4Z2LA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 33
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2lA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2lA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2lA01
1Q6GA 2XTKA 1JF5A 1Q6DA 2J8GA 5CZKA 2DT0A 1LLOA 1B31A 3DHUA 3ARZA 1V6XA 2Y24A 1FH8A 1I1XA 4F66A 2C7FA 2GK1A 5BCAA 1R7AA 4UFHA 1H11A 2RGLA 1DWAM 2PBGA 2XIIA 2W61A 4CD8A 4PMOA 3A3HA 1KR0A 1V3KA 1UZ1A 4CVWA 2W67A 4FLSA 2EPMX 5GNZA 3RPMA 1AMYA 4PTVA 3VD4A 1UR0A 4F79A 1UQZA 1GHSA 4TTUA 1US2A 1K9FA 3QOMA 5A8PA 2J7DA 4W7WA 1ODUA 1YQ2A 1Q4NX 3SIMA 4W7UA 3WQ4A 1XGZA 5D4YA 4DUWA 2GJXB 3OA5A 3OB8A 4QDMA 3RJXA 1QI5A 4V28A 1GOMA 3VOCA 4JFUA 4UQCA 1XSJA 4MPKA 3M46A 1BYCA 2OSYA 4GINA 2D1ZA 1HVQA 2WWCA 4KGJA 1CTNA 3AYSA 4AZBA 3W6LA 2Z1SA 3TP4A 2CBVA 2EO7A 1B3VA 2WSPA 3UEQA 1HJWA 4UNIA 2B31A 3N18A 3EMCA 3MMWA 2X0HA 2WZHA 1HKMA 4WSJA 2W66A 2O9OA 2AMGA 1TR1A 5BXPA 2PWEA 1CGVA 4XV0A 1KGUA 1LF1A 3OLEA 1JZ3A 1W3KA 4ZFMA 1GOKA 4OOUA 2WHLA 1TCMA 1MWOA 3FAXA 1CYGA 4J3SA 1WDPA 3DYMA 4XZBA 1E6XM 2WAGA 3QR3A 4HMDA 1VB9A 3DECA 2WMHA 3EYPA 1WP6A 2JALA 2E9BA 5EMYA 1HKIA 1OWQA 3M07A 3MU7A 4IPNB 5TD4A 3WD3A 5JUVA 2ZX8A 1H2JA 5FIPA 4PTMA 2EEXA 3GNPA 4B3LA 1C8YA 3WL1A 2YL6A 2VRKA 2BHUA 1QI2A 1W9VA 2WVVA 1D7FA 2XGIA 1VBUA 1VFMA 2J77A 3FN9A 3L4UA 4CD4A 4H04A 3GTNA 3AMDA 3POCA 3CZJA 1RH9A 3NDZA 4Z2KA 1V0LA 3ARYA 2YDRA 4Z2LA 1W2PA 2BY3A 3OZPA 2DT1A 4LXFA 5HBFA 3F5KA 1XH0A 5A6BA 4QFUA 4P8VA 2YDSA 4ZENA 3CIVA 2X8RA 4AEFA 3VIOA 3O6AA 1P6WA 3VIJA 3TTYA 4MB1A 4PUDA 3AS3A 4GKLA 4CUCA 1TA3A 2ZUMA 3T0AA 1NWRA 4DWSB 4H8UA 1GONA 3T2QA 3WQ5A 1WZKA 1V08A 4N0RA 1GORA 4LYRA 3UG3A 3PZVA 1FH7A 4Y7EA 3FY1A 1F4AA 3M6DA 2PB1A 5DO8A 3CUIA 3B9AA 1X6NA 1C7SA 1XV8A 1EOMA 2YL9A 5D8ZA 4TVDA 1US3A 2OYLA 4PBGA 2PC8A 4BQ2A 1GVIA 1BG4A 4D6HA 4AZHA 4UFKA 1M03A 2WYSA 4P7QA 4UFJA 3WUGA 1HVXA 3WUFA 5LYRA 3VU2A 2AOSA 5EB8A 3NYDA 4LYPA 4AW7A 4Z2JA 2CEQA 4HA4A 3WH9A 1VEPA 1UWIA 3AHZA 1C90A 3BGAA 1FFQA 2ZX7A 5DF0A 3VD5A 3UG5A 2G4FA 2WVUA 3MSDA 1H41A 1EHNA 4TTGA 3PZIA 3RMEA 4HPGA 3OZOA 4AZCA 3B9DA 2E8YA 2CIPA 2DQXA 5JBDA 1E55A 3VD3A 4AZ5A 2VUYA 3N12A 3VIPA 4ATLA 1NP2A 1W3LA 3VGHA 6TAAA 3VVGA 1H0IA 1R87A 4LGXA 3WELA 4U31A 1Z32X 3VKKA 2WHKA 3F5JA 1C8XA 1O6IA 1ECEA 3NSMA 1KBBA 2QV4A 2WKGA 5CQ1A 2J7CA 4D6EA 2XVGA 3L4TA 1U33A 2D3NA 4JHOA 3NUKA 1EH9A 4IPLA 2E40A 1BFNA 3BAJA 4U5IA 1BGGA 3IAQA 4AXNA 2CPUA 4DM1A 4NI3A 1UKPA 3QOKA 2NT1A 2G3IA 1E73M 5A94A 3OBAA 1MQQA 5BRQA 1DTUA 1G1YA 2WMKA 4KMQA 1JF6A 2VOTA 2GJXA 3A47A 5EFFA 1H1NA 2ZXAA 1B0IA 2E3ZA 1GUVA 1RD6A 1QHOA 2WXDM 3OGVA 1UYQA 1VFOA 1NOFA 1XSIA 4U3CA 5I3DA 3IJ8A 1PEZA 2GVYA 1CLXA 1AIWA 3ECQA 2CETA 5M3WA 2W91A 4B9ZA 3M7SA 1V3LA 1UUQA 1BVZA 3T09A 1NARA 1LJYA 4U33A 3WNPA 1HP5A 4WSKA 4ACZB 1TFVA 1ESWA 2G3MA 1KFWA 4CD5A 1VENA 5GPRA 3SCQA 3L4VA 3PBGA 2ZIDA 4M81A 4JIEA 5LA2A 4PMRA 5C8BB 5FL1A 2UY3A 1VBRA 1UD8A 2PWHA 2YA2A 4ML4A 5CPTA 3ARUA 4CN1A 5CG0A 4XB3A 4XZWA 2J74A 1FP8A 4CCCA 4JFWA 2WSKA 4D72A 3WMBA 4ZEPA 4MAZA 5BWFA 1WE5A 2CNCA 4W84A 2ZX5A 2O9RA 1KQYA 4FLQA 2VRQA 1V3HA 1XH1A 3AFBA 1GJUA 2G8ZA 4HA3A 1Q6FA 1W1VA 1VF8A 3U7BA 3FHAA 3WFLA 4EANA 5A8QA 1Q6CA 4RL3A 4CCDA 1A3HA 1FHLA 2WLZA 2DT2A 1J10A 2YKKA 1V03A 1EDQA 3A4WA 3GNOA 4BA0A 2WBKA 3SCUA 3CMJA 4H8VA 1XHGA 5ECUA 1CWYA 3VGGA 1UH2A 3VIIA 4J3VA 5A6KA 2G3JA 1JZ5A 1B1YA 2EPLX 2WM0A 1QNSA 1KXQA 2FGZA 6A3HA 1UWTA 1PX4A 4HOZA 1UKTA 4KRUA 1V6VA 2A3HA 1E6RA 3G6MA 2CITA 2EPOA 4MNKA 2CBIA 2ZOXA 2E0PA 1JD7A 3ZT5A 3WQWA 1E56A 1BPLB 4Z2IA 4JZ5A 1G0CA 1MW2A 1MVYA 1UR4A 1JNEA 2VCCA 2XUCA 5D9NA 1JI2A 1CPUA 2WHJA 4JKMA 4JKLA 4DWSA 1EXPA 3WNMA 2VZUA 1HKJA 2J7FA 1M01A 1J0ZA 3MSGA 2PBOA 4HOXA 3VIHA 4MTVA 3AS1A 1L8NA 3GYCA 2O92A 4B3KA 3CLWA 2GFTA 4W87A 1TVNA 2WKLA 1CGUA 4GXPA 1IZJA 3L4WA 1KB3A 4DWSC 2J8FA 2O9PA 3OGRA 3ARQA 1YHTA 1JYVA 1QNOA 3EDJA 3BMVA 4X9YA 3VIGA 3OLDA 1HT6A 2G3NA 3PZGA 5I23A 2DT3A 2OSXA 1XCXA 1W9PA 3AS2A 1G94A 3GBEA 2ZUVA 4PRWA 1EA9C 1GCYA 1ZJBA 2OWWA 1W3JA 3PN8A 3OG2A 5I77A 2QLYA 3EDFA 3VGEA 1MYRA 2WLYA 3SUUA 2DGAA 4UQBA 4YHGA 3AQUA 1E4MM 3ZM8A 2DSUA 4GQQA 4U2YA 3S6TA 2VT0A 1QI0A 4OJYA 4WLCA 5KEZA 4HZ7A 4JL2A 9CGTA 4HPHA 1AQMA 1XC6A 4CU6A 1W9BM 4MB4A 4HMEA 1AQ0A 1DP0A 1GOWA 2D0HA 4QP0A 1MQPA 2ZX9A 4C7FA 3W25A 2VX5A 4Q7NA 4JHZA 1KGXA 3CUJA 2GJPA 3MS8A 3W27A 1R8LA 3RCNA 5HXMA 3MV11 4CN4A 3RM4A 4KH2A 2JF6A 3QGVA 5CSUA 3K46A 2MANA 2BVDA 1VIWA 2OWXA 4EAMA 3N15A 1B9ZA 1E6ZA 1U30A 3L4XA 2VVSA 3BH4A 1NQ6A 2VCBA 2CHOA 3L4ZA 3W6MA 1OD0A 1LG2A 4YN5A 2YLLA 1MQRA 2XHYA 1ED7A 1UZ4A 4H8HA 1JYWA 4P8UA 1KCKA 3WNLA 2A3EA 4PSPA 3BAYA 1E5JA 2YL8A 1D3CA 3WUBA 1F4HA 3A4AA 2ZWZA 4P7RA 1JZ2A 3WNOA 1SYTA 4GO9A 2D49A 4D6GA 5CLWA 4MDPA 2VX4A 1PX3A 4AZ6A 7TAAA 4P8WA 3CZLA 5FCZA 1JZ8A 2GDVA 1JD9A 1CXEA 2YA1A 4PMYA 3T0DA 1UD4A 1W2VA 4RE2A 4W86A 3VGFA 3CGTA 2ESCA 2J79A 4AZIA 2WC3A 1EQPA 3EMQA 1QI4A 1XRVA 3WDHA 4BCEA 4PMVA 4KGLA 2WK2A 2BY1A 3CHCA 1XH2A 2DSKA 3OGSA 1E5NA 2J75A 1E3ZA 5D9OA 3THDA 3BAIA 3EDKA 3RM8A 5JBFA 4OZOA 1QPKA 4LYQA 1J0JA 2PWDA 1SMAA 4OBSA 1C3FA 3RDKA 5BXSA 4V2XA 3DYOA 2D0FA 5BROA 2J7HA 2F8QA 3N9KA 3T0BA 3SCNA 4FMVA 1UA7A 5I79A 5FOOA 1KXVA 4OIFA 1V6WA 1ZL1A 3ZJ8A 5BXTA 3BLPX 3GM8A 1UH4A 3W28A 2CESA 4J3TA 4MNLA 4HZ8A 3WEZA 2TAAA 5A6LA 1H09A 2CKSA 3CUHA 1BSIA 4PMQA 1E15A 4J3WA 3WNKA 2BXYA 4AY1A 1E4IA 3WF3A 1CECA 4UOJA 1OT1A 2VZTA 4TX8A 2VMFA 4AIUA 4EKJA 1NOUA 1CGYA 1GHRA 2OLHA 3WMSA 2D3LA 3PZTA 2CERA 3KL0A 1JXJA 3AXIA 2NSXA 3UERA 4YHEA 2OWCA 3PTKA 2J4GA 2YOCA 3VD7A 4MAVA 1L0PA 1E6NA 1WB0A 1MXDA 5AY7A 3D5HA 3ALGA 2D24A 2PF0A 1G5AA 2E8ZA 3ZT6A 1W9DM 4PMDA 4JL1A 4WF7A 4W88A 2WBGA 4GZIA 3BCFA 3SUTA 3SCOA 1NP0A 4E8DA 3BAWA 3FW6A 3AIUA 4HU8A 3W53A 8A3HA 1UWQA 1VEOA 2JIEA 3PZMA 3D3AA 2V5CA 4MJ2A 2W5FA 2QMKA 2GSJA 2BV9A 2J25A 3VPLA 1XD0A 2BVTA 2XSAA 4PMNA 3WEMA 4Z2GA 4ZE5A 3WF0A 1KBKA 1FHDA 3AIBA 4ACYA 3BSHA 1PZ3A 1XSKA 4ZXLA 3U5YA 3UETA 5E9AA 3VDCA 4BQ3A 5D8WA 5DT5A 2CBJA 1BVNP 2WWDA 5JBEA 1K6AA 1M7XA 2BXZA 3N1AA 1GQJA 4V27A 4M24A 5F7UA 4Q22A 2WB5A 4HP5A 5FL0A 1GQLA 3EBVA 2ZUUA 1MXGA 4W8AA 3U5UA 2WMFA 2O9TA 4MNJA 1B30A 1NWSA 1CGTA 3MO4A 2GDUA 1JL8A 1A47A 5M03A 4MJ4A 1SMDA 5GNXA 1M53A 2VCAA 3AISA 2EJ1A 3PTQA 3GBDA 4UCFA 1JYNA 2FHCA 1ISVA 1XCWA 4D71A 1Y7VA 3ALFA 3IAPA 4TVCA 2VQTA 3PZQA 2JIWA 3VO0A 1PAMA 3ZR5A 1PIFA 2DIEA 3ZT7A 2W63A 4HMCA 3ZMRA 1E6SM 3VNZA 1RP8A 1WDQA 2X2YA 1E3XA 3MUAA 3VINA 1JZ4A 1BG9A 4PTWA 2D22A 3AMLA 3GXMA 5IHRA 1TVPA 1ITXA 1QBAA 2FHBA 4J3XA 3ARVA 2EPNA 2D0GA 4GI9A 3AYRA 4AC1X 3HJEA 4KWUA 3ZJKA 3ZJ7A 1NH6A 3WDQA 1UOKA 3WKZA 3WDPP 1E0VA 2ZUNA 4GPNA 1W32A 1LWHA 3APGA 3A4XA 4KRTA 1W9UA 1I1WA 4UOQA 5A6BD 2J78A 1OINA 2PWGA 1C92A 4MB5A 4IISA 3NCOA 3SCPA 1W1PA 4HTYA 4J28A 1HKKA 3TTSA 1C91A 3NDYA 4UQAA 1HP4A 2V5DA 3AI0A 4P8XA 4HA1A 3SCVA 3DHPA 7CGTA 3SCTA 2JEPA 1E43A 3CPUA 1NOWA 1W3HA 4AZGA 1W1YA 1DWGM 1JIBA 4UOZA 3CUGA 2CXGA 4FLRA 1BYBA 5FD0A 2X05A 1UHVA 3AXHA 1B3WA 3WY1A 5I0DA 3O9NA 2QPSA 3VGBA 5E09A 1HJXA 1VEMA 7A3HA 1WZMA 3SUVA 4M1RA 3WQ8A 5A2CA 3VILA 1ZBCA 1CGXA 1ZBWA 1DEDA 3LPGA 5AC4A 3WFZA 3G6LA 1H0GA 1JDCA 4GIAA 1XYZA 2XIBA 1CEOA 3OLGA 3WF4A 2QPUA 2VJXA 3CZ8A 2WANA 2F61A 3KZSA 3IJ9A 5HNNA 3VD9A 2BFGA 2XWDA 3GNRA 3GXFA 5BYWA 3CH9A 2VI0A 1GNXA 4U5KA 2Y5EA 1J18A 2UY5A 3AIEA 3RM9A 1BQCA 2QMJA 3F4VA 3GZAA 1EO5A 1O7AA 2G41A 2BVYA 1CZ1A 4W93A 5A8OA 2UWFA 3OLIA 4S3JA 1EDGA 2VL4A 4DUVA 2C0HA 2QHAA 4CN6A 1OCQA 4CVUA 1TUXA 2XG9A 4GZEA 1ITCA 3JUGA 4MADA 2V3FA 1AVAA 3WDRA 4AD2A 1UQYA 2WNWA 3AIQA 4C7DA 1BLIA 2WMGA 4WKFA 4WK9A 2A3BA 3WD4A 5LA0A 1EGZA 4AD1A 1E0XA 1TG7A 1UR9A 4WKHA 2WVVB 3VM5A 3NJ3A 3VIMA 4AWEA 1OGBA 4M56A 1ZBVA 3AHXA 4PTXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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