5BYWA

Crystal structure of engineered trifunctional ctcel5e
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
319
structure length
319
Chain Sequence
AVDPFEMVRKMGMGTNLGNTLEAPYEGSWSKSAMEYYFDDFKAAGYKNVRIPVRWDNHTMRTYPYTIDKAFLDRVEQVVDWSLSRGFVTIINSHHDDWIKEDYNGNIERFEKIWEQIAERFKNKSENLLFEIMNEPFGNITDEQIDDMNSRILKIIRKTNPTRIVIIGGGYWNSYNTLVNIKIPDDPYLIGTAHYYDPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGTQEDMDTVVRVFDFVKSWSDRNNIPVYFGEFAVMAYADRTSRVKWYDFISDAALERGFACSVWDNGVFGSLDNDMAIYNRDTRTFDTEILNALFNPGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endoglucanase H
publication title Crystal structure of engineered trifunctional CtCel5E
rcsb
source organism Clostridium thermocellum (strain atcc 27405 / dsm 1237 / nbrc 103400 / ncimb 106
total genus 135
structure length 319
sequence length 319
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2015-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5bywA00
5A6JA 4D6FA 4MB3A 1PBGA 2XUCA 1OGGA 3N1AA 3ARVA 2VC9A 3D3AA 2JFEX 4LX4A 2J7DA 1PAMA 3CUGA 5FD0A 2YA2A 3OB8A 3IAQA 4J3UA 2C7FA 3W29A 4JHOA 2VZTA 4HA4A 3SCQA 1WB0A 1VENA 3L4WA 3AFBA 4U5KA 1JZ8A 1OGBA 1TVPA 3WNOA 4EAMA 4EE9A 1HJUA 2GUYA 3ZT6A 1W3HA 2D2OA 2Y24A 4M1RA 1XC6A 3VIIA 1QHPA 2NT1A 3BCFA 3KZSA 3ZM8A 3UG4A 1K9FA 4AIEA 4B3KA 4CU7A 3VD7A 4JKMA 3I3BA 1QPKA 1BGAA 3AIBA 3W27A 1Q6DA 3AMCA 2DPEA 2PC8A 3VGDA 1V3IA 3WNLA 2VJXA 3RM9A 4JKLA 4LYRA 3SCWA 3POCA 1LWJA 4W7UA 2A3BA 4F8XA 4TUFA 5HOSA 1C3FA 3QGVA 4QDMA 1HT6A 1OIMA 2OYMA 1GVIA 1KGWA 3L4ZA 1B9ZA 2ZX9A 5BRPA 4P7OA 2WNWA 4GPNA 3AMKA 3N11A 5BWFA 4UOJA 2BY1A 5GQBA 1AQMA 1NARA 1E56A 1K9DA 3WSUA 3WD2A 3I3EA 2QPUA 5E9AA 4TVCA 1UQYA 3VIJA 1H1NA 4MTVA 5A6BD 3MV11 5A2AA 4PCSA 3TTYA 4GQQA 2WMJA 3A3HA 1EQCA 1UUQA 4V2XA 1CEOA 2V5CA 2CEQA 1PX3A 1MYRA 3AOFA 1LF1A 1GNXA 1HKMA 1BAGA 3VNZA 4AD4A 1JZ7A 4ZE5A 1VBRA 3VMNA 1UD2A 2D24A 2O9TA 4MAZA 1DHKA 3VDCA 4JFTA 4OOUA 1JF5A 2CBVA 2DSUA 5GNZA 4AZCB 2D3NA 3VIKA 2WYSA 1LL6A 2V3FA 1XHGA 4PCTA 4URIA 1GONA 1WP6A 1OGSA 1DP0A 3WH8A 2ZX6A 4HP5A 1QW9A 3N13A 4CGTA 1EDTA 3AYRA 3M7SA 3WEZA 3QHOA 4B3LA 1KR1A 3MSGA 4D71A 3SURA 1QNQA 1E6NA 1EHNA 1E3XA 1GOWA 4D6CA 2A3EA 3RJXA 2OWCA 4QCEA 2YDRA 1E71M 1JFXA 2G3NA 4BF7A 4PMXA 1E6PA 2JIEA 4A3YA 4MB1A 3VU2A 3VMOA 4TOQA 2WBKA 5JIPA 1LL7A 1G01A 3CTTA 1JG9A 5A6KA 3A6OA 1NOUA 5C71A 1XCXA 4WKAA 1GOKA 3RIKA 1VIWA 1VFMA 5FL1A 2O9RA 2WMKA 4D6IA 1JYNA 3FHQA 3ZIZA 1DWIM 1LL4A 2GJXB 5CG0A 1BHGA 2WSKA 1OD0A 2YL8A 5AC4A 1PEZA 4QFUA 4MJ2A 2WKLA 4UFJA 3WMCA 5TD4A 1FHLA 4W85A 1VJZA 4HU0A 2B31A 1OT1A 1GOOA 1DWJM 3OLGA 3WL0A 4FF5A 3CHDA 1C8XA 3WUEA 1Q6FA 1GOMA 1L0PA 3KL0A 1E6SM 4XB3A 1KQZA 1LG2A 3APGA 1CXHA 5CPQA 3N18A 2HVMA 4JZ5A 3SCNA 1LQ0A 2XYLA 3VIMA 1JAEA 2PWFA 2D22A 3I3DA 4PMOA 3CUHA 1BQCA 2V3EA 3VGBA 5JIWA 4J3XA 3W53A 3L4TA 1NWTA 4AZ5A 4AZCA 3T0DA 1EOKA 1WDPA 2JALA 2ZX5A 3VDAA 2Y5EA 2VQUA 2WW5A 4UOZA 3UEQA 2ZWYA 5IHRA 1W3KA 3W38A 3WD1A 2VZUA 4PMVA 1CXIA 1H0GA 2YDSA 3A4WA 3A47A 4P8VA 2W92A 3CZGA 4AIUA 2DEPA 2E40A 3MUY1 2WCGA 3CUIA 3GNOA 3WDJA 1H5VA 4TTGA 2QMKA 1VFFA 3WQVA 2NT0A 2EPOA 4JAWA 3TTOA 3F4VA 1M53A 2ZXBA 2QPSA 2V3GA 1H09A 3AISA 2EPMX 4FLRA 1C8QA 1FH8A 3EDFA 5FL0A 5I6SA 4D6DA 5BXSA 4ZFMA 5I78A 3EDKA 2ZE0A 4PTMA 5GPRA 2CKSA 4AZ7A 4U3CA 1FFQA 5CGTA 2OSXA 2EQDA 4C7GA 3M46A 2BXZA 4UFKA 3T2OA 3CIVA 5EB8A 5A8OA 3ZR6A 3W6LA 1XH0A 1EHAA 4H2CA 3BAJA 3W4RA 1QHOA 3ARPA 1C93A 4AISA 4OOZA 1VB9A 2EXOA 2FGZA 3KWXA 1OT2A 4MB4A 4GZEA 1Q4NX 1UWRA 1GJUA 4F9JA 1MQPA 1W1VA 4YN5A 3MO4A 4XZBA 2ZX8A 4RE4A 5HBFA 2F2HA 3S2CA 4UCFA 1H49A 3ALFA 2ZICA 3W24A 2ZUWA 3GNPA 1KGUA 3A4XA 2YJQA 1JXKA 2WVSA 1DWFM 5DT7A 2J8GA 3CGTA 3PTMA 4L4OA 3K1DA 1F4AA 1DWAM 2YL5A 2F61A 3WIJA 1OIFA 4S3KA 1QI3A 1OB0A 4ACZA 3F5JA 5EFFA 3PZ9A 2WC3A 3MMDA 3MUZ1 4Q22A 3HMCA 1TUXA 5DEZA 4UQAA 1EO7A 3VGHA 4YPJA 3WNPA 2ZUNA 1JYVA 4TX8A 2VVSA 4BQ4A 2X0YA 2ZUVA 4W93A 1QBBA 3G6LA 3AS0A 3T09A 3WEOA 2XFRA 3ZMRA 3AS3A 4DWSA 1V6XA 2XJ7A 1V6WA 4JFUA 2DT1A 3JUGA 3VD3A 2W4XA 1JI2A 5ECUA 1UD6A 1ZBKA 1NWRA 2V5DA 4H04A 3ARQA 2CIPA 2FDMA 1GQJA 3CLWA 4PMNA 5BXPA 4FMVA 5IXEA 3U5UA 1PIFA 1UWUA 1V3JA 3KL3A 3FY1A 3WD4A 3OLDA 4QCFA 2DT2A 2ZXQA 1MQRA 1TE1A 3KE0A 3DYPA 1A47A 1V0LA 1H4PA 5I2UA 5CQ1A 1QHZA 1TA3B 7CGTA 2VZVA 2D0GA 2J77A 5E0FA 1EGZA 3NJ3A 3UCQA 2GJRA 2XVPA 4J3WA 2DIEA 1JD7A 1HVQA 2J7GA 1UHVA 4P8UA 4R27A 3IJ7A 1BYDA 3PZGA 1UKTA 2W62A 5A69A 3SUSA 1CIUA 4GO9A 2XGBA 4HOZA 1JF6A 2J25A 4QP0A 5I23A 1JDAA 3FAWA 1V3KA 4ZXOA 1C91A 2FHBA 2QHAA 3PHAA 3DC0A 1BG4A 2W5FA 3BSHA 1E4IA 1CLVA 1W9VA 4Z2HA 1ZS2A 2X2YA 5A94A 2IXUA 4QAWA 5C8BB 4PMRA 4TXEA 3NCOA 1J12A 1CXFA 1WCGA 2DGAA 4M80A 2XG9A 3AIRA 5EMYA 2VX6A 1WZMA 1MWOA 1HP4A 4M81A 3ARXA 1CGXA 1XH2A 3GXMA 1QI0A 3GXFA 3VIOA 1BYCA 5FKYA 4P8WA 5A6LA 4AD1A 1G0CA 1KGXA 1E55A 1H3GA 1IZKA 2PWEA 3WF4A 1OWQA 4ACYA 4N0RA 1E73M 1CNVA 4AZHA 1GCYA 1UR8A 1FP8A 2QLYA 1KFWA 1I1WA 2J4GA 3OGSA 6TAAA 5HPCA 3PZOA 4X0VA 5A6AA 5IFPA 3ZSTA 3WKZA 3RM4A 2BY2A 1JDDA 2YIHA 4LPCA 1TG7A 4W84A 5LYRA 3WDIA 4Q7NA 1LLOA 1ITXA 1UWQA 1E5JA 2EPLX 2E3ZA 2E9BA 4MDOA 2WXDM 1FOBA 5A6BA 1LJYA 1Q6GA 1GVYA 3G6MA 5I5RA 4YHGA 1QNPA 4PMDA 3U5YA 4QLLA 3QR3A 1UG6A 4AZ6A 1ZJBA 2CHOA 3VPLA 3AXIA 3CZEA 4D6JA 1E6XM 1H2JA 1K6AA 2VRKA 3WBAA 2NW0A 3NDZA 3AIQA 2BVDA 3VD4A 3SCTA 2WZEA 3CZKA 2WHMA 3TTSA 2BV9A 4BS0A 1ISWA 1QI2A 3BAXA 1TA3A 2DDXA 2G41A 1MW1A 3VGGA 1V6UA 4LYPA 1CBGA 4CU8A 2UY5A 3OZPA 3QOMA 3MU7A 1UR1A 1JZ2A 2VCCA 5I24A 4NRSA 1NWUA 3CZ8A 2Z1SA 2MANA 1E6QM 2XWEA 2X8RA 3ZT7A 2YOCA 3CUFA 1NWSA 2BNJA 1W91A 1P6WA 4TVDA 1VJSA 3AIVA 4S3JA 5M5DA 1VF8A 1M01A 4JHZA 2WMIA 1E72M 7A3HA 5BRQA 1HN1A 2XWDA 2AMGA 3SEPA 5A8QA 2C0HA 4AZGA 1KXVA 4GKLA 2JEQA 5GNYA 1V3HA 1CYGA 1H11A 3L4XA 4GXPA 1NQ6A 1B3XA 3O9NA 5AYIA 2VNCA 2ZWZA 5KEZA 1ZJAA 2J7FA 4KGLA 4CN1A 1PZ3A 3VUPA 1BYAA 2WPGA 5A2BA 4LQ1A 1MW3A 2W67A 1KCLA 4MJ4A 5HXMA 1RPKA 4P8XA 2WAGA 4IISA 1WZKA 2WVUA 5DT5A 5CGMA 1WNOA 2VUYA 1X1NA 3THDA 1FA2A 5D8ZA 4PTXA 4WJXA 5LA1A 1E1FA 4V28A 4GZIA 1H0IA 3WH9A 1G94A 1KXHA 4IPLA 4CVWA 1E0WA 3AHXA 5D8WA 3NSNA 3QOKA 4W5ZA 4D6EA 5BYWA 1HKKA 1RH9A 3BLKA 5M17A 3NSMA 4UQEA 3AMDA 1MW2A 8A3HA 1W1TA 4X9YA 1XGZA 2D1ZA 3U57A 1H41A 1CGTA 4J7RA 1XV8A 3M07A 3ZJ6A 3CHCA 4MADA 1ISZA 2YA1A 4B9ZA 1GORA 1OINA 4H8VA 1EDGA 4UZSA 3EYPA 4PEEA 3RILA 4TTUA 1HL9A 1PX4A 2OYLA 1V03A 3GZAA 2O9PA 3AIWA 4A3HA 1DWHM 5F7UA 2XVLA 3MSDA 1FH9A 3K8KA 1V08A 2TAAA 4PRWA 4W89A 2W66A 3VNYA 2WK2A 4BCEA 2ZX7A 1EOMA 2A3HA 3RJYA 2XIBA 3WNKA 3VMPA 1HKIA 3VINA 3WUBA 1CZ1A 1B31A 1E9LA 1UR4A 1VFUA 1LG1A 5JUVA 3LPFA 2OSWA 1VEMA 3UR7A 4HOXA 2BS9A 1JFHA 3U7BA 1XCWA 3FN9A 4DUWA 2NSXA 5KZ6A 1QVBA 4MNMA 5FOOA 2PBOA 3QHMA 1IV8A 4W7WA 4CN4A 1M7XA 2PB1A 1HP5A 5BXRA 4GO8A 3AJ7A 2CESA 2EBNA 1PIGA 3NIYA 1WZAA 2IUZA 1U2YA 3MUAA 4HZ8A 4TX6A 3UETA 2VRJA 4WSJA 3TA9A 4UQDA 2CCRA 1CENA 3VTRA 1J0HA 2IXVA 4HPGA 3DYMA 1V02A 2ZXAA 1UH3A 1W2VA 3II1A 1B0IA 4KWUA 4AZIA 4LGXA 2WANA 5CXPA 5DMYA 4NF7A 2J7EA 4ACZB 3W25A 1A3HA 3AMGA 3AIUA 3BGAA 2YKKA 1E3ZA 3MMWA 3VX1A 1KXQA 1SYTA 1WDRA 2VTFA 2UY2A 3VD5A 2CBJA 2W61A 3CZLA 1JGIA 3W28A 3PN8A 4NRRA 3T0BA 2ZOXA 2ZUSA 3T2PA 1JIBA 4RE3A 4DWSB 1E43A 3VO0A 1B1YA 4UFHA 1MW0A 5JBDA 1EDQA 1CWYA 1BGGA 4EKJA 1VFOA 5CJ5A 1HJWA 1XH1A 1GZJA 2GDUA 2DSZA 1R87A 3HN3A 4OZOA 1W1YA 4PYSA 3WNNA 3DYOA 1OSEA 3WH5A 2G4FA 2WHLA 1DTUA 5HDRA 4FK9A 2J7BA 4DM2A 4NSBA 1E4NA 3ZT5A 3PZQA 4CCCA 1AMYA 2J75A 2YBTA 2XTKA 3GH4A 4UFIA 3GH7A 4D6GA 1W2PA 1W9UA 4HMEA 4AMCA 3WBEA 4XZWA 1J10A 1W9DM 4BQ5A 3BXWA 3PZMA 3SCUA 2CERA 4J3VA 1XRVA 1UKOA 3AZRA 1J9YA 2WSPA 4AYSA 2CHNA 3NYDA 5A6SA 3AIEA 4AD2A 3K8LA 2DQXA 1V6VA 5A3HA 5GNXA 2BHYA 4GI6A 2W91A 2G3MA 1UR2A 1S46A 4FLOA 4H7VA 4F9DA 1J0IA 4IUGA 1ZBWA 4M24A 1QNSA 3WQ6A 2VX4A 1QI4A 3FNDA 3WDRA 3N15A 4OIFA 1E40A 2XFFA 5CSYA 3CMGA 2OYKA 4AD5A 1G5AA 3IK2A 2CNCA 4J3TA 1NH6A 3WUFA 1ZU8A 3AI0A 1I75A 4PUDA 3BSGA 1CLXA 4KGJA 4JL1A 2ZUUA 3GNRA 3BLPX 4B9YA 3B9EA 4OKDA 3T2QA 3OIHA 1GW1A 2VQTA 1JDCA 4ZE4A 3W0KA 1HJQA 2CETA 2YBUA 1W9BM 1JAKA 4OUEA 1XSKA 4GQRA 4JCMA 4JCLA 2WVVA 1FHDA 1UWTA 3AHTA 5DF0A 4PMQA 1JNDA 1HL8A 3B8SA 1MFVA 1V6YA 3CUJA 1EH9A 4UOQA 3WQ5A 3AMLA 1HIZA 4UFLA 4C7FA 1EA9C 3AS2A 3K4AA 4HMCA 5DFAA 5FIPA 3NUKA 4F79A 1MXGA 1C90A 1PX8A 4BA0A 2JE8A 3F5LA 3WDHA 4MNJA 4HZ7A 3WMBA 3W82A 3VM5A 1R7OA 1XYFA 1XYZA 2X05A 3ARUA 4U5IA 1PPIA 2HISA 1GQLA 4IM4A 3OZOA 1JI1A 1V0MA 3AXHA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5A6J A;  4D6F A;  4MB3 A;  1PBG A;  2XUC A;  1OGG A;  3N1A A;  3ARV A;  2VC9 A;  3D3A A;  2JFE X;  4LX4 A;  2J7D A;  1PAM A;  3CUG A;  5FD0 A;  2YA2 A;  3OB8 A;  3IAQ A;  4J3U A;  2C7F A;  3W29 A;  4JHO A;  2VZT A;  4HA4 A;  3SCQ A;  1WB0 A;  1VEN A;  3L4W A;  3AFB A;  4U5K A;  1JZ8 A;  1OGB A;  1TVP A;  3WNO A;  4EAM A;  4EE9 A;  1HJU A;  2GUY A;  3ZT6 A;  1W3H A;  2D2O A;  2Y24 A;  4M1R A;  1XC6 A;  3VII A;  1QHP A;  2NT1 A;  3BCF A;  3KZS A;  3ZM8 A;  3UG4 A;  1K9F A;  4AIE A;  4B3K A;  4CU7 A;  3VD7 A;  4JKM A;  3I3B A;  1QPK A;  1BGA A;  3AIB A;  3W27 A;  1Q6D A;  3AMC A;  2DPE A;  2PC8 A;  3VGD A;  1V3I A;  3WNL A;  2VJX A;  3RM9 A;  4JKL A;  4LYR A;  3SCW A;  3POC A;  1LWJ A;  4W7U A;  2A3B A;  4F8X A;  4TUF A;  5HOS A;  1C3F A;  3QGV A;  4QDM A;  1HT6 A;  1OIM A;  2OYM A;  1GVI A;  1KGW A;  3L4Z A;  1B9Z A;  2ZX9 A;  5BRP A;  4P7O A;  2WNW A;  4GPN A;  3AMK A;  3N11 A;  5BWF A;  4UOJ A;  2BY1 A;  5GQB A;  1AQM A;  1NAR A;  1E56 A;  1K9D A;  3WSU A;  3WD2 A;  3I3E A;  2QPU A;  5E9A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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