5CT0A

Crystal structure of ck2alpha with 3-(3-chloro-4-(phenyl)benzylamino)propan-1-ol bound
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
GPVPSRARVYTDVNTHRPSEYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
publication title A fragment-based approach leading to the discovery of a novel binding site and the selective CK2 inhibitor CAM4066.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 111
structure length 326
sequence length 326
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ct0A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5ct0A02
4IC8A 4J97A 3FEGA 3A4PA 4ITIA 5FRIA 4RWIA 1CKJA 4IWDA 3PSBA 5TR6A 5IH4A 3K2LA 4RIXA 3U51A 3HRFA 1L3RE 2PMNX 2F7XE 2YITA 4D0WA 2QOBA 3DT1A 4NWMA 5LWMA 5HBHA 3MWUA 3GFEA 3FUPA 1O6YA 2VUWA 4KS7A 3TACA 5IA3A 4X3JA 1K2PA 2YA9A 4RIOA 5AP7A 2NRUA 3DAJA 3TG1A 2JDTA 2B1PA 4IFCA 4KIKB 3C0IA 3OXTA 2EU9A 2W1EA 2HZ4A 4IBMA 5DFPA 5C8NA 4PDPA 5I0BA 3LLAA 2JD5A 4FSTA 3DAEA 3VBYA 3TDWA 2O5KA 2PUUA 2C3JA 1YQJA 1JKSA 3QUDA 3ZFMA 1GJOA 4FNZA 3TWJA 5LVNA 3MH1A 3OMVA 4OR5A 4IX3A 3PLAE 4G34A 3U6JA 3LMIA 3F5UA 2AUHA 4R6VA 3L8SA 3VWAA 3P7BA 1TQMA 3RKBA 3LE6A 4ZY4A 4L67A 3D4QA 5M4UA 2XEZA 5EOLA 5ETFA 3W8LA 5EQEA 1VEBA 3DFCB 5DR6A 4IB1A 3RALA 2KTYA 2UW7A 5FG8A 3R7IA 1AD5A 3ZUVA 5CEOA 4FSNA 2ZAZA 5DVRA 3SW7A 1UNHA 1GY3A 3IW5A 5FXRA 3NWWA 3ZM4A 5JFWA 2YJSA 5FEEA 3OCBA 5E8YA 2J0IA 5AR2A 4NJDA 4MWHA 5JZNA 1ZY5A 5CNOA 4FTNA 2QOLA 4ZSLA 2C6LA 3WZUA 4FICA 2AC3A 1PXLA 3HGKA 4GSBA 4YJNA 5C9CA 1REKA 2R3PA 2WIPA 1ZYSA 3EKNA 4QTBA 4C3RA 2C6EA 4FV3A 4BCQA 3HL7A 3R8LA 2Y7JA 4CMUA 4ZAUA 2PULA 3SRVB 4ZMFA 1R1WA 4I4FA 4JX3A 4QQ5A 3LFDA 3POZA 4C4EA 5KKRB 4UB7A 5ITAA 3EFLA 3LJ1A 3QRJA 3TTIA 2QHMA 2VTJA 4C58A 4KSPA 3N9XA 4Y5QA 3U4UA 1YOMA 3P4KA 5BMMA 4M0ZA 4BY9E 3C0GA 4YZ9A 2JDRA 4XV1A 2I40A 4LRJA 4DH5A 3KL8A 4QT1A 3I81A 3MJ2A 2BRHA 3OOMA 3HRBA 4ZLOA 4YU2A 3G2FA 4ITJA 3RINA 2R3RA 3QD4A 3DA6A 3S3IA 3DNDA 4L52A 3GUBA 4P2KA 2OFUA 2JITA 3IGGA 4U5JA 5AP1A 2Q0NA 4O0TA 5CZHA 5AP0A 5FEDA 5FEQA 4QMQA 3ZLYA 4Y46A 5AV2A 1MP8A 3GFWA 4GFOA 3BEGA 3VS3A 4X2KA 4GYGA 5IDNA 4DGLC 4DTKA 5EW8A 3MW1A 5DT0A 4HYHA 2ERKA 3ORNA 2O2UA 4F1OA 3M2WA 4S2ZA 3C13A 3R7UA 4MBLA 3FZOA 1GAGA 2QOKA 3ORZA 4DGOA 1T46A 2CN8A 3LFNA 1BLXA 4EEVA 4CKJA 2YN8A 3QWJA 4X2NA 5A6NA 2C5XA 5CAPA 4NUSA 4MBIA 4ZEGA 3A7HA 4H05A 3QQJA 3RCJA 4IEBA 4BIBA 1M7NA 1FVVA 4CFVA 1Q97A 3NCZA 3BU6A 4RVTA 2GHMA 1OM1A 3LFBA 5DEWA 3OROA 4HGSA 1H08A 2VWBA 2X7GA 4FTCA 3WF6A 2CHLA 4ASZA 3CTHA 4FKWA 4IM0A 4QTAA 3KXNA 1NA7A 2QOFA 1ZMVA 2JDVA 3RWQA 4IZAA 4DH3A 4NEUA 3RM6A 3UG1A 2VWVA 5EYDA 3TT0A 3Q4UA 4GT3A 4HNIA 5HO7A 2PE2A 2W96B 2X6DA 3MFTA 2GDOA 2J0KA 2BAKA 3LFFA 2HZ0A 3PRIA 3GU6A 3WZJA 4PMSA 4BDFA 5L2TA 3OY3A 2J5FA 4RPVA 4AA0A 1QPEA 4YSJA 3BU5A 5TT7A 4XX9A 5A4CA 3IW6A 4P4CA 3NUXA 5TE0A 4AS0A 2XNEA 4WBBB 1M14A 4PMMA 3NUYA 3DQWA 5LOHA 5BYZA 2UV2A 2GNGA 2WPAA 5ICPA 4O82A 1JBPE 4YZNA 3ANRA 5IQCA 4LOOA 3OCGA 3D2IA 2XM8A 3OEZA 3C4FA 4DGGA 4S30A 4JQEA 1LUFA 4GKHA 4BBEA 4XH6A 3G51A 3PLSA 3RP9A 2BKKA 1H24A 2W4OA 5HBEA 3S00A 5L6OA 3TKHA 5HLWA 3ZHPC 4TYJA 3BI6A 1OMWA 5D7VA 3F88A 2YEXA 3BIZA 4CV9A 1W83A 3MA3A 3T8OA 2WHBA 3OTUA 4PMTA 5HTIA 3LXPA 3E64A 2VTSA 2XEYA 4XRJA 4IZ7A 4CFNA 1IAJA 3DXPA 3R8MA 3EN5A 3QRIA 3ZZWA 3TUCA 3MPAA 1Z9XA 4UY9A 3RZBA 2PZ5A 5KO1A 5J1WA 3C5IA 3MYGA 1H1RA 3A8XA 4RMZA 3TCPA 3QA8A 2UZDA 4UX9A 4QMVA 3II5A 1E1VA 3KXHA 5JFXA 3CBLA 2X7FA 5CSVA 3SA0A 3RPOA 5AMNA 1WVXA 5LQFA 1DI9A 1UA2A 4GJ3A 4H36A 3BBWA 4JLCA 4M15A 3UVRA 3WF5A 2R3GA 2C0IA 3PPKA 1U54A 2OZAB 4KKEA 1S9IA 3BQRA 3KEXA 3U4WA 1KWPA 4V05A 4FTJA 2DWBA 5K0XA 3R2BA 1OL2A 1MQBA 2B9IA 2C1AA 4IX5A 4WNMA 2PHKA 5BVWA 5IQDA 4GK3A 3WF7A 4JNWA 3QTZA 2RL5A 1KV1A 1Q41A 4MEDA 1HOWA 2YLEA 4OTQA 5A9UA 2Q83A 5B0XA 4BDJA 4TW9A 2GTNA 3DKFA 4IM3A 4QMXA 1UV5A 2QURA 2QHNA 4TPTA 2WTDA 2VRXA 2GNLA 5L8KA 1GIHA 3EQCA 3F66A 3PYYA 4XG4A 5BUJA 3K3JA 1PW2A 3AD5A 4YZCA 4A4OA 4ANLA 4FMQA 1R0PA 4Y85A 5AAGA 3DZQA 3NR9A 3B2WA 4MXZA 4YP8A 3VRYA 5CSHA 1PKGA 1GZOA 2W1GA 4O0YA 4AWIA 3QFVA 2VN9A 4E4XA 2P2HA 2VNYA 2XYUA 3PRFA 4L42A 3ORLA 3QLGA 4HYUA 2HZIA 2F57A 4EONA 2X8IA 3KULA 1E9HA 4I6BA 2ETMA 2W1ZA 2UZVA 5AR5A 2BZHB 2X1NA 2WQBA 3PXZA 4FKIA 4AU8A 3EN9A 4EHZA 3DKCA 5J1VA 2QONA 2OXYA 5IZFA 4CYJA 2IVTA 3VBQA 2C6MA 3Q4CA 2WMXA 4ZJVA 2P3GX 3EQBA 3RNYA 2WU6A 2YHVA 3DAKA 3LFEA 4ONAA 4RVLA 3K5VA 1BL6A 1P2AA 5DPVA 3R9OA 4FTTA 4PL4A 1ATPE 5HNIX 5HX8A 1JLUE 5IA0A 2Z02A 3C51A 2OJ9A 4O27B 4C0TA 3R9RA 3BGQA 4KRCA 1PYEA 5T3QA 5C4KA 2R3IA 2XNNA 2E9VA 3QKLA 5A46A 2VO6A 4MBJA 4D4VA 3COHA 4AGUA 4MCVA 2J5EA 3QLFA 3RNIA 3UO5A 1FBNA 3NEWA 4YO6A 2CDZA 3CEKA 4CQEA 3BE2A 4HW7A 5ACKA 3VN9A 1MUOA 4XJ0A 2VTNA 4WSQA 5G6VA 2BZJA 2V22A 4RIWB 1W7HA 1J3HA 1JKKA 4NU1A 3LHJA 3MS9A 4QYGA 2A4LA 2ESMA 3R83A 3MH2A 4V01A 3KRXA 5ANDA 3SKCA 4FZ7A 4BI2A 3QC4A 3QXPA 4GT5A 3U54A 3QCSA 2VTTA 3OTVA 5BQ0A 3BCEA 5DHJA 4Z3VA 5K3YA 3CS9A 4YBJA 2R7BA 2YERA 4FIIA 5KMNA 1JAMA 3CQWA 3R1YA 5HX6A 2VTRA 3RAIA 5A4LA 3JVSA 1ZWSA 4F9AA 1I44A 3RWPA 3BEAA 4UXLA 4AFEA 2VWYA 4L46A 5IA2A 3VBTA 2R0IA 5LMKC 4XMOA 4AXAA 1V0PA 2Y4IC 3C4WA 3DK7A 4JAJA 4QTDA 2G15A 4OUCA 1UNLA 3E92A 5EM7A 3M11A 1ZZ2A 3QGWA 1H00A 3I79A 4G6OA 5AP5A 3CR0A 4D9UA 4C8BA 2V55A 3QTQA 3WZKA 4EQCA 4NH1A 3QZFA 4AN9A 2WIHA 4HPTE 1JQHA 4A9RA 3LJ2A 4AZSA 4OTIA 4ZTQA 2G1TA 3R30A 4QMUA 4HGLA 4IDVA 4EYMA 4NKSA 1RW8A 5AUZA 5I5ZA 2IVUA 4ZJJA 4WRGA 1YWNA 2R3NA 3GP0A 5F9EA 3W32A 3GI3A 3Q9XA 1O6KA 2VWXA 3V5LA 3QL8A 4X3FA 3NYVA 3QRUA 3FZTA 3OWLA 4EZ5A 4DF3A 3KXMA 4QPMA 3VS2A 4BC6A 4RC2A 4XOYA 4DHFA 1DAYA 1OKWA 3NYNA 4RLKA 3KRWA 3V5TA 3MPTA 2F2CB 4RBLA 3R7OA 3LMGA 2VTPA 2Z7LA 3O0GA 2WOTA 4BN1A 4FL1A 3SHEA 3FY0A 2WMWA 3EQFA 4M13A 4ZJIA 3V5JA 1XQZA 2PWLA 3CD3A 3OWJA 4U9AA 3VQUA 2OU7A 1KE9A 1PXMA 3PP0A 2P33A 4F64A 3D7TA 1NT2A 5CVFA 4GVJA 4O7ZA 1U59A 4PDSA 4Y95A 4CYIA 4FTAA 2I6LA 2W1HA 3UVPA 3RMFA 2IVVA 2J4ZA 4IC7A 5AV1A 4C4IA 5F20A 3OOGA 2PVNA 4PTEA 3ZCLA 2QNJA 4X3FB 3KY2A 3IGOA 4QP8A 4WNKA 4QRCA 2ZMCA 4PDOA 2WNTA 2OJJA 3EFWA 4DA5A 4ZTMA 1CTPE 4GG7A 5JGBA 3E62A 2BRBA 2V7OA 3EZRA 2IW8A 4UZDA 3TZ9A 3ULIA 5B2MA 4QYFA 4B4LA 1M17A 1OIYA 3H3CA 3I7CA 4P90A 2ZDUA 2WB8A 4FT0A 5AR3A 2ERZE 2X2KA 5CASA 1DS5A 2NRYA 3DKOA 1YVJA 4RT7A 5FP6A 2YCFA 1CKIA 2XM9A 3LQ8A 3C1XA 4KD1A 3EYHA 3MVLA 3R7EA 3MY1A 3T9IA 4BTFA 3ZBXA 2ETRA 2XH5A 4HYSA 4UZHA 1SMHA 1PF8A 5BUEA 1RDQE 3TM0A 3BYOA 3NW7A 4LGDA 4AAAA 2WD1A 3OXIA 1SVEA 2QOQA 4HVDA 3PA3A 4M14A 3F3WA 3FZRA 1WBWA 3TI1A 3HLLA 5EKNA 3F7WA 3MA6A 4OLIA 2WGJA 3RK7A 5K9IA 1PHKA 2PZIA 2BHEA 1BUHA 3LXKA 5C8MA 4KKHA 1WCCA 1PYXA 4UWCA 4L43A 1KE6A 5AM6A 4OTFA 1KV2A 4FTLA 4QP3A 5LVMA 3TV6A 5KCVA 5JK3A 5CNNA 4PP7A 2GNHA 3ZBFA 2XB7A 4IZ5A 3D0EA 3F5XA 4AW0A 2HCKA 3D5WA 2VNWA 3R04A 1YI3A 3H0YA 5CSXA 3OY1A 3E7VA 3CQEA 3QTRA 4IQ6A 4O0UA 5HICA 3A60A 4NCTA 2PVLA 4PL5A 5DMZA 4JR3A 5CU0A 1W0XC 2CKPA 2PE0A 2QKRA 4M66A 3ORKA 2W1IA 4JX7A 3ANQA 2OJFE 4NM7A 4J96A 4G31A 3NPCA 2IG7A 3UTOA 2QD9A 2OJIA 4I1ZA 3UG2A 2GSFA 4FV7A 4LYNA 3RHKA 4D1ZA 4EC8A 3LPBA 2HXLA 5BVFA 2HY81 3BYUA 1Z5MA 4E20A 4WHZA 5GJDA 3NLBA 4U43A 5KMMA 3VRZA 3VIDA 3KA0A 3P7AA 1ZY4A 4BI0A 2E9UA 4L8MA 2HWPA 4GIIA 4QO9A 3TUBA 3DGKA 3SAYA 4MNFA 5T6KA 4XYFA 4BWXA 3AC5A 5FTOA 4APCA 1REJA 2WFYA 1NVSA 2ZB0A 3CE3A 3M1SA 3V8TA 4AG8A 4Q5EA 5CEPA 2PY3A 5CANA 1SNUA 3FLNC 3UMWA 2XUUA 1CMKE 5E1EA 2PVKA 5JFVA 5A4TA 3LFAA 4JDIA 4DG3E 3B2TA 4I5CA 5EI6A 4TYEA 2YCRA 2W1DA 4DEAA 3LLTA 2Y6MA 1UU9A 2ITUA 5E8ZA 4ALVA 2X2LA 4IVCA 3OHTA 4R1VA 4TYIA 3MIYA 4IAIA 4O96A 3PIYA 1CDKA 3SV0A 2BDFA 1YOLA 2VAGA 3G0EA 4GJ2A 4L3JA 2JLDA 3F69A 4PPCA 4A4XA 4DTAA 3FMDA 5IQFA 3NMUF 2UW4A 3TV4A 3Q96A 4FT5A 3UIXA 4YJQA 2C30A 2G9XA 4LG4A 2C6IA 4CGAA 3MTLA 5FDPA 4IWQA 3DB8A 1G8SA 4YUQA 2B7AA 4C2VA 5KHXA 1H0WA 4FL3A 4JBOA 4J52A 4MF0A 2WMAA 5A4EA 4MNEB 3PJ1A 3E93A 5HCZA 5CZIA 3RI1A 5ACBC 4NSTA 3HUBA 5C26A 3VJNA 1WFCA 4W4VA 3UPXA 4W9WA 4W9XA 3VQHA 4G5JA 1OPJA 4UV0A 3QAME 3ID6C 4CEGA 2BAQA 4UWYA 3DFAA 5IKWA 5KBRA 3THBA 3IW4A 3G33A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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