The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
84
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structure length |
84
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Chain Sequence |
MFTGLNTPSGVAVDSAGTVYVTDHGNNRVVKLAAGSNTQTVLPFTGLNTPHGVAVDSAGTVYVTDHGNNRVVKLAAGSNTQTVL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
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| molecule keywords |
nvPizza2-S16H58
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| publication title |
Biomineralization of a Cadmium Chloride Nanocrystal by a Designed Symmetrical Protein
pubmed doi rcsb |
| total genus |
13
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| structure length |
84
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| sequence length |
84
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| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-07-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3WWB A; 3WW7 A; 3WWF A; 5F53 A; 4ZCN A; 5CHB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2XOK D; 2F9N A; 4NIW A; 3UUZ A; 1ZMN A; 2FO9 A; 1O2V A; 2A4Q A; 2FEQ H; 1UVS H; 1O5E H; 3BEF B; 1L1N A; 5JYI A; 1C5N H; 3A7Y A; 1N6Y A; 4LZ1 H; 1YPH E; 1C5S A; 3SZN A; 1BQY A; 4GVU A; 3UQV A; 1AI8 H; 1ETR H; 1SLX B; 5J4Q A; 4D7F A; 3MU1 A; 1DIT H; 1SLV B; 3RLW H; 4DVA U; 1ZML A; 1ELD E; 2IJO B; 1JIM A; 2XND D; 3GDS A; 3MYW A; 3HGN A; 2G5N A; 1BMN H; 1P2O A; 1S5S A; 2WPM S; 1XUH A; 5EJZ A; 5CHB A; 3LOX A; 1D6W A; 2SGE E; 1DVA H; 3HGP A; 2BLQ A; 2PUX B; 1EPT B; 3F68 H; 1LQE A; 3LGV A; 4UEH H; 2GVF A; 4UFF H; 2Q1J A; 3TNS A; 2BY5 X; 3NPS A; 2I6Q A; 2BDI A; 4Y11 E; 1BTU A; 2BD2 A; 4ASU D; 1G36 A; 2ZP0 H; 4CH2 B; 3MU5 A; 1CA0 C; 2ANM H; 1SOZ A; 4X2V A; 3RM2 H; 1EZX C; 3D23 A; 1HAY B; 1AIX H; 1A61 H; 1C5Q A; 2WPD D; 3STI A; 4YO9 A; 3U1J B; 5GXP A; 2OBQ A; 3I29 A; 3VFE A; 1BIO A; 2P16 A; 2RDL A; 1QUR H; 1OYQ A; 3A81 A; 3I77 A; 1QJ1 B; 4WJG 2; 4CRA A; 2CK3 D; 3IWM A; 2NU2 E; 1KXC A; 2P3F H; 3PO1 B; 1P10 A; 2KCO A; 4JK5 A; 3SHA H; 2KM0 A; 4RI0 A; 1GGD B; 2YMS D; 1PQ8 A; 1OX1 A; 3A84 A; 1SPJ A; 3S0N A; 5EQQ A; 3SU2 A; 2WV5 A; 4H6T A; 1Z71 A; 3OY6 U; 1BTZ A; 3NKK A; 3P6Z B; 1EAX A; 1BTP A; 5C5N A; 2BX4 A; 1P57 B; 3TNT A; 1GI8 B; 4HGC A; 3SU6 A; 1A3B H; 1IHT H; 2ZTZ A; 2UUF B; 1EB1 H; 3F2F A; 2ODP A; 1C2E A; 2PLX A; 3BG4 C; 5TCA A; 1AKS A; 1C2D A; 1VGC C; 7KME H; 4VGC B; 1K9O E; 1UTM A; 2QF3 A; 3ZZ8 A; 3P95 A; 4NZL A; 2XTT B; 1F0S A; 1SQO A; 5DPA A; 5T6F A; 3F6U H; 3LDX H; 5EU8 A; 1BTH H; 1GMH G; 1EXF A; 1ESB A; 2ZA5 A; 2ZGB H; 3PYH A; 5A2M H; 3LGT A; 2PW8 H; 1NFY A; 1QQU A; 4OS5 A; 2JKH A; 3RXJ A; 5GWZ A; 5K0H A; 3ATM A; 4M9F A; 4Q63 A; 3LC3 A; 3E90 B; 1HPG A; 5CHA B; 5F6M A; 1D4P B; 3RXU A; 1GI3 A; 4CR5 A; 3T27 A; 1K1L A; 1DWB H; 2V6N A; 1GBH A; 1C5W B; 4CHA C; 2ZHQ H; 1GBI A; 3H09 A; 1NO9 H; 3SV7 A; 2AH4 X; 1EAI A; 2SGQ E; 3O8C A; 5ETX A; 1AGJ A; 2BLO A; 1A2C H; 4X1Q U; 1MTS A; 2VVV A; 2NWN A; 4NZQ A; 2CF9 H; 1TPA E; 2R3U A; 3NUM A; 3RXI A; 2G4T A; 2GV7 A; 4I32 A; 1W12 U; 2HPP H; 3SJK A; 2PWX A; 2DE9 A; 4EST E; 3BN9 A; 1ABJ H; 3FAO A; 1UJ1 A; 2BVS H; 3DFL A; 4KEL A; 1IQG A; 1IQL A; 1C2L A; 1QY6 A; 2YMS C; 1DUA A; 1ZPB A; 3H5C B; 2QE7 D; 3NWU A; 5GCH G; 5K7R A; 1FY1 A; 2QF0 A; 4YT6 H; 1W7X H; 1BUI A; 1YKT A; 1T7C A; 2Y5G A; 1LHC H; 4DG4 A; 3RU4 D; 3SV6 A; 2VGC C; 1OSS A; 3ODD A; 2XC5 A; 1Z8R A; 3RXM A; 4X6N A; 3SOS A; 3TK9 A; 3MQK C; 1O5B B; 1KSN A; 2WIN I; 3PMH B; 5HKK D; 1SI5 H; 3UNQ A; 2VJ1 A; 1CT2 E; 4NSV A; 4FU9 A; 1LPK B; 2FDA A; 2ZHF H; 2OXS A; 3RC4 A; 1DUE A; 4XBB A; 1HDT H; 1DX5 M; 2Y7Z A; 1S84 A; 2CXV A; 1EUF A; 1BMM H; 1FDP A; 1VIT F; 1TMT H; 2FOE A; 3LGY A; 2UUY A; 3RC5 A; 1CHO F; 5DKM A; 2BDB A; 3BTQ E; 4DW2 U; 1UK4 A; 1DT2 A; 3VEQ B; 4AFQ A; 2WHX A; 1COW D; 1TNG A; 1O30 A; 2OTV A; 1H4W A; 1D6R A; 1GHW H; 5JB9 S; 1HIA B; 5DJ7 A; 3FAN A; 1SHY A; 1AFQ B; 3AAS A; 3RXS A; 1HNE E; 2BXT H; 2OBO A; 3SGQ E; 4UE7 H; 2C8Y B; 4MNW A; 1UVP A; 2VU8 E; 1OS8 A; 2GV6 A; 1WSS H; 1TAB E; 2XWB I; 2H2Z A; 2XW9 A; 1C5O H; 1DLK B; 1TX6 A; 3BTT E; 4O3U A; 1KIG H; 1PJP A; 2GD4 B; 3O8B A; 1J9C H; 1W0Z U; 1EZS C; 2OQU A; 2XNI A; 5FBI A; 1IQI A; 1TLD A; 4MNY A; 4GUX A; 2GZ8 A; 4I7Y H; 1GI7 B; 1VIT H; 2A5K A; 1O2J A; 1FY5 A; 1EPT A; 2FX6 A; 3QGJ A; 1AVX A; 4X1P U; 1EPT C; 2GJG A; 2ODY B; 1ZR0 A; 4GHT A; 4XBC A; 4BXS A; 3O8R A; 3WWF A; 2R3Y A; 3SGB E; 1EOJ A; 1EQ9 A; 5FPT A; 1HAH H; 2ZGC A; 4MQA A; 5H4I B; 1LVY A; 3AVZ A; 3V0X A; 3L6P A; 2VH0 A; 2Y5F A; 3TH4 H; 3OE7 D; 1ELE E; 4B74 A; 2OC7 A; 3ELA H; 3KYF A; 1YPE H; 2PKA A; 1SVP A; 4AB8 A; 3FFG A; 3QLP H; 1DOJ A; 4FUD A; 3GY8 A; 3UWI A; 1G3B A; 3SNB A; 3PRD A; 1A7S A; 4Q4L A; 2VWM A; 2EEK A; 4LOY H; 2C8Z B; 4BAK B; 2VVC A; 2XBV A; 5DP8 A; 1QBO A; 4JYV H; 1Y3U A; 1PPF E; 1IQK A; 1GBF A; 1GHV H; 1L1J A; 3PO1 C; 5C0T A; 2ZKS A; 4AG2 A; 4KGA A; 5FAH A; 3HPT B; 1TRM A; 3V13 A; 1WUN H; 1FV9 A; 2EI6 A; 4HZH A; 3AAV A; 1K1M A; 1XKB C; 2Z9K A; 4J2Y B; 1K2I 1; 2H9H A; 2AMQ A; 1V6D A; 3O8D A; 5L30 H; 4DT4 A; 3A7X A; 1GBD A; 4ISO A; 3E1X B; 1K22 H; 1ZSL A; 1C5P A; 1ZPZ A; 3P70 B; 1C2F A; 4YZU A; 3S7K B; 3V3M A; 4Q2K A; 2GDE H; 2FXR A; 4YOJ A; 1EB2 A; 1N8O B; 2JH6 D; 4BAO B; 3URE A; 3KHV A; 1TBR H; 3VB7 A; 3BEI B; 4MLF B; 1KMH B; 5FPY A; 2VIP A; 2YNB A; 1KXD A; 2V3M A; 1MAX A; 1ARC A; 4LK4 A; 1VJ9 U; 3H7O A; 1GJC B; 1C5V A; 4RT0 A; 4MDS A; 1MCT A; 1MCV A; 2ZO3 H; 2IN2 A; 1YYY 1; 5HXF A; 3R3G B; 4K8Y A; 3BTW E; 1GPZ A; 1D3Q B; 1UCY E; 2G8T A; 2FOM B; 2KCY A; 5C3N A; 4FVD A; 2BQ6 B; 4RT1 A; 2O8W A; 1HFD A; 1MH0 A; 3NXP A; 1NY2 2; 1QL8 A; 1QTF A; 5CHA C; 4X8V H; 2ZEB A; 3SI4 H; 1D3T B; 1ABI H; 3RXP A; 1S82 A; 2UUJ B; 1H9H E; 1JBU H; 1Z1J A; 2GMT B; 2ZWL H; 3ATK A; 3ZZB A; 4AX9 H; 1MKX H; 4E7R G; 5EJ1 A; 2FOD A; 3QWC H; 4DUR A; 4MNV A; 3TGK E; 1MBQ A; 4DCD A; 1J8A A; 3FZZ A; 1SMF E; 1JRT A; 1SSX A; 4ABF A; 1SQA A; 2J98 A; 3P8G A; 1WXR A; 1GHY H; 2GTB A; 5DP5 A; 4CRF A; 1O2P A; 5L2Z H; 2ZNK H; 5ESB A; 1C5Z B; 1LPZ B; 1O39 A; 3SNC A; 5AHG H; 1H9L B; 1W7G H; 2ZQ1 A; 3RXD A; 2PV9 B; 2TGT A; 2PR3 A; 4Q7X A; 1AFE H; 1P04 A; 2W5E A; 1HXF H; 5F8T A; 3TVJ B; 2GX4 A; 3GDV A; 1ELB A; 1CA8 B; 1MKX K; 1ZZZ A; 1TGB A; 4WF8 A; 3OYP A; 1C5R A; 4GHQ A; 1ZHR A; 1O0D H; 1OWI A; 1J16 A; 1XX9 A; 4OS4 A; 1F5L A; 1C9P A; 1TIO A; 1GVK B; 1HXE H; 4TPY A; 1BJV A; 3JZ2 B; 3N99 A; 1NRO H; 1GBB A; 4O9V A; 1UTQ A; 5FHT A; 3MNC A; 4Y6D A; 1P2K A; 1VIT G; 2FWW A; 1CHO G; 4KKD A; 2ASU B; 2A31 A; 2Y81 A; 1P9S A; 1C2G A; 1P2Q A; 1SHH B; 1EX3 A; 2ZPQ A; 3U28 C; 4IC5 A; 2FX4 A; 1P0S H; 1SC8 U; 1WDI A; 1FIW A; 1GHA F; 1NFX A; 1C1Q A; 2UWL A; 1LHD H; 3BTH E; 2TGA A; 4LXB H; 1LO6 A; 1AFQ C; 2RCE A; 4FUH A; 4X8U H; 1W14 U; 1B0F A; 1IHS H; 1BRA A; 2J97 A; 2FPZ A; 3RXB A; 3MU8 A; 1NN6 A; 4MG3 A; 1RD3 B; 3IG6 B; 5EG4 A; 1GWA A; 3FO8 D; 2QXG A; 3PV2 A; 1P2M A; 1Z7K A; 4YTA A; 1SGR E; 2R0L A; 2KX4 A; 3SJ9 A; 1NM6 A; 2TRM A; 3E0N B; 4INH A; 5E0J A; 2ZFR H; 3VB5 A; 1LKB A; 3DSP A; 5I46 H; 2BVX H; 2CV3 A; 2JH0 D; 5C1X A; 1MBM A; 4AN7 A; 2WYG A; 2Q6D A; 4CRD A; 1AKS B; 4YLU A; 1ZJK A; 1EZU C; 2O8T A; 3RML H; 1W2K H; 3P92 A; 2OC1 A; 1Y3X A; 1RFN A; 1CVW H; 1WQS A; 2IPH A; 2QA9 E; 2ZTY A; 1UVU H; 1YGC H; 2CF8 H; 2H9T H; 3VB6 A; 3ZVG A; 2Y82 A; 4MPW A; 4AG1 A; 1CSO E; 2XRC A; 1J14 A; 1O3G A; 1XM1 A; 2BDC A; 5LPF A; 3D62 A; 3G01 A; 4ZHA A; 1V2M T; 1G3C A; 1MD7 A; 1C4Y 2; 2XCF A; 1FN6 A; 2XC4 A; 2CMY A; 3MU0 A; 1GJ7 B; 5T1V A; 4INL A; 4Y8Z A; 2ZU4 A; 1P9U A; 2XYA A; 2P8O B; 2HLD D; 1GJA B; 4ZHL U; 4DT7 B; 3UQO A; 3A89 A; 2J92 A; 1ZMJ A; 2AGI X; 2Z6B D; 1V2T T; 4AYV B; 1C5L H; 4Y7A A; 1SGY E; 1GJ5 H; 3TK6 A; 1QB6 A; 1KDQ A; 1NRS H; 1T32 A; 1UVT H; 2LEL A; 1OP8 A; 1H1B A; 1NBM D; 3RUO A; 1WCZ A; 3BTE E; 3UOP A; 1YPM H; 2J38 A; 3NCL A; 3P17 H; 1MAB B; 1N8O C; 1UK3 A; 3N7E A; 1BTW A; 1C2K A; 2ZCK P; 3VGC B; 4XRN A; 2BOH B; 3PB1 E; 4RN6 A; 3KF2 A; 1MMJ N; 1XUF A; 1SGC A; 1XUJ A; 1ZTJ A; 4ZKR U; 5DP6 A; 2K1Q A; 3QTO H; 5AFZ H; 1TAW A; 1XVO A; 3B8J A; 1HGT H; 3GY3 A; 1O3F A; 3M61 U; 1LCY A; 1G32 B; 2VWN A; 2ZF0 H; 4P00 A; 4WXV A; 2DE8 A; 3AW0 A; 5EIY A; 2P59 A; 2EC9 H; 4ZCN A; 4BTT B; 3SOR A; 1BT7 A; 2P95 A; 1TGN A; 1A5I A; 2C8X B; 2PTC E; 3NRL A; 1PPB H; 1PYT C; 2VH6 A; 3BIV H; 8KME 2; 4ACA A; 3ITI A; 2PUQ H; 4OM9 A; 1FMG A; 4OGX A; 1LPG B; 1OWK A; 1G2L A; 1K21 H; 2FYQ A; 3T5F H; 1GMC F; 2VWL A; 5HM2 A; 3RU4 T; 1F5R A; 1E38 B; 1O2Z A; 2FI5 E; 2GMT C; 5JBA S; 1OWE A; 1MZA A; 1DPO A; 2G5V A; 4F4O C; 1QHR B; 3SU5 A; 4OS2 A; 1K1I A; 2OC0 A; 1HUT H; 1GHB F; 4A1X A; 2ANW A; 3E0P B; 1W0J D; 3KGP A; 1BHX B; 4ISN A; 2STA E; 5DGJ A; 1T8O A; 3RMO H; 1HAI H; 4NA9 H; 2BLW A; 1GDU A; 4D76 A; 4YES B; 4A7I B; 2KR7 A; 1XKA C; 1GVZ A; 3U9A H; 1P01 A; 1PQ5 A; 4ZKO U; 3KID U; 2QCY A; 1O34 A; 5F8Z A; 2K8I A; 3RXC A; 1SLU B; 2D1J A; 1E37 B; 1Q2W A; 1QR3 E; 2SGP E; 4X6P A; 3GS9 A; 3EDX B; 4H6S B; 3T28 A; 2RA3 A; 2ZDV H; 1V2O T; 2JDI D; 3RC6 A; 5EXM A; 3W1E A; 1BMA A; 9EST A; 3OTJ E; 4HG6 A; 5EW1 H; 2LP6 A; 3N7O A; 1CGH A; 1LVM A; 4YOI A; 2Y80 A; 2BXU H; 5DN6 D; 2NU1 E; 4GLY A; 1TPP A; 3LGW A; 4TSF D; 4ABB A; 1C2I A; 5EPN A; 1O31 A; 2WUB A; 4GAW A; 1GBC A; 4P02 A; 1O2X A; 2EI7 A; 1RIW C; 2WV4 A; 1GL1 A; 5HIY A; 3TLO A; 1KXA A; 2FOH A; 3A7V A; 4AYY B; 2HNT C; 2Z3C A; 1HJ9 A; 1AE5 A; 3U8O H; 2DUC A; 1C2H A; 2B5T B; 3K6Z A; 1A46 H; 1HAX B; 3UY9 A; 1GHA G; 2PKA B; 3LGI A; 5A09 A; 4K1E A; 1C4U 2; 1C5T A; 1DY9 A; 1TA6 A; 2G51 A; 1FY4 A; 4JZ1 A; 1TYN A; 1Q31 A; 2GGV B; 2HRV A; 1O3D A; 2WPJ S; 2R2M B; 3A80 A; 2XBW A; 4B2A A; 2BD7 A; 1Z8I B; 3LKW A; 2ZHE H; 1O3K A; 1J15 A; 1O36 A; 1L4D A; 4MTB A; 1CE5 A; 4JZF H; 1GVL A; 3SBK A; 5EXL A; 4ABG A; 3ZV8 A; 1P8V C; 4AOR A; 4ZKS U; 1P06 A; 2W26 A; 3A88 A; 1G9I E; 3BTF E; 3K9X B; 3Q3K A; 2A7H A; 4IN2 A; 4HI3 A; 1YPG H; 1SFI A; 1QBN A; 1T8M A; 3M5L A; 2QAA A; 1TNI A; 4JZE H; 4BTI B; 1YCP M; 1E35 B; 3AW1 A; 1OP0 A; 1TMU H; 1P2J A; 4Y10 E; 1BZX E; 2J94 A; 2I6S A; 1SBW A; 1WU1 A; 2VID A; 2OIN A; 1OWH A; 5EXN A; 3URD A; 3A82 A; 3EE7 A; 3Q3Y A; 2HWL B; 4K5Z A; 1UTO A; 1S85 A; 1VJA U; 4UD9 H; 4B75 A; 1ZGV A; 3ZYE A; 5HM9 A; 4JK6 A; 1TPO A; 1BTY A; 3A85 A; 2A2Q H; 1LHF H; 5BPE A; 1SGN E; 3UOU A; 4QT8 C; 3BSQ A; 3Q77 A; 1IQE A; 1EFR D; 2V7Q D; 1DDJ A; 4AZ2 B; 4X2W A; 4Q80 A; 3P8N A; 3L3T A; 4RSP A; 4B76 A; 4ISI H; 5A8X A; 1O2S A; 4RKJ B; 1NPM A; 1ZLR A; 4CH8 B; 2P8O C; 1PPC E; 5E2O A; 8GCH F; 1O5G H; 1ANC A; 2FOG A; 5L2Y H; 5C20 A; 3MNX A; 2BVR H; 4JYU H; 3CP7 A; 1LDT T; 1JIR A; 2H5D A; 1O3N A; 1V2S T; 2RG3 A; 1NES E; 4D8N A; 5HIZ A; 1S6H A; 1C1O A; 1FIZ A; 1NRP H; 5KED A; 2J98 B; 3ZIA D; 2FI4 E; 3K65 B; 5PTP A; 2AGE X; 1UTJ A; 1TX7 A; 3VGC C; 1EAS A; 1FAX A; 1F2S E; 1T4V H; 2ZDK A; 1FJS A; 3TPI Z; 3M3V A; 4WMF A; 3ZZ3 A; 1C5M D; 3GY2 A; 3TU7 H; 3LGU A; 1SQR A; 2QIQ A; 4I33 A; 2M2A A; 2ZTX A; 1C1N A; 2V3O H; 1O3L A; 1Y59 T; 2AMD A; 1ELC A; 1ESA A; 3MHW U; 3I78 A; 2F9P A; 1A0J A; 2BD3 A; 4BAN B; 1GMC G; 5F53 A; 2VB0 A; 1GI5 A; 3T2N A; 1V2U T; 1Z6E A; 4GSO A; 2ZDA H; 3RMM H; 7EST E; 1TGT A; 3MH4 A; 1EST A; 4KP0 A; 5E8E H; 2Z9L A; 4X6O A; 1ZPC A; 3P8O A; 3PLP A; 2LNC A; 2Y7X A; 4GCH F; 4K60 A; 4ZXY H; 3SO3 A; 2PTN A; 3SU0 A; 1AB9 B; 2JJ1 D; 4R0I A; 1TB6 H; 5DG6 A; 2QN5 T; 1QA0 A; 1W8B H; 1INC A; 3MWI U; 2KCP A; 4YM9 A; 1O2O A; 2ZEC A; 2H5C A; 3ZVA A; 1UO6 A; 3F9G A; 2OLG A; 4ACB A; 5SGA E; 1CT4 E; 5JPM H; 1VCQ A; 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