5AQSA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqsA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqsA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqsA04
4H0PA 4BC4A 4H0XB 4BRGA 2W40A 3VEYA 4BRNA 5BRFA 5AQOA 3MN6A 2CH6A 3CERA 4I6MA 5BPNA 3CJ1A 3H3NO 2A40A 1JCFA 2QWPA 2ZF5O 1ZXOA 3VEOA 5AQJA 1NGDA 1TUUA 2ASMA 3MMVA 2V52B 3LDPA 3A5NC 1IJJA 3VF4A 4EAHD 4QS8A 4FWOA 4CZGA 1LCUA 3TPQA 3DWLA 3CQXA 5E84A 5I9EB 3M1FA 4BRAA 3ID8A 4CZHA 4ISEA 4K42A 4BQLA 4XH1A 2YHYA 5AR0A 1XC3A 4B1WB 4FWKA 2P9KA 4Z94A 3IUCA 4YDUA 2P9NA 4BR9A 5BREA 4B9QA 1NGCA 2HF4A 4A2AA 3FGUA 5ADXH 4J8FA 1P8ZA 1XQSC 3QMLA 2H3GX 1NGAA 4BG8A 2HF3A 2EWSA 1Z6RA 3ZETA 1T6DA 2FLOA 2ZWHA 1DKGD 1BOTO 3ZEUB 3KZBA 2Q31A 3LL3A 1TUYA 2DPNA 2ITMA 3IDHA 4DB3A 3A5OC 4WQ4C 5FPDA 3VERA 2E1ZA 4WQ5C 5FPMA 1MWMA 4B1ZA 2E2QA 3HSCA 3H1VX 4RTFD 2GWJA 4H5TA 3EKSA 4BROA 1WUAA 5BN9A 1QHAA 2ASOA 3R8EA 3A5MC 4IZ9A 4CZIA 3AAQA 5EX5A 4O8KA 1HPMA 1S22A 4GNIA 3U9DA 3UB5A 2P9PA 4QS7A 4EHUA 1YVNA 3C0BA 1J6ZA 1R59O 1ATRA 3VEZA 3CJBA 1U2VB 1NGHA 5AQRA 5BPLA 3U9ZA 1RFQA 4CD3A 2PBDA 5AQQA 3GG4A 2GELA 4CZLA 4IO8A 4MLHA 4CD1A 4XH5A 4BRCA 4GY2B 3CJCA 3VETA 3VF6A 1NGFA 4WQ4A 4Y0WA 4WQ5A 2FSKA 3WQTA 3O08A 2GWKA 5AZIA 3TU5A 3VESA 1BDGA 2A42A 4BR2A 1DGKN 1ZBSA 2CGJA 3IFRA 1GLCG 1GLFO 3H3OB 5AZIB 5AQTA 2FSNA 3D7EO 5B8HA 3R6MA 4IJAA 4BRLA 5AQXA 1Y64A 3W0LA 4H5WA 4JHDA 5EOYA 5CE3A 3WQUA 4BRPA 3DXKB 3AARA 3MCPA 4MO4A 4C23A 4BGAA 4H0YB 1BU6O 5FPNA 3FZKA 1S3XA 1BG3A 1GLLO 3MN5A 2Q1NA 3CI5A 1Z05A 3GE1A 3MN7A 3WXJA 3QBXA 2V7YA 2GUPA 3MN9A 4H03B 3WXIA 1ZC6A 3OHRA 3QFUA 1QQMA 5BPMA 4BGBA 3VGMA 2V51B 3L4IA 3SLCA 5AQIA 1TYQA 2BUPA 3VEWA 3A8YA 3ZX0A 4H5NA 3ENOA 3H45C 4FOIA 3HBTA 4RWTA 3LDNA 4I6MB 3BF1A 4IXCA 1TYQB 1NLVA 2Q2RA 1GLDG 2D0PA 4F9OA 1DEJA 5BRDA 3SMSA 3AAPA 1NGJA 3D2EA 4K25A 2A41A 4BRHA 3D2FA 5KPZA 4WYBA 1BWFO 2E8AA 1JCEA 1T6CA 3EZWA 3ZX3A 3WT0A 5AQNA 3KHYA 3UKRA 1E4GT 5AQZA 2A3ZA 4B1XB 3S41A 3J8AA 2P9KB 4IWVA 2YJEA 2P9NB 4CJ7A 2I7PA 5BN8A 3U4LA 3UKRB 2CGLA 2FF3B 1NGBA 4NO7A 3ZETB 1HX1A 4HTLA 3MDQA 3H46O 4BR7A 2OANA 3QDKA 2P9LA 3VEVA 4FWSA 3GBTA 1NM1A 4FWRA 4A62A 4ISFA 1HKBA 2E2PA 4BREA 3C7NA 2E1YA 3M6GA 4CZMA 5AQUA 1HKCA 2FXUA 1E4FT 1K8KA 1NBWA 3VGKA 4IJNA 3VGLA 4H0VB 2WUSA 3CJ9A 2E20A 2VCPA 2IVNA 3C7NB 3P4IA 4FWMA 1SZ2A 4CI6A 2J4RA 3VF2A 4DCHA 3EN9A 3CIPA 3MK6A 4JNEA 3O6WA 5BRHA 3ENHA 3IMXA 4HWIA 1HJOA 4PL8A 1BUPA 2P9PB 1BO5O 2NZTA 5EXWA 4DQ8A 4A61A 4EHTA 5KPTA 1OKJA 3GDQA 3DXMA 3I8BA 5AFUA 3A5LC 2YCHA 2D1KA 2Q36A 1NGGA 5LJVA 2QW9A 2AP1A 4BRIA 2V7ZA 5F2RA 3VENA 5EVZA 2QWMA 3JXUA 3M3ZA 5ADXA 3WXKA 5KPRA 2QWQA 4XEIA 1QQOA 3CQYA 1ATSA 2YJFA 2GEMA 1YXQA 3AY9A 2BTFA 4CZEA 4DHYA 4PKHA 2E88A 3BEXA 2QWNA 3WXLA 3WEEA 3CJ7A 3QICA 2IVOA 4ISGA 3UE5A 2GTDA 4B1VA 2Q97A 3LDLA 5AQFA 5F0XA 1KAXA 3O1BA 2YHWA 3QBWA 3DJCA 4JHDB 3GL1A 5AQWA 1IG8A 3WEEB 1KAYA 4E1JA 1V4TA 3WUHA 1YUWA 1Q18A 4AM6A 1HLUA 2YI1A 3UKUA 3HTVA 1SAZA 2QM1A 2ZGYA 2UYTA 1GLEG 1GLBG 3JS6A 4FPAA 2FSJA 2YHXA 2VWBA 1C0GA 2CGKA 5LJWA 3VEXA 3VOVA 1KXPA 1WOQA 3FZMA 3FLCO 3RSEA 3UKUB 1CZAN 3B8AX 3ULEA 4BC2A 1X3MA 5AQSA 3LDQA 4JN4A 3LDOA 3HM8A 5AQHA 4JD2A 1RDWX 4BQZA 4BVPA 1JCGA 4FWPA 3CETA 4H0TB 5ELZA 3HZ6A 2QWRA 3RSEB 4FPBA 5TKYA 1C0FA 3HI0A 1H1VA 5KQ8A 1EQYA 3ULEB 3H1QA 3QFPA 2ZGZA 3CJAA 4M7XA 4MO5A 2E2OA 3O1WA 1RGIA 3O5BA 2QWLA 2CH5A 4RCHA 4KBOA 4JD2B 2HOEA 4FOEA 3O80A 4FWLA 2NRHA 3DAWA 4K43A 3KVGA 2P9SA 5BR9A 3D2EB 5JLFA 1XUPO 2AA4A 5AFUH 3F9MA 3SMPA 3U8XA 2F9TA 3D2FB 4EIAA 5JICA 4FWQA 2VYPA 4BR0A 5E26A 5FPEA 5AQVA 4PL7A 2HMPA 4QS9A 2P9SB 1SQKA 2P9UA 3ZEUA 5AQGA 1ESVA 3FE1A 4H5RA 5AQYA 1X3NA 5F1XA 4BC5A 4B1YB 3O8MA 5LY3A 3SK3A 4CZFA 3G25A 2P9UB 2I7NA 2P9LB 3H6EA 4A2BA 3FZFA 4BRDA 1HKGA 3L6QA 2E2NA 2Q0UA 5AZJA 1BA0A 5JLHA 1MA9B 2D4WA 4BRQA 4B1UB 2ASPA 4BR4A 1K8KB 3FZLA 4FL9A 1GLAG 4EFHA 1U6ZA 5JMVA 4BRFA 4H0OA 4JAXA 1NGIA 2FF6A 4M63C 5AZJB 1U2VA 1BA1A 4M7YA 4K41A 4CBUA 1NMDA 4FO0A 3QB0A 3O4WA 4BVOA 2F9WA 1G99A 4MLEA 4NB4A 5AQMA 3CHWA 5AQLA 1KAZA 1T44A 3EKUA 3DXMB 2W41A 3LM9A 2A6AA 4CZKA 4O5FA 1GLJO 2KHOA 1LOTB 2A5XA 3W3DA 5EY4A 2QWOA 2PAVA 4BG9A 1ATNA 2NLXA 4PKIA 4CBWA 1QQNA 3I33A 5KQDA 1MDUB 4BRMA 4CZJA 4FWNA 3EL2A 4BC3A 4LC9B 4XH4A 4BR5A 5AQKA 1NGEA 3DXKA 5AQPA 2P9IA 3FFKB 3ATUA 3BP8A 3GOIA 1D4XA 1QZ5A 3BF3A 3SJHA 2Q0RA 1NWKA 2IVPA 4L3QA 4PKGA 1X9JA 2D0OA 1MWKA 4BRKA 1QZ6A 2P9IB 3L0QA 4AM7A 4YDUC 1V4SA 3A0IX 3ZX2A 3EO3A 2QXLA 3FZHA 4FSVA 3LM2A 4CBXA 3R9PA 1YAGA 3VPZA 3FR0A 1HUXA 3ATVA 3BUZB 4H5VA 2IIRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HQEA 4FLZA 5AQOA 2CH6A 1RBTA 4I6MA 3H3NO 2RE2A 3EY1A 4LF9K 2LJ7A 4B3RK 3VF4A 1LCUA 3AVBA 3TPQA 2W42A 4BDPA 3CQXA 1L4VA 3M1FA 2EHGA 3DLGA 4CZHA 4B9TA 4K42A 4BQLA 3KLGA 1WAFA 4B1WB 4JKEA 2A1SA 4A2AA 1ILYA 1SS6A 4J8FA 2QA4N 1OH8A 1WSFA 2HNZA 3ZETA 4CJ4A 4ZHRA 2LR3A 3O3HA 1QVFM 3ZSXA 3OYHA 5HRRA 1VSFA 3IDHA 2E1ZA 2B5JA 5FPMA 4WQ5C 2E2QA 4KH6A 2OPSA 3ZT4A 3CCLN 1WUAA 2VY6A 1QHAA 5BR8K 2ASOA 1SN4A 4IZ9A 4B8CA 3AAQA 2OTJN 4LH5A 4JKHA 4BE2A 4FJJA 1SL2A 3U9DA 1REVA 2P9PA 4QS7A 1JJ2M 1NK6A 2O8DA 4FLXA 3DM2A 1R59O 1ATRA 5AQRA 3U9ZA 5HRNA 3TTFA 4JKGA 4M3UA 2OPRA 4OVLA 2OA8A 2ZD1A 1DLOA 4I9LA 4MLHA 4BRCA 5HRPA 3VETA 3VF6A 4GV9A 5IWAK 1ZBIA 2F7TA 1QSSA 3BY5A 2ATBA 2FSKA 4FJ7A 3O08A 2XY6A 3ISNC 2XHBA 4KHUA 1WLJA 3DI6A 3TR8A 3VESA 1BDGA 3KIOA 3ZYYX 4DU3A 1N34K 1WWNA 5CY0A 5CY4A 1DGKN 4DTJA 1WNSA 4DLEA 3P31A 2D0CA 4OGCA 1RCHA 4NLCA 4DR6K 1ZU3A 2FSNA 4FJXA 2GV9A 2G8VA 5C25A 3O4QA 2OPQA 3BGRA 4LF6K 3AARA 4MO4A 2KBJA 3AO2A 3SAGA 4BGAA 2E0HA 2O8BB 1P00A 3MEEA 3FZKA 1HYSA 1BG3A 1GLLO 4L8RB 1Q81O 3C6TA 1GPSA 1Z05A 3GE1A 4HHFA 3PX0A 3KLHA 4CEDA 1L3TA 1XNRK 3SJJA 4AEIA 3OHRA 3MWTA 4BGBA 3KP1A 1HRHA 3VGMA 1NRBA 4CFBA 3L8BA 3OBYA 5AQIA 4Y1DA 3KC6A 1LQHA 1JLFA 3VQ5A 3U6FA 2WTUA 3TAGA 3OYDA 2W00A 1RDUA 1KTQA 2YIOA 1MYNA 1FW6A 4FJNA 4I6MB 3NGZA 4CJEA 4IXCA 4CQKA 1GLDG 2O8EB 2HHUA 3LP3A 1X1PA 3K5NA 1RTDA 4F2SA 3TAPA 4B9UA 3DYAA 3OYLA 4IG0A 1ZVEA 3TSUA 4A5BA 3O3FA 3LDSA 4BRHA 3RWUA 1KLNA 3DLKA 3VA0A 3I0RA 1SUQA 3EZWA 4C8LA 2A3ZA 3SI6A 3HP6A 4M3ZA 2OYQA 4JKAA 2DY4A 3OYCA 1YJ9N 4BECA 2YJEA 5M1NA 4DTUA 4BWMA 4DQQA 3DOLA 1BIUA 4CGJA 1NK4A 4DR3K 4JI4K 3UKRB 3NH0A 2HHVA 2KZZA 3ZETB 3OBWA 1HX1A 4HTLA 3OYFA 3NF8A 2FBXA 3BK3C 2IOCA 1NM1A 4FWRA 1LAWA 1S9EA 4CF0A 1DJTA 1WSIA 2E2PA 2VGMA 4BREA 1FKOA 1HKCA 3ALYA 1E4FT 1YI2N 1NBWA 3CCJN 3R1XA 3DLHA 2WUSA 3ZLJA 4AHVA 3OYIA 2E20A 2HBJA 1VSEA 4LSLA 4KFBA 3C7NB 3P4IA 1SZ2A 2KPYA 3OW2M 1Q86O 3T7ZA 4CF9A 4JNEA 1NE5A 5HP1A 2UXCK 4W5RA 3L56A 2P9PB 5KRTA 2XY7A 5EXWA 2FBYA 4A61A 4MDAA 4EHTA 4CGHA 3VQBA 1M1KO 1KC8O 3G10A 5FLXO 3RMCA 4DV4K 3KOWA 4FJ9A 1EX4A 2YCHA 1EO1A 1NGGA 2JWKA 3F5TA 2AP1A 3D6RA 1YITN 3VENA 3THXA 1VQ8N 1SEGA 1UA1A 4DQPA 1IV0A 2FBTA 3M3ZA 2UUBK 5ADXA 3CQ8A 3L2WA 4M3XA 1TK0A 2YJFA 2GEMA 1YXQA 4CZEA 4PKHA 4AHCA 3BEXA 3KOZA 3WEEA 4E89A 2GL1A 1BI4B 4EP4A 1X9WA 1KCFA 1ZYVA 4DKWA 5FRNA 3V9WA 2WOMA 3TI0A 5F0XA 4W5TA 4ELTA 5MLCQ 4KHPK 1IG8A 1KAYA 4DR1K 1NOYA 2NUBA 3T1HK 4AM6A 1HLUA 4YFUA 4X65K 1SAZA 2ZGYA 1RT5A 2D0AA 3JS6A 1BK8A 4DLGA 2CGKA 1SL0A 4ELUA 3AO3A 3FZMA 1NG9A 3UKUB 3B8AX 3EEQA 1S1WA 4M42A 4CW7B 2JWLA 5AQSA 3P5JA 1UAXA 3LDQA 1BGXT 3TABA 4H0TB 3HZ6A 4XJXA 3RSEB 4FPBA 2RN2A 3SV3A 3HI0A 4KV8A 5KQ8A 4F3TA 3NHGA 1A5XA 4W5NA 1HJRA 3C6HA 3VQAA 3VQ9A 3O1WA 1RGIA 4V19S 1NKCA 2QWLA 4RW7A 4DU4A 1EWQA 5J2QA 2D56A 4FWLA 3J81O 3CYMA 4K43A 3KVGA 3ZSZA 5BR9A 2WFBA 5GINA 2BANA 3NVKA 3SMPA 3TTCA 4OLBA 3PY8A 2ZQBA 4JI6K 3CC4N 3ZEUA 2KJAA 1NMNA 4H8KA 4DR4K 1X3NA 2UXDK 1LW2A 3LZJA 1VQ6N 2O4GA 2NY8X 1WAJA 2P9UB 1VQ5N 4O4GA 1CZ9A 2E3GA 1KFDA 4B9MA 3FZFA 1FXXA 1ZUTA 1T3VA 3E01A 4OGEA 1HNZK 2D4WA 3I8DA 4KAZA 4BR4A 3QEIA 1G15A 4M45A 1GLAG 4FM2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HQE A;  4FLZ A;  5AQO A;  2CH6 A;  1RBT A;  4I6M A;  3H3N O;  2RE2 A;  3EY1 A;  4LF9 K;  2LJ7 A;  4B3R K;  3VF4 A;  1LCU A;  3AVB A;  3TPQ A;  2W42 A;  4BDP A;  3CQX A;  1L4V A;  3M1F A;  2EHG A;  3DLG A;  4CZH A;  4B9T A;  4K42 A;  4BQL A;  3KLG A;  1WAF A;  4B1W B;  4JKE A;  2A1S A;  4A2A A;  1ILY A;  1SS6 A;  4J8F A;  2QA4 N;  1OH8 A;  1WSF A;  2HNZ A;  3ZET A;  4CJ4 A;  4ZHR A;  2LR3 A;  3O3H A;  1QVF M;  3ZSX A;  3OYH A;  5HRR A;  1VSF A;  3IDH A;  2E1Z A;  2B5J A;  5FPM A;  4WQ5 C;  2E2Q A;  4KH6 A;  2OPS A;  3ZT4 A;  3CCL N;  1WUA A;  2VY6 A;  1QHA A;  5BR8 K;  2ASO A;  1SN4 A;  4IZ9 A;  4B8C A;  3AAQ A;  2OTJ N;  4LH5 A;  4JKH A;  4BE2 A;  4FJJ A;  1SL2 A;  3U9D A;  1REV A;  2P9P A;  4QS7 A;  1JJ2 M;  1NK6 A;  2O8D A;  4FLX A;  3DM2 A;  1R59 O;  1ATR A;  5AQR A;  3U9Z A;  5HRN A;  3TTF A;  4JKG A;  4M3U A;  2OPR A;  4OVL A;  2OA8 A;  2ZD1 A;  1DLO A;  4I9L A;  4MLH A;  4BRC A;  5HRP A;  3VET A;  3VF6 A;  4GV9 A;  5IWA K;  1ZBI A;  2F7T A;  1QSS A;  3BY5 A;  2ATB A;  2FSK A;  4FJ7 A; 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