5ANOA

Crystal structure of cdk2 processed with the crystaldirect automated mounting and cryo-cooling technology
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
298
structure length
277
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKISTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE 2
publication title Automated Harvesting and Processing of Protein Crystals Through Laser Photoablation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 277
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2015-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5anoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5anoA01
2C6EA 4C33A 5F1ZA 5C9CA 4EONA 3D5UA 3QHWA 4AGUA 4PTEA 5CYIA 3GFWA 3LE6A 4HVSA 3HMMA 3DKGA 4NW6A 3R7YA 3VHKA 4D2RA 5AR4A 1KE9A 3RM7A 4HZRA 2XJ0A 5TF9A 3WIGA 4ACCA 5HX6A 3RMFA 1PMUA 3OBJA 5CTPA 1O6KA 4S34A 1S9JA 2YWVA 2XBAA 4G3DA 3E8DA 4QYHA 3NR9A 5HG5A 5IQEA 4F0IA 5I9VA 2ITNA 4G1WA 4R7HA 5D10A 5L2QA 4KWPA 3FWQA 3NUXA 3ZYAA 2PVYA 2WU6A 3P79A 5C26A 1VR2A 2FH9A 1LR4A 4MD8E 4OLIA 4J95A 3HVCA 5CVFA 4I20A 4F65A 5JK3A 3ODYX 4XV9A 3PUPA 4M8TA 2PVHA 2PK9A 2W96B 2JFLA 3TZMA 4F7LA 4YLKA 4CFXA 3HMIA 5BVDA 3PXYA 5K9IA 4MH7A 5LJJA 5IMXA 3PDTA 2CCIA 1V0BA 2VN9A 3G33A 4KIKB 4LYNA 3MY0A 1OPKA 4RQKA 3PE1A 3MJ1A 4TYJA 2IW9A 4DG3E 4HGSA 1TQIA 4WNOA 4GYIA 3QFVA 3QRJA 4D4VA 1UV5A 4RT7A 4EZ3A 1G8AA 2XIXA 3DJ5A 3TJDA 5FBNC 4YHJA 2IG7A 4L3JA 4TXCA 4L01A 4BCGA 1L8TA 4M12A 3QL8A 4A9YA 4L42A 3DAKA 4WNPA 3BPRA 2YWPA 3JY0A 3OF0A 3Q96A 4O6LA 2XZSA 3D7TA 3KEXA 4QO9A 2Z02A 3A60A 3ZFYA 3DLZA 4MYGA 2X4ZA 3UQFA 4GT3A 4D4RA 4I4FA 1FBNA 4R7IA 5IH4A 3AG9A 4I4EA 5ACBC 4APPA 3KL8A 3FEGA 1JSTA 3BYSA 4IAYA 2BPMA 2WQMA 4CKRA 4BI1A 1P5EA 4S33A 4H3BA 5LMAA 3R7VA 3ZFXA 2WMTA 2JDSA 1OVEA 4GV1A 4IADA 2BZJA 3R8VA 4DGMA 2EVAA 5DA3A 4E8AA 3FPQA 5HCYA 4LL0A 4WBBB 3NNVA 4FKSA 2B9HA 4M84A 1GZOA 2JKMA 2X0GA 2XK8A 3QLGA 3QZIA 4L52A 3DK6A 1Y6BA 3KK9A 3QYWA 4AOIA 4BHNA 4FKLA 3MVJA 4PPBA 4BCHA 3DPKA 2XKEA 3ORKA 5AUWA 4NCTC 3EQBA 1ZMWA 4O86A 3TDVA 2C6LA 2Y7JA 3KRRA 2VTRA 3FQEA 2BHHA 4JG6A 1UU7A 3GEQA 2C6KA 2O5KA 4RIWA 4UMQA 2E9VA 3O0GA 3DNEA 2V55A 5ACKA 1JLUE 5EW9A 4IM0A 5KBQA 5L6OA 2C4GA 2C5NA 3DB8A 4QPMA 2OIQA 5DI1A 5E90A 5E7RA 1EH4A 2PZ5A 3JXWA 4I94A 5E8WA 5JH6A 4N70A 3KB7A 4FVRA 4H36A 4EH7A 4O7TA 4P7EA 4AT3A 3RBWA 5ICPA 1Q62A 1WBPA 2WMBA 4BCIA 3DBQA 5FTOA 4ZLZA 2VX3A 3EN9A 3OEFX 3D7ZA 5I3RA 4A06A 2Z8CA 4ZXTA 3TZ8A 2WIHA 4IQ6A 4QP1A 4AU8A 5E8XA 2W9FB 4Z7HA 4LMUA 4X7QA 1ZZ2A 4BIBA 4PX6A 2BILB 3LKMA 4YC8A 1WBWA 3MIAA 4EOQA 3F82A 4QMPA 4RVKA 5HD4A 4R5YA 4BB4A 4NCTA 4OTRA 4YJNA 3PJ8A 2FSLX 4EUTA 1H24A 5CZIA 3AC3A 3CD3A 4P4CA 4OTFA 5L4QA 4BCJA 4YHTA 2WGJA 3BYUA 4DEHA 5AM6A 2VWIA 4TYIA 3LW0A 3IPHA 4OTHA 4ORKA 2YDJA 3D5XA 2ZVAA 4I22A 4LI5A 4BWXA 3QC4A 3V8TA 2W1EA 4B8LA 3LZBA 2KTYA 5HO8A 1JKLA 2B9JA 3GFEA 4USEA 4NFNA 2GHGA 2H6DA 2BAKA 2Y9QA 3VVHA 4CD0A 1IASA 5LVNA 5C8MA 5HTCA 4FTTA 5M4CA 1JAMA 1H25A 4HZSA 4DH3A 1M2RA 4L6QA 4TWNA 4FSTA 1A9UA 3ZONA 5L2SA 3IDCA 5J9LA 2WPAA 4EJNA 1NY3A 3JUHA 4CLJA 3A7HA 2AYPA 2BUJA 2PVRA 2ZMCA 5EK7A 5TE0A 3P4KA 2ITZA 1JNKA 3DS6A 1FVVA 5JGBA 4NWMA 4I93A 3P86A 3DFCB 4FKTA 3M42A 3AQVA 3E93A 4E93A 2BRGA 3LMHA 4IM3A 3ZZEA 4FT0A 2XMYA 3COMA 3LXKA 3OY3A 5CVGA 3HL7A 4WOVA 3E8NA 5CQUA 1UKHA 1Q3WA 4LV5A 3V5LA 3WYXA 3RZFA 3PVWA 4CYJA 4F08A 2EWAA 5E4HA 3VS0A 4E6QA 3RTPA 2WTKB 2YM6A 2OXXA 3WF8A 4BR3A 1KV1A 1TVOA 3QTZA 2AUHA 3W2QA 1GZKA 1ERKA 4OTIA 4GMYA 5K5NA 4DGLC 3KULA 3K5UA 3ETAA 5HOAA 2Z2WA 3FLWA 4E4XA 4ZMEA 5BVFA 4ASXA 3QZFA 3BV3A 4BGQA 1STCE 5ANGA 4BC6A 5KMLA 3Q6WA 4UALA 2O0UA 3VWAA 2XYNA 3BHUA 5BX0A 1ZYDA 4C2VA 5CF5A 4YGAA 4ZOGA 3POZA 3BBTB 2QOLA 4M67A 5B2MA 4CKJA 5AUZA 2ACXA 3DCVA 3A7GA 2F7EE 1U54A 2UVZA 4GIHA 3WF7A 3FI8A 5JSMA 1XHAA 5IQAA 4J53A 4NM0A 3CJGA 2VTPA 4CQEA 2PUPA 3PZHA 3F3VA 2WU7A 4YSMA 3AT4A 2I6LA 2YCRA 4CFMA 1H08A 2HWOA 3E8EA 4G6NA 5C01A 3U87A 4PNKA 3CQWA 4ZSGA 5G1XA 4DEBA 4X3FC 3PG3A 3C0IA 4QQJA 2B54A 1PKDA 1T45A 2BFXA 2HXQA 4FV3A 4IX5A 4QP8A 5FQDC 4AF3A 3D5VA 2UZOA 3R2YA 2CKPA 4QMOA 4UB7A 5FP6A 2CN5A 4MWHA 3VF8A 4BYIA 3EN6A 4EOIA 2BAQA 3KFAA 4QMZA 4QMQA 5JKGA 2HXLA 3M1SA 3W8LA 4F64A 5BYZA 4PPCA 5A4CA 3SVVA 4IB0A 2Y4IC 4FKPA 5CI7A 3TT0A 4H3PA 4V05A 4DT9A 4HOKA 4USFA 4QQCA 4FV6A 4ZZOA 5KKRC 3U54A 1R39A 2X9EA 5CZHA 5CEIA 1ZOHA 3QD3A 4FE2A 4I92A 4UYAA 4BDFA 3SOAA 4D2WA 5HVJA 4EH2A 2YM7A 4V01A 2ZV9A 3F5XA 3CY3A 3HRCA 4IIRA 2ZM4A 4F99A 3SW7A 2P55A 2WO6A 5HBEA 2C6TA 3ZXTA 3HZTA 4EH4A 3ZM9A 2GS2A 1ZYCA 2PMNX 2YLFA 4G5PA 5G6VA 4BCQA 1JOWB 4BWPA 4W4WA 5M4IA 4X3FA 4O27B 4JLCA 4RC2A 2UZDA 2A4LA 2HZIA 5HEZA 3TKUA 3ULZA 3R00A 4AG8A 5DOSA 4AS0A 4DHFA 2PE1A 4JI9A 5L6PA 5J7BA 2H96A 4CTBA 3U4WA 5JN2A 3KN5A 4J52A 3DNDA 4R1YA 1M14A 2JKOA 2YDIA 3CKXA 3EN5A 5FBOA 4EZ5A 4F0GA 1W82A 1W0XC 4QP2A 1TQPA 4R7BA 2CLXA 4L7SA 2UW3A 3FQSA 3NLBA 4BI2A 5CVHA 1OL5A 3CR0A 5H8GA 3WILA 3BELA 3CPCA 4ITIA 4NM7A 2HW7A 4QPSA 3LLAA 5DNRA 4C4FA 5KE0A 3R7IA 4DG0E 5E8YA 4GT4A 3SHEA 1XO2B 2XEZA 3Q6UA 3QD0A 2BRNA 4P5ZA 5FP5A 3R9HA 1OM1A 1RE8A 5JMSA 4NW5A 4YZMA 4AT4A 4TWOA 3ALNA 4RJ8A 4X0MA 5TR6A 4U3YA 3RAHA 4BZOA 1NXKA 2VAGA 3NX8A 3OWKA 4XUFA 4CTCA 1J91A 4FX3A 3EN4A 1Q61A 3A2CA 4FTCA 5EI8A 3CSVA 5IUGA 4MWIA 3OWPA 1QPEA 2WMXA 4QMWA 3PPJA 4BY9E 3MPTA 4LOOA 3F3UA 3NUPA 1XKKA 1R3CA 3TNWA 4EK6A 4KAOA 1PXOA 3VJNA 2OLCA 3C4FA 3S95A 2QOBA 2OH4A 1PXIA 1H00A 3MGYA 4DN5A 1PXMA 3CLYA 4ZTMA 5JGDA 1GNGA 2PE2A 3ZCLA 4CSVA 4EK4A 1JKSA 5IKWA 1ZWSA 4JVGA 3LM0A 4PP9A 4NKAA 4GG5A 1Q8TA 3QGYA 4FV7A 4Q2AA 4RZVA 4S31A 4YJTA 4K77A 3VUMA 2I7QA 4GL9A 3CIKA 4XLIA 3WF9A 2YFXA 3BLHA 2WMWA 3QHRA 2OF4A 3C4WA 3NUNA 3HLLA 2BZIB 3P23A 4F9YA 4RWKA 2PUNA 4MK0A 3A8XA 3EQIA 1UU3A 2XB7A 4UBAA 4GK3A 3SQQA 5LOHA 2JDVA 2CKQA 4EYMA 4ERKA 3TN8A 4DTKA 4CNHA 1YI4A 5HO6A 1MRYA 2FUMA 3TNHA 2XRUA 2OJGA 3ORPA 3ENMA 2G15A 4XJ0A 3VNTA 4HVHA 4GFMA 1MRUA 3QTIA 1SVEA 2WTWA 1Q5KA 5KMMA 3PA4A 4RX7A 3ZUUA 4BDHA 3HRFA 5AP5A 3RI1A 4U7ZA 2ITUA 2IJMA 2CHLA 5AX9A 5HNGA 4NM5A 4R3PA 3DFAA 3V6RA 5HIEA 3EYGA 4HGTA 4R3CA 4HVGA 5M4UA 3TM0A 4FV0A 3UP7A 2QO2A 4TNBA 4OW8A 3MH3A 3BI6A 5BMMA 3HV3A 4ENYA 2IZRA 5HKMA 2IW8A 3MSSA 4O21A 3SRVB 4FTMA 3HX4A 4WG3A 5FEQA 3WOWA 2BALA 4YZBA 3VS1A 4IACA 3COHA 4RIOA 2BTSA 3EB0A 5L2WA 4CG9A 4BDBA 2CN8A 2VTMA 4PP7A 1RQQA 2XBJA 3FL5A 1BL7A 4UXQA 5J5SA 5CU0A 3QQFA 4PDYA 4FEVA 3SG8A 1JKKA 4FICA 2WTCA 2QO9A 3NYVA 3F2NA 5E91A 4A4LA 5C03A 5CEPA 4FV8A 4TKSA 2CLQA 1J3HA 4WNKA 4TPTA 4FIFA 4I0TA 4ZY5A 2YAAA 4GS6A 5HZNA 4FL1A 3SXSA 2UZVA 1IA8A 4F7SA 5K4JA 2QQ7A 4YTCA 3T9TA 2FO0A 2OJFE 2W1HA 3GOKA 3LCTA 1KE5A 4AE6A 5HLWA 5CENA 3MFSA 3KK8A 1RJBA 1YXUA 5CSVA 5IQHA 2CMWA 1VZOA 4FF8A 4WHZA 4P2KA 4ACHA 4GJ3A 3D5WA 5FXRA 3R71A 4H39A 4RX8A 4KBAA 4BCFA 3PRIA 4GVAA 4AZTA 5L8JA 2XP2A 5F94A 5LMKC 5FG8A 3NSZA 3RP9A 4F4PA 3MI9A 4ITJA 3UVRA 4ALWA 3WIKA 1ZAOA 3P08A 2Y6OA 3EH9A 2E9PA 4MXAA 1GY3A 2IW6A 4DC2A 1PYXA 4UMUA 3VW8A 5AUUA 2WTJA 3R0TA 3CP9A 4NJ3A 4ZSLA 3UYSA 2PVMA 4F6UA 1OITA 2E9UA 4IVDA 5HD7A 2WMUA 4EZ7A 2FGIA 4XG9A 2B0QA 4MTAA 3QLFA 2BZHB 2F4JA 3KF4A 4M7IA 1WBTA 3ZZWA 4WRSA 3RINA 4A4XA 4QRCA 5CSPA 4DGNA 5GZ9A 4OAVB 5FRIA 3GU8A 3E88A 3G0FA 2JKKA 5I9WA 3NUAA 4G3FA 4YC3A 5E8TA 5I9ZA 4J8MA 5LMKA 3KN6A 2O64A 4DYMA 4FUYA 4NSTA 4YMJA 3R1YA 3CE3A 4ZJJA 5HIBA 1DS5A 3DTCA 2XK6A 3NW7A 5HVKA 3WZUA 5IQIA 1DAWA 3KRXA 4UEUA 2WD1A 2GPHA 4OTWA 3I6UA 3PY0A 2G2HA 4O7YA 4RIXA 4BDJA 5ETFA 3BQRA 4CRLA 2WEIA 3C1XA 2VWUA 5EI2A 3VULA 4RLKA 3UC3A 3EQDA 4ZEGA 3UNJA 3FY0A 3ZUVA 4HGEA 3ZDIA 3R1QA 2HK5A 3OFMA 4U40A 4D5HA 4GEOA 4RG0A 4IWOA 4NTSA 2GQRA 4O7SA 1JVPP 3OHTA 3F3TA 2LAVA 3QTSA 5IQBA 3ZEWA 3OT8A 4M15A 3TV4A 3U6IA 4FTJA 4KSQA 5FLFA 4J96A 4C37A 2W9ZB 2VTJA 3HMNA 3ZO4A 3O8UA 4JBQA 3O23A 4QTBA 5KX8A 2R3HA 2W1GA 5EDPA 4FIJA 3RK7A 4BTMA 3MW1A 5KBRA 1SMHA 4YBJA 3R9OA 5JRSA 4PDPA 3R22A 4BTJA 5AV4A 4LOQA 3AD5A 5HE0A 4EOJA 2BKKA 2UZEA 1CMKE 1PYEA 3TJCA 2QLUA 3QQLA 3T8OA 3FDNA 2HAKA 3LAUA 4L3PA 4J97A 4S32A 4E4MA 4EH9A 2YERA 3MVMA 2R3JA 4JQEA 4U3ZA 4PMSA 2WMAA 3F5UA 4X2GA 3RPOA 4EUUA 3S2PA 2YIYA 3Q9YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5HO7 A;  5IA3 A;  3G9N A;  2XUU A;  4QML A;  1K9A A;  2RG6 A;  3FKL A;  1CDK A;  3R1N A;  3BLQ A;  4BZD A;  3QQJ A;  3O7L B;  4D9U A;  3F2A A;  4IH8 A;  2H9V A;  5D1J A;  1XWS A;  2J0K A;  1ZYS A;  2BRH A;  2RSV A;  1FGK A;  4XP3 A;  3W2O A;  4BGH A;  4CYI A;  5AR5 A;  3ENH A;  4DFX E;  3R63 A;  3LXP A;  5L2I A;  1YXT A;  3GVU A;  1PHK A;  4B7T A;  1LEZ A;  2X1N A;  2E9N A;  4N6Z A;  4K11 A;  4UYN A;  5HQ0 A;  1FVT A;  3BGZ A;  2J0J A;  2RG5 A;  3BHH A;  3LFN A;  4GH2 A;  3BEG A;  1WVW A;  3DBC A;  2GMX A;  3TI1 A;  2YCQ A;  3VAP A;  5CAV A;  3LXN A;  4WBO A;  5EM5 A;  4FSQ A;  3WZD A;  4YU2 A;  1GIH A;  3QX4 A;  3CQU A;  5GJF A;  3UG2 A;  4DEE A;  5LWN A;  3E7O A;  2R9S A;  3MBL A;  3MJ2 A;  5EFQ A;  4CQG A;  3NCZ A;  3DA6 A;  4U8Z A;  3V5W A;  5A4Q A;  1P4F A;  2AC5 A;  2R3F A;  3BE9 A;  3KCF A;  2Y6M A;  3KMM A;  3OC1 A;  4QP4 A;  3JS2 A;  3V01 A;  4CMO A;  4DGO A;  2YJS A;  3C50 A;  2OIB A;  3IOP A;  3SKC A;  3FAA A;  3VS7 A;  4GUB A;  3AMA A;  4XH6 A;  3LQ3 A;  4HCU A;  4RFZ A;  2UW4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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