4KP8A

Crystal structure of catalytic domain of human carbonic anhydrase isozyme xii with 3-[(pyrimidin-2-ylsulfanyl)acetyl]benzenesulfonamide
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
Knots found
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
KWTYFGPDGENSWSKKYPSCGGLLQSPIDLHSDILQYDASLTPLEFQGYNLSANKQFLLTNNGHSVKLNLPSDMHIQGLQSRYSATQLHLHWGNPNDPHGSEHTVSGQHFAAELHIVHYNSDLYPDASTASNKSEGLAVLAVLIEMGSFNPSYDKIFSHLQHVKYKGQEAFVPGFNIEELLPERTAEYYRYRGSLTTPPCNPTVLWTVFRNPVQISQEQLLALETALYCTHMDDPSPREMINNFRQVQKFDERLVYTSFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Carbonic anhydrase 12
publication title Benzenesulfonamides with pyrimidine moiety as inhibitors of human carbonic anhydrases I, II, VI, VII, XII, and XIII
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
total genus 71
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-05-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4kp8A00
4DZ7A 3MMFA 1I91A 1G6VA 3R17B 9CA2A 4Q09A 3KLDB 3CYUA 1Z97A 1CRMA 2CBDA 1CVBA 4WW8A 5FNMA 2NN1A 1CAJA 1T9NA 2OSFA 5E2KA 4YVYA 4QK1A 1EOUA 1HEDA 1V9IC 1ZE8A 1TEUX 4TWLA 1I9OA 1HUGA 1TG3A 2EU2A 4RFCA 1CNIA 1HECA 5FDIA 4C3TA 4YYTA 5JEHB 3HS4A 4PQ7A 2AX2A 5SZ0A 1CVFA 1CAKA 1I9MA 1BN4A 3RYZA 3W6HA 4CNRA 4YGNA 1FSNA 5DSRA 3NJ9A 1H9NA 3S71B 5EKJA 1Z9YA 3IBIA 1JD0A 1FR7A 3RYJB 5JQTA 1CVDA 3DCCA 2CABA 2WEJA 1DCAA 3OYSA 3V7XA 2POUA 3ML2A 3S73B 1BNVA 1KWQA 3M14A 4PYYA 4QJ0A 5FLSA 4R5AA 1H4NA 1G54A 2CBCA 3OILA 5DVXA 1XEGA 2CBBA 3DVDA 4KUYA 4Q78A 4QY3A 5FL4A 5JEPB 3S74B 4CNXA 3M1JA 2CBAA 4RN4A 1AZMA 4FVNA 4Q6DA 4YGJA 4IWZA 4JSAA 3S78B 5EH8A 3LXEA 5SZ4A 3N3JA 1AM6A 3RYVB 4KUVA 1OKNA 3N2PA 4Y0JA 4IDRX 5E28A 4G7AA 1G3ZA 3FW3A 5EHWA 1BZMA 1YO2A 3UYNA 1RZEA 1TH9A 3P58A 3KOKA 3P5AA 1TEQX 5JGTB 5FLQA 3RG3A 4HEYA 3VBDA 1IF4A 1CVCA 1IF9A 3R16A 1TTMA 12CAA 3NI5A 4QIZA 1HCBA 5E2NA 1F2WA 3M1QA 3JXGA 4JS6A 3HLJA 1HEBA 5G03A 3ZP9A 2CBEA 1Z93A 3MNAA 3N4BA 5E5RA 5G0BA 3S76A 1XEVA 4FIKA 2EU3A 4Q87A 1CAZA 3HKQA 4Q06A 2NNOA 3RYXB 5JG5B 2FOUA 5A25A 5FNJA 3M96A 2Q1BA 1OKMA 1TBTX 2X7UA 4ZAOA 2X7TA 5FNKA 5AMGA 3DVBA 1ZSCA 5L3OA 4Q07A 1CVEA 3MHLA 5JG3B 2FOSA 1CALA 3KS3A 2FOYA 3K7KA 3HKTA 3V3FA 2WD2A 4RIVA 3OYQA 1I9PA 4XE1A 1DMXA 1CNJA 1FQRA 5EZTX 2FOQA 1ZH9A 4FRCA 2NXRA 3U3AX 4COQA 2NWPA 5G0CA 2QP6A 3DC9A 1RJ5A 3F4XA 5E2RA 1ZFKA 5BRUA 2FNNA 2Q38A 1HUHA 3OKVA 4JSSA 4E9OX 5IPZA 5E2SA 3HKUA 4E4AA 4YXOA 5J8ZA 3TVOX 1IF7A 3M2XA 1KOQA 5CLUA 5EOIA 1TG9A 3HKNA 3T83A 1CA2A 1RZDA 5EIJA 3RYYA 3KONA 1URTA 3D8WA 3OKUA 5FDCA 5FNHA 3PO6A 3MWOA 4K1QA 4QK3A 4QJPA 2NXSA 3P4VA 4ITPA 1DCBA 1BNUA 4WUPA 3MNIA 5JEGB 3M5EA 4ILXA 5DSIA 4CNWA 4RFDA 1CIMA 4Q6EA 2HFWA 5FL5A 3MYQA 3SAXA 1ZSAA 1FQNA 1KEQA 2NNVA 4L5VA 3Q31A 1YDAA 3M1WA 2GEHA 4Q7VA 3M2YA 5AMDA 3CZVA 3W6IA 3M04A 5AMLA 3PYKA 3V2JA 3B4FA 1CANA 4RIUA 5SZ3A 1CAOA 3M2NA 1UGGA 4KNNA 4E3GA 1CA3A 5HPJA 1G4OA 4MDMA 5DOHA 5JQ0A 4R5BA 3UYQA 2ZNCA 4MLXA 2ILIA 5FNGA 1YO1A 1HVAA 2W2JA 2HOCA 4HBAA 4RH2A 1BICA 3KIGA 3OIMA 3RG4A 4QEFA 4QJWA 3M5TA 5BRVA 5EKHA 5JGSB 5L6KA 1UGBA 3M3XA 3SBIA 1BN3A 4Q49A 3U45X 4ITOA 5SZ7A 3RZ0B 5SZ2A 3KNEA 3M2ZA 4YX4A 2HNCA 5DSJA 3RJ7A 4M2WA 3V2MA 4Z1KA 3IBLA 4KAPA 4Q83A 5DSLA 1BNWA 2GD8A 1CNGA 4YGKA 4RUZA 2AW1A 3V3HB 5DSMA 5EH5A 2FNMA 5FLOA 1G46A 1ZFQA 4QSBA 1OQ5A 2OSMA 4HF3A 1CRAA 3U7CA 3SBHA 5FLPA 5A6HA 1FQLA 1IF5A 4QSIA 2CA2A 1G1DA 5JESB 7CA2A 1CZMA 3IGPA 1YDCA 2QOAA 3RZ1B 4ZWZA 4R59A 4E5QA 4PZHA 4HEZA 5DSKA 4FU5A 3D9ZA 3IBUA 4M2VA 3L14A 1BV3A 3IAIA 4JSZA 1CVHA 1CCTA 3B1BA 3D93A 3DAZA 4ETQC 1MOOA 1ZGEA 1CAYA 1ZSBA 3M40A 3RLDA 3MHMA 1JV0A 2VVBX 3K34A 4ZWYA 4FPTA 4MTYA 1G45A 3IEOA 3K2FA 3V5GA 5CJFA 3SAPA 1G52A 2WEGA 1FQMA 4QJMA 2Q1QA 3KOIA 3BETA 3GZ0A 1CNCA 3KKXA 6CA2A 1FR4A 1CNHA 3MHOA 3P3JA 5BYIA 4M2UA 2FOVA 4Q9YA 8CA2A 4E3FA 4XZ5A 2NWZA 3DV7A 4KNMA 1RZCA 4HU1A 4XIXA 2X7SA 3P5LA 2NMXA 4LP6A 3D92A 1G53A 1OKLA 3NB5A 4K0TA 5BRWA 4Q99A 4QIYA 5LMDA 3DD0A 3RZ5A 4YGFA 4RUYA 4DZ9A 3ML5A 3EFIA 3HFPA 4LU3A 4G0CA 3S97A 4YXIA 2POVA 4Q81A 2NWOA 4HEWA 4Q90A 1YDDA 3FFPX 4L5UA 4ZWIA 3DCSA 3DCWA 3PJJA 1I8ZA 4Z1NA 4K0SA 5G01A 2WEHA 1LGDA 5DSOA 1I9LA 2FW4A 4KV0A 2FNKA 1BCDA 4MLTA 3CA2A 2FMGA 5FNLA 4MDGA 2NWYA 4GL1X 2FMZA 5EHEA 4Z1EA 1G48A 4KNJA 2POWA 4YHAA 4BCWA 3V3GB 1H9QA 2F14A 3FE4A 3MHCA 3RGEA 4Q8XA 1LG5A 2NN7A 1JCZA 3EFTA 4M2RA 4HT2A 4YXUA 4L5WA 5SZ6A 4K0ZA 1I9QA 4KP8A 4Q7WA 4BF6A 1DMYA 1G4JA 2EZ7A 3OY0A 4QTLA 2NNGA 4ZWXA 3P55A 3QYKA 4QSJA 1RJ6A 3JXHC 4CQ0A 3T85A 3F7BA 4MO8A 2VVAX 1IF8A 2QO8A 4ZX0A 4RUXA 4Q0LA 4PXXA 1V9EA 2ABEA 1KWRA 5DSPA 1CCUA 3S77B 3S72B 4FL7A 4N0XB 4E3HA 3JXFA 3V3JA 1LG6A 5FLRA 1ZGFA 4WUQA 1CAHA 3U47A 1MUAA 1RAZA 4TWMA 4FVOA 1FSQA 1CNXA 5SZ1A 5C8IA 4KUWA 3T82A 4K13A 5EH7A 1BNMA 5FL6A 4YWPA 1G0FA 4X5SA 3DBUA 2H4NA 4E3DA 1RAYA 5E2MA 3N0NA 4KNIA 4Z1JA 4JSWA 3F8EA 1CILA 5DOGA 3RZ8A 3ZNCA 5DRSA 3S8XA 1CNWA 2H15A 4Z0QA 1ZNCA 3P3HA 4WR7A 4PYXA 3CAJA 2HD6A 3MZCA 1UGDA 5CACA 3V3IB 2NNSA 5SZ5A 1UGAA 1UGEA 4UOVA 1UGCA 4YGLA 1CNBA 1J9WA 1RZBA 4Q7SA 1YO0A 3S9TA 1RZAA 3DA2A 1YDBA 3DC3A 3MNHA 1HEAA 1XPZA 4ZX1A 3OIKA 3TMJA 5DSNA 1CVAA 1FSRA 2NXTA 4MDLA 4QK2A 4E49A 1CNYA 1UGFA 3C7PA 3T5ZA 3M67A 4CA2A 4LHIA 4XFWA 4QJXA 3S75B 1CNKA 3T5UA 3MNKA 1IF6A 4WL4A 5FNIA 1LZVA 1BN1A 3P44A 4WW6A 1HCAA 1CAIA 2O4ZA 5JDVB 4Q7PA 4BF1A 3M5SA 4Q8ZA 4CNVA 1BNNA 3RZ7A 1G0EA 2WEOA 4Q8YA 4HT0A 1TE3X 3D0NA 3IBNA 1AVNA 2WD3A 3F7UA 2HL4A 4QSAA 3KWAA 1I90A 5CA2A 3BL1A 1CINA 1CAMA 1CCSA 1FLJA 2HKKA 3M98A 4QJOA 3MDZA 5EKMA 1THKA 3BL0A 1TB0X 1LUGA 1Y7WA 4KP5A 1BNQA 4N16A 5BNLA 3T84A 1I9NA 1XQ0A 2IT4A 4XIWA 4CACA 1A42A 5E5UA 3MNUA 3DVCA 5FLTA 1KOPA 5DSQA 5EHVA 1BNTA 3DD8A 4Q08A 3TVNX 3MNJA 3MHIA 3M1KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4DZ7 A;  3MMF A;  1I91 A;  1G6V A;  3R17 B;  9CA2 A;  4Q09 A;  3KLD B;  3CYU A;  1Z97 A;  1CRM A;  2CBD A;  1CVB A;  4WW8 A;  5FNM A;  2NN1 A;  1CAJ A;  1T9N A;  2OSF A;  5E2K A;  4YVY A;  4QK1 A;  1EOU A;  1HED A;  1V9I C;  1ZE8 A;  1TEU X;  4TWL A;  1I9O A;  1HUG A;  1TG3 A;  2EU2 A;  4RFC A;  1CNI A;  1HEC A;  5FDI A;  4C3T A;  4YYT A;  5JEH B;  3HS4 A;  4PQ7 A;  2AX2 A;  5SZ0 A;  1CVF A;  1CAK A;  1I9M A;  1BN4 A;  3RYZ A;  3W6H A;  4CNR A;  4YGN A;  1FSN A;  5DSR A;  3NJ9 A;  1H9N A;  3S71 B;  5EKJ A;  1Z9Y A;  3IBI A;  1JD0 A;  1FR7 A;  3RYJ B;  5JQT A;  1CVD A;  3DCC A;  2CAB A;  2WEJ A;  1DCA A;  3OYS A;  3V7X A;  2POU A;  3ML2 A;  3S73 B;  1BNV A;  1KWQ A;  3M14 A;  4PYY A;  4QJ0 A;  5FLS A;  4R5A A;  1H4N A;  1G54 A;  2CBC A;  3OIL A;  5DVX A;  1XEG A;  2CBB A;  3DVD A;  4KUY A;  4Q78 A;  4QY3 A;  5FL4 A;  5JEP B;  3S74 B;  4CNX A;  3M1J A;  2CBA A;  4RN4 A;  1AZM A;  4FVN A;  4Q6D A;  4YGJ A;  4IWZ A;  4JSA A;  3S78 B;  5EH8 A;  3LXE A;  5SZ4 A;  3N3J A;  1AM6 A;  3RYV B;  4KUV A; 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