5DSLA

Structure of co2 released holo-form of human carbonic anhydrase ii with 10 min warming
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Tracking solvent and protein movement during CO2 release in carbonic anhydrase II crystals
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5dslA00
4MDGA 5FNKA 3DA2A 5G03A 1I90A 1RZDA 1CCTA 4M2UA 1RJ6A 4E3HA 1IF5A 2POWA 3V3JA 1TBTX 3MHLA 3KONA 3RG4A 1DMXA 1I91A 4DZ9A 2WD2A 3DC3A 1RAYA 3D8WA 1EOUA 1FSRA 4LP6A 1TG3A 4E49A 3IGPA 1HUHA 2NWZA 3B4FA 4R59A 4PXXA 4QK2A 1BN1A 1CNXA 3OILA 2POVA 5FL5A 4JSWA 4Y0JA 1UGGA 4YGNA 1AZMA 3V7XA 3MNUA 5CA2A 5JESB 4WW6A 1URTA 1AM6A 1CAIA 4RIVA 8CA2A 4YHAA 5LMDA 3TVNX 3DCWA 4CNWA 2NN7A 3BETA 3HKNA 3HFPA 3DD0A 3MDZA 3MNHA 4KUVA 1CVBA 3RYXB 5FNIA 4ZX1A 4MLXA 2F14A 4X5SA 1MOOA 2NN1A 4R5AA 1ZGFA 2HKKA 4QJPA 4MO8A 4RH2A 5FL6A 4PYYA 3CZVA 1ZGEA 5JGTB 1DCAA 5DVXA 5FNJA 5FLPA 1LG6A 4QK1A 1BV3A 1H9NA 5DSJA 4KNIA 2HD6A 3K34A 4YGFA 4RUZA 1RJ5A 4HEYA 1Z93A 1ZNCA 4RUYA 1HVAA 3T84A 5A25A 1FR4A 4YGKA 2WEGA 1CANA 3RZ7A 1YO1A 4FPTA 2VVBX 4CNVA 1CZMA 2WEHA 3N3JA 5DSQA 1ZSBA 3F7UA 1CA3A 4LU3A 5E5RA 1IF6A 3S74B 4LHIA 1CAZA 1HCBA 3P5LA 4QY3A 1KWRA 2WEOA 3R17B 5FDCA 1I9OA 2EZ7A 3S73B 5G01A 2HL4A 1CINA 3MNKA 1YDCA 3D93A 5BRVA 3DD8A 2FNNA 1FLJA 3HS4A 3IEOA 1BNMA 3JXGA 3V3IB 1KEQA 4Q78A 3DBUA 3KLDB 2X7SA 1BNVA 3IAIA 5E2KA 3SAXA 4CNXA 4Q8ZA 4FVNA 3M5TA 5J8ZA 5CLUA 4QSBA 5EIJA 2FMGA 3RJ7A 3HKQA 3ML2A 3EFTA 3F7BA 3MMFA 3CA2A 1JV0A 3M1QA 1Z97A 2POUA 3MHIA 1CRAA 4Z1JA 2FNKA 5DSRA 5EHWA 5JEPB 2W2JA 4ZWIA 2H4NA 4FRCA 4BF1A 3MYQA 1CAKA 3M96A 5FNHA 3DVCA 4PQ7A 2OSMA 4QSIA 3VBDA 1OKNA 4G0CA 3UYNA 4XE1A 4CQ0A 1F2WA 3KKXA 3P4VA 4XIWA 4YYTA 5DSPA 4FL7A 1CVCA 3U7CA 1CALA 3PO6A 3DAZA 4RUXA 4Q07A 2EU3A 3MHOA 3OKVA 5EKJA 1LZVA 3D0NA 3P3JA 5SZ6A 5SZ7A 4Q99A 2ABEA 1CAYA 4KP8A 1TEQX 3LXEA 5FL4A 4ETQC 4YXIA 1CAJA 1DMYA 2NNSA 5IPZA 1ZE8A 2FOSA 3OIKA 1UGCA 4COQA 3S76A 3IBUA 4Q87A 3M3XA 3NI5A 3M2YA 1FR7A 4L5WA 2NXSA 2CABA 4K13A 1YDAA 3MNAA 1TE3X 3U47A 1G46A 2GEHA 5A6HA 4M2VA 3L14A 1CVAA 4HEZA 3NJ9A 3RGEA 4M2RA 5EH5A 4MDMA 1ZSCA 2IT4A 4GL1X 3OIMA 1H4NA 1FQNA 3S77B 2CBCA 2FNMA 3M2NA 5AMDA 5SZ1A 4BCWA 1RZEA 3Q31A 1IF4A 1TG9A 1ZSAA 3HKUA 1KOQA 1RZCA 1XPZA 4WL4A 3MHMA 1CVHA 1KOPA 2EU2A 4G7AA 2O4ZA 5E2MA 3R16A 2NWYA 1CNHA 4KP5A 5G0CA 1Y7WA 4K0ZA 5AMLA 4MLTA 1IF9A 5JDVB 2WEJA 1CNKA 1HEDA 1G53A 4RN4A 5FNMA 3RYYA 4YWPA 1HEBA 1RZAA 4WR7A 4KNJA 3TVOX 4KV0A 1I9PA 4N16A 1I9MA 4K0TA 3KS3A 2GD8A 3IBIA 5EH7A 1CRMA 5E2SA 4QTLA 5JEGB 4QK3A 3M67A 4KNMA 4KUWA 3FE4A 4QJ0A 3RZ0B 5E28A 3GZ0A 5G0BA 5FNLA 4Q7VA 5HPJA 1UGAA 2FOQA 4FU5A 1UGBA 4IWZA 3M98A 3M1WA 3PJJA 3K2FA 5EHEA 1ZH9A 3B1BA 1V9EA 3HLJA 1G4JA 5L3OA 3F4XA 3V5GA 2HFWA 3HKTA 3M40A 4YXUA 3RZ8A 1G45A 4C3TA 3M14A 4JSAA 1CNGA 3EFIA 1RAZA 4XIXA 4HT0A 4KNNA 4RFCA 2ZNCA 2X7UA 3MNJA 4QSAA 4FVOA 1G4OA 2Q1QA 3ZNCA 4QSJA 3PYKA 5DSIA 2FW4A 3M1JA 5EKMA 3T85A 3T5UA 3OKUA 1I9NA 2CBEA 2AW1A 2CA2A 4BF6A 5DSOA 4KAPA 3S72B 1BICA 3T82A 4ITOA 5E2NA 1A42A 4L5UA 4YVYA 3M5EA 3DVDA 1CNWA 2WD3A 6CA2A 2X7TA 3N0NA 5DSKA 3RLDA 5FLRA 2NWOA 4Q83A 5FDIA 3NB5A 4Q06A 3KIGA 4PZHA 3MWOA 3RYVB 1LUGA 3S71B 1G54A 1BN4A 5SZ0A 2NWPA 1I8ZA 5BRUA 1V9IC 3MHCA 3P55A 3DCCA 2CBBA 3JXHC 4QJOA 9CA2A 1H9QA 3IBLA 1CA2A 4QIYA 4YXOA 5EKHA 1AVNA 1YDDA 1G52A 4PYXA 4E5QA 4XFWA 3M04A 4ITPA 5FLSA 4Q81A 5SZ3A 1BNNA 4Z0QA 4Q49A 1XEGA 2NNVA 1YO0A 3U45X 3P3HA 4Q8XA 1ZFQA 4Q7PA 1CVDA 1BCDA 4TWMA 3K7KA 5FLOA 3U3AX 2QP6A 4ZWYA 2QOAA 3S97A 4HU1A 3N4BA 5SZ2A 4ZWXA 2VVAX 4JS6A 3M5SA 3V3HB 3OYSA 4MTYA 3RZ1B 3KWAA 4E3FA 3S9TA 2H15A 4CA2A 4Q9YA 5L6KA 3D9ZA 1I9LA 3DV7A 5FLTA 5C8IA 3C7PA 4WUPA 5SZ4A 2CBDA 12CAA 3RZ5A 3KOKA 4TWLA 3W6HA 4JSSA 2ILIA 4UOVA 2NMXA 3V2JA 5FLQA 1G6VA 3T5ZA 5JEHB 4L5VA 3FFPX 1LG5A 1TTMA 3DC9A 1CAMA 3KNEA 2QO8A 5CJFA 2OSFA 4Q08A 5DSNA 4Z1EA 3M2ZA 3P44A 1HEAA 1HCAA 4DZ7A 4HEWA 3D92A 1IF8A 4E3DA 1CILA 1BNUA 4Z1KA 4R5BA 4ILXA 3RYJB 5JG3B 1CAHA 1DCBA 1TB0X 3DCSA 1TH9A 2NXTA 1YDBA 1LGDA 1CNJA 1THKA 4Q09A 1UGEA 3OY0A 4XZ5A 2NXRA 3KOIA 1OQ5A 1RZBA 1G0FA 5JQTA 1JCZA 1CNIA 4ZAOA 1BNTA 5EHVA 3S8XA 1FQLA 1IF7A 1I9QA 4HBAA 3BL0A 7CA2A 1CNCA 5JQ0A 3S75B 1T9NA 4QEFA 5DSLA 3S78B 1YO2A 1ZFKA 3JXFA 3V3GB 4MDLA 3T83A 4Q6EA 4ZX0A 4RIUA 2Q1BA 5E2RA 4Z1NA 1BZMA 1G1DA 3DVBA 5FNGA 5DOHA 1CNYA 1CNBA 5E5UA 4QIZA 3MZCA 5BNLA 1CVFA 5EH8A 4Q7SA 1BNWA 5AMGA 3ZP9A 5JG5B 4QJXA 5DSMA 2HOCA 2FMZA 4FIKA 4Q6DA 1UGFA 2FOYA 4KUYA 3P58A 5BYIA 1TEUX 4QJMA 3ML5A 3P5AA 1BNQA 4HF3A 4M2WA 5EOIA 1G48A 2CBAA 5SZ5A 3N2PA 4E4AA 3OYQA 4N0XB 4CACA 1CCUA 1FQMA 4ZWZA 4Q8YA 3QYKA 1HECA 1UGDA 2NNGA 2FOVA 2FOUA 1FQRA 3SBHA 4WUQA 3IBNA 1OKMA 1BN3A 4Q7WA 1OKLA 1G0EA 3MNIA 1XQ0A 4WW8A 1FSQA 1FSNA 4JSZA 3M2XA 3W6IA 3V3FA 4CNRA 4YX4A 1KWQA 2NNOA 3M1KA 5DOGA 3RG3A 3SBIA 3UYQA 3BL1A 3TMJA 5BRWA 4K0SA 1J9WA 4Q90A 4E3GA 1JD0A 1Z9YA 4HT2A 4YGJA 1CVEA 3V2MA 1G3ZA 2HNCA 4QJWA 3CYUA 5DRSA 3SAPA 1MUAA 5EZTX 1CCSA 4YGLA 1HUGA 1CIMA 4RFDA 3CAJA 4Q0LA 5CACA 3F8EA 4K1QA 5JGSB 2AX2A 1XEVA 4E9OX 3RYZA 1CAOA 3FW3A 4IDRX 2Q38A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4MDG A;  5FNK A;  3DA2 A;  5G03 A;  1I90 A;  1RZD A;  1CCT A;  4M2U A;  1RJ6 A;  4E3H A;  1IF5 A;  2POW A;  3V3J A;  1TBT X;  3MHL A;  3KON A;  3RG4 A;  1DMX A;  1I91 A;  4DZ9 A;  2WD2 A;  3DC3 A;  1RAY A;  3D8W A;  1EOU A;  1FSR A;  4LP6 A;  1TG3 A;  4E49 A;  3IGP A;  1HUH A;  2NWZ A;  3B4F A;  4R59 A;  4PXX A;  4QK2 A;  1BN1 A;  1CNX A;  3OIL A;  2POV A;  5FL5 A;  4JSW A;  4Y0J A;  1UGG A;  4YGN A;  1AZM A;  3V7X A;  3MNU A;  5CA2 A;  5JES B;  4WW6 A;  1URT A;  1AM6 A;  1CAI A;  4RIV A;  8CA2 A;  4YHA A;  5LMD A;  3TVN X;  3DCW A;  4CNW A;  2NN7 A;  3BET A;  3HKN A;  3HFP A;  3DD0 A;  3MDZ A;  3MNH A;  4KUV A;  1CVB A;  3RYX B;  5FNI A;  4ZX1 A;  4MLX A;  2F14 A;  4X5S A;  1MOO A;  2NN1 A;  4R5A A;  1ZGF A;  2HKK A;  4QJP A;  4MO8 A;  4RH2 A;  5FL6 A;  4PYY A;  3CZV A;  1ZGE A;  5JGT B;  1DCA A;  5DVX A;  5FNJ A;  5FLP A;  1LG6 A;  4QK1 A;  1BV3 A;  1H9N A;  5DSJ A;  4KNI A;  2HD6 A;  3K34 A;  4YGF A;  4RUZ A;  1RJ5 A;  4HEY A;  1Z93 A;  1ZNC A;  4RUY A;  1HVA A;  3T84 A;  5A25 A;  1FR4 A; 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