5AQRA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqrA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqrA04
4FOEA 1KAXA 3ULEA 5LY3A 4EAHD 2Q1NA 5AQTA 4BC5A 4H5TA 4I6MB 2FF6A 1HKBA 3LDNA 4QS7A 4BRNA 2GWJA 3D2FA 1GLLO 3UKUB 4FWRA 1GLFO 5JLFA 3QICA 4JHDA 5F1XA 1H1VA 4GNIA 5I9EB 2HF4A 4RCHA 3QFUA 4EHTA 3GG4A 3IMXA 3RSEA 2H3GX 3W0LA 4JAXA 3D2EB 4CZLA 4AM6A 3WQUA 4Z94A 3FZLA 2QWOA 2ASOA 3EZWA 5BR9A 5KPTA 2BTFA 3FZHA 1NM1A 3S41A 2YCHA 3VF2A 1DGKN 3QFPA 2ZGZA 5AQRA 4IO8A 2Q36A 4A62A 1SAZA 4CZHA 4K25A 2P9NB 3QB0A 3CJAA 1Q18A 2D4WA 3A5MC 2HOEA 3A0IX 4MLEA 4BQZA 1D4XA 5AQUA 3MN9A 4ISFA 5AQSA 3VEVA 3ENOA 1NGEA 2GWKA 4CJ7A 2QWPA 5BPMA 3JXUA 1NGBA 5BPNA 1WUAA 2GTDA 3CI5A 3O4WA 1YXQA 1NBWA 4FWSA 3H1QA 2VWBA 5BN9A 3WQTA 1BWFO 3CHWA 2I7NA 5B8HA 1X9JA 4FWKA 2IVOA 5AZJA 1RFQA 2CH6A 2HF3A 3CIPA 1E4GT 1NMDA 3EKSA 3VPZA 1RDWX 3VGKA 2PAVA 2YHXA 3TPQA 2P9PB 1HLUA 2IVNA 4B1UB 3C0BA 1JCGA 5KPRA 5CE3A 1IG8A 5EVZA 2P9LB 4JD2A 4BROA 3AAQA 3EL2A 3QMLA 3BF3A 2P9UB 5BN8A 5F2RA 2A41A 4BVOA 3LDLA 3SJHA 3HI0A 3ATVA 3CETA 4BR2A 5ELZA 2QW9A 3IUCA 2FSJA 1HX1A 5FPNA 2YI1A 3UKUA 2IIRA 4BC3A 3ZETB 4CZKA 2CGJA 2A42A 2PBDA 1TUUA 4IJNA 3FZKA 2Q0UA 3EN9A 1QZ6A 4BVPA 1R59O 4CBXA 3ENHA 3WXLA 1JCFA 3MCPA 3GDQA 4PKHA 4YDUC 5AQIA 3QBXA 2IVPA 2E2NA 4CD1A 2EWSA 3MDQA 4K41A 1RGIA 3VF6A 3VEZA 5AZIA 5BREA 4BGBA 5TKYA 2OANA 2VYPA 2FSKA 1C0FA 3SMPA 2P9KB 3FR0A 3H46O 3A5OC 4XEIA 4BGAA 1TYQA 4BRFA 3CJ9A 3ID8A 5AFUH 3UE5A 3WEEA 3KHYA 5E84A 4WYBA 1YUWA 4CI6A 3AAPA 3VEOA 3WXKA 1S3XA 4BR9A 1Z6RA 1OKJA 3HBTA 4FPBA 1NGJA 3CERA 3L6QA 4M63C 3BF1A 3GE1A 4B1YB 3C7NA 3L4IA 5AQHA 4FO0A 4ISGA 4WQ4C 2QWRA 5AQWA 2A3ZA 4QS9A 3ZX0A 3ZEUB 4H5WA 1XQSC 2CGLA 3MMVA 5E26A 3VF4A 4BRLA 4DHYA 4PL7A 3FZMA 1C0GA 4RTFD 4K42A 5JICA 2YJFA 1GLJO 1QQMA 5AQKA 5EY4A 4LC9B 2GUPA 2GEMA 2P9IB 2YHWA 3FFKB 2P9UA 3MN5A 3UKRB 4BRMA 2E1ZA 5AQNA 1U2VA 2V52B 3KZBA 5AR0A 1GLDG 1WOQA 3QDKA 3BEXA 4XH4A 1HPMA 3R8EA 3OHRA 2QWQA 2ASMA 4H0VB 5AQZA 2CGKA 2W41A 2P9SA 4BRHA 2NZTA 3FGUA 1NGCA 3DAWA 4HTLA 5FPDA 3R6MA 2A40A 4FWLA 4BR5A 3DXKB 4IJAA 4WQ4A 3CQXA 1GLEG 3DXMA 2HMPA 3LL3A 1LOTB 1U6ZA 4B1VA 1K8KB 4B1ZA 5F0XA 2D0PA 4M7XA 3L0QA 3LM9A 4CD3A 4PKIA 3ULEB 1BU6O 3ZX3A 5ADXA 5ADXH 4C23A 2QWLA 3VEWA 1E4FT 4XH1A 4BR7A 1ZXOA 4WQ5C 3A5LC 3IFRA 1YAGA 4H5VA 2ASPA 3TU5A 3D2FB 3AARA 1TUYA 1XUPO 2V51B 4FWPA 4O8KA 4L3QA 3BP8A 4JHDB 3FE1A 4BRPA 3DWLA 1X3NA 3HZ6A 4FWNA 4I6MA 4KBOA 3MN7A 1NGAA 3RSEB 3CQYA 2UYTA 3O1BA 4MO5A 3WXIA 2FXUA 2A5XA 1T6DA 1EQYA 3LDPA 2WUSA 1V4TA 1GLCG 2E20A 3VEXA 2W40A 4EHUA 3FLCO 5KQDA 3D7EO 1DKGD 1CZAN 4BRQA 3D2EA 1NGHA 1MWKA 2YJEA 3HM8A 4BRKA 2D0OA 4H0OA 4H0YB 1HJOA 4WQ5A 4XH5A 4RWTA 2Q2RA 4AM7A 3H3NO 2AA4A 2P9NA 3CJBA 4J8FA 4BR4A 4K43A 5LJVA 3P4IA 1G99A 3DJCA 4NO7A 2D1KA 1P8ZA 5KPZA 5AQXA 5AQGA 3QBWA 4BR0A 3HSCA 3AY9A 5EOYA 2F9TA 2ZGYA 4JNEA 1JCEA 3CJCA 3J8AA 5LJWA 5AZJB 1KAZA 1NGIA 2QXLA 5JLHA 2ZF5O 3U4LA 3H3OB 2FLOA 4MLHA 4HWIA 2NLXA 4PL8A 4BC2A 3H6EA 2CH5A 4H0PA 4YDUA 3GBTA 1QHAA 3WUHA 1NLVA 3U8XA 1GLBG 5FPEA 5EXWA 4JD2B 3SK3A 4QS8A 1J6ZA 3G25A 4H0XB 2P9PA 5BRHA 2E1YA 3JS6A 1SQKA 4GY2B 4H0TB 1Y64A 3UB5A 4BG8A 2E2OA 2P9LA 4EFHA 4Y0WA 5AQLA 2J4RA 3U9DA 4CZEA 4O5FA 1BG3A 2V7ZA 5AQVA 2A6AA 2GELA 2YHYA 4F9OA 1XC3A 2NRHA 4PKGA 5AQOA 3GL1A 1QQOA 1ZBSA 3VERA 3U9ZA 2QWNA 2KHOA 4IWVA 5JMVA 4JN4A 4FWMA 3ZETA 4BG9A 2DPNA 2FF3B 3O08A 3ATUA 2FSNA 2Q0RA 4CZGA 3A8YA 3IDHA 3VENA 3VGMA 5AQMA 5AZIB 3SMSA 5AQQA 3O80A 2E2QA 3I8BA 3VEYA 4FL9A 3VGLA 3O8MA 3WXJA 1BUPA 5AQFA 4H5RA 3GOIA 3HTVA 4IXCA 1TYQB 4H5NA 2E8AA 3WEEB 1YVNA 1BA0A 1ATRA 3M1FA 3MN6A 5AQJA 4DQ8A 4B9QA 5EX5A 5BRFA 2P9KA 2E2PA 4CBUA 1DEJA 3I33A 4BRIA 2VCPA 4DCHA 2ZWHA 5AQYA 4A61A 3C7NB 4BRGA 1ESVA 5BPLA 2BUPA 4FSVA 1IJJA 1BDGA 3EO3A 4IZ9A 2QM1A 3EKUA 1NGFA 1SZ2A 1T6CA 3B8AX 2ITMA 1NWKA 2Q97A 2QWMA 4BRDA 3H1VX 3O6WA 3BUZB 3FZFA 4NB4A 1GLAG 4M7YA 3ZEUA 1NGDA 3CJ7A 3W3DA 4A2BA 1LCUA 1MA9B 4FPAA 4CZMA 1U2VB 4EIAA 3LDOA 4BREA 3VOVA 3A5NC 4A2AA 4CBWA 3LDQA 1ZC6A 2I7PA 1MWMA 2F9WA 4H03B 2AP1A 2P9IA 1T44A 4BC4A 2P9SB 3WT0A 3UKRA 1X3MA 3O1WA 3VESA 1HKCA 4FOIA 1HUXA 4B1XB 1KXPA 1Z05A 3R9PA 1KAYA 3SLCA 3O5BA 4BRAA 5BRDA 1V4SA 4BRCA 4MO4A 2V7YA 3M6GA 3CJ1A 3KVGA 1BO5O 1QZ5A 4CZFA 1BOTO 3DXMB 1NGGA 4FWOA 3H45C 1HKGA 4FWQA 4E1JA 1ATSA 3M3ZA 1BA1A 2E88A 4DB3A 1ATNA 3ZX2A 4B1WB 1S22A 3LM2A 1MDUB 5KQ8A 3DXKA 3F9MA 3VETA 3MK6A 4BQLA 4CZJA 4CZIA 4ISEA 1K8KA 5AQPA 5FPMA 5AFUA 1QQNA 2Q31A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FOEA 5LY3A 4EAHD 2Q1NA 3KJVA 4I6MB 4QS7A 1LV5A 4A5AA 4CEZA 1NK7A 4DTUA 5C10A 3DOLA 4Z4FA 1GLFO 3QICA 3RMCA 4LF8K 5LMUK 1VK0A 1H1VA 2ETJA 5DM7L 4O4GA 1ICAA 3GG4A 3IMXA 2Z1JA 2G8HA 2HHTA 4PA1A 2ZJRL 4JI0K 3D2EB 4BWJA 3EZWA 2I5JA 2B4JA 4OO1J 2GMOA 2YCHA 3AVLA 1DGKN 2G8WA 5AQRA 1FXXA 2BGGA 2NRZA 4CQKA 4LH5A 4NYNA 4IO8A 3ZYYX 4DR7K 3OYKA 1KVAA 3VTHA 3AGRA 4E72A 1JKZA 1T7EA 4DTSA 1VQ6N 1D4XA 3SAGA 4MFBA 5KRSA 3MN9A 1BGXT 1NGEA 5CR4A 1F21A 4A57A 1WUAA 3O4WA 2D0CA 3CI5A 1YXQA 1NBWA 1Q82O 3H1QA 2VWBA 5HROA 3VN5A 3WQTA 3L2QA 3CHWA 1M1KO 2IAJA 4KHWA 1RNHA 5B8HA 4FWKA 3TR8A 3LP1A 1RFQA 2CH6A 4FM0A 1GOAA 3ZT2A 1E4GT 3SQ1A 2XO7A 3HSTB 1RDWX 2XY8A 3TPQA 3J7ZO 1S1TA 3OS1A 4ILGB 1RILA 4CJRA 1FH3A 4JD2A 3EL2A 3NH0A 5BN8A 3IG1A 5F2RA 2A41A 3SJHA 1T7AA 2KBJA 2UUCK 3SF4D 5ELZA 4JV5K 3IUCA 2FSJA 4NLCA 3UKUA 3DRPA 4BC3A 5M1OA 3ZETB 1C55A 4KHQA 2A42A 1TUUA 4IJNA 3EN9A 3NH1A 4CBXA 4Z4IA 1KCFA 5DK5A 4E7IA 4YDUC 5AQIA 3QBXA 1YJNN 1EWQA 4XJXA 2VWKA 3VMFB 5J2PA 5AZIA 4CHPA 3AVCA 4DU4A 5FRNA 4Z4GA 4FJMA 4HUEA 1XRSB 5M1QA 4K8XA 3DI6A 3FR0A 4DMNA 1Q9YA 3HPOA 3EEQA 4YY3K 4BGAA 3UE5A 4DFKA 4E7JA 4WYBA 1YUWA 4JK9A 5FDLA 3WXKA 1ZYVA 4BR9A 1CLQA 1OKJA 2G8KA 4HCBA 4FPBA 1AYJA 4M63C 1S6PA 3AA5X 3GE1A 4ID1A 3VTIA 2WTUA 2PY5A 1RT4A 4FO0A 4IDKA 1OH6A 4DTRA 1Z26A 1HRHA 3OJUA 2QWRA 3TSQA 2NRTA 2A3ZA 3ZX0A 1RT1A 4K8ZA 5E26A 4BRLA 4BDYA 1WT7A 3FZMA 3L2UA 4LF6K 1QQMA 1UAXA 3DYAA 4CK3A 3MN5A 2E1ZA 5AQNA 1WAJA 2V52B 3JSMA 1VQ8N 3CXCM 4DSFA 4Y1DA 4RG8A 3BEXA 3CMAN 2F8SA 4JKBA 4IOXA 2HB5A 4H0VB 5HBMA 2Q3SA 2CGKA 2OZSA 3NFAA 4DG1A 3SAHA 1TVRA 2NZTA 4CJTA 5HRNA 4FJJA 3ZT1A 2WBNA 4DUZK 4CIFA 3DAWA 4BR5A 4N56A 1CXUA 4DTOA 4WQ4A 1CZBA 3CQXA 3OYIA 1MR4A 3CCQN 4JI7K 3KD1E 2W00A 3LL3A 2UUBK 3THXB 2RHKA 2VQEK 2LY6A 3L0QA 3KHWA 3AVHA 3G4SN 1VNBA 3D6RA 4PKIA 3ULEB 3VQEA 4HHTA 3VEWA 3F2KA 3IAYA 4F8RA 3TU5A 4BE0A 3AA2A 1JLQA 2W6LA 3F9KA 4L3QA 4JHDB 4BRPA 1CHZA 4E3SA 1HNZK 3HOTA 1ASWA 4OKEA 4KBOA 1K9MO 4FJXA 3SUQA 3CQYA 1O13A 2A5XA 1EQYA 1G15A 4OVLA 4JI2K 1UGLA 2E20A 2YNFA 3VEXA 3CF5L 3FLCO 1SL0A 4DV0K 1DKGD 1CZAN 2ATQA 2E4LA 1FKPA 4BRKA 4CEDA 2ZM6K 4H0YB 4RW7A 2LT8A 4JI5K 2AJQA 4XH5A 4KH4A 4GV3A 1S5JA 5KK4A 3OY9A 1BIUA 4BR4A 5T7BA 1YT3A 3NF8A 5GINA 2OTJN 4K43A 3MXIA 4NO7A 4I7FA 4DV7K 3AVKA 1L3TA 1TGOA 5AQXA 5AQGA 3M5RA 4BR0A 3KK7A 3BZKA 3AY9A 5EOYA 1DQ7A 1EP4A 1JCEA 2NRXA 3V6DA 3CJCA 3NF7A 4RW4A 1KLMA 5CYMA 2QXLA 4FJLA 2ZF5O 3MWTA 4MLHA 4DTNA 1T0ZA 1TAUA 3TAGA 3KD5E 2NLXA 3H08A 3H6EA 4B08A 3OYCA 3SBTA 4E1MA 1WBDA 1QHAA 5CYQA 1NK6A 3SK3A 3L2WA 3NMUA 1ZUTA 2P9PA 4IEIA 2Z1IA 2KGQA 1SQKA 2E6MA 4JI1K 4BEBA 3T1AA 2IGIA 4EP5A 3MEGA 3I55N 3KK1A 4IBNA 3CG7A 3N4QA 1BG3A 2V7ZA 3C65A 3KTQA 2HBMA 4F9OA 1NOYA 5GIPA 2NRHA 3CCUN 1HQUA 1U04A 4N76A 1RT3A 1ZBSA 3VERA 2PFUA 2ZJPL 3G6EN 2MZ0A 2FSNA 1YJ9N 1IV0A 3M8RA 3TAPA 3IDHA 1IKWA 4F2RA 3SMSA 1C1AA 3O80A 2E2QA 2ZD1A 3I8BA 1GOCA 2A7TA 3ZLJA 3N4PA 4BDPA 1BUPA 4H5NA 1BA0A 4QOZB 4M3RA 4I2QA 3K5NA 4YFUA 5EX5A 1TL3A 5BRFA 4M45A 1L3SA 4CBUA 2KYQA 4M3UA 3KLEA 3O4NA 4WE1A 3V9WA 4LSLA 5JENA 3ZSYA 2HHUA 2VCPA 3IS9A 4DCHA 1HYVA 1OH5A 3ZCMA 2O8EA 4OPJA 1I94K 4YOWA 4CJUA 2HNDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FOE A;  5LY3 A;  4EAH D;  2Q1N A;  3KJV A;  4I6M B;  4QS7 A;  1LV5 A;  4A5A A;  4CEZ A;  1NK7 A;  4DTU A;  5C10 A;  3DOL A;  4Z4F A;  1GLF O;  3QIC A;  3RMC A;  4LF8 K;  5LMU K;  1VK0 A;  1H1V A;  2ETJ A;  5DM7 L;  4O4G A;  1ICA A;  3GG4 A;  3IMX A;  2Z1J A;  2G8H A;  2HHT A;  4PA1 A;  2ZJR L;  4JI0 K;  3D2E B;  4BWJ A;  3EZW A;  2I5J A;  2B4J A;  4OO1 J;  2GMO A;  2YCH A;  3AVL A;  1DGK N;  2G8W A;  5AQR A;  1FXX A;  2BGG A;  2NRZ A;  4CQK A;  4LH5 A;  4NYN A;  4IO8 A;  3ZYY X;  4DR7 K;  3OYK A;  1KVA A;  3VTH A;  3AGR A;  4E72 A;  1JKZ A;  1T7E A;  4DTS A;  1VQ6 N;  1D4X A;  3SAG A;  4MFB A;  5KRS A;  3MN9 A;  1BGX T;  1NGE A;  5CR4 A;  1F21 A;  4A57 A;  1WUA A;  3O4W A;  2D0C A;  3CI5 A;  1YXQ A;  1NBW A;  1Q82 O;  3H1Q A;  2VWB A;  5HRO A;  3VN5 A;  3WQT A;  3L2Q A;  3CHW A;  1M1K O;  2IAJ A;  4KHW A;  1RNH A;  5B8H A;  4FWK A;  3TR8 A;  3LP1 A;  1RFQ A;  2CH6 A;  4FM0 A;  1GOA A;  3ZT2 A;  1E4G T;  3SQ1 A;  2XO7 A;  3HST B;  1RDW X;  2XY8 A;  3TPQ A;  3J7Z O;  1S1T A;  3OS1 A;  4ILG B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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