5DBMA

Crystal structure of the cbp bromodomain in complex with cpi703
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
KIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Protein binding
molecule keywords CREB-binding protein
publication title Regulatory T Cell Modulation by CBP/EP300 Bromodomain Inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 114
sequence length 114
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5dbmA00
5A5SA 5CQ5A 5ENJA 4NUEA 5CQ4A 4J0SA 5FH6A 4XY9A 5E9MA 4CURA 5D3TA 2E7NA 5FBXA 5LUUA 5KTUA 4UIUA 5DYAA 4UIWA 4YY6A 4A9MA 4O7AA 4KV1A 5FB0A 5CRZA 3P1FA 4CFLA 2KTBB 5HENA 4YH4A 3P1DA 4NYXA 5LVQA 5I80A 1F68A 5FFVA 5IGMA 5F63A 1E6IA 5HFRA 5DW2A 4QC3A 2H60A 5L97A 3AADA 5EWVA 5C4QA 5L98A 2I7KA 5F5ZA 4UYGA 4A9FA 5IGLA 4J3IA 3TLPA 4O77A 4A9LA 5F61A 4XUBA 5G4SA 5EQ1A 5FE7A 4Z93A 5IGNA 4ZQLA 5KHMA 4TU6A 5DFBA 4BW1A 5EK9A 5FE1A 2E7OA 2L84A 5E3GA 5FE2A 5LJ1A 5BT3A 5FG5A 2RS9B 4NQNA 5CY9A 5C7NA 5I1QA 4YYDA 1JM4B 3UVWA 5DLXA 4LRGA 3AQAA 4IR4A 5D3SA 5E9LA 5K29A 3MQMA 2L5EA 2R0VA 4MR3A 3Q2EA 5E9IA 4Z6IA 4AKNA 4NRCA 5EM3A 5EI4A 4QYLA 4QEWA 4E96A 3K2JA 5KO4A 4TTEA 4O70A 3LQIA 4NR7A 5CUDA 3UVYA 3ONIA 4O74A 5ENIA 5F1HA 5II2A 5A81A 5DBMA 5ENEA 2OSSA 5CQ8A 2RI7A 3HMEA 3MXFA 5F2PA 2YQDA 4QSXA 3FKMX 5DYUA 5EWCA 3LJWA 5D24A 4PCIA 5DYXA 5EPBA 4QSVA 4N4HA 2DATA 4TYLA 3U5NA 4TZ8A 5CUAA 3I3JA 5DYCA 4PS5A 2L85A 4TQNA 3UV5A 4BW4A 4YADA 3HMFA 5F62A 3GG3A 5I29A 5LJ0A 5ENGA 3IU5A 4WHWA 4ZW1A 4N4FA 2OO1A 4QSRA 2WP1A 2F6JA 4BJXA 2RO1A 3U5OA 5I7YA 5HRVA 4QC1A 5CP5A 2MJVB 4CUPA 5E9KA 4ALGA 4TT2A 4NYWA 5HCLA 5FE5A 3MB4A 5ENCA 5A5NA 4NRAA 4UYFA 3UV4A 2DVSA 4HXLA 4O7BA 4YATA 5L96A 3SVFA 4O75A 4NRBA 4CUSA 4YYNA 4UYFB 4LR6A 5D3RA 5L8TA 5F3AA 5HEMA 4WIVA 5CZGA 5A83A 2YW5A 4QR5A 4NUCA 4J1PA 5LKZA 5LKUA 5A85A 5F1LA 4OGIA 3P5OA 5D3JA 5EWHA 5L8UA 5H1VA 5EPRA 5LKTA 5LJ2A 4UIVA 5CUCA 4YK0A 4Y03A 4YYHA 5CQAA 4O76A 4QUUA 4N4IA 5E0RA 5CUBA 5BT4A 4UYHA 4MEOA 4Z1SA 5E74A 4QYDA 3QZVA 5II1A 4YAXA 5AMFA 4TU4A 4Q0NA 4LDFA 3QZSA 4LZSA 4UIYA 4UYDA 5FE3A 5HQ5A 4IR5A 4Q0OA 4CUUA 4QY4A 5F36A 4XUAA 5FE0A 5D3NA 2D9EA 5CUEA 4A9IA 4TZ2A 5E7DA 3O37A 2R10A 5KU3A 5A7CA 4YYMA 5BT5A 4NS5A 5KTWA 5DW1A 5H85A 4CUQA 5FG6A 2DWWA 4PY6A 4FLPA 4BHWA 4NR8A 3DAIA 5LVRA 4HBYA 4QZSA 5F60A 3ZYUA 5I88A 4ZC9A 4C66A 5FH8A 5CGPA 3D7CA 3P1CA 4QSSA 5DFDA 4YC9A 4HBWA 4IOQA 5DKDA 3U5LA 4IR3A 3UV2A 5AMEA 2G4AA 3Q2FA 3UVDA 5CRMA 4A9HA 2RFJA 5EWWA 1WUMA 4MENA 4NR4A 3UW9A 4A9NA 4UIXA 4YABA 4MR4A 3LXJA 5I7XA 4HXSA 4QSUA 5D25A 5EU1A 5CTLA 2F6NA 5CQ6A 2OUOA 4UITA 4YYKA 5FB1A 4F3IA 4NR9A 4X2IA 5EISA 3O36A 4ALHA 5G4RA 3SVGA 5EV9A 5JI8A 5A5RA 3O35A 5HLSA 5IIDA 3NXBA 4J0RA 4YBTA 5D7XA 4QSPA 5C89A 2GRCA 5DKCA 5A82A 4NR5A 4A9OA 5IGKA 2DVQA 4HXRA 1X0JA 3SVHA 5D3HA 2DKWA 5DY7A 2I8NA 5HFQA 4NR6A 5AD3A 3JVMA 4QUTA 5FDZA 3JVJA 5TCMA 5D26A 4PKLA 4HXMA 4PTBA 4BW3A 4QR3A 2N9GA 5ENFA 4CUTA 4UYEA 4HXNA 4QBMA 5ACYA 5CPEA 5DX4A 5ETBA 4NYVA 4YBSA 4HXKA 4Z1QA 5HQ6A 3IU6A 5C85A 4N3WA 4CL9A 5HM0A 4QEVA 4UIZA 5EP7A 5FH7A 4O7EA 4WHUA 5CFWA 5H1UA 4KV4A 4O78A 3JVLA 5EWDA 4IORA 3DWYA 3LQHA 5I40A 5ETDA 4MEPA 2WP2A 4IR6A 4PCEA 3U5PA 5FFWA 4A9KA 5E73A 4XYAA 5A5OA 4NXJA 4YYJA 5E9VA 5FE8A 4MR6A 5EVAA 5C8GA 4MEQA 3QZTA 3U5KA 5HQ7A 5FFYA 4HBVA 3MULA 5DKHA 5JWMA 4TT4A 2RNWA 2YDWA 2YEMA 5LKXA 5A5PA 4DONA 1JSPB 2R0YA 4YYIA 2LSPB 2YEKA 4YY4A 4QB3A 5DFCA 5C87A 2FSAA 2NXBA 4C67A 5CQTA 5FE9A 5HRWA 5A5QA 2E3KA 4YH3A 5CUGA 5EA1A 4A9EA 4NQMA 4Z6HA 4TT6A 5F25A 3S92A 4GPJA 5HELA 3G0LA 3G0JA 4YBMA 3MUKA 4O7FA 4HBXA 5FE4A 4LC2A 3LQJA 5D0CA 4MR5A 4QR4A 4LYIA 3O33A 5L99A 3S91A 1WUGA 3O34A 4O7CA 5E9YA 5H1TA 2RNXA 5EGUA 5HJCA 3U5JA 5DLZA 4OGJA 5KTXA 3U5MA 4LZRA 2DVRA 4TS8A 4QEUA 5HRXA 5ENHA 5E3DA 5D3LA 2YELA 4O71A 5TB6A 4QNSA 5IG6A 4O72A 4A9JA 5FE6A 5FG4A 5EICA 5EPSA 1N72A 5AD2A 3RCWA 4IOOA 4HXOA 4QSQA 2RNYA 1EQFA 5COIA 2DVVA 4XY8A 4HXPA 4KCXA 3MB3A 4RVRA 4LYWA 5I89A 2YYNA 4LZ2A 5I83A 5CS8A 3HMHA 3JVKA 5CU8A 4QSTA 5D3PA 4OUFA 4LYSA 4CLBA 5IBNA 3P1EA 3UVXA 5J0DA 5I86A 2R0SA 4BW2A 4QSWA 4NUDA 4N4GA 4YYGA 1ZS5A 5CQ7A 5ENBA 5CQ3A 4CFKA 2D82A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5A5SA 5CQ5A 5ENJA 4NUEA 5CQ4A 4J0SA 5FH6A 4XY9A 5E9MA 4CURA 5D3TA 2E7NA 5FBXA 5LUUA 5KTUA 4UIUA 5DYAA 4UIWA 4YY6A 4A9MA 4O7AA 4KV1A 5FB0A 5CRZA 3P1FA 4CFLA 2KTBB 5HENA 4YH4A 3P1DA 4NYXA 5LVQA 5I80A 1F68A 5FFVA 5IGMA 5F63A 1E6IA 5HFRA 5DW2A 4QC3A 2H60A 5L97A 3AADA 5EWVA 5C4QA 5L98A 2I7KA 5F5ZA 4UYGA 4A9FA 5IGLA 4J3IA 3TLPA 4O77A 4A9LA 5F61A 4XUBA 5G4SA 5EQ1A 5FE7A 4Z93A 5IGNA 4ZQLA 5KHMA 4TU6A 5DFBA 4BW1A 5EK9A 5FE1A 2E7OA 4AKIA 2L84A 5E3GA 5FE2A 5LJ1A 5BT3A 5FG5A 2RS9B 4NQNA 5CY9A 5C7NA 5I1QA 4YYDA 3ERRA 1JM4B 3UVWA 5DLXA 4LRGA 3AQAA 4IR4A 5D3SA 5E9LA 5K29A 3MQMA 2L5EA 2R0VA 4MR3A 3Q2EA 5E9IA 4Z6IA 4AKNA 4NRCA 5EM3A 5EI4A 4QYLA 4QEWA 4E96A 3K2JA 5KO4A 4TTEA 4O70A 3LQIA 4AI6A 4NR7A 5CUDA 3UVYA 3ONIA 4O74A 5ENIA 5F1HA 5II2A 5A81A 5DBMA 5ENEA 2OSSA 5CQ8A 2RI7A 3HMEA 3MXFA 5F2PA 2YQDA 4QSXA 3FKMX 5DYUA 5EWCA 3LJWA 5D24A 4PCIA 3D1DA 5DYXA 5EPBA 3VKHA 4QSVA 4N4HA 2DATA 4TYLA 3U5NA 4TZ8A 5CUAA 3I3JA 5DYCA 4PS5A 2L85A 4TQNA 3UV5A 4BW4A 4YADA 3HMFA 5F62A 3GG3A 5I29A 5LJ0A 5ENGA 3IU5A 4WHWA 4ZW1A 4N4FA 2OO1A 4QSRA 2WP1A 2F6JA 4BJXA 2RO1A 3U5OA 5I7YA 5HRVA 4QC1A 5CP5A 2MJVB 4CUPA 5E9KA 4ALGA 4TT2A 4NYWA 5HCLA 5FE5A 3MB4A 5ENCA 5A5NA 4NRAA 4UYFA 3UV4A 2DVSA 4HXLA 4O7BA 4YATA 5L96A 3SVFA 4O75A 4NRBA 4CUSA 4YYNA 4UYFB 4LR6A 5D3RA 5L8TA 5F3AA 5HEMA 4WIVA 5CZGA 5A83A 2YW5A 4QR5A 4NUCA 4J1PA 5LKZA 5LKUA 5A85A 5F1LA 4OGIA 3P5OA 5D3JA 5EWHA 5L8UA 5H1VA 5EPRA 5LKTA 5LJ2A 4UIVA 5CUCA 4YK0A 4Y03A 4YYHA 5CQAA 4O76A 4QUUA 4N4IA 5E0RA 5CUBA 5BT4A 4UYHA 4MEOA 4Z1SA 5E74A 4QYDA 3QZVA 5II1A 4YAXA 5AMFA 4TU4A 4Q0NA 4LDFA 3QZSA 4LZSA 4UIYA 4UYDA 5FE3A 5HQ5A 4IR5A 4Q0OA 4CUUA 4QY4A 3D1BA 2EJNA 5F36A 4XUAA 5FE0A 4AKGA 5D3NA 2D9EA 5CUEA 4A9IA 4TZ2A 5E7DA 3O37A 2R10A 5KU3A 5A7CA 4YYMA 5BT5A 4NS5A 5KTWA 5DW1A 5H85A 4CUQA 5FG6A 2DWWA 4PY6A 4FLPA 4BHWA 4NR8A 3DAIA 5LVRA 4HBYA 4QZSA 5F60A 3ZYUA 5I88A 4ZC9A 4C66A 5FH8A 5CGPA 3D7CA 3P1CA 4QSSA 5DFDA 4YC9A 4HBWA 4IOQA 5DKDA 3U5LA 4IR3A 3UV2A 5AMEA 2G4AA 3Q2FA 3UVDA 5CRMA 4A9HA 2RFJA 5EWWA 1WUMA 4MENA 4NR4A 3UW9A 4A9NA 4UIXA 4YABA 4MR4A 3LXJA 5I7XA 4HXSA 4QSUA 5D25A 5EU1A 5CTLA 2F6NA 5CQ6A 2OUOA 4UITA 4YYKA 5FB1A 4F3IA 4NR9A 4X2IA 5EISA 3O36A 4ALHA 5G4RA 3SVGA 5EV9A 5JI8A 5A5RA 3O35A 5HLSA 5IIDA 3NXBA 4J0RA 4YBTA 5D7XA 4QSPA 5C89A 2GRCA 5DKCA 5A82A 4NR5A 4A9OA 5IGKA 2DVQA 4HXRA 1X0JA 4AKHA 3SVHA 5D3HA 2DKWA 5DY7A 2I8NA 5HFQA 4NR6A 5AD3A 3JVMA 4QUTA 5FDZA 3JVJA 5TCMA 5D26A 4PKLA 4HXMA 4PTBA 4BW3A 4QR3A 2N9GA 5ENFA 4CUTA 4UYEA 4HXNA 4QBMA 5ACYA 5CPEA 5DX4A 5ETBA 4NYVA 4YBSA 4HXKA 4Z1QA 5HQ6A 3IU6A 5C85A 4N3WA 4CL9A 5HM0A 4QEVA 4UIZA 5EP7A 5FH7A 4O7EA 4WHUA 5CFWA 5H1UA 4KV4A 4O78A 3JVLA 5EWDA 4IORA 3DWYA 3LQHA 5I40A 5ETDA 4PCEA 4MEPA 2WP2A 4IR6A 3U5PA 5FFWA 3VKGA 4A9KA 5E73A 4XYAA 5A5OA 4NXJA 4YYJA 5E9VA 5FE8A 4MR6A 5EVAA 5C8GA 4MEQA 3QZTA 3U5KA 5HQ7A 5FFYA 4HBVA 3MULA 5DKHA 5JWMA 4TT4A 2RNWA 2YDWA 2YEMA 5LKXA 5A5PA 4DONA 1JSPB 2R0YA 4YYIA 2LSPB 2YEKA 4YY4A 4QB3A 5DFCA 5C87A 2FSAA 2NXBA 4C67A 5CQTA 5FE9A 5HRWA 5A5QA 2E3KA 4YH3A 5CUGA 5EA1A 4A9EA 4NQMA 4Z6HA 4TT6A 5F25A 3S92A 4GPJA 5HELA 3G0LA 3G0JA 4YBMA 3MUKA 4O7FA 4HBXA 5FE4A 4LC2A 3LQJA 5D0CA 4MR5A 4QR4A 4LYIA 3O33A 5L99A 3S91A 1WUGA 3O34A 4O7CA 5E9YA 5H1TA 2RNXA 5EGUA 5HJCA 3U5JA 5DLZA 4OGJA 5KTXA 3U5MA 1ZKRA 2DVRA 4LZRA 4TS8A 4QEUA 5HRXA 5ENHA 5E3DA 5D3LA 2YELA 4O71A 5TB6A 4QNSA 5IG6A 4O72A 1PUOA 4A9JA 5FE6A 5FG4A 5EICA 5EPSA 1N72A 5AD2A 3RCWA 4IOOA 4HXOA 4QSQA 2RNYA 1EQFA 5COIA 2DVVA 4XY8A 4HXPA 4KCXA 3MB3A 4RVRA 4LYWA 5I89A 2YYNA 4LZ2A 5I83A 5CS8A 3HMHA 3JVKA 5CU8A 4QSTA 5D3PA 4OUFA 4LYSA 4CLBA 5IBNA 3P1EA 3UVXA 5J0DA 5I86A 2R0SA 4BW2A 4QSWA 4NUDA 4N4GA 4YYGA 1ZS5A 5CQ7A 5ENBA 5CQ3A 4CFKA 2D82A
chains in the Genus database with same CATH topology
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