4LP6A

Crystal structure of human carbonic anhydrase ii in complex with a quinoline oligoamide foldamer
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Structure of a complex formed by a protein and a helical aromatic oligoamide foldamer at 2.1 angstrom resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4lp6A00
4FVNA 4ZWZA 4KNNA 3DV7A 3S9TA 3B1BA 3F4XA 1YDAA 1RJ6A 2HNCA 1BNNA 4Q0LA 5E5UA 2NN7A 4K0TA 4Z1JA 3W6IA 5L6KA 1TEQX 3HKTA 5AMLA 2O4ZA 2FNMA 3FW3A 1G0EA 3K34A 5FLTA 3L14A 4WUQA 1G52A 4M2RA 3RYJB 3RYZA 4QJOA 3OYSA 4FVOA 3DVBA 1HUGA 1IF5A 1TG3A 3NI5A 1ZH9A 2IT4A 4L5WA 3MHCA 4KNIA 1RZAA 1BN1A 5E2NA 1UGAA 2VVBX 1I9PA 2WEJA 5FLOA 1KWQA 5EHEA 4ZWIA 3U47A 1CANA 3HKUA 4FU5A 2WD2A 3V3FA 3D8WA 1YO0A 1FSQA 4CNVA 1LGDA 4K0SA 4Q7PA 1IF7A 3M2ZA 4Q7WA 1RJ5A 3MHIA 4MO8A 3OKVA 3PO6A 3RZ8A 3RZ1B 1CA2A 5DSMA 1UGDA 1Z9YA 5SZ5A 3F7BA 3RZ0B 2GD8A 3DCWA 2FW4A 2Q1QA 3RGEA 1JD0A 1XEVA 3U3AX 3EFTA 3TVNX 4WW8A 3P44A 3MZCA 1CVHA 4RH2A 4Q8ZA 2CBBA 2WEHA 5G01A 5DRSA 3ML5A 1FSRA 3S78B 4L5UA 3MDZA 4N16A 1YDDA 3N2PA 1G53A 4HT0A 1G3ZA 3MHMA 1FQMA 4FL7A 1CRAA 4QEFA 4QJMA 5FLPA 5FLRA 4CA2A 3V3GB 5SZ2A 1CVEA 1I91A 3IGPA 1XQ0A 1G4JA 3S76A 3KLDB 1AM6A 5IPZA 4MDGA 3S72B 3SBIA 1IF8A 5DOHA 3IAIA 3DC9A 2Q38A 4PXXA 3MNKA 5EKHA 1G6VA 3OIMA 4KUVA 3SBHA 1HUHA 3TMJA 5E2RA 1BV3A 3V3HB 4N0XB 5JG5B 4YWPA 4Q90A 5C8IA 3KIGA 4KUWA 2FMGA 1Z97A 5JG3B 1MUAA 2HL4A 2QOAA 4QJ0A 1ZE8A 5EH7A 1UGCA 3T85A 3HS4A 2HD6A 4Z1EA 3MNJA 4HEYA 4Q49A 5G03A 5EHVA 4C3TA 2EU2A 4LP6A 1THKA 3JXGA 2FNNA 5G0CA 5JDVB 3M1KA 4QJWA 1UGEA 5JGTB 4HU1A 3M14A 1V9EA 4KP8A 1BNMA 5FL6A 4E3HA 1KOPA 3K7KA 3Q31A 3MNAA 4K0ZA 4WR7A 3MNIA 1BCDA 4MTYA 4FIKA 1ZSCA 5LMDA 5BYIA 1CVDA 1I9MA 3P4VA 3JXHC 5FNMA 1TBTX 1CAJA 5FDCA 4KP5A 4QSBA 5SZ6A 3P5LA 2Q1BA 2EU3A 1MOOA 3D93A 3R16A 3KS3A 1ZSBA 4HT2A 3SAXA 5CA2A 2CBDA 4LHIA 4DZ7A 4YXIA 2NNGA 3T83A 3M1JA 5J8ZA 3D92A 3MNUA 1G4OA 3DC3A 4XIWA 1HEDA 5BNLA 2FOYA 4Q87A 4YVYA 3T5ZA 5FL4A 2FOVA 2NNSA 3PJJA 3N0NA 12CAA 1AVNA 4RUYA 1CNIA 1CIMA 2EZ7A 4YHAA 3RYXB 1G54A 3F7UA 4BCWA 2NWPA 5DSQA 1I9NA 1CNCA 2NNOA 4XFWA 5EZTX 5SZ0A 4KNJA 4Q7VA 3U45X 3CA2A 3NJ9A 3ZNCA 1CAHA 3HLJA 1IF9A 2NWYA 3FFPX 1IF6A 2X7SA 3DA2A 4BF6A 1URTA 4G0CA 3PYKA 1RZCA 3V3IB 4JSZA 4RFDA 4M2WA 1BICA 4ZX1A 3IBUA 3BETA 5JEPB 2AX2A 7CA2A 1HEAA 3P5AA 1G1DA 4RN4A 3F8EA 5E2MA 1ZNCA 5FNGA 3DVCA 3MHLA 5JGSB 1LG5A 4JSWA 4YXUA 2AW1A 3KOIA 3GZ0A 1HCBA 4COQA 3M1WA 1H9NA 2OSFA 1ZSAA 3MYQA 4QIZA 3DD8A 3U7CA 1BNQA 4GL1X 1CILA 4Q07A 1TEUX 3OIKA 4R5AA 5EHWA 1HEBA 1IF4A 5BRUA 2F14A 1LZVA 1CAKA 3RYYA 1BNTA 2CA2A 2NXTA 1G45A 4Z0QA 3C7PA 4YGFA 1G46A 5G0BA 5JQ0A 1CAOA 3M04A 4M2UA 4CNWA 1FQLA 5DSOA 1LG6A 5DSPA 5E28A 3DCCA 3V7XA 1RAYA 3M2YA 4ITOA 3M3XA 4CACA 2NNVA 1CAZA 3P58A 4RUZA 1CCUA 1F2WA 5FNKA 1UGFA 4ZX0A 3IEOA 3QYKA 4MDLA 4QJXA 3N3JA 4Q06A 3DCSA 4R5BA 1JV0A 2FOUA 1UGBA 3MMFA 3BL0A 3NB5A 1AZMA 5L3OA 3V5GA 3N4BA 4RUXA 1I9LA 2HFWA 4LU3A 4QY3A 1CNXA 4Q8XA 6CA2A 3M98A 4JSAA 3RG4A 1DCAA 9CA2A 1HVAA 5AMDA 2FNKA 4Q83A 3MWOA 2FOSA 4X5SA 3M1QA 1XEGA 4WUPA 3D0NA 3KONA 3D9ZA 3LXEA 4RFCA 4Y0JA 4YYTA 1CVFA 5CJFA 3JXFA 1BZMA 2OSMA 1J9WA 5DSKA 3CYUA 4TWLA 3M2XA 1ZFKA 1BNWA 4CNXA 4Q99A 3T82A 4ZWXA 5JEHB 4E49A 4QSAA 4YGJA 1TG9A 1RZBA 4K13A 3ML2A 1CNHA 4UOVA 2POVA 2FOQA 4CNRA 3S73B 4XZ5A 3MNHA 3M5EA 5DSLA 3DVDA 1CCTA 4MLXA 4PYYA 5SZ4A 5SZ3A 3S8XA 2NMXA 1A42A 5FDIA 5DSNA 5DSIA 5EKMA 4ZWYA 3HKQA 3MHOA 3KNEA 1EOUA 1LUGA 3IBNA 4BF1A 1KWRA 4Q8YA 4Q7SA 4E3FA 1FSNA 1CAMA 3S71B 1CALA 1TE3X 1I90A 1CAIA 1CVAA 3T84A 1CINA 1Z93A 3RG3A 4YXOA 8CA2A 3TVOX 2VVAX 4KNMA 1FR4A 1FR7A 5FLQA 3P55A 4QJPA 2POUA 4DZ9A 4FPTA 5DSJA 1CNWA 2ILIA 5FNIA 4JS6A 3UYQA 3VBDA 5FNLA 4Q9YA 1YO2A 2FMZA 2HOCA 5BRWA 2NWOA 3S75B 1G0FA 3P3HA 1YDCA 5FNHA 5EH5A 4E3DA 2H15A 1OKMA 4IDRX 1H9QA 1YDBA 5FL5A 5HPJA 1I8ZA 1RZDA 3P3JA 3SAPA 2X7TA 3HKNA 1CNYA 3HFPA 3W6HA 4WL4A 5SZ1A 3S97A 1T9NA 4L5VA 1FQNA 4Q08A 3R17B 3RZ7A 3M2NA 4KAPA 1DCBA 4ILXA 1TB0X 1TH9A 1OKLA 3DD0A 2CBAA 4HBAA 4QTLA 2ZNCA 3M5TA 3KWAA 4FRCA 4E3GA 1TTMA 4QIYA 3M40A 1BNUA 1CRMA 4Z1KA 4E9OX 5E2KA 4HF3A 4Q09A 1OKNA 1RZEA 2CBCA 1G48A 2QO8A 5FLSA 3BL1A 4M2VA 4YGLA 5JESB 1ZGFA 1CAYA 1OQ5A 4TWMA 5EIJA 2X7UA 5A6HA 4QK2A 3IBIA 2WD3A 1HECA 1DMXA 4KV0A 2NN1A 4RIUA 3CZVA 1RAZA 4Q81A 1BNVA 4HEZA 1UGGA 3DBUA 1JCZA 5E5RA 4Z1NA 3K2FA 3KOKA 2H4NA 4QSJA 1YO1A 1H4NA 1FLJA 5EKJA 4RIVA 4PQ7A 2WEOA 2NXRA 1XPZA 1CVBA 2W2JA 1I9OA 2CABA 3T5UA 1FQRA 4WW6A 1KEQA 4KUYA 5E2SA 1I9QA 1V9IC 3FE4A 3RLDA 2GEHA 2NWZA 3M67A 3OILA 5DVXA 5JQTA 1CNGA 4IWZA 5SZ7A 1CZMA 3UYNA 3S74B 3V2JA 3KKXA 3OKUA 4PYXA 3OY0A 4YX4A 4PZHA 3V2MA 1BN3A 5JEGB 3S77B 3ZP9A 1CCSA 1ZGEA 4ITPA 1CVCA 1Y7WA 3OYQA 3V3JA 5BRVA 5CLUA 5FNJA 1KOQA 1BN4A 4HEWA 1CNJA 1HCAA 3RZ5A 4E5QA 1DMYA 5A25A 4E4AA 4K1QA 2NXSA 4MDMA 4JSSA 5CACA 1CNBA 3B4FA 5DOGA 3RJ7A 4ZAOA 4MLTA 3CAJA 4ETQC 1CA3A 2ABEA 2QP6A 4Q78A 4QSIA 4QK1A 4CQ0A 3M96A 5EOIA 2WEGA 3IBLA 5EH8A 3DAZA 4R59A 1CNKA 1ZFQA 3M5SA 5DSRA 4QK3A 4XIXA 3RYVB 2POWA 4XE1A 3EFIA 2HKKA 2CBEA 4Q6EA 4YGNA 4Q6DA 4G7AA 4YGKA 5AMGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FVN A;  4ZWZ A;  4KNN A;  3DV7 A;  3S9T A;  3B1B A;  3F4X A;  1YDA A;  1RJ6 A;  2HNC A;  1BNN A;  4Q0L A;  5E5U A;  2NN7 A;  4K0T A;  4Z1J A;  3W6I A;  5L6K A;  1TEQ X;  3HKT A;  5AML A;  2O4Z A;  2FNM A;  3FW3 A;  1G0E A;  3K34 A;  5FLT A;  3L14 A;  4WUQ A;  1G52 A;  4M2R A;  3RYJ B;  3RYZ A;  4QJO A;  3OYS A;  4FVO A;  3DVB A;  1HUG A;  1IF5 A;  1TG3 A;  3NI5 A;  1ZH9 A;  2IT4 A;  4L5W A;  3MHC A;  4KNI A;  1RZA A;  1BN1 A;  5E2N A;  1UGA A;  2VVB X;  1I9P A;  2WEJ A;  5FLO A;  1KWQ A;  5EHE A;  4ZWI A;  3U47 A;  1CAN A;  3HKU A;  4FU5 A;  2WD2 A;  3V3F A;  3D8W A;  1YO0 A;  1FSQ A;  4CNV A;  1LGD A;  4K0S A;  4Q7P A;  1IF7 A;  3M2Z A;  4Q7W A;  1RJ5 A;  3MHI A;  4MO8 A;  3OKV A;  3PO6 A;  3RZ8 A;  3RZ1 B;  1CA2 A;  5DSM A;  1UGD A;  1Z9Y A;  5SZ5 A;  3F7B A;  3RZ0 B;  2GD8 A;  3DCW A;  2FW4 A;  2Q1Q A;  3RGE A;  1JD0 A;  1XEV A;  3U3A X;  3EFT A;  3TVN X;  4WW8 A;  3P44 A;  3MZC A;  1CVH A;  4RH2 A;  4Q8Z A;  2CBB A;  2WEH A;  5G01 A;  5DRS A;  3ML5 A;  1FSR A;  3S78 B;  4L5U A;  3MDZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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