5BRBA

Crystal structure of q64e mutant of triosephosphate isomerase from plasmodium falciparum
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
246
structure length
243
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIENVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQRNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Probing the role of highly conserved residues in triosephosphate isomerase - analysis of site specific mutants at positions 64 and 75 in the Plasmodial enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 87
structure length 243
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5brbA00
1GVQA 3NZ1A 4YL2A 1KBIA 1ZAHA 3FOKA 3W73A 5KZMA 3QW3A 3W2UA 4ADTA 2VKZG 3KOFA 3RLVA 1KLYA 1TJRA 1F2JA 3PSWA 3O05A 3TQ0A 1JRCA 1W5MA 3FJLA 4EIVA 1YPIA 1UJPA 5AHNA 4GE8A 3EWXA 4QAIA 5DXYA 1F6KA 3DZ1A 2TPSA 3DFOA 4OGZA 3NM1A 3G1AA 2C6QA 3HGSA 1RQBA 1I2QA 3MO7A 1X8FA 1VZWA 4QIUA 3M41A 3O6CA 1W1ZA 3R13A 1QAPA 3CPRA 3PWAA 3HJZA 3IIPA 5HULA 1C8VA 4PA8A 3W87A 2PRHA 5HWMA 4JY9A 2CW6A 3A5VA 2E77A 3U8GA 3D0CA 3IEBA 5LNSA 4BWLC 1BEUA 6ALDA 1N55A 2FTPA 3EEGA 4MLRA 5K4XA 4I7UA 5AYXA 3L0NA 2PURA 1OYBA 1QNVA 1K8YA 2ISSA 3EWBX 1DQWA 3PC0A 5CG7A 3S9YA 1GYNA 2WJZA 2ZZ7A 1L9WA 3W2LA 1FCQA 4N4QA 5HR6A 3BGJA 3B06A 2CLIA 3UWVA 4JYEA 3TQKA 5KZDA 3LTYA 1S3HA 3P84A 4X9SA 5BMWA 1IXNA 1LORA 3A23A 1W5PA 4XZ9A 2FQIA 2PCQA 4LVFA 4M6PA 3IVSA 2UV8G 2Z0IA 1TTQA 3UD6A 4NNCA 4Y90A 3W1NA 1E51A 1YDVA 3W1UA 1FWSA 3W76A 3N34A 4OWGA 2Y63A 3LRMA 3O07A 3GXTA 4MJZA 2BTMA 3QFEA 4HN4A 4U4MA 2DORA 4LU0A 3PB2A 1EPXA 4WX2A 3HO8A 1W3IA 3EWYA 3TA6A 1OK4A 4O52A 4EF9A 4LVDA 1VR6A 1ICSA 4JTHA 3FIGA 1Z42A 3LV6A 3LB0A 5HJLA 2YYUA 1TB3A 5IBXC 2FPYA 4O0ZA 4DPPA 3NL5A 2WPBA 1FX6A 4RK8A 3KFTA 4DO5A 3MW7A 1WQ5A 3M5YA 3W84A 2DZVA 3JRKA 5AC8A 4CCCA 5DCEA 4HSNA 3NQVA 1T0OA 3QMRA 3GR8A 3G3MA 1PIIA 3LCHA 1FWWA 1PVNA 4RZ4A 4WZHA 3HGRA 5AFDA 4O4WA 3NG3A 4N9EA 4NJHA 1L6WA 5G1TA 2RDUA 4O1BA 1W8SA 3QMSA 3R8RA 2QDGA 4KFPA 1YYAA 2QUTA 4OQVA 1G4SA 4H3DA 1QPQA 1SUXA 1TPDA 4QNWA 3TK7A 2R14A 4M6VA 3OVRA 5D38A 3EXSA 2LLEA 1EUAA 1QFEA 1Z48A 4PL2A 2O7SA 1PV8A 3FEMA 4QJ1A 4CCDA 5DN1A 4JX5A 3HPZA 3THAA 4TX9A 2V2CA 2RHGA 2I9EA 2V9DA 4J9JA 1A5BA 2FLIA 3Q94A 4TMCA 1Q45A 1TPFA 2ZZ4A 3VNDA 4MYXA 1MO0A 2CLEA 2H90A 2XN1A 1I2PA 5D03A 4LWWA 3U2OA 1N8FA 1TRIA 4FO4A 4TIMA 2F84A 3PBVA 5LGZA 3B0UX 4RXGA 1OX4B 3T55A 2HTMA 1YTDA 2NUWA 4Z1AA 3NZRA 1PCWA 3HPSA 2HMCA 3TC6A 3LCFA 4QM1A 1H60A 2QCHA 2HSAA 1B57A 3MP5A 3G0SA 2YCEA 3C6CA 1LYXA 3TXZA 2Y62A 3PS7A 1EP2A 3EXTA 3SZ8A 5LGXA 1ZAIA 3GR7A 3W74A 2J9XA 3KVKA 5BRBA 5EA9A 3KX6A 4E38A 3E9AA 1UUMA 4ZZ9A 1V5XA 3PBYA 1YDOA 3O6YX 3S8HA 4FHAA 5AOUA 5LSMA 5T26A 3L5AA 1KV5A 3ZS4A 1HO4A 1JULA 4DO4A 1W31A 3IV3A 3W2KA 3LRLA 2WNQA 1F6PA 2VELA 5DBTA 4TMBA 5LNVA 4JTEA 1RZMA 2Q8LA 4Z1BA 4X22A 3L5MA 2AGKA 3MJYA 3TW7A 2FJKA 3PG9A 3NA8A 2KZHA 5FEWA 2CZEA 4JTIA 5H2ZA 1JCNA 1R47A 4MUZA 1X1ZA 1P1XA 1F7BA 3F1QA 3KXQA 1IXOA 1OX4A 2FB3A 3W7CA 3QH2A 1DOSA 5A5WA 1FCUA 5HMSA 3LXBA 2ZZ6A 4FXRA 1DVJA 2V30A 5HWJA 1PHQA 1O95A 3M5ZA 2ATSA 3W6YA 4WXYA 3T4CA 3W07A 2QKFA 3R89A 3C2OA 3L68A 3QSRA 1H50A 4JIPA 3UXDA 3W7KA 4K38A 1W5OA 3L2IA 4DELA 3O63A 2YDAA 2V81A 3MBDA 3YPIA 2FPTA 3ZFHA 1KFKA 3W7LA 1SW3A 3LRKA 1W37A 3L65A 4UTKA 3Q2DA 3F4WA 3T7VA 1TPH1 2TSYA 4LRTA 4MFDA 3WJWA 1SSGA 2A7PA 1H63A 3STFA 3UQNA 1WX0A 3PULA 3C52A 2ZRZA 4FB7A 3RF9A 4LUJA 4OU1A 5D04C 1QOQA 3LHZA 2BXVA 2CWNA 4DQWA 4WQ6A 4HNTA 4WOQA 5CPMA 3PSVA 5MHBA 2Y6ZA 4S2BA 4FX7A 1WYIA 1F5ZA 4CQAA 1TREA 3PVFA 4XBSA 1XL9A 1H51A 4JGDA 5I3GA 5HQEA 1LTDA 3OA3A 1WBHA 4FNRA 3V75A 1M7PA 3IIZA 2QCLA 3NQ2A 4I9AA 1A5CA 1U83A 2QDHA 2VEPA 1QO5A 3B4UA 3GDMA 1G69A 3GK0A 3T78A 3UPWA 3KRSA 4K8HA 2PE4A 3TX9A 2DZXA 5U4NA 3M16A 4YXGA 4MIMA 1W5NA 3DAQA 3JS3A 2QUUA 4BF9A 3LXAA 3Q58A 3QQ0A 3P74A 4C1LA 1XCFA 4GUFA 5BOOA 3ABOA 4RJEA 4E2DA 2ZTKA 4IX2A 2QF7A 3STGA 3W1QA 3W1RA 1O94A 5A8GA 1LLZA 3QC3A 3GB6A 2H6RA 4AB4A 3G8EA 3W7GA 4A3UA 2V8ZA 1PL9A 3NO5A 4UTIA 5G2WA 1XUUA 1TCDA 5FEPA 4JYDA 2HS6A 3O1NA 3SI9A 3E12A 2YYTA 3MYPA 4UTUA 2C0AA 1KFJA 2BSLA 3TAKA 4A29A 2VFEA 1SZNA 1B3OA 3V1PA 2PC4A 4FX6M 1AG1O 1BTMA 3SIZA 4AHOA 1KFLA 3BG5A 3GAKA 3LOTA 5AYZA 1EP3A 3M1ZA 1C9DA 3IGXA 2Y7DA 3S0CA 1JCXA 1L6YA 4IMFA 1T96A 3O06A 3MBFA 5G4WA 1LZOA 3EB2A 1Q6OA 2X2GA 2CLOA 3TDFA 2OCZA 1X7FA 1LBLA 3HPXA 2Q3RA 1SQ7A 2H3BA 4WJEA 5I3IA 2E6DA 1SSDA 2TRSA 3HB9A 4G1KA 3DH7A 2AQWA 5D02A 3E0IA 2QJGA 4O18A 2NX3A 4Q32A 5DLCA 2VENA 2FPVA 2YR1A 4S2CA 3L5LA 5CPNA 3DFPA 5L6UA 4Z1DA 1CW2A 3W75A 3GDLA 1Q3NA 4IPIA 4GC4A 4MKNA 1B4EA 3TUUA 3KVLA 3P61A 1OHLA 1G4PA 1H7WA 2P10A 4LV4A 3C2EA 4NJJA 5D2YA 4O53A 2E68A 4YMZA 1M6JA 4IMGA 1CX9A 1J4EA 4IPJA 4FNTA 3LCWA 4GUIA 3W3OA 2V5BA 1YXYA 2A7NA 1TMHA 1DORA 1PCKA 3O15A 1GEQA 1VGAA 1RVGA 5DELA 3MI2A 4R34A 1WBJA 3S5NA 1EWDA 1DJNA 1GVFA 1OFAA 1TQJA 2GPTA 4UTWC 5HUOA 1OYAA 4MY9A 4ICNA 3W1XA 1WOBA 1HO1A 3W7QA 1I45A 3DI1A 5AN7A 2A6LA 2C18A 3P82A 5ABTA 1VCGA 2R8WA 2JK2A 3UY8A 3VI2A 1I2RA 5AHFA 3LXCA 1VYRA 3W1PA 4K36A 4OV9A 3TMQA 2B0MA 1DJQA 4E2BA 1TV8A 1VS1A 3W7RA 4O1DA 2CU0A 4Q33A 4GJ1A 4Q4KA 1LOSA 3B05A 1KTCA 3NNTA 1XKYA 1HTIA 3BW3A 5D2WA 1OF6A 2J24A 3B0PA 1KM2A 4NT0A 1FQ0A 4JEQA 4NJKA 4R53A 3PF3A 3FYOA 4NUWA 3LTPA 1ICQA 1H7OA 4JIQA 1RR2A 1MEHA 4NJGA 3BVJA 4NX5A 2V2DA 5K7JA 5I3JA 2CLMA 4AWTA 3HGJA 1D3HA 1JUKA 3NXFA 3CIWA 4ZL1A 1W5QA 4AHPA 4GRSA 4ONVA 2B7NA 1R2SA 3HMJG 3L67A 1LCOA 1KM4A 1D3GA 5KZEA 5CPLA 1XDMA 1VHNA 4MVAA 4TU1A 2EPHA 1P4CA 3CWNA 3MI3A 1LOLA 1TRDA 2EAWA 3EXRA 2YXGA 4DO6A 3LLDA 3BLFA 5F4XA 1QWGA 3T44A 3FA5A 2XN0A 4XWUA 2GVLA 1WXJA 4C1KA 5K9XA 4DF2A 2EHHA 3Q37A 4UTWA 3WK2A 3HG5A 2QCFA 1EX5A 3WK0A 3FLUA 3GKAA 2JKEA 2QEZA 3EX6A 3P8IA 2W6RA 3TSDA 2VFHA 4O57A 1KFCA 2G96A 3UY7A 1OABA 3LLFA 3QYQA 3HG4A 3GDTA 3WJZA 3EKLA 4NZFA 3DU0A 3W7JA 3W7OA 2BWGA 3P60A 1LROA 5D09A 3W7IA 2WNZA 5I3KA 2OX1A 3RK8A 3NYZA 4EWND 3NPUA 1MXSA 3B04A 3DKJA 1F05A 4IOTA 2AAMA 2ZCGA 2NLIA 4O17A 2YX0A 3LI0A 2JGQA 5KTLA 2Y7GA 1RD5A 1OX6A 2QCCA 4GFSA 1P0NA 3IIVA 1UCWA 3N2XA 2Q3OA 3PB0A 4MLJA 3PM6A 2WSRA 1KFEA 2NXGA 3ABQA 1WA3A 1XBVA 5LNUA 3GDKA 4NQ1A 2PRLA 1G6CA 1S5VA 5AHMA 3VE7A 3OIXA 3FKRA 5FF2A 4NJIA 4Z08A 2CLHA 3ATYA 3DFQA 2ZQ0A 1NAL1 2XFWA 1FY6A 3P62A 4FIQA 2ZA3A 5FI8A 2JKAA 1IIGA 3QPZA 1W3NA 5E93A 5I3HA 3HGOA 1TTJA 1M7OA 1IXQA 1H1YA 1IXPA 5HWNA 2QR6A 3QRHA 2A2IA 3VFLA 4UMCA 2FDSA 1OF8A 3BW4A 3W71A 4BWLA 3KVJA 1LBMA 2PRMA 3NL2A 1W0MA 1VJIA 3JR2A 4PEKA 5F2MA 5LKYA 3LTSA 2WSYA 1K7XA 1DQXA 3LM7A 2DZPA 5DXXA 2DP3A 5EY5A 2YSWA 2YZRA 5EYWA 3W72A 3W9ZA 3GZ3A 2ZRWA 1JCLA 3NQAA 1SZEA 4HNVA 2C1HA 4K39A 1B4KA 1NVMA 2CZDA 1K02A 3QW4B 3EX3A 4WUIA 2R91A 4DF0A 2YGYA 3P80A 1OFRA 3R12A 3LDVA 4UFIA 4O1CA 1KFBA 3LV5A 5CZSA 2WQPA 5G5IA 1ME9A 1JCJA 5DY2A 2G5WA 4MY8A 2E6YA 3OHIA 3KAOA 4BI7A 1R2TA 3EKZA 3QZEA 4FIRA 1L6SA 2EKCA 3A5FA 4PCFA 5FF0A 2YPIA 3P7YA 1H7RA 5HUPA 3RFAA 3C3NA 3LHTA 1A53A 3TU9A 4R33A 3RNDA 5IBXA 1NF7A 1ICPA 4MZ1A 4O28A 3PY2A 3S1WA 4JTTA 5F2LA 3C61A 4JX6A 1O5KA 3W83A 1WV2A 3CU2A 3E96A 3BG3A 1SR9A 1Q6QA 3W70A 3I7QA 4DBEA 2RFGA 5D2XA 3SECA 1TPEA 3H54A 2ZYFA 1FDZA 1ME7A 4LVGA 4FX8A 2HS8A 4FXSA 4IGHA 5CZ0A 4UNLA 2ISVA 2C14A 1LRNA 4NNAA 4HKPA 1G4TA 1VLWA 4N02A 4UTTC 4YCOA 1IIHA 2A1YA 4WOZA 1OFEA 1DBTA 1QO2A 5D2VA 3UWZA 4HHPA 1ZNNA 2O7QA 2P0OA 1QPNA 1LBFA 4KWVA 3GXNA 1J2WA 4N9CA 1UUOA 3I68A 3L21A 3N9SA 5G4EA 3UWYA 4HPJA 3QJAA 4UTJA 3LCLA 3L0GA 2C19A 1AW5A 2A6NA 1H7PA 5CSRA 1FCBA 2H8XA 3GKFA 4O11A 5AHLA 5DCDA 1TV5A 4BR1A 3NQFA 4JDYA 5K2ZA 3I7SA 3GLCA 2I1OA 3BPWA 2VC6A 2ZRXA 4RCXA 3FYPA 4LRSA 4YCPA 3DENA 1R46A 1KLZA 7TIMA 4LV9A 5U7SA 3RU6A 4WXZA 4IWWA 2ZZ2A 4RX0A 3R2GA 4XQ6A 1SZFA 3CT7A 3BV4A 1VYSX 3DKLA 2RKXA 4LY8A 4TO8A 1G67A 4O10A 2QCEA 3P5YA 2B7OA 3LBCA 4LW7A 3IIXA 5E0KA 3QM3A 3SGUA 4WY0F 2GQAA 4K7VA 5AHEA 1YTEA 4ORIA 1YTKA 3SGZA 1SZGA 3LHYA 2VEIA 5TIMA 3UWWA 3GNNA 3ZWTA 4UMBA 3IRDA 1THFD 1A5AA 3TC7A 2A7RA 1JUBA 2C13A 3A9IA 3S1VA 1V7YA 1TTPA 2ZFAA 1H7NA 1R2RA 3K30A 3G1VA 1F73A 4GUHA 3WFAA 3TJXA 4CQ9A 2ZRUA 4M6QA 2Y88A 4KFNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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