5DFPA

Crystal structure of pak1 in complex with an inhibitor compound frax1036
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
293
structure length
292
Chain Sequence
SDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAMDVATGQEVAIRQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEAT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PAK 1
publication title Design of Selective PAK1 Inhibitor G-5555: Improving Properties by Employing an Unorthodox Low-pK a Polar Moiety.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 97
structure length 292
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5dfpA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5dfpA01
1OPJA 3CP9A 3EKNA 4B6LA 4Z55A 2J5EA 3NUPA 3FMKA 2GQGA 3PIXA 3ZO1A 1KE7A 4O86A 3NPCA 3TZMA 4RIWA 1WAKA 2V5QA 3BEGA 3GFEA 4G34A 1BMKA 3V3VA 3P4KA 4XX9A 3PSCA 3PRIA 4G5PA 3S4QA 3WZJA 4P90A 3CD3A 4D2SA 5HLWA 3G0EA 3RNIA 4NTSA 1GZ8A 3B8QA 1H28A 2GMXA 2R2PA 2QONA 2B54A 4TWNA 2AC5A 2F2CB 2RFDA 1R78A 2Y4PA 3DK3A 3O96A 4GV1A 5EHLA 3UNJA 2Y6MA 5IG1A 3UMXA 4OTHA 1EH4A 3R83A 4QTDA 1DAYA 1JSVA 5KKRB 5CEIA 4GUBA 5BUIA 3QKMA 2CN5A 4EQCA 2VWZA 4BY9E 3G33A 1P5EA 1ZWSA 3ORKA 4FKSA 4WG4A 1SVHA 5HE1A 4F65A 4TL0A 2C6MA 4I21A 3VUMA 2GS7A 2C3LA 3NIEA 3OBJA 4YZDA 3BQRA 5M53A 4FG8A 2CGUA 3IGGA 4WBBB 4HZSA 2VWWA 4O1PA 2FSLX 5H8GA 4MBLA 2Q83A 5A4QA 3QAME 3QL8A 4E5AX 4JXFA 3KY2A 4UZHA 3WF9A 4AT4A 1O6LA 3HV7A 2X2KA 2XJ1A 2KTYA 4L9IA 3DKFA 4X2GA 4DLJA 1F0QA 3V5QA 3ZZEA 2YWVA 2J9MA 3H30A 3R7VA 3W2CA 4DT9A 1QL6A 3MBLA 4H1JA 3SXSA 4RMZA 3BYOA 2YN8A 5KZIA 3PPZA 1PHKA 4D9TA 1PRYA 3UPXA 4ASDA 4BDJA 5JGBA 3TL8A 5JQ5A 4V0GA 4E26A 3QXPA 2JDSA 5EM5A 3BWFA 2J0LA 2W0JA 4DE4A 2RF9A 3ZUTA 1H27A 4RWIA 1SZMA 1QMZA 3L9PA 2YIXA 4JOAA 4EOQA 3E5AA 4EBVA 2PVKA 1XH5A 2QHNA 3K3JA 2G01A 3JPVA 4ANSA 3Q52A 5B2MA 3ZM4A 4RJ5A 3HDNA 2B7AA 3R2YA 3ULIA 4CZYB 4O7RA 2WXVA 2Z7RA 4CXAA 1XWSA 5FQDC 5AX9A 1UA2A 4UV0A 5EKNA 2JIUA 4EYJA 4CFXA 3DFAA 1ZOEA 2B52A 3P23A 5HG9A 3KC3A 5A6NA 1IA9A 3UP2A 3NYOA 4DF3A 5I9XA 2QKWB 3QBNA 4II5A 3ZBFA 1XH7A 1W84A 4DFLA 1PXNA 1JNKA 4BWKA 4EK5A 3NVKI 4MXCA 4DBNA 3QQLA 2C6TA 5EYCA 5LCKA 5CU4A 4O21A 5EDRA 1CKIA 4IC8A 4AN3A 4YHJA 4NEUA 3OT3A 3C51A 3BU3A 2XEZA 3NW7A 5K0XA 4I5PA 3CTJA 4O82A 5E8XA 2BPMA 3ENHA 5CNOA 4JRNA 3TEIA 4GS6A 5B2LA 4O7VA 3D5WA 3KU2A 2QOCA 3FXXA 5K5NA 4EOPA 2WD1A 2B9FA 5I3OA 3ROYA 5GIOE 1ZMVA 3PWYA 4IW0A 2XNBA 4C61A 4C4IA 2B55A 4ZTRA 2ZDUA 4F70A 3WF5A 3CQUA 4C58A 1J3HA 1WBVA 2VO7A 4DAWA 5BVEA 5HO6A 4D2WA 3DPKA 4LRJA 4QOXA 4IAIA 1AQ1A 4WRSA 4U3ZA 1Q99A 3LFBA 5FM3A 4AS0A 4FT3A 4Q5EA 4BDDA 1OKWA 2JKMA 5I4NA 5KUPA 3UDBA 1S9JA 4AOIA 4BCNA 2AUHA 2YACA 3MIYA 4EOIA 5FDPA 5I0BA 4TW9A 3NYNA 5C27A 2BZIB 2XH5A 4YURA 4CKRA 4BDCA 4U40A 3VIDA 3ANRA 3AMBA 4ITHA 3QKLA 4X3FC 5FTQA 3MSSA 1YWVA 5LMKA 4CQEA 4CTBA 3OXZA 3CKXA 3G90X 1PKDA 4U97A 5A46A 5IISA 3PVBA 4TWCA 4MH7A 3GOPA 1M52A 5LARA 3BRBA 2OG8A 4GH2A 4XV2A 3NWWA 4TYIA 5BUEA 4BFMA 4D4VA 4BHNA 4MBIA 1FGKA 5E8WA 4I3ZA 2UW8A 4QP9A 4QYHA 2JKQA 3RJCA 4PY1A 4UZDA 4LV5A 2RFSA 4TWOA 2R9SA 3QTQA 4FMQA 4PTCA 2C68A 4F08A 3KL8A 1UNHA 4WNMA 2WOUA 3BU6A 3AGLA 4DCEA 3BX5A 2WU6A 4JAJA 2C4GA 3KRJA 3TJCA 3QWJA 5IA2A 2P0CA 1NXKA 5H9BA 4IANA 1K3AA 4CQGA 5AR7A 4C3RA 5EW8A 5A54A 3SV0A 5LWNA 2VWXA 1OL7A 3EN4A 4F7JA 2ONLA 3UP7A 1M17A 2WOTA 3GEQA 4EL9A 2XCKA 4IDVA 5KMIA 3GT8A 5F4NA 5BUJA 3K3IA 2YAAA 4IADA 2WAJA 5HG5A 2E9UA 2CJMA 4LGDA 2IW6A 3NSZA 3C5IA 3ETAA 4ANLA 4F1TA 3LFAA 4C4FA 4TN6A 4K18A 3C9WA 4FTOA 2DWBA 4EHZA 2BZHB 4EEVA 3MJ1A 5I9VA 3CKWA 4G3GA 1Q41A 3NNUA 4UMPA 4YTIA 3TN8A 3SVVA 2BHHA 4GUEA 1PMNA 4UWYA 2XKEA 3SQQA 3H4JA 4JDIA 4UXLA 3VNTA 4CRSA 1CMKE 5I5ZA 3QZFA 1REKA 3MW1A 3WI6A 4BBFA 2VTJA 4KAOA 3TM0A 5AUXA 4ACDA 4FNZA 4CLIA 3PZHA 2SRCA 3QCQA 3VJNA 3TV6A 4C35A 5IZFA 5A9UA 2W1ZA 5K4IA 4FSYA 3B8RA 3HV5A 4IZAA 5L2IA 5HCYA 3PA5A 3FZPA 3OEFX 4CGAA 3BPRA 3GC0A 4FKWA 4J53A 2PSQA 3NRMA 1JLUE 1OIYA 3U8WA 3ZFXA 2PU8A 2VD5A 3VUTA 4FK3A 1JKKA 2PZ5A 3CJFA 3GENA 3H10A 4M8TA 1YOJA 4PNIA 3LPBA 4L46A 3H9RA 3O17A 1ZOGA 4LRMA 3G6GA 5HLPA 4R78A 3OWPA 4Z3VA 4NYEA 2VNYA 2X4ZA 4C3FA 1IAHA 4BBEA 3O7LD 4RC2A 1W8CA 3OFMA 5DWRA 4BVUA 1XH4A 1S9IA 3HKOA 2X9FA 4KA3A 3PY1A 4FKOA 4NW5A 5A4TA 4FIJA 5J9LA 1O9UA 4PTGA 1L3RE 2BRNA 2WQNA 4RG0A 4AZEA 2PYWA 4O7LA 2YDKA 4UMQA 3OWJA 2CKOA 4QMYA 4HNIA 5FLFA 3FLWA 5GZAA 5DT3A 1LR4A 4X2JA 4X2NA 4FKIA 5CALA 3EQDA 5JZJA 3L8PA 5CSHA 4ZTMA 5C26A 3C4FA 1LP4A 2PVHA 4GFMA 3MY1A 4YJSA 2C3KA 1I09A 2QOLA 2QURA 1B6CB 3FHRA 5BYYA 4BDKA 4O83A 3E64A 4HVIA 5EYDA 3DZQA 3EN6A 1W98A 4XMOA 4IM2A 4JQ7A 4LRKA 4HYHA 3H0YA 3QQGA 3Q4TA 4A4OA 1DI9A 4LQMA 3UOJA 2JITA 2NP8A 2ITPA 1O6KA 4FV9A 1IA8A 4NK9A 2HZ0A 4YLJA 1YXVA 3QA8A 4BCMA 3NVMB 3MV5A 4IVCA 3Q04A 2BUJA 4IXPA 5AUWA 3HNGA 3F9NA 5HI2A 3OUNB 3F2RA 4FEUA 2C6KA 2VGOA 2C5OA 4LYNA 4PMMA 1P2AA 2IVVA 4XLIA 3VJOA 5M06A 4EH8A 4RFMA 3T3UA 2A2AA 1LEWA 3OWKA 3R00A 3EFWA 2UZNA 2XJ0A 3NUSA 4F9WA 2W96B 3LFFA 4PL3A 4DT8A 3LQ5A 3OOMA 3CPBA 4FIHA 4LI5A 2H96A 1J7LA 4MWHA 4OBOA 3HZTA 1OUKA 1YWRA 4KBCA 4H36A 3CR0A 4NIFA 4D0XA 2X1NA 2G9XA 2EXMA 5AIKA 4QP3A 3F7WA 3UVPA 3LMIA 2WQOA 5HQ0A 4DINA 1AD5A 2CKEA 3UO5A 4HPTE 3F3UA 3E88A 2BHEA 3P9JA 4X0MA 5A3XA 2ERKA 3FDNA 4JI9A 4F7SA 1BX6A 3VUHA 4DG3E 2UZTA 2EU9A 3PLSA 1Q3DA 3DDQA 3HMNA 1V0PA 4FICA 4YGAA 4U7ZA 4DH1A 3R71A 4PDOA 1H01A 2YIQA 3BGZA 3D14A 4BDIA 1M2QA 3FBVA 2V7OA 3PVGA 4JBOA 3VBYA 3TV4A 5K5XA 2PZPA 4IZ5A 3HAMA 2NO3A 1BI8A 1QPEA 4FIIA 3COKA 2YIRA 3PJ3A 2P2IA 4KNBA 4NL0A 1YHVA 3MGYA 2X9EA 2BDJA 5T6KA 1KUTA 2QQ7A 1WBWA 5JN2A 4FF8A 1U4DA 2QLUA 4FTCA 4CFVA 4FTQA 3IW8A 2R64A 2J90A 2YCQA 4M3QA 4OTRA 3RHXA 4W8DA 2PE1A 3BIZA 5H8EA 3VS6A 1VJYA 4MF0A 4BCJA 2PVYA 3ORPA 3QX2A 2FSMX 4FEXA 4O27B 3KVXA 3MVMA 4D2PA 3SG9A 1QPJA 5C9CA 3Q9WA 2GSFA 3FKOA 2OSCA 2YHVA 4FK6A 2YM8A 5FTOA 2PVMA 4GMYA 5LJJA 1MRVA 3COMA 4CMUA 3L8XA 3QTXA 1WFCA 4ERKA 3W8LA 3DK7A 1ZMWA 4UWCA 5AR2A 5EM6A 4CRLA 1A06A 2FUMA 5FTGA 3PJ1A 4QMUA 2DQ7X 5DMZA 1NVRA 1Y91A 2R3IA 4YJUA 1VYWA 3BEAA 3NAYA 1CKPA 5HICA 3OWLA 5IKWA 2C6LA 5EOLA 3SXRA 4AT3A 1QPDA 4EJ7A 2RG5A 4GU6A 3VN9A 1Q62A 3WE4A 3KQ7A 2OO8X 5DLSA 4ACMA 3F3VA 4AN2A 4F09A 4OAVB 4H3QA 3UOLA 3VS4A 4Y85A 2GNHA 1DI8A 4H1MA 2PHKA 3HV3A 1U59A 4G9RA 4ZJVA 3FHIA 3FZSA 4O81A 4U80A 4RFYA 3QFVA 4EOSA 5D1JA 3TDWA 2JIIA 3W2PA 3ZRLA 3DFCB 3DT1A 4M7IA 3QGYA 4QTBA 4QNYA 3ZXTA 1SVEA 5CEMA 3FYJX 1ZY5A 4YSMA 5JEBA 1I44A 3FLNC 1JVPP 4BKJA 2PE0A 2VTOA 3F82A 3FZOA 4GIHA 3FQHA 4LUEA 4GG7A 4XRJA 2CNVA 3GC7A 5FBOA 2UVYA 2VU3A 3QLGA 4NM3A 1W7HA 3BQCA 1JKSA 2GQRA 1U54B 3E93A 1T45A 4AE9A 2JBPA 4HZRA 2GTNA 3ZFYA 1J7IA 5IF1A 5K4JA 2HK5A 3I5NA 2ZYBA 4FG7A 5AM7A 4RQVA 3AMYA 4GVAA 2UUEA 3C50A 5CXZA 3EH9A 4ZS0A 2E9VA 4MQ1A 4DH3A 5CF5A 5K3YA 3PWDA 5IUHA 4NFNA 2JFMA 2LGCA 3LVPA 3DDPA 4BN1A 4E6AA 2H6DA 4I93A 2RKUA 4N6ZA 4PWNA 3LLAA 4JIAA 3EFKA 5B7VA 3F88A 3I79A 5CI6A 5HD4A 4N57A 2PMLX 1DAWA 2C3IB 4BI1A 1XR1A 1MUOA 5CXHA 1Q4LA 2H9VA 2XIKA 3GXLA 3UC4A 4O2PA 2FO0A 1ZZLA 4B0GA 5CSVA 5D12A 1H1QA 3FE3A 4YJOA 4NCTA 5CF6A 5L3AA 4LG4A 4XP0A 1MQBA 4M12A 3PP1A 4JS8A 2QR7A 3TIYA 3WE8A 4MBJA 4BI0A 3C4WA 3D5VA 2UZLA 3DJ7A 2VWYA 2WKMA 2W1FA 5EI2A 4EWHA 2W1GA 5ACKA 3TUBA 4MXZA 1R1WA 1KOAA 3VO3A 4A4XA 2VO0A 4WUNA 4FOBA 4M97A 1J1CA 4YNOA 3TKIA 2WTJA 3GP0A 4UMUA 4QQCA 2OXXA 3QCSA 4YR8A 4BC6A 3D5XA 4IJ9A 3ZO3A 4KKHA 1VR2A 5GZ9A 3DOGA 3OROA 2ITZA 3KXNA 4FTKA 4N6YA 3FSKA 4UXQA 4BCHA 3VUGA 3VBQA 3VWAA 3NMUF 3R6XA 5AWMA 5HU3A 4C2VA 3VVHA 2ZV9A 1ZYDA 3ZSHA 4PP7A 4NJDA 2X81A 4KIOA 4KSPA 4MXOA 3KB7A 3P1AA 5E4HA 3R7OA 2BAKA 3D7TB 4FTJA 3EQHA 2HWOA 3C0GA 4K33A 3E8EA 4DEAA 2OIQA 4YZNA 2Y0AA 2O2UA 2QG7A 4QTCA 2R3NA 2VWVA 1J91A 3PXZA 4IMYA 2YZAA 3QTWA 4U79A 3QUDA 4I5MA 3V6RA 3RKBA 3O23A 4FE2A 5CWZA 1TVOA 4KIKA 1PXPA 4DTAA 4W4VA 1H24A 3TUCA 2OJ9A 3UVQA 3OW4A 5E8YA 3RZFA 3SLSA 3CY3A 3ZRKA 4K6ZA 3V8SA 5BPYA 4FSWA 4WG3A 4Y46A 4TYJA 2OGVA 5IA5A 2VTRA 4BR3A 4L53A 4AGUA 2R3RA 3ODYX 1U54A 3C4EA 3A7HA 4IB5A 5DT0A 4OTQA 5CAUA 1PXJA 5IUIA 4UBAA 5E91A 3F3WA 3RNYA 5M4CA 1UU8A 1RE8A 4AG8A 1WBPA 2OLCA 4ZJJA 2J0JA 4NUSA 3W32A 3EL7A 4D55A 5AAFA 4ZMEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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