4QJWA

Crystal structure of catalytic domain of human carbonic anhydrase isozyme xii with inhibitor
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
KWTYFGPDGENSWSKKYPSCGGLLQSPIDLHSDILQYDASLTPLEFQGYNLSANKQFLLTNNGHSVKLNLPSDMHIQGLQSRYSATQLHLHWGNPNDPHGSEHTVSGQHFAAELHIVHYNSDLYPDASTASNKSEGLAVLAVLIEMGSFNPSYDKIFSHLQHVKYKGQEAFVPGFNIEELLPERTAEYYRYRGSLTTPPCNPTVLWTVFRNPVQISQEQLLALETALYCTHMDDPSPREMINNFRQVQKFDERLVYTSFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 12
publication title Functionalization of Fluorinated Benzenesulfonamides and Their Inhibitory Properties toward Carbonic Anhydrases
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4qjwA00
4RN4A 3PO6A 3U3AX 1CAIA 3P5AA 2NMXA 3KONA 4KNNA 4YVYA 4PQ7A 5EH7A 3RYVB 1RZBA 4YGFA 1IF4A 1CVAA 5EH8A 1YDAA 4M2UA 2FMGA 5AMGA 1CAJA 3MDZA 5SZ1A 4UOVA 1BICA 1CVHA 2FOQA 1MOOA 4E5QA 1OQ5A 1RJ6A 2NNVA 3M40A 4E3FA 4BCWA 3M2YA 1G0FA 3N3JA 3IBNA 4E3HA 3UYQA 5JESB 4HF3A 2WEOA 1CAZA 1KWQA 5FL6A 3Q31A 1ZH9A 4WUQA 3S77B 1EOUA 1YO0A 4Q09A 3V3JA 4Q8XA 7CA2A 3W6IA 1YDDA 3P58A 4JSSA 4Q7SA 1FQRA 2QP6A 1A42A 4KP5A 3F8EA 5EHWA 5G01A 3M5SA 5HPJA 3V3GB 4QSBA 3S8XA 1Y7WA 1ZSBA 4HEZA 4ITPA 2FNMA 4K1QA 5DRSA 3DA2A 1I9MA 3S73B 3EFIA 3NI5A 4RH2A 3OIMA 3JXGA 1YO2A 2ABEA 4HU1A 5E5RA 5JQTA 1TG3A 3K2FA 2HNCA 1IF7A 4QK3A 5SZ2A 2X7SA 1TTMA 5SZ4A 1BNQA 1KWRA 1CNCA 4ZWYA 1BNWA 3FFPX 4Q0LA 5EZTX 3KKXA 4R5AA 1Z9YA 2VVAX 1HUGA 1HEDA 3B1BA 4Z1EA 1UGGA 3M1QA 1FQNA 4RIUA 1CVDA 3UYNA 3MNHA 2CABA 5EHVA 1ZFQA 4M2WA 4ZWZA 5JEGB 2CBBA 3RLDA 4BF1A 1HCAA 4YX4A 1XQ0A 4FPTA 4KUWA 4XZ5A 3MHOA 5G0CA 5DSRA 3MHLA 5L3OA 4QK1A 4HBAA 1CNXA 4KUYA 1CNGA 1UGEA 1URTA 1LZVA 4LU3A 1FSRA 2CBEA 3D93A 3ZP9A 1LG5A 4QJOA 3M04A 1BNNA 5JDVB 1IF8A 5JGSB 3NB5A 1CA3A 4ZAOA 1LGDA 2CBCA 1G52A 3FW3A 1I9NA 2FW4A 3QYKA 3MYQA 4FU5A 3OYQA 1BCDA 3V3IB 2VVBX 5FLPA 3HFPA 4LP6A 1MUAA 3IBIA 4CNVA 5EKHA 4Q7VA 4Q90A 4WW8A 3BETA 3KIGA 4XIWA 3S9TA 2FNNA 2FOUA 2WD2A 1FLJA 5FNGA 3SAXA 4X5SA 3U47A 1KOPA 5DSOA 4QSAA 3MHIA 3RGEA 4CNRA 5FL4A 4CNWA 4E3DA 4Q6DA 2FOVA 5EKJA 4MDLA 5CLUA 1AM6A 1CNKA 4Y0JA 3T84A 1BNVA 5FLSA 1LG6A 5AMLA 3RZ0B 1CIMA 3HKUA 1G4JA 4Q83A 4KV0A 3DBUA 3P55A 5C8IA 3KNEA 2NN1A 1CCSA 1UGFA 2NNSA 3L14A 2HKKA 3V7XA 1ZNCA 5FDIA 2X7TA 1HECA 1I9OA 1G3ZA 4L5UA 1CCUA 3SBHA 2H15A 3OYSA 1IF6A 3GZ0A 4QIZA 3N0NA 2AW1A 4ZX0A 4QIYA 5FNJA 1YDCA 3P3HA 2NNOA 1CNYA 1CRMA 5DSMA 3KOKA 4KNMA 1DCBA 1HEBA 1CVBA 4E9OX 1UGCA 1TBTX 3MNAA 1V9EA 3LXEA 1CAYA 2Q38A 5FDCA 4YWPA 4Q7WA 3R16A 3D9ZA 4R5BA 1CA2A 3S76A 4CACA 1CNHA 4YXOA 1OKMA 3P4VA 4DZ7A 5EHEA 3TVNX 1UGBA 3HKQA 5E2MA 4QJXA 5JEPB 1I9QA 3M2NA 1BNMA 1TEQX 4L5VA 1HEAA 3S75B 3DVBA 3SAPA 5G0BA 2Q1QA 3T83A 4FVNA 4IWZA 5DOHA 5CJFA 5FLQA 3M1KA 2NWPA 3KLDB 3VBDA 2POUA 4K0TA 3K7KA 4XIXA 1CINA 9CA2A 2ZNCA 4MO8A 1HCBA 2POVA 4Q6EA 4YGJA 3M2ZA 3MMFA 5FLTA 5FNLA 3IGPA 4YGNA 4RFDA 5FNMA 4CNXA 1BV3A 3P44A 3MNKA 5E2KA 4ZWXA 1RAYA 5AMDA 3B4FA 3RZ7A 2IT4A 4Q87A 4C3TA 3JXFA 3DCCA 5E2NA 1BN3A 3HKNA 4QJPA 2F14A 4QSJA 5CA2A 3ZNCA 5SZ3A 4Z0QA 4ZWIA 2WEHA 4QJMA 3ML2A 1G45A 3IEOA 3S97A 3M96A 1CILA 4YHAA 4YYTA 4YGKA 5BRUA 3MHMA 2FNKA 5FNHA 1T9NA 4RIVA 1FR7A 2WEJA 3MNJA 4Z1JA 4TWMA 1ZFKA 3D92A 1RJ5A 3S71B 3M3XA 1Z93A 3M5EA 2EU2A 4JSWA 1YO1A 3NJ9A 2NXSA 4Q81A 1CNBA 2HD6A 4E4AA 5LMDA 5BYIA 1CVFA 1TB0X 4Q06A 5IPZA 5DOGA 4JSZA 4PYXA 1CNJA 4KAPA 4Q8YA 1HVAA 1XPZA 4WR7A 5FL5A 1BN4A 2NN7A 4Q99A 5E5UA 3DCSA 1ZE8A 3M5TA 1CZMA 4YGLA 4IDRX 5BRVA 1G1DA 2NXTA 3JXHC 5JG3B 4Q8ZA 5E2RA 5EOIA 2HL4A 5DSJA 5A6HA 1FSNA 1BZMA 3C7PA 3CAJA 5DSQA 4KUVA 4WL4A 1DMYA 1UGDA 3KWAA 4YXIA 1ZSAA 4CQ0A 1TEUX 1G54A 4XFWA 1OKNA 2GEHA 4Z1KA 4CA2A 1CANA 5FLOA 2POWA 1G48A 3M98A 4MLXA 1CNIA 3TMJA 3EFTA 4FVOA 4Q08A 3P3JA 4N0XB 1RZEA 5BRWA 3DC3A 1ZGFA 1H9QA 12CAA 5EH5A 2NWZA 3HS4A 3MHCA 2CBAA 1J9WA 4KP8A 4FRCA 4RUXA 3RZ8A 5DSIA 1V9IC 1XEVA 3M1JA 3R17B 1UGAA 4G0CA 1CALA 3MWOA 5EKMA 1CVEA 1FR4A 4QY3A 1BNTA 4MTYA 2X7UA 2W2JA 4K13A 3U7CA 2FOSA 1BN1A 3DC9A 1FQLA 3KS3A 6CA2A 3M2XA 1FQMA 3U45X 1JCZA 1ZGEA 3BL0A 4K0ZA 3V2JA 3HLJA 5DVXA 3S72B 2WEGA 4FIKA 4BF6A 1H9NA 2FOYA 3S74B 1TE3X 4RFCA 5E28A 3RYZA 4ZX1A 4MLTA 1G0EA 5JGTB 3CA2A 3IBUA 4JSAA 3RJ7A 5E2SA 1AZMA 1H4NA 4Q49A 3K34A 4PXXA 1TG9A 5J8ZA 4KNIA 1OKLA 3KOIA 4GL1X 3FE4A 4HEWA 5DSKA 4ETQC 3T5ZA 5A25A 4QEFA 2WD3A 4MDMA 4LHIA 4MDGA 2ILIA 1LUGA 2OSMA 3T5UA 1CAMA 1IF9A 2GD8A 2NWYA 3M67A 4COQA 5JQ0A 4HEYA 2CA2A 2EU3A 3N4BA 1THKA 3PJJA 3M1WA 1I8ZA 4PYYA 5SZ0A 2CBDA 3OY0A 5DSPA 1RZDA 4E49A 3PYKA 3DAZA 4N16A 1CAOA 4Q78A 4R59A 3IAIA 4HT2A 4QJ0A 3T85A 5JG5B 1Z97A 3DVDA 1ZSCA 1I90A 1KOQA 4WUPA 3F7BA 3RG4A 1XEGA 3HKTA 3RZ1B 5SZ7A 1CAHA 2HOCA 3SBIA 1CRAA 5SZ5A 3T82A 3DD8A 1DCAA 1TH9A 4DZ9A 1IF5A 3F7UA 1HUHA 3DCWA 4KNJA 1RZCA 2NWOA 5FLRA 4QTLA 1CAKA 1RAZA 3MNIA 1FSQA 2NXRA 3P5LA 3OIKA 4K0SA 3W6HA 4PZHA 1AVNA 3DD0A 4FL7A 1BNUA 5JEHB 4Z1NA 4WW6A 3RZ5A 1RZAA 1CCTA 4G7AA 5FNIA 3ML5A 4YXUA 2FMZA 5DSLA 4Q7PA 5G03A 5SZ6A 2O4ZA 1G46A 4RUYA 3V2MA 3BL1A 3TVOX 3V3FA 1DMXA 1F2WA 5DSNA 4L5WA 4E3GA 3RYXB 5L6KA 3MZCA 1G4OA 1I9LA 4JS6A 4XE1A 2AX2A 2EZ7A 3S78B 1I9PA 1I91A 4M2RA 3RG3A 4QSIA 5BNLA 3RYJB 1CNWA 3CZVA 5FNKA 3IBLA 4QJWA 4TWLA 5EIJA 2HFWA 2OSFA 3DVCA 4ITOA 4QK2A 3N2PA 4M2VA 1G6VA 1YDBA 3V5GA 3F4XA 5CACA 2QOAA 3CYUA 3D0NA 3OILA 3OKVA 3DV7A 3OKUA 4HT0A 1CVCA 3V3HB 2NNGA 1KEQA 2Q1BA 4ILXA 3MNUA 4Q07A 1JV0A 1G53A 2QO8A 4Q9YA 4RUZA 3M14A 3RYYA 2H4NA 8CA2A 1JD0A 3D8WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RN4 A;  3PO6 A;  3U3A X;  1CAI A;  3P5A A;  2NMX A;  3KON A;  4KNN A;  4YVY A;  4PQ7 A;  5EH7 A;  3RYV B;  1RZB A;  4YGF A;  1IF4 A;  1CVA A;  5EH8 A;  1YDA A;  4M2U A;  2FMG A;  5AMG A;  1CAJ A;  3MDZ A;  5SZ1 A;  4UOV A;  1BIC A;  1CVH A;  2FOQ A;  1MOO A;  4E5Q A;  1OQ5 A;  1RJ6 A;  2NNV A;  3M40 A;  4E3F A;  4BCW A;  3M2Y A;  1G0F A;  3N3J A;  3IBN A;  4E3H A;  3UYQ A;  5JES B;  4HF3 A;  2WEO A;  1CAZ A;  1KWQ A;  5FL6 A;  3Q31 A;  1ZH9 A;  4WUQ A;  3S77 B;  1EOU A;  1YO0 A;  4Q09 A;  3V3J A;  4Q8X A;  7CA2 A;  3W6I A;  1YDD A;  3P58 A;  4JSS A;  4Q7S A;  1FQR A;  2QP6 A;  1A42 A;  4KP5 A;  3F8E A;  5EHW A;  5G01 A;  3M5S A;  5HPJ A;  3V3G B;  4QSB A;  3S8X A;  1Y7W A;  1ZSB A;  4HEZ A;  4ITP A;  2FNM A;  4K1Q A;  5DRS A;  3DA2 A;  1I9M A;  3S73 B;  3EFI A;  3NI5 A;  4RH2 A;  3OIM A;  3JXG A;  1YO2 A;  2ABE A;  4HU1 A;  5E5R A;  5JQT A;  1TG3 A;  3K2F A;  2HNC A;  1IF7 A;  4QK3 A;  5SZ2 A;  2X7S A;  1TTM A;  5SZ4 A;  1BNQ A;  1KWR A;  1CNC A;  4ZWY A;  1BNW A;  3FFP X;  4Q0L A;  5EZT X; 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