5AQTA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqtA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqtA04
4DCHA 2GWKA 5AQZA 4EHUA 5ADXH 3C0BA 4H03B 4PL7A 5AQMA 5FPNA 4CZGA 3KHYA 4AM7A 5KQ8A 1ZC6A 2VYPA 3CJCA 5KPRA 4WQ4A 2BUPA 5BPMA 3KZBA 2E8AA 3ENHA 5AQKA 2F9TA 4XEIA 3VEVA 4BRCA 4FWOA 5AQNA 3KVGA 3VGKA 3W0LA 1KXPA 4F9OA 3A8YA 1BU6O 4PKHA 4CI6A 5ADXA 3O1BA 3UKUA 5JMVA 1HX1A 2P9KB 1LOTB 4FWKA 1NGBA 3ULEB 2QWMA 2OANA 1NBWA 4FPAA 3M1FA 4CD3A 1T44A 3ZEUB 1DEJA 1U6ZA 5LJVA 4LC9B 3GE1A 1NGEA 3GOIA 5AQVA 1T6CA 3HI0A 1IG8A 5EX5A 4JD2B 2A42A 3VESA 4B1WB 4CBWA 3EL2A 5EXWA 3FZMA 4BVPA 2HMPA 3FZKA 4IJAA 3QFUA 3AY9A 4CZFA 4K25A 4H5WA 4PL8A 4QS9A 3OHRA 4DQ8A 5AQPA 2P9PA 3LDOA 1V4SA 2NZTA 4BRAA 2FF6A 4QS8A 1YXQA 3A5MC 4H0TB 3SMPA 3QICA 1ZBSA 1QZ6A 3RSEA 3FE1A 1NWKA 4Y0WA 4BR5A 4B1UB 2FSKA 3I33A 3CI5A 4I6MA 4ISEA 4PKIA 4FWRA 3WEEA 3HTVA 4H5TA 1GLDG 4NO7A 1YVNA 3O6WA 3VEYA 4BRKA 3UE5A 1QQMA 4H0OA 2YI1A 3VGMA 4O5FA 4BRMA 2BTFA 2ZGZA 1IJJA 5EVZA 5LY3A 2W40A 1H1VA 5AZJB 1TYQA 4IO8A 2PAVA 1KAZA 2P9IA 2P9LA 3MK6A 3CETA 3SK3A 3BF1A 2CH6A 3LDNA 3FGUA 5EOYA 1V4TA 4CBXA 3D2FA 1E4GT 2NRHA 3M6GA 1JCEA 3UKUB 3ATUA 2FSJA 4BC4A 4PKGA 3U4LA 4BQLA 3D2EA 4FSVA 1BDGA 4BC2A 3QDKA 1MWKA 1GLJO 3L6QA 3VEWA 1Y64A 4FL9A 4CZMA 3H46O 2KHOA 3A5OC 3O80A 4H0VB 4BVOA 5AFUH 4BGBA 4QS7A 3A5LC 2QWPA 4FOEA 3QB0A 4H0YB 4BREA 3C7NB 1Q18A 3P4IA 2V52B 4H5RA 4MLEA 4DHYA 4FWNA 2D0OA 1T6DA 1NGCA 3UB5A 3BEXA 4GNIA 3LM9A 3TU5A 2P9SA 2F9WA 3L0QA 5BPLA 1RDWX 3J8AA 3U9DA 3LM2A 2GUPA 2QW9A 1JCFA 1HKBA 3IDHA 3WQTA 3CQXA 3B8AX 3WXIA 3RSEB 4IJNA 5AQIA 5CE3A 5JLFA 1DKGD 1NGDA 5AQYA 1NM1A 4YDUC 2AA4A 5ELZA 4NB4A 4B1VA 3GDQA 1NLVA 4FWPA 1QHAA 4IWVA 2QWRA 5FPEA 3A0IX 2QWOA 3EKUA 5BR9A 3GL1A 3S41A 3MCPA 3MN6A 4H0XB 4BGAA 4K43A 1XQSC 5F2RA 3HSCA 1C0GA 3R9PA 3QFPA 4JHDB 4EFHA 3VF2A 1NGFA 4A61A 3DXKA 2D0PA 4WQ5C 2E1YA 5AQGA 3F9MA 3AAPA 1ESVA 4BQZA 5AQFA 1HPMA 2QWLA 5EY4A 3FFKB 5AZIA 3R8EA 3D2FB 1QZ5A 1HKGA 2FXUA 2VCPA 4BRHA 3WXKA 4RWTA 1CZAN 2ZWHA 3CQYA 4ISFA 4MO4A 3CHWA 1NGGA 1E4FT 3FZHA 1WUAA 2A5XA 4IXCA 1GLCG 3DWLA 1MDUB 3UKRA 3ZETB 2WUSA 2A3ZA 2GWJA 2E88A 2P9UB 3LDQA 3VETA 1TUUA 5AQSA 4HTLA 1Z6RA 1ATRA 2ZGYA 3QMLA 1SZ2A 4L3QA 3BP8A 4BG8A 4EIAA 2YHYA 5BN9A 4M7XA 4IZ9A 2YHXA 2Q0RA 4BRFA 1SQKA 2P9SB 3DXMA 4DB3A 5TKYA 5KPZA 3JXUA 4FWLA 4EHTA 3D7EO 2NLXA 3QBXA 2A41A 4M7YA 1WOQA 1GLEG 3HM8A 4K42A 4BRLA 3H3NO 4BR0A 2D1KA 3WXLA 4FWMA 1R59O 2QWQA 3CIPA 3O8MA 5AQWA 2CGJA 2PBDA 3TPQA 4RTFD 5AQUA 2ASPA 5FPDA 2E2PA 2Q97A 4M63C 3ENOA 3O1WA 4AM6A 5AQQA 4B1ZA 2P9KA 4A2AA 3H6EA 2E2OA 3ULEA 4CZJA 1YUWA 4BROA 1S22A 3ZEUA 2FSNA 4A2BA 5AQLA 1MWMA 1QQOA 3CJ9A 5AZIB 2Q1NA 4JD2A 5KPTA 2V7ZA 2A40A 2I7PA 3VEOA 1X3MA 4BR7A 3VERA 3O4WA 4B1XB 5B8HA 5AQRA 4Z94A 4YDUA 3VOVA 3M3ZA 2P9PB 5AFUA 3H1QA 1QQNA 2E1ZA 5BRFA 2IVOA 1HUXA 4C23A 3IFRA 3EKSA 4WYBA 2Q31A 3H45C 3IMXA 3O5BA 2VWBA 2AP1A 4E1JA 1GLBG 4CZIA 3ATVA 2HF4A 4H5NA 5JICA 4O8KA 4I6MB 2IVNA 4FWSA 3WEEB 4BRPA 5FPMA 4WQ5A 1HLUA 1OKJA 2ITMA 1LCUA 5JLHA 1DGKN 2V51B 1BG3A 3VF4A 4XH4A 1HJOA 3VF6A 5BRHA 3ID8A 3W3DA 2ZF5O 3ZX0A 1KAYA 3U9ZA 1YAGA 3WXJA 4CJ7A 3LDPA 3DJCA 3VENA 1NGIA 5AZJA 1TYQB 3EO3A 2P9NA 4A62A 2P9IB 2P9LB 3L4IA 1SAZA 2E20A 4B1YB 1MA9B 1ZXOA 3IUCA 1S3XA 1RGIA 2I7NA 3CJBA 2IIRA 5AQTA 1GLLO 3QBWA 2DPNA 2Q0UA 2E2QA 4H0PA 3D2EB 4WQ4C 1KAXA 1NGHA 2W41A 2YJEA 4FOIA 3CJ7A 2CH5A 5F0XA 4KBOA 4CZEA 1NGJA 3FLCO 1BUPA 5AQHA 3I8BA 4BC3A 1P8ZA 3VGLA 4RCHA 4HWIA 4FO0A 4JN4A 1RFQA 4BC5A 2UYTA 3H3OB 1U2VA 3HZ6A 3C7NA 1NGAA 3JS6A 4H5VA 2CGKA 1ATNA 4BRQA 2QWNA 3O08A 2YJFA 3FZFA 5BRDA 3ZX3A 5LJWA 1BOTO 1K8KA 2Q36A 3CJAA 5I9EB 3SMSA 5AQJA 1Z05A 1G99A 1JCGA 5AR0A 3EZWA 2HOEA 4JAXA 1X3NA 1NMDA 4ISGA 3MN9A 2QXLA 5AQXA 3VPZA 1GLFO 4GY2B 3SJHA 1BA1A 5E26A 3WUHA 1ATSA 3CERA 4JNEA 3A5NC 4BRDA 2Q2RA 2V7YA 3MN5A 3MDQA 4XH5A 4BR2A 3BF3A 4FWQA 4BRGA 4BRNA 3AAQA 4MO5A 1XUPO 4JHDA 5F1XA 2EWSA 3LDLA 1TUYA 4XH1A 5KQDA 3DXKB 3U8XA 2P9NB 2H3GX 4J8FA 4K41A 3SLCA 4B9QA 3MN7A 2YHWA 2IVPA 4CZKA 2E2NA 2FLOA 3ZX2A 1HKCA 5BN8A 3WT0A 1EQYA 1D4XA 3VEZA 5BPNA 1BWFO 3BUZB 1J6ZA 4BR9A 3AARA 5BREA 2GELA 2HF3A 2GTDA 2A6AA 2J4RA 3WQUA 4CZHA 3R6MA 4FPBA 1X9JA 3UKRB 3ZETA 4EAHD 2CGLA 3DAWA 3CJ1A 3H1VX 2D4WA 4CD1A 2ASOA 3EN9A 3VEXA 2P9UA 3FZLA 1U2VB 1GLAG 2QM1A 4BR4A 5AQOA 1BA0A 2ASMA 3MMVA 2GEMA 1C0FA 3G25A 4MLHA 2FF3B 2YCHA 3LL3A 4BG9A 4CZLA 4BRIA 3GG4A 5E84A 3GBTA 1BO5O 1K8KB 3HBTA 4CBUA 3DXMB 1XC3A 3FR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T7BA 1BRZA 5AQMA 3KHYA 4B9TA 2ATQA 1YIJN 4Z4HA 1RDDA 2VYPA 2YKMA 1HMVA 4XEIA 4JLHA 3C6TA 5AQNA 3T1AA 5M1NA 1KXPA 5HRNA 3LP1A 4MDBA 4O0IA 2WOMA 1BU6O 1FW6A 5E41A 1QS4A 3O1BA 2RKIA 4AHVA 4BE7B 2P9KB 4FPAA 1RTDA 3M1FA 3ZSQA 2KZZA 1F21A 3ZEUB 1U6ZA 4FJNA 2VWJA 4XJXA 1BQMA 1JKZA 1BQNA 1NGEA 1MU2A 4JD2B 4OGCA 3NF8A 3P39A 5TKWA 3KLFA 4BVPA 1D9FA 1Y97A 1IG9A 2N2QA 2PYLA 4HHFA 4DTUA 4FXDA 1ILYA 5KRSA 2O8EB 4G1QA 4PL8A 4DSIA 1I6GA 3OHRA 5AQPA 1B3CA 3LDOA 1V4SA 3SAHA 2NRRA 4BRAA 2W00A 3KWGA 2QTDA 1L3TA 1DTQA 3FFIA 2Q3SA 4HUEA 4DUYK 3TAFA 3FE1A 2BANA 4BR5A 4JKGA 4E7JA 1KVAA 3NAEA 2QA4N 3EZ5A 3NH2A 2IGIA 4DS5A 1QQMA 4BE0A 4IFVA 3TTFA 4FJLA 3SCXA 3O3FA 1AHOA 3S3OA 3VGMA 4HE7A 4BRMA 2UXDK 1X9MA 2ZGZA 1HNZK 2HW3A 2X6SA 1W2BM 1NKCA 1VSEA 1H1VA 3NVMA 1U45A 2P9IA 3SK3A 4JKEA 1KTQA 2CH6A 3HVTA 3KWIA 3AV9A 5EOYA 1TAUA 2HNDA 3UKUB 1ZBUA 4DV0K 2Z1HA 3DRSA 1NJYA 4PKGA 3U4LA 4JI2K 5CY4A 3D2EA 2HBMA 4QOZB 1MWKA 1VSIA 1GLJO 3AO4A 3NDKA 3A5OC 1VRTA 3O80A 1RDCA 1HNXK 2OTJN 4BGBA 3QEVA 3Q7BA 2V52B 1NG9A 1JL1A 2R7YA 2KFNA 3HPOA 4H5RA 2YBRC 4DHYA 5FROA 1KLNA 3BEXA 4DSEA 4GNIA 1BIZA 3MX2A 1BMRA 4O55A 4LF4K 4JI7K 5BPLA 1RDWX 1VSMA 1XNRK 1CHZA 3EE8A 1C1CA 2GUPA 1UA1A 4FJKA 2W42A 1HKBA 3CQXA 3RSEB 1T1TA 3NGYA 1T05A 1DKGD 4B1VA 1C1BA 3M8SA 4FWPA 1QHAA 5HP1A 4IFEA 1SKSA 3L3VA 1XHXA 1HQUA 3CCEN 3S41A 4H0XB 3MN6A 4BGAA 4DSJA 1XWLA 3KP1A 1Q8IA 4MDAA 5F2RA 1NRBA 3HSCA 4CHZA 3R1XA 3CXCM 3QFPA 3VF2A 1RT2A 2JWLA 3ALYA 2GL1A 3DXKA 2D0PA 4N41A 2O4IA 1LWCA 1T3VA 3AAPA 3RRGA 3HPHA 5AQFA 4OKEA 5EY4A 3FFKB 2A7TA 5AZIA 1CN2A 3KLEA 2FXUA 5GIOA 3IRXA 3T7ZA 4DTPA 1CZAN 3I0RA 4DV4K 3L3UA 1E4FT 2HHIA 3UKRA 1NMNA 2KPYA 2HHUA 2GWJA 4AHUA 4ID5A 2WONA 2G8IA 1ZYWA 1AYJA 3MWPA 4CJ3A 3AVHA 1L3UA 1VSKA 4HTLA 1Z6RA 5K14A 4L3QA 3QEIA 3QMLA 1C6VA 1OVYA 4IZ9A 4LFAK 2Q0RA 3HYFA 4BRFA 1SQKA 1EO1A 2GX9A 2P9SB 3LANA 3DXMA 1ICAA 4DB3A 3LP2A 3JXUA 1GOCA 4FWLA 2NLXA 3V9UA 1WOQA 1GLEG 2OYQA 2HNZA 4BR0A 2OTLN 5C42A 4V1DC 4KHWA 4JI6K 2NRVA 3CIPA 1GPTA 1DJTA 4YNQA 2P5GA 1VSDA 2BE2A 4OPKA 3J7ZO 4YY3K 4EZ9A 5BR8K 1TK8A 4RTFD 5AQUA 2ASPA 2G8UA 3AVLA 2E2PA 3KC6A 2F7TA 4QAGA 1RT3A 3EE9A 5C24A 2P9KA 3H6EA 1XRSB 2KZMA 3CD6N 2YX6A 3MWTA 3NH1A 2KQ2A 1S22A 3ZEUA 3AVCA 4A2BA 1QE1A 2KGQA 5HBMA 1MWMA 5KK4A 5GAHP 4F2RA 2A1RA 1GPSA 4JD2A 3SQ4A 1IBMK 4M41A 4JI4K 4OLAA 4CEFA 4C1NI 1EXQA 4KI6A 3PIOL 1ZBLA 3F2KA 3VEOA 3O4WA 3V9SA 5B8HA 1WSGA 1YVUA 5AQRA 2O8EA 4WCEL 1NK6A 4OPJA 5KTQA 4O8UA 2YC1C 2M8BB 3H1QA 3KIOA 1QQNA 4KV8A 2E1ZA 4CESA 2NRTA 3O4QA 4LSNA 3F9KA 1HUXA 3IFRA 4FZYA 3SQ0A 3EKSA 2Q31A 1TKXA 3H45C 3IMXA 1S1VA 3LAMA 4CK2A 1ZFUA 3ATVA 4H5NA 2HF4A 1T7AA 1RTHA 4I6MB 2HHQA 2HHTA 4BRPA 5FPMA 3U6FA 1OKJA 1RBTA 3QETA 3EYZA 3CM6A 2O8CB 2V51B 3VF4A 5D3GA 5BRHA 3ID8A 1LAVA 3W3DA 3OYEA 2ZJPL 1TKDA 1VNBA 1RDBA 4WE1A 5FRNA 3VENA 4BY9C 3OJSA 1HYZA 1NJWA 3L4IA 3ZT2A 4UY8O 2E20A 2HBJA 3K0SA 3VTHA 3AGKA 3IUCA 4I2QA 2ZJQL 4E89A 1KLMA 4KI4A 2IIRA 5AQTA 4YORA 1GLLO 1I39A 3NFAA 1JLCA 1LQHA 4R5PA 4H0PA 4LSLA 1FH3A 4DFMA 1PTXA 1NGHA 2YJEA 4FOIA 1N32K 4DS4A 2CH5A 3TR8A 3FLCO 1BUPA 2VQFK 1YJ9N 2LY5A 1P8ZA 3VGLA 4HWIA 4BC5A 3HVRA 2UYTA 5EU7A 4DF4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1T7B A;  1BRZ A;  5AQM A;  3KHY A;  4B9T A;  2ATQ A;  1YIJ N;  4Z4H A;  1RDD A;  2VYP A;  2YKM A;  1HMV A;  4XEI A;  4JLH A;  3C6T A;  5AQN A;  3T1A A;  5M1N A;  1KXP A;  5HRN A;  3LP1 A;  4MDB A;  4O0I A;  2WOM A;  1BU6 O;  1FW6 A;  5E41 A;  1QS4 A;  3O1B A;  2RKI A;  4AHV A;  4BE7 B;  2P9K B;  4FPA A;  1RTD A;  3M1F A;  3ZSQ A;  2KZZ A;  1F21 A;  3ZEU B;  1U6Z A;  4FJN A;  2VWJ A;  4XJX A;  1BQM A;  1JKZ A;  1BQN A;  1NGE A;  1MU2 A;  4JD2 B;  4OGC A;  3NF8 A;  3P39 A;  5TKW A;  3KLF A;  4BVP A;  1D9F A;  1Y97 A;  1IG9 A;  2N2Q A;  2PYL A;  4HHF A;  4DTU A;  4FXD A;  1ILY A;  5KRS A;  2O8E B;  4G1Q A;  4PL8 A;  4DSI A;  1I6G A;  3OHR A;  5AQP A;  1B3C A;  3LDO A;  1V4S A;  3SAH A;  2NRR A;  4BRA A;  2W00 A;  3KWG A;  2QTD A;  1L3T A;  1DTQ A;  3FFI A;  2Q3S A;  4HUE A;  4DUY K;  3TAF A;  3FE1 A;  2BAN A;  4BR5 A;  4JKG A;  4E7J A;  1KVA A;  3NAE A;  2QA4 N;  3EZ5 A;  3NH2 A;  2IGI A;  4DS5 A;  1QQM A;  4BE0 A;  4IFV A;  3TTF A;  4FJL A;  3SCX A;  3O3F A;  1AHO A;  3S3O A;  3VGM A;  4HE7 A; 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