4FIKA

Human carbonic anhydrase ii h64a complexed with thioxolone hydrolysis products
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGAAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Synchrotron Radiation Provides a Plausible Explanation for the Generation of a Free Radical Adduct of Thioxolone in Mutant Carbonic Anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2012-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4fikA00
3U45X 1I9OA 4E9OX 3HLJA 4Q78A 3W6IA 4MDGA 1EOUA 1CAOA 2CBDA 1CVHA 3MNKA 3RG3A 3MHIA 3M67A 2FMZA 4QJ0A 5SZ4A 2FOYA 4K0TA 3PJJA 4CA2A 4COQA 4L5UA 1G54A 4BF6A 4CNXA 1BN3A 4JSWA 3F7BA 4Q7PA 1CILA 4FL7A 1G0EA 4YGLA 5EHEA 2EZ7A 1JV0A 3QYKA 1LG5A 4M2VA 3P5LA 5CA2A 3M1JA 4YYTA 3IBIA 1CVCA 1CA2A 4Q90A 1HEDA 2H4NA 3RYZA 3S71B 2O4ZA 2WEGA 5FLOA 5L3OA 3S76A 3OKVA 3D0NA 3P3HA 2NNSA 5EH7A 1BN4A 3NJ9A 4XIWA 2ZNCA 1CIMA 5BRWA 4IDRX 1MUAA 3ZP9A 1G52A 4Q7VA 4DZ9A 5G0BA 1KEQA 4X5SA 3T84A 5EH8A 2HNCA 3M3XA 4HEZA 5G0CA 3HKTA 3OIMA 3M5EA 1UGCA 5SZ5A 4G0CA 4IWZA 2W2JA 3NB5A 4QK1A 4L5WA 1BICA 3HKUA 1KOQA 3MHMA 4MLTA 5FNGA 5IPZA 1TBTX 4KV0A 4QK3A 3RYJB 4Z1NA 3V5GA 3DCCA 5DOHA 3K34A 3SBIA 3TVOX 3OYSA 2AX2A 4E3HA 4KUYA 4PQ7A 4ETQC 3U7CA 4QJWA 5DSOA 4Q8XA 5SZ3A 4K1QA 5AMLA 5JESB 1MOOA 2VVAX 5JG3B 5EIJA 2NNVA 1BNTA 3OY0A 1RJ5A 3M2YA 1FR7A 2X7TA 4YXOA 5JDVB 1OKMA 1TEQX 2QO8A 3DCWA 1LGDA 3JXHC 1FSNA 1T9NA 1I8ZA 3RYYA 1KWQA 2GD8A 3D93A 5E2NA 4KP8A 2HL4A 1FR4A 1YDBA 5DSQA 2POUA 5SZ7A 5E2KA 1G45A 2CBEA 4YWPA 3IGPA 5C8IA 5JG5B 5BNLA 3S75B 3EFIA 2QP6A 4WW6A 1Z9YA 5JEPB 4RIVA 2Q1BA 4RUXA 4Q99A 5E2MA 4XFWA 5DOGA 1ZFKA 2QOAA 4K0ZA 4Q87A 5FLPA 2FMGA 4Z1KA 5E2RA 4LHIA 4HU1A 1HUHA 3SBHA 5BRUA 1BV3A 3DCSA 4ZX1A 4WW8A 5E2SA 5CACA 1CAYA 4WR7A 1TG3A 1TG9A 4JSAA 4R5BA 3MNJA 1CVEA 1YO0A 3R16A 1CAIA 3RYXB 1CNBA 2OSFA 1CNIA 2NXTA 4ILXA 3MMFA 3GZ0A 5FNKA 3S74B 5LMDA 3CAJA 1CVBA 4YGJA 4TWLA 5FLQA 5DSMA 2NXSA 2CBCA 4ZX0A 4KNMA 3B4FA 1UGFA 1IF5A 3KOKA 1BNNA 3KS3A 1JD0A 1AM6A 3S9TA 4Q6DA 5JGSB 1RZDA 4QTLA 1CNKA 5DSJA 3S72B 1UGAA 1OKLA 5DSKA 3M2NA 5FNJA 3BL0A 5FDCA 4E3DA 4Q7WA 4E3GA 1Z93A 3V3IB 3RZ7A 1XQ0A 5EKMA 1BZMA 1FQNA 3F7UA 1CCUA 1I9PA 1F2WA 3M5TA 3BL1A 4K0SA 3V3GB 1CNHA 1ZH9A 3KKXA 4YXIA 4PYYA 1CNWA 1RZCA 3IBLA 1BNVA 2NMXA 1XEVA 4Q8ZA 4QJXA 3S97A 1G6VA 4E4AA 4QSAA 1HCAA 3KONA 3IEOA 3MHOA 3JXFA 5FLTA 4BCWA 5JQ0A 3M14A 1RJ6A 4PYXA 4HF3A 3HKNA 5FNHA 1YDAA 5CLUA 9CA2A 4N16A 4MDLA 4RUZA 5DSIA 1UGDA 5DRSA 5BYIA 1I91A 3M5SA 4KP5A 4CACA 5DSLA 1ZGEA 3HFPA 2WD2A 2POVA 5FDIA 4QJMA 1ZSBA 1CAZA 1XEGA 3S77B 3D92A 3M40A 5FLRA 2FOUA 3Q31A 1RZEA 5FNIA 1UGGA 2WEJA 4E49A 4E3FA 3MHCA 1CNCA 3M98A 1OKNA 3T85A 1YO2A 2HOCA 5AMDA 1KOPA 3KWAA 4QY3A 3OKUA 3BETA 4FPTA 4KNJA 4WUQA 4R59A 3T5UA 1CAJA 5FL5A 5HPJA 1BN1A 1CZMA 1YDDA 4JSZA 5EKJA 3RGEA 2FNNA 1G0FA 2CBAA 3P4VA 5E28A 1CA3A 3MNIA 3KLDB 4QSBA 5EHVA 4BF1A 5JEGB 1ZNCA 5DVXA 3P44A 5JEHB 3DVDA 1I9NA 4Z1JA 4Q81A 3K2FA 4R5AA 1Z97A 2OSMA 1G4OA 1BNUA 1IF6A 3KNEA 3MZCA 2POWA 2NN7A 2NN1A 1FQLA 3UYQA 2NWOA 1XPZA 1FQMA 4LP6A 3LXEA 3TMJA 4JS6A 4Q7SA 2ABEA 5EZTX 3SAXA 3P5AA 3DV7A 4KNIA 3KIGA 6CA2A 1CVFA 3RLDA 4YGNA 3HKQA 5DSRA 4Q9YA 5EOIA 4E5QA 2Q1QA 3EFTA 3M2ZA 1LG6A 3IBUA 3DD0A 4HBAA 4QSIA 3PO6A 3TVNX 4ITOA 2CABA 3W6HA 1ZSAA 2EU3A 4WUPA 3K7KA 3M1QA 4TWMA 2NWPA 1G3ZA 4MDMA 4JSSA 1CAHA 2NNGA 2X7UA 4KUWA 1AZMA 3MNHA 3OIKA 3L14A 3RZ8A 4FU5A 1URTA 1TTMA 5FL4A 5SZ0A 5DSNA 3RZ0B 3M2XA 4HEYA 4Q08A 3DVCA 2HKKA 1FQRA 1I90A 3MWOA 3KOIA 3ML5A 3ZNCA 4GL1X 3RZ5A 5EH5A 3R17B 1CINA 3RYVB 1LUGA 3FFPX 4HT2A 1TEUX 2Q38A 1HEBA 2HD6A 4K13A 2ILIA 3V2MA 3N4BA 2WD3A 1RZBA 4XIXA 12CAA 4ZAOA 4DZ7A 1BNQA 5JGTB 1ZE8A 4KNNA 3RJ7A 1YDCA 3SAPA 3CYUA 3RG4A 7CA2A 2NNOA 3N2PA 1CCTA 1LZVA 2WEOA 1CALA 1G4JA 1V9EA 3F8EA 3MHLA 4LU3A 4MTYA 4RFDA 3F4XA 1ZGFA 1BNMA 3M04A 4M2WA 2CBBA 4QIZA 3RZ1B 3D8WA 4YGFA 3MNAA 3DD8A 3N0NA 1IF8A 2CA2A 4HEWA 1FLJA 4RFCA 4YVYA 1G48A 4Z1EA 1IF7A 5E5RA 1RAZA 2GEHA 3M1KA 4FRCA 3T5ZA 1CAMA 3PYKA 4QIYA 3T83A 2FOVA 5G01A 2FNMA 1TB0X 4Q6EA 3JXGA 3FE4A 1KWRA 5AMGA 1CANA 1CVDA 4XZ5A 4FIKA 4G7AA 3V3HB 1CAKA 4QSJA 3M96A 1CNJA 3ML2A 1YO1A 4Q07A 4Q09A 3HS4A 3S78B 3V7XA 3P55A 1FSRA 1TH9A 5SZ1A 3UYNA 3DA2A 3T82A 4RH2A 1FSQA 1HUGA 4Q06A 4YXUA 1CCSA 3MYQA 3U3AX 4ZWZA 1IF9A 5SZ2A 4N0XB 4WL4A 4Z0QA 5JQTA 5DSPA 3OYQA 2H15A 4Q0LA 3IBNA 3V2JA 4Y0JA 5L6KA 1ZFQA 2FW4A 5FNLA 1CNYA 5FNMA 4PZHA 1JCZA 3V3JA 4C3TA 3M1WA 1HVAA 1RAYA 3DBUA 2NWYA 2FNKA 4MO8A 3S73B 4ZWYA 1A42A 1CRMA 3D9ZA 3N3JA 4XE1A 8CA2A 1OQ5A 4RIUA 1H4NA 4ZWIA 1V9IC 1DMYA 1HCBA 2NWZA 4M2UA 4QK2A 3VBDA 4QJOA 4M2RA 3DAZA 5EKHA 5CJFA 1HEAA 2AW1A 4CNVA 3DC3A 2VVBX 4YGKA 4MLXA 2NXRA 4CNRA 1RZAA 1H9QA 3MDZA 1CRAA 3V3FA 4YHAA 5A6HA 1UGBA 5BRVA 4Q49A 4RUYA 5FLSA 3OILA 3DC9A 4YX4A 4ITPA 4CQ0A 1CNXA 1ZSCA 2HFWA 4PXXA 4UOVA 3C7PA 3NI5A 4FVOA 4HT0A 3DVBA 1CVAA 4RN4A 4KUVA 2FOQA 4KAPA 5A25A 1I9MA 3MNUA 2WEHA 4QJPA 4ZWXA 1AVNA 3B1BA 3CZVA 5EHWA 2EU2A 5G03A 1DCAA 1Y7WA 1DCBA 4FVNA 1HECA 4Q83A 5SZ6A 1H9NA 3IAIA 1I9LA 3FW3A 4L5VA 4Q8YA 2X7SA 1G53A 3P3JA 3P58A 1BNWA 5E5UA 2FOSA 1THKA 2F14A 3CA2A 5J8ZA 1DMXA 1CNGA 2IT4A 1I9QA 1TE3X 3S8XA 5FL6A 1UGEA 4QEFA 1J9WA 1IF4A 1BCDA 3U47A 1G46A 1G1DA 4CNWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3U45 X;  1I9O A;  4E9O X;  3HLJ A;  4Q78 A;  3W6I A;  4MDG A;  1EOU A;  1CAO A;  2CBD A;  1CVH A;  3MNK A;  3RG3 A;  3MHI A;  3M67 A;  2FMZ A;  4QJ0 A;  5SZ4 A;  2FOY A;  4K0T A;  3PJJ A;  4CA2 A;  4COQ A;  4L5U A;  1G54 A;  4BF6 A;  4CNX A;  1BN3 A;  4JSW A;  3F7B A;  4Q7P A;  1CIL A;  4FL7 A;  1G0E A;  4YGL A;  5EHE A;  2EZ7 A;  1JV0 A;  3QYK A;  1LG5 A;  4M2V A;  3P5L A;  5CA2 A;  3M1J A;  4YYT A;  3IBI A;  1CVC A;  1CA2 A;  4Q90 A;  1HED A;  2H4N A;  3RYZ A;  3S71 B;  2O4Z A;  2WEG A;  5FLO A;  5L3O A;  3S76 A;  3OKV A;  3D0N A;  3P3H A;  2NNS A;  5EH7 A;  1BN4 A;  3NJ9 A;  4XIW A;  2ZNC A;  1CIM A;  5BRW A;  4IDR X;  1MUA A;  3ZP9 A;  1G52 A;  4Q7V A;  4DZ9 A;  5G0B A;  1KEQ A;  4X5S A;  3T84 A;  5EH8 A;  2HNC A;  3M3X A;  4HEZ A;  5G0C A;  3HKT A;  3OIM A;  3M5E A;  1UGC A;  5SZ5 A;  4G0C A;  4IWZ A;  2W2J A;  3NB5 A;  4QK1 A;  4L5W A;  1BIC A;  3HKU A;  1KOQ A;  3MHM A;  4MLT A;  5FNG A;  5IPZ A;  1TBT X;  4KV0 A;  4QK3 A;  3RYJ B;  4Z1N A;  3V5G A;  3DCC A;  5DOH A;  3K34 A;  3SBI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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