4JSSA

Human carbonic anhydrase ii h94d bound to a bidentate inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFDFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Metalloprotein-Inhibitor Binding: Human Carbonic Anhydrase II as a Model for Probing Metal-Ligand Interactions in a Metalloprotein Active Site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4jssA00
2ABEA 3RG4A 3N2PA 3EFIA 3M3XA 4HBAA 3L14A 5G03A 3F7UA 1CAKA 9CA2A 4E3GA 2NWYA 3JXGA 1CAJA 1CA2A 5G0BA 1IF4A 2WEGA 4YGNA 4YWPA 4QTLA 5EH7A 2IT4A 3M1WA 4CNWA 3DVBA 1HECA 3IBIA 3S78B 1HUHA 2EU2A 4CNRA 5AMLA 1AM6A 3S72B 2CA2A 4RH2A 4RUXA 3FFPX 3HKQA 4MDMA 5JQTA 3M40A 2FNKA 3MNKA 4E3DA 4XE1A 4HEWA 1G52A 3RZ8A 3M5TA 1CRMA 2QP6A 4YGLA 5FDIA 4MLXA 4Q09A 5FDCA 4PYXA 3D0NA 4BCWA 2HKKA 3M1QA 3BL0A 3MHMA 1V9EA 2WEOA 5EOIA 2GD8A 3V3HB 1ZH9A 4FL7A 4WW8A 5DOGA 3MZCA 5E5RA 1MOOA 4KNNA 1CVFA 2NMXA 4Q7VA 4HT2A 4QK1A 2WD3A 3P55A 3MHCA 2X7TA 5E2MA 2EU3A 2W2JA 1CCSA 1G45A 1I9LA 3R17B 1FQRA 1RAYA 4N16A 1T9NA 1ZSAA 4IDRX 3MYQA 5DSJA 1CVAA 3T85A 4Q87A 3P44A 3RZ0B 5DSKA 3W6IA 3ZP9A 4JSWA 3OYSA 2NXTA 1G4OA 5A6HA 2FMZA 4HEYA 3W6HA 4QJXA 2QOAA 4KP5A 5SZ5A 1I8ZA 1KEQA 4Z1EA 3M5EA 1RAZA 5FNHA 5JGTB 1HEBA 4DZ7A 2POUA 3U45X 1FQMA 1HEAA 4YXIA 3DCWA 4YHAA 3OIKA 5BNLA 1OQ5A 1TH9A 2HFWA 4L5VA 4Z1JA 1CZMA 2X7UA 3CYUA 3K2FA 3BETA 5G01A 3HKTA 1HVAA 1MUAA 1BN1A 3U47A 3HKNA 1THKA 4MTYA 4YXUA 4Q0LA 3N4BA 4HT0A 3DVDA 4Q78A 3Q31A 1I9MA 3KOIA 4FVOA 1CAHA 4JSAA 1AZMA 3KS3A 3GZ0A 4QJWA 2HL4A 5FL6A 3R16A 4QJ0A 3RYVB 5DRSA 3D8WA 2VVAX 1CAYA 5E2KA 1CVDA 1CCUA 2Q1QA 1XEGA 3IBUA 3S71B 3KLDB 5FLOA 1BN3A 3DA2A 1BNMA 2NNVA 1KWQA 4KNIA 1IF5A 3OKVA 4HEZA 1RZCA 2NWOA 3KONA 4FPTA 3M2XA 4Q9YA 4Z1NA 5EH5A 4YGJA 1I91A 2FNMA 4QSAA 1YO0A 3T5UA 5FL5A 3DCCA 1I9NA 1ZE8A 3MNIA 2FOSA 4QEFA 1RJ5A 1TE3X 3KKXA 3S8XA 1G4JA 2NXRA 3M14A 4RN4A 3S97A 4XFWA 1YO2A 4HU1A 1RJ6A 4G7AA 3OYQA 4RFDA 4XIWA 5E2RA 4Q99A 3DD0A 4YVYA 1DMXA 2CBCA 2FW4A 1I9OA 1G46A 2WEJA 4KUVA 4HF3A 5AMGA 5LMDA 3SBHA 1IF7A 1YDAA 4Q7PA 5E2NA 3RJ7A 3UYNA 2Q1BA 2H4NA 5EKMA 1FSNA 1CAZA 1Y7WA 4QSBA 4JSSA 1CNGA 1BNTA 1CAMA 1ZNCA 4Q8XA 3OIMA 4KAPA 4CNXA 1I90A 3JXFA 4X5SA 4QJPA 4KP8A 4QSJA 4M2UA 5CLUA 3DV7A 1TB0X 3MNHA 4XIXA 5E28A 3V2JA 4XZ5A 3OILA 4M2WA 1BICA 3IEOA 4E3HA 5FLTA 1G53A 5SZ6A 3V3GB 1BNUA 4Q6DA 1ZFKA 5DSIA 3CZVA 3V3IB 4QJOA 1ZGEA 3S77B 1CA3A 3P4VA 1HCBA 1LG6A 3U7CA 4CA2A 1BNWA 4COQA 2NWZA 1CILA 3ZNCA 4R59A 1F2WA 1DCBA 1G3ZA 5EKHA 1FR7A 4MDLA 5FNLA 4ZWXA 1FQNA 3DD8A 4E4AA 3PYKA 4R5BA 4Y0JA 1LZVA 1OKMA 4KNMA 1ZSBA 5A25A 3D9ZA 4Q49A 4G0CA 5EH8A 4K1QA 3P3HA 1CNWA 5EHVA 1CVBA 5FLQA 2FOYA 4RUYA 4RUZA 3K34A 1XEVA 3B1BA 4FIKA 3B4FA 3S75B 1CNCA 4RFCA 4E3FA 4E5QA 4WL4A 3EFTA 2NN1A 5E2SA 3MHLA 1HEDA 1LUGA 3DCSA 4QY3A 4WW6A 4L5UA 5SZ2A 1YO1A 2O4ZA 3MNAA 5BRVA 3S9TA 5AMDA 1FR4A 3OY0A 1BNQA 1ZGFA 4M2VA 1UGEA 5CJFA 2FOUA 4Q08A 3M2YA 8CA2A 4WR7A 5HPJA 1IF8A 4RIUA 2NNOA 4Q6EA 1BV3A 3HKUA 2ZNCA 5J8ZA 5FLSA 2X7SA 3IBLA 1CNHA 1CRAA 2CABA 1CAIA 1I9QA 4PXXA 4C3TA 5DVXA 3RGEA 4KV0A 1YDDA 1BNNA 1BN4A 1A42A 3KWAA 3ML2A 5DSNA 4PQ7A 1OKLA 3S76A 3SBIA 4BF1A 2Q38A 1UGCA 3U3AX 1G1DA 1UGAA 3LXEA 1YDBA 5EIJA 3P3JA 1J9WA 1KOQA 5L3OA 3M67A 4Q06A 2HD6A 3M1JA 3V7XA 4Z1KA 1XQ0A 3MHOA 1TEQX 1CNJA 2NWPA 5DOHA 3V3JA 3M2NA 3S74B 1Z97A 3M2ZA 4ZX0A 3BL1A 4K0TA 3QYKA 4QK3A 3D92A 1HCAA 1CNKA 1YDCA 1LGDA 1CVHA 1CINA 1IF6A 3M1KA 4ITPA 5DSOA 3DBUA 3RG3A 3MNJA 5C8IA 5FL4A 4Q81A 1IF9A 3KOKA 1UGBA 3HFPA 1I9PA 1KOPA 1H9NA 1CNIA 1KWRA 3F8EA 3MDZA 2OSFA 4L5WA 4CACA 2NNSA 1RZBA 4PZHA 4DZ9A 4YXOA 1TG9A 2FMGA 4WUPA 3DC3A 3DAZA 5E5UA 4ZWIA 4QIZA 3VBDA 4YGFA 5SZ4A 1CAOA 5CACA 3F4XA 5SZ0A 1ZSCA 4TWMA 2WD2A 2GEHA 3IBNA 5SZ1A 1ZFQA 3T84A 1XPZA 5JG3B 3FE4A 4LHIA 3TVOX 4LP6A 2NXSA 5EHWA 1RZEA 5G0CA 2HNCA 1FSRA 5JDVB 4QJMA 1G54A 2CBBA 3PO6A 1DMYA 1G0FA 1JD0A 3N0NA 4MLTA 3RZ5A 1TG3A 3V3FA 4YYTA 1CNYA 3RYYA 3MWOA 1BNVA 1CVEA 1URTA 5EKJA 1RZDA 4MO8A 3DVCA 5JQ0A 3RYZA 4ETQC 1FSQA 1BCDA 1CANA 3IAIA 1V9IC 3T83A 1G6VA 4QSIA 1UGGA 5JEGB 1UGDA 2POVA 3DC9A 5CA2A 4JSZA 2FOQA 4WUQA 1G48A 5DSMA 5FNJA 2HOCA 4RIVA 5EHEA 1BZMA 3P58A 4YGKA 4FVNA 2F14A 1TTMA 3ML5A 1LG5A 2H15A 3RLDA 3S73B 3M5SA 5BRUA 1OKNA 2AW1A 3RZ1B 3RYXB 2FNNA 5JESB 3T82A 3MHIA 1TBTX 1TEUX 4KNJA 5DSLA 3V2MA 5DSPA 2CBDA 1CNBA 1RZAA 4QIYA 3V5GA 4E9OX 1Z93A 7CA2A 5SZ7A 3CAJA 4LU3A 3MNUA 1CCTA 2FOVA 4Q8YA 3SAXA 4ZX1A 2CBAA 2ILIA 4Q83A 2POWA 4Z0QA 1FLJA 4CQ0A 4ZWYA 1H4NA 3KNEA 5JGSB 1CIMA 1JCZA 4ZWZA 4Q8ZA 5FLPA 2VVBX 5BYIA 3MMFA 4Q7SA 4PYYA 2NN7A 5EZTX 4BF6A 3F7BA 3N3JA 3M04A 4QK2A 3CA2A 4K0ZA 2WEHA 4CNVA 3P5LA 5JG5B 4R5AA 1AVNA 4IWZA 3SAPA 12CAA 4N0XB 4UOVA 5FNIA 5L6KA 3M98A 5FLRA 1UGFA 4TWLA 1CVCA 3NI5A 3HS4A 3NJ9A 3FW3A 4M2RA 5DSRA 4Q90A 3K7KA 4ILXA 3TMJA 3TVNX 6CA2A 4KUWA 3JXHC 1DCAA 3OKUA 1H9QA 3IGPA 5FNGA 5BRWA 2CBEA 4K0SA 5IPZA 4ITOA 1CALA 2QO8A 5FNMA 3T5ZA 4Q7WA 5SZ3A 5JEHB 1CNXA 4GL1X 2AX2A 1HUGA 3P5AA 3M96A 4ZAOA 5FNKA 1FQLA 5JEPB 3RYJB 5DSQA 1JV0A 1G0EA 2NNGA 1Z9YA 2OSMA 4Q07A 1EOUA 3KIGA 3HLJA 3PJJA 4E49A 3RZ7A 4JS6A 4YX4A 3UYQA 3NB5A 4K13A 4FRCA 4KUYA 3C7PA 3D93A 4MDGA 2EZ7A 4FU5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2ABE A;  3RG4 A;  3N2P A;  3EFI A;  3M3X A;  4HBA A;  3L14 A;  5G03 A;  3F7U A;  1CAK A;  9CA2 A;  4E3G A;  2NWY A;  3JXG A;  1CAJ A;  1CA2 A;  5G0B A;  1IF4 A;  2WEG A;  4YGN A;  4YWP A;  4QTL A;  5EH7 A;  2IT4 A;  3M1W A;  4CNW A;  3DVB A;  1HEC A;  3IBI A;  3S78 B;  1HUH A;  2EU2 A;  4CNR A;  5AML A;  1AM6 A;  3S72 B;  2CA2 A;  4RH2 A;  4RUX A;  3FFP X;  3HKQ A;  4MDM A;  5JQT A;  3M40 A;  2FNK A;  3MNK A;  4E3D A;  4XE1 A;  4HEW A;  1G52 A;  3RZ8 A;  3M5T A;  1CRM A;  2QP6 A;  4YGL A;  5FDI A;  4MLX A;  4Q09 A;  5FDC A;  4PYX A;  3D0N A;  4BCW A;  2HKK A;  3M1Q A;  3BL0 A;  3MHM A;  1V9E A;  2WEO A;  5EOI A;  2GD8 A;  3V3H B;  1ZH9 A;  4FL7 A;  4WW8 A;  5DOG A;  3MZC A;  5E5R A;  1MOO A;  4KNN A;  1CVF A;  2NMX A;  4Q7V A;  4HT2 A;  4QK1 A;  2WD3 A;  3P55 A;  3MHC A;  2X7T A;  5E2M A;  2EU3 A;  2W2J A;  1CCS A;  1G45 A;  1I9L A;  3R17 B;  1FQR A;  1RAY A;  4N16 A;  1T9N A;  1ZSA A;  4IDR X;  3MYQ A;  5DSJ A;  1CVA A;  3T85 A;  4Q87 A;  3P44 A;  3RZ0 B;  5DSK A;  3W6I A;  3ZP9 A;  4JSW A; 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