5ADXH

Cryoem structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords ACTIN RELATED PROTEIN 1
publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5adxH03
1U2VA 5AFUA 1GLDG 1C0FA 4H0TB 4NO7A 2NRHA 4WYBA 4CBUA 3IDHA 2ZWHA 4YDUA 3MK6A 5LJWA 1ZBSA 5AQMA 4XH1A 4BRPA 4K25A 3FZLA 1RDWX 5JLHA 2P9PA 4FWKA 1NGIA 4FOIA 2W40A 1SAZA 3VESA 2E2NA 3WXIA 4BRGA 4MLHA 1NGFA 1LOTB 3D2EB 2CH6A 5KPZA 4BRAA 4FWMA 5BREA 4YDUC 1WUAA 2F9WA 5KQDA 1ATRA 3LDOA 3EZWA 1GLCG 2E2OA 2D1KA 4BR7A 1SZ2A 3C7NB 4B1WB 4EAHD 3CHWA 5AQVA 1K8KA 1NGJA 4QS9A 2P9IA 3A5OC 4BR4A 1NGGA 4BREA 2D4WA 1U6ZA 3EKUA 1LCUA 1OKJA 3ENOA 5AQLA 2CGJA 3UKRB 4BVOA 2Q31A 3QDKA 3MN7A 3QFUA 4PL8A 1KAYA 4BC4A 3CQXA 1GLJO 2P9NA 2V7ZA 4FWNA 4MLEA 4FPAA 2AA4A 1QQMA 5BPMA 3S41A 3VEVA 1C0GA 3VF4A 4BC3A 2A5XA 5AQTA 1BU6O 2AP1A 3VETA 3WEEA 4CZLA 3M3ZA 4A62A 3H3NO 4CBXA 3CJ7A 4BRDA 3HSCA 5EX5A 4KBOA 4CD3A 5FPDA 1QHAA 3LM9A 4BG9A 1GLEG 1DGKN 3BEXA 3VGMA 3FZFA 4XH4A 3WUHA 1BO5O 4L3QA 1BUPA 2ZGYA 4BRFA 3VEZA 3P4IA 2Q1NA 5EOYA 2PAVA 3O5BA 2YHYA 4IZ9A 3VPZA 4C23A 3CJBA 3ID8A 2CGLA 4JNEA 4GNIA 1BA1A 1HPMA 3VEOA 4IO8A 2P9UB 4LC9B 4BRLA 3DXMA 5AQSA 3R9PA 2QWLA 4H0PA 5I9EB 2P9KB 4FWSA 1BOTO 1U2VB 1JCFA 3R8EA 4A2BA 1BWFO 3FZMA 2WUSA 2DPNA 2Q36A 3KVGA 3WXLA 2E8AA 2V52B 4AM7A 1NMDA 5FPEA 3IUCA 5AQQA 4B1ZA 1NM1A 1ATNA 4K41A 1QQOA 3H1QA 3ZX3A 1TUUA 3B8AX 4FWRA 2P9PB 4RTFD 4AM6A 1XQSC 1R59O 2V7YA 4MO4A 1IG8A 2QWOA 3HTVA 3EKSA 5AQFA 2FLOA 4BC5A 5AZJA 4BRCA 1GLLO 1CZAN 2IVPA 3CJ1A 2E88A 5BRHA 3CI5A 3GOIA 1GLAG 2NZTA 1K8KB 4FPBA 2W41A 2QWMA 1J6ZA 2E2PA 2P9IB 5ELZA 4BQLA 5ADXH 4QS8A 4K42A 4FWQA 5BRFA 2GWJA 3H45C 2QWQA 5AQKA 3GDQA 1NGBA 2ITMA 4PL7A 4EIAA 3FFKB 3EN9A 3O4WA 1KAXA 3FLCO 3O80A 3L0QA 5AQJA 2P9NB 2Q2RA 4BGBA 1EQYA 3FZHA 5LJVA 5AQNA 2A6AA 4EHTA 4H0OA 2VYPA 4O5FA 4B1UB 3AY9A 3QFPA 3IMXA 4PKHA 3ENHA 3GG4A 4CZHA 3WEEB 2J4RA 2QW9A 2VWBA 3HBTA 2IIRA 1NGAA 4FWLA 5BPLA 1RFQA 3HI0A 3H1VX 1KXPA 2I7PA 3EO3A 4F9OA 2Q97A 4FOEA 4M63C 3A8YA 3FZKA 3ZX0A 5BN8A 1TUYA 3UE5A 3ZX2A 5ADXA 3QB0A 2UYTA 1HJOA 3MN9A 3ZETA 1QZ6A 5AQPA 5FPMA 3LDLA 3AAQA 4ISFA 4DB3A 3O08A 4QS7A 2QWNA 3UKUA 5F0XA 4H0YB 4ISGA 5TKYA 3CJ9A 5AZIA 1IJJA 1X3MA 4CBWA 4M7XA 4BRHA 4BVPA 3DXMB 5B8HA 4FWOA 2QXLA 4RCHA 2YI1A 2HMPA 3ULEA 4BQZA 4H0VB 2IVOA 3FGUA 2YHXA 4BG8A 2GWKA 3MMVA 3BF1A 3I8BA 1E4GT 1NGHA 2D0PA 1HUXA 3C0BA 3JXUA 2E20A 4FSVA 1YAGA 1Z05A 4K43A 3VERA 4H0XB 3G25A 3MCPA 3O8MA 3ATUA 2ASPA 4I6MA 3VEXA 5JLFA 5EXWA 1E4FT 5F1XA 1JCGA 3A0IX 3VGLA 4XEIA 5CE3A 5F2RA 3U9DA 3L6QA 2Q0RA 4J8FA 2P9LA 4M7YA 3F9MA 5AQRA 4H03B 3BF3A 5JICA 2PBDA 5AZJB 1ATSA 3D7EO 1XC3A 3QICA 2ASOA 2GUPA 3WXJA 1S3XA 3GE1A 3RSEA 3QBWA 2HF4A 4HWIA 1T6DA 4IWVA 3VENA 3BP8A 1BDGA 2V51B 1MWKA 4EFHA 4JN4A 3U4LA 3LM2A 1ZC6A 3TPQA 2CGKA 4WQ4A 3CQYA 3L4IA 4WQ5A 2CH5A 1Y64A 4IJAA 2E1YA 3SLCA 1DKGD 2VCPA 4NB4A 2FSJA 1P8ZA 1TYQA 3KZBA 4JHDA 1YVNA 3JS6A 3ATVA 2FSKA 5EY4A 4BRIA 2P9SA 5KQ8A 2HF3A 1NGDA 3DAWA 4BRMA 3AARA 1MWMA 4WQ4C 4WQ5C 4MO5A 1D4XA 4H5VA 5E26A 3UB5A 4E1JA 5FPNA 3LDPA 4BRKA 4JAXA 3W3DA 4BC2A 4BRNA 4H5NA 3FR0A 1SQKA 2D0OA 3TU5A 4RWTA 4CZJA 2YHWA 2GELA 2ZGZA 3H6EA 3H46O 2I7NA 3H3OB 2FXUA 3DXKA 1QZ5A 2BUPA 4PKIA 3D2FA 5BR9A 1JCEA 4CZEA 3ZETB 3J8AA 1DEJA 1MDUB 3VF2A 1GLFO 3GBTA 3OHRA 3QBXA 3WT0A 1T44A 3KHYA 3UKUB 3CJCA 4BRQA 5AQYA 2FSNA 4JD2A 1BG3A 4BR0A 5EVZA 1H1VA 1NBWA 5AZIB 5BRDA 4B1VA 2YJFA 3A5LC 2A40A 1NWKA 4GY2B 3VOVA 5E84A 4DCHA 2QWPA 3VF6A 3ZEUA 3ULEB 1V4SA 5BN9A 3FE1A 2ZF5O 1HKCA 1YUWA 3M1FA 1MA9B 3DWLA 3VGKA 5AQXA 4CD1A 1NLVA 1X3NA 3A5MC 3BUZB 2GTDA 4B9QA 1XUPO 4CI6A 1NGEA 5AQHA 3IFRA 2FF3B 3WQUA 1NGCA 3I33A 4CZFA 4H5TA 3SJHA 4I6MB 4FWPA 4A61A 2NLXA 5AQGA 2A3ZA 2HOEA 3AAPA 1BA0A 4IXCA 3GL1A 3D2EA 2P9LB 4O8KA 3CIPA 4Z94A 3WXKA 5LY3A 4ISEA 3A5NC 5AR0A 4CZKA 3LL3A 2EWSA 4XH5A 4BGAA 4BR9A 3C7NA 2A41A 4BROA 1V4TA 5KPTA 2H3GX 3SMSA 3W0LA 3RSEB 1ESVA 2A42A 1HLUA 3LDNA 5AQIA 5AQOA 2KHOA 3HM8A 5AQZA 2F9TA 3SK3A 2Q0UA 2OANA 3QMLA 4IJNA 4DHYA 3EL2A 1KAZA 2BTFA 1GLBG 3UKRA 1YXQA 3MDQA 1WOQA 2QM1A 1TYQB 1X9JA 3U8XA 4JHDB 1Q18A 3HZ6A 3VEYA 4Y0WA 4DQ8A 2P9SB 1HKBA 4B1XB 1Z6RA 2GEMA 4CJ7A 5AFUH 1HKGA 2QWRA 3CERA 2YCHA 4CZMA 3U9ZA 4HTLA 5AQUA 2IVNA 3WQTA 1S22A 3LDQA 4EHUA 3CETA 2FF6A 3R6MA 3CJAA 3MN6A 2ASMA 5KPRA 3M6GA 4FO0A 4FL9A 3DXKB 3O1WA 3D2FB 4A2AA 1T6CA 1G99A 1QQNA 3O1BA 5JMVA 4H5RA 3SMPA 3DJCA 4BR5A 5AQWA 1HX1A 4H5WA 3VEWA 4JD2B 5BPNA 1ZXOA 2P9UA 4PKGA 4CZIA 2E2QA 3O6WA 4B1YB 2E1ZA 4CZGA 1RGIA 2P9KA 3ZEUB 4BR2A 3MN5A 2YJEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1U2VA 3MX5A 4KH4A 3PO4A 4YOYA 2VQFK 3RR7A 2VG5A 2HBMA 1ZBSA 4M3UA 2PZSA 4NYNA 4GVEA 1S5JA 4RW4A 1RDWX 2OYQA 2OZSA 2PFUA 2P9PA 1IH7A 3QO9A 4FOIA 3C6HA 4B08A 4Z4CA 3WXIA 2ZJRL 1LOTB 5EU7A 1QE1A 2CH6A 5KPZA 3U6FA 4FCYA 4YDUC 2ITGA 4FLVA 2F9WA 1HRHA 3LDOA 3KD5E 3WNHA 5I42A 4IFYA 4R5PA 4O8UA 3THYA 3AVHA 4O0JA 4MDAA 4DU4A 5AQVA 3ZSOA 1K8KA 4JI0K 1NGJA 1QSYA 2P9IA 3RMDA 2D4WA 4CEAA 4I2QA 1J53A 4DTUA 3ENOA 3U3YA 2CGJA 4LY7A 4G9ZA 3PIOL 4DSEA 3MN7A 3QFUA 1NG9A 1ASUA 3MEGA 3HP9A 2V7ZA 4DSLA 2HVHA 5IWAK 4GVMA 1T3VA 4N47A 4BC3A 1RT6A 3TWHA 1BHLA 1QSSA 3EY1A 2NNWA 1RBSA 1U45A 2OA8A 3M3ZA 4CGDA 3H3NO 4DLGA 3ITHA 1TKTA 1ZBUA 4B3SK 5HRPA 4JRPA 3SI6A 3RRGA 1RBUA 3AVKA 3ZSVA 1RDCA 4FJNA 1UAXA 4BG9A 4E7IA 4JK9A 3VGMA 1BO5O 3PLAA 2KLAA 3M8QA 3C94A 4BWJA 3VEZA 5A2QO 3NH1A 4CJSA 3C95A 1KTQA 3CJBA 4C23A 4ILHA 4H8KA 3CCRN 2VWJA 1C0MA 1YTAA 3AVGA 1BA1A 1HPMA 3S5TA 1C1BA 4B9NA 4IO8A 2P9UB 3ALYA 3I0RA 4KKOA 2QWLA 4DR1K 2P9KB 4FWSA 1YHQN 1S1UA 1BOTO 3AA2A 4KREA 4A2BA 1BWFO 3FZMA 3TARA 2HHQA 1CZ9A 2IAJA 3VQ6A 4OPKA 4GW6A 2V52B 4K8ZA 5FPEA 4DS5A 5J2QA 1Q7YO 4KPYA 1T8EA 2IC3A 3ZX3A 3CFOA 4ICLA 1VQ6N 3DLKA 5M1FA 5HRRA 1NJZA 3C6TA 4E7LA 3SUOA 4FJ5A 3QNNA 3HRGA 4B3OA 5AZJA 1EXQA 3C6AA 1CZAN 2IVPA 5M1QA 2E88A 4CHOA 2NZTA 2OTLN 3U3GA 2B4JA 2OCEA 2ZJQL 5ELZA 3QINA 1KCFA 5BRFA 4DSIA 3TSPA 4BE1A 3AO1A 3PSFA 3J7ZO 1KAXA 4FK0A 1W7AA 3O80A 3SJJA 2NRXA 2Q2RA 1EQYA 1RBVA 4LSLA 1YF5L 5LJVA 2D5RA 5CHIA 2R7YA 1D8YA 3V1QA 3ENHA 1JLFA 3GG4A 3KK3A 3Q7CA 1J5EK 1I39A 3DLLL 1NGAA 2YX6A 1RBTA 4FWLA 4JI2K 2WTUA 5KTQA 2GX9A 1RFQA 2HSTA 5E41A 3H1VX 3B6PA 4C8MA 3QEVA 4AHRA 2Q97A 2ZJPL 4WFNL 3LZIA 5BN8A 3UIQA 3UE5A 3MAQA 3O9QA 4CFBA 3MN9A 1NKEA 1QZ6A 2HHTA 4WCEL 3ZYYX 4NLBA 4CEDA 1IKYA 2W6KA 3D0PA 3RMCA 1GOBA 4CEOA 4CK1A 4CF9A 4O55A 1HPZA 4BVPA 1SL0A 3DXMB 3PY8A 1KVBA 4FWOA 4RCHA 3SYZA 3OYFA 4JS5A 4EZ6A 2HNDA 3FGUA 4BG8A 4DFMA 3I8BA 3C0BA 3JXUA 5JVGL 4K43A 3VERA 3ATUA 2ASPA 4I6MA 1E4FT 5F1XA 1Y97A 3AO2A 3VTIA 2BH1A 4CGIA 1JCGA 3VGLA 1KSPA 3VA0A 4FW2A 3U9DA 3L6QA 2Q0RA 4J2AA 2P9LA 4H4OA 4KH6A 2XO7A 3BF3A 3F73A 2O8DA 5JICA 3NGIA 3OS1A 1XC3A 4N76A 1A5WA 3QICA 2ASOA 5C10A 1TKDA 3AA4A 3OJSA 1S3XA 4LFBK 3THWB 2WONA 3GE1A 3RSEA 2HF4A 4OKJA 1KRPA 4KHUA 4IWVA 3VENA 4EP5A 3BP8A 4JI3K 3V1OA 3LM2A 4B9VA 3AVCA 3CQYA 3L4IA 1RDAA 1OH5A 2CH5A 4M3XA 4M3WA 3K5NA 5LMUK 3NHGA 1GOAA 2YNHA 1UWBA 4NB4A 2FSJA 1P8ZA 1TYQA 3KZBA 2HBLA 1T7PA 1YVNA 3ATVA 2FSKA 3HPOA 4WE1A 5KQ8A 1QVFM 3CF5L 1CZBA 1JKHA 2DFFA 3FFIA 3MCAB 4MO5A 3VA3A 2A1SA 1NJYA 3SQ0A 1SL2A 1YIJN 1NK5A 5FPNA 2LSNA 1XNRK 4H5NA 3TR8A 5SZTA 3L2QA 1SQKA 2D0OA 2YV0X 4B3TK 5C0YA 3H6EA 2I7NA 3EEQA 5JENA 2FXUA 4C8OA 4JKEA 1JLCA 4CZEA 3ZETB 2XY5A 1U4BA 1WBBA 1MDUB 3VF2A 3GBTA 3KHYA 3ID6A 3UKUB 5AQYA 4JD2A 1IBKK 4BR0A 5EVZA 1NBWA 4JKFA 5BRDA 3BY5A 3O9TA 3AVIA 4CGHA 2A40A 4BY9C 1QTMA 5E84A 4DCHA 2BANA 3QEIA 2ZF5O 3FE1A 4MDBA 3DRPA 2DFEA 4CD1A 3DMJA 1NLVA 3A5MC 1NGEA 3AGKA 5AQHA 4FLXA 3IFRA 3NDKA 2FF3B 3ENBA 3WQUA 4YOTA 3I33A 1C0TA 4CZFA 1K73O 4IFVA 3C65A 2HBJA 2Z1HA 2HOEA 3AAPA 4JV5K 3CFRA 3K5MA 4FZZA 4LF8K 4IXCA 1HNWK 3SQ1A 3KK1A 4DV6K 4F2RA 4F4KA 5AR0A 4CZKA 3VQPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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