5B8HA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase (pank iii) from burkholderia cenocepacia complexed with pantothenate, imidodiphosphate, and amp
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
SEPHLLIDAGNSRIKWALADARRTLVDTGAFGHTRDGGADPDWSRLPRPRGAWISNVAGADVAARIDALLDARWPGLPRTTIRSRPAQCGVTNGYTTPEQLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGCFTGGLIAPGWALMMRALGTHTAQLPTLTTDIASGLLAGAQAEPFQVDTPRSLSAGCLYAQAGLIERAWRDLVAAWQAPVRLVLAGGAADDVARALTIAHTRHDTLILSGLALIAAD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Type III pantothenate kinase
publication title Crystal Structure of Type III pantothenate kinase (PanK III) from Burkholderia cenocepacia complexed with pantothenate, imidodiphosphate, and AMP
rcsb
source organism Burkholderia cenocepacia (strain atcc baa-245 / dsm 16553 / lmg 16656 / nctc 132
total genus 74
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2015-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5b8hA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5b8hA02
3LM9A 4BR4A 1S22A 5KPTA 5FPDA 3LDOA 1ZBSA 2NZTA 1K8KB 1NWKA 2GWJA 2ZWHA 1LCUA 1XC3A 3J8AA 3BEXA 1NLVA 3MN5A 3H45C 1QQNA 1BA1A 3H6EA 1NM1A 3IFRA 1NBWA 5BPNA 1NGFA 5KQDA 5JLHA 4H5NA 4PL8A 1HLUA 2GUPA 4BRHA 4BRGA 4DCHA 3GE1A 4IO8A 5AQIA 4A2BA 4BRQA 3VEZA 3U9DA 5E84A 4BRKA 1LOTB 3QB0A 3L6QA 1TYQB 2UYTA 3FR0A 3W0LA 5AQNA 1QQMA 1NGIA 4Z94A 4BRIA 5LJWA 3U9ZA 1JCFA 3FGUA 1GLBG 1C0GA 2KHOA 2IIRA 4BVOA 4H5RA 5LY3A 5ELZA 2P9LA 2Q1NA 3CIPA 4A61A 3WQTA 2ZF5O 2J4RA 3H1QA 5AFUH 1HKBA 2Q31A 5AQZA 2FSJA 3CJ9A 2D1KA 2P9UB 5KPZA 5AR0A 4B9QA 2QWQA 3FLCO 3L4IA 1X3NA 1K8KA 4BR2A 4LC9B 4BR9A 1KXPA 5FPEA 2V52B 1QQOA 3ZEUA 2I7NA 1NGHA 4ISGA 5ADXA 2GTDA 2P9IB 3S41A 3KHYA 3MN7A 2NRHA 3CJCA 2A40A 4BQLA 4FWQA 3JXUA 3MK6A 4FWRA 1GLDG 1HUXA 1BO5O 3ZETB 4F9OA 3AAPA 3UE5A 3EZWA 4H0VB 3GG4A 4IWVA 5FPNA 5CE3A 4CZJA 3A5OC 4B1XB 3GDQA 4A62A 4BC5A 1TYQA 1RGIA 3O5BA 3SK3A 3L0QA 4BRDA 4XH5A 3UKRB 3KVGA 5AQQA 2QWMA 2P9SB 2VWBA 2W41A 3B8AX 4K42A 2P9PB 2E8AA 3ULEB 3CERA 2AP1A 1NGCA 3MCPA 4O8KA 1MWKA 4EAHD 2A42A 3HI0A 1TUUA 1YUWA 4CZEA 5KPRA 5BRHA 3D2EA 3FZLA 4BR0A 5AFUA 3VF6A 2P9UA 4H0PA 3ENHA 4JHDB 4CZHA 1WOQA 1NGEA 5E26A 2YI1A 3I8BA 3MMVA 3O80A 2YHXA 5AQMA 4CBWA 4FWNA 5BRDA 1Z05A 4FWLA 2A6AA 2Q0RA 4MLEA 2FF6A 3P4IA 5F2RA 4DB3A 3QFUA 3IMXA 2GELA 2P9IA 3CHWA 2ASOA 1T6CA 1XUPO 5JICA 2BTFA 2F9TA 3VEVA 3BF1A 3SJHA 3SMPA 3CQXA 4CZGA 3ZETA 3LDLA 4FPAA 3SLCA 3EKSA 4BGBA 4FWSA 1DGKN 4EIAA 2QWPA 3O1WA 4H0OA 5BRFA 4CZIA 4BRNA 2ZGYA 3CJ1A 5AQOA 3UKRA 1TUYA 3VEYA 5AQWA 3ZEUB 2P9SA 2E2NA 3ENOA 5ADXH 1NGGA 2P9PA 1E4GT 3ZX2A 3A0IX 3ULEA 3MN6A 3VPZA 1KAZA 4FPBA 5JMVA 5EXWA 1U6ZA 3VF4A 1S3XA 1XQSC 1C0FA 5BPLA 1EQYA 2A3ZA 4BRCA 1T44A 1KAYA 3HTVA 1BOTO 1WUAA 3VETA 4JHDA 4DQ8A 1HPMA 4H0YB 2DPNA 1GLAG 3H46O 2A41A 4BGAA 3R9PA 1P8ZA 3MN9A 2Q0UA 4PKGA 2FXUA 4RCHA 2Q36A 4IZ9A 2YJEA 2HF3A 2IVNA 1YAGA 4RWTA 1JCEA 2P9KB 3A5MC 4PKHA 5AQSA 1JCGA 1X3MA 3G25A 3WXKA 3D2EB 3QMLA 1U2VB 3BP8A 4M7YA 1QZ5A 1DKGD 3AY9A 3CETA 2H3GX 4K43A 2FSNA 4CBXA 3QBXA 3U8XA 4EFHA 2E2PA 4CZKA 5FPMA 1ESVA 1SQKA 1NGBA 2HMPA 5AQLA 4JD2A 3RSEB 1YXQA 1RFQA 2EWSA 3OHRA 4ISEA 2GEMA 4H5TA 3EL2A 2PBDA 4H0XB 4CJ7A 4XEIA 3VGLA 3CJBA 1BG3A 3CQYA 4EHTA 1NGAA 2D0OA 1X9JA 4FWKA 4BG9A 4WQ4C 4AM7A 1BDGA 4CZFA 2Q2RA 3I33A 5JLFA 2QM1A 4B1WB 3VERA 3M1FA 3H3NO 5AQTA 4B1YB 4NO7A 1DEJA 4MLHA 3IDHA 2P9KA 5EOYA 5LJVA 1MA9B 3CJAA 1U2VA 3BUZB 2CH5A 2E2OA 3A5NC 5B8HA 3HM8A 2YJFA 5AQVA 3JS6A 3R8EA 4MO5A 4CBUA 4ISFA 3VESA 3HBTA 4JAXA 3VF2A 3LDQA 3C7NA 4K41A 2OANA 4PL7A 3EKUA 3QDKA 4CD3A 4HWIA 4KBOA 1HKGA 3RSEA 3EO3A 4IJAA 4C23A 3DXMB 5AZIB 2D4WA 3FE1A 2D0PA 2IVOA 3DJCA 3QBWA 3WEEB 2FSKA 3WQUA 3LL3A 3CI5A 4HTLA 3O08A 5F1XA 2HOEA 3GOIA 2YHWA 4H5WA 4WQ4A 5AQYA 4BREA 4QS8A 3VOVA 3TPQA 5AQHA 4NB4A 3GL1A 4JNEA 1GLFO 3O8MA 3R6MA 4GNIA 3D2FA 4MO4A 1ZXOA 4GY2B 4IXCA 4JD2B 5AZJB 4YDUC 4FWPA 3ATVA 3WT0A 5TKYA 3VEOA 2GWKA 5KQ8A 1ATNA 3UKUA 5BPMA 2Q97A 1V4TA 2NLXA 3VGKA 3C0BA 4BRLA 2A5XA 3UB5A 5BN8A 5AQPA 2ASMA 4H5VA 5AQJA 3DXKB 3WXIA 4B1ZA 1IG8A 4O5FA 1QZ6A 4A2AA 5F0XA 2FF3B 1IJJA 1ATRA 3H3OB 4BC3A 3FZKA 5BR9A 3DXMA 4BRMA 4FWOA 5AZIA 1Q18A 4BRPA 1MDUB 3WEEA 4BRFA 3IUCA 2QWOA 2QWLA 1NMDA 3A8YA 5BN9A 2V7ZA 2YCHA 2ZGZA 3CJ7A 2E1ZA 2V7YA 4QS7A 3DWLA 1BUPA 1HKCA 3VEXA 3AARA 2F9WA 1OKJA 3C7NB 4YDUA 3GBTA 3QICA 2CH6A 3MDQA 2QWNA 1V4SA 3ZX3A 4B1VA 5AZJA 3VENA 1D4XA 1KAXA 2ASPA 4Y0WA 2AA4A 3TU5A 1YVNA 4CZMA 3FFKB 4E1JA 3ID8A 3AAQA 2P9NB 4H03B 2IVPA 4BVPA 5EVZA 4BRAA 4BC4A 5AQFA 4FSVA 4I6MB 4BROA 4AM6A 1GLCG 2QWRA 4DHYA 3DXKA 4WYBA 5AQUA 1HX1A 3VEWA 1BA0A 1ATSA 5BREA 4J8FA 4FL9A 2BUPA 3DAWA 3HZ6A 3O1BA 2E1YA 3D2FB 1NGDA 3ATUA 4B1UB 3WUHA 3VGMA 4FWMA 5AQRA 2CGLA 3ZX0A 1Z6RA 3WXLA 4QS9A 3WXJA 4H0TB 1ZC6A 4CD1A 2HF4A 2YHYA 4WQ5C 1SAZA 4BR7A 1BU6O 2E20A 2FLOA 3UKUB 3LDNA 1RDWX 4JN4A 3LM2A 5EY4A 1R59O 4BQZA 3W3DA 4M63C 1Y64A 1SZ2A 3SMSA 3QFPA 3F9MA 4EHUA 5AQXA 3O4WA 1J6ZA 1GLJO 3HSCA 2CGJA 4K25A 3FZMA 4PKIA 1G99A 4FOIA 2WUSA 3O6WA 4CI6A 5EX5A 1QHAA 2I7PA 1T6DA 1GLEG 4BR5A 2W40A 1MWMA 3FZFA 2P9NA 3LDPA 4CZLA 2PAVA 1H1VA 5I9EB 3FZHA 5AQKA 4I6MA 1CZAN 3EN9A 2VYPA 1GLLO 1HJOA 2E88A 3M6GA 4RTFD 4XH1A 2ITMA 3A5LC 3BF3A 1NGJA 3M3ZA 2CGKA 4FO0A 4L3QA 3KZBA 4WQ5A 2QXLA 4M7XA 4FOEA 2P9LB 2E2QA 3U4LA 2V51B 2VCPA 1E4FT 4IJNA 4BC2A 4BG8A 4XH4A 3H1VX 2QW9A 1BWFO 3D7EO 5AQGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DV0K 5KPTA 2WBNA 3B6PA 3OYLA 5C2FA 3VA3A 4QOZB 3LDOA 2NZTA 2GWJA 5HL7L 4FXDA 4CFBA 1XC3A 4J2AA 3J8AA 5LMUK 4Z4HA 4KB1A 2F8SA 3IFRA 1NBWA 5KQDA 4JI5K 4H5NA 3DM2A 4JKHA 2BANA 1TKXA 4A2BA 3T1YK 3VEZA 1BQMA 1RT1A 3S9HA 3T1HK 1LOTB 4JEPA 3KKSA 2LSNA 2VQFK 1ZBFA 3SUOA 4Z94A 1NGIA 2UUCK 3CC7N 3U9ZA 2KHOA 2GUIA 3QEPA 4H5RA 2Q1NA 4CERA 3WQTA 1TV6A 3TTDA 1VSEA 2J4RA 3LDSA 1TK0A 4IO9L 5AQZA 4DFJA 1NKEA 2D1KA 1S1XA 5KPZA 1RBTA 3L4IA 1X3NA 3Q7BA 4KPYA 3OS0A 2I7NA 2PZSA 5ADXA 4U7BA 5GAGP 3BZCA 2GTDA 4FZZA 4C1NK 3MN7A 4C1NI 2OPQA 4U67L 3JXUA 4FWRA 1GLDG 3V9XA 3QNOA 4DTMA 3EZWA 4H0VB 3K2PA 1JLGA 4RW7A 4G1QA 2HHUA 1T3VA 3HOTA 1KFDA 1TYQA 1X9MA 4FLYA 3PUFA 4XH5A 3P83D 5IT9O 3KVGA 1HNVA 3CG7A 4CGHA 2QWMA 3OYCA 1T7PA 3LPUA 1RNHA 4B3RK 4FJKA 1HNIA 1NGCA 3F73A 3OW2M 1KLMA 4CEBA 4OX9K 3VF6A 4EP4A 5HLFA 1JLAA 4DSJA 4CBWA 1QSYA 5BRDA 1Z05A 2A6AA 4MLEA 5F2RA 3HXMA 4CIGA 3QFUA 4DB3A 4DR6K 2P9IA 2HNZA 4WF9L 3SNNA 1YIJN 1T6CA 5JICA 2BTFA 4O4GA 3VEVA 4DLGA 2XRIA 3SJHA 3KJVA 3CCEN 3LDLA 3SLCA 4BGBA 3NH2A 4CJKA 3AVFA 3P31A 3G71N 4DTNA 5BRFA 3AA3A 4KAZA 4CESA 3KD1E 4B3SK 4KH6A 4F2SA 5AQOA 5HOOA 4FJ8A 1TUYA 3SBGA 1JL1A 3VEYA 1I94K 4Z4CA 5AQWA 4FM0A 3HRGA 3U3YA 1W7AA 1KAZA 4LH4A 1X9SA 3TARA 2WC9A 1R0AA 5CZ2A 4AHSA 1C0FA 5T7BA 4DWIA 4DFPA 3M8SA 1ASVA 4NXMK 1VQNN 1BIZA 4KHWA 3BZKA 2HHXA 4YY3K 4BGAA 4FCYA 3R9PA 3SAGA 1RT7A 4DTOA 4M3ZA 3G6EN 1TK8A 3KTQA 2VGMA 2KFZA 4RWTA 1JCEA 4IFVA 1O1WA 5AQSA 1X3MA 3D2EB 3QMLA 4DFKA 5C15A 1DKGD 3K9JA 2NRZA 3O3HA 1UA0A 2G8FA 3J80O 3HJFA 2D0CA 3QBXA 3VQEA 3K59A 2RN2A 1ESVA 4J2BA 1SQKA 1Q82O 4HCCA 3HO1A 4JD2A 1XWLA 4CEEA 4FJMA 4OVLA 1N34K 5HP1A 4WCEL 2UXCK 4YOXA 3PSFA 5DK5A 4J2DA 3H08A 4RW9A 2ITGA 3V9ZA 2PBDA 3K57A 1W9HA 2QA4N 1BIUA 2VGNA 5M1QA 4TSXA 5I42A 4O44A 2D0OA 2WFBA 4WQ4C 2OPRA 1VK0A 2O8EB 1UWBA 3I33A 2QM1A 4CJ5A 2E4LA 3CPWM 3M1FA 3H3NO 4ILGB 3TTFA 1HNXK 3IDHA 4O0IA 3WNHA 5LL6Z 4WE1A 3TI0A 3CJAA 3CFRA 1U2VA 3BUZB 3DYAA 2CH5A 2Q3SA 3C95A 4OJRA 4BE1A 4W5QA 1J5OA 4JK8A 3NBPA 3R8EA 2IC3A 1VSJA 1NK5A 3I56N 4IBNA 2RF2A 4DG1A 4K41A 2OANA 4FK2A 3C6UA 3KWGA 4CD3A 4HUFA 2QK9A 3RSEA 3KWIA 4KHNA 2WTUA 4DTPA 3EO3A 3UIQA 3D0PA 3DXMB 1WAFA 2D0PA 1DT9A 3L4QA 2FBVA 3CI5A 1VQ4N 1EKEA 3D6RA 4WQ4A 1NJXA 4QS8A 3OBYA 3VOVA 4Z4IA 5AQHA 3VQQA 3GL1A 4JNEA 1GLFO 3O8MA 3S3MA 2JLEA 2YKMA 5AZJB 3TAPA 4YDUC 3C65A 3MXMA 3VQBA 2ZJPL 4LF7K 2GWKA 5KQ8A 1ATNA 4MDBA 1C0TA 2Q97A 1KVCA 1TVRA 2A5XA 2FBTA 5J2PA 3SZ2A 3VN5A 3PIPL 1KSPA 5GAHP 3QESA 5AQJA 4KHQA 3TAQA 2HVHA 5F0XA 3H3OB 1IBMK 3MAQA 1OVQA 4BRMA 4JKGB 1MDUB 2IS3A 3IUCA 3CFOA 3A8YA 3LAMA 5BN9A 1Z26A 3CJ7A 1VQ7N 1BUPA 1HKCA 2G8KA 1OKJA 3C7NB 4YDUA 1TKDA 4Z4GA 1OVYA 4FW2A 2XY7A 4R79A 4B1VA 3L8BA 4AILC 1KAXA 5GIPA 3SYZA 2ASPA 4KKOA 2EHGA 1YVNA 3FFKB 4KREA 1QQCA 3ID8A 3EYZA 1C1CA 3QIOA 3THYB 3DRRA 3I8DA 4LF9K 1RDCA 1EWRA 3CCSN 1T8EA 5AQFA 3TABA 4I6MB 3L2RA 4C8NA 4CJ3A 2B6AA 5AQUA 4JLHA 1ATSA 2B4JA 5KI6A 3KD5E 2BUPA 4V19S 1NGDA 5HBMA 4FJ7A 3SUQA 3WNFA 2HF4A 1GOBA 5CYMA 4BR7A 2VQEK 3LDNA 3C94A 3LM2A 4ILJA 5EY4A 1REVA 4JRQA 4CF8A 2W6KA 4LH5A 4M63C 1Y64A 3HT3A 3BY5A 1BGXT 3F9MA 3SPZA 3F5TA 1VQ9N 1J6ZA 1Q86O 2CGJA 4K25A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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