4Z0JA

F96s/s73a double mutant of plasmodium falciparum triosephosphate isomerase
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
247
structure length
244
Chain Sequence
ARKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGAYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHSERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Connecting Active-Site Loop Conformations and Catalysis in Triosephosphate Isomerase: Insights from a Rare Variation at Residue 96 in the Plasmodial Enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 94
structure length 244
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4z0jA00
4MIMA 1LBLA 3S5YA 1KM6A 5FF7A 1JCYA 3F4WA 3O05A 1Q45A 2HTMA 3MP4A 3M5YA 1ICPA 3LGEA 3TSBA 5HNRA 2R91A 2OT0A 1TJRA 4NVTA 1XFBA 5HWJA 3LRKA 1LLZA 3TA6A 4O28A 5EKYA 2WSRA 4M19A 2JGYA 1PHWA 1L6SA 2GVLA 2VFGA 4TMBA 1BKSA 1SSGA 4AF0B 4KFPA 2TMDA 3P80A 4IGHA 4FO4A 3N9RA 3LXBA 3W71A 5KZEA 2FIQA 2VFDA 4JNMA 2C13A 3LHUA 3IGUA 1A5AA 3L5MA 4IMGA 4BK9A 3O6YX 4FX8A 2NWRA 3QQ1A 5FI8A 4GWEA 1EA0A 3EKZA 4HHPA 1RQEA 3M9YA 3NA8A 4MYXA 1ME8A 2QR6A 1T96A 3LTSA 1TSIA 1WX0A 1IXPA 1IXNA 5FESA 3G0XA 3SR7A 2B4GA 3KRSA 4Y9AA 4NNBA 5G1TA 1KLYA 3DENA 3P81A 1H1ZA 3M1ZA 3BGGA 2A85A 2I1OA 4Z08A 2A2IA 3PBWA 2HMCA 4NUWA 1QPQA 4CCDA 3L0GA 2UV8G 4GRSA 5F4SA 3UPBA 4QITA 5ABTA 1LOQA 4LOCA 5FEPA 4JX4A 2X1RA 4WY0A 2CZEA 3HG4A 5EYWA 5AHLA 3DBPA 4A3UA 4WJEA 1R47A 5EPDA 3UD6A 1VS1A 4IMDA 1VZWA 3O8AA 3HF3A 2QDGA 4DBEA 3BG3A 5D2VA 1FCQA 1FDYA 3EXSA 1I2OA 4MJZA 4UFKA 3DH7A 2W6RA 5EBUA 1DVJA 4WX2A 3LHZA 1XL9A 2O7SA 3MW7A 4I7UA 4NU7A 4E38A 1W3TA 3NQ7A 3O63A 1MXSA 1OVDA 2NUWA 1EUNA 1ZY9A 3DU0A 2C19A 3UWWA 5G4EA 3TC7A 1YTEA 2NUXA 3WK3A 1SUXA 2Z6JA 3MBFA 4GXMA 1A53A 2EF9A 2QCMA 3GR8A 1XDLA 4AXKA 1LDCA 1UJPA 1TTQA 2G95A 2RDUA 3LDVA 1DQXA 2XN1A 4LWWA 5BNKA 2YSWA 3MHUA 3IEBA 1KFLA 3ZWTA 3FKKA 1GT8A 1RPXA 4DO5A 4S1FA 3WJXA 2WV8A 2X1UA 2ALDA 3O6CA 4I7WA 2QCHA 4QSHA 1WYIA 3TW6A 1W37A 3KX6A 2W0UA 3T40A 2H90A 3CHVA 4NNCA 3KXQA 2H8XA 3T44A 3VCRA 2RHGA 3BVJA 3TFCA 3FOKA 2ZA1A 3I7RA 2JGQA 3EWWA 1TPFA 2NV1A 3BG5A 2QCDB 3CIXA 3NQGA 3TQKA 4BWLA 3SIZA 4CQ8A 4ZZ9A 5G2IA 1DQWA 1XXXA 1KFEA 2GVGA 3O1NA 1LBFA 3ABRA 1H7WA 4GFSA 3TXZA 4Q33A 1RQHA 5AB3A 1YDNA 1XBZA 4ZL1A 3LXCA 3SSJA 3MYPA 4DBDA 1AL8A 3GZ3A 3C2VA 2YW3A 5CSSA 5H91A 1YDOA 1OX4B 1I2RA 1GZGA 3B04A 2E6DA 2ZRWA 2V2CA 4I9AA 4ADTA 1TPUA 1JRBA 3FS2A 5C6MA 2DZUA 1NF7A 1TTJA 4IOTA 2VFFA 2C14A 3DAQA 1T99A 1G67A 3RMJA 4XKYA 1R30A 4UFLA 3N14A 3JRKA 5LHFA 2QUVA 2Y7DA 4WUIA 1XC4A 4N9BA 1D3GA 1QPOA 5H2ZA 3HG3A 3MUXA 1FDZA 2Q3RA 3VE7A 3NNTA 2VXNA 2EGZA 2NWSA 2QJIA 3LCFA 3PUEA 3A5VA 3OHIA 4GBUA 1OK4A 3HGOA 2NLIA 1XUUA 3LHWA 3U6WA 5LSMA 2QDHA 2CLOA 1H61A 4AWUA 3DFNA 1H1YA 4L4MA 1NAL1 2IQTA 1W0MA 1X1OA 3GIYA 2GJNA 1L9WA 1F2JA 1ICSA 3I68A 3G1FA 4BFAA 4GE8A 3TSMA 2XN2A 2QKFA 4LC8A 1LOLA 4P2VA 3L67A 3IVSA 2Y89A 5FF4A 4S2BA 1ZENA 3CWNA 4NNAA 2VENA 2Y62A 5LNSA 4U4MA 3HPZA 4ORIA 4XTIA 4K39A 3F4NA 3GX9A 3SY5A 2VEKA 3L21A 1AW5A 4I7VA 3NQ8A 1TQJA 1G7UA 4ZQRA 3TKFA 5I3FA 3QQ0A 2C6QA 1SPQA 4DF0A 4H4IA 1F74A 2A7RA 3PC0A 4B5NA 2C16A 1S5WA 3G8EA 1TREA 2Q3OA 3N19B 5AYZA 3NXFA 1UCWA 1TQXA 3M5XA 4UTHA 3NPUA 4OWGA 4O17A 3SFKA 4K8HA 4MKNA 3JS3A 1KFCA 3PBUA 4O0KA 5DY3A 5HQEA 1DBTA 3W1AA 2YGYA 3TFXA 1FWTA 1SU5A 1R2RA 1YPIA 1KTBA 3QW4B 1QWGA 1CI1A 1TPWA 2GJLA 4NT0A 1H5YA 2B7QA 1SO4A 5D04C 3OVPA 4WXYA 2YZRA 1EEPA 3N2MA 2JKAA 4N9DA 3PY2A 2AAMA 2CLIA 4FNUA 4ZQMA 2Y88A 4AHPA 4IPJA 1QR7A 2G5WA 4POCA 1WBJA 3NZRA 3MHFA 3Q2DA 1T8XA 1H51A 5TIMA 1VHNA 2BZNA 3P60A 1S5TA 3G1VA 3C8FA 1JUKA 1H50A 1TIMA 3S8HA 4IMCA 4IQLA 5KINA 5KSWA 3W7EA 4QNEA 3E49A 4UUIA 3E96A 3R8RA 2F7FA 4YL2A 3W1TA 4DEFA 4E2DA 3ABSA 2EKCA 2QCGA 4M7SA 3W1QA 3INPA 2E6AA 3EXTA 5CPLA 3S1UA 2ZA2A 3EX6A 3WJZA 1TPC1 2HS6A 3ANYA 2H8ZA 3EEGA 3WJWA 3O07A 1QDSA 3UXAA 1VYRA 2WQPA 3IGXA 2YYUA 3PM6A 5LGXA 1H7NA 1O4UA 3ATYA 3PF3A 5AYXA 1OYAA 1HUVA 2A0NA 4IJBA 5K7JA 4TIMA 4RZ5A 4RXFA 2V0TA 2CLKA 3B06A 1OFBA 4O11A 3WJSA 4M6QA 3SECA 3CEUA 2BLEA 5LNVA 5HWMA 5F4WA 1P5BA 2VEPA 2ZRVA 3QRHA 4FEZA 1OX6A 2PRHA 4JYEA 3M5VA 3P8IA 3P7YA 2V82A 2A1YA 5I3JA 2P1FA 3W9ZA 5AFDA 1GWJA 1GYNA 3M6YA 4O10A 3MI6A 3QW3A 5K9DA 2QCDA 4FXRA 4JIPA 4Z1AA 2BXVA 3T78A 2PRLA 1LORA 3PSWA 3NL3A 3GNNA 4N6FA 3H54A 3LRLA 4JS3A 3HGSA 2DZSA 3CEPA 4JTJA 1G4EA 2JKPA 1QPRA 4BWLC 3LCGA 1GYLA 1SZFA 4TX9A 1YADA 3WFAA 4O8RA 3S0CA 2TSYA 2AGKA 1OX4A 5FF3A 1HTIA 4MPQA 3TJXA 1U83A 3KOFA 3NEVA 1DL3A 2QJHA 3TDFA 4EF8A 3S5NA 2H3BA 3M5ZA 2DORA 4UCGA 3KHJA 4NZJA 3BW3A 5AC8A 3S1VA 3EKLA 5LHEA 3TNOA 4LTSA 1ICQA 2OZ0A 4RXGA 4IX2A 1JCLA 2ZZ1A 3TQ0A 3LLFA 1J4EA 3WK0A 3G1XA 1C9DA 1I2NA 3A22A 1SSDA 1ZALA 3LHYA 3THAA 2BSLA 3NYZA 3C52A 3BPWA 5DCBA 4N02A 3F03K 5I3HA 3S6DA 1WBHA 3W1UA 2A4AA 3TCEA 1F76A 3YPIA 3L9CA 4OU1A 5E1QA 5HR7A 3LBCA 4JTSA 2TRSA 2DZVA 4K7VA 3W2KA 3W2JA 3QPYA 4G1KA 2ZA3A 1M5WA 2ABBA 3VFLA 1ONRA 3GDLA 2R94A 4FHAA 2I14A 4HT3A 4QAIA 1NF0A 3W7PA 3S1XA 2Y61A 1KM3A 5D2TA 3NOEA 5E93A 3UQNA 4FNTA 3NM1A 3W70A 3EWZA 3SJ3A 4O57A 1FWSA 5K9XA 1G4SA 2CLHA 4N2YA 3EXRA 3T4CA 1Z41A 3QF0A 3NQVA 3N3MA 1B57A 3W7MA 1EP2A 3NQ6A 4NQ1A 3D0CA 4UIOA 3LCHA 1JCJA 3T55A 4O19A 1EWEA 2FPYA 2HSAA 4FNSA 4RZ6A 3V1PA 1QOQA 1LM1A 5BRBA 4O53A 1YTKA 1LLWA 2I9EA 3BLEA 1NEYA 4O54A 2RKXA 1B9BA 4ADUA 1KFKA 3HG5A 3Q94A 3C6CA 2TPSA 1VH7A 3MWAA 4HIBA 1OYBA 1X6UA 1XM3A 5AC7A 1SQ7A 1OYCA 3P82A 3S5OA 3S5ZA 3FYPA 3LTPA 5FEXA 5DY2A 2WJZA 4WZHA 2GOUA 2ZZ7A 3ELFA 3G0UA 1GPWA 2BX7A 4X3ZA 4IUOA 2OX1A 1K3UA 2ZRXA 3RF9A 4AVFA 2GVJA 5FF0A 5I3KA 1NVMA 5DLCA 1XKYA 3MHGA 5CZ0A 5AC6A 3LB0A 1TV8A 4UTWA 1KM4A 2HS8A 3L68A 3PG8A 2YYTA 5CZJA 1QO2A 3GAYA 3PBYA 4AHQA 2E5DA 3QZEA 2D73A 1SO3A 3NQDA 1W3IA 4DXVA 4LVAA 2CZFA 4IPIA 1SO6A 2YFOA 4MOZA 2OMAA 4Z0SA 4AAJA 3A5FA 1LYXA 2DZPA 1XCFA 4DO4A 3TROA 3B0PA 1T0OA 2ATMA 5TBOA 3GYEA 3C2OA 3W1PA 3LCWA 5K2ZA 3LHVA 5LNWA 1UASA 3CWOX 5EL1A 3H55A 2WO5A 1K7EA 4NXKA 1FCBA 3OVQA 4A2SA 2XN0A 2E6FA 2NX1A 4LC6A 3TU9A 3MI3A 1C8VA 3NM3A 4K7YA 3C56A 4BI5A 5TQLA 1L6WA 3NL5A 3IIVA 2R8WA 1WQ5A 4LVFA 2QCEA 1ML1A 3NQMA 2CWNA 2ISSA 4Q32A 3NZ1A 2Z1BA 4K6AA 2VFEA 2X1SA 1KTNA 4UTJA 3ABOA 4O1BA 3LCIA 4XBKA 2NXIA 3W2LA 4A21A 4H6KA 1SFLA 4QM1A 4AWSA 4IMFA 2Y70A 3Q37A 1ZCOA 1DJQA 1CW2A 1GVQA 5DXXA 4ZQOA 2X30A 1K7XA 4OQVA 1HFBA 3V75A 2H6RA 2NX9A 3RLVA 3TW7A 4BR1A 3NPXA 4JX5A 5HULA 1ME9A 1QOPA 2EHHA 2J88A 2ZRUA 3C61A 2ATSA 2Y7EA 4UR8A 4UTLA 1N7KA 5I3IA 3DXIA 2FLIA 5T26A 3N9SA 3A9IA 3M0ZA 1AL7A 1XBYA 1GEQA 4KFNA 2YFNA 1IIHA 3P67A 4MY8A 3TR2A 3IRDA 3W7OA 5HR6A 1VPXA 3DZ1A 3UY8A 1LCOA 3PUOA 4AMAA 4UNLA 5AHMA 3L5LA 3G22A 3L66A 1BWKA 3VKJA 4W9TA 1F7BA 1OHLA 5BW6A 3JR2A 2J27A 3W72A 2Y7FA 1WAUA 3EX1A 3KRZA 1PHQA 4ZQPA 2QUTA 4FNPA 3LV6A 2V5LA 1VHCA 4GNJA 4ZQNA 3I6RA 1A5BA 4JICA 1F73A 1DORA 2Z2UA 3NQ2A 1MEIA 2LLEA 1A50A 1OFAA 1K8YA 3BK0A 3S1WA 4YXGA 2ZDRA 4HNTA 4O15A 5FEZA 5J5RA 3R89A 4K38A 2J24A 5CKSA 3BW2A 3FKRA 1JR1A 1SZEA 2YR1A 4BI6A 4HPXA 3DFPA 5EA9A 5KZDA 4FB7A 2ABAA 3QSTA 3EWBX 3ZFHA 4JGDA 4JY8A 1AK5A 3N2XA 4NJJA 3ATZA 3EX4A 2WSYA 5GVJA 3TH6A 1THFD 5E0KA 3B4UA 3MMTA 1JQVA 2FPVA 3U8GA 4DF2A 1UUMA 1FX6A 2E5CA 4M7TA 3NG3A 1W1ZA 2CFFA 4DO6A 5AN7A 4WOZA 2RH9A 1W5NA 1VJIA 3W1MA 1D3HA 3HOJA 4IXHA 2A6NA 1RD5A 3B05A 2WNNA 4UR7A 4OE7A 1A5CA 4CQAA 5HWNA 2Z0IA 3IGSA 4OV9A 3TAOA 1X7FA 2CZ5A 5AHNA 4JTUA 4AF0A 3L0NA 3W2NA 1RQBA 1VYSX 5D05A 1R2TA 2V30A 4UFJA 3QPZA 3BO9A 1WA3A 2OJPA 3W22A 6ALDA 4YLWA 2E68A 1Q6QA 1FWWA 5CZTA 3ZR4A 4RR4A 4EIVA 1HO4A 1R2SA 3KVJA 1W5PA 3TIMA 2WNQA 3NL6A 5C2XA 1XDMA 2V2HA 2C1HA 4JDBA 4FXSA 3SGUA 3PBVA 1MEHA 3R5EA 1GG0A 3M47A 3PWAA 5CSRA 1KM0A 3LLDA 2VOMA 1YXCA 4K37A 4RZ4A 3A21A 3W7CA 4LVBA 3NGJA 4UTUA 1SZNA 4AH7A 1MZHA 5D32A 5AHIA 1SZGA 3TC6A 1GVFA 1F6KA 2V81A 1G69A 3USBA 4O4VA 3C0JA 3TMLA 1DJNA 3W7GA 1FDJA 1O95A 3E9AA 5C54A 1Y0EA 4XZ9A 3C4UA 3W88A 1OFRA 3OG3A 2O7QA 2A7NA 2PC4A 4JTGA 1OJXA 3UXDA 1ALDA 2EAWA 3PSVA 4DQWA 4M6VA 4UTMA 2PRMA 4IMEA 5F2IA 1ZAHA 4Y6GA 3IVUA 5AYYA 1IGSA 2CLFA 4PEKA 3NDOA 2VKZG 4UTWC 1OF6A 1TV7A 2NXGA 1QAPA 4L4LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3BZJ A;  3S5Y A;  5FF7 A;  3UXK A;  4D8A A;  3M5Y A;  3QTG A;  1ICP A;  3SCN A;  3IAC A;  3VGF A;  3ANU A;  3TSB A;  2R91 A;  1XFB A;  5HWJ A;  2YXO A;  4O28 A;  2QDD A;  1WO2 A;  3MSD A;  2GVL A;  3CPU A;  4TMB A;  4XK2 A;  2FJU B;  4HK5 A;  4LUS A;  1BFN A;  1EDG A;  4FO4 A;  5FOO A;  2E7F A;  3TC3 A;  1CLK A;  4KPL A;  1DIE A;  2VFD A;  3WH6 A;  1E5N A;  4NI3 A;  3L5M A;  3AIR A;  3W24 A;  5I0D A;  3O6Y X;  3AU2 A;  3B9D A;  5I79 A;  2X09 A;  4CD5 A;  2XSA A;  4C65 A;  2WZM A;  3QGA C;  2NVA A;  1U30 A;  1EZW A;  1Q66 A;  1RQE A;  3VM7 A;  1A0C A;  1IXP A;  3A9B A;  1IXN A;  3WLN A;  4H2H A;  1YX1 A;  3QHM A;  5CXP A;  4Y9A A;  3BCD A;  2OO0 A;  3ONC A;  4EP8 C;  1ZTV A;  1H0G A;  3BDK A;  2BVD A;  3P81 A;  2BS9 A;  3JVA A;  1BG9 A;  1D8W A;  2A85 A;  3GY1 A;  2A2I A;  1W3K A;  4NUW A;  1TE1 A;  2CIP A;  1MDR A;  1AUS L;  2QT3 A;  4QIT A;  1LOQ A;  1JAE A;  3S6O A;  2RAG A;  2XVL A;  4O1E A;  2FZN A;  4A8I A;  2CC0 A;  5M03 A;  4GCX A;  5AHL A;  3GZA A;  3VOG A;  4WJE A;  4BY3 A;  5EPD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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