4CA2A

Engineering the hydrophobic pocket of carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Engineering the hydrophobic pocket of carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1991-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4ca2A00
4KP8A 2X7SA 3M2NA 1ZSBA 1G45A 1CCTA 1CAIA 2IT4A 1CAMA 3JXGA 4QK1A 5EOIA 1RAYA 3RYXB 5JDVB 1RJ6A 5CJFA 1BNTA 1KOPA 4WR7A 1ZGFA 4DZ7A 5DSKA 3MNKA 3KWAA 4WL4A 4E3DA 1ZGEA 2Q1BA 2GD8A 5L3OA 2EU3A 5JG5B 1CNGA 4RUXA 3UYNA 3PJJA 5FL6A 4L5VA 9CA2A 4HU1A 1V9EA 1KEQA 1G4JA 1I9QA 4QEFA 4CA2A 1RZAA 4QK3A 4MLTA 3IEOA 3W6HA 2X7TA 4KAPA 4KV0A 1I91A 5FNHA 2NWOA 3FFPX 5EKJA 1CZMA 3S71B 4MDMA 4ZWYA 2GEHA 3MHOA 3S78B 3M1JA 2FOVA 3HLJA 4Q6DA 2POUA 3DCSA 4Q90A 5SZ0A 4YXIA 1IF9A 3U47A 3KKXA 3MYQA 3C7PA 4IDRX 3P3JA 1MOOA 3DD8A 3S72B 1Z93A 3M2XA 3MZCA 4XE1A 5DRSA 3P44A 3ZNCA 1KWQA 3M04A 3SAXA 1TE3X 3ML5A 4YGFA 5EHVA 1CNKA 5CACA 5E2RA 4Z1NA 5JQTA 5J8ZA 3MNIA 3RZ5A 3T5UA 4MTYA 4LHIA 5AMLA 4Z1KA 1FQRA 4YGKA 3HKUA 3M1WA 5FLOA 1FSQA 2FNMA 3L14A 4UOVA 5FL4A 1JD0A 4JSAA 1G0FA 1Z9YA 4JSZA 5E5UA 3FW3A 4HBAA 5FLQA 2X7UA 5FNMA 4CQ0A 3F7BA 4JSSA 3W6IA 4QJWA 1HUGA 1IF7A 3DCWA 1G52A 3D8WA 3CAJA 4C3TA 1TTMA 5EH7A 4FVOA 1FSRA 3S74B 2FNNA 5L6KA 5FDCA 1CCUA 4M2WA 3S76A 4GL1X 2VVBX 5DSRA 5FNIA 3MNJA 1G53A 3MHMA 3U3AX 1TEUX 1ZE8A 4CNRA 5JEHB 2H4NA 1FQNA 1CAYA 3U7CA 1AZMA 3M40A 3DC3A 3RZ0B 3MNHA 1ZSAA 1DCAA 1CNBA 1FQMA 1CNIA 3IAIA 4Q07A 3MHCA 4Q81A 5DOGA 3M3XA 3OIKA 4JSWA 2HOCA 4ZWXA 4QSAA 4XIXA 4KP5A 1BNMA 8CA2A 4FIKA 1I9MA 1MUAA 1HCAA 2NWYA 4QTLA 3GZ0A 1J9WA 5JQ0A 3BL1A 1AVNA 4YVYA 2NNVA 1ZSCA 4Q8ZA 5BRWA 1CAZA 4FRCA 4E3HA 1CNXA 2NMXA 4Q8YA 4TWLA 4HF3A 4WUQA 4WW6A 4Y0JA 5DOHA 3SBHA 5SZ5A 4XIWA 2HFWA 5FNJA 4Q99A 4WUPA 5BYIA 4RN4A 1IF4A 4K1QA 4XZ5A 3P5AA 4QIZA 5DSPA 1CAOA 3PO6A 1CRAA 3RYZA 4G7AA 4FU5A 1BNWA 1CNCA 1ZFQA 1BZMA 4KNJA 1CVDA 3RGEA 4HEYA 3QYKA 1CVAA 1XPZA 1I8ZA 2HKKA 2VVAX 1HECA 3V3FA 2QP6A 2ABEA 1XQ0A 2FOQA 1BNVA 1KWRA 1CNHA 1JCZA 4K0SA 3U45X 3HKTA 3T84A 5JG3B 3D93A 1DMXA 3IBNA 3JXHC 3P3HA 3HKNA 3P55A 5DSIA 4YGNA 3IBIA 3HS4A 1RAZA 3IBLA 1UGBA 4BF6A 3K2FA 4CACA 3D9ZA 4YGJA 1AM6A 5E5RA 3M1KA 2WEHA 1H9NA 1UGAA 2NXRA 1IF6A 3RLDA 4DZ9A 2WD2A 2CBAA 1BNQA 1RZDA 3T5ZA 3V2JA 2W2JA 1KOQA 2WEOA 2CA2A 1CVEA 1CNYA 3IGPA 3B1BA 4FL7A 3S8XA 1TBTX 5C8IA 2ZNCA 2OSFA 4CNVA 5DSJA 4R5BA 3DVDA 1BICA 3MNUA 4Q87A 3IBUA 3V5GA 3RZ7A 1CA3A 3S75B 3OIMA 1YDAA 3Q31A 1CAJA 1T9NA 3NI5A 5EIJA 4YGLA 5SZ4A 4MDGA 3V7XA 4M2RA 5DSOA 3OILA 4TWMA 3V3IB 5IPZA 3RJ7A 1ZH9A 4ZX1A 3M98A 1CILA 1CVBA 1RJ5A 4PYXA 5FNLA 3TMJA 1YDDA 1BN1A 3B4FA 5FNKA 4QY3A 1BN3A 1XEGA 3SBIA 1Z97A 2NWZA 3DD0A 4COQA 1UGFA 3KOIA 4E3FA 1THKA 4Q6EA 1G4OA 4MLXA 2NXTA 5FNGA 3RZ8A 4Q78A 1YO1A 5AMDA 3RYYA 1TG9A 1ZNCA 1UGDA 1G46A 3K34A 1HUHA 3TVOX 2AX2A 2FNKA 3DAZA 3BETA 1CVCA 2NN1A 3DCCA 4Z0QA 4YYTA 5FLSA 4RIVA 2NWPA 5BNLA 4PXXA 3OKUA 2WEGA 3BL0A 3V3JA 4M2VA 4L5UA 3NJ9A 4WW8A 1CRMA 4QSJA 3MNAA 1CVFA 2NN7A 5E28A 4PYYA 1DMYA 4PQ7A 4Q49A 2FOUA 4BF1A 1FR4A 2CBBA 5FL5A 4Q0LA 4LP6A 5EH8A 2AW1A 3M67A 3MWOA 4ILXA 4Q7WA 3M1QA 1TB0X 4MDLA 7CA2A 4Q9YA 1FR7A 1BNUA 2EU2A 5E2NA 4RUZA 1OKLA 3DA2A 4Z1JA 5JEPB 1JV0A 1BCDA 2CABA 4RFCA 5BRVA 1IF8A 4HEZA 3CYUA 4QJMA 3RYVB 2POWA 1IF5A 3ML2A 4K0ZA 3F7UA 1TH9A 4Q7VA 1H9QA 5JGTB 3JXFA 3MHLA 2FOYA 5FDIA 3F8EA 4HT0A 12CAA 1FQLA 1H4NA 1LG6A 1UGGA 4Q09A 3R16A 3DC9A 1XEVA 2F14A 3EFIA 5E2KA 3RYJB 3M14A 3M5SA 1CINA 4KUWA 3V3HB 4QJXA 3HKQA 5SZ6A 6CA2A 3T83A 4Z1EA 2HNCA 2NNGA 3RZ1B 3V2MA 4YWPA 1EOUA 3CA2A 2O4ZA 4RIUA 4IWZA 4ITPA 4YHAA 4Q08A 1ZFKA 5EZTX 3FE4A 5DSMA 4RH2A 4N0XB 1CNWA 4KUYA 4Q83A 3P4VA 4R5AA 2H15A 3D92A 3D0NA 3OY0A 1G48A 4LU3A 1OKNA 1LZVA 3T82A 4M2UA 4Q06A 4E9OX 3N4BA 4CNWA 5JEGB 1CAHA 4HT2A 1HVAA 3T85A 5BRUA 1CA2A 5EHWA 2EZ7A 4G0CA 2HL4A 3DV7A 4RUYA 2HD6A 3S73B 3M2YA 5A25A 3S97A 3UYQA 3NB5A 2QO8A 1I9NA 4YXOA 3KIGA 5CLUA 3KOKA 4PZHA 1RZEA 2NNOA 4QK2A 3P58A 3KS3A 5A6HA 1I9OA 1BN4A 1YO2A 3OYSA 5CA2A 5JGSB 3DBUA 4K0TA 1YO0A 5DSQA 4N16A 2WEJA 3KONA 2QOAA 4ZWZA 4HEWA 1CIMA 1HEAA 3KNEA 4YXUA 3CZVA 1BV3A 3EFTA 5SZ2A 1G54A 5G0BA 5FLRA 5FLPA 4ZAOA 1CAKA 3TVNX 2WD3A 2CBDA 3P5LA 3DVBA 5DSNA 3M5EA 1F2WA 3OYQA 4QSBA 3R17B 3N3JA 3M2ZA 4QJ0A 5AMGA 4ETQC 3S9TA 2CBCA 1CALA 1HEDA 1LG5A 1RZBA 4QSIA 1G6VA 1UGCA 4Q8XA 1CNJA 4FVNA 1G0EA 4R59A 2FW4A 1CCSA 1OQ5A 4KNMA 3MMFA 4K13A 3MDZA 1V9IC 1G1DA 3SAPA 5LMDA 4MO8A 2Q38A 4E4AA 4E3GA 3DVCA 3N2PA 3RG3A 1CANA 1I9LA 3F4XA 4ITOA 1Y7WA 4X5SA 5E2MA 4BCWA 4L5WA 4CNXA 2POVA 5EKHA 3VBDA 5EH5A 3K7KA 5E2SA 3V3GB 3PYKA 4E49A 4KNIA 5SZ3A 1OKMA 3KLDB 1LUGA 5EHEA 2FMGA 2FMZA 2OSMA 4JS6A 2ILIA 4XFWA 1HEBA 3OKVA 1FLJA 2NXSA 4RFDA 3M5TA 4KNNA 5DSLA 4YX4A 1CVHA 5JESB 1FSNA 4QIYA 3ZP9A 1BNNA 2Q1QA 1TG3A 1A42A 2FOSA 3N0NA 1DCBA 1YDCA 3RG4A 4QJOA 5DVXA 4Q7PA 1I90A 1I9PA 1URTA 1YDBA 5G0CA 3HFPA 3LXEA 1HCBA 5G03A 3MHIA 1G3ZA 5SZ7A 4Q7SA 3S77B 4E5QA 4KUVA 1RZCA 5FLTA 4ZWIA 5SZ1A 1LGDA 5EKMA 2CBEA 4FPTA 1UGEA 3M96A 4ZX0A 5G01A 4QJPA 1TEQX 5HPJA 2NNSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4KP8 A;  2X7S A;  3M2N A;  1ZSB A;  1G45 A;  1CCT A;  1CAI A;  2IT4 A;  1CAM A;  3JXG A;  4QK1 A;  5EOI A;  1RAY A;  3RYX B;  5JDV B;  1RJ6 A;  5CJF A;  1BNT A;  1KOP A;  4WR7 A;  1ZGF A;  4DZ7 A;  5DSK A;  3MNK A;  3KWA A;  4WL4 A;  4E3D A;  1ZGE A;  2Q1B A;  2GD8 A;  5L3O A;  2EU3 A;  5JG5 B;  1CNG A;  4RUX A;  3UYN A;  3PJJ A;  5FL6 A;  4L5V A;  9CA2 A;  4HU1 A;  1V9E A;  1KEQ A;  1G4J A;  1I9Q A;  4QEF A;  4CA2 A;  1RZA A;  4QK3 A;  4MLT A;  3IEO A;  3W6H A;  2X7T A;  4KAP A;  4KV0 A;  1I91 A;  5FNH A;  2NWO A;  3FFP X;  5EKJ A;  1CZM A;  3S71 B;  4MDM A;  4ZWY A;  2GEH A;  3MHO A;  3S78 B;  3M1J A;  2FOV A;  3HLJ A;  4Q6D A;  2POU A;  3DCS A;  4Q90 A;  5SZ0 A;  4YXI A;  1IF9 A;  3U47 A;  3KKX A;  3MYQ A;  3C7P A;  4IDR X;  3P3J A;  1MOO A;  3DD8 A;  3S72 B;  1Z93 A;  3M2X A;  3MZC A;  4XE1 A;  5DRS A;  3P44 A;  3ZNC A;  1KWQ A;  3M04 A;  3SAX A;  1TE3 X;  3ML5 A;  4YGF A;  5EHV A;  1CNK A;  5CAC A;  5E2R A;  4Z1N A;  5JQT A;  5J8Z A;  3MNI A;  3RZ5 A;  3T5U A;  4MTY A;  4LHI A;  5AML A; 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