4QJ0A

Crystal structure of catalytic domain of human carbonic anhydrase isozyme xii with inhibitor
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
KWTYFGPDGENSWSKKYPSCGGLLQSPIDLHSDILQYDASLTPLEFQGYNLSANKQFLLTNNGHSVKLNLPSDMHIQGLQSRYSATQLHLHWGNPNDPHGSEHTVSGQHFAAELHIVHYNSDLYPDASTASNKSEGLAVLAVLIEMGSFNPSYDKIFSHLQHVKYKGQEAFVPGFNIEELLPERTAEYYRYRGSLTTPPCNPTVLWTVFRNPVQISQEQLLALETALYCTHMDDPSPREMINNFRQVQKFDERLVYTSFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 12
publication title Functionalization of Fluorinated Benzenesulfonamides and Their Inhibitory Properties toward Carbonic Anhydrases
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4qj0A00
2QP6A 1AM6A 3CAJA 3CA2A 3RG3A 1G0EA 3Q31A 4QK3A 5G0BA 1CNWA 4YX4A 2NMXA 4CNWA 4ZWZA 2NXSA 3OYSA 4QK1A 5A25A 5CACA 1G48A 3M5EA 4HEZA 5DOHA 1I91A 1XPZA 5BRWA 5FDCA 1TBTX 4HBAA 3M1WA 3V5GA 4IWZA 1HECA 5E28A 3MNHA 4PXXA 4Q8YA 1CAYA 1RAYA 3MHCA 1UGAA 4YWPA 4E4AA 1JD0A 4ZWIA 4XIXA 1UGGA 3NB5A 3C7PA 3M04A 4QJPA 4WW6A 3S75B 3MNUA 2H15A 1H9QA 5FLPA 2FMGA 4COQA 1CNCA 3DCSA 4Q06A 3V3JA 5BRUA 1CAKA 1HUHA 4LP6A 3RYZA 1UGCA 5E2NA 3MWOA 3RZ5A 4Q7VA 1CZMA 1RZDA 4JSZA 4Q09A 3B1BA 9CA2A 3D9ZA 1ZFQA 4XIWA 4HT0A 3ML5A 2X7UA 5J8ZA 2CA2A 2FOYA 5BYIA 5EZTX 2NWZA 3U45X 3HKTA 5EHWA 3KKXA 1HEBA 4Q7PA 2CBEA 3S73B 3MHLA 4BCWA 3M5TA 1YO2A 4N16A 4QIYA 1CAIA 2WD2A 3M14A 1KEQA 4QSJA 1CVHA 4YXOA 4RN4A 5L3OA 4HT2A 1ZSCA 1CNJA 3M2XA 5FNGA 3T84A 1CRAA 1HCBA 4YGFA 4QTLA 5DSRA 4TWLA 3UYQA 3T82A 4IDRX 4KUYA 3HKQA 4FU5A 3DC3A 1I9QA 2WEHA 5DSOA 3RZ0B 3RYJB 1BNVA 1I90A 5L6KA 4Q81A 5JQTA 5CJFA 2FOUA 2WEOA 4CA2A 4L5WA 5JESB 4M2RA 5EH5A 4PZHA 2FMZA 1TG3A 5IPZA 3M5SA 1CAMA 3M1KA 3K34A 2EZ7A 1Z9YA 1FR7A 4YGJA 5AMLA 1MOOA 1TB0X 3M3XA 12CAA 3M98A 3KOKA 1XEGA 5EH7A 4CACA 1TE3X 3F7UA 4Q9YA 2NNSA 4YGNA 1CAJA 1V9EA 4L5UA 3S9TA 3FW3A 2HFWA 1FQLA 3S74B 3DBUA 1HUGA 1HVAA 1Z97A 3GZ0A 1CALA 4ETQC 2ABEA 5JQ0A 3T5ZA 1OKMA 4LHIA 2W2JA 4JSWA 4E3HA 3T5UA 3MNAA 4RIUA 3HKUA 4G0CA 1BNNA 4RIVA 1UGBA 5DSNA 3P4VA 3RGEA 1BNMA 2ILIA 2EU3A 1CAZA 2GD8A 3K7KA 1URTA 2FOSA 3DVCA 3ML2A 4WUPA 1I9MA 5HPJA 3BETA 4ITPA 1CVCA 4MLXA 1I8ZA 5JDVB 2FNNA 5G03A 5AMGA 4Q49A 1G52A 2VVBX 1I9PA 3S76A 5G01A 5EH8A 3N2PA 5JEHB 2FW4A 1ZH9A 1YDAA 4Z0QA 1FQMA 3LXEA 1IF6A 3M40A 5DSPA 4QSIA 5CLUA 4QJWA 5DSMA 4M2UA 5JG5B 1CNYA 3OIKA 4ZWXA 1CNIA 3M67A 3DAZA 3MMFA 1LGDA 1FSRA 3V7XA 3RZ8A 1G45A 4WL4A 4FRCA 1EOUA 3FE4A 1KOQA 3TVOX 3KONA 2FNMA 4UOVA 1HCAA 4MDMA 2AW1A 4C3TA 4KNIA 3OYQA 4ZX1A 4QSBA 3W6IA 4Q6EA 1CVAA 3S78B 3L14A 2X7TA 1CVFA 3JXFA 1H9NA 3DD8A 3IEOA 5FLQA 5FL6A 5FLTA 1G54A 1IF5A 3NJ9A 3S97A 4WW8A 2NNGA 3MZCA 3V2JA 1BCDA 2OSMA 3OKUA 1CA3A 4R5AA 5FL4A 2AX2A 3KOIA 4QJXA 1XEVA 3K2FA 3ZP9A 4K1QA 4N0XB 4JSAA 1UGFA 5SZ5A 3IBIA 1CCTA 3MDZA 5EIJA 3SBIA 1BNWA 3T83A 3KLDB 1CNKA 1AZMA 3P5LA 4Q90A 3N0NA 4RH2A 4HEYA 1G53A 4MO8A 2NN7A 4M2VA 5JGTB 2H4NA 3M2ZA 1CINA 5E5UA 1Z93A 3DCCA 5EKHA 4Q78A 4K0TA 3V2MA 5BNLA 4WR7A 5DSKA 2NWOA 3MNIA 1BZMA 3OILA 5DVXA 3MYQA 1CAOA 3RZ1B 1BNUA 1G1DA 1KWRA 3R17B 1CCSA 4MLTA 1DCAA 5DSJA 3HS4A 3P5AA 3RZ7A 1HEAA 1V9IC 3MNJA 1RAZA 3MHIA 4PQ7A 4Q87A 1FSNA 4YYTA 2NNVA 4QIZA 2CABA 4RFCA 4MTYA 1TEQX 4Q8ZA 5JGSB 3KS3A 1OQ5A 1BN4A 4HU1A 3KIGA 8CA2A 5AMDA 2QO8A 4KNNA 2HL4A 4QSAA 4HF3A 4E9OX 4Z1EA 4E3FA 3JXHC 2FOVA 1DCBA 1RZAA 4BF6A 3IAIA 5DSQA 1CNGA 2FOQA 4L5VA 3D93A 4KUWA 1YDCA 4Y0JA 3S71B 2NWPA 4R59A 4RUYA 4YXUA 3V3HB 4QEFA 4QJMA 3DD0A 4CQ0A 3FFPX 4FIKA 3U7CA 4ZWYA 1FLJA 3P3HA 1ZSBA 5JG3B 3BL0A 1IF9A 5BRVA 3EFIA 1TH9A 3RJ7A 2VVAX 3EFTA 2Q38A 1ZFKA 4Q0LA 1KWQA 3NI5A 5FNJA 1JV0A 3SAXA 3M2YA 2GEHA 3RYXB 5EHVA 3TMJA 3P44A 3M96A 3RG4A 1JCZA 1ZNCA 4TWMA 3DC9A 1LG6A 1CNBA 2IT4A 4G7AA 2WEGA 4E3GA 4YGKA 4E49A 5SZ2A 2OSFA 1LG5A 4GL1X 5FNLA 4YXIA 3DA2A 1CAHA 5E2MA 1ZGEA 1RJ5A 3OY0A 4KP5A 5LMDA 2WEJA 2HD6A 4X5SA 5E2RA 4ZAOA 1CVBA 1HEDA 1IF4A 2O4ZA 3RYVB 4Q7WA 1XQ0A 4MDGA 3HKNA 2POVA 4Q6DA 3HLJA 4RUXA 4RUZA 4YGLA 4Z1NA 2NNOA 1BNTA 1I9NA 4QK2A 4QJOA 5EKJA 4BF1A 5SZ7A 1YO0A 1T9NA 3M1QA 3TVNX 4KNMA 3T85A 1H4NA 3F8EA 2HOCA 1F2WA 2CBBA 3F4XA 3U3AX 3DV7A 1KOPA 3MHMA 5SZ6A 5E2KA 5A6HA 1TTMA 1BNQA 1YO1A 3OIMA 4QY3A 1I9OA 5FNKA 1I9LA 4JSSA 3DVBA 1UGDA 3KWAA 2CBAA 4KAPA 5DRSA 5DOGA 2POUA 3SBHA 4KP8A 3MNKA 4KUVA 1A42A 3JXGA 2POWA 1TEUX 4MDLA 5FLSA 1J9WA 3CYUA 4CNRA 3PYKA 3RLDA 4XFWA 3N4BA 1OKLA 3M1JA 4DZ9A 5SZ4A 1CRMA 1THKA 1DMYA 1CANA 2Q1BA 3OKVA 1RZBA 2NXTA 1YDBA 1IF7A 5E2SA 4HEWA 4CNVA 4K0ZA 1CVDA 1ZGFA 3IBLA 2NWYA 3M2NA 4FVNA 1BN3A 3B4FA 3W6HA 1CNXA 3F7BA 1LZVA 1TG9A 4KNJA 4WUQA 2NXRA 3D8WA 4XE1A 3P55A 1OKNA 2HNCA 2HKKA 4JS6A 3S72B 4E5QA 4Q8XA 1ZSAA 3V3IB 1G0FA 1G6VA 3QYKA 1CNHA 1BN1A 5FNIA 4Q83A 4CNXA 4FL7A 1G4OA 4QJ0A 1MUAA 1RZEA 1LUGA 4Q08A 1G3ZA 4Q7SA 3UYNA 5SZ1A 4K13A 3ZNCA 2X7SA 3KNEA 4K0SA 4LU3A 4R5BA 5G0CA 2CBDA 5JEGB 1G46A 4FVOA 4Q07A 4E3DA 1CCUA 3S8XA 2Q1QA 5FNHA 1DMXA 3D92A 3V3GB 5DSLA 4ITOA 1FR4A 3P3JA 3D0NA 3HFPA 4PYYA 3V3FA 1G4JA 1CIMA 5C8IA 1RJ6A 4PYXA 2CBCA 5FLOA 5EOIA 3IBUA 3R16A 5FLRA 1FQNA 1Y7WA 3S77B 1ZE8A 4KV0A 1BV3A 4YVYA 4XZ5A 3DVDA 1CA2A 3N3JA 3IBNA 1UGEA 2FNKA 2WD3A 4FPTA 3U47A 2QOAA 4YHAA 1YDDA 5FL5A 1AVNA 3DCWA 4RFDA 5FDIA 1IF8A 5SZ3A 5SZ0A 4Q99A 1FSQA 4M2WA 5E5RA 3IGPA 3P58A 1RZCA 3PO6A 5DSIA 3VBDA 4Z1KA 4DZ7A 3CZVA 2NN1A 5FNMA 2ZNCA 3MHOA 2EU2A 1CILA 4Z1JA 3PJJA 3SAPA 5EKMA 3BL1A 5EHEA 4ZX0A 5JEPB 5CA2A 6CA2A 1BICA 3RYYA 7CA2A 1CVEA 2F14A 4ILXA 1FQRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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 2QP6 A;  1AM6 A;  3CAJ A;  3CA2 A;  3RG3 A;  1G0E A;  3Q31 A;  4QK3 A;  5G0B A;  1CNW A;  4YX4 A;  2NMX A;  4CNW A;  4ZWZ A;  2NXS A;  3OYS A;  4QK1 A;  5A25 A;  5CAC A;  1G48 A;  3M5E A;  4HEZ A;  5DOH A;  1I91 A;  1XPZ A;  5BRW A;  5FDC A;  1TBT X;  4HBA A;  3M1W A;  3V5G A;  4IWZ A;  1HEC A;  5E28 A;  3MNH A;  4PXX A;  4Q8Y A;  1CAY A;  1RAY A;  3MHC A;  1UGA A;  4YWP A;  4E4A A;  1JD0 A;  4ZWI A;  4XIX A;  1UGG A;  3NB5 A;  3C7P A;  3M04 A;  4QJP A;  4WW6 A;  3S75 B;  3MNU A;  2H15 A;  1H9Q A;  5FLP A;  2FMG A;  4COQ A;  1CNC A;  3DCS A;  4Q06 A;  3V3J A;  5BRU A;  1CAK A;  1HUH A;  4LP6 A;  3RYZ A;  1UGC A;  5E2N A;  3MWO A;  3RZ5 A;  4Q7V A;  1CZM A;  1RZD A;  4JSZ A;  4Q09 A;  3B1B A;  9CA2 A;  3D9Z A;  1ZFQ A;  4XIW A;  4HT0 A;  3ML5 A;  2X7U A;  5J8Z A;  2CA2 A;  2FOY A;  5BYI A;  5EZT X;  2NWZ A;  3U45 X;  3HKT A;  5EHW A;  3KKX A;  1HEB A;  4Q7P A;  2CBE A;  3S73 B;  3MHL A;  4BCW A;  3M5T A;  1YO2 A;  4N16 A;  4QIY A;  1CAI A;  2WD2 A;  3M14 A;  1KEQ A;  4QSJ A;  1CVH A;  4YXO A; 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