4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
4YWOA 2B9YA 1TDOA 2IIDA 3PVCA 2C67A 1ZOYA 2GMJA 3DH9A 2F5ZA 3BNMA 1PXAA 3CNJA 3M0OA 4Z25A 3DJGX 1Z6LA 4Y4NA 2WP6A 3ATQA 3C96A 1MOKA 3DK9A 3AEGA 1DNCA 4DSHA 1CL0A 2WETA 2Y6RA 3CGEA 3UP4A 4B64A 4GUVA 4U8OA 4EQXA 4X4JA 4H4SA 3V3OA 1DOBA 4TM0A 3NYFA 3LZWA 4CCRA 3RHAA 1B8SA 3OZ2A 1OJDA 1GREA 1L0VA 4Z2RA 3LADA 3AB1A 3AD9B 3UP5A 1N4WA 3GD4A 2YLSA 3AEEA 4JQ9A 2GF3A 4M52A 4AP3A 1TRBA 3QVRA 2GB0A 3LB8A 4C77A 3GD3A 1M6IA 3RNMA 3NK1X 4EMJA 1DOCA 1PDHA 2YLTA 3CPJG 3UKAA 4WX1A 4ADWA 1S3EA 3KD9A 3NK0X 4IVOB 2VVLA 2XVFA 1COYA 2EQ6A 1FCDA 4YTPA 3SM8A 1B4VA 3KKJA 2GAHB 3FG2P 5EB5A 4BJZA 2BK5A 2VRMA 2B9XA 2YG4A 2VOUA 3BI2A 4YTMA 4YSZA 4YTNA 1M64A 3H4KA 4H50A 2VRLA 1VRQB 5FMHA 2WEUA 3AE1A 3DK8A 4JN9A 3UOXA 1NDAA 2OLOA 3D8XA 3CNPA 1D4EA 5U1OA 1GRFA 3G5RA 1HYUA 3AE5A 4AP1A 4U8JA 5KWFA 4H4XA 1NG4A 1GESA 5FS9A 1LTXR 1NPXA 1H7WA 2AAQA 3F8RA 5JCMA 1NHSA 5LV9A 3CGDA 3IWAA 3P4QA 4JDRA 3ABVA 3AD7B 5BULA 1XPQA 2XVEA 5JCLA 2R4EA 1AOGA 1CJ3A 2BXSA 3NGCX 1FEBA 4H4QA 3BI4A 2R0GA 2V3BA 1O5WA 3D1CA 1N4VA 1YY5A 4K5RA 2OALA 4EQSA 1QJDA 1KNPA 3URHA 1Y0PA 4AT0A 2GR0A 1XDIA 3NH3X 1H6VA 3ITJA 2AR8A 3M13A 3NK2X 3KPFA 4ZCDA 2E4GA 1K0IA 1ONFA 2JB3A 1CC6A 4N9XA 3AE9A 3IHMA 3GRSA 4NTCA 3ALJA 3NN0X 4OPDA 1SEZA 1YQ3A 2GMHA 3S5WA 4U8KA 1YKJA 2XYOA 1EL7A 3G5QA 2YVGA 2XFNA 2YVFA 4XWRA 4ZN0A 2OA1A 4GF7A 3NRNA 5FS8A 4CY8A 4B66A 3Q9TA 4ZCCA 1TDEA 3V3NA 3FMWA 2C76A 4ECHA 2CDUA 3AE4A 2VQ7A 3GDNA 1Q1RA 3BNUA 4TLXA 4UDPA 4K5SA 2Q0LA 4UP3A 3NNEA 3UKQA 1PBCA 2V60A 2XLRA 1DJQA 2WOIA 2A89A 2WU5A 2YG7A 3CNDA 4U8PA 2GV8A 1S3BA 2R45A 1ZX9A 2QA1A 2ZZCA 1LQTA 4BV6A 1D5TA 4KPRA 4J31A 2FJDA 4H2NA 1KNRA 1ZDLA 1ZY8A 5KVIA 3RP6A 4C3YA 3P4RA 4H2PA 4APNA 4REKA 4Y4MA 2YLZA 2X3NA 1PBBA 2JB1A 3QSSA 2VQBA 5EBKA 4I58A 2A8XA 3AE6A 4GDPA 1EL9A 1O94A 1XHCA 4CRTA 4EM3A 3NYCA 4BK3A 2YQUA 1NHQA 2C65A 4NTDA 2B9WA 2GQWA 2C7GA 4RSLA 1IUUA 2GQFA 1B37A 5EB4A 1CBOA 1Q9IA 3NKSA 3NT6A 4BURA 1UKVG 1GERA 5JCNA 3JSKA 3VRBA 4YSXA 1PBEA 1ZP0A 1ZKQA 1TYTA 2XLPA 4H4VA 2E5VA 1H83A 1XANA 2WPCA 1PS9A 4PAAA 5HY5A 3RP7A 1GV4A 1KSUA 4HA6A 1JNZA 1NHPA 1JOAA 3I6DA 4IVMB 1FEAA 4U8IA 4LU6A 4OVIA 4OPUA 4WCTA 3PS9A 4EQRA 3KU9A 2OLNA 3UTGA 3H8LA 4JNAA 2FJBA 2QCUA 2WDVA 2EQ8A 2XLTA 3Q6JA 4NTEA 4A5LA 2IVEA 4OPGA 4OPLA 3GMCA 4Z26A 1F8SA 2Y6QA 1NENA 3PO7A 2C66A 4LA1A 4TM3A 2WU2A 3OC4A 3UTFA 4D04A 2R0PA 1TDFA 4CCQA 5U25A 4D03A 2DKIA 1F3PA 1KSSA 4IV9A 3I3LA 1GTHA 5KOXA 4EIPA 4Z2UA 2V3AA 1L9DA 4FK1C 5J60A 1PJ5A 2BC1A 1E1LA 3P1WA 1E1NA 2GH5A 2BK4A 2OAMA 5C2TA 2EQ9A 1CJCA 5KRQA 3CPIG 1KDGA 1ZMDA 2WOWA 1H81A 2R9ZA 1Q1WA 1RYIA 1PJ6A 1GPEA 4J33A 3GMBA 3GWFA 3AXBA 2BCGG 3SGLA 3V76A 3COXA 2BABA 2YLWA 2ACZA 1CHUA 2YR5A 1TYPA 2A87A 3UOYA 2O9ZA 4NEVA 2BCPA 1JRXA 2Q7VA 2RGOA 4H4PA 4P9SA 5M0ZA 2WP9A 3S61A 3F8PA 1H82A 2V6OA 2GR2A 1Y56B 1DODA 1E7PA 1RSGA 4JNQA 3B6DA 5JCIA 2WOVA 1N1PA 5DBJA 3SFDA 3K30A 2XFUA 4E0VA 5HHFA 3CTYA 4Z43A 2YLXA 4FDCB 4OCGA 1H84A 2GAGB 2BS3A 1EL5A 3UKHA 3WE0A 3GSIA 3BI5A 3QSEA 1GT8A 1OJCA 1BZLA 4IA5A 2WDQA 3DK4A 4UDQA 4YSYA 2JKCA 2BC0A 3O0HA 2XLSA 3T37A 3DJJA 3LOVA 2BACA 4GDEA 2BK3A 2H89A 2R46A 2FBWA 1JEHA 4I59A 3KVEA 3LZXA 1BGNA 5BVAA 3AEFA 2YLRA 2V61A 3NIXA 4GR1A 1LPFA 1E1KA 2B7RA 4A79A 3CGBA 5HYMA 4H4WA 1K0LA 3AE8A 1ELIA 4YKFA 2YM1A 2E1MA 5IQ4A 2RGHA 4H2QA 2NVKX 2IVDA 3UTHA 3CGCA 4AOXA 1D7LA 4A6NA 4B65A 2FJEA 5M10A 1Y56A 4FX9A 4J56A 3AEDA 5BRTA 2X8HA 3UKPA 3ALMA 1PN0A 3AYJA 1PXCA 3HZLA 2WP5A 3FBSA 4GCMA 1S2QA 2BA9A 5L46A 3IC9A 1IUWA 2GRTA 1F8RA 2GR1A 4YXDA 1L9CA 2BS4A 3IF9A 2APGA 4DSGA 4Z24A 1E1MA 4DNAA 1ZOVA 1PXBA 4X9NA 2VZ2A 2CFYA 3EANA 4Y4LA 2WS3A 1PHHA 2J3NA 3EAOA 1L9EA 3SFEA 4BJYA 2Z5YA 3NN6X 1BKWA 1H86A 1BWCA 2YAUA 4PABA 1NAAA 3BHKA 4HB9A 1IUVA 1GETA 3AEAA 1CF3A 2TPRA 3ADAB 4H4UA 3M12A 3QVPA 4K2XA 5EOWA 4B1BA 1P2EA 4EMIA 2EQ7A 2JBVA 2XCGA 3ICRA 4NZHA 4AT2A 4J36A 4LIIA 1GALA 2WPFA 2WQYA 2B76A 2XVHA 3CNTA 3CNSA 1W4XA 3ICTA 3P9UA 3GDPA 4J34A 2XDOA 2Q6UA 2C75A 2JB2A 4J2WA 3EPTA 1FECA 1D7YA 3KLJA 1X31B 1NG3A 2QA2A 2FJAA 1CC4A 1O95A 3P4SA 4JY3A 3NYEA 3FPZA 2ARDA 2WPEA 2C64A 3BHFA 3II4A 3VR9A 4CBQA 1FOHA 2GR3A 2JK6A 3NTDA 2C3DA 1GRGA 4Z2TA 2ZBWA 5CQFA 2WDRA 1OJAA 1TDNA 2H88A 3ZDNA 1GNDA 4U8LA 3AYLA 4RG4A 2UZZA 1PBDA 2C3CA 2RABA 2GEWA 2W0HA 4U8NA 3R9UA 3G5SA 1IJHA 1VQWA 3GYIA 1NEKA 4EQWA 2YM2A 2QAEA 4FK1A 1BGJA 3EF6A 4IA6A 1PBFA 4H4ZA 3ZYXA 3NLCA 4K22A 3IHGA 4O5UA 3UKLA 5C3JA 1VG9A 2C72A 2XLUA 1ZK7A 1GSNA 1OJTA 3H8IA 3GYJA 4H4YA 1K4QA 3AD8B 4H4RA 3LJPA 1B5QA 1E39A 3FIMB 1N4UA 1S2YA 2ZZBA 3K7TA 1OJ9A 3GWDA 1QLBA 4Z44A 2C73A 4H4TA 4GRTA 4OPIA 2WHDA 4BK2A 2WBAA 4YSHA 4A6NB 5IPYA 1EL8A 4CNKA 1DJNA 2BS2A 1GOSA 4EIQA 2RGJA 3L1RA 3L8KA 2AQJA 1EBDA 1IUSA 1KFYA 2Z5XA 1BF3A 3DA1A 3DGHA 4K8DA 4AOSA 1PJ7A 1D4DA 4K7ZA 5FS7A 3K7MX 3QFAA 4YT0A 3NG7X 2YG6A 4J57A 3UKFA 1JRYA 3QFBA 3UKKA 3ISHA 1GXFA 1YQ4A 2PHHA 5FS6A 4CNJA 2CVJA 2XFPA 4H2RA 4BK1A 3DJDA 4OPCA 4U8MA 4USQA 3NTAA 4A65A 5KVHA 1CC2A 4USRA 1NHRA 1IUTA 5BUKA 5IQ1A 4A99A 4A9WA 3ICSA 2XFOA 1VDCA 2DKHA 1MO9A 3RP8A 4OPTA 3AWIA 4A7AA 2YVJA 4EM4A 3AE7A 5ER0A 2R0CA 2X8GA 1JRZA 3DJEA 5U63A 3UOZA 4DGKA 3CIRA 2YR4A 1YQZA 2GVCA 2I0ZA 2X8CA 4RG3A 1QO8A 2X99A 3CN8A 1DXLA 2PYXA 5GSNA 4U2TA 5KXJA 3AEBA 3AYIA 4UDRA 4NEWA 1P2HA 3DGZA 4H7UA 5KOWA 5TR3A 3VR8A 4C74A 1LQUA 4XWZA 1LV0A 1ZMCA 2TMDA 1E6EA 3C4AA 5GRTA 3VRAA 4EMWA 3K7QX 3ATRA 2X50A 4B68A 4O5QA 2V5ZA 2YR6A 1CJ2A 3F8DA 1RP0A 4JY2A 3UCLA 1REOA 2JAEA 2VVMA 1LJ1A 4CY6A 3REDA 4TM4A 2Q0KA 3ALLA 1GRHA 3E1TA 1GEUA 4X9MA 2BXRA 4B63A 1DOEA 5HXIA 3AECA 1K0JA 3CPHG 3KA7A 4B67A 3SQPA 1LVLA 1CJ4A 2YG3A 5CKUA 5J7XA 2R4JA 1GRBA 1IUXA 2VVLG 3UOVA 3NHOX 3UTEA 4C3XA 3GRTA 1FL2A 2ZZ0A 4U2SA 1GTEA 3B3RA 1V59A 3C4NA 1JU2A 1GRTA 3DMEA 3VRDB 4B69A 4XXGA 1D4CA 1F8WA 2HQMA 4TLZA 2YG5A 2YWLA 3LXDA 2XFQA 4TM1A 4C5OA 2B7SA 1F6MA 3QJ4A 2CULA 2WESA 4U2LA 2BYBA 2XVJA 1MXTA 3AE2A 3P4PA 4KX6A 4MJWA 5JCKA 1TDKA 1GRAA 3VQRA 2C70A 2NPXA 3QSMA 1H7XA 1KF6A 2XVIA 1JNRA 3AE3A 4YKGA 1VG0A 4ICYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M0FA 2GVPA 2HI7A 3GSTA 1PXAA 5JCUA 1Z6LA 4Y4NA 5EPFA 2L4CA 3UP4A 19GSA 4H4SA 1TK5B 2XC2A 1A2JA 4TM0A 4CCRA 1S3RA 3F4TA 1B8SA 3RHAA 1OJDA 3ZREA 3L9SA 1Q98A 4TOPA 2P31A 1V57A 4JR4A 1TRBA 3QVRA 2GB0A 1G6WA 5J41A 1F37A 3GD3A 4WBJA 4EMJA 3HXSA 2YLTA 3CPJG 5A4UA 1LU4A 3KD9A 3NK0X 5ABRA 1FCDA 3TUEA 3G7YA 4BJZA 3P90A 3MIXA 2VCWA 2MMNA 2FD3A 4EVMA 4E8EA 1M64A 1A0FA 1TI1A 4DSQA 2WEUA 4IW9A 2E0QA 3AE1A 3DK8A 1AQXA 3UOXA 1D4EA 5U1OA 1GRFA 3AE5A 4FYBA 5KWFA 4XRDA 4OMVA 2YV9A 3IHQA 4ZILA 2VCXA 1NHSA 3CGDA 2IMDA 2VCTA 2RUFA 3IWAA 2PERA 5ECNB 1ACVA 2E2MA 4GSNA 2R4EA 1AOGA 1M9AA 1GTUA 1FEBA 4HJ2A 3BI4A 3GMFA 1YY5A 2X4AA 1YEPA 3ISOA 1WJKA 3ITJA 4IKHA 3RPPA 3M13A 2L5LA 3HYPA 1ONFA 4N9XA 4KX4A 3GRSA 4MZWA 1PMTA 4BWSA 1WRYA 3NN0X 1M3JA 2J23A 1YKJA 2XYOA 2YPMA 2FGXA 3G5QA 4MA9A 2YVGA 3VLNA 4ZN0A 5GAND 2OA1A 3ERWA 1GULA 2EIQA 3NRNA 2KP1A 2CX3A 3GHAA 4IVFA 2VL2C 4KH7A 2GSRA 3FMWA 5CRGA 3TOTA 4Q5RA 2VD1A 1HQOA 2V2GA 4K5SA 3NNEA 1N2AA 1GSQA 4OFMA 2V60A 2XLRA 2YP6A 2NDOA 3TOUA 1X5CA 1KNGA 2FJDA 4XIHA 1GSYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3M0F A;  2GVP A;  2HI7 A;  3GST A;  1PXA A;  5JCU A;  1Z6L A;  4Y4N A;  5EPF A;  2L4C A;  3UP4 A;  19GS A;  4H4S A;  1TK5 B;  2XC2 A;  1A2J A;  4TM0 A;  4CCR A;  3RHA A;  3F4T A;  1B8S A;  1OJD A;  3ZRE A;  3L9S A;  1Q98 A;  4TOP A;  2P31 A;  1V57 A;  4JR4 A;  1TRB A;  3QVR A;  2GB0 A;  1G6W A;  5J41 A;  1F37 A;  3GD3 A;  4WBJ A;  4EMJ A;  3HXS A;  2YLT A;  3CPJ G;  5A4U A;  1LU4 A;  3KD9 A;  3NK0 X;  5ABR A;  1FCD A;  3TUE A;  3G7Y A;  4BJZ A;  3P90 A;  3MIX A;  2VCW A;  2MMN A;  2FD3 A;  4EVM A;  4E8E A;  1M64 A;  1A0F A;  1TI1 A;  4DSQ A;  2WEU A;  4IW9 A;  2E0Q A;  3AE1 A;  3DK8 A;  1AQX A;  3UOX A;  1D4E A;  5U1O A;  1GRF A;  3AE5 A;  4FYB A;  5KWF A;  4XRD A;  4OMV A;  2YV9 A;  3IHQ A;  4ZIL A;  2VCX A;  1NHS A;  3CGD A;  2IMD A;  2VCT A;  2RUF A;  3IWA A;  2PER A;  5ECN B;  1ACV A;  2E2M A;  4GSN A;  2R4E A;  1AOG A;  1M9A A;  1GTU A;  1FEB A;  4HJ2 A;  3BI4 A;  3GMF A;  1YY5 A;  2X4A A;  1YEP A;  3ISO A;  1WJK A;  3ITJ A;  4IKH A;  3RPP A;  3M13 A;  2L5L A;  3HYP A;  1ONF A;  4N9X A; 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