5AUZA

Crystal structure of dapk1 in complex with genistein.
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
276
structure length
274
Chain Sequence
TVFRQENVDDYYDTGEELGSGQFAVVKKCREKSTGLQYAAKFIKKRRTKSSRRGVSREDIEREVSILKEIQHPNVITLHEVYENKTDVILILELVAGGELFDFLAESLTEEEATEFLKQILNGVYYLHSLQIAHFDLKPENIMLLDRNVPKPRIKIIDFGLAHKIDFGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGDTKQETLANVSAVNYEFEDEYFSNTSALAKDFIRRLLVKDPKKRMTIQDSLQHPWIKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Death-associated protein kinase 1
publication title Structural Insight into the Interactions between Death-Associated Protein Kinase 1 and Natural Flavonoids.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 274
sequence length 276
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5auzA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5auzA01
3I81A 3Q9XA 4JBQA 4HZSA 3A61A 4QPAA 2WQEA 1CKJA 3A7HA 4ANLA 5J79A 1J3HA 4AXAA 4U9AA 4AN3A 4BCMA 2W1GA 3E3BX 2UZWE 4R3RA 1R1WA 5TF9A 5EDRA 3DCVA 5B0XA 4CLIA 3IO7A 5CZHA 2JDVA 1FBNA 5LQFA 1H25A 1H0WA 4E7WA 1PXMA 3QLFA 3FYJX 4TZRA 2YIQA 4XLVA 3DPKA 3ZZWA 3H0YA 4RRVA 5LVMA 3WBLA 3QD4A 1Q5KA 4QP6A 3FL4A 4QNYA 4C58A 5A9UA 1UWJA 1WZYA 2HXQA 5HVKA 3NVMB 4CMOA 4Y8DA 3MV5A 2J5FA 3C9WA 5AMNA 4TYJA 3RK5A 4EH3A 1JSVA 5K5NA 2CMWA 3IW8A 5BUJA 5I9YA 3PVBA 3RPYA 3EN9A 3DT1A 4BDDA 4X2KA 2YISA 4BC6A 3PDTA 2PVJA 3GENA 3DKOA 4WNMA 3ZBFA 1FGKA 1XH8A 2PMLX 3BQCA 4EZ3A 4DG3E 4IAYA 3K54A 4MNEB 2OI4X 3QTXA 1YOLA 3UVRA 4ARKA 3OWPA 4HW7A 3NPCA 4CZYB 2ONLA 5HG9A 1KV1A 3I6UA 3ULIA 4UWYA 4D2WA 3HRCA 4IAZA 2WHBA 3FMLA 3GCUA 3GGFA 3W18A 3QGWA 2Y0AA 2ZM4A 4KKHA 4CZTA 3A62A 3TZ7A 2B54A 4EQUA 5AWMA 4DF3A 2H96A 2R3PA 3HAVA 4IJPA 5DR9A 5GHVA 5JFVA 4JJRA 3SX9A 5IEVA 4ANSA 4CD0A 4A9RA 4XP0A 3UZRA 3FXXA 3G51A 3HP2A 5ANDA 3S2PA 2BRHA 2BMCA 3BGZA 4LOOA 1JBPE 2P4IA 4IAAA 4IVBA 4QQCA 3SDJA 2I0YA 5CEMA 1TKIA 1WMKA 2QO7A 3FZPA 1ZAOA 4DTAA 5CNOA 3R22A 3RALA 4NJDA 4U40A 3WF6A 4BDHA 5GIPE 3LFCA 2YLEA 4ALUA 4U97A 3VS1A 3W1FA 4O86A 1L8TA 4YTHA 4TNBA 2BZIB 3U54A 2OJ9A 3MYGA 5JN2A 3TZMA 1J7IA 3C7QA 4TYIA 4FIEA 3R9DA 1S9JA 2YHVA 2A2AA 1UV5A 2WD1A 1M2RA 4GT3A 1GZ8A 4XG2A 1REJA 2QVSE 4ZY6A 3EN6A 1J91A 2QKRA 4ZZOA 5IPJA 3R83A 2CKEA 4BCJA 2C0IA 2UZEA 3R28A 4X21A 2Y6MA 3RCDA 4FSYA 4IDTA 3CY3A 4LMNA 3CEKA 1BMKA 4XG8A 3DNEA 5E8UA 5DYJA 4BR3A 5HD7A 2XIKA 3B2WA 2PE1A 5IQCA 4YBJA 3BHTA 1IAHA 4JAJA 3LJ0A 5H8EA 1H1RA 4BKJA 3UPZA 5HGIA 3QQJA 4JDKA 4CLJA 4G6LA 4MWIA 2QCSA 4HYSA 3KMMA 4M13A 2OIDA 2WMXA 2QLQA 4EK4A 3QHRA 3F9NA 4YNOA 5AEPA 3QUDA 4IFGA 4QTAA 4PMPA 4FIGA 4EC9A 3C50A 2C5YA 4KS8A 3A7JA 2WMBA 1UVRA 2X9FA 3KRLA 4LRKA 4N6ZA 4HCVA 4QP3A 4CQGA 4FF8A 3TIYA 5CI7A 4C37A 4IZYA 3OHTA 4QO9A 1VEBA 4UB7A 5A4CA 1RW8A 2OBJA 3U4WA 3BWJA 2C3LA 3T9TA 4QMPA 4RZVA 5FEEA 5LWMA 2HIWA 4E4NA 3PZHA 1PYEA 2J6MA 1DAYA 4E93A 4W4XA 2CN8A 1P5EA 3BU3A 4W8DA 2FB8A 4FL2A 3OT3A 4FKPA 1I09A 5H8BA 5HE2A 3KMWA 5KZIA 5E8SA 2UW9A 2A27A 1WBWA 4NT4A 3UMXA 2BAJA 1R78A 2BIYA 2YFXA 3ALNA 3C5UA 1GAGA 3EYGA 2PZPA 3MH0A 3OD6X 1QPJA 2W7XA 5CEIA 5BYLA 3UQCA 3GU6A 3IECA 4P5ZA 2CNVA 5E91A 2FSMX 2QONA 4U79A 1M7QA 3V8WA 1ZXEA 4RVLA 3P4KA 4P90A 5E9EA 2OF4A 3JY9A 4ZJJA 4N4SA 3IW4A 4F9YA 1WBNA 2DWBA 5CVHA 5E8YA 5IEYA 3PXFA 1XO2B 5ETAA 4O6EA 2JKKA 3KC3A 3OBJA 3W2RA 3UBDA 4O7TA 3NUNA 2JAVA 3WILA 4TYEA 3LCTA 4D2RA 3EZVA 5IMEA 3NUYA 1XH4A 4DEDA 2ZDUA 3UTOA 2C6OA 4JOAA 5DVRA 3QTUA 4TRLA 3QRIA 3FLYA 2OU7A 3TTJA 1Q8YA 4YZBA 1ZYCA 4OTPA 3LPBA 2C5OA 3VBVA 2ZDTA 5DR6A 5TR6A 3P08A 1XWSA 1GZOA 4MBJA 2OXDA 1Q8ZA 2XM9A 3D0EA 1YOJA 1ZYDA 5EW8A 5IA0A 4QP7A 4EHZA 3QTSA 5AIRA 3ORLA 4AACA 4C4EA 1SNUA 2W0JA 3QXPA 4NZWB 3QKMA 4FICA 3EQIA 3I4BA 3R1YA 4XG4A 2CHLA 4IZAA 4AZTA 2OZOA 2E9UA 4RX9A 3HV5A 3LFFA 3GU4A 4BZOA 2IJMA 4HNFA 3ODYX 4JRVA 1K9AA 3RM6A 1OM1A 5HX8A 2BDFA 2XRUA 4YBKA 3S95A 5K5XA 4KBAA 4BL1A 5AV3A 4OTIA 1PXLA 3ALOA 2FYSA 3QZIA 2OJGA 3LKMA 3ORMA 4CQEA 5E8VA 1QCFA 4U43A 4F7LA 5HD4A 5FXRA 2X8EA 2XKEA 5KMOA 3COKA 2HZIA 3ACJA 3E8EA 3AC4A 3LOKA 4QMVA 2FSOX 4NSTA 5E1SA 5LOHA 1YI3A 4OTFA 2QODA 3HMNA 4F4PA 3E7VA 4IXPA 4MD7E 3KXHA 2UW7A 3NW6A 2OWBA 1F3MC 1B39A 3P7BA 3MY1A 4O22A 3OWLA 1G5SA 2YM8A 1YXSA 2ITPA 4ZTLA 4LOPA 3BX5A 3UYTA 3V5JA 3FSFA 1F5QA 4E4LA 3AT2A 4BKZA 3QRUA 4GKIA 3LXLA 2GPHA 3RAIA 2VX3A 4G31A 5FBOA 3KK8A 2YWVA 2HK5A 4G2FA 2B7AA 3EOCA 4F0FA 3QQFA 3VW8A 2WQOA 2OGVA 2REIA 4FG9A 4LYNA 1KE9A 1KOBA 4D2VA 4S30A 4MXCA 4JNWA 5KMLA 5M08A 2WELA 4UZHA 5DA3A 3MH2A 4N70A 2PUNA 3VBWA 5JGDA 4FI1A 4F6UA 2W06A 2VTIA 3I7BA 4RWLA 4QQ5A 4X6QC 3POOA 4K8AA 3R8PA 3R7UA 3ZM9A 2O5KA 5ANKA 5IA5A 4B8MA 4F7NA 3AMYA 3H10A 2YA9A 2E9VA 3HVCA 3NX8A 3VULA 1OZ1A 3WARA 4JBVA 5HCXA 4Y73A 1JQHA 5DBXA 4IAKA 4FV6A 5DLSA 3ZO4A 4I6HA 4EBVA 4EK5A 4F70A 4F9AA 4UXQA 3FE3A 2XZSA 5ICPA 3L8PA 4P7EA 3FKNA 4I4EA 4DFNA 3GC9A 3PY3A 3WZDA 1SYKA 3CJFA 5JH6A 3NCGA 4RX7A 3KVXA 4TWNA 3ZFMA 3R73A 5HLNA 4FV3A 3HL7A 4DINA 1URCA 2JIVA 3Q6WA 3DU8A 4TW9A 3RHXA 4G5PA 5AX3A 4X3JA 3EKKA 3GT8A 2WTIA 3OXZA 2QO9A 4UMTA 4DEBA 4JBPA 2DS1A 5FXQA 2OXXA 3C4EA 3TIZA 2QU6A 3E64A 3KMUA 4L7SA 5BVEA 4ANOA 4BHNA 4D4YA 3PY1A 4B9DA 1OKZA 4KA3A 5LARA 4B0GA 4F09A 3E7OA 4PF4A 4XOZA 4D5KA 4F7JA 1AGWA 4QYYA 3TDWA 3DV3A 4D2SA 4HVIA 1J7UA 3K5VA 2XK9A 4FOBA 4PMSA 4V01A 1CMKE 5I9UA 4FNZA 4KKEA 3QGYA 4AGDA 5KX8A 2YDKA 5EHOA 5B2MA 4D9TA 1PYXA 5HU3A 3LQ8A 3EQBA 4JQEA 3Q53A 1XBCA 2PVMA 2XM8A 5JFWA 1W8CA 3OY3A 3S3IA 3UVPA 5M53A 4AW5A 3KY2A 4Y85A 5IQAA 3UIUA 1SVGA 4QD6A 5EK7A 5CWZA 4DLJA 2C5VA 3DKFA 2BFXA 3OY1A 4O0SA 4TT7A 2PVFA 2PVLA 3CLYA 4IEBA 4L3PA 2VTQA 5FM3A 4BHZA 4CFUA 5I5ZA 2J0KA 3BKBA 2CDZA 2XYNA 3OT8A 4P4CA 4ACDA 4I22A 2W5HA 2WTKC 3LCSA 4YTIA 4UEUA 2ZJWA 4M67A 3UO4A 4KIOA 2WMQA 4G6OA 4J95A 1YDTE 1Q41A 3DNDA 4AQCA 5JQ5A 3L9MA 5EW3A 5HVYA 2Y4PA 3PJ8A 2ITOA 3GFEA 4K18A 4JBOA 4GS6A 3REPA 4BRXA 2XRWA 5FRIA 1BL7A 1YHVA 2PVKA 5CYIA 3FHIA 4AW1A 3DTCA 2XJ2A 2VO7A 1PXNA 2YAKA 3FZTA 1W98A 3KQ7A 2OZAA 5EHLA 3COMA 5IUIA 2X0GA 1GIIA 3HA8A 4U42A 2FSTX 5F94A 2J90A 4BBEA 2ZMDA 3EN4A 4X7QA 1OPLA 3D5WA 2JDRA 3NUXA 4O38A 2R3NA 2WNTA 3DQXA 2E2BA 5EQYA 3EB0A 3GC0A 1WBVA 1PW2A 1XR1A 3NSZA 1VZOA 4USDA 4Y46A 2GHLA 5CXZA 4LMUA 3UNJA 4EUTA 4BWKA 3SQQA 3IK3A 3A7GA 5A14A 4QMYA 2X4ZA 4OGRA 5CQUA 3SW4A 3QQUA 3CXWA 2Z7QA 5LCKA 3Q04A 4R7IA 4DYMA 5HNGA 3RAHA 2R3RA 2BKZA 3CPCA 3Q4UA 4BGHA 1YDRE 3G0FA 4CXAA 5FP6A 3R8LA 3OCSA 2LAVA 3P5KA 3Q96A 4BDGA 5HORA 5FTGA 2XBJA 3OBGA 3DXQA 4I0TA 2W99B 5FEDA 4DH7A 3OCGA 1W7HA 4C4HA 1JSUA 4MH7A 3UO5A 2UZTA 2I0EA 5DE2A 5CEQA 1BUHA 3HP5A 4ALVA 3TV6A 3ZUUA 5CX9A 3K3JA 3AD6A 3SV0A 2YLFA 3VS6A 4QTBA 2GS7A 2FGIA 4DC2A 4HVGA 3LXKA 1H4LA 1A9UA 2OH0E 3DZOA 2GS2A 1NVQA 4C62A 4CCUA 4C61A 3DJ6A 3P1AA 2EVAA 2XBAA 2B4SB 3IDPA 3IPHA 2C69A 3VO3A 3N4UA 3PLAE 4GFMA 4EORA 3O7LB 4JVGA 4UALA 5M4UA 5FQDC 3TUDA 3CTJA 4FTMA 2VWBA 4GRBA 2EWAA 2IPXA 4O0RA 3DK6A 3JUHA 4GU9A 4K6ZA 5DT4A 2RGPA 5JZNA 4YO4A 4I24A 4YLJA 3PYYA 2H8HA 5IUGA 4F99A 3I79A 2HZ4A 4GV1A 3VUGA 4BYIA 2IN6A 3VS2A 4FKIA 2ZV8A 3R7GA 2J0IA 3QKLA 4I5PA 4N6YA 5CSHA 3GNIB 2ZV7A 4J1RA 3GXLA 2X2LA 4BI1A 1SMHA 2BCJA 4GSBA 1KWPA 2GNJA 3FAAA 5CTPA 5CAPA 5KNJA 3T3VA 4OTQA 4MAOA 1H1QA 2VN9A 5CNNA 3VRYA 3QQGA 3ZBXA 2JFLA 4OT6A 2OZAB 4M68A 4Y72A 4QMQA 1JKLA 4QP2A 4RC4A 4H3PA 1OBGA 3DDQA 3SW7A 4L44A 4FT7A 2XK6A 2J0MB 3ET7A 5GNKA 4FSTA 1ERKA 4CG9A 4EOJA 4RBLA 5HG5A 4DEAA 4AG8A 5DRDA 4YJRA 4KIKA 4DFZE 4IM2A 4YURA 1Y6BA 4KS7A 2B9FA 4EONA 3BLRA 3ORZA 4CVAA 4YMJA 4EWQA 5L8JA 5J5SA 5M4IA 3EFKA 3FHRA 3MTFA 4HNIA 4JDJA 3QKKA 2I6LA 2E9OA 3ANQA 2CGWA 4YZCA 3R02A 2HY81 3DGKA 4PV0A 2R3LA 4BDCA 2C6LA 3D14A 5CLPA 4F9CA 2Z02A 3G2FA 4NL0A 1GIJA 3NUSA 3PXKA 4U3ZA 3P86A 4YJUA 2IW9A 4H05A 3BHYA 4GL9A 4O91A 3JXWA 4RVKA 4DG0E 4NK9A 1OUYA 4BCHA 5J9YA 4TWCA 1OKVA 2Z7SA 2XEYA 3MH3A 4IX4A 2VO6A 2OSCA 4TYGA 4RJ4A 3C4FA 4V04A 5FM2A 3D7TA 4ZLOA 3EQDA 3Q2MA 4PPBA 5LJJA 3NMUF 5CXHA 5E1EA 3DAJA 3UJGA 2QD9A 3FMMA 4KKGA 3PVUA 1J1BA 4YZNA 2HY0A 3TNQB 1U54A 2HW6A 3QZHA 3UE4A 3SOCA 2BZJA 5I4NA 3MFUA 5AAEA 2ITQA 1FOTA 3AMAA 4OTGA 4AOJA 3UOLA 2QOKA 3R9NA 3CP9A 4QNAA 3EWHA 5EDPA 1ND4A 1Q3WA 5JFXA 1WFCA 4FKSA 2QLUA 4A9TA 2ITYA 4DAWA 5A6OA 1X8BA 3HRFA 4TTHB 2BAKA 2W1HA 5JRQA 4U44A 4DFBA 2GTNA 2C5NA 4ZEGA 3PJ2A 4XBUA 3O50A 5AP2A 1OI9A 1XKKA 3BE2A 3DBQA 4J96A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1U5Q A;  3V8T A;  1T45 A;  4EH5 A;  3W33 A;  2JDO A;  5CU3 A;  3NIE A;  3LCK A;  3ETA A;  4S34 A;  2ERK A;  4IVD A;  4ERK A;  3G9N A;  4QMU A;  4PP7 A;  4RIX B;  3KXG A;  1OPK A;  2JKM A;  2Y4I C;  4BTF A;  2XIX A;  3RPR A;  4B8L A;  4FII A;  5BVD A;  1OIQ A;  4RMZ A;  1T46 A;  4ZLY A;  5KKR B;  4MNE A;  3LMI A;  4EUU A;  2J0L A;  3ZM4 A;  4FX3 A;  4G3E A;  4CKJ A;  2WMA A;  4HPU E;  1FGI A;  4R7B A;  4O21 A;  5M55 A;  4EH2 A;  5DG5 A;  5IQI A;  2G01 A;  5AIK A;  4UYN A;  5ANI A;  3UNK A;  2XS0 A;  1YXT A;  2CJM A;  1H01 A;  4MQ1 A;  4GK3 A;  4OTW A;  4WSY A;  5K3Y A;  2J2I B;  2OK1 A;  3BYU A;  3LFE A;  4ZLZ A;  3K3I A;  5DT0 A;  5JKG A;  3AOX A;  2RFN A;  3OUK A;  4DEG A;  2ZM3 A;  4E6A A;  4FVQ A;  3AQV A;  2VGO A;  4IE9 A;  3GU8 A;  4AZF A;  4O83 A;  3OG7 A;  3EQF A;  2ZV9 A;  3HMO A;  1OVE A;  4MED A;  4ZAU A;  5J5T A;  1YQJ A;  4BDK A;  4PNK A;  5KMJ A;  3ATS A;  4EOM A;  2WIH A;  3IKA A;  3C0I A;  1PF8 A;  3QC4 A;  4F63 A;  5K0K A;  3Q5Z A;  4DGL C;  4PL4 A;  2IZS A;  4W4Y A;  5CQW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3I81 A;  3Q9X A;  4JBQ A;  4HZS A;  3A61 A;  4QPA A;  2WQE A;  1CKJ A;  3A7H A;  4ANL A;  5J79 A;  1J3H A;  4AXA A;  4U9A A;  4AN3 A;  4BCM A;  2W1G A;  3E3B X;  1W2D A;  2UZW E;  4R3R A;  1R1W A;  5TF9 A;  5EDR A;  3DCV A;  5B0X A;  4CLI A;  3IO7 A;  5CZH A;  2JDV A;  1FBN A;  5LQF A;  1H25 A;  1H0W A;  4E7W A;  1PXM A;  3QLF A;  3FYJ X;  4TZR A;  2YIQ A;  4XLV A;  3DPK A;  3ZZW A;  3H0Y A;  4RRV A;  5LVM A;  3WBL A;  3QD4 A;  4BJJ A;  1Q5K A;  4QP6 A;  3FL4 A;  4QNY A;  4C58 A;  5A9U A;  1UWJ A;  1WZY A;  2HXQ A;  5HVK A;  3NVM B;  4CMO A;  4Y8D A;  3MV5 A;  2J5F A;  3C9W A;  5AMN A;  4TYJ A;  3RK5 A;  4EH3 A;  1JSV A;  5K5N A;  2CMW A;  3IW8 A;  5BUJ A;  5I9Y A;  3PVB A;  3RPY A;  3EN9 A;  3DT1 A;  4BDD A;  4X2K A;  2YIS A;  4BC6 A;  3PDT A;  2PVJ A;  3GEN A;  3DKO A;  4WNM A;  3ZBF A;  1FGK A;  1XH8 A;  2PML X;  3BQC A;  4EZ3 A;  4DG3 E;  4IAY A;  3K54 A;  4MNE B;  2OI4 X;  3QTX A;  1YOL A;  3UVR A;  4ARK A;  3OWP A;  4HW7 A;  3NPC A;  4CZY B;  2ONL A;  5HG9 A;  1KV1 A;  3I6U A;  3ULI A; 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