5BRWA

Catalytic improvement of an artificial metalloenzyme by computational design
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGMAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSMTTPPLLESVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKLRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Improving the Catalytic Performance of an Artificial Metalloenzyme by Computational Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5brwA00
1ZSCA 3NI5A 3S97A 4E49A 5G0CA 1RZDA 1BNQA 2FNKA 4BF6A 4M2VA 1YO2A 5EOIA 5FLTA 1CVCA 5DSMA 4E5QA 3S8XA 3OIMA 2EU3A 5DVXA 5LMDA 3S74B 3Q31A 6CA2A 3UYQA 2ZNCA 4MTYA 3V2MA 2NWYA 3KOIA 5AMGA 4Q8YA 4L5VA 2F14A 4K1QA 2W2JA 3D92A 1CCUA 4YGNA 4PZHA 3OY0A 3P5AA 2Q38A 4MDLA 2HKKA 2NN1A 4M2WA 4JS6A 1HCBA 4ZX0A 4PYYA 1CNJA 1CNYA 3P3JA 4K0SA 1FR4A 4Q7SA 1H9NA 1BNUA 3JXGA 4Q78A 4PYXA 4CQ0A 1FSRA 4Q87A 3DC9A 1UGEA 3SBIA 3IBIA 4Q90A 3S9TA 5E5UA 1ZGFA 2WEJA 4R59A 3D93A 4ILXA 4CNXA 4E3GA 1OKLA 4ZAOA 4E3HA 3SAXA 1TE3X 3IAIA 4X5SA 4XE1A 1G6VA 4RUXA 3TVOX 3KNEA 2NXTA 4Z1JA 4ZX1A 3S77B 3N2PA 4HEZA 1MOOA 1XEVA 5FNMA 4JSZA 2NNSA 3B4FA 4ZWZA 1JD0A 2NNGA 1AM6A 5JQTA 4WW8A 3VBDA 4QEFA 1G45A 2HD6A 5EH5A 2HOCA 1FQRA 1I9LA 3MHLA 4QJMA 4FIKA 1CAKA 1I9QA 1DCBA 1JV0A 3MNHA 4QK2A 9CA2A 1H4NA 1BV3A 1CVDA 1H9QA 1G3ZA 4MDGA 4Y0JA 3RGEA 5EZTX 3S75B 3MHMA 1OQ5A 2NNOA 1F2WA 3M2NA 2O4ZA 4KAPA 4Q6DA 5FL6A 1OKNA 5FNKA 4KNJA 4FRCA 4FL7A 3ML2A 3M1WA 1G48A 3RYVB 3CZVA 3HS4A 4L5WA 2QP6A 1I9OA 4JSWA 1UGDA 1OKMA 2HL4A 5SZ2A 1AVNA 4XIXA 5EHVA 1IF4A 1CAMA 4K0ZA 5DRSA 4QK3A 1G0FA 4FVOA 2FMZA 4QY3A 5CA2A 1RJ5A 4LP6A 3TVNX 1CVBA 3OIKA 4HT0A 4YXUA 5JQ0A 1YO1A 3MHIA 4LHIA 1BNVA 3P3HA 4Q0LA 5JG3B 2CBCA 3JXHC 3K34A 3HKQA 4RUYA 3N0NA 2ABEA 3M2ZA 1CAIA 2WEOA 5DOHA 3OKUA 2GEHA 1HVAA 4RIUA 1KOQA 3MNKA 3SBHA 4QK1A 4RIVA 3DBUA 1CCSA 4Q6EA 2HNCA 5FNJA 3T84A 4DZ7A 4UOVA 3MWOA 4RFDA 5EHEA 1FR7A 3DCWA 1BZMA 5BRUA 2FNMA 3OILA 4E3DA 4R5AA 4Q83A 1FLJA 2ILIA 1KOPA 4JSSA 5JG5B 1CA2A 1KEQA 4HF3A 4CA2A 5C8IA 4LU3A 1LZVA 1I9NA 3MNAA 1TG3A 1BNTA 5BNLA 2GD8A 5BYIA 5EKMA 5EH7A 1FQNA 3RYZA 3MMFA 3T5UA 3M5SA 1Z97A 5DSKA 4RFCA 4HEYA 4YGKA 5SZ6A 1BNWA 1V9EA 4K0TA 4PQ7A 3DCCA 2Q1QA 1CVHA 4Q09A 5FNGA 2QOAA 2CBAA 3F7BA 5EKJA 1G54A 4L5UA 4ZWIA 4QJ0A 3C7PA 1TTMA 1MUAA 3V3FA 3RYYA 2POWA 4HU1A 3HKUA 3LXEA 4G0CA 1DMXA 3DAZA 4CNWA 3RZ7A 5DSNA 1CAZA 1FSNA 5G0BA 3IGPA 1TBTX 5JGTB 4Q7PA 1LGDA 2WD3A 5FDIA 5E28A 4N0XB 5SZ0A 3RZ0B 5FLQA 5DSJA 3UYNA 4QJWA 1BN4A 1Z93A 2CABA 5FNHA 4RUZA 1HCAA 5E2MA 4YYTA 1G0EA 1CNHA 4YGJA 3S72B 5FLOA 2FOYA 3M04A 4KNNA 1I90A 1IF5A 5E2SA 1HEAA 3DC3A 3F8EA 3M5TA 3V7XA 3L14A 1CRAA 5DSQA 3MNIA 2VVBX 3HKNA 3V2JA 4GL1X 1ZFKA 5FLRA 1RJ6A 1I91A 1CRMA 1TEQX 4XFWA 3W6IA 5DSIA 5HPJA 4QIZA 5A25A 3RG4A 1CZMA 2OSMA 4IDRX 3P4VA 3V3IB 3M96A 4FU5A 2FOUA 1CINA 2H4NA 3QYKA 1CNCA 3P55A 3T82A 5E2RA 4KP5A 1CNWA 5SZ3A 4ZWXA 3B1BA 5A6HA 3FFPX 4ITOA 4KUYA 4JSAA 3KOKA 1RAYA 5FNIA 4QJXA 4CACA 4ETQC 5CACA 3DVDA 3KIGA 1Y7WA 3KONA 3MDZA 3MNJA 2NWPA 2OSFA 5SZ5A 1RAZA 4QSBA 1TH9A 3ZNCA 12CAA 3M98A 4Z1EA 5DSRA 3S73B 1ZGEA 3RZ5A 1HEDA 3OYQA 3D8WA 3F7UA 1A42A 3N4BA 4HT2A 3BL1A 2FOQA 2NXSA 5FDCA 1CVEA 1UGCA 3P58A 5E5RA 5G03A 3U45X 4E9OX 1XQ0A 3GZ0A 1RZBA 4KNIA 5DSOA 1G53A 3M1KA 1CA3A 1CCTA 5DSLA 3RZ1B 4FPTA 1IF6A 4YGFA 1CANA 3FE4A 1IF7A 4Q7WA 3T85A 3V3GB 4MLXA 4Q08A 1CAYA 3IBLA 2H15A 1THKA 1Z9YA 4FVNA 5JEGB 5EHWA 4QSIA 4DZ9A 2POUA 2FOVA 3P5LA 1BNNA 5FNLA 5G01A 1UGFA 2FW4A 1I9PA 1J9WA 4ZWYA 1XPZA 5BRWA 4QJPA 4KV0A 3MNUA 4N16A 1BN3A 4QJOA 5EKHA 1DCAA 1G4OA 1ZH9A 2IT4A 3V3HB 4WUPA 3NB5A 4ITPA 3KWAA 2X7UA 1UGGA 5DSPA 1T9NA 4COQA 2AW1A 2QO8A 3S76A 4Q07A 1TEUX 3D0NA 3CYUA 4KUVA 3RYXB 1ZFQA 4XIWA 2WD2A 1AZMA 1TG9A 4RH2A 1HEBA 3U7CA 3IBUA 4QTLA 1FQMA 3V3JA 1XEGA 4Z1KA 4YHAA 3IBNA 1CAHA 1IF9A 3DCSA 1CAOA 2WEGA 1CVAA 3ZP9A 2EZ7A 1URTA 4E4AA 1HECA 3HFPA 1YDAA 1G46A 3IEOA 1CVFA 3EFIA 3M40A 3DVBA 1LUGA 1V9IC 4CNRA 2AX2A 3M2YA 4BCWA 3RZ8A 4QSJA 1CNIA 1CNBA 1BICA 4Z0QA 1TB0X 1YDCA 4M2RA 2CBBA 4M2UA 2CBEA 1KWRA 1UGBA 3HLJA 3KS3A 3T83A 3DD0A 2POVA 1I8ZA 3CAJA 1HUHA 3V5GA 2WEHA 3W6HA 3RJ7A 3NJ9A 4MDMA 5JGSB 4R5BA 1ZSAA 1BCDA 4G7AA 5L3OA 3EFTA 1FSQA 4XZ5A 5E2KA 5SZ7A 2NNVA 4BF1A 5E2NA 4TWMA 2NMXA 7CA2A 2FOSA 5FLPA 5JEHB 2FMGA 5CLUA 3PJJA 5FLSA 3K7KA 2HFWA 2NWZA 3S78B 8CA2A 3T5ZA 3RYJB 1CNKA 1CALA 3MHCA 3OYSA 3HKTA 1YDDA 4K13A 3S71B 3KKXA 1LG5A 1ZE8A 5J8ZA 4WR7A 3SAPA 3M1JA 4YX4A 4QIYA 3MHOA 3KLDB 2EU2A 1CNGA 1DMYA 2CA2A 2CBDA 3FW3A 4Q81A 4YVYA 5FL5A 3U47A 4WW6A 4HBAA 5JEPB 1FQLA 3M67A 3M5EA 1EOUA 1CIMA 5SZ4A 2NXRA 3MZCA 5JESB 3DVCA 4RN4A 3P44A 4MO8A 5FL4A 5AMLA 1G52A 3M14A 4Q9YA 1CAJA 4MLTA 3MYQA 1ZNCA 4Q49A 3TMJA 2NWOA 3BETA 4IWZA 1RZCA 4HEWA 5IPZA 1G4JA 3M3XA 2FNNA 3PO6A 2X7SA 1ZSBA 1HUGA 1KWQA 3U3AX 4C3TA 3M1QA 4Q06A 3M2XA 2NN7A 4Z1NA 3PYKA 4WUQA 1RZEA 1BNMA 4E3FA 3N3JA 4YGLA 1YDBA 4Q99A 4TWLA 1LG6A 4KP8A 3ML5A 5SZ1A 1YO0A 4PXXA 1G1DA 3CA2A 3R17B 4YWPA 2X7TA 3JXFA 4Q7VA 4KUWA 3RLDA 5DOGA 3DD8A 3DV7A 5CJFA 1I9MA 1RZAA 4QSAA 4Q8ZA 4YXIA 2Q1BA 5EH8A 3DA2A 1UGAA 5AMDA 4WL4A 5L6KA 1JCZA 3RG3A 4YXOA 1CILA 4KNMA 4CNVA 3BL0A 4Q8XA 3R16A 3F4XA 1BN1A 1CNXA 2VVAX 5BRVA 5EIJA 3OKVA 3K2FA 3D9ZA 5JDVB 1IF8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZSC A;  3NI5 A;  3S97 A;  4E49 A;  5G0C A;  1RZD A;  1BNQ A;  2FNK A;  4BF6 A;  4M2V A;  1YO2 A;  5EOI A;  5FLT A;  1CVC A;  5DSM A;  4E5Q A;  3S8X A;  3OIM A;  2EU3 A;  5DVX A;  5LMD A;  3S74 B;  3Q31 A;  6CA2 A;  3UYQ A;  2ZNC A;  4MTY A;  3V2M A;  2NWY A;  3KOI A;  5AMG A;  4Q8Y A;  4L5V A;  2F14 A;  4K1Q A;  2W2J A;  3D92 A;  1CCU A;  4YGN A;  4PZH A;  3OY0 A;  3P5A A;  2Q38 A;  4MDL A;  2HKK A;  2NN1 A;  4M2W A;  4JS6 A;  1HCB A;  4ZX0 A;  4PYY A;  1CNJ A;  1CNY A;  3P3J A;  4K0S A;  1FR4 A;  4Q7S A;  1H9N A;  1BNU A;  3JXG A;  4Q78 A;  4PYX A;  4CQ0 A;  1FSR A;  4Q87 A;  3DC9 A;  1UGE A;  3SBI A;  3IBI A;  4Q90 A;  3S9T A;  5E5U A;  1ZGF A;  2WEJ A;  4R59 A;  3D93 A;  4ILX A;  4CNX A;  4E3G A;  1OKL A;  4ZAO A;  4E3H A;  3SAX A;  1TE3 X;  3IAI A;  4X5S A;  4XE1 A;  1G6V A;  4RUX A;  3TVO X;  3KNE A;  2NXT A;  4Z1J A;  4ZX1 A;  3S77 B;  3N2P A;  4HEZ A;  1MOO A;  1XEV A;  5FNM A;  4JSZ A;  2NNS A;  3B4F A;  4ZWZ A;  1JD0 A;  2NNG A;  1AM6 A;  5JQT A;  4WW8 A;  3VBD A;  4QEF A;  1G45 A; 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