5AQIA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqiA04
2IVNA 3C7NA 1GLDG 3GOIA 4O8KA 2KHOA 3WQTA 4FWOA 4BR0A 4Z94A 3EKUA 3LDOA 1QQMA 3FZMA 4M63C 3WQUA 1XQSC 4JAXA 2GUPA 2AP1A 1NGEA 4MLEA 2QWMA 2CH6A 2E20A 2YHWA 2I7NA 2UYTA 4I6MA 1TYQB 2HF4A 3H6EA 3LDNA 2QM1A 1XUPO 2A6AA 4JNEA 2ITMA 4EHUA 1E4FT 4H0PA 3VEWA 1H1VA 2CH5A 3LL3A 3H3NO 3ENHA 1BA0A 4H5NA 2E88A 2VWBA 4AM6A 4RCHA 3QDKA 5AZJB 3ZETA 3LDPA 1ZC6A 4CZJA 3W3DA 4HWIA 2E2OA 1U2VA 4BQZA 1GLLO 4EHTA 4H0OA 3UKRB 2E1YA 4JHDB 1QQOA 5AQHA 5FPDA 3A5MC 3A5OC 1V4SA 3R8EA 3H45C 1SZ2A 4KBOA 3SMSA 3MN9A 1NGJA 4FPBA 1BWFO 1GLCG 5JMVA 3JXUA 1QQNA 2FF3B 2PBDA 4IWVA 1EQYA 1NWKA 2P9PB 4FWNA 4Y0WA 3EO3A 4K43A 2HF3A 4BG9A 1BUPA 2A5XA 4CZEA 3U8XA 4BRPA 4QS9A 1T44A 2WUSA 3BUZB 3SMPA 4AM7A 2FLOA 3IMXA 2A41A 4H0TB 4BG8A 2BTFA 3R9PA 4B9QA 3ENOA 3A8YA 4MO4A 1Z05A 1XC3A 2E2PA 2E8AA 3VESA 1X3NA 3VGLA 4ISGA 4BRQA 4RWTA 5FPMA 1P8ZA 1MDUB 3LDQA 2QWNA 4CZMA 2D1KA 1NGBA 3O08A 4WYBA 4BC2A 5AQOA 5AQLA 2ASPA 3HM8A 2GELA 3WXLA 3ZX0A 3BF3A 4IJAA 5AZJA 3I8BA 4K25A 5BPLA 3EKSA 3IFRA 3VEOA 3CJ1A 4FWRA 3FLCO 2BUPA 2P9LB 2QWLA 5B8HA 4QS7A 4XH1A 2IIRA 5AQRA 3UKRA 2YI1A 3BP8A 5AQKA 3A5NC 4BRLA 4FL9A 4FSVA 4CI6A 1BG3A 2D4WA 1LCUA 3GG4A 3ULEB 5F1XA 5KQDA 1ZXOA 5LJVA 5E26A 3SK3A 3QMLA 2YCHA 4E1JA 3QBXA 1WUAA 2P9PA 4PKGA 3VEVA 1HX1A 5AFUH 1NGGA 1Z6RA 4FWSA 4M7XA 3CHWA 2PAVA 3CJ9A 3KHYA 3O1WA 5KPZA 4IZ9A 4CZHA 3CETA 4H5RA 1X3MA 3R6MA 4BQLA 4FO0A 4JN4A 3MN7A 4A61A 3LDLA 4CZIA 2P9KB 4K42A 1LOTB 3CERA 3H1QA 1HLUA 2GWJA 3A0IX 4FWPA 5AZIA 2ZGYA 4H5WA 4FPAA 4GY2B 3DAWA 3O80A 4CBWA 3M1FA 3OHRA 2FSJA 5AQSA 3P4IA 4DHYA 5KQ8A 5AQNA 3IDHA 1QZ6A 5F2RA 1ATNA 5JICA 1YUWA 1HPMA 3UKUB 3WT0A 1BU6O 3O6WA 2Q31A 2FSKA 3HI0A 5I9EB 2EWSA 2W40A 4BRHA 2OANA 5BN8A 1G99A 3FGUA 4H5TA 3LM9A 4ISEA 4L3QA 4BR7A 2QXLA 4CZLA 3WUHA 2ASOA 1GLEG 3U4LA 3VF2A 1T6CA 3MK6A 3VOVA 1GLBG 3CI5A 2ZWHA 1JCEA 1C0GA 4XH5A 2E1ZA 1NGFA 4O5FA 1R59O 1QHAA 2ZF5O 4GNIA 1ATSA 1ATRA 1NGIA 5E84A 5AQQA 3WXKA 3RSEA 4BR2A 1HKGA 2A40A 3D2EB 2P9IB 3FFKB 1YVNA 5BRFA 2F9TA 4BC4A 3DWLA 4CZKA 5BRHA 3O4WA 2P9SB 4JD2B 2Q0UA 3GBTA 4BGBA 2D0PA 5ELZA 2A3ZA 1CZAN 1S22A 5LJWA 2HOEA 4BVPA 1YXQA 3WEEB 3IUCA 1BDGA 3ZEUB 2QWOA 5FPNA 4BC3A 1HUXA 3EZWA 2P9NB 5JLHA 2V52B 3FZLA 3UKUA 1TYQA 2H3GX 1KAXA 1SAZA 1TUYA 4BR4A 4BRAA 2Q0RA 3FZHA 4QS8A 4BVOA 1YAGA 3BEXA 3C0BA 4XH4A 1TUUA 3TPQA 3D7EO 5CE3A 3L0QA 3SJHA 5BR9A 2QWRA 1HKCA 3CJCA 4RTFD 4EIAA 4PL8A 5KPRA 4ISFA 2I7PA 2A42A 4H0YB 3MN6A 4A2BA 3CJAA 5LY3A 5AQVA 3HBTA 5AQYA 4JHDA 5KPTA 1MA9B 4FOIA 3VPZA 4BRFA 1S3XA 5AQFA 3DXKB 1BOTO 2D0OA 3JS6A 5TKYA 1D4XA 4EFHA 4I6MB 2P9IA 1J6ZA 4DQ8A 1X9JA 2CGLA 2VCPA 1Y64A 3D2FB 4H03B 2GWKA 3AAQA 2NLXA 3HZ6A 3DXMB 3U9ZA 5AQPA 3A5LC 4H0XB 3MCPA 3ZEUA 4MLHA 4CBUA 4WQ4A 1K8KB 1KAZA 1MWMA 2CGJA 3VF4A 2P9NA 3O1BA 4PKHA 3WXIA 5EXWA 1ZBSA 3QICA 4BRCA 4BRIA 2P9UB 5ADXA 4BRDA 1IJJA 4HTLA 5EVZA 3QFUA 3LM2A 2NZTA 4CZFA 1T6DA 3L4IA 3F9MA 3VEYA 3VGMA 2GTDA 5AQTA 4C23A 1NGCA 4B1VA 3S41A 4BRNA 1ESVA 1MWKA 1RFQA 3VEZA 4YDUA 3TU5A 4A2AA 3DJCA 1SQKA 1E4GT 5BPMA 3KVGA 2GEMA 3WXJA 4K41A 2P9LA 2Q36A 5JLFA 1NLVA 1DEJA 1KXPA 3O5BA 4H5VA 4B1UB 3SLCA 3VGKA 3VERA 4CJ7A 3ULEA 3DXKA 2FSNA 4WQ4C 4M7YA 1NGAA 3BF1A 5FPEA 1V4TA 2Q97A 4DB3A 4EAHD 3FE1A 3HSCA 5AQMA 2VYPA 3FR0A 2AA4A 4FWMA 3D2FA 4FOEA 3AAPA 1JCFA 4CZGA 1QZ5A 3ID8A 4CBXA 4BR5A 2V7ZA 3EL2A 1DGKN 3DXMA 4BC5A 3M6GA 2Q1NA 4BROA 5ADXH 1NBWA 4B1ZA 2V51B 5EOYA 5AQUA 5EX5A 3L6QA 1K8KA 4DCHA 5BPNA 2ZGZA 3CQXA 5AQWA 4YDUC 3W0LA 1GLAG 3KZBA 2P9KA 1U6ZA 4J8FA 3ZX3A 2P9UA 3B8AX 2DPNA 4F9OA 2Q2RA 3FZKA 3GDQA 3CJBA 1HKBA 1RGIA 1GLJO 1NM1A 3GE1A 3O8MA 3CQYA 3MN5A 4IO8A 4IXCA 4B1YB 5AQXA 2W41A 4WQ5A 2NRHA 4BREA 4B1XB 2E2NA 3FZFA 1WOQA 2FF6A 3H1VX 2FXUA 4XEIA 3VF6A 4BRKA 3ATVA 4A62A 2J4RA 2IVPA 5BN9A 2YJFA 3ZX2A 1C0FA 3C7NB 5BRDA 5F0XA 5AFUA 2ASMA 5EY4A 3VEXA 1BO5O 1BA1A 5AQJA 3CIPA 4IJNA 3AY9A 4PKIA 1NGHA 2CGKA 5AR0A 1NGDA 3J8AA 3QB0A 4PL7A 3GL1A 4NB4A 5AZIB 4BRMA 1RDWX 3H3OB 4CD3A 1KAYA 2IVOA 2YJEA 1GLFO 2QW9A 3AARA 3U9DA 3G25A 3D2EA 3H46O 4NO7A 2QWPA 2E2QA 2P9SA 4FWLA 3MMVA 5AQZA 4JD2A 4BGAA 4WQ5C 5AQGA 1HJOA 2YHXA 3UE5A 1JCGA 3ATUA 2YHYA 3VENA 2F9WA 1IG8A 3WEEA 4LC9B 2V7YA 3HTVA 3ZETB 2QWQA 5AQIA 1DKGD 3M3ZA 1Q18A 3CJ7A 3EN9A 3MDQA 3QBWA 1U2VB 3VETA 4FWQA 4FWKA 3UB5A 1NMDA 1OKJA 3I33A 4CD1A 3QFPA 4B1WB 4MO5A 5BREA 4H0VB 4BR9A 3RSEB 2HMPA 4BRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IVNA 2F8TA 3QESA 4YFUA 2UU9K 4LF4K 3KJVA 1I6GA 4DQRA 1Z26A 4Z94A 2GBZA 3K57A 3BGRA 3F9KA 1NK5A 3G0ZA 4JAXA 4FJ5A 1BCMA 4HUEA 1RBSA 2AP1A 2C1GA 3D45A 3K9JA 4MLEA 3KK1A 4FLZA 4DFKA 2HHVA 3S9HA 4AILC 3H6EA 4UAEF 2FC0A 4CFCA 2QM1A 4CF1A 4FLYA 1YJWN 4CJWA 1P0AA 1NOZA 2CH5A 5J2NA 3DI6A 2G8WA 1BA0A 4CJ5A 2E88A 3RTVA 3TAEA 1D9FA 2VY6A 4F2RA 3QDKA 5CZ1A 2Z1JA 3VN5A 4CCHA 4HWIA 1U2VA 1XWLA 1RDDA 4CEBA 4EZ6A 1XNQK 3UKRB 4DF4A 2O8EA 2E1YA 4JHDB 1SS6A 1KVCA 2IOCA 3SMSA 3MN9A 4KHPK 1HNIA 5GIPA 3JXUA 4DLGA 2FF3B 4Y0WA 2P9PB 4CGIA 3EO3A 3TTCA 4CK1A 4Q5VA 1RTHA 2A5XA 3OYNA 3L2QA 1QVFM 4CZEA 4X64K 3OVNA 3L8BA 4DV7K 1T44A 2WUSA 4AM7A 3IMXA 4H0TB 4B9QA 1S1TA 4BECA 1NKCA 4YOVA 1S5JA 1TK5A 3VESA 3MECA 2B5JA 1EETA 4R79A 4BRQA 4IOCL 4AF1A 3I8DA 3LDQA 4CZMA 2VQFK 1ZU3A 2D1KA 1XNRK 5KRSA 1GPSA 4CHYA 5BR8K 4KI4A 3N4QA 3LPTA 1OMYA 2NUBA 5JVHL 3NAEA 3THWB 2OPRA 3ZT0A 5AZJA 3I8BA 4K25A 4YOXA 3TARA 3WNHA 3EKSA 3VEOA 3CJ1A 3FLCO 2HHHK 1ZUTA 2P9LB 4DTMA 2M8BB 4JI7K 3BY5A 1HNZK 2HBKA 1IH7A 4CGGA 3OJSA 4M42A 4KAZA 3AGKA 2K35A 3RR7A 3SK3A 1RDAA 2NRRA 3QMLA 2YCHA 3TTFA 4IFYA 2KZZA 4PKGA 3VEVA 5AFUH 4FWSA 1XMQK 1WAJA 3ZSRA 1VSMA 2HBJA 5KI6A 4Z0UA 5KPZA 4YOWA 1YITN 4CZHA 2G2KA 3OBWA 4CF8A 4DU4A 3SQ0A 4ELUA 2LY5A 3NMUA 4A61A 2P9KB 2UUAK 2YHAA 1ASVA 4Z4IA 3CERA 3C95A 3DRRA 5C12A 4FK2A 2BGGA 2LY6A 4H5WA 1LQIA 1RBTA 4JK9A 3DAWA 3P83D 3O80A 3M1FA 3OHRA 4M3WA 3P4IA 5F2RA 2OTJN 4AB0A 5JICA 3UKUB 3O6WA 1CLQA 3NH0A 4BRHA 5CY4A 3FGUA 4H5TA 1GOBA 3U3YA 4PY5A 1TK0A 4TSXA 3RRGA 2IS3A 4O55A 3L2WA 3R2VA 1TL1A 1F21A 3QEXA 2O8FA 2O8BA 3T19A 1HYSA 2OA8A 1WB9A 1RNHA 2JWKA 2NY9X 2A7TA 3SAFA 4FXDA 4DFMA 4M3YA 1NRAA 4O5FA 2ZF5O 1QHAA 1JLFA 1S6QA 3AVFA 1NGIA 2RE2A 4JI0K 4RG8A 2YC1C 3RSEA 1HKGA 2A40A 1ITGA 4WCEL 1YVNA 3HXMA 4LF7K 2P9SB 4JD2B 4JI6K 3GBTA 2OPPA 3ZSOA 3ZCMA 2D0PA 5ELZA 4OPJA 4IO9L 4BVPA 3OYCA 1BDGA 3CC4N 3NCIA 2HNZA 4BC3A 1LAVA 1JXEA 2I5JA 1P90A 3EZWA 1FKPA 3CPEA 2V52B 4JKBA 1FKOA 3FZLA 3QIPA 1NPIA 1QQCA 2H3GX 1KAXA 4CFBA 2HBLA 3DRSA 3TAMA 1HNWK 2YIOA 3BEXA 1G15A 1RBVA 3TSQA 4OPKA 5CE3A 1SNBA 3BZKA 3CCEN 4FJ7A 3VQEA 4DSEA 1VQ7N 4PL8A 5KPRA 4HE7A 4YOYA 4FLUA 1KLMA 4CEZA 1RT3A 3SAGA 1WNSA 4AEIA 2YNFA 4KB1A 2G8FA 3DLBA 2HW3A 4Z4HA 4CECA 1MA9B 4BRFA 4DTNA 1EWQA 3BZCA 2D0OA 3I56N 1VQ8N 3LANA 3PO4A 3P5JA 3K5NA 3CG7A 3KHWA 4KHSA 2ETJA 4IDKA 5KGXA 2VCPA 3QEWA 1KSPA 2O8DA 2O4GA 4DSKA 2RPIA 4YOTA 3DXMB 2ASCA 4B3TK 3ASMA 4DTJA 1DTQA 2Q3SA 3ZEUA 4CBUA 1RTIA 1K8KB 4NCGA 1MWMA 3SF4D 4FW1A 1L3SA 1I94K 2WTUA 4BRIA 2FBXA 1JLEA 4DV5K 5ADXA 1JLGA 5SZTA 4LF9K 5EVZA 3V9ZA 4I2QA 3SQ1A 4CZFA 1C55A 1NK7A 2GTDA 5DMRA 4CK3A 3LP0A 2N69A 4FW2A 4C23A 4WFNL 4JV5K 3J7AP 2O8CA 4B1VA 1MWKA 4AQYK 4A2AA 4IOXA 4CEEA 1SQKA 3UIQA 4E72A 2KW4A 5A2QO 3KVGA 2GEMA 4AHVA 1PE4A 5JLFA 1DEJA 3ISNC 1KXPA 3CCLN 3BDPA 4LD0A 4B9UA 1TGOA 3VQ4A 2FSNA 4BE0A 4NYNA 4BDPA 4IDHA 1XHZA 1JKHA 1OH7A 1X9MA 5HLFA 5FPEA 1NJZA 3HVRA 3FE1A 2Y1JA 1WN7A 3KC6A 4JRPA 3AAPA 4NLCA 5M1OA 2R7YA 4FJMA 3EL2A 1RCHA 2UUCK 4CEFA 2Q1NA 1NK4A 3WNGA 3TANA 1NBWA 1W97L 2V51B 4CGFA 4RW7A 2ZGZA 1ZYVA 1UOCA 3CQXA 5IT9O 4E7HA 2P9UA 3B8AX 1QSLA 4F9OA 2PFUA 3THYB 3RMDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2IVN A;  2F8T A;  3QES A;  4YFU A;  2UU9 K;  4LF4 K;  3KJV A;  1I6G A;  4DQR A;  1Z26 A;  4Z94 A;  2GBZ A;  3K57 A;  3BGR A;  3F9K A;  1NK5 A;  3G0Z A;  4JAX A;  4FJ5 A;  1BCM A;  4HUE A;  1RBS A;  2AP1 A;  2C1G A;  3D45 A;  3K9J A;  4MLE A;  3KK1 A;  4FLZ A;  4DFK A;  2HHV A;  3S9H A;  4AIL C;  3H6E A;  4UAE F;  2FC0 A;  4CFC A;  2QM1 A;  4CF1 A;  4FLY A;  1YJW N;  4CJW A;  1P0A A;  1NOZ A;  2CH5 A;  5J2N A;  3DI6 A;  2G8W A;  1BA0 A;  4CJ5 A;  2E88 A;  3RTV A;  3TAE A;  1D9F A;  2VY6 A;  4F2R A;  3QDK A;  5CZ1 A;  2Z1J A;  3VN5 A;  4CCH A;  4HWI A;  1U2V A;  1XWL A;  1RDD A;  4CEB A;  4EZ6 A;  1XNQ K;  3UKR B;  4DF4 A;  2O8E A;  2E1Y A;  4JHD B;  1SS6 A;  1KVC A;  2IOC A;  3SMS A;  3MN9 A;  4KHP K;  1HNI A;  5GIP A;  3JXU A;  4DLG A;  2FF3 B;  4Y0W A;  2P9P B;  4CGI A;  3EO3 A;  3TTC A;  4CK1 A;  4Q5V A;  1RTH A;  2A5X A;  3OYN A;  3L2Q A;  1QVF M;  4CZE A;  4X64 K;  3OVN A;  3L8B A;  4DV7 K;  1T44 A;  2WUS A;  4AM7 A;  3IMX A;  4H0T B;  4B9Q A;  1S1T A;  4BEC A;  1NKC A;  4YOV A;  1S5J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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