4ZKTB

Crystal structure of the progenitor m complex of clostridium botulinum type e neurotoxin
Total Genus 271
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
271
sequence length
1159
structure length
1114
Chain Sequence
KINGNLNIDSPVDNKNVAIVRSRDVFFKAFQVAPNIWIVPERYYGESLKINEDQKFDGGIYDSNFLSTNNEKDDFLQATIKLLQRINNNVVGAKLLSLISTAIPFPYENNTEDYRQTNYLSSKNNLVIFGPGSNIIKNNVIYYKKEYAESGMGTMLEIWFQPFLTHKYDEFYVDPALELIKCLIKSLYYLYGIKPNDNLNIPYRLRNEFNSLEYSELDMIDFLISGGIDYKLLNTNPYWFIDKYFIDTSKNFEKYKNDYEIKIKNNNYIANSIKLYLEQKFKINVKDIWELNLSYFSKEFQIMMPERYNNALNHYYRKEYYVIDYFKNYNINGFKNGQIKTKLPLSKYNKEIINKPELIVNLINNTVLMKSNIYGDGLKGTNFYSNYIIPYNHSINYSYLDNVNIEEIEKIPPINDEDIYPYRKNADTFIPVYNITKEINTTTPLPVNYLQAQMIDSNDINLSSDFLKVISSLVYSFLNNTMDYLEFIKYDKPIDTDKKYYKWLKAIFRNYSLDITETQEISNDTKIIPWIGRALNILNTNNSFVEEFKNLGPISLINKKENITIPKIKIPSSMLNFKDLSENLFNIYCKNNFYLKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMASKSVLAQEKLIKKLIQKQLRYLMENSNISSTNLILINLTTTNTLRDISNQSQIAINNIDKFFNNAAMCVFENNIYPKFTSFMEQCIKNINKSTKEFILKCTNINETEKSHLIMQNSFSNLDFDFLDIQNMKNLFNSYTELLIKEQTSPYELSLYAFQEQDNNVIGDTSGKNTLVEYPKDIGLVYGINNNAIHLTGANQNIKFTNDYFENGLTNNFSIYFWLRNLKQNTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFENDGLVFNIIDSNGNEKNIYLSNISNNSWHYIVISINRLKDQLLIFIDNILVANEDIKEILNIYSSDIISLLSDNNNVYIEGLSVLNKTINSNEILTDYFSDLNNSYIRNFDEEILQYNRTYELFNYVFPEIAINKIEQNIYLSILNFKPLKFKLLNQYVQKWDEVIFSVLEKYLDISTTNNRIQLVDNKNNAQIFIINNDIFISNCLTLTYNNVNVYLSIKNQDYNWVICDLNHDIPKKSYLWIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/toxin
molecule keywords Bontoxilysin A
publication title Molecular Assembly of Clostridium botulinum progenitor M complex of type E.
pubmed doi rcsb
total genus 271
structure length 1114
sequence length 1159
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 4zktB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4zktB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4zktB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 4zktB01
4EFPA 3BRFA 3PVNA 2DWRA 3IM5A 6I1BA 3ZXLA 3QIXA 1GSLA 1GGPB 4I8MA 4JP0A 3WNXA 2WJSA 1Q56A 1IKQA 1DHKB 2H0BA 1ULCA 2NZ9A 4X38A 2FGFA 4YG3A 2ZZJA 3WMUA 4I4OA 4P6AA 2ZGNA 4J2YA 1VIWB 2K4AB 3OGFA 5FNXA 1SLBA 3JU9A 4CTEA 4LO7C 4BOWA 1DYPA 1JQZA 1UN1A 3VKNA 3QW7A 3AP7A 4PC4A 4YW3A 5KXEA 3HMYA 4WV8A 4FOQA 1V6VA 3INAA 1TEIA 3SNVA 1ZA4A 5BQUA 1BYHA 1AX2A 2D3RA 3BWIA 3O12A 5DVHA 3AYDA 2EXJA 3O44A 3WG3A 2D6NA 4D69A 1E1HA 4ZKTB 4U36A 2A6WA 4LO3A 5JDBA 4YGEA 1UL9A 1VAMA 4Y24A 3O4AA 4FGFA 1S0BA 1NZKA 5DZEA 5GM0A 4LBOA 3SH5A 3N35A 1ISZA 1ZN3A 1FNZA 4YW5A 4WVWA 1RINA 4Y22A 2UWCA 4QBCA 1WUVA 4GA9A 3AZVA 4J2XA 2GDFA 2R9KB 3ZVXA 1JHNA 5F90A 3WHUA 2NTDA 1DQ2A 5T55A 1CPNA 4JC1A 3ILRA 4PBOA 2TEPA 2GNDA 1S0JA 4XTPA 5LK5A 1DQ6A 5DSSB 1MS8A 4ZGRB 2AH2A 5F8WA 1NUNA 1HWNB 3P6JA 2YUGA 1JUIA 4KEKA 1BZWA 1WLWA 4Y1VA 1MACA 3R4UA 1LEDA 4OZXA 1N3PA 2NN8A 2DVBA 3ILAA 2D6LX 5SV8A 7I1BA 1LENA 3UJQA 3H6RB 2GMMA 1T3CA 3AH4A 4KBBA 2A97A 4H55A 3BTAA 3FLRA 5HCAA 4Z8BA 3LSDA 1LOAA 2XG3A 2HYKA 1KITA 2ISEA 3CRIA 3V64A 1SLTA 3RQ0A 4XJZA 2FHRA 3AKGA 3S8KA 1V6JA 5CNAA 2IMCA 2G7NA 3B01A 1FN0A 4GP3A 5E24E 3DS9A 3APBA 2ZHKA 4QKSA 1S1AA 5H9QA 2Q3NB 1ISXA 4AYUA 3JRRA 3WDUA 1LOGA 3OYWB 2NVHA 2NMNA 4C1XA 4OWLA 1PWAA 4XBNA 3OJMA 5JOXA 4WZFA 3AXEA 3T2TA 1UZYA 1W6PA 21BIA 4ZA3B 1W6QA 1EPWA 1SBDA 1GNHA 3D5OA 5DUUA 3FBYA 3WVJA 5T50A 2IMAA 4BMEA 4YM1A 1WBLA 1V6XA 2EIGA 3BAUA 1ZL5A 3WV6A 3AKIA 1YYNA 5DUYA 3I4IA 1FQ9A 4XJAA 4BLJA 2KKIA 1KRIA 3T1LA 2ZAAA 4UW4A 3U4XA 5T5JA 3CA3A 2CYFA 2JD4A 2GNMA 3LCPA 1JT5A 1XZZA 1AXKA 1AXMA 1CE7B 4Q27A 2ILPA 4G6MA 1E0OA 3M3EA 2D3SA 4TYSA 4YZ3A 1XYFA 5FZUA 3BB2A 4P14A 4Q8LA 1W6MB 2P3IA 4AGRA 1HLCA 3HOMA 4YGBA 3PG0A 4XMAA 4USPA 1ENSA 4FPGA 3B00A 1I1EA 2DS0A 1WD3A 5CAZA 4DRVA 4YZ5A 4K1YA 1EVTA 5AVAA 3BAQA 3IM0A 3WHTA 4QC4A 4A7YA 1ISVA 4GWMA 1BASA 1V00A 2VXTI 1AVAC 2W08A 3E8LC 4P9YA 1BKZA 1AVXB 3AFKA 1APNA 2VW0A 1GV9A 5IK4A 4YGDA 3AP9A 1QDOA 4LO2C 1PC8B 4DRRA 1P63A 1YXWA 3FIIA 1XG6A 2FDBM 4HEVA 2YMZA 4JRAA 2ZGMA 3O4CA 2AGSA 3ZUQA 1IS4A 4D0ZA 3OGGA 3FJAA 3MW3A 5GLVA 4M3CF 1LGCA 2HWMA 3C89A 3ZXGA 4LBJA 1QOTA 1DJSB 2D43A 3N7KA 3HBWA 1I3HA 5EHAA 1JLYA 2WBCA 2GMEA 2FFVA 3N7JA 3C8BA 4I30A 4R6UB 4G6JA 3C9ZA 1YRZA 3FLTA 4J1LA 1Z7HA 5IK8A 2D7FA 5KXBA 1HCEA 3O0XA 4OEGA 2PHFA 2KH2A 1GNZA 1V6OA 2SLIA 1LGNA 4QO3A 4YM3A 4Z9WB 2AYHA 4ZBVB 3K1XA 2W39A 2J3PA 4KUFA 1HQWA 4I4YA 3B3QE 2G7KA 3H6RA 3FGMA 3AP4A 2V73A 3LSEA 1PZ7A 2PHXA 1C57A 3D7WB 1WBAA 5F8SA 1M2TB 3WA1A 3QYDA 3UD8A 3DDBA 3A0NA 4FPJA 1KJLA 2DVAA 2JJ6A 2DURA 2OVUA 4Q1PA 4YZ1A 1MS4A 2QN4A 4LO2A 3GALA 3O5WB 2V5YA 1YVGA 3FJHA 1MS5A 2D44A 1L2HA 1HQLA 1R8NA 3AZYA 4D8HA 3FJIA 4LO1C 1AX0A 4JKXB 4PF5A 1BQPA 3OPZA 2DVGA 3PVEA 1ENRA 3UDAA 2UWBA 3FLPA 1CQ9A 2RHPA 4DEPA 8I1BA 3OYWA 3BRGC 3WCSA 4YGCA 3ZYPA 3BODA 5IK5A 2IWTB 3C88A 2WKKA 3MW4A 1W6NB 3BA5A 1EV2A 2ZQOA 2C5DA 1VALA 1AJKA 2P3JA 3M1HA 1G8WA 5HPZA 2WQZC 4Q91A 5T5PA 1LGBA 1UZZA 1OQLB 4OW4A 2AREA 1NXD1 4OEFA 4OEEA 3ZSMA 4LBNA 1HWMB 2BEBA 5DZFA 3AYCA 1R1ZA 3IIRA 4XOGA 2ARXA 2EXKA 3CA6A 4JAWA 4LO8B 4I1BA 3QJ0A 4FOWA 4AGGA 1Q8SA 1LHUA 1N4KA 1YBIA 4Q2FA 4KEIA 4MYEA 3IM7A 1QQLA 5D61A 5FZYA 3IAGC 1FNYA 4DFSA 1IS5A 3V0BB 4L8QA 1W6MA 4FQZA 3VT2A 3Q7WA 1WW4A 3O49A 2D22A 4ZOTA 4LO1A 4I3NA 1QXMA 5HCBA 4ITCA 1GZCA 3NBEA 2ZMLA 3QW5A 1LOFC 4IQPA 1LULA 4IZXA 4PCRA 1YO8A 4AVVA 3A23A 4EEEB 2P2KA 1LHOA 3ZSKA 1Q1UA 2FO1A 4J2KA 4Y1UA 2Z48A 1QOOA 5FREA 2NP0A 2UWAA 2P34A 4GALA 3B9CA 3AH2A 3NWKA 1DGLA 1QDCA 1DQGA 4I1EA 4I96A 2AR6A 1AVBA 4BMBA 3MEPA 5JMCA 4YM0A 1GZ9A 3RMXA 2GZBA 3HN1A 1HWOB 4Y20B 3P6IA 3BX1C 1ULGA 5EXOA 1Y7BA 4P9XA 3ZSLA 4ZFWB 3MALA 4JKQA 2GN3A 2WRYA 4R9DA 4SLIA 4GKYA 3FJ9A 1SZ6B 2LIEA 1GYKA 4XHXA 4TZDA 4LBMA 3WOGA 3ZSJA 3W59A 3FJ8A 1N1SA 4Y26A 1MD6A 2CNAA 1YIFA 1F5FA 1C1LA 3CA4A 3UD7A 2D23A 4HL0A 1TP0A 3H6QA 4K21A 1ULDA 4YW2A 2EALA 1LOFA 3VKOA 3UJ4A 2W68A 1ILR1 9ILBA 1A3KA 5BXSA 5E88A 3JUUA 2KI4A 3VV1A 4F83A 4DS0A 3FJJA 4AWDA 1X50A 4XKIA 3CA0A 1ABRB 2D24A 2ZHLA 2JE9A 4J2SA 1ULEA 3O4OA 4AN6A 3CRHA 1MVEA 1JXNA 4PBPA 3VSFA 2A5ZA 1G9CA 2DVDA 3AH1A 1JOJA 4W65A 3IN9A 1W0OA 2Y9FA 2D6MA 2DU0A 5GJ6A 1SBFA 4USOA 2E4MC 2D3PA 3AZWA 3H6SE 1RIRA 1WW5A 3RMYA 3FJBA 4WBCA 1DZQA 1S0IA 3BOPA 1MC9A 2FFUA 1MS3A 1PUUB 2ENRA 4I7IA 4TLPA 1G9FA 4CZSA 1UX6A 1JYCA 1CESA 3S8JA 1TOOA 1PZ9A 1RZOB 4ZJXA 4EJ5A 1W6NA 4UW5A 2WT1A 4IONA 1W6OB 1IHKA 4AN7B 3CU1B 1OFSA 3LTQA 3K3QB 4YFWA 3ZYRA 3QR5A 4EL4A 2LTNA 5FNWA 3IKWA 1JY0A 3CAHA 3I8TA 2WSVA 4Z8SB 4FPLA 1GLHA 1BFBA 1B09A 3VT1A 4FPHA 2EAKA 5BXRA 5DZGA 3NJ5A 3POWA 1ONAA 2D6OX 3M2MA 2D7RA 1KDKA 4H04A 5DUVA 1R8OA 5E8AA 1FAYA 1Z78A 2ZHNA 41BIA 2R0FA 3A4UA 3V0BA 1LJ7A 3I2AA 2A8AA 1FV2A 1DZCA 2E4MA 5DXDA 1D2SA 1Z4SA 2AXMA 4D0TA 4DCKC 3FFZA 4XXAA 2AUYA 1S0CA 4P0JA 3WDYA 1DIWA 3N7LA 4EFRA 1DQOA 2R1DA 1ISYA 5EYXA 4QBVA 1CVSA 1G9DA 1UKGA 1HCDA 3AJ5A 3MW2A 5BQMB 4XJWA 3USUB 3VKLA 2ISHA 1WLDA 4FPYA 1DFCA 2ZA9A 4QD2B 3F62B 2R1BA 3N36A 1LECA 4ISQA 4XJUA 3O3QA 1H9PA 4LBQD 1T4QA 2A6YA 3N7MA 3FIEA 3WDWA 2KLLA 3N3HA 4I4XA 1HKNA 3UD9A 2CTVA 1FGAA 5T52A 1BA7A 1QNWA 5GLUA 1MS9A 4OUJA 3I2XA 3OJ2A 1Q03A 4A7ZA 1VCLA 1QMJA 2GN7A 2JECA 4Y20A 2E7QA 4FQ4A 2L5XA 2JKBA 1FATA 1AXZA 1O4ZA 4X39A 4IY9A 4Y1ZA 2DVFA 4QKRA 3PVOA 3BOOA 1XHBA 3FJDA 1Z2VA 2ZGSA 2UUSA 4CRQA 2IHOA 4FVVA 1FYUA 4XTMA 1MVQA 1IOBA 2C9AA 4Q9GA 3AJYA 3I29B 5GAQA 1HKDA 2Y9GA 2MC2A 4ZFUB 2PHUA 3IMNA 3D4KA 1JW6A 1H9WA 1V6MA 2D6KA 3FJKA 4FP3A 4ASMB 5FZZA 1TTUA 1LTEA 1JT3A 3ZUSA 3AZZA 5HCFA 4RL7A 4FPCA 4FOYA 3WO2A 2E51A 4A7KA 5JOYA 3RSJA 3CA5A 4XIKA 1IS3A 1LU1A 2GMPA 1G7YA 1ENQA 1G86A 1PZ8A 2YY1A 1WBFA 1Z0HA 2Z42A 2VY0A 4HA2A 3CRGA 2AQZA 5BP5C 3O0WA 4YOLA 5GZFA 1T9FA 5GLWA 3BONA 4IY8A 4IZEA 1YTOA 2A6ZA 5CBLA 2DUOA 5CB7A 1HDKA 1CJPA 2VXRA 1W0PA 3D6EA 1RITA 1IRAX 3VWCA 1ZKWA 1LOEA 1VAVA 3ZC8A 4I4VA 4F34A 2JDZA 2VLCA 4QD2C 5BQNA 3AX4A 1MS1A 1LU2A 2A7AA 1W6OA 1Q8VA 1S0DA 1Q8QA 1KQRA 2UU8A 4Q26A 4XBLA 2HWAA 2FMDA 1CONA 1AVUA 1JLXA 4FPOB 3NV1A 5T5OA 3Q7YA 4I0YA 4ATEA 3MPPG 3BA4A 2E7TA 1S0GA 3NBCA 2XHLB 2B7YA 4XXPA 1WLCA 1V6NA 2A3YA 2LALA 4GOYA 5F5QA 2Y9WC 4JQ0A 4NO4A 1CIWA 4R9AA 2P39A 31BIA 3A0KA 1N1VA 4G9MA 1TFMB 1SCSA 1FWUA 3POYA 2VU9A 1I1BA 3BAOA 4ELCA 5BP5A 1YI7A 4U2AA 1FMMS 2VSAA 3VUOA 1J0SA 1W3AA 3WG4A 3A22A 3FJCA 3D3XA 5DUXA 1G82A 3QW8A 4XHBA 2ERFA 5F9TA 5H9RA 4M3CB 4XFSA 3POKA 1OQ1A 2GO2A 2A70A 3USUA 5BQMA 2D7IA 2ZMKA 3NBDA 3WINC 1A8DA 1FMZA 3M3CA 3OJVA 1N1TA 1N3OA 4L4IA 1MS0A 5CA6A 3WMVA 1W3FA 2G7QA 1SLCA 5G00A 3BA7A 3TAYA 4EFQA 3ZC9A 5EG6C 3VKFC 4LO0C 4YZ2A 2RG9B 1URXA 2PHTA 4L4HA 3DGTA 2NM1A 2MIBA 2E6VA 3WDVA 4XZPA 5DG2A 1CR7A 2ETFA 2ARBA 1RY7A 1CPMA 1AZDA 2WNEA 2RQ9A 3RRDA 3NF3A 3QLQA 2A6XA 4UW3A 3L2YA 3WO4A 1QOSA 3DSEA 1DBNA 4R9CA 2DRZA 3AXDA 3ZX7A 1ZB7A 1QF3A 4XFTA 3NBNA 3RG0A 4X37A 3V0AB 3AKHA 4Q1RA 2NMOA 5EWSA 2ZMNA 1NLSA 1JYIA 1GKBA 5IK7A 2CWSA 4BPZA 1XQNA 1J1TA 3ILNA 4HJJA 4J23B 4P0KA 4XILA 4KEJA 5GZGA 1MZ5A 3O4BA 1GBGA 2I1BA 1LEMA 1D0HA 3KM5A 3W9TA 1ZKXA 1ONKB 1RG8A 1U0AA 2K43A 2OW4A 1CN1A 3FJFA 2AAIB 3B9UA 3WINA 2W2DB 4KS6A 1DQ0A 5BVPI 1QGLA 1HIBA 3NV3A 4YG0A 3LLPA 3BAGA 3WZ1A 1II4A 4II0A 1SLLA 2ES3A 2Q9XA 1W3GA 1C4RA 3VEQA 4LO0A 3OBRA 5KXDA 2DUPA 1LHVA 1PUMB 1BXHA 3AYAA 2M49A 3BADA 4XE9A 3FUOA 1BFFA 3TC2A 5DUWA 4ATFA 2DTWA 5GLTA 2F2FC 1OKQA 4YFZA 1IRPA 4GWNA 3M3QA 4Y1XA 3GNEA 2VH9A 4XBQA 3AP6A 3AJ6A 5JOZA 2ZGLA 4AVTA 1SLAA 2VSEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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