4QIZA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with inhibitor
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
publication title Functionalization of Fluorinated Benzenesulfonamides and Their Inhibitory Properties toward Carbonic Anhydrases
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4qizA00
3ML2A 1CAYA 1DMXA 3MHOA 1BCDA 3D0NA 1YDCA 1Y7WA 1CCSA 1RZAA 3Q31A 5EHWA 3HKQA 4WW8A 3V7XA 3NI5A 1TE3X 4HEZA 1FSRA 4PZHA 1UGBA 3BL0A 5FNGA 3RYZA 4YGLA 1ZH9A 1CVDA 4CNWA 4YGKA 5EKJA 1CNIA 1LUGA 3DC3A 3U47A 5FNJA 4HT0A 4Q49A 1CINA 1FQRA 5DOGA 1HVAA 1YDBA 5DVXA 5SZ2A 4XIWA 1UGAA 3V3IB 4YGNA 4YXUA 1HUHA 4YGJA 4IDRX 1XEVA 3K7KA 1YDDA 1I9QA 1BN4A 5DSQA 2Q1QA 3DCCA 4QJOA 4HT2A 1I9LA 4YGFA 4HU1A 4TWLA 3HKUA 4X5SA 3M2NA 3SAXA 5LMDA 5EHVA 1DMYA 4Q7SA 4E3HA 9CA2A 1HCBA 4CNRA 1CA3A 2EU3A 2FNMA 5SZ3A 1BNWA 3V3HB 5DSRA 5DSKA 1CVEA 3RYYA 4Q06A 1OKLA 1JV0A 4KNJA 2FMGA 3DVDA 4YXIA 4R5BA 1BNTA 1I9MA 2FW4A 1TB0X 4M2UA 1FQMA 4QJXA 4KAPA 3MHIA 1LG6A 3RZ7A 1RJ5A 2HL4A 1A42A 1OKMA 3M5TA 3IBNA 3M2ZA 4GL1X 8CA2A 2HD6A 3OILA 1UGEA 1CAMA 1I90A 2O4ZA 2Q38A 5E2KA 4PQ7A 3P58A 1IF6A 2EU2A 3ZP9A 4ETQC 4QK2A 3M1QA 3SBHA 3RZ0B 5FDIA 4XE1A 1G0FA 4Q9YA 5EH5A 5EZTX 5G01A 1CAKA 5EKHA 3RG3A 3DVCA 1G54A 1ZFQA 3P55A 4FVNA 4BF1A 2CABA 5A6HA 2W2JA 3KS3A 3MWOA 1Z97A 4QK1A 1IF9A 4ZX1A 1HEDA 3M2XA 1CCTA 3QYKA 5E2SA 3S77B 4WR7A 3S97A 3T84A 1XQ0A 5DSLA 4IWZA 3V3GB 5CJFA 1FR7A 4JS6A 1G1DA 1CIMA 2HFWA 3KOKA 5J8ZA 4Z1KA 3TMJA 3FW3A 1BV3A 3DVBA 3OY0A 3RYJB 1TTMA 3M1JA 4FVOA 4HEYA 5JQ0A 3MNUA 4ILXA 3OKVA 4K0ZA 3IBUA 4N16A 3F7UA 5CLUA 1G0EA 5FL4A 4M2RA 2FNNA 4Q90A 1TG3A 5CACA 2CBBA 4FU5A 2FMZA 3HLJA 3CA2A 3V5GA 3DBUA 1MUAA 3K34A 3HFPA 3K2FA 3DV7A 2ABEA 3M1KA 3V2JA 4ZAOA 2QOAA 4Q8XA 2NNOA 3S73B 4Z1NA 5E2RA 1CVFA 4Q83A 1RAYA 4QSBA 1CNYA 4KNIA 4LU3A 3PO6A 3RZ1B 4PYYA 1LZVA 4ITPA 1TH9A 1V9IC 5BRWA 5C8IA 4ZWIA 2NNVA 1LG5A 4COQA 4MDLA 1CNXA 1HECA 1HCAA 3M14A 1TG9A 4WUQA 3KKXA 3CYUA 3IGPA 1ZGEA 3IEOA 2NNSA 4KP5A 4YHAA 1CRMA 5DSOA 3TVOX 2H15A 1CVAA 4FPTA 3KLDB 3RZ8A 4E49A 2VVBX 3EFIA 3DD0A 3RYVB 3DC9A 5JDVB 4QJ0A 5A25A 3MNAA 4E3DA 4E5QA 2FOYA 1HEBA 4RN4A 3MHMA 3MNHA 5G03A 4Q78A 3IAIA 5E28A 5FLRA 4Q6DA 2HKKA 5JGSB 4FRCA 2X7SA 3T5UA 4KNMA 1CAHA 1FLJA 1V9EA 3M40A 3MDZA 2X7UA 3P44A 4RH2A 1I9OA 3DCSA 5DSIA 4HF3A 1ZE8A 5SZ0A 2WEHA 3S71B 3MHLA 5E2NA 3V2MA 4K1QA 3P5LA 1FSQA 1I9NA 3PYKA 1CALA 1FQLA 3KWAA 2HNCA 1JD0A 5SZ1A 5BNLA 1G3ZA 5SZ4A 1BNQA 4Q8YA 4CNXA 1HUGA 4KV0A 4RFDA 3JXFA 1Z93A 5L3OA 3R17B 4C3TA 2CBEA 5DSNA 5FNMA 1T9NA 1KWQA 3V3FA 3S74B 4QSIA 1AZMA 5SZ6A 1YO1A 2QP6A 7CA2A 1G45A 6CA2A 4L5WA 3W6HA 5E2MA 4QEFA 1KEQA 3ML5A 4RFCA 3S78B 3L14A 5EOIA 4Q8ZA 5JG3B 2FOQA 3T5ZA 2NN7A 3OIMA 4QIZA 4Q6EA 4ZWYA 2NWYA 5DSMA 4QJWA 5BRVA 4WW6A 5DSPA 2NMXA 4JSWA 5JEPB 2WEJA 4FL7A 1BN1A 1UGDA 4YYTA 5AMGA 5BRUA 3S75B 2AW1A 3V3JA 4FIKA 2GEHA 5IPZA 3RGEA 1XEGA 4BCWA 3S9TA 4ZX0A 3D9ZA 3N2PA 4RIVA 1F2WA 3OKUA 3MNIA 3KONA 4HEWA 1BNVA 3D93A 4QSJA 1CAZA 1TBTX 5FNIA 1MOOA 2NWPA 1G48A 1RZEA 2H4NA 1G6VA 3FE4A 3PJJA 2FOUA 4CACA 3CZVA 5FLTA 3SAPA 5G0BA 4KUWA 4KUVA 4G0CA 2OSFA 3T82A 3S76A 1H9NA 3P3HA 4WL4A 4MDGA 4L5VA 1ZGFA 4Q7WA 3MYQA 4LHIA 4R59A 5G0CA 1FQNA 4QSAA 3TVNX 1CNHA 1BZMA 4DZ9A 1CNCA 3LXEA 1DCAA 4MDMA 1FSNA 5JEGB 4QJPA 4M2WA 4G7AA 3OIKA 3M98A 2WEGA 1RZDA 3P3JA 3N4BA 4ZWZA 1CCUA 5FLSA 3M5EA 5BYIA 1AVNA 1Z9YA 1CVHA 1OKNA 4E3FA 5AMDA 1LGDA 3SBIA 1FR4A 2NXSA 4MLXA 1CNBA 5EHEA 3RZ5A 3DA2A 2X7TA 3F7BA 4Z1EA 3ZNCA 2ZNCA 3N3JA 3F8EA 3U3AX 5JG5B 3CAJA 3D92A 3D8WA 12CAA 3HKTA 4JSAA 3UYQA 5FDCA 1ZSBA 4Q81A 1G4JA 1I91A 1G52A 1BNNA 5FNLA 3UYNA 4QIYA 1CNKA 1YO2A 2CBCA 1KOPA 4JSSA 3BL1A 3FFPX 1AM6A 4K0TA 2CBDA 4KUYA 3U7CA 3OYQA 3MHCA 1UGFA 2EZ7A 3DCWA 4XFWA 1RZCA 2NN1A 3EFTA 3M5SA 2WD3A 3OYSA 5SZ7A 1ZSAA 2VVAX 1BN3A 5FL5A 3DAZA 3IBLA 2POWA 1G46A 4XZ5A 4Z1JA 1XPZA 2FOSA 1BNMA 3M67A 1YO0A 5E5RA 5DSJA 2FOVA 1CRAA 3S8XA 2NWOA 1CNWA 1CVBA 3NJ9A 3RG4A 1CILA 1H9QA 2WD2A 1ZSCA 4Y0JA 3T83A 1I8ZA 3MNJA 2WEOA 2NWZA 1ZFKA 4M2VA 1CNGA 5L6KA 5CA2A 1URTA 3M04A 5JQTA 4Q07A 1UGGA 5DRSA 4YWPA 5FNKA 4CNVA 4UOVA 3B1BA 1J9WA 1RZBA 2QO8A 4YXOA 1H4NA 1THKA 1UGCA 4TWMA 1CAJA 1IF8A 4N0XB 1G4OA 3M3XA 3M2YA 4QK3A 1ZNCA 3KNEA 4RUZA 4XIXA 3VBDA 1HEAA 3P5AA 1CAIA 4MTYA 1IF5A 4K13A 3RLDA 1RAZA 4LP6A 4RUXA 2CBAA 4R5AA 5JGTB 3RYXB 3MNKA 1CANA 4MLTA 2OSMA 3GZ0A 2HOCA 1JCZA 5E5UA 4Q7VA 3IBIA 2POUA 5FNHA 1CVCA 2F14A 2NXRA 1KOQA 4YVYA 2NXTA 1IF7A 4L5UA 3S72B 4KNNA 1RJ6A 5EIJA 5JESB 3C7PA 2AX2A 1TEQX 4Q7PA 4QY3A 3T85A 1TEUX 4HBAA 4Q0LA 3M96A 4ITOA 1IF4A 3R16A 4E3GA 2POVA 4Q87A 5FLOA 4JSZA 1CNJA 5SZ5A 1I9PA 2NNGA 1DCBA 4E9OX 4Z0QA 3BETA 3RJ7A 3NB5A 4DZ7A 3DD8A 2GD8A 3JXGA 3KIGA 3W6IA 4Q09A 4ZWXA 4RIUA 5AMLA 4QTLA 1CAOA 4Q99A 5FL6A 5DOHA 1EOUA 4YX4A 3HS4A 3N0NA 1KWRA 1OQ5A 2ILIA 5EKMA 2FNKA 3U45X 5FLPA 3JXHC 4BF6A 1CA2A 2IT4A 3M1WA 4WUPA 5EH8A 2Q1BA 1G53A 5JEHB 1YDAA 4PXXA 2CA2A 4PYXA 3F4XA 3HKNA 3MMFA 4CA2A 1BICA 5EH7A 3KOIA 3P4VA 4K0SA 4Q08A 4CQ0A 1BNUA 4QJMA 1CZMA 3B4FA 4KP8A 5FLQA 4MO8A 5HPJA 3MZCA 4E4AA 4RUYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ML2 A;  1CAY A;  1DMX A;  3MHO A;  1BCD A;  3D0N A;  1YDC A;  1Y7W A;  1CCS A;  1RZA A;  3Q31 A;  5EHW A;  3HKQ A;  4WW8 A;  3V7X A;  3NI5 A;  1TE3 X;  4HEZ A;  1FSR A;  4PZH A;  1UGB A;  3BL0 A;  5FNG A;  3RYZ A;  4YGL A;  1ZH9 A;  1CVD A;  4CNW A;  4YGK A;  5EKJ A;  1CNI A;  1LUG A;  3DC3 A;  3U47 A;  5FNJ A;  4HT0 A;  4Q49 A;  1CIN A;  1FQR A;  5DOG A;  1HVA A;  1YDB A;  5DVX A;  5SZ2 A;  4XIW A;  1UGA A;  3V3I B;  4YGN A;  4YXU A;  1HUH A;  4YGJ A;  4IDR X;  1XEV A;  3K7K A;  1YDD A;  1I9Q A;  1BN4 A;  5DSQ A;  2Q1Q A;  3DCC A;  4QJO A;  4HT2 A;  1I9L A;  4YGF A;  4HU1 A;  4TWL A;  3HKU A;  4X5S A;  3M2N A;  3SAX A;  5LMD A;  5EHV A;  1DMY A;  4Q7S A;  4E3H A;  9CA2 A;  1HCB A;  4CNR A;  1CA3 A;  2EU3 A;  2FNM A;  5SZ3 A;  1BNW A;  3V3H B;  5DSR A;  5DSK A;  1CVE A;  3RYY A;  4Q06 A;  1OKL A;  1JV0 A;  4KNJ A;  2FMG A;  3DVD A;  4YXI A;  4R5B A;  1BNT A;  1I9M A;  2FW4 A;  1TB0 X;  4M2U A;  1FQM A;  4QJX A;  4KAP A;  3MHI A;  1LG6 A;  3RZ7 A;  1RJ5 A;  2HL4 A;  1A42 A;  1OKM A;  3M5T A; 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