5CG7A

Leishmania siamensis triosephosphate isomerase
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
249
structure length
244
Chain Sequence
AKPQPIVAANWKCNGTTASIEKLVQVLNEHQIDHDVQCVVAPSFVHIPMVQAKLNPKYAVSAENAIAKSGAFTGEVSMPILKDLGVSWVILGHSERRTYYGETDGVVAQKVADAYNQGFMVIACIGETLQQREANQTAKVVLSQTAAIAAKLPKEAWSQIVLAYEPVWAIVATPEQAQEVHALLRQWVSEKIGNGVATKLRILYGGSVTAGNAKTLYMKPDINGFLVGGASLKPEFRDIIDATR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Crystal structure of Leishmania siamensis Triosephosphate isomerase at 1.88 Angstroms
rcsb
source organism Leishmania sp. 'siamensis'
total genus 89
structure length 244
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5cg7A00
3LB0A 3IGXA 4EOUA 1AG1O 3PBUA 3B8DA 4IXXA 4O0KA 4FNSA 2GPTA 4DF1A 5C2XA 3RK8A 3O05A 4R34A 3HG2A 1FWTA 4N4QA 5A8GA 4UTUA 2CZEA 3NL5A 3W1QA 3C2VA 2C0AA 2QJIA 2PE4A 2A7NA 1K3UA 3PAJA 2ISVA 3MO7A 4UFMA 3T4CA 2GOUA 3FJLA 5HUPA 3VE9A 1DHPA 5SWUA 2ISWA 2A7RA 4FXSA 1A5SA 1O60A 2W79A 1B57A 2JGQA 3BLIA 5BW6A 3W7JA 4DO5A 4UNLA 5AC8A 4JYFA 3BW4A 3C2OA 1HO4A 3LTPA 3W2UA 5I3IA 3UQNA 4N6EA 2WV8A 1KTNA 1Z41A 1R30A 3Q94A 3EWBX 3NNTA 2HSAA 4UMCA 3P5ZA 1QPNA 2JBMA 2ZRYA 5TIMA 5LGZA 3PUDA 4IPJA 3E0IA 1KM6A 2WNZA 1U5JA 4PL2A 1TPFA 2W6RA 1K02A 3ABOA 3UWWA 4N02A 3NQ2A 1L6SA 5G4WA 4UC5A 5AHMA 1QOPA 2ISSA 1TTJA 1SSGA 3QF0A 4NZFA 3THQA 3N73A 4DPPA 2Y88A 1QO2A 3L2IA 3TXZA 1ZY9A 3HGJA 3Q58A 4TR9A 3KOFA 3UZJA 2NV2A 2NUWA 2QR6A 3NPUA 4YWIA 2VFGA 4LWWA 5G4EA 2A0NA 3W1LA 1JCMP 4I7UA 3OVPA 1IXOA 1SZEA 2JKAA 5FF7A 2NV1A 4ZQNA 3P80A 1I45A 2ZCGA 3EX1A 1GQNA 2ZA3A 4N9EA 4YCOA 1KTBA 2C16A 4JNMA 4JYEA 4Z0JA 3CM4A 1G4SA 1Q6LA 4DEFA 1OK6A 4NJJA 1TTIA 4MUZA 3ELFA 2CZ5A 3W71A 4IX2A 2PRMA 2EF9A 4BI6A 5KZDA 1VHCA 4GWEA 4RK8A 2P1FA 3LLFA 1JRBA 3NPWA 3PC0A 1TSIA 1TV8A 3W1TA 3PY2A 3S1WA 1K8ZA 1XM3A 3M9YA 4DO4A 3L5LA 1TJRA 6ALDA 3DI1A 4HPXA 3NPXA 4UTWC 3E9AA 3NYZA 5AHEA 4AH7A 1SFJA 5U7SA 3N14A 3W2LA 4JIQA 1TPDA 3TFXA 4CQ9A 1P0KA 2QAPA 3W1PA 5CZTA 3SJ3A 3PF3A 3C2FA 5EL1A 1DQWA 2Y62A 3CEUA 3UPBA 4FB7A 2DJXA 4GBUA 4U28A 1ZAHA 5H91A 3EKLA 1TPUA 3G24A 3P7YA 2Y63A 3M5ZA 5HR7A 2XN0A 2Y7DA 4ORMA 4EWND 1QR7A 4X2RA 3W1RA 3G3DA 2J88A 2ZDRA 1DKWA 5DY3A 1H51A 3DZ1A 1TYGA 2LLEA 3IGSA 1KW1A 2ZRZA 2VOMA 2F84A 3W87A 4AHPA 1ZAIA 4MPQA 4JX4A 4XUGA 3C6CA 1KM1A 1LOSA 2BWGA 4EF9A 2Y7GA 3IVTA 3G0UA 1OX5A 2RDTA 5EY5A 2Y61A 2G97A 5U4NA 3KVMA 5FEWA 2NUYA 5E1QA 4K8EA 5DCDA 2P10A 5D04C 4WY0F 1KBJA 4LRSA 4O53A 3HGOA 3A22A 2Z0IA 4WD0A 1W56A 4LS1A 2OX1A 4ZL1A 2TYSA 1S5WA 3L0NA 1WOAA 4MOZA 1YDNA 4M19A 1SO6A 4JDYA 2FPVA 3HBLA 5D09A 3I7RA 1XDMA 1B4KA 2WOQA 5DY2A 1JCLA 3O6YX 3MWAA 1ICPA 1XC4A 4Z1CA 4ADSA 4IJBA 1KFJA 4E0CA 3UZ5A 2FDSA 5AHFA 1P1XA 2Z1BA 1RQHA 3MW7A 3TR2A 5C5YA 2RH9A 2BZNA 1DBTA 3P81A 4LS0A 5CPOA 2NWRA 4BK9A 2RFGA 4FIRA 2ZBTA 1QFEA 3E02A 2GQ8A 4ZVJA 3M44A 3IIVA 1A5CA 5AC6A 3LTSA 4JN6A 1O5KA 1ZAJA 1TREA 1W3TA 3L67A 3W75A 3MUXA 2ZZ5A 1WOBA 5K9XA 3W76A 2ATSA 5LGXA 1LM1A 2QUTA 1F05A 2C14A 4O28A 1CX9A 5FF0A 1PCWA 3THAA 3TAKA 3SGZA 2CLIA 3EB2A 3FEMA 5D2TA 1OJXA 3LXBA 1QOQA 3ABSA 2XN2A 3H54A 4I7WA 3B05A 1OK4A 4H6KA 5FEPA 1OFRA 1R47A 4WOQA 3W7NA 1OG0A 1FXPA 1EEPA 5K9DA 3RFAA 1L9WA 2CZFA 2Y7FA 1OFEA 1NAL1 2GJLA 1I2PA 1F2JA 3ATZA 1H60A 3WJYA 4M5PA 4UNKA 5K4ZA 5DXYA 1VLIA 1SPQA 1GYLA 2YW3A 4AWTA 3B4UA 1WYIA 3S5OA 2QCMA 4O12A 1BWKA 3M5XA 1VC4A 2VEMA 4UCGA 1VYSX 1IIHA 1OFDA 2B7NA 1ME8A 4O14A 3UWQA 5CKSA 5G2IA 3NQ7A 3QSTA 4L4MA 1W5QA 5AYXA 4K38A 3F4WA 3IIPA 4RJEA 3N9SA 2BX7A 2QCHA 3MHFA 4LV9A 2Y7EA 4M7SA 4MZ8A 1PV8A 1M7PA 3HOJA 3QMSA 3TUUA 1ONRA 3N2XA 2DZTA 1X6UA 3CQ0A 5E0KA 1SU5A 4JTIA 1OYCA 8TIMA 2DZPA 3GAYA 3R13A 1DV7A 3VKJA 4AEOA 2EAWA 5DCBA 3BG3A 3TH6A 4JTGA 4RZ5A 4ZQMA 3WJZA 3W7HA 1K7FA 4UTJA 2QCEA 1HG3A 4I7VA 4BI7A 2WNQA 3I7SA 4MLJA 3B0UX 1RQBA 5FEXA 2X1SA 3PSVA 1V7YA 4Y8FA 4Z1DA 3LRKA 1W5OA 2Y70A 4AMAA 3BG5A 3TA6A 3STGA 5F4WA 3ZFHA 5DXXA 1HO1A 3CHVA 3GDMA 3RF9A 2ZTKA 2OT1A 3DU0A 1IXNA 2YDAA 3MMTA 3NQMA 3O16A 3AO0A 3NL2A 3GR8A 1KM3A 3HMJG 1UCWA 2FPTA 2V9DA 3LHVA 3STCA 3G1YA 1MZHA 2ZTJA 5DELA 3TAOA 1SZNA 3I6RA 3HGSA 1IF2A 3KFTA 3FYPA 3NVTA 3TW6A 5HNRA 2NX3A 1LBMA 1W31A 1K03A 1LLWA 2WQPA 4UUIA 4JY9A 3HG4A 2YYUA 4IMCA 3W83A 4JIPA 1ICSA 3IGUA 2QJHA 5CGQA 2V8ZA 5F2IA 3TJXA 4OHQA 1CI1A 2OJPA 2VFEA 3INPA 5I3GA 3MP3A 2G5WA 2BSLA 3S9YA 1TV7A 1GYNA 3WJSA 1W5MA 4XWUA 3CLMA 1QMLA 3NM3A 1KM0A 4RLIA 1C29A 4PL1A 3UY7A 3EKZA 4UMBA 2Y6ZA 2VC6A 4O4VA 1VCVA 4FNQA 2ALDA 2FFCA 5AHIA 3FLUA 1FDZA 1WBHA 3QYQA 3R8RA 1MEWA 5K7JA 1I4NA 2CFFA 2CLLA 2HS8A 2H3BA 2YR1A 2ZZ2A 3A24A 3C8FA 4LRTA 5CZSA 4O1DA 2RHGA 1YTEA 3DFSA 4TMBA 3GXPA 3TKFA 4JX6A 2ZA2A 4HSOA 4MFDA 3P74A 2GJNA 1AW1A 2NXIA 4HNTA 1Q45A 4O1AA 1KV5A 4OGZA 4LU0A 4NNCA 2ZZ3A 3QZEA 1ZCOA 3B0PA 3G1SA 3MYPA 5D37A 3GNNA 4UTTA 1QCWA 4CQAA 1LP6A 4QM1A 1L2UA 3GZ3A 4LV4A 4E2BA 1YXYA 2DP3A 2QDGA 1KM5A 2J9ZA 1GVQA 2FQIA 1G67A 4MVAA 5BMXA 2KZHA 2DU2A 1T99A 3AJXA 5F1VA 1LLZA 1T96A 1I2RA 3W73A 1PS9A 4LVFA 4DXVA 3IVSA 1LOLA 1OX4B 1VQTA 2FIQA 4O10A 1AL8A 3CWNA 4KFNA 3CTLA 4UTHA 3USBA 3I7QA 4XZ9A 4PA8A 4TO8A 4Z08A 3M7WA 4JS3A 1W5PA 1GG0A 1X1ZA 4FXRA 5EA9A 4EIVA 3GDTA 3GAKA 1GWJA 1ZENA 1GPWA 2ZRWA 4UFKA 1B4EA 4QJ1A 5K2ZA 2J27A 4RKAA 3G8EA 4GUGA 2E09A 3LI0A 1KFKA 1PHQA 3L0GA 1MSSA 1NVMA 2B0MA 1W3IA 5D33A 4IGHA 3FOKA 1TPVA 4E2DA 4P61A 3E49A 3TMLA 1Y0EA 3GXTA 2A21A 3LDVA 1VYPX 2Q3RA 4HSNA 4JTSA 1H62A 3DFOA 1H7NA 4ZQRA 5CSRA 1OX6A 4NQ1A 1W8SA 3IIZA 3C0JA 2C13A 3G0XA 3WFAA 2ZZ4A 4BI5A 2E6DA 1QNVA 3NM1A 3CT7A 2DJLA 1QWGA 4UR7A 2C19A 4LUIA 5BOOA 3GDLA 3LBMA 1J2WA 1JUEA 4R53A 3W7GA 3PUEA 1KLZA 3UY8A 1JQXA 4A22A 3GKAA 1FXQA 3NQGA 2QCDB 4LNYA 1GVRA 3KXQA 3LRMA 1VJIA 3BK0A 4OE7A 3M5YA 1WXJA 1XDLA 1ZHAA 4HKPA 2J6XA 1NFBA 1W0MA 1QPOA 4TMCA 1P4CA 3W7PA 3NR0A 3HPXA 2EHHA 4BR1A 1XCFA 5CPMA 1G4PA 3R12A 4A29A 5LSMA 3JS3A 4WXZA 1TTPA 5I3FA 4BWLC 3FS2A 4FX7A 4PFMA 2R8WA 4JTEA 5TQLA 4NZJA 5D2YA 2VFHA 2X2GA 3EWUA 3L68A 3BARA 3DFTA 1TQJA 3W22A 2AQWA 5F1UA 4KWVA 1GVSA 1NEYA 3TCEA 3EWWA 1FWRA 2TMDA 3SY5A 4O1CA 3LGEA 2V82A 4MLRA 2E6AA 1FDJA 2PC4A 5EMUA 3LTYA 3NL3A 3WK2A 3B03A 4CQ8A 1G7UA 4DQWA 4Y96A 3A9IA 3C52A 4A2RA 2V30A 4XKYB 3NQAA 2NX1A 1LOQA 4POCA 3BLEA 2YZRA 5L9FA 1VH7A 4HT3A 4GUIA 1BTMA 2CZDA 3W72A 1FWWA 1SSDA 1LDCA 2OMAA 2ZRXA 4WJEA 5CPNA 3O6CA 1VR6A 3QRHA 3OVQA 1MXSA 2GQ9A 3G1AA 5D30A 5HR6A 1RR2A 2FB3A 3M16A 3IEBA 4UTLA 2E5DA 1K7EA 5BMWA 3EX3A 3HF3A 7TIMA 1R2SA 3PG9A 3UWVA 2Z2UA 1DQXA 3PULA 2PURA 1SZFA 5EBUA 2E77A 1YPIA 2DZWA 5CPLA 3F4NA 4JD4A 2PRLA 1VZWA 1ICQA 5D03A 3M6YA 3S42A 3NQCA 2E5CA 4ZZ9A 3T44A 5DBTA 4O16A 3O07A 2ZA1A 1LCOA 2ZYFA 5F4XA 4N9DA 1GJPA 3M41A 5G2WA 1XFBA 2VELA 1G4TA 2R94A 1XXXA 4PODA 3IRDA 3UWZA 2Y85A 3W7RA 1C9DA 3W1NA 2A85A 2I1OA 1C8VA 3QW4B 1OX4A 1U83A 3PM6A 3W2JA 2C3ZA 3PBYA 4O19A 2V81A 2VENA 1H63A 1RD5A 3GNDA 3NQFA 1TPWA 3S5NA 4BFAA 1YDVA 1AW2A 2ZZ6A 2JK2A 3Q2DA 2WKJA 2UV8G 1LBLA 3OA3A 3LCXA 3G1VA 1TIMA 3PBVA 2J24A 4A21A 4FNPA 5F2GA 1KLYA 5LZLA 2V2HA 3BW2A 1UBSA 4L4LA 1J4EA 3MI2A 3LHWA 4Q33A 2C18A 2BXVA 5D2WA 3TE9A 2DZUA 1TPH1 4MIMA 2ZRVA 4Z1AA 4WXYA 5IBXA 4IUOA 3LI1A 2C6QA 3TK7A 5GVJA 2NLIA 3LCHA 1F5ZA 1K8XA 5KTLA 3W2KA 1FCVA 1HFBA 3QEZA 3DI0A 4G1KA 3W1AA 4WY0B 1G4EA 1MEIA 1JCJA 2JKPA 2NXHA 4K7YA 3N2MA 3G8RA 1EPXA 1AL7A 4YLWA 2VEPA 3IIOA 2FLIA 5AHLA 3W70A 1QAPA 3W7MA 3DAQA 3VE7A 4GUHA 3C2EA 4AXKA 3EX6A 2X30A 2X16A 4UXDA 2XN1A 4Y90A 4JDBA 3D0CA 3WK3A 3EEGA 2QCNA 3FA5A 1A5BA 1FUYA 2FPYA 3NA8A 4JTUA 4XQ6A 3LHTA 2QCDA 4PH6A 1AW5A 2V0TA 3NZRA 4B5NA 1IIGA 2E5BA 2QEZA 4Y9AA 4GRSA 4TU1A 3NEVA 5E93A 3QQ0A 3MHUA 1H7XA 4HIBA 3HG5A 1NF7A 1KA9F 3MI6A 2FB2A 4O8RA 3HPZA 1LRQA 4CCCA 1X1OA 1H1ZA 4LT9A 1TJPA 5FF2A 1GOXA 2BTMA 4IX0A 3RLUA 5CSSA 1Q6RA 1OABA 4FNUA 3LCWA 4M6VA 3RNDA 2DZXA 4S2BA 4JEQA 2QCLA 1LBFA 3TNOA 4LVBA 3EXRA 1O95A 3LRLA 4O0ZA 3NOEA 4YMZA 1PHWA 2WSYA 1RPXA 2DZSA 3UXDA 2Y89A 5T26A 2A7PA 2RDWA 1RZMA 3G1XA 2A1YA 1LRTA 1SO4A 1YTKA 4WX2A 5LNVA 4CNPA 1XUUA 1OF6A 1FWSA 4JXCA 5HINA 1I8JA 4C1LA 4IXHA 3V75A 2BLEA 5ABTA 4M6PA 4FIQA 2R14A 5IM51 4XBKA 4UTKA 3CIWA 4GUFA 2CLHA 3LCIA 1DL3A 1A5AA 4XTDA 4X3ZA 1JJKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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