5DSIA

Structure of co2 bound holo-form of human carbonic anhydrase ii with 0 sec (no) warming
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Tracking solvent and protein movement during CO2 release in carbonic anhydrase II crystals
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-09-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5dsiA00
1I9LA 5FLRA 2QOAA 2AX2A 5FLTA 3M1QA 1FQRA 1TEQX 5FDIA 1FQLA 1CVEA 4YYTA 3ML5A 1RZCA 5FNGA 2GEHA 4WR7A 5EKHA 1THKA 3V3GB 1YDCA 3V3HB 3RZ0B 1G48A 1MOOA 1TBTX 5SZ3A 1URTA 1JD0A 3NJ9A 3R17B 5FLSA 1UGDA 3EFIA 4L5WA 3RLDA 1G0FA 1CZMA 1RAYA 3HKQA 5JEHB 1JV0A 3MNJA 4PQ7A 3F4XA 4Q8ZA 3TMJA 4QJMA 1RZEA 3RYXB 4M2RA 1TH9A 3RG3A 1HUHA 3S8XA 5DSJA 1G54A 1TTMA 5EZTX 1UGBA 1G53A 3MHIA 3D0NA 5FL4A 4RN4A 2NNGA 2NXRA 1CNWA 3V2MA 2POVA 4L5UA 1G1DA 5DOGA 4LHIA 4YGNA 1H4NA 1TEUX 1I8ZA 1H9NA 4G0CA 4BF6A 3MHMA 1KEQA 1TB0X 1LG5A 3N4BA 4YGKA 4R5AA 4JSSA 4CNXA 2CBDA 3P44A 1G4OA 2HFWA 2NNVA 4UOVA 2AW1A 3R16A 4RIVA 1FLJA 5E5UA 4QJPA 2EU3A 2ILIA 3N2PA 5EKMA 3T5UA 3DV7A 2WEGA 3S71B 4RFDA 4MDGA 1H9QA 4WW8A 1ZH9A 5AMDA 3F7BA 4KP8A 1CNKA 3HS4A 4QK1A 3P4VA 4IWZA 3RZ1B 3MZCA 3DCSA 1AZMA 1TG3A 2POUA 1BNMA 1YDBA 4HF3A 1KWRA 1IF9A 1LG6A 1V9IC 1CNIA 4Q6DA 3OYQA 3RYVB 2NXSA 4RUZA 1CNJA 1UGCA 4Q7VA 1CVHA 2NWPA 3DCCA 2CBEA 4R5BA 1CVAA 4DZ9A 1CCTA 2NWYA 3DVCA 2WD2A 3V3FA 4YXUA 4ZAOA 3MHCA 4QJ0A 5JEPB 4QY3A 3M3XA 3S97A 1HEDA 5FLQA 1CVCA 3PYKA 1FR4A 3PJJA 5EHVA 3RZ8A 4PXXA 1BICA 3M5EA 1TE3X 2ABEA 1ZSCA 1G4JA 1CAHA 5DSRA 4K0SA 5EHWA 4Z1KA 5CJFA 4HBAA 4K0ZA 1HEAA 2POWA 4E3FA 3KKXA 3IBIA 5JDVB 3TVNX 5A6HA 4CNWA 2EZ7A 3M2NA 4G7AA 3D8WA 3P5LA 2VVAX 4Z0QA 2FMGA 4RUXA 5JEGB 4YGJA 5EH8A 1I9QA 3MNHA 8CA2A 3K2FA 2Q1QA 4FL7A 4COQA 3MYQA 3CYUA 3V7XA 3DA2A 2FNKA 5E2MA 3KIGA 4FRCA 4PYYA 3MNUA 5BRWA 4JS6A 3IBLA 3M98A 5FNLA 3S78B 2W2JA 5E28A 1CNGA 3SAXA 5BYIA 3MHLA 4K13A 4PYXA 5BRVA 3KS3A 4QIZA 1FSNA 1BZMA 1IF7A 1ZE8A 3M1KA 3V2JA 5DSQA 1Z9YA 4ZX1A 1CCSA 5CA2A 5BNLA 5DVXA 1TG9A 3P58A 1CAMA 4E3GA 1XPZA 4Q7SA 1CNCA 3S76A 3BL0A 3T83A 3FE4A 4KUYA 1I9NA 2NWZA 3M2ZA 3P3HA 3QYKA 12CAA 5DSNA 2FMZA 3T82A 1Y7WA 4MO8A 5AMLA 3KWAA 2FOSA 2Q38A 4YGLA 4Q7PA 3M2YA 1CNBA 1RJ5A 3CAJA 3HKUA 2FOQA 4K0TA 2CBAA 3B4FA 3N0NA 4JSWA 1BCDA 3U47A 4E49A 1CVDA 4Q78A 3DBUA 3P3JA 3DCWA 2QO8A 4KUWA 4WW6A 1CVFA 5E2KA 1DMYA 4Q49A 3TVOX 3VBDA 5DSPA 1CALA 4TWMA 3FW3A 4HEZA 3D92A 3RYZA 1BN3A 2CA2A 4QSIA 5FLPA 5SZ1A 3D9ZA 3KNEA 4Q90A 3MDZA 3MWOA 2CBBA 1CAZA 5FNMA 4MLXA 5IPZA 1XEVA 4HT2A 5G01A 3V3IB 3OIMA 3JXFA 4M2UA 6CA2A 4QIYA 3T85A 5SZ4A 3T84A 4MDLA 4K1QA 4Q81A 1ZFKA 1CNXA 3OIKA 4M2VA 1IF8A 3S72B 3M40A 4Q09A 5EH5A 1RZDA 3HKTA 5LMDA 5SZ0A 5JG3B 5SZ2A 4CA2A 4IDRX 1CRMA 5CACA 3B1BA 4CNRA 3IEOA 4WUQA 1ZNCA 4CQ0A 2ZNCA 3IAIA 5E5RA 3N3JA 3KOIA 3RYJB 4QJXA 5E2NA 2QP6A 3K34A 1BNVA 2EU2A 4Q99A 5AMGA 5DSKA 1CCUA 1G45A 1G6VA 4GL1X 4HT0A 1AVNA 4KNMA 3MMFA 1KWQA 4QJOA 2X7TA 5JGTB 3MNIA 3P5AA 3IBUA 3HKNA 3S73B 4Q6EA 2FNNA 3KOKA 2HNCA 1F2WA 3NB5A 3CZVA 5EKJA 2FOYA 2HD6A 5E2SA 4N16A 1FSRA 3OKVA 1RAZA 4YGFA 1RZBA 2HKKA 1KOPA 1CAJA 3SBIA 1G3ZA 1BNTA 1ZSAA 5G0BA 4QSAA 4XE1A 2NNOA 3DAZA 5FDCA 5EHEA 1FR7A 2FOVA 2X7UA 5FLOA 5J8ZA 1LGDA 5FL5A 4BF1A 3IBNA 3UYNA 1CAIA 4YX4A 2HL4A 2NMXA 4HU1A 2Q1BA 4ILXA 1FQNA 4XFWA 4Z1JA 4E3DA 3DD0A 1ZGEA 3KLDB 4KNNA 5G0CA 1V9EA 3D93A 5L3OA 5DSOA 1IF6A 5JGSB 4FIKA 4RUYA 4YHAA 2HOCA 5DSMA 3V5GA 3OILA 2VVBX 4FPTA 1LZVA 5JG5B 1T9NA 1UGGA 1CANA 5L6KA 1DCBA 3FFPX 1J9WA 1HCAA 3W6HA 3K7KA 2WEOA 5C8IA 4QK2A 3MNKA 2X7SA 1CILA 1UGAA 4MLTA 4YXIA 3M14A 4KUVA 5BRUA 4MDMA 4R59A 4YVYA 1BNQA 5DSIA 1I9OA 3DC9A 5JQTA 1EOUA 1ZSBA 4C3TA 3JXHC 4Z1NA 1YDAA 4Q07A 5E2RA 1BN1A 1RZAA 4PZHA 4QK3A 4JSZA 3V3JA 4HEYA 4FU5A 1Z97A 4WL4A 2NWOA 3DVDA 1YO2A 4E3HA 2FOUA 4Q7WA 4Q83A 3RGEA 1CVBA 1LUGA 4ZWXA 2NN1A 3NI5A 3M1JA 4TWLA 4XIXA 1OQ5A 3ML2A 2WEHA 3M2XA 4QTLA 9CA2A 3ZNCA 3UYQA 3RZ5A 3RYYA 3OYSA 5DSLA 2FNMA 4Q08A 4HEWA 4M2WA 3RZ7A 1AM6A 1XQ0A 1HECA 1CAKA 1CA3A 3DC3A 1OKNA 4ETQC 1DMXA 3U7CA 4E5QA 3C7PA 3M1WA 4E4AA 3M96A 3W6IA 1CAYA 5FNKA 4RIUA 4CACA 1Z93A 4JSAA 5DOHA 5SZ7A 3LXEA 3U3AX 2WEJA 1HEBA 4KNJA 4LU3A 1YO1A 2H15A 1RJ6A 2GD8A 4MTYA 1CIMA 1FQMA 4LP6A 5HPJA 5EOIA 4YXOA 1HCBA 4N0XB 5SZ6A 1ZFQA 1JCZA 4Q8YA 1I9MA 3S74B 3GZ0A 4X5SA 4WUPA 3S75B 3P55A 2O4ZA 1ZGFA 4ZWZA 4RH2A 1G46A 2CBCA 3ZP9A 1YO0A 1CA2A 1IF4A 4QSBA 1BNWA 3HLJA 3JXGA 1XEGA 3S77B 1UGFA 2NN7A 3SAPA 4Y0JA 3CA2A 5FNIA 3M5SA 1CAOA 3OKUA 4CNVA 4QJWA 1A42A 4KNIA 1CNHA 5DRSA 3S9TA 4RFCA 3M5TA 5FNHA 1DCAA 1HVAA 3DVBA 1IF5A 4FVNA 1FSQA 4Q8XA 3RG4A 5JESB 1I90A 4L5VA 4Q0LA 4Q06A 1BNUA 4Q87A 5CLUA 2IT4A 2OSMA 3KONA 4BCWA 5FNJA 4XIWA 3F8EA 1G52A 4E9OX 1I9PA 5EH7A 4FVOA 5A25A 1BV3A 3L14A 3MNAA 1YDDA 2F14A 3MHOA 3PO6A 4QEFA 1G0EA 3SBHA 4DZ7A 2H4NA 1BNNA 3BETA 1I91A 4ITPA 5JQ0A 2WD3A 3DD8A 3EFTA 4ZWIA 4ZWYA 1CNYA 7CA2A 1OKLA 3T5ZA 4KAPA 4XZ5A 3BL1A 3M04A 3IGPA 3HFPA 4Z1EA 1KOQA 5FL6A 2CABA 3RJ7A 5EIJA 1CINA 1CRAA 2NXTA 3Q31A 4KV0A 1HUGA 3M67A 4Q9YA 5G03A 2FW4A 1MUAA 1BN4A 3OY0A 2NNSA 3F7UA 2OSFA 5SZ5A 4YWPA 4ITOA 3U45X 4QSJA 4KP5A 4ZX0A 1OKMA 1UGEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1I9L A;  5FLR A;  2QOA A;  2AX2 A;  5FLT A;  3M1Q A;  1FQR A;  1TEQ X;  5FDI A;  1FQL A;  1CVE A;  4YYT A;  3ML5 A;  1RZC A;  5FNG A;  2GEH A;  4WR7 A;  5EKH A;  1THK A;  3V3G B;  1YDC A;  3V3H B;  3RZ0 B;  1G48 A;  1MOO A;  1TBT X;  5SZ3 A;  1URT A;  1JD0 A;  3NJ9 A;  3R17 B;  5FLS A;  1UGD A;  3EFI A;  4L5W A;  3RLD A;  1G0F A;  1CZM A;  1RAY A;  3HKQ A;  5JEH B;  1JV0 A;  3MNJ A;  4PQ7 A;  3F4X A;  4Q8Z A;  3TMJ A;  4QJM A;  1RZE A;  3RYX B;  4M2R A;  1TH9 A;  3RG3 A;  1HUH A;  3S8X A;  5DSJ A;  1G54 A;  1TTM A;  5EZT X;  1UGB A;  1G53 A;  3MHI A;  3D0N A;  5FL4 A;  4RN4 A;  2NNG A;  2NXR A;  1CNW A;  3V2M A;  2POV A;  4L5U A;  1G1D A;  5DOG A;  4LHI A;  4YGN A;  1H4N A;  1TEU X;  1I8Z A;  1H9N A;  4G0C A;  4BF6 A;  3MHM A;  1KEQ A;  1TB0 X;  1LG5 A;  3N4B A;  4YGK A;  4R5A A;  4JSS A;  4CNX A;  2CBD A;  3P44 A;  1G4O A;  2HFW A;  2NNV A;  4UOV A;  2AW1 A;  3R16 A;  4RIV A;  1FLJ A;  5E5U A;  4QJP A;  2EU3 A;  2ILI A;  3N2P A;  5EKM A;  3T5U A;  3DV7 A;  2WEG A;  3S71 B;  4RFD A;  4MDG A; 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