5D30A

Directed evolutionary changes in kemp eliminase ke07 - crystal 9 round 5
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
LAKRIDAALIMKDGRVVKGSNFENLRDSGDPVELGKFYSEIGIDELSFWDITASVEKRKTMLELVEKVAEQIDIPFTVGGGIHDFETASELILRGADKVEINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVYIAAKRVDGEFMVFTYSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEIVLGSIDRLGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIAHRGAGKMEHFLEAFLAGADAAKADSVFHFREIDVRELKEYLKKHGVNVRLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags De novo protein, lyase
molecule keywords De novo kemp eliminase KE07 round 5
publication title Directed evolutionary changes in Kemp Eliminase KE07 - Crystal 9 Round 5
rcsb
source organism Synthetic construct
total genus 93
structure length 250
sequence length 250
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5d30A00
1V7YA 2QDGA 4ICNA 4TX9A 1TYGA 4ZQOA 5E0KA 1I45A 3HOJA 1FCUA 2BLEA 3U2OA 4UNKA 5SWUA 1HO4A 4JX4A 2HS8A 4JTLA 4A29A 3YPIA 1PS9A 2CWNA 4HSNA 3DBPA 3A23A 4IMDA 5AFDA 3TC6A 2NUWA 2CLEA 3B8DA 3G1SA 3TE9A 1H7XA 3CTLA 4AWTA 4O8RA 3QM3A 4O4VA 3UQNA 3TFXA 3TR2A 2X16A 4Y9AA 1F05A 5DY2A 2FB3A 4DO4A 4PTNA 3HF3A 4E2BA 2NWRA 5D38A 2XFWA 1JRBA 1GYLA 4PC8A 3W2MA 2GQ8A 2NXGA 4NZFA 4BI7A 4QM1A 4MPQA 3NPUA 4FNPA 4MY8A 3TJXA 2JKEA 3TIMA 1HTIA 1THFD 3BG3A 3T7VA 3IIOA 3TNOA 2R91A 4BWLC 4R33A 1G4EA 1G4PA 3EKZA 2V0TA 3W7NA 1VLIA 2ZRZA 4MJZA 1LRQA 1P4CA 3OBKA 1SSGA 3DENA 2X1SA 4LW7A 1I8JA 3ANYA 3TXZA 3W2LA 1RZMA 5KZMA 1KBIA 1LROA 2NZLA 4KWVA 1PCWA 2DZVA 2DZUA 3HIJA 1PL9A 3BG5A 4LS2A 4GNJA 4P61A 3GDRA 5G2HA 2PRMA 2EHHA 5CPNA 2EF9A 1Y0EA 4CQAA 4GFSA 4OT7A 5DBTA 3UY7A 4RZ5A 4MOZA 2H3BA 3FYOA 4DO6A 2NXIA 4Z1AA 4DF1A 4DQWA 5AHFA 4MY9A 3A22A 5D05A 1TRIA 2ZZ2A 5LHEA 2FLIA 5BW6A 3NZ1A 1OX4B 1EP2A 2VFEA 2ZDRA 3I7RA 3LHYA 4JX5A 1X1OA 4MYAA 1TIMA 1GYNA 1W0MA 2FQIA 5LGZA 3GIYA 2QAPA 5K4XA 2XN2A 5U7SA 1VR6A 3NQFA 4LVBA 4QNEA 1OHLA 2Q8LA 3L68A 4PODA 2H8ZA 3AJXA 5D04C 4HPXA 1GVSA 2P10A 3H55A 1R2RA 2V5BA 3TX9A 3MBFA 3SZ8A 4NZJA 1BWKA 3UWVA 1KV5A 1UASA 4IWWA 1TQXA 1ZNNA 1RD5A 3ABQA 3H54A 1VGAA 2QUTA 3W1PA 1VCGA 5LKYA 4MKNA 3KXQA 3GR8A 5FF2A 3CIWA 3EWWA 3TROA 2E6AA 2VFGA 1TO3A 3I7QA 3W7KA 1YDVA 1FX6A 1KFCA 4GUGA 1PVNA 1KM2A 3DAQA 2AGKA 5FEXA 5MHBA 3M5XA 3C2FA 4M7SA 4O54A 3W7RA 5E1QA 5CZTA 4FIQA 1XUUA 2C1HA 1JCNA 3HGSA 1GVQA 4K38A 1G7UA 1QDSA 1TCDA 4WOQA 4XBKA 4IGHA 5D30A 4K6AA 1PIIA 1XM3A 3QW4B 3NL3A 1XBZA 1W5NA 3L5MA 1OFQA 2FIQA 5FF0A 3ZS4A 4BR1A 3TU9A 3UWZA 4JTSA 4N02A 2FPYA 3S1VA 3P8IA 4MUZA 1ME7A 4X9SA 3CB8A 3NYZA 1H7RA 2C19A 5I3GA 3IIPA 4RCXA 3P84A 1D9EA 3LBCA 3TH6A 1GWJA 3W2JA 1KM1A 1SR9A 3ZWTA 4NX0A 4MFDA 3CM4A 3RU6A 2P1FA 4X3ZA 3MWAA 1OX5A 3VI2A 2HS6A 3S1WA 5C54A 1H7PA 2BSLA 4QIUA 1AMKA 4IX2A 1F73A 3NQ8A 3IGXA 5EA9A 1QO5A 2WKJA 4BK9A 3A5VA 3LI1A 4PCFA 3B0UX 1OFEA 2FDSA 2ZYFA 4UMCA 2I1OA 2OMAA 2Q3OA 3HG3A 2CU0A 5L6UA 3SY5A 2VFHA 2H90A 2WNQA 3ABRA 1KLYA 4Y96A 4ML9A 3UWYA 3R13A 3E96A 1KW1A 3S5NA 2P0OA 3N9RA 1G4SA 1B4EA 4O50A 3LCIA 3UZ5A 2QCGA 1YDOA 3G0XA 4Q33A 2E5CA 4R7JA 4NJIA 3TFCA 3NGJA 1FCQA 2AAMA 1SZNA 3W75A 2EAWA 3P61A 1Z44A 2GJLA 3DHFA 2RDUA 1W56A 5EKYA 2CLOA 4LRTA 4HHPA 3D0CA 1TV8A 3NDOA 1TREA 3GAKA 4JICA 4RX0A 1JR1A 4FIRA 1LZOA 4LT9A 3R8RA 3KVLA 3M7WA 1JUKA 3EWBX 1YTDA 4NNAA 2GVJA 3L0GA 1BEUA 2Y88A 3GK0A 5D03A 2W0UA 5I3JA 4JTGA 3N73A 3CLMA 5D2YA 1U5JA 1KLZA 4YWIA 4IXHA 3N34A 3G18A 2Z2UA 1CX9A 1O60A 1MEHA 4N2YA 3S5ZA 1G6CA 3W72A 4PA8A 4G1KA 1K02A 4HN4A 1YTKA 3A24A 1XI3A 1GEQA 1TMHA 1TQJA 2ABBA 1EPXA 1ML1A 3FOKA 3VE7A 1TV5A 3W7IA 3HJZA 2FPVA 3OEXA 3NAVA 4JTUA 3W7JA 3G8RA 4EF8A 1JQVA 5K9CA 3EB2A 4XTDA 1HL2A 5DCBA 3THAA 1OF8A 1W1ZA 3KRUA 2YW3A 5G1TA 2DZTA 3W83A 4FX6M 4WQ6A 1FDZA 1QWGA 5CKSA 4GUJA 3PBWA 4FXSA 4DF0A 4LUJA 2A7NA 4QNWA 3TQKA 3CT7A 5U4NA 1XL9A 2YFOA 3DFQA 1EWEA 3SECA 2J24A 3I68A 5I3KA 1EIXA 3LRKA 2E09A 3DGRA 3EX2A 3BPWA 4IX0A 3QEZA 3C56A 1TPC1 3W2NA 5F4XA 3N14A 3QF0A 5CG7A 2CFFA 4EF9A 2GVLA 2V2DA 4K8HA 2IQTA 1OFRA 2V82A 4FB7A 1YXCA 2EPHA 3TMQA 4UFKA 1DVJA 1QCWA 1XBVA 1T96A 4A2SA 4NU7A 2ISVA 4O1AA 3SIZA 2JGYA 4UTMA 5K9DA 1F6PA 1LOSA 4KKXA 1YDNA 3QPZA 2NUXA 4JTHA 5FEPA 1W5QA 4QAIA 4IMGA 4OWGA 4J9JA 3BW3A 3PSWA 4MZ8A 3MUXA 5G4EA 2OZ0A 4NXSA 3BGJA 3P62A 4HIBA 2YCEA 2HTMA 5TBOA 2V9DA 4LY8A 3PB2A 3LHVA 2ZRXA 2FJKA 3G1VA 3LTSA 5LSMA 3NNTA 3WK3A 3IRDA 2G5WA 2QEZA 3HGRA 3Q2DA 3P60A 1JULA 2E5DA 4YCPA 1D3GA 3IIZA 3W74A 3CC1A 2AQWA 2WNZA 3STCA 4MJMA 3W88A 5K9XA 4AMAA 1Z42A 1EEPA 1LTDA 1TTQA 1SO5A 1WDWA 2ZZ1A 3FYPA 2ALDA 1KBJA 2QAFA 1UB3A 4M6PA 3BVJA 1E51A 1I2QA 3SGUA 1BTMA 8TIMA 4AB4A 1JCLA 2QR6A 3TQ0A 4YXGA 4KFPA 4LUIA 4XZ9A 3S8HA 3SI9A 2NX3A 4LC8A 3C2OA 3G1DA 4N9BA 4WJEA 3GZ3A 2ATMA 3P81A 3TDFA 3W22A 3W7HA 2PURA 1NAL1 4A2RA 4MIMA 3ZR4A 3G22A 3NOEA 3QYQA 1FDYA 4MYXA 3GB6A 2RDWA 4FF7A 1GTEA 3VFLA 1F74A 2C18A 4GXMA 2X1RA 1NVMA 4A21A 1N8FA 2FB2A 4QISA 3THQA 1B57A 1UUMA 4LVGA 1V5XA 1HFBA 3OVQA 1VRDA 1UBSA 3GNNA 3W1TA 5KSWA 5AHNA 4AF0A 2C14A 4IQLA 1MZHA 2GPTA 1CI1A 3LXBA 5ABTA 3TUUA 3LRLA 2Z0IA 4DEFA 1GPWA 3DFSA 5HWNA 1GVOA 1SU5A 3HPZA 3M5YA 3NL2A 4I7WA 1FWNA 1S5VA 3LTPA 1NFBA 3EWYA 3B05A 5DCDA 4EWND 3O07A 3CQ0A 3KX6A 4M6QA 4E38A 5CZJA 3MBDA 1L9WA 2WPBA 3GXTA 1RQBA 4L4LA 1DKWA 1OK6A 2A7RA 2YW4A 3LCLA 4NUWA 3STFA 3PG8A 3RLVA 1F76A 2OT1A 3BGGA 1TRDA 2ZZ7A 1RPXA 4C1KA 4TO8A 1YLVA 2A21A 3L21A 4DO5A 5FF4A 3HPSA 2Y7GA 2J88A 1PCKA 3W71A 2EGZA 2ZZ4A 2QCDA 1R2SA 4QSHA 3ATYA 3G0SA 1ZAIA 5KMYA 3QMSA 4X2RA 3LERA 1W37A 4MZ1A 1KFEA 4IMFA 3F4NA 1NF0A 2VELA 3S0CA 3W7OA 1KFJA 5KITA 3IEBA 1ADOA 4YMZA 1K8ZA 1LP6A 1OJXA 3LHUA 1K8XA 4PEKA 1SO3A 4LU0A 1VS1A 3PBUA 1JQXA 4U4MA 3C0JA 1TV7A 4OGZA 1QMLA 3LM7A 5KTLA 1WYIA 4FO4A 4AXKA 4CNPA 4JX6A 4ADSA 2GJNA 2J27A 2J9YA 2Z6JA 2QJIA 3P74A 4O11A 2QDHA 3UXDA 1FQ0A 2NXHA 1ALDA 1NF7A 1JUBA 1CW2A 1XCFA 2E68A 4JTKA 1H62A 3KVJA 2YFNA 4P2VA 1Z48A 5C55A 1F5ZA 1RVGA 3U6WA 3UPWA 4WXZA 1KFKA 2B7OA 3NPXA 1VC4A 3WJZA 5CSSA 3N3MA 3R2GA 1JVNA 3O6YX 4WUIA 2A4AA 3DXIA 5I3HA 3HMJG 4Z0JA 3QW3A 4WD0A 1W3IA 2Y85A 3LX9A 3W84A 2ZTKA 2BWGA 3QJAA 3VCRA 1XBXA 5HINA 4OQVA 1L6WA 5LZLA 3NO5A 5HNRA 3KOFA 5DXXA 3G0UA 4CNNA 1IIGA 4N9CA 2BX7A 4GBUA 5AYXA 1LBMA 4I9AA 3DHDA 3Q37A 3W3OA 4JYDA 2Y6ZA 3EX6A 1F7BA 4KFNA 1GOXA 4IPJA 2LLEA 1QPQA 3JR2A 3KVMA 4DELA 3RK8A 2CZEA 1A5AA 3FFSA 3W1RA 2Y62A 3M6YA 1L6SA 3C2EA 3FEMA 4ORIA 1RQHA 3IV3A 3WJXA 3H53A 3MO7A 1K7FA 4ZQNA 3C2RA 1OK4A 4RLIA 1WOAA 3UPBA 5DN1A 5AHLA 1GT8A 1MEWA 1H61A 1WV2A 1XDMA 4JTFA 4LVFA 1LLWA 1XFBA 1FDJA 1ZJIA 4HT3A 3MP4A 3FA5A 3NQCA 4UR8A 2PE4A 4ADTA 1QOPA 4O16A 4RKAA 4DBDA 1WX0A 2G97A 2OT0A 3E49A 1GG0A 5AC7A 4ZZ9A 3BK0A 4WX2A 3DFOA 2HSAA 1XKYA 3B06A 3IVTA 4JYEA 1ICQA 1GTHA 1RV8A 1SUXA 3ABSA 2DZSA 3CIXA 4XUGA 5DBUA 3RNDA 1OYCA 3L67A 3P5ZA 3GKFA 4PL1A 3NL6A 3BARA 1VH7A 4N6EA 3W7DA 2QUVA 4GJ1A 1TPUA 3GXPA 2V2CA 3HGJA 4KWWA 4K7YA 4QITA 4ZQPA 1HUVA 1XDLA 1IF2A 1TTPA 2PC4A 3BG9A 1LLZA 1IXOA 1VYSX 3PSVA 1QAPA 3LLFA 4O4WA 4HPJA 1H7WA 4UTTC 3FJ6A 1W8SA 3C6CA 5TQLA 2PRLA 1I2OA 5FEZA 4AF0B 5G2WA 5AC8A 1QPRA 1AL7A 4LS0A 1LOQA 2YSWA 4KFOA 4GUFA 3A5FA 1L2UA 2CZFA 2WO5A 1WOBA 3QRHA 1IXQA 2C6QA 2VEPA 4I7VA 3RFAA 4NVTA 5HR7A 4HNNA 4NNCA 5LNSA 1H7OA 3O8AA 3M0ZA 3L0NA 4FX7A 3M43A 4Q4KA 1S5WA 3GR7A 1TPH1 3NVTA 2VEIA 1OF6A 4OE7A 2ZFAA 3G1HA 1KM5A 3DI0A 4FNUA 3EWZA 1SSDA 3R5EA 3NZRA 3GLCA 1EX5A 1ZALA 3GAYA 3LRMA 4CQ9A 3CEPA 4ZL1A 4NJGA 4WY0F 5L9FA 4O0KA 2YDAA 1IIHA 4A3UA 3MW7A 3DH7A 3PUDA 3G24A 3QSRA 2QCDB 1H1YA 5CPMA 3BV4A 4WY0A 1EWDA 3DFPA 3W7GA 1VHCA 4UTWA 1QNVA 2F84A 2NV1A 1DJQA 3GNDA 3EX1A 2C15A 1GVFA 3B04A 1LYXA 3NM1A 3UXAA 3HBLA 2VFDA 3LOTA 1TPDA 2A85A 3PS7A 4FXRA 1VCFA 2A5HA 5J5DA 5G5IA 1OG0A 3QC3A 1U83A 1L6YA 2I9EA 3JS3A 2OCZA 3PWAA 3MHFA 4D2JA 4UFHA 4IOTA 2ABAA 3EEGA 1QO2A 3P8JA 1SW0A 3TQVA 1I4NA 3NM3A 4K36A 3ELFA 3CWNA 4NXKA 1TPB1 3C4UA 4ZQRA 1JCXA 4AAJA 3UYCA 3TSBA 3QMTA 6ALDA 4GC4A 4UNLA 1IXPA 1N55A 4UTTA 1OFOA 3MMTA 4O15A 3NL5A 2VENA 1KM4A 3I7SA 5HUPA 3TCEA 1X8FA 2Y7FA 2ZZ3A 4GRSA 5D02A 3S9YA 3L2IA 3W76A 4Y90A 4E0CA 1OFPA 1SW3A 2TMDA 3RF9A 2QCEA 5KZDA 1KV8A 4BF9A 3KHJA 4O57A 3S1UA 3BLIA 5KZEA 1PHWA 1TSIA 5D2VA 1H1ZA 5K3VA 4JN6A 3L0KA 1Q45A 5BMWA 1H5YA 3TK7A 3NEVA 1QPNA 3NPVA 2R8WA 2ZRYA 2GQAA 1JCJA 3P7YA 3N2XA 3PUOA 3QQ0A 2CLKA 3MYPA 4POCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1UR0 A;  2QDG A;  4W5Z A;  5C7H A;  4ZQO A;  5C2G A;  4JX4 A;  4JTL A;  4A29 A;  3CZJ A;  5D9M A;  3NOY A;  3OPS A;  3RHG A;  2PWU A;  4IMD A;  1AA1 B;  1WXZ A;  2CLE A;  1PTG A;  3B8D A;  2WVT A;  4N7Q A;  3TE9 A;  4PUN A;  4BEQ A;  4KGL A;  3UQN A;  1XS2 A;  1F8I A;  5DY2 A;  3AWO A;  2FB3 A;  3WLI A;  2D3L A;  1J0I A;  3O9N A;  4PTN A;  4E2B A;  3KHD A;  1GYL A;  3W26 A;  2NXG A;  3ZVH B;  1PAM A;  4MY8 A;  1A0E A;  5A2A A;  1THF D;  2HDJ A;  1BRL B;  2GZX A;  2VVN A;  2R91 A;  4R33 A;  3OZY A;  1G4E A;  4HHL A;  4GAB A;  4M0X A;  3BQ6 A;  4PGL A;  1UWA A;  1P4C A;  3OBK A;  3ERP A;  3PTK A;  3TXZ A;  1RZM A;  5KZM A;  2VT0 A;  3U2Z A;  4PMR A;  2XWD A;  2DZV A;  4MMW A;  3WH8 A;  1PL9 A;  3L23 A;  4LS2 A;  4GNJ A;  2RGL A;  1VFL A;  2R24 A;  3GDR A;  5G2H A;  3XIN A;  4UQC A;  5CPN A;  4HCD A;  3BLO A;  5DBT A;  3VD9 A;  4PMY A;  3FYO A;  3M0I A;  4Z1A A;  1XJB A;  4DF1 A;  3PJX A;  4DQW A;  3W38 A;  1WDD A;  4BY3 A;  3VMO A;  3WMB A;  3ALG A;  5BW6 A;  2GDU A;  2XH0 A;  4PRW A;  1XHG A; 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