5AQYA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
AKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqyA04
3VGLA 2QWPA 3G25A 2V52B 5AQWA 3VEZA 4PKGA 1K8KA 1SZ2A 2A42A 2ZF5O 3UKUB 3QMLA 2OANA 1V4SA 4LC9B 3WXLA 4BR4A 1GLEG 1EQYA 1P8ZA 5JICA 2NZTA 1H1VA 3L6QA 4FPAA 1KXPA 2F9TA 2NLXA 1CZAN 4K43A 3L4IA 4WYBA 4BR2A 4K42A 3O1WA 3MN7A 2FF3B 1XUPO 2W41A 3D2FB 2P9IB 4ISGA 4CI6A 3ZEUA 1WOQA 3QICA 4YDUA 3FE1A 3VF6A 4BR5A 3LDOA 5AQPA 1BWFO 4MO5A 3VEWA 4FL9A 1LOTB 2HMPA 2CGKA 1S3XA 2Q0RA 3A8YA 1ZXOA 5BPNA 2CGJA 3AAPA 4XEIA 5AQRA 3R8EA 2Q1NA 2P9LB 4FWNA 4K41A 4KBOA 1YVNA 3WQUA 4I6MB 5AQLA 2E2PA 3ZX2A 5FPDA 5AFUH 1SQKA 4H5WA 2Q36A 4BGAA 4FPBA 3BUZB 5EVZA 3VGKA 2W40A 4RWTA 1TYQB 4CD3A 4CZEA 3FFKB 3D7EO 3EO3A 4L3QA 2QWLA 4A61A 3FZHA 4EFHA 3A5LC 5AQMA 4H0TB 3I33A 5AR0A 3RSEB 3A5MC 1YAGA 1HJOA 1MA9B 5BRHA 1JCGA 1LCUA 3KZBA 4NO7A 4FOEA 5AQNA 1BDGA 1QHAA 5KPRA 3IMXA 3QBXA 5BR9A 3QFUA 4PL8A 2EWSA 3UE5A 5BPMA 5FPNA 2P9KB 4BC4A 4BREA 4XH4A 2A41A 3WXIA 3DWLA 3GBTA 3BEXA 1BU6O 2I7NA 1QQNA 2IVOA 4BRMA 4CBWA 5AZIB 4BRCA 3M1FA 3H1VX 2E88A 2YHYA 3D2FA 3CI5A 4H0OA 1GLBG 2CGLA 5AQHA 3O6WA 4DHYA 4IO8A 4M7XA 1DEJA 3LDLA 5E26A 3FZMA 2QM1A 4BR0A 3F9MA 2P9LA 3AARA 4K25A 3ZX3A 4FWOA 4DQ8A 4I6MA 2P9SB 4IJAA 4WQ5A 4CZLA 5KPZA 3HZ6A 1QQMA 5LJWA 2P9NB 4C23A 1GLFO 5AQQA 3VPZA 1TYQA 5KQ8A 2F9WA 3EL2A 3CJ7A 2IVPA 2YI1A 1NGEA 4XH5A 5JLHA 1NGJA 1E4FT 5AQXA 4F9OA 5B8HA 1DKGD 3RSEA 1BA0A 3U9DA 4JNEA 4B1VA 4E1JA 3MN5A 3HBTA 3O8MA 2GWJA 5EOYA 1E4GT 3AAQA 4RCHA 4AM7A 3VGMA 4J8FA 2AP1A 2P9KA 3LM2A 2YHXA 4B1XB 3TPQA 3CJ9A 1TUUA 3DXMB 1MDUB 3SK3A 2VWBA 3CERA 4BQLA 1HLUA 3D2EB 3CETA 2GUPA 5AZIA 3R9PA 4H0PA 2FSKA 2E8AA 3UB5A 4CZHA 3EKSA 4JD2B 3MDQA 4PL7A 1RFQA 2Q97A 4JHDB 2D4WA 3BF3A 2QWRA 3CJBA 3WXJA 1T6DA 3FGUA 4MLHA 2FLOA 2P9UB 3JXUA 2YHWA 4BGBA 2KHOA 3VOVA 4H5TA 2P9SA 3R6MA 3SLCA 5BRFA 3ZX0A 2A5XA 4FWSA 2P9NA 3IUCA 1XQSC 3FZFA 1GLLO 1HUXA 1RDWX 1RGIA 5AQJA 4BROA 1BOTO 4FWLA 3GOIA 1NGCA 4WQ5C 1NM1A 1Z05A 2H3GX 3WT0A 2BTFA 3ULEB 4A2AA 4Z94A 5AQZA 3H3OB 4FWRA 5LJVA 4RTFD 5LY3A 3H46O 4QS9A 2P9PB 2FF6A 1QQOA 2A3ZA 4B1YB 3HTVA 1JCFA 4B9QA 4BQZA 3O80A 4QS7A 3KHYA 4CJ7A 1MWKA 3ID8A 1NGHA 1DGKN 1WUAA 5KPTA 5AQGA 3M3ZA 4H03B 3LDNA 3IDHA 4BG8A 4AM6A 4BRAA 1Y64A 2I7PA 3DXMA 1NGFA 3O08A 3A5OC 2HF3A 3DJCA 3D2EA 1QZ6A 1C0FA 2QXLA 3HSCA 3HM8A 4BRGA 3O5BA 4JD2A 3VEXA 3M6GA 5AQUA 5F2RA 3SJHA 5EX5A 1BUPA 4JHDA 3VEVA 4BC3A 4M63C 1YUWA 5JLFA 2FXUA 2V7YA 5AQOA 1BG3A 2GTDA 4FOIA 4CZMA 1ZC6A 3VEOA 3CJ1A 1HX1A 2P9UA 3A5NC 1NLVA 3FR0A 3DAWA 5ELZA 4FWMA 3O1BA 4B1ZA 4HTLA 4XH1A 1NBWA 4WQ4A 2ASMA 1J6ZA 1NMDA 1HKBA 2AA4A 3IFRA 1NGBA 3ZETB 1JCEA 3CQXA 4H0XB 4NB4A 5KQDA 2E2NA 4M7YA 3VENA 3WEEB 4A62A 2E2OA 4BR7A 2QWNA 2IIRA 4GY2B 1X9JA 3MN9A 3ULEA 3FZKA 3OHRA 5JMVA 4BRFA 4H0YB 3CQYA 5F0XA 2YJFA 3W0LA 3UKRB 4IZ9A 1R59O 1TUYA 2P9PA 4BRLA 5E84A 4BVOA 4DCHA 3GDQA 3C0BA 1BA1A 5EY4A 1KAZA 2PBDA 3O4WA 1NGAA 2GEMA 3LL3A 1IJJA 3DXKB 3I8BA 1GLAG 4H5NA 3EN9A 4CZJA 4BRQA 3AY9A 2UYTA 3EKUA 3VF4A 3CJCA 4FSVA 3ENOA 5AZJB 4FWKA 2ZGZA 3VERA 2WUSA 4CZFA 2E20A 3CIPA 4BRKA 2Q0UA 2V51B 2GELA 3WXKA 3WUHA 2ASPA 5AQYA 4BRPA 3U9ZA 3BP8A 3H45C 2NRHA 1MWMA 5I9EB 1ZBSA 3C7NB 1U2VB 3KVGA 5FPMA 1T44A 3VEYA 2ZGYA 2FSJA 4FO0A 5ADXA 4ISFA 1XC3A 1NGDA 4JAXA 2Q2RA 2A6AA 3MCPA 2YJEA 2E1YA 1U6ZA 4CZGA 4B1WB 4CBXA 3CJAA 5AQTA 4MLEA 2Q31A 3VETA 4EHUA 4IWVA 3EZWA 4CBUA 5BRDA 1NGGA 3QB0A 3LDPA 4H5RA 2GWKA 3MK6A 2J4RA 3SMPA 5AQFA 3ZETA 1ATSA 2E1ZA 1HPMA 1T6CA 1NWKA 3B8AX 1ATRA 4ISEA 4QS8A 3WEEA 1GLCG 1D4XA 1GLDG 1S22A 4FWPA 3ATUA 1ESVA 3U8XA 2CH6A 1V4TA 4WQ4C 3VF2A 1NGIA 1ATNA 4JN4A 1GLJO 4Y0WA 1G99A 2BUPA 4GNIA 5TKYA 4H0VB 5EXWA 2D0OA 3GE1A 5CE3A 3UKRA 3L0QA 3U4LA 3W3DA 3FZLA 4IXCA 3GL1A 3BF1A 3DXKA 1K8KB 5BPLA 3WQTA 1OKJA 1Q18A 4BR9A 4BG9A 2QWMA 4B1UB 4H5VA 4CZKA 4EHTA 5FPEA 2E2QA 3LM9A 4IJNA 3MN6A 1SAZA 5AQVA 1X3NA 3UKUA 5AZJA 2QWOA 4A2BA 4BRDA 1YXQA 3HI0A 3MMVA 4BRHA 2DPNA 3S41A 2QWQA 5AQKA 5BREA 4BRNA 2HOEA 2PAVA 4CZIA 3C7NA 3JS6A 1U2VA 5BN9A 3CHWA 3SMSA 3ZEUB 5ADXH 3A0IX 2CH5A 3VESA 5AQSA 3LDQA 2ITMA 3ATVA 2P9IA 3H6EA 2HF4A 2VYPA 3TU5A 4BVPA 4DB3A 2ZWHA 2QW9A 5BN8A 3QFPA 1IG8A 3FLCO 4EIAA 1HKGA 2VCPA 4HWIA 1Z6RA 2YCHA 4BC5A 4BRIA 2ASOA 3H3NO 4EAHD 3J8AA 2A40A 4YDUC 1BO5O 2D0PA 5AFUA 3QDKA 3GG4A 4PKIA 2D1KA 4PKHA 2V7ZA 4FWQA 1QZ5A 3ENHA 3H1QA 1KAXA 5AQIA 3QBWA 4BC2A 4MO4A 2FSNA 5F1XA 1C0GA 4O8KA 3P4IA 4O5FA 1HKCA 4CD1A 2IVNA 1KAYA 1X3MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4A5BA 3G25A 5AQWA 4LF9K 3J81O 4PKGA 1S1VA 3UKUB 2OANA 1VQKN 3V9XA 3Q7BA 4FK0A 4BR4A 4CF0A 3TR8A 4JI0K 4FZXC 1GLEG 5JICA 5HBMA 2KBHA 1H1VA 4JI7K 1KXPA 1VQ7N 1OH5A 4DFKA 3O1WA 1CN2A 1JLCA 4HHTA 2FF3B 4JKCA 4KHUA 4O44A 3D2FB 3MWPA 4CI6A 4DF4A 2HHXA 4DV5K 4YDUA 3FE1A 5AQPA 4OO1J 3KK1A 1DTTA 2KW4A 2Q3SA 2CGKA 4GKKK 2YIPA 4DUYK 4HCCA 5BPNA 4WFNL 2JDQD 2IGIA 3R8EA 4U67L 2HHWA 2P9LB 3AVLA 3IAYA 3OBWA 4I6MB 5AQLA 1SN4A 4JLHA 3HO1A 2MZ0A 1VRTA 4B3MK 3PSFA 1D8YA 2Q36A 5EU7A 4DTSA 3OYJA 2HB5A 5EVZA 4DSEA 2O8DB 4KHPK 4CD3A 3D7EO 4L3QA 2QWLA 4A61A 5SZTA 2UUBK 2E2FA 1MU2A 4CFDA 3I33A 5AR0A 3RSEB 1MA9B 3KZBA 4NO7A 4FOEA 1BDGA 3KK3A 5KK4A 5J2MA 5KPRA 3IMXA 4YOTA 1QE1A 5BR9A 4CF9A 2ZQBA 3KJVA 4GKJK 2EWSA 5FPNA 4XJXA 4FK4A 2A41A 4DR4K 3VQ5A 5HRSA 3NVMA 1IKYA 2HBKA 3KLEA 4ELUA 2I7NA 4NXNK 3R1XA 2IVOA 2EHGA 3DLHA 2E88A 3VA3A 4F8RA 4CFCA 2D0CA 3K9KA 4KH4A 1NK5A 1TKDA 1C56A 2CGLA 4DS4A 5AQHA 1M1KO 4DV0K 3RTVA 3NF8A 4M45A 1DEJA 2QM1A 5DMRA 1EX4A 3MEGA 4B3RK 1JLFA 4DTRA 4IJAA 1UWBA 4PHTX 1NNEA 3HZ6A 1SL0A 4CEFA 1S9GA 5LJWA 1G15A 1JL2A 3VQCA 1NK6A 4C8LA 3L2WA 3KTQA 5E41A 2QKBA 1TYQA 1TL1A 1ASWA 2YI1A 5JLHA 3QERA 1RBSA 4AHSA 5GINA 1WSFA 4HUFA 3DI6A 1U49A 1ASUA 2O8EA 3HK2A 1FKOA 3U9DA 3LP0A 4FJKA 4KYPA 3OA9A 1MR4A 1Q81O 2GWJA 1I3AA 3AAQA 1Z26A 4B9LA 4CEQA 3OYAA 2DFFA 4MQ3A 2HNYA 2P9KA 4Z0UA 1NJIO 1D5AA 1A5WA 3ZCMA 3H08A 3KKSA 4B1XB 5BR8K 2ZD1A 4IFEA 1YHQN 2C1IA 3OYHA 3DXMB 2NRTA 3E7UX 4RW9A 3V9ZA 3NVKA 3CERA 3TSPA 1SL2A 3I56N 1S6PA 3UB5A 1P0AA 3P5JA 2D0BA 3MDQA 4H4OA 3K0SA 3D6RA 3C6AA 4N5SA 3BF3A 3CFPA 2O4GA 4AHCA 2E4LA 1T6DA 4MLHA 4Z4HA 1W9HA 4OGCA 4OPHA 1GOCA 5DK5A 1TV6A 3R6MA 1NK8A 3CG7A 1FK9A 2FBTA 3ZX0A 4C8NA 1KQSM 4J2DA 3EE9A 4QCLA 2P9NA 3NDKA 3CYGA 1HNZK 3ID6A 3F5TA 1HUXA 1VQNN 1RDWX 4CW7B 1RGIA 5AQJA 2WONA 1QVFM 4BROA 1C0MA 3GOIA 1N8RO 1T7AA 4JK8A 4WQ5C 1I2UA 3R2VA 4DV1K 1S1WA 4M3YA 1RTHA 5LJVA 1KD1O 1VK0A 4M3XA 4KKOA 4IBNA 5DM6L 1VSFA 1RDBA 3J7ZO 4CJ7A 4CESA 3NGIA 1BCMA 1RTJA 3IDHA 1HMVA 4AM6A 1Y64A 2Z1HA 2Z1JA 3A5OC 4GVEA 3IKMA 2HF3A 3U3YA 1RT4A 2I61A 3VEXA 1Q9YA 1GPSA 3ALYA 5AQUA 2I5JA 4DTPA 1BUPA 1GPTA 4OX9K 4WFAL 4R5PA 1KV0A 2HHSA 4FOIA 1WSEA 4CZMA 3SV3A 3CJ1A 3AVMA 1HX1A 1NLVA 1N33K 3OYDA 1JXBA 5ELZA 4B1ZA 3L8BA 3ZSXA 4J2AA 2AA4A 4F3OA 3IFRA 1NGBA 4NB4A 1KLMA 4DFMA 1WSHA 3EEQA 5CY4A 3ULEA 2LSNA 3OHRA 5JMVA 3DYAA 3MX2A 4BRFA 4H0YB 3PO4A 5IWAK 1U4BA 3W0LA 4CERA 4B3OA 3UKRB 1TUYA 2P9PA 4BVOA 3ZSRA 4EP5A 2ETJA 3O4WA 3LL3A 4CEBA 3RMBA 4H5NA 3AGRA 4PQUA 3ULDA 4FSVA 2OZMA 3T7ZA 5AZJB 1TAQA 1NK0A 4FWKA 1OH7A 3OYKA 1Y97A 3CIPA 3N4QA 2RF2A 1XMOK 4K0KK 4KTZA 3ZYYX 2OTJN 3H45C 4FJXA 3TSQA 1MWMA 3A2FA 3P38A 4CIGA 1ZBSA 4B9NA 1XHZA 1BRZA 2WOMA 4F2SA 3KVGA 1RDDA 4DF8A 3DLGA 3VEYA 2ZGYA 2FSJA 1BCOA 2NY9X 3IS9A 1XC3A 3R3LA 1LQIA 4DU3A 3MAQA 1U6ZA 4HVJA 4CBXA 5AQTA 3VETA 4WCEL 4IWVA 2F8SA 3VQ8A 3QEWA 3PX4A 1SKSA 5BRDA 1NGGA 1VQ8N 1VQON 3QB0A 1KTQA 2K35A 1JJ2M 3ZSZA 4CJ3A 4EZ9A 2E1ZA 1JXEA 4JI2K 1IKWA 4ISEA 1D4XA 3L3UA 4FWPA 1ESVA 1KRPA 1P00A 3U8XA 3O4NA 3HJFA 5TKYA 3DM2A 4E1MA 1B7DA 3AV9A 3CCLN 3L0QA 3C94A 4JI4K 3PSMA 3K2PA 2OA8A 4IOXA 4JI3K 4BR9A 4E3SA 3SQ0A 3ISNC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4A5B A;  3G25 A;  5AQW A;  4LF9 K;  3J81 O;  4PKG A;  1S1V A;  3UKU B;  2OAN A;  1VQK N;  3V9X A;  3Q7B A;  4FK0 A;  4BR4 A;  4CF0 A;  3TR8 A;  4JI0 K;  4FZX C;  1GLE G;  5JIC A;  5HBM A;  2KBH A;  1H1V A;  4JI7 K;  1KXP A;  1VQ7 N;  1OH5 A;  4DFK A;  3O1W A;  1CN2 A;  1JLC A;  4HHT A;  2FF3 B;  4JKC A;  4KHU A;  4O44 A;  3D2F B;  3MWP A;  4CI6 A;  4DF4 A;  2HHX A;  4DV5 K;  4YDU A;  3FE1 A;  5AQP A;  4OO1 J;  3KK1 A;  1DTT A;  2KW4 A;  2Q3S A;  2CGK A;  4GKK K;  2YIP A;  4DUY K;  4HCC A;  5BPN A;  4WFN L;  2JDQ D;  2IGI A;  3R8E A;  4U67 L;  2HHW A;  2P9L B;  3AVL A;  3IAY A;  3OBW A;  4I6M B;  5AQL A;  1SN4 A;  4JLH A;  3HO1 A;  2MZ0 A;  1VRT A;  4B3M K;  3PSF A;  1D8Y A;  2Q36 A;  5EU7 A;  4DTS A;  3OYJ A;  2HB5 A;  5EVZ A;  4DSE A;  2O8D B;  4KHP K;  4CD3 A;  3D7E O;  4L3Q A;  2QWL A;  4A61 A;  5SZT A;  2UUB K;  2E2F A;  1MU2 A;  4CFD A;  3I33 A;  5AR0 A;  3RSE B;  1MA9 B;  3KZB A;  4NO7 A;  4FOE A;  1BDG A;  3KK3 A;  5KK4 A;  5J2M A;  5KPR A;  3IMX A;  4YOT A;  1QE1 A;  5BR9 A;  4CF9 A; 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