5ANIA

Crystal structure of cdk2 in complex with 6-chloro-7h-purine processed with the crystaldirect automated mounting and cryo-cooling technology
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
297
structure length
280
Chain Sequence
ENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE 2
publication title Automated Harvesting and Processing of Protein Crystals Through Laser Photoablation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 280
sequence length 297
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2015-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5aniA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5aniA01
3O2MA 2B52A 1ZWSA 4DT8A 3CPCA 4W8EA 5AUZA 4U81A 3PIYA 5AP1A 5ETIA 5GZ8A 3EKNA 4IZ5A 5D41A 4O7SA 2O64A 4BDHA 3HMNA 3CY2A 4QMYA 4AW5A 1J7LA 4NZWB 1ZMWA 3ZO4A 2CCHA 4C34A 4XP3A 5AV1A 4EOOA 3LXLA 2W1DA 4PMSA 3ACKA 2C30A 3DKGA 2GCDA 4FSQA 4WRSA 4X3FA 5GHVA 3WI6A 4CQEA 2PMOX 4GK3A 3IK3A 4RG0A 3AT4A 3BU5A 1LEWA 2IVTA 4XUFA 3ULZA 4I5HA 4JBQA 3DFAA 4NTTA 1XHAA 1Y8YA 2ESMA 3R1SA 3A7JA 1OL7A 3L9MA 4IFGA 4ID7A 4R3RA 5CU4A 3GU4A 5LARA 3H10A 3EFJA 4QMVA 4O0VA 4RIWB 5J7HA 3ZM9A 2ITWA 4FODA 4DGLC 1VYWA 3ZLXA 3FPMA 3JVRA 2V7AA 3GCSA 3UOLA 3W2QA 4GEOA 4ZJVA 3W2PA 2QD9A 3UIUA 3GI3A 4JDHA 2UV2A 4YTHA 3F5UA 4AA4A 4CMUA 4J98A 4NH1A 4K18A 4EQMA 4JIAA 3TTIA 4YZ9A 2XEYA 4AUAA 2ZYBA 4JDJA 4OBPA 4R1VA 3U87A 4F7SA 3DDQA 3O8PA 4BFMA 1MRYA 3OWKA 3OW3A 2VWWA 4QP1A 2GSFA 3OT8A 4NYEA 4KIQA 3C5IA 2Y8OA 4XV2A 4J8NA 5GZAA 4EH7A 4FNYA 3R00A 1RDQE 4FSRA 3MESA 3D7TB 2W1CA 2GS6A 5M07A 4PDOA 1BKXA 1T46A 3UZRA 4NW6A 3MY1A 3HA8A 2GNGA 5ICPA 2VD5A 5M4CA 3TJCA 3TEIA 5AUWA 4AS0A 3O8UA 2HY81 4EORA 2I1MA 2J90A 3AOXA 3PXRA 3TZMA 2WQOA 4IB1A 2YM3A 2OXXA 3WARA 4FV4A 4KRDA 4FV9A 4A4OA 2WQBA 4NCTC 2VTNA 5ETCA 4YBKA 2AC3A 4ANSA 3RWPA 3AMAA 3R21A 4ZAUA 1HCKA 4O6LA 2WMAA 1BL6A 2QHMA 2UZLA 5CF4A 4DE4A 2EB3A 1F3MC 3EN6A 2R3KA 3H9RA 4FKGA 4U97A 5EHYA 4OTDA 2C6LA 3QXOA 3FEGA 4IZAA 4JI9A 5BQ0A 4JNWA 3VS7A 2OXDA 3QTWA 3FZOA 3UDBA 4BDCA 2OU7A 4F09A 3BX5A 3FL4A 4I0TA 2F49A 4AZEA 3GENA 2B9IA 4G3FA 3BEAA 2E9PA 3CQUA 5ANIA 2ITPA 4IX6A 5GJFA 2XM8A 5HE1A 3QZGA 4KAOA 3QA8A 2B9JA 3PZEA 5AM6A 4EKKA 3UIBA 2G2HA 2X7OA 3BU6A 3I4BA 1VEBA 5BMMA 4M0ZA 4EH2A 3TNQB 3DV3A 3BIZA 4CRLA 4F64A 2VWXA 3ENHA 4H3PA 5AWMA 4CFXA 1UKHA 2XNBA 3O51A 2UW9A 3AXWA 1OL2A 5JZNA 3O17A 3QCQA 4I1ZA 4EH4A 2C6EA 3BEGA 4EOLA 3OUKA 1UKIA 3O50A 1OUKA 3TXOA 2PE0A 5CENA 4YO4A 4CTBA 2VV9A 2Y0AA 3E7OA 2BFYA 3FXXA 3P08A 2WQEA 2ITYA 3WF7A 4EBWA 3LMHA 3BQCA 3MBLA 4AFEA 3QHWA 4DTKA 4O6EA 2C69A 5I9VA 4ACHA 3MFTA 4FKSA 3W2RA 4RX8A 3ORPA 2XYNA 4FEVA 2LGCA 3BRBA 3EFLA 1P14A 4O91A 4GFOA 3SRVA 5EW3A 3LXKA 3KQ7A 3ZRLA 3OCTA 2OJFE 1GJOA 4PPCA 1UVRA 1NXKA 3GB2A 2RFEA 4O7YA 2ZM4A 5IU2A 1GNGA 4M97A 2QKRA 2W5AA 3E88A 3HKOA 3TWJA 2YERA 1YXVA 1PXPA 1WBSA 4M14A 3EL7A 3AD4A 3UMWA 4BI0A 4DC2A 4BGQA 4QPAA 2R3GA 4RBLA 2UZDA 2O5KA 4KBKA 3JYAA 1MUOA 3UG1A 4KKEA 4RWJA 2ZOQA 4OTRA 4CFUA 3HZTA 4ALWA 4F99A 4MNFA 3SKCA 3KFAA 1GZOA 3CKWA 1BUHA 2PSQA 3AGLA 3NYOA 3QCXA 4FEWA 4DTAA 3CJFA 3DB8A 2XKEA 3QD2B 1KWPA 3NAYA 3HEGA 2UZEA 3OOGA 5HNIX 2RG5A 3DQXA 2NRUA 3DBFA 3A7GA 2F7XE 2WNTA 2R0UA 3DKCA 3E92A 3HAVA 2BDJA 4I92A 5D10A 4FKQA 3M42A 5ETFA 3ZLWA 3W8LA 4F6UA 3BYSA 4ZSGA 4DG3E 3QX2A 1R78A 1W82A 3ODYX 3V6SA 3EQRA 4ACMA 4IM2A 2JC6A 3LFAA 4ACGA 4YLKA 1OIUA 2I7QA 4G5PA 1YDRE 4ZK5A 3G33A 3QWKA 2CGUA 2UZUE 3OFMA 3TUDA 3IW4A 1Q24A 2BAQA 4IX3A 2WMXA 3KA0A 4ITHA 4KB8A 4RJ8A 4L45A 4MXYA 3K54A 2R3IA 3FHRA 4CFFA 1GIIA 3TZ7A 3NR9A 5C03A 3UC3A 4BIDA 3VULA 5IEVA 3LFQA 5DR9A 3O7LB 4O0WA 3QF9A 4CNHA 3PY3A 3QTUA 5E8VA 4KKHA 1Z57A 2A1AB 1ZXEA 4GSBA 4XMOA 5DEYA 3PG3A 3VIDA 3ANRA 3OEZA 4CKJA 2QODA 4PDSA 3CR0A 5TF9A 4BF2A 4ERWA 3F3VA 3Q4TA 3F7ZA 4LI5A 4QMNA 4FE2A 4O96A 4X7QA 2HW6A 2VTMA 2X9EA 5AP3A 2PUUA 4BDIA 4FR4A 1WMKA 4KBAA 1J91A 5JEBA 2HZ0A 1Q8UA 3QU0A 4GJ2A 5AIKA 2OJ9A 3O7LD 4MQ2A 2VTLA 3VJOA 5I9YA 3R1NA 2WELA 2C5XA 3F66A 1QPDA 1UU7A 2HK5A 3KRLA 4GIHA 4GFGA 3UOKA 4IAYA 4WSQA 3TKHA 4V04A 5GNKA 4F63A 4HVSA 3RK5A 2PUNA 2OFVA 2Z7SA 4AT4A 2FB8A 4YC6A 5EDPA 3IKAA 5HE3A 3R8UA 2R3QA 4F6WA 3RINA 3FI2A 4EH5A 5HQ0A 4BVUA 1J3HA 2YM5A 4ACDA 3JVSA 4GYIA 3BGQA 1YXTA 4PNKA 2PULA 3MA6A 4MXXA 4X6QC 5FTOA 4EH3A 5CEOA 4PX6A 5IQBA 2W4KA 4FL1A 1O6KA 4RT7A 1JLUE 1P2AA 3NUNA 4GVAA 3MTLA 3QQJA 4HYSA 3IOPA 4LL0A 4O27B 3FKNA 2BTRA 4U6RA 1MQ4A 3RNIA 3CY3A 3VNTA 5FTGA 4FZFB 4BR3A 1STCE 2LAVA 2QOQA 3UVQA 4XG9A 4CEGA 5IA3A 1KE5A 4LL5A 4RMZA 4USDA 5FRIA 1WAKA 3EZRA 2FSMX 2OICA 1JSVA 4BZNA 4YZBA 3VS4A 4X3JA 3ZHPC 4ZLYA 1IRKA 3FZSA 3I0QA 1PKGA 4PL4A 4X2GA 2B55A 5AUVA 3PJ1A 4LMUA 4DCEA 4DLJA 3MV5A 3SDJA 3HDMA 1FVTA 3TN8A 4CRSA 1OBGA 1H1RA 2GNHA 1QPEA 1ZY5A 4IC7A 2JAMA 3NUUA 3P5KA 4FEQA 3JUHA 4EBVA 4H3BA 4IACA 3RTPA 2XH5A 4TYHB 4DFZE 2GQRA 4TY1A 2ZDTA 2O63A 4Y85A 3EQGA 5ANEA 1OIRA 4TN6A 3O8TA 4ZLZA 4S33A 4AW0A 2BRBA 4E1ZA 3R71A 4FV5A 4LUEA 4D9TA 5IH6A 2BRGA 3W10A 2GS7A 4WIHA 4U8ZA 1JBPE 5EYMA 3ZXTA 2WTCA 3LMIA 4TPTA 5JRSA 3P9JA 2ZMCA 5AFVA 2XEZA 2ZM3A 4NFNA 2XCHA 2FSTX 3RZFA 4BBEA 1H27A 3LIJA 1CM8A 4GT5A 4KRCA 1YI4A 2PK9A 4HCTA 4YHFA 5KBQA 5M57A 3SD0A 2GHMA 3OHTA 5FG8A 3LJ0A 3IW8A 2C47A 4BHNA 3UNZA 5AAGA 2BDFA 4DAWA 4CVAA 4ALVA 1VR2A 3VRZA 1P5EA 2Y6MA 3D5WA 4FZ6A 4HOKA 5ANJA 2HWPA 3Q60A 2CMWA 3DPKA 3PIZA 4NWMA 2XK7A 2I0VA 3FY0A 3KC3A 4U0IA 4CSVA 3DTCA 3LFCA 1PW2A 3EQCA 3VS2A 3A99A 3DT1A 4YJSA 1TQPA 3VUMA 4NTSA 2I0YA 3ENMA 3RCJA 3CD3A 3LVPA 2EU9A 4JQ8A 4R7HA 4EOQA 1XO2B 3S4QA 4KABA 1H28A 3H4JA 4LQMA 4I5CA 4XX9A 2GTMA 4FUYA 3D15A 4LOQA 3E8EA 4RA4A 4NKAA 4WD5A 4ZSLA 5HD7A 3GFWA 2ZMDA 1XR1A 5CU6A 2WTJA 3TZ8A 3NSZA 2CGWA 1MRVA 3E3BX 4QPMA 1YOMA 2XRWA 4FSNA 4D1XA 4DG0E 5CASA 3NNWA 3HL7A 1OPLA 4DBXA 2BDWA 3UO4A 4X3FC 2EXCX 3O0GA 2C6DA 1ZY4A 4GU6A 2YM6A 4D55A 2HELA 4A06A 1WBVA 4ZTLA 3B8QA 5TR6A 4AN3A 1H1WA 3R8ZA 2W5HA 2RIOA 2ZV2A 4QMOA 5ANGA 3QUEA 4Q9ZA 4F65A 4RRVA 4AZWA 4RIXA 5CS6A 5LMAA 3SAYA 2XNMA 4FV6A 4QYEA 3SGCA 2W1ZA 2W05A 2XBJA 4GCJA 4I21A 2V0DA 3OWPA 4FYNA 5HHWA 3QKMA 3UOJA 4ZY6A 4FG8A 5HIDA 5DRBA 5IA5A 3BWJA 3W2SA 5A54A 4BKYA 1K3AA 2QOCA 3KK8A 4QMLA 4BGGA 3V5QA 4CG9A 1PXLA 4XOZA 1URCA 4GS6A 3CGOA 5ANKA 3VQUA 5KMIA 4AE9A 3DBEA 4FKWA 2JFMA 3WBLA 4ZJJA 1H1SA 3CGFA 2UUEA 3F6XA 2WXVA 4LMNA 4F9BA 2Z02A 4FTMA 2XIRA 1X8BA 2HZ4A 2REIA 2XB7A 5AUXA 4RIOA 4D0WA 2R3RA 3HVCA 1PXMA 4RVLA 3NMUF 4D4SA 1L3RE 4TTHB 4O22A 4M69A 2W5BA 4H39A 1M2RA 4AG8A 2ZV9A 5IUIA 3SW7A 2ITNA 3RVGA 4ZTRA 4XLIA 2B9FA 4BWXA 3ZDIA 1XBBA 3QRIA 4LRJA 4A7CA 5HTIA 1H00A 3R6XA 4BDGA 3JR1A 2VN9A 3QX4A 3AD5A 2R3HA 3KRXA 4B7TA 5FUTA 3S00A 2CKEA 3RI1A 1UU8A 2JIUA 5IQCA 1H0VA 3HDNA 2B4SB 2OJJA 3DDPA 2RFNA 3I79A 3R7GA 4M7IA 3NUAA 5HICA 4Y95A 2HAKA 2WPAA 1YHSA 2VX0A 5K0XA 4MX9A 3R28A 4U44A 4IH8A 5K3YA 3UODA 2ITTA 2W4OA 5C8NA 1JPAA 5JN2A 5CZHA 2CKOA 5DT3A 4BKJA 4C59A 3Q9YA 4EOMA 3LLAA 1B6CB 4BI1A 4C2VA 2QOBA 3LMGA 3ALNA 3P7CA 5LQFA 4YGAA 3TG1A 3QAME 4FV7A 4FOCA 4L3LA 4UMQA 4YP8A 3RJCA 4NEUA 3U54A 2F7ZE 4TZRA 4MKCA 4YR8A 1OGUA 2PVLA 4DGNA 4GIIA 3BI6A 3H9OA 3MWUA 2J6MA 2YCRA 3G6HA 4FICA 3MIAA 3ZSHA 1PKDA 4N57A 2VRXA 3GNIB 3ODZX 4IVBA 3BHHA 1Q99A 5TE0A 3Q04A 5AR4A 5FEDA 2CNVA 3FXWA 4FT9A 4FTTA 3LFNA 1O6LA 4X2JA 4EH9A 5IG1A 4CKRA 3DXPA 4C35A 4I93A 5E1SA 5DRDA 2X6DA 4PDYA 1SMHA 4MYGA 5CU0A 2QURA 3MVJA 5M4IA 3EJ1A 4QTDA 5CTPA 2R7BA 2QVSE 4W4VA 4WG3A 3QFVA 4Z9LA 2Z7QA 4MD8E 3MI9A 2UZVA 1YVJA 2W1FA 1JKTA 4YU2A 1PYEA 3DS6A 3EQHA 3I1AA 2NP8A 4N4SA 3DJ6A 1U46A 1A06A 2P2IA 5HG5A 3T3VA 3TNHA 4EUTA 4AZTA 3A4PA 3MH0A 2WIHA 5IQDA 4EJNA 5LVOA 3MFRA 3P1AA 2PVNA 4IC8A 3UE4A 4FT0A 1UNGA 4OT6A 4H1JA 3HV6A 3R1QA 4C33A 5EI2A 4NL0A 3OXIA 5BX0A 4RIYB 1Y6BA 2PVFA 2R9SA 3KCKA 3R7VA 1WZYA 2VO7A 2VWYA 1YDTE 3MB6A 4TYJA 1W7HA 1Q8ZA 2WTKC 4AX8A 5EYDA 5CEQA 3EIDA 4MH7A 4JG8A 1SVHA 4UMUA 2KULA 2R3JA 1H24A 2H8HA 2YA9A 3CBLA 1YRPA 3JS2A 4IW0A 4LG4A 3ZFMA 4TXCA 5A6OA 2UW5A 1Q8TA 3FMJA 2WMTA 4HZSA 4QQ5A 5E8YA 5DR6A 1OI9A 2PY3A 2IG7A 1M2QA 2DYLA 3DXNA 4ZXTA 3TACA 4YJVA 1U54A 1DI9A 3DNDA 3LM5A 4LGHA 4EJ7A 2R2PA 4ZEGA 2OBJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3UYS A;  4MWI A;  4S32 A;  2VWZ A;  2BRM A;  5ACB C;  3TL8 A;  3HEC A;  3C0I A;  4TWN A;  3VBW A;  2IN6 A;  3VUK A;  2PML X;  4QP3 A;  4BCM A;  5F20 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O2M A;  2B52 A;  1ZWS A;  4DT8 A;  3CPC A;  4W8E A;  5AUZ A;  4U81 A;  3PIY A;  5AP1 A;  5ETI A;  5GZ8 A;  3EKN A;  4IZ5 A;  5D41 A;  4O7S A;  2O64 A;  4BDH A;  3HMN A;  3CY2 A;  4QMY A;  4AW5 A;  1J7L A;  4NZW B;  1ZMW A;  3ZO4 A;  2CCH A;  4C34 A;  4XP3 A;  5AV1 A;  4EOO A;  3LXL A;  2W1D A;  4PMS A;  3ACK A;  2C30 A;  3DKG A;  2GCD A;  4FSQ A;  4WRS A;  4X3F A;  5GHV A;  3WI6 A;  1XML A;  4CQE A;  2PMO X;  4GK3 A;  3IK3 A;  4RG0 A;  3AT4 A;  3BU5 A;  1LEW A;  2IVT A;  4XUF A;  3ULZ A;  4I5H A;  4JBQ A;  3DFA A;  4NTT A;  1XHA A;  1Y8Y A;  2ESM A;  3R1S A;  3A7J A;  1OL7 A;  3L9M A;  4IFG A;  4ID7 A;  4R3R A;  5CU4 A;  3GU4 A;  5LAR A;  3H10 A;  3EFJ A;  4QMV A;  4O0V A;  4RIW B;  5J7H A;  3ZM9 A;  2ITW A;  4FOD A;  4DGL C;  1VYW A;  3ZLX A;  3FPM A;  3JVR A;  2V7A A;  3GCS A;  3UOL A;  3W2Q A;  4GEO A;  4ZJV A;  4I6L A;  3W2P A;  2QD9 A;  3UIU A;  3GI3 A;  2AQX A;  4JDH A;  2UV2 A;  4YTH A;  3F5U A;  4AA4 A;  4CMU A;  4J98 A;  4NH1 A;  4K18 A;  4EQM A;  1TZD A;  4JIA A;  3TTI A;  4YZ9 A; 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