5AQPA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqpA04
4B1YB 1ZBSA 3MCPA 3I8BA 2VCPA 4CJ7A 1XC3A 2E88A 4IXCA 4A2AA 3A5LC 5AQTA 5AQOA 4MO4A 4BR9A 4GY2B 1QZ5A 5AFUH 2KHOA 2QWPA 3FE1A 3ZETB 2YCHA 4DQ8A 1U2VB 1ATRA 4J8FA 3R8EA 3SJHA 5AQIA 4WQ4A 3VF2A 1MA9B 5AZIB 5AQYA 4EAHD 2CGJA 3CJAA 3LDPA 1X3NA 3QB0A 3DAWA 2P9IA 4E1JA 4A62A 2A41A 3LDQA 1BG3A 2OANA 1HKCA 3HZ6A 3IFRA 3MN9A 1ESVA 5AQHA 2QXLA 3L0QA 3WXKA 4BRMA 5AFUA 2FF3B 3KHYA 3SK3A 2Q97A 2YHWA 4BR4A 3MMVA 4BR0A 3VF6A 5ADXH 5KPZA 3O5BA 2P9NB 3FZKA 1Z05A 4B9QA 5AQXA 2CH5A 3CJ9A 1XUPO 2P9UA 4AM7A 3CI5A 1IJJA 3FR0A 4CZEA 3HSCA 2P9KA 3AARA 3CHWA 4CBWA 5F1XA 1BO5O 2ASMA 5BREA 1K8KB 3IDHA 1QQMA 4XH1A 3TU5A 1GLJO 4BROA 5BN8A 4BRDA 1HPMA 1SQKA 3OHRA 3O80A 1KXPA 1T44A 4B1VA 4H5TA 5ADXA 3M3ZA 3WQUA 4BRAA 4B1UB 2YJEA 2HOEA 1SZ2A 2QWMA 1MWMA 4MLEA 3U9DA 2ZF5O 4PKGA 1T6DA 4DHYA 3VEYA 1KAZA 3FZMA 4PL8A 4BG9A 2J4RA 3DXKB 5EX5A 5AQNA 4IJAA 4JHDA 3EZWA 4B1WB 4CI6A 5BPNA 4CZHA 3A0IX 2QW9A 2BUPA 2V51B 3O1BA 1QZ6A 4B1XB 4MO5A 1YXQA 3WEEB 1R59O 1TYQB 1NGFA 4BRQA 2E2OA 4H0PA 1DKGD 4AM6A 1QQOA 3M1FA 3WXLA 3S41A 3FZLA 5AQSA 3ZX0A 5AQLA 3WUHA 2WUSA 3CETA 4PL7A 2P9LB 5ELZA 5EOYA 2D4WA 2IIRA 3QBXA 5AZJB 4BG8A 3AY9A 4I6MA 5LJVA 3GL1A 3RSEB 5BPLA 2NLXA 4JAXA 1NGGA 3C7NB 5E84A 4NB4A 2W40A 2EWSA 3A5MC 1C0FA 3W0LA 3D2EA 2UYTA 1V4SA 2AP1A 4PKIA 5F2RA 2ASPA 3QMLA 1NBWA 1WUAA 4DCHA 4M7YA 3CJ1A 1Y64A 4CD3A 3SMSA 3VF4A 2P9PA 3G25A 4BR5A 4XH5A 1OKJA 3D7EO 1HX1A 2DPNA 5LJWA 2Q0UA 5JMVA 2VYPA 3R6MA 1YUWA 4BGBA 4CZIA 5EY4A 3BF1A 4FO0A 3ID8A 4QS9A 4KBOA 2ASOA 4FWKA 5AQRA 1ATSA 1BOTO 4EIAA 1YAGA 1CZAN 4FPBA 4JN4A 4LC9B 3FZFA 1BUPA 2YHXA 3JS6A 4DB3A 4MLHA 2F9WA 4GNIA 3ZEUB 1KAYA 1NMDA 3BUZB 2FLOA 3UKRB 3WQTA 3IMXA 3D2FB 3O08A 3ENOA 3ULEA 2QWNA 3DXMA 4H5RA 2GUPA 4H0OA 3VENA 1P8ZA 4BRFA 3GOIA 4JD2B 2P9SB 4M7XA 4ISFA 4RTFD 1C0GA 4XH4A 3TPQA 4BVOA 3UKUA 3B8AX 5FPEA 2QM1A 4IZ9A 2Q0RA 3VETA 3SMPA 5I9EB 5AQZA 1NGBA 4FWMA 3VEVA 3ZX2A 5AR0A 1DGKN 2BTFA 1NGIA 1HLUA 5BRDA 4FL9A 4WQ4C 3U4LA 1NGJA 3H45C 4A2BA 3WXJA 1Z6RA 3BP8A 2QWOA 2GWKA 2ITMA 3VESA 4K25A 1SAZA 3VGMA 2A42A 5F0XA 3A5OC 1GLEG 5JLHA 4L3QA 2V7YA 1GLLO 1NGEA 2PAVA 2ZGYA 3ZETA 4CZGA 2E2PA 1U2VA 3L6QA 2CGKA 2E1YA 5AZIA 4F9OA 3VPZA 1ZC6A 5KQDA 2PBDA 3DWLA 1TUYA 3ENHA 1JCEA 2A6AA 3D2EB 4H03B 5AQJA 2GEMA 3HM8A 5FPDA 3DJCA 3GG4A 1DEJA 1GLCG 3UE5A 4YDUA 5AQUA 3VEOA 3LM2A 1X3MA 3H3OB 1TUUA 2ZWHA 1NM1A 3MN7A 2P9NA 4FWRA 2GTDA 4CZFA 4FSVA 2E1ZA 3QBWA 3M6GA 2HMPA 2CH6A 2Q36A 3QFUA 5AQPA 1NGHA 3ATUA 1NLVA 5CE3A 2QWRA 4WQ5A 5BRFA 3EKUA 4H0YB 2E2QA 2FSKA 3FLCO 1K8KA 5B8HA 2QWQA 1MWKA 3LL3A 1JCGA 1LCUA 2D0PA 1QQNA 4QS7A 4BRNA 3WT0A 3C0BA 4BC2A 1MDUB 3GDQA 2W41A 3H3NO 5E26A 3HI0A 2FSJA 1HKBA 3GBTA 1S22A 2GWJA 4FWQA 2F9TA 4BQZA 2P9IB 1GLBG 3KVGA 4CD1A 1RFQA 2A5XA 4FOIA 1J6ZA 4IWVA 3ATVA 4H0XB 4NO7A 2Q1NA 3VGKA 3WXIA 1ATNA 2NZTA 4BRPA 3DXKA 4IO8A 3BF3A 2FF6A 4HWIA 4BVPA 3CJBA 1NGDA 5AQVA 3O1WA 5JICA 4BRKA 3FZHA 1QHAA 4K41A 3VEZA 4WQ5C 4FOEA 5JLFA 3WEEA 1S3XA 5BR9A 2IVPA 1TYQA 4FPAA 2A3ZA 1RDWX 5BPMA 3UB5A 3SLCA 2P9UB 3MK6A 4BC4A 1EQYA 1G99A 2IVNA 3HTVA 4FWSA 4FWPA 4XEIA 3MN6A 4K42A 2I7NA 3F9MA 2P9KB 3O8MA 3IUCA 4K43A 5BRHA 4CZMA 2P9LA 1NGCA 5AQMA 5AZJA 2I7PA 3VGLA 3RSEA 3W3DA 1U6ZA 3LDLA 3QDKA 3FGUA 2IVOA 4C23A 3C7NA 3FFKB 4BRGA 3EL2A 3EO3A 1GLAG 1NGAA 2V7ZA 2FSNA 4H5VA 4IJNA 1RGIA 1X9JA 3P4IA 5AQGA 3H6EA 1D4XA 1E4FT 1HUXA 5FPNA 1YVNA 3EN9A 5TKYA 2E2NA 5EXWA 4BGAA 4JHDB 5AQWA 3QFPA 1HJOA 3HBTA 4O5FA 3O6WA 3H1VX 4ISGA 1BU6O 4M63C 4CBXA 2QWLA 3BEXA 3MN5A 2CGLA 3JXUA 3AAQA 2V52B 4BRCA 4FWNA 4HTLA 1GLFO 3CQYA 4FWLA 5EVZA 1GLDG 3CQXA 4BC5A 3QICA 3J8AA 3CJCA 1JCFA 2VWBA 3U9ZA 4I6MB 4BRLA 2D1KA 1KAXA 5BN9A 2FXUA 4FWOA 3I33A 3ZEUA 4BREA 4RCHA 4BC3A 1T6CA 5AQQA 3VEWA 3UKRA 4O8KA 2E8AA 3D2FA 1ZXOA 1LOTB 2H3GX 4CZKA 1IG8A 2E20A 3R9PA 3A8YA 3LDOA 2ZGZA 3CERA 1HKGA 4JD2A 2P9SA 2YHYA 4BQLA 4BRHA 1NWKA 3H46O 4EHTA 3L4IA 2P9PB 3VEXA 4B1ZA 5KPTA 3LDNA 4RWTA 4A61A 2YI1A 1BA1A 2Q2RA 3MDQA 4Z94A 4BRIA 3LM9A 4BR2A 3AAPA 3CIPA 3KZBA 4QS8A 4EFHA 4WYBA 4ISEA 3EKSA 5KQ8A 4H0TB 1XQSC 3U8XA 3GE1A 5AQKA 2YJFA 3H1QA 4JNEA 2HF4A 4H5NA 2NRHA 3CJ7A 4CBUA 4PKHA 4CZJA 2GELA 3ZX3A 4BR7A 4H0VB 3A5NC 4YDUC 3ULEB 4Y0WA 2D0OA 3DXMB 1V4TA 1BA0A 5KPRA 5FPMA 3VERA 2A40A 3VOVA 1Q18A 4CZLA 1E4GT 3UKUB 1WOQA 4H5WA 3O4WA 2Q31A 5AQFA 4EHUA 1BDGA 2HF3A 1H1VA 5LY3A 2AA4A 1BWFO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SN1A 1ZYWA 3MCPA 4DMNA 3S3OA 1WMTA 3KOYA 1Q81O 3EYZA 1D8YA 4C1NI 5C42A 4K8ZA 1FW6A 3NE6A 4FW2A 1N8RO 4BR9A 3QINA 1U49A 3WNHA 1JZBA 1Q82O 5AJ3K 2JGUA 2KGQA 3L56A 3K9JA 3RTVA 2GL1A 2LY5A 3GKUA 2YNGA 4EP4A 4E72A 4JEPA 2NUBA 3VQAA 3S3MA 1P00A 3SJHA 1ATRA 1LW2A 1JL2A 3ISNC 4IG3A 4NXMK 3SQ4A 1KRPA 3SCXA 4CJPA 4ELTA 4LFBK 1HKCA 1GPSA 3VQ5A 5AQHA 3TABA 1BISA 5AFUA 4KHUA 2FF3B 1QTMA 4FVUA 2Q97A 2YHWA 1EO1A 5KRSA 3ENBA 4F2SA 1U04A 2XY8A 3SUQA 4BR0A 4BY9C 3D0PA 1Z05A 4FJXA 4WFBL 1IJJA 3AVNA 4R79A 4IOAL 4C1NK 4E1NA 3BY5A 3M8RA 2OPQA 1OH6A 1K8KB 1QQMA 4CHOA 1TKZA 1EXQA 2ZJRL 4B3TK 1T44A 5ADXA 2Z1HA 1M1KO 1XWLA 4B1UB 4CEFA 3BDPA 2QWMA 4O5BA 4CK3A 4F3OA 3VQDA 3U9DA 1Q7YO 4DHYA 3FZMA 4IBNA 3DXKB 3K5NA 5AQNA 3OYMA 3KWIA 3C6AA 4CI6A 4DR2K 1SS6A 4KHPK 1RBVA 2HHHK 5CYQA 1YXQA 5IWAK 3TARA 1R59O 4B9UA 2KTQA 3AO2A 2E2OA 3C94A 1QQOA 3K2PA 4KHSA 1TGOA 3M1FA 1B9FA 3WXLA 1S72N 1UAXA 5AQSA 5AQLA 2KYQA 3CETA 2IIRA 1WAFA 4FJIA 3RSEB 3G71N 4DTPA 5J2MA 1RDBA 1RT4A 1A5XA 3AA5X 3OYEA 2W40A 3A5MC 4OJRA 3D2EA 5IT9O 1NMNA 1V4SA 4FJJA 1BCOA 1B92A 4OPJA 2ITGA 4JKBA 3AA2A 2ASCA 3O4QA 4CD3A 3SMSA 2N2RA 2SN3A 2E4LA 1NK7A 4BR5A 1DLOA 2KFNA 4CJTA 2VG7A 2HBMA 5LJWA 5JMVA 2VYPA 3DI6A 3ID8A 4QS9A 4KBOA 2ASOA 4ZHRA 5AQRA 4YHHK 1CXUA 4JI1K 3HXMA 1SKWA 1SNBA 4EIAA 3EZ5A 1NJXA 1FJGK 4RW7A 1CZAN 3DYAA 1L3SA 3ZSOA 1TK0A 4DV2K 1BL3A 4HCBA 3V6DA 2LR3A 1NMDA 3AV9A 2FLOA 1NJZA 3WQTA 1RTIA 3DXMA 4H5RA 5CR4A 3LPTA 4H0OA 3VENA 4FJ8A 4JI5K 2XY7A 4AB0A 4FJKA 2P9SB 3C6HA 4RTFD 4BVOA 1NK5A 2YBRC 5FPEA 2PFUA 4IZ9A 2Q0RA 4MDAA 3SMPA 1AHOA 4A59A 1IV0A 3PX0A 3RRGA 4OLAA 3AVCA 3CM5A 5AR0A 5I3UA 1NGIA 1WBDA 3NMUA 4KHNA 2HMIA 4FL9A 1EP4A 3H45C 3VQ7A 3I56N 3LDSA 1Z6RA 3BP8A 2QWOA 3OS1A 1NNEA 4K25A 1SAZA 4DU4A 1W7AA 4CGFA 4JK8A 4WFAL 4KB0A 3P31A 3V1RA 4YY3K 4HUEA 2IC3A 2ZGYA 4CZGA 1HNVA 1VRUA 2E2PA 2CGKA 2G8VA 3R1XA 3VPZA 5I42A 4AHUA 1ZC6A 2RF2A 4IEEA 2PBDA 3DWLA 3KWGA 2UUCK 2BE2A 1FK9A 4DTRA 4HUFA 5JVHL 1L3TA 5FPDA 3DJCA 4FJ7A 3CG7A 4C8MA 5AQUA 1GOAA 3SBGA 4IDHA 3VEOA 3PO4A 3ALYA 4E19A 1TUUA 2P9NA 3SBTA 1T05A 4IOCL 4FSVA 3KK7A 3QBWA 2HMPA 2CH6A 4YOUA 3VN5A 3KD1E 1NGHA 3C95A 2NY8X 1C1BA 2EX3A 3EKUA 3AVBA 4JKAA 3SQ0A 1F21A 1U4BA 4OKKA 5B8HA 2YKMA 1QVFM 2QWQA 1VSJA 3I0SA 1JCGA 1LCUA 2D0PA 4O0JA 4QS7A 3WT0A 1MDUB 3GDQA 3HI0A 2FSJA 2GV9A 3ZSVA 3OYGA 1VSKA 4FWQA 4BDZA 2D5RA 4CFAA 4C8KA 5A2QO 2HHQA 2HW3A 4E7LA 1LQIA 4CD1A 3AVJA 4IWVA 3KHWA 3KOXA 3P83D 1IBLK 4AHVA 3SUOA 3BF3A 4CJFA 2QK9A 4BVPA 2ZQBA 4I2QA 1QHAA 4RW8A 1WSIA 5JLFA 1S3XA 5BR9A 4KTQA 2IVPA 4FPAA 4JI2K 3SNNA 5BPMA 2HBJA 4B9MA 3UB5A 4BC4A 3MK6A 3SAFA 5LMUK 2IVNA 3TAMA 3NBPA 3MN6A 4JKCA 3KTQA 3F9MA 3O8MA 3TAFA 5BRHA 4KHWA 1ZYQA 3R3LA 4HHTA 3RMDA 2HNDA 1U6ZA 3MXIA 4QOZB 3O9SA 2VGMA 4C23A 4FJGA 3C7NA 3FFKB 4BRGA 3FFIA 3NAEA 3IRXA 1T0ZA 1JKHA 4LFCK 4V19S 1RT5A 1KSPA 3HP6A 3O9QA 4LSNA 2YV0X 1N5YA 4J2DA 4E7KA 4FJ9A 1A5VA 3CW4A 1VAZA 4O8UA 4KI6A 4BGAA 1U48A 5DMRA 1POIA 4DS5A 1VNAA 2LKBA 4ID1A 3E9LA 3KIOA 3LZJA 3H1VX 2UUBK 4OGCA 3NGZA 3P38A 1C6VA 5HP1A 3MN5A 3VQBA 5BR8K 5EVZA 1JXEA 3CMEN 1QQCA 1VSHA 3PX6A 1JLFA 4KREA 3HK2A 4FLUA 2D1KA 1KAXA 2FBXA 2FXUA 2W42A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1SN1 A;  1ZYW A;  3MCP A;  4DMN A;  3S3O A;  1WMT A;  3KOY A;  1Q81 O;  3EYZ A;  1D8Y A;  4C1N I;  5C42 A;  4K8Z A;  1FW6 A;  3NE6 A;  4FW2 A;  1N8R O;  4BR9 A;  3QIN A;  1U49 A;  3WNH A;  1JZB A;  1Q82 O;  5AJ3 K;  2JGU A;  2KGQ A;  3L56 A;  3K9J A;  3RTV A;  2GL1 A;  2LY5 A;  3GKU A;  2YNG A;  4EP4 A;  4E72 A;  4JEP A;  2NUB A;  3VQA A;  3S3M A;  1P00 A;  3SJH A;  1ATR A;  1LW2 A;  1JL2 A;  3ISN C;  4IG3 A;  4NXM K;  3SQ4 A;  1KRP A;  3SCX A;  4CJP A;  4ELT A;  4LFB K;  1HKC A;  1GPS A;  3VQ5 A;  5AQH A;  3TAB A;  1BIS A;  5AFU A;  4KHU A;  2FF3 B;  1QTM A;  4FVU A;  2Q97 A;  2YHW A;  1EO1 A;  5KRS A;  3ENB A;  4F2S A;  1U04 A;  2XY8 A;  3SUQ A;  4BR0 A;  4BY9 C;  3D0P A;  1Z05 A;  4FJX A;  4WFB L;  1IJJ A;  3AVN A;  4R79 A;  4IOA L;  4C1N K;  4E1N A;  3BY5 A;  3M8R A;  2OPQ A;  1OH6 A;  1K8K B;  1QQM A;  4CHO A;  1TKZ A;  1EXQ A;  2ZJR L;  4B3T K;  1T44 A;  5ADX A;  2Z1H A;  1M1K O;  1XWL A;  4B1U B;  4CEF A;  3BDP A;  2QWM A;  4O5B A;  4CK3 A;  4F3O A;  3VQD A;  3U9D A;  1Q7Y O;  4DHY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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