5CYYA

Structure of the c-terminal domains of dipz from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
TGTEIREQLNLGGIVNAQNAQLSNCSDGAAQLESCGTAPDLKGITGWLNTPGNKPIDLKSLRGKVVLIDFWAYSCINCQRAIPHVVGWYQAYKDSGLAVIGVHTPEYAFEKVPGNVAKGAANLGISYPIALDNNYATWTNYRNRYWPAEYLIDATGTVRHIKFGEGDYNVTETLVRQLLNDAKPGVKLPQPSSTTTPDLTPRAALTPETYFGVGKVVNYGGGGAYDEGSAVFDYPPSLAANSFALRGRWALDYQGATSDGNDAAIKLNYHAKDVYIVVGGTGTLTVVRDGKPATLPISGPPTTHQVVAGYRLASETLEVRPSKGLQVFSFTYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Protein DipZ
publication title Structure of the ectodomain of the electron transporter Rv2874 from Mycobacterium tuberculosis reveals a thioredoxin-like domain combined with a carbohydrate-binding module.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 91
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF17991 Thioredoxin_10 Thioredoxin like C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.260 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Galactose-binding domain-like 5cyyA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5cyyA01
2JZSA 2BBAA 4MGSA 2VR4A 1VGLA 1V58A 4A45A 2E26A 1NW2A 2YJHA 1LJRA 1AW9A 2V6OA 2WRTA 5GAPD 3LXZA 2ON5A 1FAAA 3ZVJD 1GNYA 4A4AA 4D73A 2FD3A 3GH9A 5ELAA 1AXDA 2DSAA 4H86A 3LG6A 1CQHA 2R6KA 2WYSA 4PURA 1MDKA 4KDYA 1M2AA 1GLQA 3KD0A 1U3IA 3DVXA 3C8EA 1OC9A 2PUKC 1AQXA 2YZHA 1X5EA 5B7CA 5F8BA 3PINA 4TXOA 1EP8A 4Q5NA 4ACSA 1W8OA 1FVJA 2L4QA 5CP1A 3H4KA 1SJZA 2FLSA 1YKAA 3C73A 1PX7A 1M2BA 3F6FA 3UMAA 3VD4A 3A21A 4POBA 3DGQA 4CU8A 2MBSA 2W46A 1PKWA 2IMKA 4DUXA 4LL1B 3R2QA 2H6XA 3F9UA 2WGRA 2H1DA 2G2QA 4YPJA 4PX1A 3TCOA 3DEXA 1UY2A 17GSA 1GP1A 2BZDA 2Y6JA 1OC9B 4TKYA 5H5SA 5CRDA 3M3MA 3VWVA 1UXZA 3M9KA 2P5QA 4TXOB 1RQMA 2QSIA 3J7Yk 4OWYA 3BN6A 2W87A 5JMOA 2YCDA 2WCIA 2J1UA 2JD9A 2YC4A 3FHAA 2KLXA 3RPPA 2C80A 11GSA 4O7HA 2GT6A 4KSMA 2VZ3A 2M72A 5LA2A 2A2SA 3NRUA 1PGTA 1F6MC 4DVCA 4P08A 3A2XA 2LSTA 1T7PB 1O8PA 2WULA 3EURA 3VWUA 4OO4A 1G6YA 1J0FA 2ORZA 5JXJA 4GRFA 3WEZA 3EYPA 1TOFA 3SKVA 3GKXA 22GSA 1WP0A 3H1NA 5D9VA 3ZFBA 2FWHA 3EMXA 4RYDA 3CSHA 4EVMA 4GQFA 4OFNA 4ML1A 2R37A 5IO0A 4JKLA 3CRTA 1YZXA 3UESA 4KI5M 3NQHA 4QB6A 3ME7A 2QC7A 1Y6EA 3OGRA 2R3XA 2VMEA 2V1MA 2L6CA 2QQKA 2H76A 3QFAC 4ILFA 1PMHX 1U88A 4TTGA 4XHMA 2GLRA 5DDLA 4XS4A 3EMPA 3ABZA 1WMJA 3WT1A 1US3A 2VO5A 1YEPA 1B8XA 2YP6A 5CNWA 1BYEA 1O8SA 2WBKA 2H0IA 4Q5QA 1UA5A 2VLTA 4MF5A 2GSQA 3P6BA 1GNEA 2VZRA 1D7PM 1HNAA 1PN9A 2FCHA 1KGYA 5IMCA 5F0GA 2VZSA 4QAWA 2LEGA 1TU7A 2VM9A 2VZUA 3WSOA 1OC8A 1TG7A 1US2A 5C7GA 1GSYA 5G04L 3W8JA 3ACFA 1AIUA 4XS4B 1UXXX 3IC4A 2YANA 4ZZ5A 2Y6KA 4W4ZA 1GRXA 3ZRDA 4YAVA 1WE0A 3Q74A 4TR0A 3CZUA 3RAZA 1EZKA 2VCAA 4WEYA 3UARA 1K0MA 2MYGA 2C3NA 3C7OA 1RYYA 2PMTA 1TK8B 3VDCA 5HQPA 4MJAA 4QDSA 1HD2A 1ABAA 1T00A 4IP1A 5I0DA 2CX4A 3LPFA 3U5RE 1F2EA 5KN2A 5H5RA 3GTUB 5HXMA 4OZOA 1VF4A 3IRAA 1Z3EA 3ZZXA 5INYA 1EGRA 4GSNA 2JDAA 1KEBA 4L8EA 2HSYA 3UIWA 2H01A 2PPTA 2N5FA 5HR1A 3WNLA 1FB0A 2IMDA 2O7KA 2J1AA 1EV4A 4PQ1A 4I5QA 5DAKA 4EDZA 3QMXA 2TIRA 2DJJA 2DJ1A 1T3BA 3JXSA 3D21A 4HOJA 1FVKA 3SBCA 3VI5A 4HG6B 2B4KA 1PL1A 3HVVA 5CREA 6GSVA 4XRDA 2ZUPA 5LCWL 2HYXA 2ON7A 3GM8A 1MPXA 2ID4A 1K0NA 3ERGA 3H8QA 4K2DA 4G19A 5D9TA 2K6VA 4AAXA 1Z6MA 3HOBA 2FWEA 5F05A 1X5DA 3UOMA 2HLEA 2VZVA 1WOUA 2KP1A 1AUCA 1QUWA 4IKHA 4NV5A 5D9XA 1TRSA 3TJJA 4OFMA 2L6DA 5DAKB 1THOA 3FEUA 4ZXEA 3AY8A 3GSSA 4PF1A 3PGTA 1JHJA 4BPYA 4MP4A 2GZPA 4JHZA 3C1SA 2VMCA 3I97A 1G0TA 2C9KA 3FHKA 4TXVA 2AV4A 3A22A 1J9BA 1Z9HA 5GSSA 4DEQA 1XWGA 2YWNA 4N30A 3I2FA 4KCAA 3UAPA 4TW5A 1B4PA 3EB7A 3PUHA 4IGJA 5COHA 3TJGA 5C00A 4WBJA 2KUCA 4YH2A 4P00B 5ELGA 3MNGA 3ME8A 3C7EA 3HJPA 5ECSA 5ECRB 2PU9C 1X0RA 4EKZA 3MUY1 1QXHA 2GTUA 3IBHA 3VD7A 13GSA 4V2MA 3CIHA 3OGSA 5HR2A 1K42A 3DYOA 4KUNA 4Z2AA 4KCEA 2VZQA 4HU7A 2CQ9A 2ZNMA 4MDCA 2ZCTA 4BK4A 2WAOA 2K18A 5G31A 2WZEA 5G1KA 2VCXA 4ZBAA 2A4VA 2P31A 3VI7A 2QQIA 2ALBA 1PKZA 9GSSA 3KMNA 1YY7A 2L5LA 1WRYA 2VLUA 1BQ7A 1GU3A 2KP2A 2WN3A 3P7XA 3A5WA 2HLSA 2XQXA 5EY6A 1XVQA 4TVEA 5ECQB 2K8SA 1NKGA 3GYKA 3SEEA 1GTAA 2W47A 2WQ8A 1SK0A 2C3TA 2EIOA 2GT5A 1ON4A 4RN5A 2E2GA 3TRQA 2WN2A 1TW9A 4GSSA 3TRPA 3TDGA 1ERUA 1EP7A 2QKEA 1JZDA 1IQDC 1S3CA 3T09A 2C26A 2E33A 3FR9A 3D6IA 3FK8A 3P8WA 2VCZA 1JZWA 1IYIA 3VPQA 3GSTA 4NAXA 2VL9A 1O7UA 2V5DA 2YC2A 1EGOA 1TTZA 3I3EA 3HCZA 1PX6A 4FH8A 2VD0A 2GSTA 1SK1A 1SK2A 1XWAA 5IMDA 18GSA 2CZ2A 5ECOB 2HRNA 2RUEA 4IQAA 5IPHA 2I9HA 2VCWA 4EC0A 2E31A 4TR3A 2L5OA 3ZITA 1OKDA 4BXSV 3GDBA 4ZB6A 4CUBA 4BA7A 1A0FA 2W1UA 4IHUA 4POLA 3ZVJA 3C71A 1YF0A 1Z7RA 2LJKA 2B6MA 2AB6A 4OUEA 2EIBA 1A24A 3VFIA 3D0ZA 3E0UA 4A3ZA 1YQ1A 20GSA 3HDCA 1MD3A 2JZRA 1RK4A 2I4AA 3I2KA 3TKSC 1GMMA 1ZL9A 3RDWA 3IOSA 5JWRB 2PGTA 2JKXA 2FGXA 5A1AA 3DMLA 3D22A 1XIYA 1AQVA 1R5PA 3T0BA 1O81A 1O8XA 5DALA 1SYRA 5G2ZA 1HQOA 3W5NA 4MK3A 1SL2B 3UNPA 5AIVA 1URMA 4OO5A 2Y6GA 4L5OA 1F4AA 1G7OA 4K6XA 1OH4A 2L59A 1NAEA 3HY2A 4E8HA 3WF2A 4L0WA 3H79A 2C4XA 3WGDA 4M4PA 1KEXA 2J1TA 4LL4B 4JKKA 4KSOA 1JZRA 4O32A 4ZL7A 1ZGNA 1JYWA 4MF7A 5DALB 3TRXA 3CBUA 5AN1A 2J1RA 4FIWA 8GSSA 1TRWA 2VO4A 3HNYM 1G7EA 1FB6A 4K7IA 1A2JA 4JRRA 2DDUA 1XCCA 2ORXA 3Q19A 4HUAA 5FUIA 5B4XA 2VUPA 3HZ8A 1XW5A 1O85A 1JZ2A 4BK5A 4MOAA 3TB2A 1L7RA 3KGKA 5LD0A 2L57A 1AAZA 4GSTA 4NXIA 1JLVA 5CRHA 3TGZA 3GGLA 4XUNA 1F9MA 2QGVA 2Y6LA 1XBSA 2E7PA 2IJYA 3HJMA 2H1AA 3KMOA 1W8NA 3ZL5A 3CRUA 2WABA 3K4AA 1TK5B 2C0DA 5IMAA 4XUTA 3HEIA 3P90A 4K0NA 4G10A 1GSFA 2RVAA 2YV9A 4IELA 3F0IA 1Z6NA 1J84A 1XPVA 4E8EA 1R5AA 1UY0A 5J5NA 2OE0A 1IYHA 1GTIA 1KNGA 2QQNA 1VRSD 1QK8A 1GTUA 4J56E 1I5PA 4L0UA 1JZ5A 4E8DA 1DUGA 4JBBA 1BX9A 2OBKA 2RIIA 1BG5A 3UBLA 4CVUA 5E4WA 3T0AA 4CU9A 3MWHA 4LLRA 2CVDA 1MEKA 4N0VA 1QQ2A 4MJBA 2VAFA 3IHQA 3QPMA 2JE8A 4QPWA 1B48A 5ABRA 4WKWA 1BAYA 4HZ2A 1A23A 4MABA 3THDA 4J2FA 5FT3A 4MO3M 1ULOA 2R2JA 1UY4A 5A4UA 2Z9SA 3K4DA 2X8CA 4P5YA 2VOTA 3DWVA 5AGYA 1NUKA 3LEGA 2B7KA 3N9JA 2H72A 3US3A 3GIXA 3E9JB 4QL7A 3P1IA 4O5RA 2OA7A 2GSRA 2OE1A 4BDVB 4P02B 2MMNA 4OCEA 3QR6A 1WWJA 3KP9A 2ZEYA 3HJOA 2VCBA 2CDPA 5ECNB 3A2WA 1YQ2A 4CDOA 2YZUA 1R64A 4IUGA 4MF6A 1DP0A 3CKHA 2X8HA 3G9BA 3CSJA 4DUVA 1OF3A 3I2JA 4JU5A 3VWWA 1U6TA 3BBYA 1ST9A 2B5XA 1EEMA 2LQOA 3F63A 2DIZA 4CHSA 3ETPA 4ZY9A 1ZYQB 4PGTA 1T8EB 4ARXA 5ECMB 1XOBA 1A2LA 2GQKA 3K8NA 4Z7XA 2Y6HA 4DUWA 5B8AA 4I97A 1S3DA 3TKQA 4GZ9A 1K0CA 3LJRA 3O76A 4ZZ8A 1X5CA 4I8BA 5DPNA 3NIVA 4MH2A 4CU6A 2HNLA 3ZM8A 1M2DA 2J9HA 4XUQA 1VF3A 3HVXA 4WR5A 3D4TA 2B1KA 4IJ3A 2PWJA 2LRNA 3CTFA 2B9VA 3F4TA 2OADA 2GZZA 4TN8A 3LYPA 2VTFA 3L9UA 1ZMAA 4A44A 5LA0A 4GF0A 4CU7A 2E32A 1PSQA 3BOAA 1UZ0A 2QBXA 4DXSA 4W8JA 3C7HA 2XPEA 4ZB8A 2H8LA 2HFDA 4KX4A 1Z7PA 2IL3A 3VD9A 1K0OA 3TOTA 1FHEA 2HZEA 2PERA 3KIJA 3LQ7A 1CIYA 2C0FA 2IMEA 2JU5A 5ECKB 2C0EA 4GWJA 5ID2A 2YFUA 2R4VA 3TJKA 3G7IA 4P3YB 3WF4A 5D9WA 4OFTA 3WF3A 4QB1A 3C7GA 3GTUA 1X9SB 2B5YA 3Q18A 3L4NA 3VLNA 1SG3A 3RHBA 1PX4A 3IA1A 1P8JA 3TJFA 1YJ6A 1ERVA 1KTEA 2O8VB 5JCWA 1AQWA 5GSTA 2WZ9A 4F03A 4M4RA 1YDKA 2C4JA 1JYNA 3BCIA 4PNGA 2LV3A 2WAAA 1TXXA 2VQUA 1TVGA 2HZEB 2VJXA 3U6VA 4JKMA 3ZYWA 4HJMA 2F8AA 1OVNA 2GVPA 1K3OA 1XOAA 3M9JA 4WR4A 2IN3A 5ID2B 2QQLA 5IJRA 1TDIA 3FW2A 1USBA 2V4VA 4N0ZA 4XS6A 1UYYA 2JL4A 2MMZA 3MSZA 4OCFA 5IOWA 5GAND 1MDIA 1SKRB 4IVFA 1GSEA 4IW9A 3TKPA 2J23A 2CAIA 5H5QA 2V32A 2F51A 2C0GA 3BGAA 3ZIJA 5G05L 1NHOA 1F3AA 4MJCA 4IBPA 5ECHB 3L9SA 2Z4FA 1DE2A 3IR4A 1UX7A 4HDEA 2NVLA 3UEMA 1XWBA 4MMMA 4K7OA 2GSSA 4NWYA 4DSRA 3A7QA 1A2MA 1QFNA 1B9XC 3LYKA 4NPBA 1SKWB 5IM9A 3OB8A 1FO5A 1GOGA 3GKNA 1GOHA 4KA0A 5HFGA 2IMIA 1HNCA 4LA1A 1XXUA 3E1F1 2VCTA 1XVWA 4ULXA 5D93A 5AIXA 2VM1A 1JZOA 1J83A 4FYUA 1GH2A 2YWIA 2F3MA 1F3BA 1CZSA 3IXRA 1T4ZA 2LQQA 1R26A 1ZYEA 1GUKA 4V1Ap 2W94A 1LNSA 1YKCA 4KNDA 3HJRA 2WZ8A 2O89A 3FR6A 1W99A 3IAS2 3MV11 2VL4A 2OE3A 3ZMLA 5CRWA 2QQMA 1OF4A 3GX0A 5F06A 2LW8A 4XVHA 2IPAA 1JZ6A 2HXKA 1SYXA 3MBWA 1E6BA 3GURA 1O73A 1W0NA 1O6JA 4Q5FA 3NJVA 4F0CA 2GS3A 4POKA 1EUUA 2LRTA 2PN8A 4JZQA 3ACIA 2P5RA 1JU4A 5LNKe 4A42A 1F4HA 4MLYA 4X0XA 3F4RA 4WBRD 4D0QA 2GQLA 4EDYA 4N11A 3A3TA 2YJ7A 5ECPB 2LUSA 5J9CA 6GSYA 1JYVA 3V1WA 4YQVA 3KXOA 1DBYA 3OR5A 2W92A 4DSQA 3HVSA 1C72A 4IQ1A 2B5EA 2J1VA 3UBKA 2V2GA 4OMVA 3RPNA 3S9FA 1SU9A 3FRCA 1TI1A 3IAM2 3KP8A 1F37A 1GNWA 3CMIA 2X10A 1GSDA 2VCVA 3I3DA 3LORA 1GUMA 2BERA 2B7JA 4FI9A 4AJ8A 2ZXQA 4F9ZA 5F7UA 4GQCA 5DJLA 5JWOB 1PL2A 3VDBA 1G6WA 5CYYA 3IK7A 4KW6A 3GX8A 4D8MA 4AG4A 2C8UA 4PNFA 3W6GA 1PA3A 4KGIA 2VZPA 1M0UA 1QGVA 1EOHA 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 2O87 A;  5C71 A;  4CUC A;  4BVY A;  3L9V A;  5J1X A;  5KN3 A;  4LQR A;  4KH7 A;  3ECQ A;  3IE3 A;  3EE2 A;  3TKS E;  1GOF A;  3APS A;  2VOC A;  2FHE A;  3ZTL A;  2XC2 A;  2XHN A;  5KN1 A;  2FA8 A;  3DKS A;  2YWO A;  5G5F A;  1Z5Y E;  3EIN A;  4K0G A;  2H0H A;  4WF5 A;  4QB2 A;  2X99 A;  1TU8 A;  2EC4 A;  2J7M A;  1A0R P;  2L4C A;  2A2R A;  1AC1 A;  3GH6 A;  3HNB M;  1J08 A;  2LTK A;  1V2A A;  2CVK A;  4XTS A;  3GXU A;  1ERT A;  3WNN A;  3F4S A;  4NV2 A;  3OEA A;  1YF1 A;  4ECC A;  3GRX A;  2FY6 A;  1ERW A;  1I9D A;  1OC3 A;  3NZN A;  4NHZ A;  1R7H A;  3FL7 A;  3I2G A;  4DXR A;  3CSI A;  3D4M A;  1ULP A;  3RHC A;  14GS A;  1EUT A;  5AIS A;  3LEI A;  1SKS B;  2NDO A;  5IYY A;  3WNK A;  2CV4 A;  1SDD B;  2B1L A;  3WNO A;  1GTB A;  1K3Y A;  2H0G A;  4LPL A;  2H19 A;  2PVO C;  6GSX A;  4IS0 A;  5IFP A;  3Q6O A;  5HPO A;  3DVW A;  1FOV A;  3LQC A;  4L0P A;  2XPD A;  3HYP A;  5G1L A;  2GQM A;  4UOJ A;  2FA4 A;  7GSS A;  4MAD A;  2BGP A;  3ACH A;  1TI3 A;  5IQY A;  4NMU A;  3QD9 A;  2XOM A;  2D2Z A; 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 3G7J A;  4EO3 A;  2FWF A;  4BWQ A;  1CZV A;  1MD4 A;  5EJZ B;  1CZT A;  1OAZ A;  1O59 A;  5CZK A;  2DCJ A;  2QQO A;  4ECI A;  5J4U A;  4OYU A;  4XCS A;  4WXT A;  3WF0 A;  3TKS A;  2TRC P;  1EEJ A;  1ZZY A;  3C8X A;  2X09 A;  1SJ6 A;  4ZL9 A;  3FZA A;  1QMV A;  2H6Y A;  1K0B A;  5ECI B;  3LSZ A;  3O6T A;  3KH9 A;  3M0F A;  3MO4 A;  5IMZ A;  2VM2 A;  4TRX A;  5HFK A;  2EID A;  3NNG A;  3GL3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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