5BR9A

Crystal structure of an uncharacterized protein with similarity to peptidase yeaz from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
HMSTLLALDTSTEACSVALLHEGRALSHYEVIPRLHAQRLLPMVRDLLDEAGVALSAVDAIAFGRGPGAFTGVRIAIGVVQGLAFALQRPVLAVSDLAILAQRAYREQGAERVAAAIDARMDEVYWGCYQLQQGEMRLAGSEAVLPPERVAVPWDAAAADWFGAGTGWGYVERMPQRPVALDASLLPHAEDLLSLAGFAWARGEGVEAEQALPVYLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Unknown function
molecule keywords Uncharacterized protein
publication title Crystal structure of an uncharacterized protein with similarity to peptidase YEAZ from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa (strain atcc 15692 / pao1 / 1c / prs 101 / lmg 12228)
total genus 63
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00814 Peptidase_M22 Glycoprotease family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5br9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5br9A02
1Z05A 5AQSA 3O1WA 5JICA 2Q0UA 2ASPA 2W40A 3KVGA 3UKUB 1NGHA 4CZFA 2ZWHA 5AQYA 1EQYA 3LM2A 5AQKA 4BC4A 2E2PA 3O8MA 1CZAN 2AA4A 3L4IA 2Q2RA 5AZJA 2P9LA 3H3OB 1NGDA 3EN9A 3HZ6A 4K25A 4A62A 2IVNA 1BOTO 2PBDA 1K8KA 3QBWA 5KPZA 5BPLA 3I8BA 5BREA 3H3NO 2FSJA 3KHYA 4ISGA 2P9NA 5BR9A 1GLDG 5AZIB 1DEJA 1GLLO 1X3NA 1OKJA 3M1FA 3GBTA 1HKBA 5AQHA 4AM6A 3FE1A 3C0BA 1MWMA 1YVNA 3LDPA 1T6DA 3P4IA 5AQUA 3MK6A 3R8EA 3O1BA 3DAWA 3FGUA 4FWRA 4BR9A 1TYQB 2E2QA 4EHTA 1BWFO 3QBXA 4BRFA 4QS9A 4FWNA 2ZF5O 2CH5A 2CH6A 4BRMA 1P8ZA 4EFHA 4B1ZA 3VGLA 5TKYA 3VEYA 4CZKA 3ULEA 3O4WA 3BUZB 3CERA 1MA9B 3CJ7A 4XH4A 3FZMA 4BR5A 4BGBA 2OANA 3A5NC 4RCHA 3WXLA 3VENA 3VEWA 2P9KB 5BPNA 5AQZA 2Q31A 1ATSA 4H0OA 2HF3A 1IG8A 4C23A 4CZJA 1NGCA 5AQWA 3QMLA 2P9IB 2GWJA 1QQOA 4MLEA 1KAZA 3EKUA 3ENOA 3M6GA 3UKRB 5AQLA 3W0LA 4BR0A 4CZHA 5JLFA 3U8XA 5EY4A 4DB3A 4IXCA 4CZIA 3H6EA 1QQMA 3VEVA 1BA1A 3QICA 1H1VA 1GLCG 3LDOA 1WUAA 2NRHA 1GLJO 2E2OA 4O5FA 3IFRA 3A5MC 1NGEA 3TU5A 5BN9A 2QWMA 2E20A 2YHWA 3O6WA 2QWQA 4QS8A 1SQKA 3GL1A 4BC5A 3EO3A 4JHDB 4PKIA 1T44A 3ZEUB 4BGAA 1E4FT 5EX5A 3AAPA 3MCPA 4ISEA 4B9QA 1RGIA 4K41A 5B8HA 4XEIA 4BRKA 4H03B 4BRIA 2FSKA 4FO0A 1XC3A 3MDQA 4BVPA 3ATUA 4BRNA 1SZ2A 2D0PA 2IVOA 2FF3B 2GELA 3AARA 5E84A 5AQJA 3A5LC 1GLBG 5BRDA 1NBWA 1QHAA 3MN6A 1JCGA 1NGBA 3D2FB 2GUPA 3DXMA 1XQSC 4H0VB 2KHOA 4BRCA 1LCUA 2ASOA 2CGLA 3VPZA 1TUUA 4H5VA 2GTDA 4PKHA 1NGGA 2QM1A 3RSEB 2P9SA 3L0QA 4IWVA 4FWKA 1YAGA 3DXKA 1NWKA 4BRPA 3VF2A 2P9PB 2AP1A 3LL3A 4IO8A 5BRFA 2E8AA 1QZ6A 3BF3A 1DGKN 4WYBA 4H5RA 3UKUA 1BUPA 3VF4A 4FOEA 3ENHA 3FZFA 3EL2A 4CZMA 2NZTA 2I7NA 1IJJA 4CD3A 1V4SA 3HTVA 5ADXH 5JMVA 4NO7A 2VWBA 5BRHA 3CIPA 1U2VB 2J4RA 2V7ZA 1C0FA 1LOTB 3FFKB 2QWNA 4H0YB 5I9EB 5AZIA 3O5BA 4HTLA 4BQLA 1JCEA 4BG9A 1Z6RA 1S3XA 1HX1A 1KAYA 4DCHA 4O8KA 3GOIA 5E26A 3VF6A 4A61A 3O80A 3A8YA 2ASMA 4JN4A 1BA0A 3SK3A 4JAXA 3U9ZA 4H5TA 4CBWA 5AFUA 1TYQA 4BROA 4CD1A 1DKGD 1HUXA 1MDUB 3KZBA 3AY9A 3C7NB 3MN5A 5AQOA 5FPNA 2P9UA 3H1VX 3VEOA 3QFUA 1X9JA 1NGIA 1SAZA 1HJOA 1J6ZA 3QB0A 1GLFO 4M7YA 3VESA 2D0OA 4M7XA 5LY3A 5FPDA 2ITMA 2HF4A 4LC9B 4GY2B 1JCFA 3EKSA 1WOQA 1HLUA 3LDNA 5FPMA 2DPNA 2P9KA 4M63C 4AM7A 3QFPA 3ATVA 4BRLA 2FF6A 3UE5A 3SJHA 3CHWA 1RFQA 3UB5A 1G99A 2P9IA 5AQIA 2IIRA 3FZHA 4JD2B 1NGJA 3G25A 4BRQA 2QWLA 3IMXA 3VEXA 4PL8A 2QWPA 4E1JA 1YUWA 3EZWA 3WXJA 3CETA 4A2BA 1NM1A 5ADXA 5FPEA 1QQNA 2V7YA 3AAQA 3CI5A 4B1YB 4EHUA 3LM9A 2QWRA 5AFUH 3F9MA 4WQ5C 3U9DA 3LDQA 4FPAA 1NGAA 3OHRA 1XUPO 3ZETB 2V52B 3FZLA 4ISFA 4FOIA 4BG8A 3FZKA 1GLAG 4H5WA 4JHDA 3BP8A 4IJNA 3ZEUA 1BO5O 4PKGA 4CZEA 4DHYA 1E4GT 4BC2A 4CBUA 3IUCA 4MO5A 4I6MA 1D4XA 5CE3A 5AQXA 2QWOA 3WQTA 4WQ5A 3WEEB 1T6CA 4FWMA 4Z94A 3D7EO 5F1XA 3D2EB 5JLHA 4QS7A 3VGMA 5F2RA 3D2FA 4K43A 4YDUA 1ZBSA 4L3QA 3CQYA 1Y64A 4BC3A 2A40A 4PL7A 4BR2A 3HBTA 3RSEA 2BTFA 3FLCO 4BQZA 4CBXA 1BDGA 4IJAA 5AQMA 2P9PA 5ELZA 3BEXA 5BPMA 3HI0A 4BRHA 5KPTA 3SMSA 2FXUA 3W3DA 5AZJB 5KQDA 2P9LB 4BR4A 5AQVA 5AQQA 4J8FA 5AQRA 5KPRA 1K8KB 1NLVA 3CJCA 5LJVA 2VCPA 4FPBA 3R6MA 5AQFA 1KAXA 1C0GA 3JS6A 4H0PA 2P9NB 3VETA 2CGJA 4WQ4C 2IVPA 3SMPA 4RWTA 4FWOA 1NMDA 2BUPA 1V4TA 1U2VA 2CGKA 4EAHD 2E2NA 1U6ZA 1QZ5A 3I33A 4FWLA 3O08A 3ZX0A 3DJCA 3JXUA 2GEMA 2YI1A 3CJBA 2FLOA 3MN9A 4KBOA 3VOVA 3WXKA 5F0XA 3GDQA 2W41A 4WQ4A 3R9PA 4B1XB 3B8AX 5EXWA 2HMPA 3FR0A 3ULEB 1ATNA 1YXQA 2A42A 2P9UB 2ZGZA 2Q36A 2YJEA 3C7NA 1BG3A 3GE1A 3HSCA 3VEZA 2F9TA 1RDWX 4XH1A 2D4WA 4BREA 2D1KA 4FWQA 5LJWA 2Q1NA 4NB4A 4CZGA 2VYPA 3GG4A 2WUSA 4EIAA 2A5XA 4GNIA 2YHXA 3QDKA 4B1UB 3TPQA 3ID8A 5EOYA 3CQXA 3WUHA 2E1YA 1ZXOA 3MN7A 4DQ8A 4Y0WA 1Q18A 2YHYA 5AR0A 2E1ZA 3BF1A 3CJAA 3ZX2A 3ZX3A 4A2AA 3SLCA 4F9OA 2UYTA 5AQGA 3U4LA 2NLXA 5AQPA 3MMVA 3UKRA 3J8AA 1X3MA 3VGKA 3S41A 4HWIA 2I7PA 1TUYA 4FWSA 4BRGA 3A5OC 2PAVA 4K42A 4JNEA 1HPMA 2A41A 1NGFA 1S22A 3CJ1A 4JD2A 4RTFD 2ZGYA 4CI6A 3IDHA 1HKGA 3A0IX 2QXLA 2H3GX 2YJFA 3DWLA 1HKCA 1ZC6A 4H0XB 3H45C 1ESVA 4IZ9A 2Q0RA 4CZLA 4BVOA 3H1QA 3HM8A 3WXIA 4YDUC 3M3ZA 1ATRA 4BRAA 1GLEG 5AQTA 4FL9A 5EVZA 2GWKA 3L6QA 2A6AA 3ZETA 4BRDA 1KXPA 2F9WA 2FSNA 5BN8A 2V51B 2QW9A 4MO4A 3CJ9A 2EWSA 2Q97A 3LDLA 4MLHA 3VERA 4I6MB 3WT0A 3DXMB 2A3ZA 2E88A 2YCHA 4FSVA 4XH5A 4H0TB 4FWPA 3WEEA 4B1VA 2P9SB 3D2EA 3H46O 4B1WB 4H5NA 3DXKB 4BR7A 3WQUA 5KQ8A 1R59O 1BU6O 5AQNA 2HOEA 1MWKA 4CJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Z05A 1BISA 1IG9A 4BDPA 4DQIA 5KGWA 3CPEA 1JL2A 3KVGA 3AVIA 3CMAN 1TVRA 1JLEA 3LM2A 3DLKA 4KRFA 3VQ9A 1QSSA 1TAQA 3AVAA 1Q8IA 3L4IA 5DMRA 1R0AA 2Q2RA 5FDLA 3EN9A 3OJUA 3NF8A 3QEIA 5CYQA 4CIFA 1BOTO 1K8KA 3QBWA 1TGOA 4DTUA 4DKWA 1WSJA 4DR4K 3H3NO 2FSJA 3KHYA 5M1NA 1S72N 4CJ4A 1Q81O 1Q9YA 1DEJA 1JL1A 3KK7A 2BGGA 3LP2A 1TL1A 3JYTA 5AQUA 4LF4K 3CFOA 4FWRA 1RNHA 3DM2A 2OCEA 2WONA 1UA0A 4BR9A 3CYMA 2E2QA 2FC0A 3QLHA 1BWFO 4CJRA 3QBXA 4QS9A 4FWNA 2ZF5O 4BRMA 4B1ZA 5C25A 1IBLK 3VEYA 4CZKA 3AA3A 3SQ0A 1IH7A 3ULEA 4IG0A 3WNHA 3BUZB 3CJ7A 4HHTA 4JI5K 3FZMA 2E6MA 4BGBA 4C8NA 4RCHA 4DTJA 5J2MA 1ASVA 3EYZA 4CERA 2P9KB 5BPNA 5AQZA 4EZ9A 2HF3A 1FW6A 3TWHA 4OO1J 1NGCA 3BZKA 2P9IB 5M1FA 5FRNA 2B6AA 3EKUA 4YOTA 5AQLA 5JLFA 4KH5A 2KTQA 1VRTA 1BQMA 4IXCA 5HRSA 2YKMA 3C95A 3H6EA 4PY5A 1QQMA 3VEVA 1S9EA 1HNWK 3QICA 3LDOA 1UAXA 2NRHA 3THXB 2EX3A 2XY6A 3LZJA 1D5AA 3PIOL 2KZZA 5C2FA 2ZD1A 4CJTA 4PHTX 3GL1A 1EP4A 3QEWA 4O4GA 3E01A 4YOWA 4GV3A 1BIUA 4PKIA 1XMOK 1E4FT 1L3UA 4B9QA 5HRNA 5B8HA 2JWKA 4XEIA 4JKEA 4FM0A 1XC3A 3MDQA 4LF8K 4BRNA 3OYAA 3EE9A 1NKEA 2GELA 2Z1HA 5AQJA 3A5LC 4J2AA 4Q5VA 4PUOA 4RW6A 1QHAA 3MN6A 1HMVA 3MEGA 2GUIA 3JAMO 3D2FB 2GUPA 4DV2K 4BRCA 1M1KO 2CGLA 3VPZA 3L4QA 1TUUA 4CEQA 3RSEB 3L0QA 3MX5A 4Z4HA 4FWKA 4CFBA 3NH2A 3LWMA 4IOXA 2HHXA 3OVNA 1RT7A 3VMFB 1N5YA 1NU0A 1DGKN 2YHAA 1W0HA 3NH0A 4H5RA 1I3AA 4FOEA 1N8RO 2IC3A 3OYIA 3CCRN 1XNQK 1X9WA 4O5BA 3SAFA 1EWQA 3ISNC 5ADXH 1ZBUA 4NO7A 3A2FA 2AJQA 2VWBA 1VSMA 5H1SQ 3AVJA 1T03A 4CHZA 1RTIA 3TABA 1YITN 1LOTB 2QWNA 3T1HK 1JCEA 4BG9A 2XRIA 1KAYA 4DCHA 3TSQA 3VF6A 3A8YA 2ASMA 4JKCA 4FZXC 4H5TA 1BI4B 3G10A 4DG1A 1MDUB 2D0AA 3O9UA 3AY9A 3C7NB 3LANA 3MEDA 3BZCA 2P9UA 5K14A 3SZ2A 1C0TA 1S6PA 4CJVA 4OPAA 4IOAL 1DT9A 5LMNK 4CW7B 4DUZK 3TAQA 4UY8O 4LF7K 2G8UA 3P39A 2HF4A 4LC9B 1NG9A 4GY2B 3K5MA 4DF8A 3VQ6A 4AHVA 5HP1A 2UU9K 4FLYA 2P9KA 4JRPA 4Z4FA 1HNXK 3QFPA 3LAMA 3UE5A 2OZMA 3SJHA 1B9DA 2F8TA 4DSLA 1OH5A 4B9TA 2P9IA 4DTNA 2ZJRL 2GBZA 4B8CA 4RG8A 2QWLA 4HCCA 5DK5A 1JXEA 2HNZA 5C0YA 2KKZA 2B4JA 2XHBA 2RN2A 3JSMA 2QWPA 4QAGA 3MWTA 1YF5L 4A2BA 1C0MA 3AAQA 2UUAK 3CI5A 4B1YB 1N6QA 2NRZA 5MLCQ 3LM9A 4ZTJA 4ID1A 2QWRA 3F9MA 4WQ5C 3THXA 3MXMA 3U9DA 3LDQA 1SKRA 1NGAA 1RT2A 3CC7N 4B9LA 3OYDA 5DM7L 4IJNA 1BO5O 4DHYA 5GIOA 1E4GT 1TAUA 4BC2A 5C12A 1P90A 3ZSOA 3RWUA 2W6LA 1D4XA 1XNRK 4N76A 5AQXA 4EP5A 4DF4A 2Z1GA 3CFPA 2O4GA 1RDAA 2DY4A 4L8RB 3E9LA 3D2FA 4DTXA 1ZBHA 4M41A 4YDUA 1A5XA 4RW8A 1S1XA 4M45A 2UUCK 1VQ8N 2IGIA 3RSEA 5CHIA 1FK9A 4KH6A 1KFSA 4BRHA 3SMSA 2FXUA 3W3DA 1MU2A 5AZJB 1VQ6N 4CJWA 5KPRA 2VGMA 2HMIA 1NLVA 4U7BA 5LJVA 3QINA 3R6MA 3SPYA 2PFUA 1ILYA 4HUFA 2JLEA 4JS4A 1TL3A 3VETA 4HTUA 3ZT3A 1WSHA 5GAHP 4WQ4C 3SBTA 3NAEA 4Q0BA 3O9SA 5SZTA 3V6DA 2OPSA 2VG7A 2BUPA 2E2NA 4CHOA 3NMUA 2RPIA 3DJCA 1EXQA 4OKEA 4CF1A 3CJBA 3TARA 4KHNA 2D5RA 3WXKA 3V4IA 2HMPA 5JS2A 4XIUA 4W5OA 3PX0A 4NLBA 1BI4A 3HVTA 4CEFA 4DV5K 2Q36A 3C7NA 2D4WA 4CEAA 2O8FB 2ZQBA 4NB4A 3HP6A 4BACA 2VYPA 4FZYA 4GNIA 2YHXA 4IOCL 4DSEA 4B3TK 3QDKA 3TPQA 3CQXA 1EO1A 1LW2A 4YFUA 1ZXOA 3VQ7A 1TK5A 1SL1A 3E66A 3VN5A 3S3MA 4CJSA 1Q18A 2E1ZA 3CJAA 3ZX2A 2G8FA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1Z05 A;  5AQS A;  3O1W A;  5JIC A;  2Q0U A;  2ASP A;  2W40 A;  3KVG A;  3UKU B;  1NGH A;  4CZF A;  2ZWH A;  5AQY A;  1EQY A;  3LM2 A;  5AQK A;  4BC4 A;  2E2P A;  3O8M A;  1CZA N;  2AA4 A;  3L4I A;  2Q2R A;  5AZJ A;  2P9L A;  3H3O B;  1NGD A;  3EN9 A;  3HZ6 A;  4K25 A;  4A62 A;  2IVN A;  1BOT O;  2PBD A;  1K8K A;  3QBW A;  5KPZ A;  5BPL A;  3I8B A;  5BRE A;  3H3N O;  2FSJ A;  3KHY A;  4ISG A;  2P9N A;  5BR9 A;  1GLD G;  5AZI B;  1DEJ A;  1GLL O;  1X3N A;  1OKJ A;  3M1F A;  3GBT A;  1HKB A;  5AQH A;  4AM6 A;  3FE1 A;  3C0B A;  1MWM A;  1YVN A;  3LDP A;  1T6D A;  3P4I A;  5AQU A;  3MK6 A;  3R8E A;  3O1B A;  3DAW A;  3FGU A;  4FWR A;  4BR9 A;  1TYQ B;  2E2Q A;  4EHT A;  1BWF O;  3QBX A;  4BRF A;  4QS9 A;  4FWN A;  2ZF5 O;  2CH5 A;  2CH6 A;  4BRM A;  1P8Z A;  4EFH A;  4B1Z A;  3VGL A;  5TKY A;  3VEY A;  4CZK A;  3ULE A;  3O4W A;  3BUZ B;  3CER A;  1MA9 B;  3CJ7 A;  4XH4 A;  3FZM A;  4BR5 A;  4BGB A;  2OAN A;  3A5N C;  4RCH A;  3WXL A;  3VEN A;  3VEW A;  2P9K B;  5BPN A;  5AQZ A;  2Q31 A;  1ATS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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