5AHN | Genus

Total Genus 102

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	102
sequence length	467
structure length	297
Chain Sequence	MLRISQEALTFDDVLLIPGYSEVLPKDVSLKTRLTRGIELNIPLVSAAMDTVTEARLAIAMAQEGGIGIIHKNMGIEQQAAEVRKVKKHTYPLASKDEQGRLRVGAAVGTGADTGERVAALVAAGVDVVVVDTAHGHSKGVIERVRWVKQTFPDVQVIGGNIATAEAAKALAEAGADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQISAIANVAAALEGTGVPLIADGGIRFSGDLAKAMVAGAYCVMMGSMFAGTEEAPGGALSAIVHQLMGGLRAAMGYTGSADIQQMRTQPQFVRITGA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
publication title	Crystallographic Studies of Two Variants of Pseudomonas Aeruginosa Impdh with Impaired Allosteric Regulation pubmed doi rcsb
source organism	Pseudomonas aeruginosa pao1
total genus	102
structure length	297
sequence length	467
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2015-02-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A	PF00571	CBS	CBS domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5ahnA00

3HO8A 4JTFA 3C56A 1EP3A 3B0PA 3NA8A 2H3DA 3NEVA 4WY0B 4IX0A 5D2XA 3M41A 5AYXA 3RLVA 1W3IA 3GR8A 2J88A 2A2IA 2E5CA 2V30A 2DU2A 3NL5A 3CPRA 4GUGA 4MVAA 1TQJA 5G2WA 2ZA2A 5AHFA 1DJNA 3KVLA 2X2GA 4UFIA 4JTLA 4NX0A 3TAKA 1KM0A 5C6MA 3W72A 3I7SA 3S8HA 1KM1A 1I8JA 1B9BA 1GG1A 2GUUA 3GLCA 3MP3A 4KWVA 3EWXA 1BTMA 5DLCA 1FWSA 1ZAIA 4GUJA 2FJKA 1YDNA 4FNQA 3E9AA 3THAA 3TXZA 1K7FA 2CZFA 3S9YA 3YPIA 4I9AA 2DZVA 4O1AA 2C18A 2Y70A 2FQIA 1IXOA 3WJXA 4A3UA 3SR7A 1XBVA 4WOZA 3O8AA 5G4WA 2E5DA 3VE9A 3DAQA 3QH2A 3R5EA 4LY8A 2WNZA 2EPHA 2FLIA 3NPUA 4C1LA 2VXNA 3M5XA 4DXVA 5CZJA 1QCWA 4CQ9A 3KXQA 1TTQA 1GJPA 1LRQA 3P5ZA 1CX9A 1SW3A 3KOFA 4ADUA 3PB2A 4N9CA 4ORMA 4LU0A 1K8XA 3K30A 3W83A 3A23A 4XBSA 2DZPA 1D3HA 3G3MA 4Z0SA 3GNNA 2ZRYA 4RXGA 1YDOA 4WQ6A 2QDGA 3L68A 1K8ZA 3WFAA 4ONVA 3W1QA 3RNDA 4O53A 3KVKA 4HNVA 1TPDA 1ZHAA 1NFBA 4AHOA 3IVUA 1I2PA 2KZHA 3M0ZA 3ZWTA 4JTTA 1OF8A 5KZDA 3WJYA 3G1DA 2TMDA 1A50A 3IGSA 2NWSA 4BR1A 4WX2A 2Q8LA 4K8HA 3MI2A 1GPWA 2O7QA 3DI0A 1XXXA 4FX7A 2VENA 5LGZA 5D38A 4JTUA 3G3DA 2FPYA 2E1DA 5A8GA 2OT0A 4UTHA 5AC7A 2NZLA 3NL3A 3W2LA 1LROA 3STEA 2Y7GA 3E02A 3CWNA 3QEZA 3TCEA 3W2NA 4W9TA 3TAOA 1LP6A 3EWZA 5E1QA 3N34A 3L66A 4UFJA 1C9DA 2C1HA 4N02A 2JGQA 3NOEA 1FXPA 1X8FA 4X3ZA 3IRDA 3W1AA 5CPOA 3G8RA 1SSDA 3CEPA 3KRSA 3HJZA 3BVJA 3BPWA 3PB0A 4MJMA 2A6LA 1W3NA 2V2HA 3N3MA 5I3IA 1C8VA 3ABSA 3W22A 3KX6A 1NVMA 3HPZA 4WXZA 4KKXA 1W5MA 3FYOA 1OX5A 2JBMA 2ATSA 3QSTA 4UTTA 4K38A 1W56A 1HO4A 6ALDA 2C15A 2QJIA 3T44A 3TH6A 2J24A 5EMUA 1X7FA 3OBKA 5HJLA 2RHGA 4LNYA 3HOJA 4AWSA 5FEWA 1EA0A 4O19A 1H51A 2ZZ6A 4JX6A 1YXYA 5AOUA 3RLUA 3S1UA 3ZWSA 1DORA 1L9WA 1D9EA 3GDKA 4UR8A 3H54A 3CWOX 3FJ6A 4PCFA 3MJYA 3UWWA 4OBTA 5FF7A 4K7VA 1ZALA 4UFMA 1JQXA 1L6YA 2TRSA 3P8IA 3BARA 2QAFA 3LV5A 2V0TA 4P61A 4ALDA 3BV4A 1OK6A 1EEPA 4N9DA 4IXXA 3TSBA 3LCXA 4M6PA 1Q6LA 4EIVA 4XUGA 4RV8A 4GC4A 2CZDA 3W1UA 4HNUA 5LGXA 5D30A 4YL2A 2RDWA 3BW2A 4PTNA 1LBLA 3WK1A 2QCFA 4IPIA 1NF7A 3NQCA 2ABBA 3KHJA 1EWDA 1TPWA 5K9CA 1QMLA 4GBUA 4CNOA 1OYCA 1AG1O 4X9SA 3FKKA 2NV2A 3GNDA 2H8XA 1OFRA 2RH9A 3DKJA 1RR2A 3TJXA 3TNOA 2A7RA 3UZJA 1Q6QA 3N9RA 1VYSX 3KRZA 4CQ8A 2NUYA 3GKFA 3TR2A 4FF7A 3DI1A 4LWWA 1H61A 1YDVA 3LCHA 1TJPA 3IGXA 1GEQA 1OG0A 1A5AA 4O16A 3MHGA 2H6RA 3N2MA 3PUOA 4IJBA 5F2IA 3CC1A 4R33A 1ZFJA 1SSGA 3W7QA 4R7JA 5FEPA 3NQAA 4XQ6A 2Y89A 3OG3A 5EA9A 3G24A 4MLRA 1TV5A 3WJWA 1LLWA 2H3BA 1LM1A 4MY1A 1M5WA 5T26A 4GWEA 3LCFA 4DQWA 4CCEA 5F4SA 1S5TA 4UUIA 1FCVA 1SZFA 3QW3A 4AAJA 3F4WA 3OHIA 4PH6A 4Z1BA 3TROA 1VGAA 3C8FA 1XKYA 2Y6ZA 1IXPA 4S2CA 2ZRVA 4JX4A 5HINA 1ICPA 1BWKA 2BLEA 3PM6A 1OX6A 3W1PA 3W70A 3M43A 4LOCA 3W7EA 2DJXA 1TCDA 3PBYA 4MIMA 1SZGA 1YXDA 1VCGA 4JIQA 4O52A 3MBFA 4RZ4A 4WY0A 1A53A 4UTUA 2QCGA 3B03A 4O14A 2DZUA 1G4SA 4NNAA 3LRMA 4NXSA 4Y8FA 3PC0A 1QFEA 7TIMA 5E0KA 3M1ZA 2VEPA 3TV8A 1HTIA 1RV8A 4BWLC 4NJGA 2NXIA 4WXYA 3IIZA 3OVPA 4K6AA 4FIRA 5CSRA 3LHYA 1OYBA 4HNTA 3CTLA 3SIZA 2NXHA 1W31A 5KITA 1O4UA 3R12A 1TREA 3HPSA 4QSHA 2WPBA 1H50A 3LXBA 3NQEA 2DORA 2WQPA 4OU1A 3WK0A 4AF0B 1EP1A 3UPWA 2QUVA 2VELA 4IMGA 4AB4A 3NPVA 4ADTA 3HMJG 1B57A 4E38A 2VEIA 1AW1A 5GVJA 1OX4B 1I4NA 2DZTA 2A21A 1N8FA 1SQ7A 1HL2A 2OT1A 3W84A 5HUPA 5D04C 3NQMA 2RFGA 4YMZA 1FCUA 4P2VA 3LBMA 2BX7A 4UTJA 3T4CA 1DQWA 2J27A 3DH7A 4ZQPA 3DXIA 1H7OA 3LHZA 1EX5A 3G0SA 1P1XA 1TPB1 3A9IA 5EY5A 3S1VA 1IXQA 3NZ1A 1I2RA 3O06A 3LI0A 3NQ2A 5AFDA 3EKZA 3MWAA 4DBDA 3I7RA 2YYUA 4XKYB 3CQ0A 1ICQA 3LHVA 5E93A 4A2SA 3LRLA 1OJXA 2ZA1A 3ABQA 4MYXA 3PBWA 3W73A 3EXTA 1SO3A 1WAUA 1SZNA 4DF0A 3CEUA 1P0KA 1QNVA 3O6DA 5K4XA 1K02A 3O07A 2QCCA 5I3HA 4E0CA 5CZTA 3BG3A 2VFFA 2R8WA 1VHNA 3W86A 5LHFA 1XDMA 3UD6A 3T78A 4LVBA 2GOUA 3DFSA 4YCPA 4LRTA 2WOQA 1W5QA 1O60A 2B7OA 4HNNA 1KTCA 1RQEA 2ISSA 3I65A 3PG8A 3GB6A 4IGHA 3NG3A 3FEMA 4FNSA 4DPQA 2GVJA 4GRSA 2ZFAA 3P82A 3F03K 4N6EA 5AHIA 5F2MA 2ZZ2A 1W3TA 4TIMA 1I2NA 5FF4A 2DZWA 4IX2A 1B3OA 1VLWA 2W6RA 2A1YA 4NVTA 1KLYA 3QM3A 4U4MA 3MI3A 1KFCA 3TQKA 5IBXA 4UTWA 5F4WA 1F7BA 2QUUA 2X1SA 2DP3A 1JCXA 1L2UA 3IVTA 3TK7A 1T99A 3TW7A 1DL3A 3LB0A 1VH7A 3QQ0A 2QCDB 4JGDA 1X6UA 1G7UA 3QQ1A 4HN4A 4TO8A 5CZSA 1VYPX 1IIHA 3C61A 3W07A 2B7NA 1KV8A 1W37A 4IWWA 4CQAA 3H55A 1SR9A 1GTHA 4K37A 2QR6A 5IM51 1I2OA 1RPXA 5AYZA 3T7VA 4CLMA 3C6CA 3L0GA 3STFA 3PULA 5FF3A 3RK8A 4FXRA 4GXMA 3W2UA 4ZVJA 2ISVA 3NQGA 4GNJA 5KMYA 3M5YA 1FWNA 2HTMA 3PUDA 4DF1A 3OEXA 4O15A 5AYYA 2ZTJA 4NJHA 3ELFA 5I3KA 3L21A 3KFTA 3ZS4A 1W5NA 3QMTA 4JNMA 4UNKA 2VFHA 3WJZA 1V5XA 1PCWA 3W88A 1W5PA 3B4UA 4IXHA 3G0UA 1LYXA 2ZZ7A 4RK8A 1E51A 5D32A 3M7WA 2WNQA 4GUIA 1RQBA 1OFPA 2NUXA 3AJXA 2QCMA 4KFOA 3LXAA 2GVGA 2V2DA 4FHAA 1H7NA 4FXSA 3P74A 3IV3A 1XUUA 4S1FA 4UIOA 4K36A 1IIGA 3E96A 2ZTKA 2YW3A 4LT9A 5K9XA 4WOQA 3TUUA 3G8EA 5D37A 4O12A 3TQVA 2FDSA 3QSRA 5AN7A 1JR1A 2EGZA 3M5ZA 3M6YA 2FB3A 5EYWA 3TU9A 4OQVA 1Y0EA 4DF2A 3HG2A 2B0MA 2E68A 1M7PA 4JTSA 3G1SA 4N6FA 2QCEA 1MEIA 1JUBA 1WDWA 2WSQA 1UBSA 1S3HA 1EP2A 3W7GA 4KWWA 4U28A 1VC4A 3I6RA 1H63A 2QCHA 4UTLA 1TPEA 2PRMA 2ZBTA 1VHCA 5D2VA 3ABRA 1KM3A 4NX5A 3EX1A 1LOSA 3KVJA 2EAWA 4I7VA 5KINA 3ABOA 1QPOA 3N19B 2CW6A 3UQNA 3L5MA 4R34A 3GXNA 3W7CA 5EBUA 1GVQA 2QJHA 3QF0A 4M7TA 4LC8A 2YFNA 3PS7A 5TQLA 5D09A 5FESA 4R53A 1OABA 4NNBA 3QPZA 3VKJA 1PL9A 1FDZA 2NWRA 4Q4KA 4O57A 3LXCA 3HIJA 2V9DA 2Z2UA 2Z6IA 3NQDA 5I3JA 2GJNA 1B4KA 3RMJA 1S5WA 1T8XA 5LNWA 3BK0A 1ZAJA 8TIMA 1GVSA 2NV1A 2J9XA 1QO5A 2VOMA 3MHFA 3PSVA 4ZMGA 4M7SA 3W7IA 1QOQA 2WO5A 1O5XA 3V75A 4RCXA 3C52A 4UMBA 1WOBA 5AHNA 3MP4A 4AHPA 4WZHA 4UTKA 4QQ3A 1TPUA 2V5LA 3HF3A 4K8EA 4LVDA 5H2ZA 5BRBA 2X1UA 1O94A 1Q3NA 4D2JA 4UTMA 2VEKA 5I3FA 5L6UA 5G2HA 3DFPA 5DCEA 3TC7A 1GOXA 1EUAA 5DN1A 3GVGA 4HPJA 1AMKA 2A85A 3USBA 2E6FA 3LDVA 2JKAA 3N73A 2WSRA 1N55A 4AF0A 3TMLA 1I2QA 1Q45A 3SZ8A 3HGSA 5K4ZA 3CIWA 4LRSA 3W1RA 5F2LA 5L9FA 3SSJA 2C14A 4LVGA 2ZA3A 1OX4A 1XI3A 3QMSA 2NX1A 4QIUA 1J4EA 1KV5A 5J5RA 3A21A 1XBYA 3CU2A 2NX9A 3Q2DA 1A5SA 1UUMA 1ZJIA 1GZGA 5KSWA 2WJZA 1G69A 3L9CA 3QRHA 4QITA 1KBJA 3BLEA 1SW0A 1OFEA 2EKCA 3PWAA 3STGA 3S5NA 3C2VA 4Z1CA 1U5JA 2QF7A 2XN1A 5LSMA 1TV7A 4MKNA 4QNEA 4AHQA 4QNWA 3LM7A 2TYSA 3Q58A 4XKYA 4MZ1A 4PL1A 1LBMA 1JQVA 3PVFA 2GQ8A 3GXTA 3F4NA 3O63A 1TRDA 2ZQ0A 4Z08A 2J9ZA 2FPTA 4IPJA 2QCLA 1LCOA 3NYZA 2DZSA 3S5YA 5U7SA 4JTHA 3G0XA 1H7WA 2VFIA 3MYPA 4JYEA 4NZFA 1UCWA 1QPRA 3FS2A 5HR7A 4Y96A 3EWUA 2Y85A 4TU1A 2QAPA 3W7MA 4ZL1A 4XWUA 3RF9A 5BMXA 4FO4A 4IMFA 5G1YA 1WOAA 4QM1A 4LVFA 2ZRXA 3Q94A 3SFKA 3P84A 1TJRA 2W79A 2WNNA 1KLZA 4JD4A 4MZYA 1W0MA 2ABAA 4XBKA 5CZ0A 4HKPA 4HSOA 1OFOA 4GE8A 1UJPA 3W6YA 3A22A 2Z1BA 3C2FA 3W7OA 2FFCA 4DO5A 3NDOA 1OHLA 2AAMA 3PY2A 1JCMP 3SECA 3FLUA 1H7PA 4NU7A 3BW4A 3HG3A 4BI5A 3G18A 4MZ8A 3M44A 4UTIA 4UC5A 3O16A 3W1MA 1LLZA 4OT7A 5CGQA 2X1RA 4AWTA 3GIYA 2YSWA 5HWMA 5HQEA 4DBEA 1O95A 3TSDA 2BTMA 1KFBA 3R8RA 3TFCA 3W7PA 1BEUA 1EPXA 3FKRA 3O1NA 1VCFA 1EWEA 1FWWA 1F73A 2Q3RA 3PG9A 3UWQA 2QCDA 3QFEA 4OE7A 3S5ZA 2C3ZA 1R2RA 3EXRA 2A7NA 3LI1A 1PCKA 3EEGA 3SI9A 5C54A 1F6KA 3ANYA 3R2GA 5D2TA 4JR5A 2AQWA 2V5BA 2XFWA 5K9DA 5G2IA 1XDLA 2E77A 3BGGA 1OYAA 1HFBA 2BXVA 1TRIA 2OJPA 3MW7A 2DZXA 5D05A 3C2EA 4MPQA 1DHPA 1IGSA 1PVNA 2C16A 1AL8A 3W3OA 1GVFA 4LS0A 3STCA 2GJLA 3DKLA 1GVRA 1H1YA 1OFQA 4O18A 2OMAA 4AWUA 4H3DA 1G7VA 1K8YA 5AHLA 1GYLA 1NEYA 3L0NA 1KM4A 3NNTA 4BF9A 3OA3A 4IMEA 3GR7A 4LV9A 3TDFA 4FNUA 4Y90A 3TW6A 2R91A 2Q8ZA 1P0NA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5AHNA

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