The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGCTTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| publication title |
Rotameric preferences of a protein spin label at edge-strand beta-sheet sites.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| total genus |
14
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ON8 A; 2JWU A; 4HJG E; 2LHE A; 4OZA A; 2K0P A; 1K52 A; 1HZ6 A; 4GLS C; 4KGT A; 1K50 A; 5HG2 A; 1IBX A; 4D2K A; 1EM7 A; 2OED A; 2LUM A; 1FD6 A; 2J53 A; 2ONQ A; 4OZC A; 1MPE A; 2EEL A; 2JSV X; 2PLP A; 2ZW1 A; 5HI1 A; 2PTL A; 5BMG A; 4KGR A; 5JXV A; 2RMM A; 4OZB A; 1IBX B; 2KDM A; 1XCT L; 1XF5 L; 2IGH A; 2J52 A; 2PW9 A; 2KWD A; 2IGD A; 4IOI E; 1D4B A; 1HEZ E; 2N7J A; 3FIL A; 2I38 A; 2N9K A; 1K53 A; 1F2R C; 2LHD A; 1IGC A; 2N9L A; 1MHH E; 3V3X A; 1YMH E; 1IGD A; 1HZ5 A; 5BMH A; 1K51 A; 1Q10 A; 1PGB A; 2GI9 A; 1PGX A; 1FCL A; 1UWX A; 2GB1 A; 2NMQ A; 5HHD G; 3FIL B; 4IKG A; 2JU6 X; 2KAC A; 3UI3 A; 4WH4 A; 2I2Y A; 1YNT E; 2LGI A; 2RPV A; 1P7F A; 1F2R I; 3GB1 A; 1PGA A; 1KH0 A; 1MVK A; 2IGG A; 4KGS A; 2JXT A; 2QMT A; 2KQ4 X; 2JZP A; 1QKZ A; 1C9F A; 1MHX A; 1ZXH A; 1FCC C; 1MI0 A; 2ZW0 A; 4HKZ E; 1XCQ L; 1GB4 A; 2KN4 A; 5HFY A; 1JML A; 1P7E A; 1GB1 A; 5BMI A; 4MAC A; 2QSD A; 3MP9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4WQM A; 3RMK C; 3U2S C; 4DQO C; 2G3Q B; 2BT6 A; 2WS3 B; 2W9N A; 3C19 A; 4DHJ B; 3TUO A; 3PLU A; 2PIA A; 2MBO A; 4YL8 A; 5E6P A; 5CHF A; 1C3T A; 3DHG C; 1PYW D; 5D94 A; 4C7Y A; 1TS2 A; 3QJZ A; 2FAZ A; 1WMH A; 3OLM D; 1RAX A; 4LCD E; 1E90 A; 4JQW C; 1AYF A; 1FXT B; 3GP7 A; 1ZPS A; 4WWP A; 4YXD B; 2Z0E B; 4KZ0 A; 4K7W A; 4IOI E; 2MX2 A; 1IP9 A; 1D3Z A; 2WXK A; 4KZC A; 4YWG G; 2INN E; 4MGK E; 1F2R C; 1L7Y A; 2AEH A; 2ZNV C; 4LNF A; 1OFF A; 4GN1 A; 2LZ6 A; 3J9C A; 2PVG C; 1UBQ A; 4IWP A; 3ML8 A; 3Q8C A; 1OQQ A; 4OVZ A; 3GE8 C; 3A9J B; 3ZQ4 A; 1UWX A; 2M8S A; 4XZ4 A; 5AZG A; 3AE6 B; 4IC7 B; 4GU2 A; 3ZYY X; 1DYQ A; 2ZJD A; 3P4Q B; 4HDO A; 3UI3 A; 1OQY A; 2ZNV B; 4BKG A; 1E7V A; 1V9J A; 3ETR A; 2KWV B; 2KTR A; 3MC8 A; 3VRA B; 3ZXR A; 1MVK A; 2NPT A; 1QKZ A; 4OVU A; 1C9F A; 1XLP A; 1MHX A; 3KUD B; 4K1R B; 3PT2 B; 2N4F A; 4US9 A; 5DPT A; 3RZF A; 3V62 A; 1TTN A; 3I9V 1; 2VZK D; 3CMM B; 1B1Z A; 3H1U A; 4JE3 B; 1XLN A; 4OZA A; 2EKI A; 4ZHP A; 3A1Q A; 3ZTD A; 2L0T A; 1ZOY B; 1TGZ B; 1J8C A; 4XDD A; 3W9C B; 1XD3 B; 3ALB A; 4W9L A; 1T0Y A; 5AUI A; 3MFG A; 4C00 A; 3GE3 C; 2JSV X; 1R4N I; 5G55 A; 3RNC C; 4EZK A; 3MHZ A; 2SAK A; 1C79 A; 3DBL B; 3X23 A; 5BO4 B; 4ICV A; 1WYG A; 5JXV A; 1I4X A; 1TT5 B; 2PW9 A; 2KC2 A; 1V2Y A; 2WXG A; 2NCN A; 3IHP C; 2LXC A; 4HPL B; 1BUI C; 2V1Y A; 3QC8 B; 1Y8R C; 2QHO A; 4W9D A; 3MJ5 A; 4BAX A; 4LJP B; 3DBS A; 2CR5 A; 1IGC A; 3HIZ A; 2NTS A; 2MA9 B; 4RGN A; 2KK8 A; 3LDZ E; 1YMH E; 3C0R B; 1T0Q C; 3IT4 B; 2D3B A; 4DHZ E; 4OW0 A; 3H8H A; 3NHE B; 4IKG A; 4W9K A; 5BYR A; 3M62 B; 3D32 A; 4RNA A; 1UGM A; 2D3A A; 2LWP A; 2YVC A; 3JW0 X; 5AEK B; 2QCZ A; 3W1Y A; 1KFY B; 1JW9 D; 2ZVO A; 1TKG A; 2DYM A; 4BKT A; 1RYJ A; 2M4N A; 3DWG C; 5TSS A; 2BS4 B; 3AEF B; 1UGJ A; 5JHA A; 2WU5 B; 2D3C A; 2W54 A; 4ZRI A; 2A5U A; 1FPY A; 1YIW A; 3A9K B; 4HKZ E; 2KLC A; 4NJ7 A; 1QOG A; 2BVC A; 1J7C A; 4FN2 A; 4JWU C; 1FFU A; 1L4Z B; 4MJS B; 2KVZ A; 2QC8 A; 1ISN A; 1WGR A; 4A6Q A; 1E8W A; 3EEC A; 2MCN B; 3B9J A; 3FAH A; 4KX6 B; 3B08 A; 1SXT A; 1V81 A; 2AQ3 B; 4GLS C; 2KQ7 A; 1NYR A; 3N30 A; 1ZE3 D; 2J0M A; 2FCS A; 3NOB A; 1YD8 U; 5D3D A; 2REX A; 4A55 A; 5EE3 A; 2UYZ B; 2L52 A; 3AH7 A; 1SGH A; 1UH6 A; 2R2Q A; 3UIO B; 3DPD A; 2L00 B; 3DBR B; 4ZRJ A; 1XLO A; 4YSX B; 2B3A A; 4GDK B; 1V97 A; 4OZB A; 2RDH A; 2IGD A; 4FLH A; 2MBH A; 2DZM A; 1JWB D; 2FNJ B; 2D10 A; 1GJZ A; 1YQB A; 2MBB B; 2MJE A; 1P98 A; 2PKO A; 1VD2 A; 1SE2 A; 3PHX B; 1IGD A; 4WAA A; 3V61 A; 2JQR B; 3TSS A; 1B9R A; 3VVW B; 2WGS A; 2WXR A; 2WXF A; 2BWE S; 2IYD B; 4F8C B; 4W9F A; 4NQK E; 1RFK A; 2N9E B; 2JU6 X; 2BYF A; 4B9K A; 3WAP A; 5EDS A; 4RCO A; 4A20 A; 2KVR A; 1E7U A; 4XC2 A; 3IAM 1; 2RPV A; 1L2N A; 4GMV A; 3VH4 B; 1PGA A; 1F0Z A; 2NBW B; 3Q8E A; 4MH0 E; 1WXV A; 1TZO A; 3CST A; 2QEJ C; 3R7R A; 4GB9 A; 2DHZ A; 2JRI B; 3NVY A; 2DYO A; 5T8I A; 4MEL A; 3ZGZ A; 1I7H A; 2IJ0 A; 1T0R C; 1WM3 A; 3JVZ X; 2JRH A; 1KLG D; 3BII D; 3MP9 A; 2ZVN A; 2LGX A; 1SF0 A; 2IBI B; 1BT0 A; 4N58 A; 2BQQ A; 5LLI A; 2KKC A; 1GUA B; 5G5H A; 3U30 A; 4FBJ B; 1WJ4 A; 5GMV A; 3WAM A; 2WHI A; 3R8B A; 4MGY E; 2K5P A; 4IDI A; 1QOF A; 2V3S A; 2UU7 A; 2DZI A; 5E6N A; 3K9P B; 1SE4 A; 2JT4 B; 2ZW1 A; 5BMG A; 2MBE A; 3VFK A; 2N0S B; 2DBY A; 2INP E; 3Q6B A; 3CF6 E; 1ACC A; 3UIN B; 2J52 A; 1KTK A; 2KAJ A; 4E3C A; 3PZ7 A; 1WMH B; 4JGH B; 1EWC A; 2G4S A; 2I38 A; 2E3T A; 2LUE A; 1Q0W B; 2O6V D; 3DHH C; 3PRZ A; 4RMA A; 2WYQ A; 3BVZ A; 3PZ8 A; 1T6B X; 5AZH A; 1YQ3 B; 2C5L C; 3KUC B; 4ANW A; 2ZPY A; 2BS3 B; 2GMI C; 2WLB A; 5L83 A; 1VDV A; 4ZOH C; 2JYE A; 2MWS B; 2KAN A; 4EOY A; 4ANU A; 1R4M I; 3N9Y C; 1E5W A; 2MLB A; 3HRD D; 4ZDV A; 4REZ A; 4W9G A; 2LGI A; 3W2D A; 1WR6 E; 1M94 A; 1HA5 A; 3AED B; 4A3O A; 4EZJ A; 2NS5 A; 2RDB C; 1UF0 A; 5MPO A; 3UQB A; 4NAW A; 3QA8 A; 4DXG A; 1R4N B; 2IDY A; 1SB3 C; 1GB4 A; 1XO3 A; 3GS2 A; 2MQJ A; 3I57 A; 4GSW A; 1OGW A; 2LJ5 A; 5LNK 1; 3AE9 B; 1MG4 A; 3DOW A; 1IUE A; 4LNN A; 1I4R A; 1RLF A; 4JX1 C; 1EO6 A; 1M4V A; 1X1M A; 2LUM A; 2K39 A; 4LK0 M; 3ZNI D; 3O13 A; 3IAS 1; 4HXD A; 2D2Q A; 1STE A; 2CHW A; 1WE7 A; 2KFJ A; 4KGR A; 3A1Q B; 1QZE A; 4DXF A; 2DNF A; 1T0S C; 1FXA A; 4LLG M; 2IZV B; 2MW5 A; 1YN3 A; 3TEW A; 1WFY A; 2RD0 A; 1YX5 B; 2W3S A; 1VR9 A; 2MH7 A; 3MHS D; 2AYO B; 2GBJ A; 4B0M A; 4WUR A; 1N5W A; 3VUX A; 2Y5C A; 2CU1 A; 3TJP A; 2WXN A; 1DGJ A; 1DOX A; 3ZRF A; 2K25 A; 1E8X A; 2KN5 A; 3ZO5 B; 2C7H A; 3Q3O C; 3PO0 A; 2D3G A; 1XLQ A; 3GOE A; 3L16 A; 1N60 A; 2H89 B; 2KJ6 A; 3VTV A; 2XK5 A; 3ZNZ B; 3M3J A; 1E7P B; 3H9D A; 3B1L X; 1XXG A; 3TEX A; 1JRP A; 2G1E A; 4GXB A; 3E56 A; 1TZ1 A; 2KNB A; 2HTH A; 2N1V A; 3U52 E; 4J3O D; 2ZW0 A; 1S1Q B; 1ZDV A; 1SIF A; 4M8M A; 3RD2 A; 3L10 B; 3W1S C; 2LFI A; 2V3P A; 4WWN A; 4B6W A; 5DCN A; 1OEY J; 3NZ3 A; 4DHZ B; 1YJJ A; 2VZK B; 1JAL A; 1C1Y B; 2K22 A; 4RM9 A; 3BK1 A; 2L05 A; 3WAO A; 2W82 A; 1E8Y A; 4KGT A; 4M0W A; 3TEY A; 5BYS A; 3HM3 A; 4XE0 A; 2OHF A; 4TSS A; 3NVW A; 2LMC A; 4LJO B; 1ZXI A; 4MDK E; 4M00 A; 2XN9 C; 2ONQ A; 4AS1 A; 1JRU A; 3A33 B; 3FC4 A; 4DK5 A; 1D5M C; 5H92 C; 4HVB A; 2JZZ A; 4DWF A; 1Y56 A; 3URY A; 2KYW A; 3TCA A; 2KDM A; 2JZ3 B; 2KWD A; 2K6Q A; 1LGR A; 2CS4 A; 3RCZ A; 1VZ6 A; 3VHT C; 4ITK A; 1H8C A; 5G2N A; 1DOI A; 2GBN A; 2OJR A; 2LHD A; 1QQR A; 2XBB C; 2A4Z A; 1C78 A; 4KV2 A; 2GI9 A; 2I1J A; 3P4R B; 4W9E A; 2J0J A; 4W9C A; 4HK2 A; 1N63 A; 2O2V A; 2KO3 A; 3OAW A; 5E6J A; 3U7D A; 1C77 A; 4MM3 B; 1FRD A; 1ZP0 B; 1FO4 A; 4IM0 A; 3GB1 A; 1WJN A; 5G5G A; 3S2A A; 1UZX B; 4JLC A; 4K7S A; 5CX3 A; 2AQ1 B; 2JZP A; 2VH2 A; 1XQQ A; 5FR6 A; 3Q2A C; 4LNO A; 1NBF C; 2YLM A; 3RUI B; 4RF0 A; 2LI5 A; 2IO3 B; 4BZA A; 3LYY A; 2KFK A; 3TEZ A; 4HJG E; 1WH3 A; 3DHI C; 1HZ6 A; 1WGG A; 1K50 A; 1WI0 A; 3L08 A; 4H2A A; 1YN4 A; 2WXL A; 5KHO A; 3DQV A; 1WM2 A; 2W3R A; 2ZPN A; 4P6V F; 4IM2 A; 1AN8 A; 5J2R A; 2X38 A; 1L6V A; 2V4L A; 1C76 A; 4NJ6 A; 3KVF B; 2BYE A; 1T3Q A; 1PQS A; 3AEC B; 3NVV A; 1V49 A; 3NRZ A; 1F1H A; 3ML9 A; 1QIL A; 1TKE A; 3AV8 A; 4P16 A; 4M8N A; 3RNG C; 1FNU A; 3R66 C; 2G4D B; 3DWM A; 4RF1 A; 1Q5W B; 4TQ1 A; 3FIL A; 2AL6 A; 4KIK B; 4II3 B; 2JPH A; 1SEB D; 1UBI A; 3ZDM C; 1EF1 A; 3Q8B A; 2GLS A; 4HPM B; 1PUT A; 3QAQ A; 1FXI A; 1FCL A; 2GB1 A; 3AEG B; 1BML C; 4KSL C; 2DX5 B; 4ZYN A; 3HM6 X; 3ZKJ C; 3NG0 A; 3AE4 B; 3JSV A; 4WWO A; 4PK1 A; 3Q3M C; 3AE1 B; 3KYD D; 3EGR A; 5EE9 A; 3PRM B; 3N1Z C; 2BB5 A; 1FCC C; 2KTF A; 3NVZ A; 2GOW A; 3BYY B; 3Q69 A; 2IO0 B; 4AP4 C; 3KH0 A; 4B0E A; 1ROE A; 4PYU A; 2OJW A; 1WJ6 A; 2W55 A; 4P1C C; 5BYQ A; 2BBC A; 4PS3 A; 4C56 C; 1OTR B; 3VRB B; 2LHE A; 2DWQ A; 3IXS A; 1NDD A; 4FHK A; 2WDR B; 4NAW B; 5HG2 A; 5E6O A; 1EM7 A; 4RFB A; 2NTT A; 2OOB B; 4NQL B; 1EU3 A; 2G9H D; 1NEK B; 2CHZ A; 4KSK C; 3H7P B; 2JX5 A; 4I6P A; 2K1F A; 2GBM A; 4ZHO A; 3R3M A; 3PHW B; 1TS5 A; 3HVZ A; 4RGO S; 2BKF A; 4C4V A; 2H88 B; 2M0A A; 1WGK A; 4N6E B; 3P4P B; 1V1P A; 1K53 A; 2WU2 B; 2LRW A; 2N9L A; 3R2I A; 4ASW C; 1NEN B; 2O6V B; 1EWY C; 4ZRP A; 5IO9 A; 1PGB A; 3WAL A; 3FKY A; 4K3C A; 3BVM A; 3KYC D; 4J6I A; 2LVQ A; 3KWV A; 4XDC A; 4A9A A; 1HQR D; 2EMS A; 4W9J A; 1VZ7 A; 3T8M A; 4BBN C; 1YNT E; 3DVN V; 3VR9 B; 2IGG A; 1LFD A; 4A90 A; 2QMT A; 2LJI A; 2BPS A; 2KOX A; 5HKH A; 1I4H A; 3Q8F A; 1Z5S B; 1XCQ L; 4DDI D; 1LM8 B; 5HFY A; 3M95 A; 4YTN B; 4AQ7 A; 2XK5 B; 3VH3 B; 1GB1 A; 4MGZ E; 1AAR A; 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5AZF A; 2EEL A; 4G50 A; 1CQV A; 2BYT A; 1R7S A; 2KTR B; 5HI1 A; 4O1N A; 2Z59 B; 2NPT B; 2CU3 A; 1TY2 A; 4MT5 A; 2C7M B; 1ZDX A; 2G45 B; 3DBL I; 4PS7 A; 3VUY A; 1FM0 D; 3SD5 A; 4G11 A; 2HTM E; 2Q5W D; 3KUZ A; 1HE8 A; 2N7J A; 4HEA 1; 3NS8 A; 4CO7 A; 2DYB A; 1AW7 A; 1P9D U; 1S3S G; 2N9K A; 3AMZ A; 3L54 A; 3L13 A; 4WJQ A; 1VRA B; 2L32 A; 2GBK A; 2JUO A; 2C9W B; 5D3I B; 3V3X A; 1WF9 A; 1HZ5 A; 4ANX A; 1LQB A; 4L2Y A; 3PZD A; 1WSP A; 5H8Y E; 3BWU D; 3VTU A; 2NR2 A; 4DXA B; 5HHD G; 3RPF C; 1JWS D; 3FIL B; 3T3O A; 2ASQ A; 2KWU B; 3AB5 A; 2J42 A; 4DBG A; 2K8C A; 3PVL A; 3ZJV A; 2KQ4 X; 1WXM A; 4RGM A; 3ZJU A; 2MBQ A; 4CHK A; 3ZTC A; 3Q3F A; 2IND C; 2RSU A; 4AJW A; 2BKR B; 2QDF A; 3ONS A; 4CYE A; 1SIJ A; 1MG8 A; 4N59 A; 2KX0 A; 3QHT A; 4HPP A; 2Z0D B; 1WXA A; 2KQS A; 4HLE A; 5EE0 A; 1GC6 A; 1P7E A; 1WX9 A; 2FUG 1; 2WDQ B; 2D07 B; 4WJP A; 2MSE D; 1UEL A; 4A3P A; 1K52 A; 1NI3 A; 3QCA A; 1VLB A; 1CZP A; 1VJK A; 2LGS A; 2N9X A; 3ZVV A; 4LNI A; 1CMX B; 2HJ1 A; 3H6N A; 3IFW B; 5LXH A; 4US8 A; 4MSQ B; 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