5CPLA

The crystal structure of xenobiotic reductase a (xena) from pseudomonas putida in complex with a nicotinamide mimic (mnh2)
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
359
structure length
359
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGLINDWHQVHYASMARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIGADDARGWETIAPSAIAFGAHLPNVPRAMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPETNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Xenobiotic reductase
publication title Better than Nature: Nicotinamide Biomimetics That Outperform Natural Coenzymes.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas putida
total genus 130
structure length 359
sequence length 359
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5cplA00
4GC4A 1JR1A 2H90A 3I68A 3NQEA 4IXXA 2FFCA 4S2BA 3ZR4A 3W1TA 2R14A 3W23A 3DHDA 1A53A 1WOAA 1OX4A 1G6CA 3W1MA 4JTKA 3LTYA 4O53A 1OK4A 2X2GA 3E49A 1O95A 4I7UA 3F4WA 3JRKA 2ALDA 4AAJA 2WPBA 1SZGA 4XZ9A 3VNDA 3DFOA 4UTLA 5LNWA 4Y9AA 4RCXA 3UPWA 3G1YA 4O1BA 2Y62A 3U6WA 3VFLA 3NAVA 3MWAA 1JUEA 1L6WA 1K03A 2EKCA 1DQWA 1S5TA 4YCOA 3WK0A 5DELA 3PF3A 1AK5A 4JY8A 4Q33A 3LV6A 1EUAA 3EX4A 4GWEA 3KRSA 1A50A 2GVJA 3BG9A 3PB0A 3G3DA 4JTGA 4WQ6A 3RU6A 5K9XA 4MYXA 3P5ZA 2C14A 1PIIA 3A23A 3BV4A 4Q32A 5KZDA 2NXHA 3LCXA 2QKFA 5CZ0A 3GKAA 4MZ1A 3S5NA 1KM3A 1X8FA 3G1AA 4MKNA 2I14A 3WK3A 1X1ZA 2NWSA 3LHWA 4RZ6A 5TQLA 4MYAA 1UASA 1ICPA 1ZAIA 1D9EA 3GZ3A 3B4UA 2ZQ0A 1A5BA 4IUOA 3MP4A 4LVAA 3TNOA 5I3FA 4Z0SA 3ABSA 3ATYA 4RK8A 5KZEA 2ZTJA 2Y88A 3GLCA 2GVGA 3NR0A 3P84A 3W2JA 4ZVJA 1KFBA 3L0GA 3TMLA 3MMTA 3NEVA 4JNMA 3GDTA 3OVPA 5F4SA 1HUVA 1NF7A 3TFCA 1VCFA 1KM2A 3SSJA 4UMAA 2QEZA 3STGA 4YXGA 3TXVA 1H62A 3T40A 2JKPA 2Z6JA 3LBMA 1HTIA 1VRDA 1DVJA 3EKZA 4WY0A 1OFEA 2OZ0A 4MLRA 4FIQA 3TQKA 3TW6A 4JIQA 4AF0A 4LUIA 1OX4B 3L5AA 5FF4A 1BWLA 4HNNA 5H2ZA 4OQVA 1GG0A 2NZLA 1IIGA 2ATSA 3W87A 1NSJA 1EA0A 1AL7A 1TJRA 1KTBA 3IGSA 1P4CA 3UYCA 3L67A 3P74A 2FLIA 1FWNA 1XFBA 1LRQA 3S5YA 3TV8A 2VELA 5DCBA 2FPVA 1KTCA 4OT7A 2ZZ1A 4Z08A 3W2NA 4O54A 1WYIA 1F5ZA 2VFGA 3R5EA 3MP5A 3TK7A 4O0KA 1KFJA 2Y7DA 1CW2A 4JTIA 3KX6A 3W86A 4CQAA 3LI0A 1K3UA 5I3KA 4FXRA 4O1AA 1K7EA 1ICSA 2GQ8A 3UWVA 1YTDA 3PG8A 4ZQPA 3NZRA 4QJ1A 3Q58A 2Z6IA 2YYTA 2C18A 3WK1A 1QPQA 2A7PA 1B57A 2PE4A 1KM4A 2QAFA 3LERA 3NYZA 3FIGA 3A21A 4RJEA 2QJIA 1FY6A 4LOCA 5J5RA 3Q94A 4XWUA 1KFLA 3HF3A 2ZCGA 4QM1A 3W6YA 1DJQA 3ABQA 3S1XA 3HIJA 1VH7A 2GQ9A 3PBWA 2JK2A 4NNCA 4JDBA 3BLIA 4CLMA 3FYPA 1K8YA 3W1PA 1B4EA 3WK2A 2AAMA 2QDHA 3RMJA 2X1RA 3LHVA 3UD6A 1GEQA 3B8DA 3W1UA 4JTEA 2WSRA 2JKAA 2WSQA 4DO6A 3F4NA 4C1LA 5LNSA 3G1DA 2CFFA 1GVRA 1JCMP 2CW6A 1V7YA 1H7OA 4O18A 4IXHA 4AF0B 2GUUA 4UTTA 4LC8A 4AHOA 3W7IA 4IMDA 3IIXA 1SW3A 4XKYA 5CZJA 2FIQA 3G1VA 1BKSA 1NF0A 2J9ZA 5DXXA 4YCPA 5IM51 4JEQA 5HUOA 3OIXA 1QOQA 2VEMA 2YCEA 2VFIA 3O16A 2TRSA 3W7LA 5EKYA 1R47A 1TPB1 2VKZG 2VFEA 1YPFA 4AWSA 1FDZA 4O57A 2W79A 3RNDA 1SZNA 2Z0IA 2GPTA 3GDLA 1N8FA 1Y0EA 4HPJA 3G22A 2AQWA 1DV7A 3QMTA 5DCDA 5EMUA 3EWBX 3I7SA 4WOZA 1JCLA 3CPRA 1GVSA 1TTJA 3BGGA 3UWUA 2YDAA 4Z1BA 2YX0A 5AC7A 4M19A 1QDSA 3IVUA 4FNUA 2WNQA 1OFOA 5HULA 5AHMA 4I9AA 2OCZA 4JXCA 4JY9A 4TMCA 3W74A 3STCA 3O15A 1PV8A 2JKEA 3LXBA 1TPUA 1Z41A 3NM3A 5I3GA 3A9IA 2R94A 3THQA 5I3IA 1GVOA 2E6DA 3W7CA 2G95A 1A5SA 2CLIA 5D09A 4QSHA 3W22A 1SUXA 3T55A 2EGZA 5LHEA 3LHYA 1SO3A 1Q45A 1LLWA 4CCDA 3IIOA 3W7EA 2J27A 3EEGA 1WOBA 4OBTA 4UFJA 4BI7A 4MVAA 1J4EA 1RR2A 3DGRA 3EB2A 3W70A 2ZA1A 3Q37A 3TQVA 4FNSA 1UUMA 4LV4A 3DI0A 5G1TA 2PRLA 4MZ8A 5K3VA 2VFFA 3P67A 1KW1A 2WV8A 1OJXA 4M5PA 5HWNA 3C2EA 3M41A 1MSSA 1ME8A 3DFQA 3O8AA 5KITA 3HGRA 1TTQA 4DBEA 4HT3A 3L68A 3JR2A 3LBCA 3E0IA 3TUUA 2E5BA 4N9CA 2C0AA 4LC6A 1M7OA 1O5XA 4UIOA 3FKKA 3C52A 5TIMA 1OABA 3MJYA 3GR8A 4NXKA 3LTSA 4GJ1A 3HB9A 1QR7A 2A7NA 4O14A 1GZGA 2UV8G 1JUBA 2QCDB 1XCFA 3W7NA 5IBXC 2GQAA 4LU0A 4JTFA 3W88A 4ZZ9A 2JGQA 1JCJA 1XBVA 1VHCA 3KRUA 2J88A 3QC3A 4OGZA 1TPVA 4OU1A 3B0VC 4K8HA 4WJEA 1AW2A 3THAA 2RH9A 2YSWA 2ZYFA 4ZL1A 4ALDA 2C16A 2WQPA 4FX7A 4H3DA 4UMBA 2QAPA 3IRDA 1KBJA 2P0OA 4JIPA 3G1XA 1OFRA 3WJSA 1TPEA 5AYZA 1RVGA 4QAIA 4NXSA 2YZRA 5I3JA 4JYFA 4ZQRA 4X2RA 2ZTKA 4ORMA 2V9DA 4TO8A 2EF9A 3NQDA 3SJ3A 1JCXA 1YXDA 3UWWA 3L5LA 4O19A 3TSDA 2ZRUA 2FDSA 4U28A 3LRLA 4MFDA 4K37A 2OT0A 4HNUA 3QQ0A 2X16A 2ZRXA 3HQ1A 1E51A 4ADUA 2DZVA 3HO8A 1VYSX 3PVFA 3TC6A 3LB0A 5D2TA 2AGKA 1B9BA 4UTKA 3MUXA 3ANYA 3G3MA 3U8GA 4MJZA 3TA6A 2QCFA 1Q3NA 4ORIA 1SQ7A 3PAJA 4I7VA 5AHLA 3N9SA 2C13A 3EXTA 4QISA 1I4NA 1SZFA 3C56A 2VOMA 2DJXA 3EXRA 5F4XA 3OVQA 2V2CA 4JD4A 1TMHA 1JULA 2D73A 3H55A 2BWGA 3NPXA 1OYAA 3KVLA 3QM3A 4ICNA 1RD5A 1P0KA 5D04C 3GX9A 4FNPA 4CQ8A 4LVFA 3C61A 1YDOA 1GPWA 4O4VA 4K7YA 1ALDA 3KOFA 3NNTA 1FWRA 1OK6A 3P5YA 5D33A 2XN0A 1XDLA 1RV8A 5K9DA 1C8VA 2F84A 3DFPA 5EYWA 4FB7A 1T8XA 1OYBA 3W7QA 3C2VA 4JX4A 4MY9A 1J5TA 5F2IA 1KV5A 1G4EA 3M5YA 1OFDA 1TPFA 3BGJA 3TSMA 2NX1A 4EF8A 4FNTA 3MO7A 4MUZA 2VC6A 3GNNA 5E93A 3LX9A 5FF0A 4LWWA 2EHHA 5FEPA 4JYDA 1A5AA 4B5NA 3C2RA 1O60A 3T78A 2QUUA 3GIYA 3GXNA 1G7VA 1IXOA 3RLUA 3HOJA 3G0XA 5LHFA 3V1PA 1DBTA 3N3MA 4O10A 1PE1A 3B0UX 3TROA 3KVMA 2NXIA 5F2LA 3EWWA 1XUZA 2BX7A 2NUWA 3W7HA 3P7YA 3PSWA 4LRTA 1SW0A 3OA3A 2J6XA 3EWUA 3TMQA 1TREA 5DN1A 4DPPA 3C4UA 3CHVA 1FXPA 4M7TA 2X30A 1EEPA 1U83A 2Q8LA 1ONRA 4NNBA 1OX5A 5FF3A 3OBKA 3B05A 5K9CA 2JBMA 4TU1A 5U4NA 3W2KA 3C8FA 4WXYA 5DBUA 1EP2A 3SZ8A 3M7WA 5D2XA 4H4IA 4RXGA 5DXYA 2A1YA 3N34A 2RKXA 1DOSA 4QQ3A 5AHEA 4N2YA 4AMAA 2X1TA 1K02A 3L2IA 3LCHA 3TW7A 2A7RA 1HFBA 1PCWA 2ZRWA 2CZ5A 4OHQA 3DFNA 5HWMA 1TV5A 1H60A 1HL2A 1BWKA 5AHIA 1ZNNA 4PA8A 1SW7A 5K7JA 4GUGA 3CC1A 4UCGA 1OHLA 2VEPA 5TBOA 3WJWA 1I45A 3W3OA 1TCDA 3GAYA 3GYEA 5EA9A 4FNQA 2Y7GA 3E96A 3MHFA 1CI1A 4FIRA 4LVGA 4HNTA 5K4ZA 3CT7A 5GVJA 1N55A 4EOUA 1O4UA 3W7DA 3NQ6A 2WOQA 4DF2A 1VCGA 2OT1A 4QITA 3UXAA 3VI2A 3VCRA 3PR2A 3I65A 3LCLA 1LOSA 1GVFA 3PS7A 1UCWA 4N6EA 3QSTA 3A5VA 1K8ZA 2Y70A 3GDMA 2WJZA 4CNNA 7TIMA 3CM4A 1IXQA 3N73A 2Z1BA 3FOKA 5DLCA 5KSWA 4O11A 3USBA 2QCMA 3P8JA 3PUEA 4HSNA 4HHPA 1KFEA 4FX8A 5DBTA 1F74A 1DHPA 1M6JA 2FB2A 1FCVA 2E68A 1KTNA 3UQNA 2CLHA 3M6YA 3SGZA 3HGOA 4UTWC 1W5MA 3W73A 1KFKA 1YYAA 3HG3A 5L9FA 3BW4A 3PWAA 4PC8A 3DXIA 2P10A 3NOEA 1IXNA 3T7VA 1EPXA 4N9EA 3S1UA 1VC4A 1MXSA 4YMZA 5FF7A 4AXKA 4A3UA 1R2RA 3EWYA 2XFWA 5CPOA 4ML9A 3QPYA 3PM6A 4NQ1A 4PODA 3W1AA 3RFAA 2E6YA 2ZFAA 1LOQA 3NQFA 3G24A 1THFD 2YGYA 5CGQA 3PULA 3QPZA 3R8RA 4E0CA 3BPWA 4NT0A 5C5YA 4HSOA 2V2DA 1S3HA 3TQ0A 3IIZA 3TE9A 3OVRA 3G0UA 2VXNA 1QWGA 3GK0A 2TYSA 2V81A 4D2JA 2ZZ4A 1I8JA 2DZTA 1YTKA 1O94A 1QOPA 3QYQA 4NJGA 3MYPA 4RXFA 4ADSA 4X3ZA 2NV2A 1TTPA 2ZRYA 3DAQA 5EBUA 4O28A 1H7RA 3CWOX 3EWXA 1WV2A 1SO4A 4IPJA 2C15A 2V82A 3I7RA 4UFHA 4A2SA 4O52A 4M6PA 5F4WA 1WBJA 2QR6A 2E1DA 4R34A 2YPIA 4NVTA 3A5FA 1LORA 3S9YA 5J5DA 1LBFA 4GFSA 5F2MA 1KM6A 2Y61A 5G4EA 1W5PA 3TXZA 1G4TA 1AW5A 4PH6A 4E2DA 2DP3A 1QPOA 1AL8A 5IBXA 3I6RA 4UR8A 3W7MA 2RDUA 3KXQA 2HTMA 3HPZA 4MJMA 4NJKA 4GUIA 3AO0A 1QPRA 3ZS4A 1XBYA 1W5OA 1W1ZA 3UZJA 2F7FA 2NUYA 5H91A 4QIUA 1TV8A 2CWNA 4LV9A 5HINA 4PTNA 2A0NA 3NL5A 2ABBA 3LGEA 1NAL1 1ME9A 3BK0A 2Q3RA 4GNJA 2CLKA 3A22A 3BW2A 3IIVA 1U5JA 4NJHA 3NXFA 1V5XA 1H1YA 4MIMA 4XUGA 3T44A 3LXAA 2QUVA 2FTPA 1SZEA 1PHQA 3EXSA 4L4LA 4CCCA 4JS3A 1K8XA 1H7WA 1RQBA 3W7JA 1S5WA 4IOTA 3TX9A 2E6FA 4G1KA 5AFDA 1XL9A 5D38A 3FS2A 3M44A 4K38A 1YXCA 4EWND 3O6DA 3LHZA 1TPC1 1JJKA 4MPQA 1YXYA 1MEIA 2Y63A 3PUDA 1LCOA 5LKYA 3CU2A 2QCDA 1MEWA 3PBVA 3NQ8A 1R30A 4EVZA 5A5WA 4IGHA 3HG5A 2PCQA 2FPTA 1IGSA 1FX6A 1SSGA 2C1HA 5HWJA 4DXVA 1VJIA 2W0UA 2ZZ3A 5G2HA 4LVDA 1KLYA 3LCIA 1SPQA 4I7WA 1AG1O 4JTLA 3LI1A 1M7PA 1XXXA 2DZUA 1JVNA 1XC4A 1UB3A 1FDYA 3TCEA 2XN2A 3LM7A 4S2CA 4DF1A 4KFOA 3CEUA 3MW7A 4O13A 3Q2DA 4TR9A 4UTUA 1LLZA 2YFNA 1J2WA 4C1KA 5AHFA 2QCNA 4FF7A 2V2HA 1LOLA 2E5CA 4LS0A 4UFMA 3UPBA 3E9AA 3SR7A 4GUJA 2NWRA 2DJLA 4LUJA 4POCA 1YLVA 3TKFA 6ALDA 1W31A 4LY8A 1H51A 3LLFA 4PL2A 3O06A 3MI3A 4FNRA 1TIMA 4LS1A 1GYLA 1JQXA 1T96A 3CB8A 3NG3A 1TTIA 1EP3A 3W7RA 1TV7A 1D3GA 3KVKA 1O5KA 4ADTA 3F1QA 3ZFHA 1NFBA 2QUTA 1RQHA 4L4MA 2EPHA 3B06A 2QCGA 3DHFA 1W8SA 1SR9A 3P61A 3BARA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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