5CVGA

Crystal structure of ck2alpha with a novel closed conformation of the ad loop
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
PVPSRARVYTDVNTHRPSEYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
publication title Specific inhibition of CK2 alpha from an anchor outside the active site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 326
sequence length 326
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5cvgA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5cvgA02
4GFGA 3DJ5A 5KKRC 4MQ1A 4JG7A 1VYWA 2IZUA 2PZIA 2Y6OA 2YIXA 3QQGA 5C4KA 3KF7A 4FL3A 4WBBB 4BDGA 3UMWA 5F4NA 2G15A 4NTSA 5AA8A 2FB8A 1KE9A 4RJ4A 3UO6A 1H27A 3UQFA 1SVHA 3FMLA 4HCUA 5D10A 2FSTX 4GEOA 3RPOA 3DT1A 2OI4X 2Z60A 4WG3A 2X4FA 4R1VA 4DFUA 3E5AA 4L01A 2WQMA 1UKHA 2OIBA 3L8SA 4UMTA 3VW6A 3O50A 4DH7A 5M4FA 1B6CB 3PVGA 3RK9A 4BI0A 2J7TA 1WBVA 1Q41A 3RTPA 2W9FB 1W84A 5I9WA 3KQ7A 3PG1A 3F61A 4OBOA 5CU2A 4G6LA 3CCNA 5ANOA 1ZYLA 3OUNB 2ZYBA 3AGMA 4AWIA 2YIWA 5TOZA 1AQ1A 2RFSA 2WQBA 4G34A 4CG9A 3Q04A 2YM5A 5JQ8A 2PUIA 4OT6A 3N4UA 3AGLA 4ZP5A 2C6OA 3O71A 2QOQA 2RGPA 2WMXA 4LYNA 4Q2AA 4S34A 5HBEA 2WFYA 3F3VA 5EK7A 4DH1A 4N57A 2QURA 2WZJA 4DEAA 5CF8A 1JOWB 2YCFA 3OOMA 4LUEA 5HIEA 5CTPA 4E7WA 1E1VA 4I5PA 3AD6A 4RMZA 4DAWA 5L2SA 1JBPE 5IDNA 3LCTA 3DKOA 4E6QA 4MNEA 3PY1A 3EYGA 2R2PA 4C8BA 1H1QA 2BAQA 3CPBA 3ZDIA 1WMKA 3GCPA 2RG6A 4OLIA 2WTDA 1PXMA 4FSYA 4UWYA 1S9JA 3ZM4A 4CFMA 3OVVA 3IDPA 3DU8A 3NMUF 5DFPA 4FVPA 3REPA 3V5QA 2ITOA 2WD1A 2RFNA 3FI4A 3MYGA 4PDSA 4RWJA 3R9RA 2ETRA 2V0DA 3AMYA 3PSBA 2PE2A 5DE2A 4PV0A 3TJDA 4BYIA 3LCOA 3Q4CA 5JGBA 4DEEA 4UMUA 4AOIA 1M17A 3LJ2A 1Q61A 2YCRA 3F7WA 4QP2A 3PVUA 4XV9A 4JQ7A 4GL9A 2V62A 3R9DA 5T68A 3LJ1A 2H6DA 4MWHA 4WKQA 4LQMA 4CXAA 2NRYA 1W7HA 1Q4LA 1LPUA 2IZTA 2PMLX 2G01A 3NSZA 3ZC5A 3AC5A 3TTJA 1I44A 4XP0A 4RQVA 2QCSA 1AGWA 3ZDUA 5IA3A 5DYJA 3PIZA 5TR6A 1GIIA 3FI3A 1J3HA 3O2MA 4U8ZA 3Q2JA 4M68A 1WFCA 4IX6A 1UU9A 1XQZA 4X2NA 4YLJA 5BVWA 3B8QA 1CM8A 5EKOA 5E9EA 4AAAA 2X39A 4OBQA 2PHKA 3QF9A 3F5UA 1Q8ZA 5A4EA 3OW3A 2UUEA 2QQ7A 2WMRA 3FKLA 4TN6A 4E93A 4BTFA 3SLSA 5BVOA 2BZIB 3S1HA 4X2KA 1WBSA 3WBLA 2RF9A 3QTUA 5FEDA 2G2IA 1J7UA 4JX3A 1WZYA 4UYAA 4M12A 5HG9A 2QNJA 3P5KA 4A9TA 3G90X 1H4LA 2GS6A 2GHGA 5ICPA 4X3FB 2IW9A 4QOXA 4DFLA 4GV1A 2QU6A 2J9MA 3BWFA 3DBDA 2XH5A 4RC4A 2XF0A 4OR5A 4DCAA 4EOKA 3WARA 2VO0A 3HNGA 4FV0A 3GVUA 4JDIA 4MHAA 3UO5A 5CT7A 4TY1A 2YISA 3MPTA 5A6NA 1NW1A 1JWHA 2XJ0A 2VTQA 5HU3A 5AP6A 2QOKA 1ZMUA 2PYWA 2IJMA 2YLFA 3QQFA 4GUBA 4II5A 5FP6A 3SDJA 2I7QA 4DA5A 4ORKA 3AD4A 2BAKA 2ZV7A 2QD9A 4MBJA 3BU3A 2CGVA 3I5NA 2XKCA 3TZMA 2WO6A 4YMJA 3LW0A 3Q4ZA 2C3IB 3B2TA 4PTEA 4XRJA 3PXKA 1UU8A 1VZOA 3GFWA 4RSSA 5IA2A 3KRWA 4FV9A 3FL5A 4JR3A 3MH1A 4GU9A 4RRVA 1U5QA 4QYYA 4LGGA 4M0YA 5FTOA 3TV7A 2F57A 1UWHA 4IBMA 4O7RA 4IB1A 3LMHA 1ZAOA 3VS7A 4KABA 3IDBA 3DBQA 3OBGA 4FG9A 4LG4A 1H01A 3QCYA 3I0OA 4NCTA 2WTKC 3SD0A 2X8IA 4YSJA 2CGXA 3FAAA 4MWIA 4WBOA 2GTNA 2IW6A 4EOQA 3CS9A 3KXZA 4MK0A 4Z3VA 2QOFA 4BRXA 1T46A 3R22A 5B2MA 4XOYA 2Q0NA 3DXPA 4J53A 3MY0A 3O51A 2W4KA 5CENA 4XLIA 5BVFA 5CALA 1H25A 3ORLA 4XV3A 5J9YA 3FQEA 4EJNA 4MEDA 4F1TA 4L7SA 2PY3A 3TUDA 5BUIA 1FMOE 2W9ZB 3Q32A 4QP3A 4YJVA 5L2QA 1CTPE 4DG3E 3DAEA 4JBOA 4DHFA 1M7QA 5AV1A 1TQMA 4RVKA 3SRVA 3FMKA 3SA0A 3U87A 4L42A 5KMMA 5CWZA 2ZV8A 3LQ5A 4U9AA 3R7YA 3EFLA 3WF6A 5H8GA 2RFDA 3NS9A 3PE1A 2GSFA 4G2FA 4IXPA 1Q8YA 3HUCA 4MXYA 3G5DA 1OIRA 2BAJA 3MFSA 3U4WA 2ZVAA 3PRIA 4R5SA 4QPSA 4E20A 1JKLA 5LCKA 4QQ5A 3E64A 4FKLA 2WMBA 4QP4A 4K33A 3C0IA 5JFWA 3Q5IA 5CLPA 2O3PA 2OJ9A 3LFCA 4FYOA 2BR1A 2VTNA 4IWPA 2XBJA 1J1BA 1O6YA 5GJDA 5DA3A 5D7VA 4NYEA 5IEXA 2PULA 2HY81 3QUPA 5EDPA 2YAKA 4G3CA 5M51A 3MH0A 4BCOA 4JDKA 2R0UA 4LI5A 2C6IA 3L9NA 5LJJA 3PJ3A 4O7ZA 2X2MA 3HMOA 2XEZA 3G9NA 4RQKA 4V0GA 4J95A 5D7AA 3R21A 3DAKA 2VWXA 4MCVA 3IONA 2YM7A 2RKUA 4G3EA 4IZ7A 4G3FA 5CXHA 3S0OA 3K2LA 3RJCA 2PK9A 4A4OA 3KMMA 5ANDA 3TN8A 3EQCA 4D2WA 5JMSA 3EQFA 3GI3A 3QZIA 4RA5A 5HG5A 4XS2A 4FKRA 3UQGA 2OZAA 1MRYA 4QP1A 3UE4A 1IAJA 3UNKA 4GKHA 3OWPA 1F5QA 3LLAA 5EW8A 4A7CA 2ZM4A 3NYVA 4EH6A 4L45A 1U59A 2JC6A 3JVRA 4I4FA 3QX2A 4Y5HA 1WBNA 4RZWA 3BGPA 4XNEA 1R39A 1R78A 2R3JA 1FGIA 3W33A 5BPYA 4MQ2A 2OO8X 3GNIB 3D15A 1O6LA 3KXNA 4Q9ZA 4ZSGA 1NY3A 2BDFA 4QQCA 4BCIA 5CU0A 1XH9A 3NYXA 3I7CA 2QG5A 4P5ZA 5FBOA 3DAJA 3RK5A 3V51A 2GQGA 2HZNA 3ORPA 3PIXA 3WE4A 4DGNA 4DITA 4ZLOA 5DBXA 2J0LA 1HCLA 5LMBA 4OW8A 4E6AA 4PMPA 3QLFA 4NSTA 3ENHA 1Z5MA 1L3RE 5CNOA 4CT2A 3Q6UA 4AA4A 3FZ1A 4KNBA 4W4WA 4IB0A 4AGUA 3CKWA 4BCFA 3W8LA 3VUGA 5K3YA 3K3IA 4IE9A 3W18A 3LM0A 5LWNA 3ZH8A 3BBTB 4Y46A 3FHRA 4JNWA 4JOAA 3SKCA 4ID7A 2UZVA 3QD0A 4BWPA 2OICA 3MGYA 4IIRA 2VTJA 2VX3A 3AC3A 3DQXA 2OXDA 4XP3A 2F2UA 2KTYA 4M0ZA 5AR2A 2E2BA 4KS8A 5L2WA 2WXVA 2XK8A 3VQUA 3Q9WA 4I6BA 2WMWA 4O0VA 2Q0BA 2YJRA 2WAJA 3OWLA 2WTIA 3QD3A 5LWMA 2FYSA 3W8QA 2W1GA 3NNWA 5HVJA 2B9FA 3OROA 4CG8A 3ZUTA 5HG8A 3ZO3A 2C3KA 3AOXA 3ANRA 5EKNA 3IOKA 1X8BA 5H3QA 4M69B 1XH6A 4TW9A 5LVOA 3GU6A 1OKWA 4FTJA 4BBMA 5A14A 3MBLA 4OTFA 2OLCA 4FSNA 4TKSA 1CKJA 1PRYA 4EUUA 4D5KA 5HNIX 5E92A 1W8CA 4APPA 4KWPA 1PXJA 2QOOA 5GIOE 2VV9A 1W82A 3LIJA 2GNFA 2VWYA 4Q9SA 5H8BA 3D2KA 5DT3A 1YHVA 2JIVA 4JX7A 3ORXA 4AACA 2FVDA 2ITTA 3RHXA 5HTIA 4O0SA 3QCXA 1PMEA 3ORKA 4KIPA 4BZDA 2QKRA 4RJ6A 3ORZA 3K3JA 3F5PA 3UJGA 3CTJA 5J95A 2G2FA 1R0EA 2UZEA 2QVSE 4TYJA 4XHKB 2XK3A 5JRSA 3UVPA 2P33A 3OF0A 3R8PA 3VW8A 3COHA 4EOOA 5DEWA 2UW4A 3VUKA 4BBFA 3LKMA 4KKGA 4CSVA 4HGSA 2IPXA 3R30A 2OIQA 5IA5A 3VUIA 5D41A 2DUVA 2CLXA 4IQ6A 4UEUA 5M55A 5KKRB 3LXNA 5ANGA 3JS2A 4BDKA 5M08A 4L6QA 5EI2A 4D9UA 3KXGA 4FTRA 1ZOEA 2EB3A 3LE6A 3A99A 4LOQA 3A4OX 4ACCA 1JQHA 4P7EA 4QYHA 1H0VA 2G2HA 1Q97A 4KAOA 5K5NA 5M53A 4QPAA 3E8CA 3R1YA 2F7XE 5E1SA 4BTJA 2OK1A 4G17A 4IZ5A 3U9CA 3A8WA 3EN9A 3N4TA 4R8QA 3UTOA 3I4BA 2OJJA 4YGAA 4EHVA 4EOLA 4N6ZA 1WAKA 3R7GA 3ZM9A 3FMEA 2GMXA 5F1ZA 4RFYA 4ZTHA 2WOTA 5IU2A 3IW8A 2UV2A 4IM2A 4E8AA 1IAHA 4C33A 4GFOA 5HEZA 3HZTA 2QG7A 3LVPA 4G3GA 4QP8A 3F5GA 2HZ4A 1G5SA 3SVVA 2CSNA 1LP4A 3AT4A 4D28A 4IJPA 2VU3A 4BDFA 4PRJA 4IJ9A 2C0OA 2PL0A 1XWSA 3DTCA 2QI8A 4ZMEA 5KCVA 2XP2A 3MIAA 3G0EA 3WZEA 5FP5A 3UC4A 1Y6BA 1YQJA 4K11A 5JGAA 3LMIA 2OFUA 5A4TA 5JSMA 4ZJJA 3UNJA 4H3QA 4R78A 2Z7QA 3H9OA 3TNWA 1Q3DA 3KRLA 3QRUA 3VJNA 5E90A 4F63A 2XIXA 3R9NA 4ITIA 4F7LA 4FIJA 3L9PA 2XA4A 3LM5A 4YJTA 4E73A 2YZLA 2YM8A 3QD2B 3QHRA 4RPVA 5KNJA 3MFRA 3GUBA 5CEMA 1RJBA 2PVYA 3NVMB 4UXQA 5L6WL 3WOWA 2CKQA 4JQEA 4FIFA 4B7TA 3E7VA 2ONLC 4DINA 4AG8A 4OTWA 4YHFA 1UNLA 4O7SA 2CKPA 5IQEA 3EQGA 5JZJA 4R1YA 4DEHA 3JPVA 2ETKA 5EI8A 4E5BA 1NVQA 2C68A 4EI4A 5BVDA 2VX0A 2QC6A 4RIYB 4L3JA 2IVTA 3WYXA 1MRUA 4HYHA 3DY7A 5BVKA 2YCSA 3A7IA 2EB2A 4OTHA 5AR8A 2XK7A 3MIYA 3FXZA 3ZYAA 4BCMA 3W55A 3GCVA 1OKZA 3HRBA 5DEYA 3D7TB 3ITZA 2RL5A 3G0FA 1YXXA 4TPTA 3V3VA 5I3OA 3V5JA 3PG3A 4ERKA 5KMIA 4FIIA 1JSUA 3F6XA 4A07A 5KBQA 1ZYJA 2J50A 3CY3A 3ZBFA 5CQWA 3D94A 4FKJA 4ALUA 5CAPA 4U3YA 3E62A 4YHJA 4L46A 4EH3A 3SW4A 3UZRA 2ETMA 3R8LA 4BKZA 5EYDA 5ITAA 2PVFA 3Q9ZA 5J87A 2UVYA 2JKQA 4FKSA 3TM0A 2W17A 2YM6A 3KVXA 4EYMA 4ANQA 4C3FA 4DBNA 4EHGA 3HMNA 3EWHA 4RIXA 2C3LA 3FZRA 4YJUA 2OJGA 3KK8A 2BDJA 3P4KA 5HX8A 1YI4A 4QRCA 4YU2A 4RFZA 1EH4A 2HK5A 3RBWA 4D4RA 3ATSA 4F70A 5AAGA 2QOHA 3IO7A 3MPMA 4TWPA 3QCSA 3W2PA 4IAZA 4NL0A 1PXIA 2VGOA 4MKCA 3O17A 2PVKA 4J97A 1M2QA 2IW8A 3PYYA 4HOKA 3G33A 3DJ7A 4IHPA 4IW0A 3TL8A 3A7HA 4ACMA 3RNIA 4C4HA 2VD5A 2WTVA 4MXOA 4RC2A 3R8UA 3GC9A 4JRVA 4YNOA 1BYGA 2PVJA 1G3NA 3QA8A 4M8TA 3IW7A 2XNBA 2IZSA 4ANNA 3BHUA 2VNYA 4MH7A 3EJ1A 5ETFA 5EQYA 3MDYA 4FV7A 3BLHA 3MPAA 2CMWA 5ETIA 5T3QA 3G6GA 4AOJA 3OS3A 4YZNA 3TNHA 3II5A 4TYHB 2PZRA 3BPRA 4TXCA 3CPCA 5A4LA 5JGDA 1OI9A 2OBJA 4JVGA 4P5QA 4C7TA 4BR3A 2X6EA 4L7FA 4P2KA 1B38A 1KE7A 2QLUA 2WTKB 4OBPA 4I22A 4R7IA 1GIJA 4WSYA 5DT0A 4ZTSA 2J90A 4J99A 5HGIA 3ZHPC 4CV9A 5HORA 4UB7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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