0EA 2PE0A 3ZXZA 3FYJX 3HV3A 4GVJA 2VU3A 3F2NA 5CTPA 5CYIA 3VBWA 5AP0A 2BROA 4GL9A 4BVUA 3BPRA 4GU6A 4EOQA 3I81A 2FYSA 2G2IA 4TYJA 4XRJA 3KCKA 4JRNA 3QD4A 4NZWB 2UW6A 4JL9A 4YPDA 4YHTA 3TUBA 2GCDA 2NPQA 3PPKA 5EW9A 4ZZNA 3NLBA 5CAPA 1KE7A 3R2BA 5CSVA 4BZOA 4F9WA 2W1DA 5AAFA 4ZEGA 4ASDA 5CU0A 4KS7A 4KIKB 2X39A 4YSMA 5BYLA 3PE1A 4ZIMA 3P9JA 4HYIA 5AUVA 1WBTA 3S1HA 2RKUA 3F2RA 2HWPA 2HENA 4AF3A 2J4ZA 3PUPA 4UYAA 1YHVA 3TM0A 2IVTA 5JMSA 1YDTE 3BWJA 2HZ4A 3F2AA 5TE0A 4C7TA 2PPQA 1PXIA 4C0TA 5E7RA 4C36A 1YI4A 2V7AA 2W1CA 3W1FA 1YOMA 2W05A 5K4IA 4PL5A 2W4JA 4D2RA 5CEIA 3JPVA 5ANJA 4XG8A 3TDWA 1H26A 4RFMA 2R3NA 3OWKA 1W7HA 4DCAA 3KC3A 1H27A 4ZOGA 1KV2A 4RFZA 3ORIA 3HV4A 4TT7A 5M55A 3RNYA 3Q9XA 3GCUA 3OWJA 4YZNA 3SW7A 2VTSA 5FD2A 2RFNA 3F69A 3HL7A 4Y95A 3UBDA 3DKCA 5CVGA 4A9YA 1DAYA 4NYEA 1GAGA 4F9CA 1YXUA 2GSFA 5IQBA 4CVAA 1H28A 1YXTA 2Y9QA 3GC9A 5CI6A 3MDYA 3UQFA 4PNKA 1I44A 3CGOA 3LLAA 3SV0A 4F64A 2X9EA 3DKOA 3RZFA 2JKKA 3GOPA 4L42A 4ZS4A 2JLDA 3ZS5A 5AADA 4GG5A 3W2OA 4R5SA 4X2GA 5CVHA 1MP8A 5DH3A 1O9UA 3G6GA 4LV5A 5C4KA 4ACCA 2VNWA 4ZZOA 4FT7A 4H39A 5KKRC 5J9ZA 1QPEA 1OL5A 3EYGA 4BCQA 4D2TA 4CKJA 3PLSA 3CD3A 5EYCA 2BTRA 4GH2A 3Q3BA 1R0PA 2JKQA 1GZ8A 2XP2A 4CTCA 4BDHA 4O7TA 3BHYA 3NW7A 5CSWA 3UVRA 3ZDUA 4U0IA 3JYAA 4C61A 1NVSA 3QTWA 5CAOA 1RQQA 3LCTA 4H3PA 4PDYA 3CTHA 5JFVA 2BZJA 4RT7A 4FC0A 4GIHA 5CU4A 3QQLA 4W8EA 4YO4A 1JAMA 2OZAA 4AW2A 4RWKA 3TV6A 3OT3A 4X3JA 1W82A 2W5AA 4YJPA 3NVMB 3NMUF 3O8UA 4NCTC 1XH8A 1A9UA 2W1GA 3R21A 3Q6WA 5J79A 3DLSA 3FZRA 3RGFA 5CAUA 2C3LA 5FG8A 3P7CA 4ZLZA 4JQEA 2AC3A 3UYSA 4BTMA 3O17A 5E8YA 4Y72A 5EHYA 4EOKA 1LPUA 5HESA 4X7QA 3PJ2A 4I22A 3TNHA 1UU3A 4IB5A 4C4IA 2VX0A 5M07A 4WNKA 3QCQA 2VD5A 2ZM4A 4I93A 3QD2B 3F3WA 4FMQA 3LFCA 4RWLA 1NXKA 3FAAA 2ACXA 2CHLA 5HQ0A 4FKQA 3QCYA 2VTJA 3HNGA 3L8SA 4ZSLA 4JNWA 3NPCA 4LGGA 5B2KA 1IAJA 2B9IA 4AOTA 3DTCA 1TQPA 3SRVB 2BFXA 2ITYA 2JFMA 4G16A 4ENXA 5BVDA 1PXPA 2JITA 3FDNA 1F3MC 3H9FA 4MXAA 3ZSIA 4DGLC 5BVOA 5HE0A 3VO3A 4JR3A 5IU2A 4BWXA 2VO3A 1JQHA 4DFYA 5CVFA 2X9FA 3KMWA 3ORZA 4RJ5A 3TZMA 2UZWE 4Y5QA 2R2PA 4CKIA 3DKGA 4FZ7A 3ZMMA 2PVLA 2ZV2A 5HIDA 3KULA 2QOHA 3UODA 4FV6A 4DGOA 4EONA 5L8KA 3AC5A 2XKCA 2PZYA 3LJ2A 3DNDA 4I5CA 5AMNA 2YCQA 2FGIA 3QKLA 5JFXA 3OEFX 2GMXA 2IW6A 2R3FA 3PWYA 1IEPA 2YM3A 3TNWA 4ARKA 5HX6A 4UZHA 5EOBA 4QP6A 4QMUA 3T3VA 4V0GB 4YZDA 2J2IB 5DT4A 5HOAA 2YDJA 1WBSA 3FMJA 4XJ0A 4TRLA 3NUAA 2BAKA 4ACGA 5CLPA 2JBOA 4G3DA 3ELJA 3FQHA 4N6YA 4DFBA 3ZZWA 4NM3A 5DEYA 3TG1A 3VUKA 2OK1A 3ODZX 4O0TA 4N4SA 3IW4A 3COMA 3SAYA 2R3HA 1VZOA 1XH4A 3C0GA 3F5PA 4YP8A 4E5AX 4QRCA 3AC4A 1NT2A 1WVXA 3OMVA 2QO7A 2AYPA 3PVBA 5HX8A 5L6OA 3DK6A 4AGUA 2JD5A 5DT0A 3NUPA 2H9VA 2ETKA 2BDFA 3ZDIA 5H2UA 1WCCA 5EYMA 3AD6A 4I0SA 2BIYA 3MY0A 3DXNA 5BUJA 4FSWA 3FMMA 4IVCA 1S9IA 2WO6A 4YLKA 1XH6A 3A2CA 3BCEA 3V5PA 3DJ7A 3W55A 5LVLA 5GIPE 3FY2A 3Q9YA 5J5SA 5L2QA 5FXRA 2HY0A 5AUZA 5FTGA 2G2FA 3HUBA 2B9JA 4MQ1A 4JVGA 3SKCA 3OOMA 1XBCA 4C34A 4YJQA 1Q8TA 4M0ZA 3F88A 3OP5A 5A46A 5GNKA 2GNHA 2ITXA 4QMVA 3ZH8A 2PUUA 2H8HA 2ZOQA 5HTIA 3L9MA 2PUIA 3BHHA 5CU3A 1U54B 4LG4A 4YZMA 5B7VA 1J7UA 3GT8A 4UMRA 4HPTE 2OJ9A 4QMQA 1U59A 1JNKA 3NYNA 4AAAA 2RGPA 3BEAA 2HAKA 3QL8A 4TW9A 3TNPC 3R1QA 3FMDA 4CFXA 3LFNA 5IQAA 2O8YA 3LJ1A 3DNEA 3QU0A 4X3FC 3B2TA 4PNIA 5L2SA 5IA0A 4G3GA 4O0RA 4D9TA 4ANBA 1U46A 4U8ZA 4AFEA 4LYNA 4BCMA 3BYMA 5HNBA 2OXYA 4M12A 1ND4A 4BKZA 3W16A 5EK7A 4DINA 4G9RA 4FV3A 2A4LA 4HCUA 3KMMA 3UOLA 4K1BA 5FEEA 2W1HA 3A8WA 3CY2A 4XH6A 3VF9A 1W8CA 3O71A 5AV0A 3FV8A 4RIYA 3PVWA 5TO8A 3KY2A 3O51A 1PXNA 5EM6A 5CZIA 4AGCA 3AT4A 4EH6A 3EMGA 3ZO2A 2Y4IC 4ANMA 2KTYA 2WNTA 4AU8A 3LPBA 3S3IA 4FSQA 3DJ6A 4MD9E 4UX9A 5K9IA 1H07A 3ZEWA 4EOOA 2YM7A 3PYYA 5LVMA 4GG7A 1HCKA 5DR6A 4WHZA 2YDIA 3W8QA 2W1EA 3EQCA 4XNEA 1AQ1A 1MRUA 2GS2A 4RC2A 4BCFA 3GBZA 3SG8A 3DBDA 4FIFA 4YZ9A 4FI1A 1B39A 2YIWA 2CN8A 1XBAA 2PWLA 2OU7A 2QOCA 5HG5A 3RK9A 3VJNA 2OH4A 3VUMA 5HE2A 4IC8A 2X8EA 3TN8A 2QURA 4E26A 3TIYA 2IPXA 4O38A 3WBLA 3DAEA 5CXZA 2JIVA 4JIAA 1XR1A 4DLIA 1VYZA 2PE1A 4FKSA 2F57A 4K6ZA 4BI2A 1URWA 3I79A 2BRHA 4YJSA 2X8DA 3EH9A 4M13A 3LLTA 1PF8A 4MF1A 3NGAA 5EDRA 5ACKA 2EWAA 2XIRA 2EU9A 3OXIA 4M67A 4AA5A 2CSNA 2IVSA 3UG2A 2RFEA 4PPAA 2OJFE 3D94A 5K0KA 1FOTA 4CT2A 2C5NA 3P1AA 3D2KA 5AP3A 5HE3A 4EZ3A 1FPUA 4C3PA 2XRUA 3DK3A 3DLZA 2JIUA 4NM5A 5CT0A 4YJTA 4CZUA 5AX3A 3TCPA 3TT0A 3MA6A 4C8BA 5HTBA 3SGCA 3VS6A 5IDNA 4CMUA 1Q41A 3C13A 2V7OA 4IM2A 5LMBA 3DB8A 1U5RA 3AC1A 4J1RA 3C5UA 1FVVA 3C0IA 5AR2A 2QU5A 3MH2A 4KNBA 1ZRZA 5BNJA 4XG9A 2BZIB 3FXZA 3IK3A 1WFCA 2YIRA 3JY0A 3DCVA 2F7ZE 5H8GA 3BGQA 1W98A 2XIKA 4EKLA 3TUDA 1J7IA 3SHEA 3DQWA 4KIQA 4A07A 1FVRA 4IAFA 4XG6A 5I9YA 3R01A 3MTFA 4MAOA 2W1ZA 2VTOA 2X4FA 5AV3A 3ZFMA 2XNMA 4OT5A 1JLUE 2ZV7A 3JVSA 3QQFA 5GHVA 5EYDA 1WBPA 4HVDA 3ZC6A 5ETFA 4AE9A 3QA8A 2XIZA 2JC6A 4TY1A 4OTPA 3EN9A 2C5VA 2ZB1A 5LQFA 4NCTA 5CS6A 4EUTA 4BDKA 4MX9A 1H1PA 1YVJA 4TWOA 2RG5A 4CZTA 4ZY4A 4BHNA 3SDJA 1PYXA 3HX4A 3THBA 3FC2A 4IAZA 5AR4A 1RW8A 4OUCA 4OTRA 4IACA 4CFVA 3I7CA 3G51A 5BVWA 3I6WA 4IXPA 5J87A 3W10A 4W8DA 3RJCA 1GJOA 4I1ZA 4J52A 4LL0A 5AP4A 3U6JA 2UW0A 3OF0A 2XM8A 3OFMA 1DM2A 3F7ZA 4EBVA 3OOGA 4GK3A 2GQRA 3A4PA 2UV2A 4N70A 3F3UA 3NUUA 4NWMA 1M2PA 3SD0A 3KVXA 2OSCA 3FJQE 4L3PA 3KCFA 5D11A 4E8AA 3FMEA 4CMOA 3DTWA 4K18A 4WD5A 5HCXA 2X4ZA 2PVMA 3U54A 4O6EA 1UV5A 2OIDA 2XUUA 1KWPA 4UZDA 1UKIA 2W99B 4GS6A 4H1JA 3OG7A 3F6XA 3KK8A 3QHRA 5FWKK 5HBHA 1SVHA 3V51A 1LP4A 3C4XA 3MPAA 4KAOA 4FTJA 4A7CA 2OF4A 2RSVA 2O3PA 1TQIA 3CCNA 1OM1A 4KBAA 4DEDA 3LFFA 3F3ZA 4FR4A 4NW6A 4O7RA 1GIHA 1ZOGA 5CSHA 5AWMA 4EK8A 3BWFA 4FSRA 5IUIA 4L8MA 3EFKA 2I40A 2VTMA 3A61A 3EN5A 5IH4A 3ZSGA 3P78A 2OF2A 5EOLA 3ZO3A 3AMAA 3MFTA 3TV7A 4QP7A 4FIHA 3D0EA 2R9SA 3NAYA 3EZVA 4BFMA 1UA2A 4C57A 4R3RA 4LRJA 3VW6A 3GU4A 3PRIA 4GV1A 4IM0A 1BYGA 1URCA 4G6LA 4K2RA 2J7TA 3WF7A 3VBTA 3BBTB 4C4JA 3TL8A 4GK2A 4BI0A 4F7SA 2YJRA 5T68A 2DQ7X 5JGDA 4D5KA 3CTQA 3MY1A 2CCHA 2GTNA 4TYGA 5AV1A 5I3RA 5L6PA 4AS0A 1IA9A 3QC4A 2Z7QA 5JEBA 1DI8A 3PJ1A 1J1CA 4EJNA 1H01A 2X2KA 3EN6A 4HNIA 4RMZA 4EOIA 4CQEA 3EHAA 5T6KA 4R7BA 4DFUA 2Y4PA 4GT5A 2E9UA 4EQCA 3U6HA 4EHZA 4QTCA 1PRYA 3UVPA 5GJDA 4QYFA 1H00A 4B8MA 1YOJA 3C4WA 3KRJA 2J0LA 1H1RA 3CTJA 3V5LA 4KKHA 1P4FA 1WBNA 4IADA 4JBPA 4BGGA 5C26A 2ITUA 4F0GA 5CENA 4RSSA 4RVLA 3W2SA 4BL1A 1Y6BA 5B2LA 2VWXA 3EQFA 4UV0A 4BWPA 1V1KA 3EOCA 3JVRA 3FHIA 4IAYA 3BI6A 4MK0A 5A4QA 4I20A 2VO6A 4AW1A 2QC6A 5CANA 3DGKA 4AXAA 4IIRA 2QG7A 2WTKC 3G6HA 4O6LA 2QD9A 1JBPE 5HLNA 1WZYA 2B55A 4I0TA 2VAGA 4A4OA 2GPHA 4UWBA 3MESA 4WSYA 4LRMA 1H08A 2VWZA 3F5XA 1P4OA 4GRBA 3A4OX 3HA6A 2VNYA 3FEGA 3VRYA 3RAIA 1RJBA 3QQJA 4CMTA 4OLIA 3UOJA 2E9NA 3RKBA 4OTIA 3U9NA 5HIBA 1VYWA 2PSQA 4D9UA 4CYIA 2FSMX 4P7EA 3QRIA 5AP6A 2G2HA 4YC3A 1UNHA 2YCSA 4WNMA 4WUNA 1IA8A 4NKSA 4F6UA 4X3FA 4RQKA 2RFDA 4RRVA 5BX0A 2OG8A 1NVQA 3DKFA 5HU3A 3Q6UA 4L52A 4NK9A 4QMXA 4DA5A 3LXKA 4AX8A 3UIMA 2BPMA 3FXWA 4C4HA 3LFSA 4CG9A 4FIIA 3WIKA 4ZJIA 2UW3A 5E4HA 1BKXA 2GTMA 2QODA 2QR7A 2OIQA 2UUEA 4FSMA 4QQCA 4BIEA 3EZRA 4IC7A 4RX5A 3BV2A 3EFWA 4GMYA 5EM5A 1YXSA 3HMPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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