The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
86
|
structure length |
86
|
Chain Sequence |
SHMFTGLNTPSGVAVDSAGTVYVTDHGNNRVVKLAAGSNTQTVLPFTGLNTPSGVAVDSAGTVYVTDHGNNRVVKLAAGSNTQTVL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
|
| molecule keywords |
nvPizza2-S16S58
|
| publication title |
Crystal structure of nvPizza2-S16S58
rcsb |
| total genus |
12
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| structure length |
86
|
| sequence length |
86
|
| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-04-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5F53 A; 4ZCN A; 3WW7 A; 3WWB A; 5CHB A; 3WWF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3S9C A; 2QCY A; 3A85 A; 1DST A; 3MNX A; 3RXJ A; 2SGQ E; 4LK4 A; 1LVY A; 1ARC A; 1TAB E; 1XVM A; 4OS4 A; 1AMH A; 2JJ1 D; 3ZZC A; 3GCH C; 3GY5 A; 3S9B A; 1ORF A; 3RDZ A; 1SGF A; 1YP9 A; 2FOD A; 1LHD H; 1TOM H; 3TH4 H; 1QZ8 A; 2BOH B; 2YMS B; 3EA8 A; 3QX5 H; 1EAI A; 1AZ8 A; 1SQT A; 4RSP A; 1Y5A T; 2VVC A; 3I77 A; 1AUT C; 1CBW C; 4MNY A; 1LQD B; 1FON A; 1O2Z A; 2R9P A; 4KP0 A; 1C1T A; 4I8G A; 5C3N A; 5EQR A; 5A8Z A; 5TJX A; 2ASU B; 4XBB A; 2Q6G A; 2GMT B; 2OD3 B; 3OSY A; 1FAK H; 3T28 A; 1NRS H; 4Q63 A; 5HIZ A; 3A89 A; 1ELV A; 2J98 B; 3H5C B; 5F8X A; 3GY2 A; 1V2P T; 4J2Y B; 1CT4 E; 1C5W B; 4M9F A; 2Z9L A; 4GCH F; 1YCP M; 1AFQ C; 1AB9 B; 4I8L A; 8KME 2; 3RM2 H; 1RTL A; 1DFP A; 5GDS H; 1SHY A; 3U8T H; 4MQA A; 1YPH E; 1ELA A; 1L1G A; 1OPH B; 1O2P A; 1L1N A; 3TLO A; 1C1R A; 3H7O A; 3MNC A; 4DT7 B; 1FUJ A; 1RD3 B; 4WVP E; 1V2K T; 2BZ6 H; 2O8M A; 1O2O A; 3ZZB A; 1XUK A; 1TOC B; 2AGG X; 2BQ7 B; 1UTP A; 1TLD A; 1YPE H; 4ISO A; 2FOH A; 2RG3 A; 1OWH A; 4YLQ H; 5C17 A; 1XKA C; 1IQM A; 2XC4 A; 4M7G A; 1BTU A; 3FAO A; 3UNR A; 3ZVA A; 5IYT A; 3UQV A; 3TIT A; 1C2E A; 1C4Y 2; 3DCL A; 1IQK A; 4NIV A; 4FUG A; 2C8Y B; 1DE7 H; 1J9C H; 2BLW A; 2LNC A; 1FQ3 A; 1BTW A; 3KNX A; 2W7U A; 3MO6 A; 2Z9J A; 1WYK A; 1Y3Y A; 4NCY A; 4ZRO A; 2H2Z A; 2QF4 A; 5CHA C; 4X6N A; 1QBN A; 1IQF A; 4D8N A; 3ZZ3 A; 2ZA5 A; 1O33 A; 3PLP A; 4WY3 A; 2ZU1 A; 4YOG A; 1QR3 E; 3T5F H; 1ESA A; 3UOP A; 5A0C A; 1OYT H; 1S81 A; 4AN7 A; 3RU4 E; 3EA7 A; 1HXF H; 5FL7 D; 3F9G A; 5EOD A; 1TGC A; 1OWJ A; 3SBK A; 1K1I A; 4FU7 A; 5GPI B; 1E37 B; 2A1D B; 3SNC A; 2QF5 A; 2PTC E; 3K6Z A; 2ZNK H; 1L4D A; 1SBW A; 1RFN A; 4AYV B; 2FIR H; 1GG6 C; 1GJ5 H; 1O2G H; 3EE7 A; 3RXA A; 1TA6 A; 2WPH S; 3QTO H; 1F5L A; 4AOR A; 1F0U A; 3ZZ4 A; 2BY5 X; 3FO8 D; 4XRN A; 4AYY B; 1C5N H; 9LPR A; 2PSX A; 3SQE E; 4FUB A; 1H9H E; 1TIO A; 2WPL S; 1AE8 H; 2CMY A; 3DFL A; 5JB8 S; 3BEF B; 3AAV A; 1YWU A; 2QGR A; 3MNB A; 4A1T A; 3A7Y A; 1K1O A; 1YBW A; 4AG2 A; 2HLC A; 1BTP A; 2JET B; 3LOX A; 3F2F A; 1W2K H; 1P2N A; 1XX9 A; 3PWC A; 1MTW A; 4HI3 A; 7EST E; 4AB8 A; 2FTM A; 4RN6 A; 2KR7 A; 1EP5 A; 1O2R A; 1BHX B; 2BDB A; 1GPZ A; 5F53 A; 2KZ4 A; 3RMO H; 3URE A; 2QXJ A; 1HJA B; 3TNS A; 1BTX A; 4X2W A; 2F43 B; 3B9F H; 3ITI A; 4AGJ A; 2ODP A; 4CHA B; 2YOL A; 1C1W H; 4HFP B; 4K60 A; 4UON A; 3TVJ B; 2ODY B; 1ZHM A; 1C2F A; 4O97 A; 4ABJ A; 5H4I B; 3VB3 A; 4ACB A; 3NUM A; 1DIT H; 3QZR A; 3FOA A; 1TYN A; 1CHO G; 1YYY 1; 5FCR A; 3E1X B; 1O5E H; 4K5Z A; 3TJO A; 1QJ1 B; 1GL1 A; 1LHE H; 1EPT A; 1P9S A; 1E1R D; 3E6P H; 2A5A A; 1O3N A; 1GHW H; 3RLW H; 2DUC A; 2F9V A; 1TON A; 1ZTJ A; 3IIT A; 4NGA H; 2FOF A; 4IMZ A; 1X7A C; 4XDE A; 2FP7 B; 1DT2 A; 4H4F A; 5LPF A; 2V35 A; 4CRD A; 4F55 A; 4OS2 A; 5FX5 A; 2GV6 A; 1CGI E; 3LKW A; 1NRP H; 3HKJ B; 4NA9 H; 2ZFR H; 1MCT A; 1KXD A; 3ZZ5 A; 2C8X B; 1NRR H; 2VID A; 1QL7 A; 1VIT F; 4UFF H; 3BTQ E; 2XWA A; 3BTM E; 4AFZ A; 2XW9 A; 1SGD E; 1RIW B; 2P59 A; 1OWE A; 2KX4 A; 2XBX A; 2Y5H A; 2A31 A; 3E8L A; 3A7V A; 2A4O A; 8GCH F; 3SHA H; 4DUR A; 3RUO A; 2AGI X; 1T31 A; 1EP6 A; 3D49 H; 2GT8 A; 3P8N A; 1MU8 B; 2XNI A; 4MLF B; 5B6O A; 2Z3E A; 1A3B H; 1FY4 A; 1WU1 A; 1D9I A; 4ABH A; 2BY7 X; 1K0H A; 1SFI A; 2FOM B; 1Z8J B; 4Y11 E; 3LDX H; 5GCH G; 3PYH A; 3P8O A; 1TMU H; 4NWL A; 2B9L A; 1EPT C; 1HNE E; 2Y81 A; 4LZ1 H; 1O3I A; 5F03 A; 5JDU B; 2P94 A; 1HAG E; 2W6I D; 2BDI A; 3SJK A; 1HAO H; 1CA0 B; 1SLX B; 1GI6 A; 5FX6 A; 1T32 A; 1O2J A; 1TNH A; 2BY8 X; 2G51 A; 1TRN A; 2R3U A; 1SB1 H; 2GCH F; 1HCG A; 3RXQ A; 1HYL A; 2XC5 A; 4K3J A; 1P3C A; 2ZGH A; 1BMN H; 3ZZ6 A; 3F9H A; 1Z8I B; 3WW7 A; 3BG4 C; 3MU4 A; 2HVY B; 1QB9 A; 2ANY A; 3A7W A; 3GYM A; 1OXG A; 4J1Y A; 3TPI Z; 2OC7 A; 1TBZ H; 3NRL A; 1Z1I A; 1WCZ A; 4TSF D; 1V2M T; 4YT6 H; 2WPI S; 3O8C A; 1MH0 A; 5DP3 A; 2FMJ A; 4KTU A; 1VKY A; 3NPS A; 1SLV B; 1QRW A; 1UVU H; 3BTW E; 3NCL A; 1EJN A; 3M5N A; 3GDU A; 2EY4 C; 1QY6 A; 2RDL A; 1GBT A; 3QWC H; 3TK5 A; 4BTT B; 3LPR A; 3A83 A; 2R0L A; 4AG1 A; 3PV2 A; 1T8N A; 3ZV8 A; 4WJG 2; 3MQK C; 5EW1 H; 2BY9 X; 2PKS C; 2P95 A; 3NZI A; 2BD4 A; 4CRB A; 1U6Q A; 4U01 A; 1P3E A; 3ZVB A; 3CS7 A; 1FY1 A; 2J5U A; 1AN1 E; 1J8A A; 1CQQ A; 1ZJK A; 3BV9 B; 1XUG A; 1GCT C; 3O8B A; 4AB9 A; 1EAW A; 4E06 H; 4IC5 A; 2PLX A; 3BF6 H; 3RXL A; 1O5A B; 1UHB B; 4NIY A; 4JZD H; 3SU1 A; 1YPL H; 3K2U A; 1EUF A; 3EDX B; 4X1Q U; 1HXE H; 1C9T A; 4MPX A; 2CXV A; 1ESB A; 3GS9 A; 1GI4 A; 3OTP A; 2BDC A; 1C2L A; 1O3P B; 3SUF A; 4I32 A; 3RXM A; 1O5B B; 4B1T A; 1IQJ A; 4D9Q A; 2Z3C A; 1XUI A; 3ZZ8 A; 4Y0Z E; 1TB6 H; 1GJD B; 1DWC H; 5LPR A; 4ZKR U; 3SNA A; 1V2N T; 2WV5 A; 3EGK H; 3L33 A; 4IN2 A; 5C0T A; 3P8G A; 1P01 A; 3VB4 A; 1WQV H; 3M5O A; 1GJ7 B; 1UTM A; 3PMH B; 5HM9 A; 3PV5 A; 2BD7 A; 1J17 T; 2EI8 A; 4WMF A; 4Y76 A; 1IOE A; 5C2Z A; 1MQ6 A; 2C8Z B; 1RXP A; 2I6Q A; 1EQ9 A; 1N8O B; 2F4L A; 2CGA A; 1LHF H; 1L2E A; 4MVN A; 1HUT H; 3ENS B; 1Z8G A; 3NWU A; 1ZOM A; 3GIC B; 2Q1J A; 1YLD A; 4FUJ A; 2FOA A; 3UNQ A; 1FMG A; 3MOC A; 2ZO3 H; 1KDQ B; 1COW D; 2GCT C; 3SZN A; 1UVS H; 4O03 A; 2K0Q A; 3PLB A; 2ZDK A; 1P2I A; 1QA0 A; 2VIN A; 4X8V H; 4OS1 A; 1FNI A; 2OLG A; 3P8F A; 5EST E; 3UY9 A; 1GI3 A; 1GBC A; 4FET A; 4OGY A; 2WPD D; 4E05 H; 4FUH A; 4Q4L A; 2QC2 A; 1TPO A; 4YXW D; 3FP7 E; 1E34 B; 2VWL A; 1DY8 A; 1S5S A; 4DJZ B; 2VVV A; 5KGO A; 1S82 A; 3LIW A; 1H4W A; 1W12 U; 4DG4 A; 3PRB A; 4XD7 D; 1LVB A; 3TIU A; 1YY3 A; 1UTK A; 1DX5 M; 2ALP A; 4CBN A; 1O2M A; 3M7U A; 2YMS D; 2ZTY A; 2ZDM A; 4TYD A; 4DVA U; 3K9X B; 2VWM A; 1QNJ A; 3A84 A; 1WQS A; 1ELF A; 3W94 A; 1E35 B; 1O5C B; 1GBH A; 1GJB B; 4Y8X A; 5HM2 A; 5JBT A; 1OOK B; 2C93 B; 2VVU A; 3E0N B; 3PTB A; 4EST E; 2OBO A; 4X2X A; 4IW4 E; 2Q6F A; 1TNI A; 2EI7 A; 3D23 A; 1QL8 A; 6GCH G; 3HKI B; 2AS9 A; 5DP4 A; 3QLP H; 1XM1 A; 2WSS D; 4YTA A; 5AF9 H; 4K8B A; 1NTP A; 2J95 A; 3V13 A; 3IG6 B; 2KCA A; 1TGB A; 3ZV9 A; 5DK1 A; 1O2T A; 3NK8 A; 3OY6 U; 1O3L A; 1ZPB A; 1SR5 C; 2Y5F A; 3FVF B; 2FPZ A; 1AKS A; 1G32 B; 3SJ9 A; 1GDN A; 4NWK A; 5GND A; 3ZVE A; 1TNG A; 2NWN A; 4Y10 E; 3DSP A; 2ZFP H; 4B71 A; 4ABE A; 3SJI A; 2ZDV H; 1C5Q A; 2A0Q B; 3FAN A; 4GLY A; 1BDA A; 3LH3 A; 5DPA A; 3N7E A; 3GCO A; 2H5C A; 2HOB A; 1K1L A; 2A32 A; 1QJ6 B; 3MO3 A; 4FUI A; 4ABF A; 2O8L A; 3A7T A; 1B7X B; 1AY6 H; 3MWI U; 1AO5 A; 2Z9K A; 1O2N A; 1J14 A; 2OC8 A; 2SGP E; 1GJ9 B; 5J4S A; 1GHY H; 1SI5 H; 3O8R A; 4DIH H; 1W0K D; 4RI0 A; 3T27 A; 3M3T A; 3TH3 H; 3VFE A; 3BEU A; 1PPB H; 2BD2 A; 1W11 U; 1GMH G; 2ALV A; 3UNS A; 5T3H A; 2PSY A; 1L4Z A; 1NZQ H; 2W3K A; 2TRM A; 5EU8 A; 1RJX B; 1SL3 A; 2B0F A; 2A5K A; 5FXL A; 4I7Y H; 1GMD G; 3F2G A; 1UJ1 A; 3DFJ A; 1ELB A; 1EZU C; 2KM0 A; 4E7N A; 5FPS A; 3GCN A; 1UTQ A; 2G8T A; 3OYP A; 1C2H A; 3M3V A; 1E79 D; 5F8Z A; 3RXT A; 4ACA A; 1IQH A; 3FN8 A; 1DXP A; 4NG9 H; 1IQI A; 3OE7 D; 2KCY A; 4YES B; 1GJ8 B; 3GCH B; 4Y71 A; 1GBL A; 2M2A A; 3FZD A; 2BZA A; 3OEE D; 1E1Q D; 3STI A; 4JK5 A; 4WH6 A; 1S0R A; 1C4V 2; 3SZE A; 5DP5 A; 4B74 A; 5DP8 A; 4KGA A; 4A6L A; 5DN6 D; 4D7G A; 1CE5 A; 3E0P B; 4ISH H; 1A1R A; 4UEH H; 2OC1 A; 1MD8 A; 1A61 H; 1MBQ A; 2VH6 A; 1UK3 A; 4TY7 A; 3DA9 B; 1CBW B; 4BAQ B; 1FY5 A; 4Q7X A; 4H42 U; 1SQA A; 1WV7 H; 5A0B A; 3OU0 A; 1C9P A; 3SUE A; 1TX7 A; 1TRY A; 2WYJ A; 2BDY A; 3RC5 A; 4Q80 A; 1DUA A; 3SGQ E; 7GCH F; 2QYI A; 5GIB A; 1O3B A; 1HIA B; 1WTG H; 1C5M D; 1M9U A; 1D6R A; 4WF8 A; 3ZZ7 A; 1GBD A; 2FI5 E; 3S7H B; 2A2Q H; 1P03 A; 1RTF B; 3N7O A; 4BOH A; 2BB4 A; 3E3T A; 2HPQ H; 3R3G B; 4I31 A; 1VGC C; 1IQL A; 2CN0 H; 2NU3 E; 4ISN A; 3RC4 A; 1DIC A; 3RML H; 1UCY H; 4NSV A; 5EJL A; 2SFA A; 2SNV A; 3EQ0 H; 1MTV A; 3PO1 C; 5AHG H; 2QE7 D; 3PRD A; 3LGT A; 2YNB A; 3E91 A; 2GX4 A; 4TY6 A; 2V6N A; 2D2D A; 4TT3 D; 4SGA E; 2GP9 B; 4ASU D; 2F83 A; 2BQ6 B; 1TGS Z; 1HDT H; 1T8M A; 4Z0K A; 3AVZ A; 2STB E; 1N6X A; 1O2U A; 3UB0 A; 3LGY A; 5JBB S; 1GI9 B; 5CHA B; 2C8W B; 1GHB G; 3BG8 A; 3F0P A; 1GJ6 A; 1UTL M; 1PYT D; 2JH0 D; 4YOI A; 4NIX A; 1ZHP A; 2F9N A; 2DE9 A; 4RKJ B; 3RXP A; 1AHT H; 3W95 A; 4WXV A; 1NM6 A; 1T8L A; 4AFQ A; 5F8T A; 1TAL A; 2ZU4 A; 3C27 B; 2PFE A; 3ZVD A; 3OFN D; 1O30 A; 2ZCL P; 3B8J A; 4UD9 H; 1C5P A; 4Z1M D; 1FDP A; 2ZGJ A; 2DE8 A; 1GI1 A; 1SGI B; 3AAS A; 1PPH E; 2UWP A; 4K1E A; 2P8O B; 3ZYD A; 4ZXX H; 3TGJ E; 1LVO A; 1NO9 H; 2XBY A; 1FN6 A; 2G81 E; 5CMX H; 2I6S A; 1GVK B; 4X2V A; 2ZFQ H; 2Z6B D; 1NFX A; 3C1K A; 1G36 A; 3GY6 A; 1SSX A; 2XBV A; 1C5Y B; 1KSN A; 4U2W A; 1K1M A; 2ZEC A; 1W10 U; 2RDE A; 2HVX A; 4JK6 A; 2VWN A; 1MAX A; 3RXB A; 1BMF D; 1HV7 A; 1LMW B; 1ZMN A; 3M61 U; 1GJC B; 1O3K A; 5DGJ A; 3KF2 A; 4FUD A; 1GI0 A; 1P2J A; 4MNW A; 2ULL A; 3A8D A; 4D9R A; 1D3Q B; 3P92 A; 1UK4 A; 4YZU A; 3T2N A; 3PWB A; 1QJ7 B; 3A7X A; 5C67 A; 4NFF A; 1GCD A; 1B5G H; 2J38 A; 2FM2 A; 4I8J A; 2H9T H; 3CNR A; 1G3E A; 1AGJ A; 1T4U H; 1ZSK A; 3MMG A; 2BD3 A; 3HPT B; 2TGD A; 4K1S A; 4R0I A; 5DSF A; 5I46 H; 3L3T A; 1NBM E; 4DY7 B; 2VWO A; 4WH8 A; 1V2Q T; 1TNK A; 4IS5 A; 1DWD H; 4IN1 A; 3OEH D; 1FLE E; 2HPP H; 1A0L A; 4A7I B; 2VIW A; 2WZQ A; 2GDE H; 1UCY E; 2ZGC A; 3T62 A; 4MPW A; 1BML A; 4K2Y A; 4I8H A; 1ACB E; 1S6L A; 1TNL A; 1HAV B; 2WPJ S; 1UCY K; 1GBA A; 1SGE E; 2JIZ D; 3MU0 A; 1P11 E; 2ZPR A; 3VPK A; 1MZD A; 1F5R A; 2FOB A; 5TCA A; 5E0H A; 2EST E; 1SGY E; 2STA E; 4NIW A; 2ZQ2 A; 1UMA H; 2GJG A; 4X8U H; 3N99 A; 1O3C A; 1QB1 A; 3HK3 B; 4ISL A; 1JWT A; 1SHH B; 3RU4 D; 1V2S T; 1JBU H; 1PQA A; 1KXC A; 1GJA B; 1O2L A; 3HGP A; 1G3C A; 1L0Z A; 1PQ5 A; 1QGF A; 1XXD A; 2LPR A; 2O9Q A; 4YLU A; 3SGA E; 2KCO A; 1FIZ A; 2HRV A; 2BMG B; 3BTK E; 1A4W H; 2V3O H; 1BHX F; 3OY5 U; 1IHT H; 2A7J A; 4XFQ A; 1WXR A; 2IN2 A; 4X1N U; 1W8B H; 3UUZ A; 1HAY B; 1O2X A; 1JMO H; 2PP6 A; 4GHT A; 3ATK A; 1K21 H; 1NRN H; 1NU7 B; 1O2S A; 1SGR E; 2SNW A; 3GDS A; 1AFE H; 3KQE A; 4Q7Z A; 4YOJ A; 4X6O A; 2UUY A; 4Y8Z A; 5JYI A; 2BOK A; 2CHA C; 1SQO A; 1MKX H; 3PMJ A; 3TK6 A; 2FLR H; 4MG3 A; 1EPT B; 1C2D A; 5TCC A; 4QT8 C; 3FKS D; 1DUE A; 5G4B A; 2OUA A; 1BZX E; 5A2M H; 3M3S A; 3KCG H; 3V0X A; 3IWM A; 4ZCN A; 3Q3X A; 1W0Z U; 1WUN H; 2RFK C; 2SGD E; 2HNT F; 3LGI A; 3TJU A; 2BDA A; 3E16 B; 1DDJ A; 1Y5U T; 1AI8 H; 1WDI A; 2XOK D; 1O35 A; 4ZHM U; 2A4Q A; 3ELA H; 1MU6 B; 4OM9 A; 4GVU A; 1YGC H; 3BG4 B; 1XUH A; 1XUJ A; 3JZ2 B; 1SLW B; 3N7D A; 2WIN I; 1CHO F; 4Q7Y A; 5GJ4 B; 2BVS H; 2OQ5 A; 2PUQ H; 2JKH A; 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