4Z2RA

Crystal strucutre of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
581
structure length
566
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGYPEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 187
structure length 566
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2rA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2rA01
2WPCA 2ZZCA 3GDNA 3NTAA 1NDAA 1Y56A 1GESA 3DJEA 2APGA 5M10A 2VRLA 1LJ1A 2XDOA 1L9EA 3ITJA 4REKA 2FJBA 3DK4A 2YVGA 5KVHA 3VRAA 1XANA 1CHUA 2B9YA 5U63A 2C7GA 3NN6X 2RABA 3FBSA 2JKCA 1NG4A 3P4SA 1E1MA 3PS9A 2R4JA 3LZWA 3UOZA 2GR1A 1COYA 3URHA 1PXAA 2Q6UA 4OPIA 4EMJA 2XLSA 3IWAA 4H4XA 4Z2RA 2BK3A 4BJYA 2C64A 1FL2A 3KA7A 4KPRA 1TDKA 1D4EA 3AD7B 2B9XA 3DJGX 4USRA 1K0JA 2YG3A 3QFAA 5KRQA 3AEAA 2F5ZA 2GR3A 2FJEA 1JEHA 1SEZA 4UDRA 3F8DA 3UTFA 1PHHA 2R9ZA 1GREA 2C65A 3VR9A 5FS8A 3AE7A 2WOVA 3ICSA 1TDEA 1TDNA 3CPJG 2CULA 2DKIA 3UOXA 5HXIA 2GRTA 3AEFA 1DJNA 3AEEA 3L8KA 3NLCA 4N9XA 5GSNA 3AE6A 2R46A 1H6VA 1CL0A 1GRHA 4FK1A 1L9CA 1NPXA 4H4TA 3LADA 1Q1RA 2YM2A 1RP0A 3NHOX 5FS7A 1REOA 2GH5A 1NHRA 3UKPA 2B7SA 1QLBA 5C2TA 1JNRA 4DSGA 2BA9A 1E6EA 2BS4A 2E4GA 3DK8A 4CCQA 4Z25A 2BC0A 3B3RA 1JNZA 3NH3X 2XLRA 1Q1WA 2WU2A 1Y56B 5FS6A 2X99A 1K0LA 3RP8A 3UCLA 1F8WA 3AD9B 1S3EA 4LA1A 4NZHA 2VQBA 4U8PA 2YLZA 1RSGA 2OLOA 2GF3A 5BVAA 2XLUA 3QFBA 3K7MX 5GRTA 3AE1A 3ALMA 3BNMA 2YLTA 1PBCA 1PJ6A 1CC6A 1VG0A 4AOSA 1M64A 5BRTA 1S3BA 3NGCX 4I58A 1X31B 1BWCA 2A8XA 3PO7A 5J60A 1YQ3A 2IVDA 2XFUA 3DH9A 1GRBA 2XVIA 2WP9A 3UKFA 4OPTA 3R9UA 1JRXA 4XXGA 5CKUA 3BI2A 4J57A 2ARDA 2QA2A 4H4RA 4DGKA 1D7YA 2IIDA 2BCGG 1H7WA 3BNUA 4EM4A 3FMWA 3BI5A 1LVLA 2GB0A 2Z5YA 1DOEA 3KD9A 2QA1A 3CIRA 3WE0A 4DSHA 1N1PA 2J3NA 4Z44A 5EOWA 1ONFA 1B5QA 4B1BA 1H81A 4H4YA 4YTMA 3SM8A 1BGJA 4H2NA 1DOBA 2WPEA 1PBFA 1ZMDA 2EQ7A 2GMJA 3BHKA 4YSZA 3OC4A 1O95A 4H4VA 2BC1A 2PHHA 2YLRA 3G5QA 3LB8A 1CJCA 1FCDA 4YSHA 1PJ7A 4A9WA 5IQ1A 1O5WA 1P2HA 2X3NA 2E1MA 1TYPA 4B65A 3CPIG 1DODA 3F8RA 2GV8A 1IUXA 4H4ZA 5FS9A 1K0IA 4J56A 4J33A 2GR0A 5U25A 3UKLA 1YY5A 2EQ6A 1Z6LA 3CNPA 1CBOA 1CC4A 1NEKA 4MJWA 4AP3A 3V3NA 4Z26A 4ECHA 2BK4A 3NRNA 3CNDA 4OPCA 3UP4A 2JB3A 4RG3A 3CGEA 3LZXA 2V60A 3D8XA 4AT2A 2XFOA 3ALLA 2C67A 4K22A 1AOGA 4EM3A 3IC9A 1KDGA 1HYUA 4TM1A 1GXFA 2Q0LA 4H2QA 5HYMA 3IF9A 1BF3A 1YKJA 2WDRA 4U8OA 2R0PA 1Y0PA 3CN8A 2GAHB 3AE3A 1NHQA 1MO9A 2WOWA 1YQ4A 4CY8A 4IA6A 4JNAA 3CGBA 4DNAA 2R0CA 5EB4A 3C4NA 1JU2A 3VR8A 1LV0A 3CGCA 1GPEA 2BABA 2YM1A 2YR6A 3ADAB 3ALJA 3GSIA 5HY5A 3GRSA 1B8SA 1GTEA 1H7XA 1ZP0A 4A65A 2C72A 4D04A 5BULA 2CVJA 1N4VA 1BGNA 1GSNA 1V59A 4M52A 4U8MA 4AOXA 3K7QX 4H2RA 3SFEA 3NK2X 2JB2A 4TM0A 2YVFA 2BS2A 3KVEA 4OVIA 3GDPA 2BACA 3P4PA 4PABA 2BCPA 5JCMA 3S61A 1MXTA 3VQRA 3ZYXA 2TMDA 2JAEA 1GNDA 4NTDA 4AT0A 5L46A 1TYTA 3ABVA 5HHFA 4ZCDA 4O5UA 3II4A 4WCTA 4USQA 1OJAA 2ZZ0A 4EQWA 2ZBWA 4NTCA 4Z2TA 1S2YA 4NEWA 3UTGA 2V61A 3M13A 3UTEA 1W4XA 3AE4A 4JY3A 1D4CA 2BS3A 2YLWA 2C76A 3AD8B 2RGHA 2C3CA 3GWDA 4FDCB 3UP5A 1E39A 5KOXA 3EPTA 3CTYA 3GMBA 3IHGA 1VG9A 3KU9A 4JNQA 1QO8A 1PJ5A 2WHDA 4LIIA 1H84A 2B76A 1CC2A 1TDFA 2OLNA 2JK6A 3GD3A 4APNA 2RGOA 2OALA 3CNTA 2AAQA 4BK1A 2X8GA 4BK2A 1ZOYA 2B9WA 3UTHA 3K7TA 4OCGA 3COXA 2XVHA 3QJ4A 1PBBA 5IPYA 1E1LA 3DMEA 3ICTA 4TM4A 1NAAA 2FBWA 3I3LA 4GDPA 1L9DA 2XLPA 1CJ4A 3EAOA 3H8LA 3DK9A 3BHFA 3FIMB 4E0VA 5JCKA 2YLXA 1KSUA 4Y4MA 4IVOB 4JQ9A 5TR3A 1LQUA 2EQ8A 4B69A 1GRFA 3OZ2A 1KFYA 1ZY8A 4X9NA 2GR2A 2UZZA 2WU5A 1RYIA 3LJPA 2O9ZA 2BXSA 3O0HA 3PVCA 2VOUA 3AEBA 3GYIA 4U8IA 2QAEA 2V3BA 4H50A 3SQPA 1FEBA 2YQUA 5U1OA 1F8RA 1F3PA 4UDQA 4NTEA 2WP5A 2VZ2A 2C73A 2WBAA 1EBDA 4JY2A 1IUUA 2A87A 5KVIA 1GTHA 4H4PA 2GEWA 2WESA 5LV9A 1EL8A 4TLXA 1GERA 1H86A 2E5VA 5KOWA 1ELIA 1UKVG 1PS9A 1GT8A 3SGLA 4CCRA 4JDRA 4C3XA 2XFNA 1D7LA 4A6NB 3REDA 4H7UA 3DA1A 4B66A 3G5SA 2C3DA 4GUVA 4A7AA 4YSYA 3NYCA 2C75A 2TPRA 3GRTA 4U2TA 2YWLA 2IVEA 2Q7VA 4B64A 4XWZA 1PXBA 2YG4A 4YWOA 3VRDB 4U8KA 1NENA 3NT6A 4BURA 4CNKA 3CPHG 1DNCA 2C70A 1F6MA 1JOAA 4U8LA 3KPFA 4GR1A 4H4SA 3IHMA 1Q9IA 3K30A 3P4QA 4TM3A 2PYXA 2V3AA 1XDIA 2GQFA 3DJDA 4YKGA 3G5RA 5ER0A 4YT0A 5BUKA 2YG7A 2WDVA 4J31A 3DJJA 2WP6A 1XHCA 4K5SA 2WETA 3H8IA 1FECA 4Z2UA 4GRTA 1IUSA 3CNJA 2HQMA 3NTDA 5M0ZA 2R45A 1GRGA 2X8HA 5JCLA 4J36A 3AB1A 1OJTA 3AYLA 4A99A 4EMWA 4YTNA 3D1CA 3GWFA 4EQRA 3AYJA 2RGJA 2YR4A 4BJZA 4P9SA 1CJ2A 2EQ9A 4EQXA 3EANA 3RHAA 1H83A 2B7RA 3T37A 1OJCA 4EMIA 1IUVA 1CF3A 3KKJA 3CNSA 3S5WA 3NN0X 2XVJA 2VVMA 4X4JA 1PBEA 4UDPA 2C66A 1KNRA 1VQWA 3UKKA 3ISHA 4B67A 1PXCA 2BYBA 4A5LA 5KWFA 5J7XA 2JBVA 4U8NA 2XVEA 3GYJA 3QVRA 4YXDA 4B68A 1ZDLA 3EF6A 2ACZA 2H89A 3NYEA 4ZCCA 2WS3A 1ZOVA 1GALA 1MOKA 2BK5A 3P4RA 4GDEA 3AWIA 3UOYA 4OPLA 1OJ9A 1GV4A 3JSKA 1IUTA 2WEUA 4JN9A 2OAMA 3NK1X 2YAUA 3V3OA 4A79A 5C3JA 1BZLA 1FOHA 1PDHA 4GF7A 1NHSA 1JRZA 2GAGB 4FX9A 2WPFA 2X8CA 3QVPA 3UKHA 1XPQA 4IV9A 2X50A 2XFQA 4HB9A 4RG4A 2JB1A 4TLZA 4Z24A 3SFDA 1K4QA 2W0HA 3C4AA 1E7PA 2A89A 3ICRA 4XWRA 5FMHA 3UKAA 4A6NA 3DGZA 4K8DA 3AE2A 1FEAA 4YKFA 3I6DA 4EQSA 3ATQA 1H82A 1N4WA 1PBDA 2XFPA 4IA5A 3QSMA 1IJHA 2CDUA 2GMHA 5KXJA 1KSSA 3ATRA 3BI4A 3Q9TA 1P2EA 1N4UA 4KX6A 2VVLG 4LU6A 1KNPA 1GRTA 1S2QA 2YG6A 1CJ3A 1L0VA 4B63A 2GVCA 1DJQA 2Y6QA 5IQ4A 1NHPA 3L1RA 1DXLA 3M0OA 2YVJA 1OJDA 3NNEA 3M12A 4YTPA 4RSLA 4UP3A 4OPDA 3RP6A 3RNMA 5DBJA 4J34A 2R4EA 2V6OA 4IVMB 3AEGA 3H4KA 4BK3A 1GOSA 3NYFA 1LQTA 4WX1A 4D03A 4Z43A 3HZLA 2YLSA 3V76A 1ZK7A 3LOVA 2OA1A 4C3YA 1TDOA 1ZMCA 3P1WA 4K5RA 3FPZA 5EB5A 3AEDA 2R0GA 2I0ZA 1M6IA 3NK0X 1EL7A 3DGHA 1GEUA 2WDQA 1ZKQA 4OPGA 3F8PA 2FJDA 4J2WA 3AE5A 3QSEA 4H2PA 4NEVA 2V5ZA 2QCUA 2XYOA 3AE8A 4C5OA 1GRAA 2XCGA 4O5QA 4Y4LA 4CBQA 3B6DA 2XVFA 1EL9A 2VVLA 3GMCA 4GCMA 3AECA 2BXRA 4EIQA 2WOIA 1D4DA 4U8JA 3ZDNA 1KF6A 1YQZA 4K7ZA 4YSXA 5JCNA 4CNJA 4ICYA 2XLTA 1NG3A 2Q0KA 3KLJA 2DKHA 4H4QA 1BKWA 3E1TA 4C74A 2WQYA 4Y4NA 1ZX9A 2VQ7A 3QSSA 1E1KA 3AYIA 1IUWA 2AQJA 4U2SA 1F8SA 1JRYA 2Z5XA 5CQFA 3NG7X 4FK1C 4H4UA 1PN0A 5EBKA 1D5TA 2NVKX 3P9UA 3GD4A 1QJDA 4I59A 4BV6A 1O94A 5JCIA 3FG2P 2YG5A 3C96A 3LXDA 4EIPA 3AE9A 4CY6A 3NIXA 3AXBA 1GETA 4C77A 4CRTA 2H88A 4AP1A 2AR8A 3Q6JA 1DOCA 1TRBA 4U2LA 2FJAA 2GQWA 3CGDA 2ZZBA 1LPFA 2VRMA 4H4WA 4PAAA 4K2XA 2NPXA 2YR5A 2CFYA 2Y6RA 1VDCA 3UOVA 4OPUA 1B4VA 1VRQB 4HA6A 3VRBA 4X9MA 3RP7A 1B37A 4ADWA 3NKSA 1LTXR 1EL5A 4ZN0A 3UKQA 1E1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NDAA 3W6GA 1GESA 3GA4A 3KH9A 3VI7A 4REKA 2MZCA 3BOAA 3DK4A 4HDEA 5KVHA 3MYDA 2C7GA 2RABA 4E8EA 3PS9A 1KBNA 1XW5A 2LJKA 3BBYA 1PXAA 4H4XA 1TRVA 4BJYA 2C64A 2HRNA 1G7EA 22GSA 3EINA 1W4VA 2YG3A 4TXOB 3IR4A 3QFAA 1VF4A 2GR3A 2B7KA 2TRXA 2FGXA 1JEHA 5AIXA 2R9ZA 2C65A 1MEKA 2HLSA 5FS8A 2WOVA 4MZBA 1TDEA 3CPJG 2DKIA 2CULA 4NHZA 2GRTA 1DJNA 3AE6A 4FYBA 4ID0A 1SD9A 1NPXA 4OCEA 2YM2A 3EMPA 4TR0A 2GH5A 5C2TA 2B7SA 4DSGA 1J9BA 2BA9A 2E4GA 3QMXA 2BC0A 3B3RA 3NH3X 1TJDA 1IYHA 2H6YA 3IRAA 4ZB8A 5FS6A 2X99A 1X9SB 1TRSA 3UMAA 4KNDA 4LA1A 1GWCA 4OWYA 2VQBA 4NZHA 2OLOA 3DGQA 3K7MX 1A2JA 2VLTA 1PBCA 1M64A 4I58A 3NGCX 1E6BA 3R3EA 1GUKA 5EY6A 1BWCA 5J60A 1YQ3A 2XVIA 2WP9A 3UKFA 3GYXA 1B9XC 1LBKA 4QQ7A 4XXGA 5CKUA 4NHWA 2QA2A 5KMSA 3N5OA 1EGOA 3CSJA 2IIDA 1ML6A 1ZYEA 3K8NA 1U3IA 1H7WA 4EM4A 2A2SA 1TW9A 1I9DA 1WP0A 5ELAA 4EXJA 3WGXA 1DOEA 3KD9A 2QA1A 3CIRA 2XPDA 2P31A 4F03A 5ECHB 4H4YA 1BGJA 2CT6A 2MBSA 1ZMDA 3ZZXA 2C0DA 4OMVA 1SENA 3OC4A 2J9HA 2BTOT 1PQNA 3LB8A 1CJCA 1PJ7A 1XW9A 1S3AA 1UC7A 1TYPA 1DODA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1NDA A;  3W6G A;  1GES A;  3GA4 A;  3KH9 A;  3VI7 A;  4REK A;  2MZC A;  3BOA A;  3DK4 A;  4HDE A;  5KVH A;  3MYD A;  2C7G A;  2RAB A;  4E8E A;  3PS9 A;  1KBN A;  1XW5 A;  2LJK A;  3BBY A;  1PXA A;  4H4X A;  1TRV A;  4BJY A;  2C64 A;  2HRN A;  1G7E A;  22GS A;  3EIN A;  1W4V A;  2YG3 A;  4TXO B;  3IR4 A;  3QFA A;  1VF4 A;  2GR3 A;  2B7K A;  2TRX A;  2FGX A;  1JEH A;  5AIX A;  2R9Z A;  2C65 A;  1MEK A;  2HLS A;  5FS8 A;  2WOV A;  4MZB A;  1TDE A;  3CPJ G;  2DKI A;  2CUL A;  4NHZ A;  2GRT A;  1DJN A;  3AE6 A;  4FYB A;  4ID0 A;  1SD9 A;  1NPX A;  4OCE A;  2YM2 A;  3EMP A;  4TR0 A;  2GH5 A;  5C2T A;  2B7S A;  4DSG A;  1J9B A;  2BA9 A;  2E4G A;  3QMX A;  2BC0 A;  3B3R A;  3NH3 X;  1TJD A;  1IYH A;  2H6Y A;  3IRA A;  4ZB8 A;  5FS6 A;  2X99 A;  1X9S B;  1TRS A;  3UMA A;  4KND A;  4LA1 A;  1GWC A;  4OWY A;  2VQB A;  4NZH A;  2OLO A;  3DGQ A;  3K7M X;  1A2J A;  2VLT A;  1PBC A;  1M64 A;  4I58 A;  3NGC X;  1E6B A;  3R3E A;  1GUK A;  5EY6 A;  1BWC A;  5J60 A;  1YQ3 A;  2XVI A;  2WP9 A;  3UKF A;  3GYX A; 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