4ZY5A

Crystal structure of p21-activated kinase 1 in complex with an inhibitor compound 17
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
292
structure length
283
Chain Sequence
EEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFKIGQGASGTVYTAMDVATGQEVAIKQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRNIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PAK 1
publication title Structure-Guided Design of Group I Selective p21-Activated Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 283
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4zy5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4zy5A01
3MH0A 3FL4A 3UGCA 2YM4A 4YHTA 4RIXA 3F3UA 3LFBA 4FTKA 4JLCA 3UDBA 3ZDUA 3NAXA 4DEGA 5HTBA 4O7VA 3R9OA 4EEVA 4O0XA 5HBEA 3HP5A 4AZSA 2Q83A 4U0IA 3RJCA 4GU6A 4E4NA 2R3HA 3AC2A 3SQQA 3FKNA 5G6VA 3DQXA 3KB7A 3ZRMA 2RKUA 4DEDA 4NIFA 5BUIA 4CKRA 3VBTA 3AGMA 3HV7A 5IH6A 3ZUUA 4QPMA 4UMTA 5KBQA 3CTQA 3R28A 4R7HA 4YTCA 1Y8YA 4ANOA 5DRBA 4I93A 4JDJA 2Y8OA 5CF6A 3HDNA 4Z16A 3ZO3A 1OVEA 3VBXA 3CCNA 3DDQA 4NWMA 5EDQA 2R3RA 1MRUA 4DEBA 3NUSA 3UZTA 4FBXA 5HD7A 3CQEA 4UY9A 3UMWA 3W2PA 4DFBA 3COIA 3I81A 4TWPA 1ZYCA 2I0EA 3QUPA 3I5NA 5FEDA 2R3JA 5KHXA 1W0XC 2XIZA 5IMEA 2YIRA 4IC8A 1VYZA 2JGZA 5M56A 1M2QA 5JGBA 2JFMA 1WFCA 3R7GA 4ZJJA 3QA8A 4LRMA 3WF9A 1SMHA 3CTHA 3B2TA 3EQBA 4FL3A 4QMVA 2CNUA 4GEOA 3SDJA 5DT3A 3W16A 5T3QA 3G0FA 2RF9A 4XV2A 5J5TA 5LCJA 2NRYA 4R5SA 4IJ9A 2DWBA 1XQZA 3FHRA 2UVYA 3EN4A 1RE8A 5EM8A 2J0KA 2XIRA 2XK9A 2XM9A 2H34A 2VTTA 3HUCA 5AM7A 4C62A 5BQ0A 2UZVA 3OCBA 3DKOA 3UZRA 4HPUE 3SKCA 3L9LA 4WSQA 3VUHA 4DITA 3C13A 5FXRA 2GSFA 2PMNX 4FKGA 2PZIA 2Q0NA 2YM6A 4I1ZA 1Q62A 1JPAA 3IDPA 3ACJA 3POZA 1R3CA 3QBNA 4CKJA 5K0KA 5BVKA 4PQNA 3RPYA 5I9ZA 4XV3A 1SNXA 3KU2A 2WTJA 1DAYA 2AC3A 5ANKA 3GENA 4A7CA 3VS3A 4IEBA 3TV6A 4C7TA 4U5JA 4XCUA 3QQFA 3GFWA 4ANNA 2F7ZE 4XP0A 3BV2A 3R21A 5DNRA 3I7CA 3NNXA 4CCUA 4I0TA 3HZTA 4J52A 1CKPA 4LYNA 3FXWA 1RJBA 3PP0A 5A3XA 3TNWA 2W4OA 4U45A 4X3JA 1PMNA 4OAUC 1GIHA 2HY0A 1BYGA 2XNEA 2J50A 5I9VA 3TUDA 3UPZA 5DA3A 4YJVA 3VWAA 4DF3A 3A7GA 4IX5A 4FNZA 1YOJA 1ZLTA 3BE2A 4JRVA 3VW6A 5BMMA 3QAME 5HQ0A 3LVPA 4ZY4A 5BYYA 1V1KA 3EQDA 3Q96A 3FLZA 4I21A 4DBNA 3LCTA 3DCVA 5CSVA 4LG4A 4XG6A 4IW0A 3KRWA 3COHA 2QO7A 3CKXA 5ETCA 3IW5A 3BU5A 3NLBA 3DA6A 5JRSA 1ZZLA 4BTMA 3A62A 4NEUA 4RJ5A 4WNMA 3QKKA 4FKJA 3PPZA 1J7IA 3F5PA 4ZAUA 4H36A 3KULB 3LXKA 3JY9A 3CEKA 4JAIA 3AD5A 3L9PA 4JBVA 4JX7A 3WZJA 2BZKB 4TYIA 3LJ1A 4IVBA 4MK0A 5BUEA 3OS3A 2YAKA 4GFMA 3F2RA 4KIPA 3SLSA 4USEA 3OP5A 2QOQA 3BPRA 4FKVA 3DBFA 4QQCA 3VS1A 4BVUA 4D1SA 2HIWA 2ITPA 3SHEA 2R9SA 4IAAA 4G3CA 3ZSGA 1NXKA 4G31A 3AXWA 3W32A 4XX9A 4UXLA 4HYUA 5AUYA 4BIEA 2VTRA 3I0OA 3LFNA 4KBCA 3RWQA 2JEDA 3PVBA 1PYXA 2VTSA 1NVQA 1KE7A 1QL6A 2GFSA 5FG8A 2FH9A 4KD1A 4WUAA 2X0GA 5HVYA 3VJOA 1CSNA 4L45A 3Q9ZA 5K9IA 2V55A 3EIDA 5FP5A 1ZYDA 4IXPA 3TUBA 4WIHA 3GC8A 1V0BA 4OTGA 2E9UA 3PFQA 3R7UA 3MH1A 3W2RA 4IAIA 3EFKA 4XG4A 4MCVA 4RX5A 2ONLA 2G2IA 2BKZA 2E9VA 4MHAA 5J7BA 2BVAA 5HIBA 4QT1A 1FVRA 3ZDIA 4ZSLA 4IH8A 4QP1A 1W98A 4O91A 3EH9A 4QPAA 5AAEA 3CR0A 3EKKA 5CXZA 3QTZA 4DBXA 3E8EA 4O0RA 4CNHA 4W8EA 2C30A 3UE4A 5E8ZA 2CN8A 3R6XA 3GEQA 4IZAA 5DMZA 3C4WA 2W4JA 5GZ8A 2B52A 3MVMA 1KUTA 4FMQA 1SYKA 3ENMA 4FEXA 4GKHA 5DN3A 2XEZA 3D2IA 4IVAA 3F69A 3MJ2A 5EG3A 3DXNA 3PSCA 1M2PA 4G5PA 4WOVA 3HL7A 4EC9A 3ZCLA 2PK9A 2QHNA 3P78A 4EH6A 4A4XA 4DEIA 4H58A 3G6HA 3ZTXA 4AOTA 5F9EA 4RJ8A 4APCA 5CAQA 3ORXA 3C5IA 3JVSA 5DHJA 4PL5A 3PUPA 4D2SA 3RTPA 2W99B 4BBMA 4EHEA 1Q61A 5E8XA 5CLPA 4TYEA 2R2PA 2HY81 3O50A 5IKWA 1ZARA 3BE9A 3EMGA 4OBOA 2JD5A 4IB5A 4BGGA 4FEWA 5L6PA 1I44A 1WBNA 5E8TA 4OUCA 3Q5ZA 2PTKA 4FL2A 2UW8A 4GYIA 3O51A 3RAHA 1W83A 4F08A 5D1JA 4CZUA 4PDSA 3A7FA 3QXPA 4G6OA 2QC6A 4F99A 4S34A 4ZP5A 3IDCA 3Q32A 3PJ1A 3DK7A 4KSPA 3BEAA 4ZTLA 4KABA 4NM7A 3NEWA 5J8IA 3DNDA 3W10A 1ZY5A 1UNLA 5LQFA 1LEZA 3L8VA 4N0SA 1WCCA 1OPLA 4EHGA 4NCTA 3FEGA 5CSXA 5CZHA 1O6LA 5IA0A 5L2TA 2O5KA 3R04A 4RIWA 2GNGA 3D5UA 2Z7RA 3LCKA 3VN9A 3CJGA 3ZBXA 3F82A 3QZFA 4O7SA 2YN8A 3NR9A 3U9CA 2GNHA 3FHIA 3AC3A 3PJ3A 5J87A 2CKEA 3HAVA 4YP8A 4DGGA 3PY3A 4PMMA 2IG7A 1YHVA 4KIKA 5IA5A 5ANDA 4CXAA 4F7JA 4BCIA 4DGLC 3D7TB 5HO6A 1YXTA 4EOOA 2XRWA 1BI7A 2PHKA 3MVHA 4CD0A 4F0GA 5L2SA 2DYLA 4FKWA 4Y95A 3GQIA 5C27A 4O84A 4RC3A 1P2AA 2E2BA 4UZHA 5HLNA 1GAGA 3LFQA 4IHPA 3ZONA 1K3AA 5AADA 3N9XA 2ITUA 2IVTA 4MAOA 4EZ5A 2Z2WA 1ZY4A 1ZMUA 3TV4A 2GNFA 3ZH8A 1OIRA 4FT7A 4QQ5A 4FSZA 3VS4A 3FYJX 4MXZA 1J1BA 1CDKA 2YIXA 5D12A 1BLXA 3L8SA 1GIJA 1JAMA 3MW1A 1OZ1A 4S32A 3MESA 3PA5A 3MIAA 2WMWA 3LFAA 4RIYA 4BTFA 5D7AA 4JX3A 3LCSA 4IWQA 4F0FA 5JRQA 2YWPA 2X7OA 3LPBA 2OKRA 4TL0A 4Y73A 5KMJA 2QOLA 2WIHA 4DFNA 4R3CA 2GNLA 3VUKA 1YDSE 4GG7A 4AZEA 4G1WA 4IM3A 2Y4IC 2IVSA 4FL1A 3FUPA 4O22A 2C6LA 4BDIA 4FT5A 1WMKA 3MFSA 3HUBA 4FSRA 4FTNA 2W5HA 2XYNA 1FINA 3O7LD 2WAJA 4E6AA 4FSQA 5JQ8A 4DGOA 2OH4A 4DYMA 1ZYJA 3QC4A 4L7SA 1P14A 4NL0A 5DEWA 1R1WA 4BY9E 2W0JA 2YCSA 4CFUA 2JBOA 2W17A 4NJ3A 5AIKA 2W5BA 3DT1A 5BNJA 5LJJA 2ZDUA 5KHWA 2WQBA 3CD8A 3ULIA 1H25A 4IVDA 5DT4A 2C5NA 3QKLA 4U8ZA 4UX9A 4D2TA 4L3PA 2GTMA 3EQRA 2LGCA 1GNGA 2WTKB 3I0QA 3QKMA 4OTFA 4IIRA 3WE4A 2CKOA 3OFMA 4YZNA 1P4FA 4QMLA 2GS2A 2QG7A 5FEQA 4RVLA 1OL1A 4GFOA 2O65A 2FSTX 3IW6A 3R01A 4ZLOA 1OBDA 2HELA 3DJ6A 3OCGA 4XUFA 3VHEA 1WBVA 3LJ2A 4NKAA 3V5QA 2Z7LA 3GB2A 2XJ2A 3VUGA 5HICA 4TKSA 2QI8A 3KN6A 1KOBA 1X8BA 3HEGA 3TTJA 3D7TA 2HZNA 1BMKA 3PXKA 5BVWA 4CTBA 5H9BA 3MI9A 2YZAA 2J0LA 4U80A 1GZKA 3E8NA 5E8VA 2C5XA 1PXNA 4RBLA 3OEZA 3ZSHA 3SW4A 1OKYA 4FSNA 2YM7A 1U5RA 2CNVA 4YURA 2UVXA 5EYKA 4NKSA 3TV7A 4ERWA 5KMMA 3R9DA 5FTQA 3UG1A 2QODA 4E6QA 2Q0BA 3HMMA 3SX9A 3NDMA 1OPKA 1MUOA 2H96A 4FIEA 3G9NA 4D2RA 5EW9A 2ZV7A 3C4CA 5DG5A 5I9UA 2C4GA 1MQBA 3F66A 3FZTA 4YNEA 4XG9A 2P4IA 5KKRC 5LVNA 3NW5A 3U54A 2XIKA 5TO8A 3VRZA 3H4JA 1Q24A 2W1CA 3VUTA 3ZC5A 3V8TA 4USFA 4QMYA 1Q3WA 3FPQA 3ROYA 2Z7QA 4BCNA 3QGYA 3F5GA 4GFGA 4DFYA 5GIOE 3RMFA 5GNKA 3ZC6A 5J9LA 4RWKA 3TM0A 2A0CX 5AP2A 5DIAA 2O8YA 4WO5A 4DCEA 4G9RA 4ANSA 5J9ZA 3O7LB 2SRCA 1G3NA 3LLTA 4EOIA 3ZXTA 3UO5A 4O27B 3S3IA 1DI9A 4NYEA 2QOFA 4YSJA 4O83A 3QC9A 3ZZEA 1B6CB 3D5WA 4R3PA 3QF9A 1FGIA 1W8CA 4RLKA 4I3ZA 4OW8A 5B7VA 2R3KA 1FGKA 3L9NA 5HESA 3M42A 3HGKA 4LUEA 5CENA 5AAFA 4D2VA 3FLNC 3U55A 4NUSA 3SG9A 5AUXA 3FMNA 2OIDA 3ZO2A 3ZUVA 5JFXA 1F3MC 4MXAA 2VTHA 3BX5A 5CXHA 2UW6A 2BUJA 4BZDA 4MXOA 2UZEA 4J95A 4TY1A 3RZBA 4KUJA 3QX4A 4LQMA 5GJDA 5F4NA 3L9MA 1FPUA 4ID7A 1P4OA 2VX3A 2ZVAA 3DNEA 3KCKA 4CRSA 1PMUA 4E4MA 3B8QA 4NTSA 3GT8A 2X9FA 3F5UA 5CSHA 3BWJA 4FTMA 3QFVA 2UW4A 2VO3A 1YOMA 4C0TA 2ZM4A 5CSWA 3R1SA 4FUXA 5HHWA 2VN9A 4TYHA 1A48A 2NNWB 2R7BA 3DQWA 5IQHA 2WMQA 5EDPA 3MV5A 2YEXA 1M2RA 4R1VA 3WF5A 3ZM9A 4FK6A 2GDOA 4FGBA 2R3FA 2IZUA 4AQCA 5EKOA 4EBWA 5EQEA 4JIKA 4CT2A 4GW8A 3LKMA 4HW7A 3NUUA 3R9HA 1Y6BA 4O38A 5HVKA 5HNIX 5AP0A 4UMUA 3R7OA 2XCKA 4DCAA 5KMNA 2BTRA 2P55A 3NS9A 3QLFA 4FSUA 2B54A 2OH0E 5CWZA 4DFXE 3ZLWA 5I9WA 5JQ5A 4E5BA 2BRBA 1OL7A 3UOLA 3BU6A 4EYJA 2IO6A 1AD5A 3CQUA 5K3YA 4QTAA 3ZXZA 5JEBA 3DU8A 1UVRA 3LFCA 2XVDA 2QOKA 3QQLA 5D10A 2UW0A 2OJ9A 4P7EA 5LVMA 4GU9A 2BIKB 4Y5HA 5AWMA 2XK8A 4CV8A 1Q8TA 3ULZA 3EQPA 2OXYA 4ANBA 2ITTA 2W1DA 4UMPA 3H9FA 4R77A 3UVRA 2XH5A 5AP6A 5TKDA 2BKKA 1SM2A 4FTAA 2CNQA 2JLDA 3ODYX 3OT3A 3PG3A 5D41A 5K4JA 5A4TA 1T46A 2YWVA 4RX7A 3RPVA 5L8JA 5IA1A 1WAKA 4AWIA 1UU8A 3WARA 2CKPA 3IW4A 4YZBA 4DGNA 2FSLX 4H1MA 1YXUA 4DGMA 2HK5A 5K0XA 3NWWA 4NH1A 2ITZA 4I41A 4L46A 4XMOA 5I3RA 4AZVA 3UPXA 2R0UA 1A06A 2XKFA 1FMKA 4FV6A 4M8TA 4PDPA 2O2UA 3FPMA 3SG8A 5K5XA 1O6KA 4BC6A 5M4UA 2XNMA 1OBGA 4I5MA 3T3UA 2W06A 4JBQA 3GBZA 3PIXA 4JI9A 1Q99A 4Q5HA 1K9AA 4M3QA 4J8MA 3IQ7A 4YR8A 1OUYA 2ITOA 4M15A 4TTHB 3PVGA 3LFFA 4GT4A 3ZLXA 3G51A 4OTHA 4FKIA 5E8WA 3F88A 3JYAA 3ETAA 1CKIA 3QUEA 3R0TA 4GUEA 2PSQA 4JBOA 4XLVA 1PXKA 3N4TA 3Q5IA 3DLZA 5HI2A 4EONA 3NW7A 2VZ6A 1WBOA 4U81A 4O7WA 3PZHA 4O1OA 3RHKA 2J0JA 4UMQA 3EQFA 4H3QA 5EYMA 3VBYA 4BYJA 5D11A 4PUZA 4ZMFA 3U4UA 4RQVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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