5AQLA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLWSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqlA04
1HKBA 3SK3A 4FWLA 4O8KA 3R8EA 1Y64A 1QHAA 5AZJB 4K43A 3AY9A 5FPMA 2QXLA 4JHDA 2FSNA 3FZLA 4BC2A 4BREA 2D0OA 3EL2A 3A5NC 1JCEA 3MMVA 3AARA 4PKHA 4H0TB 3HZ6A 1EQYA 3UKUA 4FOIA 1X3NA 4WQ5A 1HPMA 3CHWA 4B1YB 3UE5A 2E2PA 1QQNA 3H6EA 4WQ5C 4DHYA 4BC4A 3GL1A 2IIRA 4M7XA 2V51B 5BPMA 5KQ8A 2P9PA 3ZETB 1NBWA 4B1XB 3RSEB 5KQDA 3VEZA 4PL7A 3WQUA 3CQYA 3H3OB 4GY2B 1E4GT 4K25A 1DGKN 3FGUA 4NO7A 3LM2A 4BVOA 2GEMA 3AAPA 3R6MA 3U8XA 3CETA 4CZMA 3KVGA 4IJNA 2QM1A 4BGBA 3DXKB 4BC5A 4XEIA 2A42A 1GLJO 1HLUA 1GLEG 4J8FA 3DXMA 5AQRA 2P9IA 3GDQA 2CGJA 5EXWA 1X9JA 3ZEUB 1SAZA 4BRFA 1SZ2A 4Y0WA 3ZX0A 4CZHA 5AQIA 1X3MA 1MWKA 2ZGZA 4FWKA 2PBDA 3DWLA 5AQNA 3CJAA 3C7NA 4WYBA 4ISFA 3UKRB 4BR9A 1QQMA 4O5FA 1HKCA 1XUPO 3GBTA 2ASMA 1NGIA 3ULEB 3GE1A 1GLFO 1BA0A 3CJBA 4CZEA 2QW9A 2Q2RA 3WEEB 2DPNA 5AZIB 3CI5A 3U9DA 4H5RA 5AQFA 1HUXA 3LDQA 2CGKA 4CZKA 5AQSA 1Z05A 5EX5A 4NB4A 2AA4A 1BU6O 4H0PA 4JHDB 1MA9B 1K8KA 2FSKA 4CZJA 1YVNA 3ATUA 3JS6A 5AQHA 2YJFA 5BN8A 3EKSA 3WQTA 3VEOA 5JLHA 4QS9A 2W40A 1S22A 5AQWA 3UKUB 3H3NO 1HX1A 3SJHA 2Q97A 4H5TA 2CH6A 3M1FA 5KPTA 1QZ6A 2P9PB 5JMVA 2GUPA 1KAXA 4MO4A 3VEXA 1G99A 2P9NA 1GLAG 2QWQA 5E26A 5BRHA 5AR0A 4KBOA 3VPZA 4BGAA 3MN6A 3IUCA 5F1XA 2VWBA 2EWSA 5AQMA 1BWFO 3SMPA 3HBTA 2FF6A 2E20A 5JICA 4CBXA 3A5OC 4BR5A 4IO8A 1ZC6A 4PKGA 2BUPA 1TYQB 4H0XB 4CZFA 3MCPA 1YXQA 4MO5A 4EAHD 4BQLA 1JCGA 3CERA 3D2EB 4FWQA 4BR4A 1BUPA 4YDUA 3CQXA 4DCHA 3U9ZA 4YDUC 3O1WA 4DB3A 5AFUA 3VGMA 1KAYA 3IMXA 3FE1A 1WOQA 2Q1NA 3QBXA 1RGIA 3FZHA 4FWOA 4CBWA 2E8AA 2CGLA 3CJ7A 5EOYA 4CZIA 4E1JA 3L0QA 4EHUA 3WXJA 4ISGA 4PKIA 1Q18A 2NRHA 2GWKA 3HSCA 5EVZA 4FWMA 5FPNA 4BRAA 2GTDA 3QFPA 1ATNA 3D2FB 4I6MA 2ZWHA 3MN5A 3FFKB 1C0GA 3ENHA 2AP1A 1K8KB 1BOTO 1ESVA 2F9TA 4B9QA 2QWLA 2ASOA 2FXUA 3FLCO 1D4XA 5AQTA 3GOIA 2KHOA 4FPAA 3FZKA 1DKGD 3W3DA 1GLDG 2BTFA 1BDGA 2P9UA 3R9PA 5ADXA 3VEVA 1V4SA 3BF1A 5AFUH 1T6CA 3DAWA 3VOVA 2A40A 4FWRA 5B8HA 1NGBA 1BA1A 2P9LA 2P9NB 2FLOA 1NGCA 4HTLA 3WXIA 1JCFA 3BP8A 3DJCA 3OHRA 5AQJA 4B1WB 1V4TA 4H0OA 2F9WA 4BVPA 2W41A 2V7YA 4M63C 1RFQA 1E4FT 1OKJA 4K42A 3WUHA 4C23A 5F0XA 5AZJA 3QFUA 1LOTB 2HF4A 1ATSA 5TKYA 2A41A 3H1QA 1QQOA 1XC3A 1WUAA 4PL8A 1YAGA 4QS7A 4EFHA 5AQPA 4A2BA 4RWTA 1ZBSA 4AM6A 1BG3A 3JXUA 5ADXH 2P9KA 4H5VA 4A2AA 3L4IA 5AQQA 4BR0A 1U2VA 3O1BA 3BF3A 1TUUA 2E1YA 2ZGYA 3F9MA 3HI0A 2FF3B 3RSEA 4BROA 2D4WA 3ENOA 3WXKA 4EHTA 5LJWA 1J6ZA 4BRIA 2I7PA 4CBUA 4DQ8A 3ZX2A 2UYTA 2D1KA 3LL3A 4JD2A 3B8AX 4FO0A 4BRHA 5KPRA 1GLCG 4H5NA 3C0BA 4H0YB 4Z94A 1T44A 1GLLO 3VETA 2A6AA 3CIPA 1R59O 4CI6A 4FL9A 3VENA 2Q31A 4RTFD 2QWNA 4WQ4A 4LC9B 5LJVA 5LY3A 4IZ9A 1IG8A 4WQ4C 2Q36A 5FPEA 3LDOA 4BG8A 3QICA 4XH4A 3O08A 4BG9A 1LCUA 4RCHA 3QMLA 5BPNA 3O6WA 4BRQA 4A61A 1HKGA 3KZBA 2A5XA 3DXMB 3BUZB 2P9IB 3MDQA 3VGKA 4BC3A 1NLVA 2J4RA 3QDKA 4FPBA 3VF2A 3VGLA 1IJJA 3EKUA 2ITMA 1NWKA 1T6DA 2YJEA 3C7NB 3SLCA 5AZIA 5E84A 2E1ZA 4FSVA 2GWJA 3L6QA 2GELA 3EN9A 2E2NA 3QB0A 1GLBG 3D7EO 2CH5A 4BRLA 2IVNA 4BRGA 2Q0UA 2HF3A 4QS8A 5AQZA 1H1VA 3TPQA 3I33A 4IJAA 1DEJA 3FZFA 2D0PA 2FSJA 3CJCA 3VF4A 3M3ZA 3A5LC 1C0FA 2V52B 3CJ9A 1HJOA 3VESA 3BEXA 1CZAN 2QWRA 2QWMA 5JLFA 3KHYA 5BREA 5KPZA 4K41A 3O8MA 2P9KB 2YHXA 4JNEA 2P9SA 4BRMA 4MLHA 3J8AA 3G25A 3FR0A 1U2VB 3FZMA 3EO3A 5BN9A 1SQKA 4IXCA 5ELZA 1NMDA 4M7YA 1KXPA 5AQKA 2VYPA 2NLXA 2IVOA 2WUSA 4MLEA 3VF6A 1QZ5A 5FPDA 3MK6A 2E2OA 2HMPA 1NGAA 1S3XA 3H45C 2HOEA 3VEWA 3W0LA 4B1VA 4JD2B 5BRFA 2IVPA 3M6GA 5EY4A 1NGGA 4CD1A 3U4LA 1KAZA 1P8ZA 3WT0A 5AQVA 2PAVA 5AQOA 3A5MC 1TYQA 2I7NA 4FWSA 4H5WA 4CZLA 2QWOA 5AQXA 2E2QA 4IWVA 4H03B 1NM1A 1NGFA 1NGJA 4HWIA 3D2EA 2VCPA 1YUWA 2H3GX 3O80A 3O5BA 2A3ZA 1RDWX 4CD3A 4F9OA 5BPLA 3A0IX 2ASPA 5AQGA 1TUYA 5AQYA 3A8YA 1XQSC 2YHYA 4BRNA 3ID8A 2V7ZA 4FWPA 5AQUA 3VEYA 4BRCA 5AQLA 3MN7A 3LM9A 4XH5A 1ZXOA 4ISEA 5I9EB 1NGDA 1MWMA 4BQZA 4BRDA 3SMSA 2ZF5O 3H1VX 3ZETA 4CJ7A 3D2FA 3HTVA 4A62A 5F2RA 3O4WA 4B1UB 3QBWA 5CE3A 4EIAA 4I6MB 1ATRA 3I8BA 2NZTA 4XH1A 4FOEA 4BR7A 3HM8A 4L3QA 3S41A 3IFRA 4B1ZA 4JN4A 4H0VB 3UB5A 3DXKA 4BRKA 3H46O 2E88A 5BRDA 3AAQA 2P9SB 5BR9A 4BRPA 3TU5A 2YI1A 1Z6RA 1NGHA 2P9UB 3ZEUA 3LDNA 1U6ZA 4CZGA 3WXLA 3LDPA 4BR2A 2OANA 2QWPA 3LDLA 3UKRA 3VERA 4AM7A 2P9LB 3EZWA 3GG4A 3MN9A 3CJ1A 1NGEA 3ULEA 2YHWA 4FWNA 3IDHA 4GNIA 1MDUB 3WEEA 3ZX3A 2Q0RA 2YCHA 1BO5O 3ATVA 4JAXA 3P4IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HKBA 4E7IA 1QHAA 4M3TA 5D3GA 5HL7L 4K43A 2F8TA 3AY9A 5FPMA 4JHDA 1XI1A 2FSNA 2LI7A 1PE4A 3FZLA 1I6FA 2B6AA 4BC2A 4Q5VA 4UAFE 3EL2A 1JCEA 3AARA 4H0TB 3RWUA 1EQYA 4FOIA 4JKDA 3CHWA 4DHYA 1RBTA 3AVAA 4C8MA 2QKKA 4BC4A 4JI0K 1T8EA 5HBMA 2O8FA 3K9JA 1TKZA 4BWJA 1NBWA 3ITHA 1WSFA 3VQAA 2G8FA 3V1RA 1WBBA 3WQUA 1YF5L 1E4GT 3PSMA 3DOKA 2QK9A 3CCJN 1G15A 3KWIA 4GV3A 3LM2A 1UOCA 4HCCA 2GEMA 2G2KA 3EZ5A 2A1SA 4PQUA 2G8HA 1K8AO 3KVGA 3QEIA 4IJNA 2HHUA 4M42A 4GW6A 3AGKA 1ASUA 5FROA 1GLJO 2FC0A 4J8FA 1XMQK 3DXMA 1VHXA 1NNEA 4M41A 3RR8A 1X9JA 3ZEUB 4Y0WA 3ZX0A 4CZHA 5AQIA 2XY8A 4FWKA 4CF9A 3THWA 5LMNK 1IO2A 5AQNA 3KD5E 1NJYA 1F21A 4ISFA 4BR9A 4CJWA 1PX9A 4KAZA 1XUPO 4DR3K 4LFAK 3ULEB 4IOCL 3GE1A 4CZEA 2QW9A 2Q2RA 4EZ9A 2KW4A 5CHIA 3RR7A 4IEEA 3U9DA 4FJKA 5T7BA 1BK8A 1LQHA 4O5BA 3D6RA 3KLFA 5AQSA 1M1KO 1A5VA 2DTUA 2AA4A 3HXMA 2LJMA 3CCSN 1MA9B 4BE0A 4LH4A 2HHTA 4CZJA 3ATUA 3CCRN 2YJFA 1RNHA 3AVHA 4J2DA 2VGMA 3DRPA 3P5JA 2YKMA 5JLHA 1SS6A 2KBKA 3TAGA 1K8BA 3SUQA 3AA4A 4H5TA 4OGCA 3M1FA 3LWLA 2HHHK 1I39A 1RT1A 4CEBA 5C0YA 5KPTA 1QZ6A 2P9PB 2G8IA 5JMVA 4MO4A 3E9LA 3DLGA 1NK4A 3L2QA 4E72A 1GLAG 2QWQA 5BRHA 1KV0A 5AR0A 2UUCK 4YOVA 3MN6A 1REVA 3CW4A 1RT6A 3L8BA 2FF6A 3OS0A 4PKGA 4O44A 2BUPA 4H0XB 4YORA 1OVYA 3MCPA 1YXQA 3F9KA 4KH6A 2VG7A 4MO5A 1N32K 1JCGA 5C2DA 1ZYWA 5FRMA 4FWQA 4LF9K 1T1TA 4YDUA 2HNDA 3O1WA 4DB3A 3VGMA 3QEXA 2YHBA 4JYAK 3FZHA 4DKWA 4B8AB 4KHUA 2CGLA 4BE7B 5GINA 3WXJA 1VQ9N 3E9OA 4ISGA 4UADE 4NLCA 4PKIA 3KD1E 4CJKA 1Y97A 4IKFA 5EVZA 3QFPA 3WNHA 3HP9A 4I6MA 2ZWHA 3SPYA 3QI7A 2ETJA 1QVFM 4JS5A 3KOZA 1J53A 3ID6A 2UUBK 3FFKB 1NJIO 3ZCMA 4BDPA 2P5OA 4B9QA 4BE2A 2QWLA 3IRXA 4V19S 3VQ4A 5KTQA 4C8OA 1RTHA 3OS1A 4YNQA 2OZMA 3K5OA 3CG7A 3FZKA 1I6GA 4DFPA 1DKGD 4E3SA 1A5XA 3QNNA 1T6CA 4HUEA 3RRHA 1N8RO 4CJTA 4PUOA 1NGBA 3VTHA 2P9LA 2P9NB 4IG0A 3LAKA 3QERA 3AVGA 1CHZA 3S5TA 4IFEA 3HT3A 3BP8A 3MCAB 1BHLA 1EP4A 2IGIA 1WB9A 2F9WA 1PTXA 4KB1A 2BGGA 4C23A 5AZJA 1BCMA 1LOTB 2HF4A 4QAGA 4JI1K 5TKYA 3TAFA 1WUAA 1ZUTA 1YAGA 4EFHA 3OY9A 3M8QA 2HHSA 3LPUA 1I2VA 2OYQA 3VA0A 1BG3A 3P1GA 3VN5A 1BMRA 1JLBA 4AEIA 4QCLA 3BF3A 2XY7A 2IC3A 3HI0A 2FF3B 5GAHP 1XWLA 4CJ5A 2O8FB 3WXKA 4JI6K 5LJWA 2I7PA 1Q7YO 4I9LA 4CEQA 4DQ8A 3LL3A 4AF1A 1HYSA 3CCVN 5KGWA 4Z94A 4MQ3A 1GLLO 3DLBA 3OYGA 4DLEA 1R59O 3AVFA 2Q31A 1TI5A 4RTFD 2GBZA 4WQ4A 5M1PA 1IH7A 5LJVA 4IZ9A 1IG8A 2LKBA 1QHTA 3KK1A 4H8KA 5FPEA 3LDOA 5JVHL 1XMOK 1JLQA 4LFCK 4RCHA 4OKJA 4DQPA 4MDAA 1A5WA 1N33K 1U48A 5BPNA 1BQMA 4FLZA 2A5XA 1WMTA 3DXMB 3MDQA 2J4RA 1OH5A 1VQPN 2WC9A 3VF2A 1SKRA 4GV9A 3NF6A 5JS1A 3NAEA 1NWKA 5C12A 2WFBA 4I2PA 3KKRA 1NKCA 4DSKA 3SLCA 2KJAA 4FSVA 2GWJA 2X6SA 3QB0A 3V1OA 3D7EO 1WSGA 4BRGA 3KP1A 3KK2A 2ZQBA 4F3OA 5CR4A 3C6TA 1HNZK 1S1TA 4IJAA 1LV5A 3M8PA 4KTZA 1C0FA 2V52B 2N66A 3BEXA 3NVMA 2QWRA 4DTRA 1I3AA 2R7YA 4K41A 3MX5A 3ZT2A 3NHGA 4BRMA 2MN5A 1FW6A 3EO3A 1L3UA 1L3VA 4CK2A 2ASCA 3SBTA 3AA5X 1XHZA 5GADP 1QZ5A 1ICAA 1C0TA 1ZBUA 3H45C 5M1QA 4B1VA 4CJVA 1YJWN 3M6GA 4CD1A 1RT2A 3CCUN 3WT0A 4KPYA 4NYNA 3RMAA 4CJEA 3EYZA 3TSPA 5AQXA 3O3FA 1YJNN 4NXNK 4H03B 3RMCA 1HRHA 4ZTJA 2HBKA 1NGJA 2GMOA 2QTDA 3D2EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HKB A;  4E7I A;  1QHA A;  4M3T A;  5D3G A;  5HL7 L;  4K43 A;  2F8T A;  3AY9 A;  5FPM A;  4JHD A;  1XI1 A;  2FSN A;  2LI7 A;  1PE4 A;  3FZL A;  1I6F A;  2B6A A;  4BC2 A;  4Q5V A;  4UAF E;  3EL2 A;  1JCE A;  3AAR A;  4H0T B;  3RWU A;  1EQY A;  4FOI A;  4JKD A;  3CHW A;  4DHY A;  1RBT A;  3AVA A;  4C8M A;  2QKK A;  4BC4 A;  4JI0 K;  1T8E A;  5HBM A;  2O8F A;  3K9J A;  1TKZ A;  4BWJ A;  1NBW A;  3ITH A;  1WSF A;  3VQA A;  2G8F A;  3V1R A;  1WBB A;  3WQU A;  1YF5 L;  1E4G T;  3PSM A;  3DOK A;  2QK9 A;  3CCJ N;  1G15 A;  3KWI A;  4GV3 A;  3LM2 A;  1UOC A;  4HCC A;  2GEM A;  2G2K A;  3EZ5 A;  2A1S A;  4PQU A;  2G8H A;  1K8A O;  3KVG A;  3QEI A;  4IJN A;  2HHU A;  4M42 A;  4GW6 A;  3AGK A;  1ASU A;  5FRO A;  1GLJ O;  2FC0 A;  4J8F A;  1XMQ K;  3DXM A;  1VHX A;  1NNE A;  4M41 A;  3RR8 A;  1X9J A;  3ZEU B;  4Y0W A;  3ZX0 A;  4CZH A;  5AQI A;  2XY8 A;  4FWK A;  4CF9 A;  3THW A;  5LMN K;  1IO2 A;  5AQN A;  3KD5 E;  1NJY A;  1F21 A;  4ISF A;  4BR9 A;  4CJW A;  1PX9 A;  4KAZ A;  1XUP O;  4DR3 K;  4LFA K; 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