5DXXA

Crystal structure of dbr2
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
383
structure length
376
Chain Sequence
KPTLFSAYKMGKFNLSHRVVLAPMTRCRAINAIPNEALVEYYRQRSTAGGFLITEGTMISPSSAGFPHVPGIFTKEQVEGWKKVVDAAHKEGAVIFCQLWHVGRASHQVYQPGGAAPISSTSKPISKKWEILLPDATYGTYPEPRPLAANEILEVVEDYRVAAINAIEAGFDGIEIHGAHGYLLDQFMKDGINDRTDEYGGSLENRCKFILQVVQAVSAAIGTDRVGIRISPAIDHTDAMDSDPRSLGLAVIERLNKLQFKLGSLAYLHVTQPRYTADGHGQTEEEEVAQLMKTWRGAYVGTFICCGGYTRELGLQAVAQGDADLVAFGRYFVSNPDLVLRLKLNAPLNRYDRATFYTHDPVVGYTDYPSLDKGSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Artemisinic aldehyde Delta(11(13)) reductase
publication title The Crystal structure of Dbr2
rcsb
source organism Artemisia annua
total genus 139
structure length 376
sequence length 383
ec nomenclature ec 1.3.1.92: Artemisinic aldehyde Delta(11(13)) reductase.
pdb deposition date 2015-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5dxxA00
4CQAA 2G95A 2ZCGA 3GDRA 4DELA 2A7RA 3BV4A 1OF6A 2ZYFA 4RXGA 2VFIA 2A85A 3W1NA 1EB3A 5CPLA 4JY9A 3DBPA 3TROA 3PR2A 2F7FA 1H50A 3L2IA 3UWYA 3LV6A 3UZ5A 1LP6A 3O63A 3W86A 3I7SA 3SI9A 2VOMA 3G1DA 3GKFA 5A5WA 2A7PA 4G1KA 1I2QA 4RKAA 1OX6A 4FXSA 3CIWA 3GR8A 5F2GA 2V8ZA 5CSRA 1QR7A 2WPBA 1LLWA 3TXZA 1VR6A 3YPIA 5E93A 3STCA 3UPBA 3CM4A 2CLEA 2QR6A 1SO5A 1WOAA 4ZQPA 3IIOA 4X2RA 4QITA 3MHFA 1GVRA 2CLLA 3MYOA 5DXYA 4N2YA 1C9DA 4IJBA 1F73A 4AF0A 5CG7A 4JEQA 2ISSA 4PC8A 3LHUA 2V2DA 2X2GA 1BEUA 1SZNA 4WJEA 3MJYA 1JCLA 5LNRA 1P0NA 1JCJA 2DJXA 4IOTA 2YYUA 4WZHA 3E49A 5CZTA 1H51A 3LXBA 3R5EA 3T40A 3KHJA 5FEWA 3QSTA 4N9BA 4Q32A 3NXFA 5I3KA 1TPEA 3B0PA 1S5TA 1T96A 4H3DA 2FJKA 5HMSA 3GB6A 3TFXA 1X7FA 2Y63A 3KRUA 2B7PA 3I65A 3LI1A 1OX4B 3F03K 1NVMA 1EIXA 1DBTA 1VPXA 3T55A 4OU1A 3IVSA 3UD6A 3QMRA 3NQFA 1GTHA 4KFPA 4EIVA 3DU0A 5C5YA 3TJXA 3O15A 2UV8G 2A21A 4O11A 2NWSA 3G18A 3IIPA 4LV4A 5BNKA 1TV5A 1W1ZA 2FPTA 2CZEA 4K8HA 3W70A 2B0MA 1I2RA 1DJQA 1WV2A 2NX3A 2ZRXA 2QF7A 3QFEA 1QMLA 3O06A 4LV9A 4LTSA 2E77A 3W1TA 2QAPA 4D2JA 3EXTA 1FQ0A 3FA5A 4HN4A 4JR5A 4NVTA 1A50A 3W7RA 1AL7A 1WYIA 2GOUA 2TSYA 1FX6A 2OX1A 4RV8A 1KTBA 4DEFA 3L66A 4FIRA 4NJIA 3M7WA 4R53A 4DF0A 3TQVA 1F5ZA 5D30A 2ZA3A 3TDFA 5CSSA 1GG1A 3DFNA 1AMKA 1R2SA 2VFFA 1XC4A 4A29A 1JVNA 4ADSA 3UQNA 1ZAIA 3L0GA 4XZ9A 3HGOA 3KOFA 4U4MA 1VH7A 1W3TA 3ABQA 4Z08A 2VELA 2YGYA 3I6RA 2CW6A 4QM1A 2ZZ4A 1OG0A 1A5SA 3OBKA 5CGQA 4GUIA 2B7NA 1QPOA 5K7JA 3HIJA 2YFOA 4H4IA 4IPIA 4ZQOA 1SO4A 2Y62A 4MPQA 3NM1A 3DH7A 4HHPA 2VEPA 1X8FA 4QSHA 3ABOA 5E1QA 5EYWA 5KZDA 4MOZA 1LBMA 2Z6JA 1XBXA 2GVGA 3FEMA 3RLVA 2YW3A 1EUNA 1QOQA 1L2UA 3W07A 1LORA 3W7EA 4MZ8A 4M7TA 2WOQA 4ONVA 3SGZA 2QUUA 2ZRVA 2A2IA 2NWRA 4JY8A 3S1XA 3SR7A 3A5FA 4MY8A 5IBXA 3DI1A 3BG3A 2BX7A 3KRSA 3U2OA 2X16A 1VLWA 3PBWA 1TB3A 3BPWA 4RZ4A 4S2BA 4UTLA 1LOLA 3TR2A 4YCPA 1F6KA 5K3VA 3NL5A 1CI1A 1QDSA 4CNOA 3P7YA 3UYCA 1THFD 4M7SA 1SZFA 1LM1A 1TTQA 3H54A 1XDLA 2Y85A 3O16A 4PL1A 1KLZA 2CLIA 2JBMA 2V2HA 1KM3A 5G2IA 5L6UA 1XFBA 3NO5A 3BLEA 4BF9A 3ELFA 1F76A 1KA9F 1M7PA 4GFSA 2WNZA 4FNTA 3G1FA 3TQKA 3G24A 2CLHA 1H7PA 1W56A 3S42A 2ATMA 3L21A 3R8RA 3PULA 3C2RA 3M41A 3N14A 4DBDA 5C6MA 8TIMA 3W2UA 1KLYA 4MZYA 4BWLA 2CZFA 1LOSA 2GJNA 2QUVA 5H2ZA 2BSLA 1IIGA 4Y90A 2FQIA 4FNSA 3C4UA 2EAWA 3NQGA 2C1HA 3EWUA 3EX3A 2GVJA 3W9ZA 3VE7A 1KBJA 5AHNA 3EX6A 2J9YA 4S2CA 3DAQA 3FJ6A 2WNQA 4MLJA 1W37A 1VCFA 4WY0B 3TW7A 4CCCA 5K2ZA 4IMCA 4OHQA 5ABTA 1PCKA 3IRDA 2CLOA 4KKXA 3O07A 1VC4A 5AHLA 3GXPA 3TUUA 1LTDA 4IXXA 5AC8A 4IMFA 1AK5A 2Z6IA 4UNKA 4LS0A 4UMCA 1GG0A 2V30A 1LDCA 4FB7A 3W2MA 3NPWA 3LCXA 5AC7A 1JUKA 4LUJA 3W7QA 4TO8A 4AHOA 1YDNA 4X9SA 4NJHA 3TW6A 1SZGA 3TAOA 3RFAA 2O7SA 2ZA1A 3W22A 5F4WA 1GJPA 1OK6A 1K3UA 1SSDA 3STGA 1GOXA 1TPDA 2E5DA 1WXJA 2V81A 1CX9A 1XL9A 1KW1A 4XBKA 4M19A 3EKZA 4X3ZA 2Y88A 1TPVA 1GQNA 1EP2A 3GK0A 4GC4A 4E2BA 2ALDA 1DOSA 3CLMA 4DXVA 4UFMA 2EF9A 3TKFA 3WJYA 5IM51 3MI3A 1GTEA 3S1VA 2ZRZA 3W83A 3OVRA 4TU1A 2I14A 1H60A 5FEZA 2QKFA 3NNTA 3E0IA 2GPTA 1WBJA 3F4WA 3N3MA 3KAOA 1XKYA 4LWWA 1RPXA 4XQ6A 3WK1A 1OABA 1H1YA 1QNVA 2ZQ0A 5D05A 4MUZA 3PUEA 4P2VA 2XFWA 3KVLA 3KVMA 1GYLA 4E38A 1W31A 3W7CA 4CQ8A 5T26A 2QAFA 1TQXA 4O8RA 4JIQA 2W6RA 1WX0A 5G2HA 2AAMA 3BGGA 3EX1A 3V1PA 3HO8A 1EPXA 5DY3A 3W3OA 3WK3A 3L0NA 5F1VA 5AYYA 3G8RA 2QCCA 3LHTA 3WK2A 3QPZA 1HL2A 4CCDA 1SR9A 3LBCA 1XXXA 5I3FA 1YXCA 3ZWSA 3KFTA 1FDYA 4UC5A 4ZZ9A 5K9CA 3RU6A 3STFA 4O53A 3W1AA 3H55A 5FEXA 3W1LA 1GVFA 3TC7A 3CWOX 3NQEA 2VEKA 1VRDA 4DPPA 3GNDA 1HG3A 2PRMA 3BGJA 4JTSA 4DF1A 4O1CA 1T8XA 1JUBA 3TE9A 4QNWA 1KFCA 3AJXA 4JYEA 3L5MA 1SU5A 4QNEA 1PHWA 1M7OA 3L0KA 4O1DA 5HULA 4IWWA 5KINA 2DU2A 2ZRUA 1TRIA 4OV4A 1HO4A 2ZTKA 4UTTA 5D03A 5LNUA 2X1RA 3JS3A 5G4EA 4UTWC 1FWRA 4DO4A 2ZZ1A 3CWNA 2BXVA 4LVFA 4NNAA 4MJMA 4UIOA 5EMUA 3B03A 2Z1BA 1KM5A 3C2FA 3HQ1A 4O19A 5KZMA 1TMHA 2FPYA 4AHQA 2Y7DA 3EKLA 2PE4A 2J9XA 2JKEA 3NGJA 1OFBA 1ZJIA 3FYOA 4XWUA 5LGXA 5K4ZA 3HGJA 4OBTA 5FF7A 3W1PA 2IQTA 5HWMA 3QMTA 1G6CA 3GR7A 3UXAA 3EXSA 3GXTA 4FXRA 4WOZA 1NEYA 2X1SA 3EEGA 3VNDA 2WJZA 3A9IA 1JCXA 3NPUA 1LRNA 2FFCA 3UWQA 3TSMA 1D3GA 2PC4A 3ZR4A 3NQ7A 2E68A 4Y6GA 4OT7A 1YXYA 1TTPA 3QYQA 4R7JA 1KV8A 4UFKA 1L6SA 4YLWA 1FCBA 3PSVA 2A4AA 4AMAA 4LNYA 3P5YA 1O60A 3DGRA 1RZMA 4ICNA 2VXNA 2WV8A 3N19B 2PRLA 4QQ3A 1WBHA 1I45A 3GAYA 1DHPA 3S5ZA 1KTNA 4ZQMA 1EWDA 5HWNA 3P8IA 1R30A 3ABSA 5D37A 2RDWA 4FO4A 1XUUA 3LHZA 3GLCA 4O14A 1R2TA 4K7VA 4Y8FA 3INPA 3W72A 1WDWA 3KXQA 4UTUA 3MHGA 3TSBA 4XBSA 1W5QA 3W7HA 3NQDA 4O13A 3L5LA 1FWNA 2LLEA 4MVAA 4ZVJA 1JRBA 2WSRA 4NUWA 1CW2A 5A8GA 5G2WA 4ZQNA 2CFFA 3LV5A 5D04C 1NSJA 4W9TA 2Y7EA 4HNNA 1H1ZA 1I2OA 4BR1A 1KM0A 3EWYA 2HS8A 1YXDA 1DV7A 3NZ1A 1ME9A 4RCXA 3C6CA 1JR1A 1UJPA 4RJEA 4PA8A 3JRKA 1JRCA 3L67A 1UCWA 4JICA 3M44A 1ICSA 2PRHA 3I7RA 5CKSA 1TRDA 4EWND 1VYSX 3B8DA 3QMSA 1HUVA 3E12A 1PHQA 4ADUA 1OYCA 3DHFA 1IGSA 1SFJA 4KFOA 3ZWTA 2WQPA 2EHHA 4LVAA 3S5OA 4FF7A 1FUYA 2ZBTA 3A5VA 1OFEA 3NEVA 4N6FA 4JTFA 3D0CA 4UCGA 4K7YA 1TTJA 1P1XA 1S5WA 4XKYA 3W2KA 4OQVA 1AG1O 5AFDA 2VENA 3BO9A 3CEUA 1J2WA 5DN1A 3CU2A 2JKPA 1C29A 5U7SA 1H7OA 2B7QA 3TIMA 5KMYA 2QEZA 5SWUA 4RXFA 1SUXA 1VLIA 1Q6RA 3LX9A 4NX5A 1SW7A 3O1NA 1SQ7A 4TMCA 1OHLA 1SW0A 3PY2A 4FNQA 5K9XA 1F2JA 1EP3A 3TC6A 3PSWA 1KM6A 3HG4A 1Z41A 1MO0A 4RZ5A 4O0KA 5GVJA 3A23A 2Q3OA 3P8JA 2P1FA 2NXIA 4UTHA 1TV8A 3LCLA 2V9DA 4NX0A 5CPNA 3EXRA 1ICPA 1V5XA 3K30A 4LC6A 4EVZA 1J4EA 4FNRA 2J27A 3G1XA 1SW3A 2ISWA 3EWZA 2KZHA 3UWWA 1Q6OA 3B4UA 4OV9A 5BOOA 5K4XA 1JJKA 4O57A 4XUGA 2VFDA 1G4EA 1O4UA 3LXCA 1GVOA 2H90A 4HNUA 4CLMA 1IXPA 3HGSA 1Q6LA 1V7YA 1VQTA 2CWNA 5J5DA 3E96A 5HNRA 1QCWA 4UTJA 4MIMA 2V5LA 3E9AA 3C2EA 1YTEA 1H63A 4CQ9A 2O7QA 1FDZA 4AB4A 1FDJA 4FEZA 1Z48A 3W2JA 4AWUA 4IUOA 3CB8A 2E09A 4GWEA 4DQWA 4UMAA 1LRTA 1LRQA 5CPMA 5G1TA 4E2DA 4U28A 1JQXA 4ZQCA 4JTEA 3THAA 1H7XA 1LOQA 3O6YX 3QEZA 2H6RA 5CPOA 3EWXA 2E5BA 1VCGA 2YR1A 2GVLA 4CNPA 4MY1A 3N34A 4J9JA 1U83A 1KFKA 4GUFA 3MP4A 2BLEA 2XN0A 3BK0A 3M5ZA 2TMDA 2J24A 2QCDA 4M6QA 2Y7GA 3BG5A 3E02A 5D2XA 1XCFA 4L4LA 4LS1A 3LB0A 4O54A 2YCEA 2JK2A 3TQ0A 2QCMA 3LTPA 3LHWA 1IXNA 3PS7A 4LY8A 3M43A 3TU9A 1TQJA 1OFDA 3NQ8A 3T4CA 4FHAA 1FBAA 2CLMA 1LCOA 3W1XA 4GNJA 3G0XA 4UR8A 3UNDA 3CIXA 4BI6A 2E6FA 1G7VA 2WO5A 4RK8A 2FDSA 1X1ZA 3HF3A 3PBUA 4IMDA 1KTCA 3A24A 1W5PA 5C2XA 3LCIA 4B5NA 4IPJA 4BI5A 5FI8A 3QQ1A 3FKRA 1KM4A 4O17A 1K7XA 3QPYA 1PCWA 3TMLA 2TPSA 1TPUA 5D32A 3I7QA 2QCHA 3TAKA 3G8EA 1OK4A 3OG3A 4RR4A 3NQCA 2QJGA 4HNVA 1YPIA 3P62A 3SGUA 1OFQA 1I4NA 3EB2A 4N9EA 3IGUA 1W5OA 3M1ZA 3M5XA 4PH6A 2CZDA 3CT7A 4LU0A 1TJPA 5I3HA 1OFOA 1Z42A 3OVQA 2NUYA 1VYRA 4UFHA 1QOPA 3B05A 1GPWA 4NXSA 3QRHA 5D2WA 5AYXA 4KWWA 3W2LA 5HINA 3SECA 3W7GA 2C18A 4WXYA 2W79A 2J88A 1GZGA 5CZJA 2YZRA 2W0UA 4JYDA 3NYZA 2QCEA 2ZA2A 3LCHA 4YCOA 1L9WA 1ZAJA 1PL9A 1YDOA 3EX4A 4UFLA 5LHEA 2OT1A 4NT0A 3FIGA 3RMJA 2D73A 2ZZ7A 5DBTA 3C2VA 1LBFA 2XN1A 1X1OA 4AXKA 4HT3A 4NJJA 1DKWA 2HTMA 3GDMA 4AVFA 4LVDA 1DQXA 5DELA 1K7FA 3NPVA 1UUOA 3C61A 4AEOA 6ALDA 4MZ1A 3NDOA 4O12A 3S9YA 2V0TA 5K9DA 2X1TA 4C1LA 1RVGA 5LZLA 2DZPA 3DZ1A 3DFOA 1AL8A 3GDKA 4UNLA 1JQVA 1YTKA 3HPXA 3C0JA 2E1DA 4O18A 4PODA 4O52A 3WK0A 2CLFA 1P5BA 3GDTA 1JULA 4ZQRA 3G0UA 3W2NA 1ZHAA 2QCLA 4YL2A 4AF0B 3QJAA 4FX6M 5D38A 4NZFA 2Z2UA 3KRZA 1PIIA 1TPFA 2HSAA 5HR6A 3QF0A 4GE8A 3A22A 3W7PA 1OX4A 4Z0SA 1ML1A 3SFKA 3IIZA 3LCFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CQA A;  5FCZ A;  2BP1 A;  1US0 A;  3L4V A;  4INF A;  3VNZ A;  3F7J A;  4PCS A;  2BGS A;  3VNJ A;  1PXG A;  4F8X A;  1BHG A;  1D3C A;  1F4A A;  3VIK A;  3PR2 A;  3L2I A;  3LV6 A;  4KWU A;  1S5M A;  3MDU A;  3I7S A;  4BQ5 A;  4ZSU A;  1NY1 A;  3EDK A;  5A5W A;  4JQA A;  1I2Q A;  1V3J A;  1E0X A;  4FXS A;  5F2G A;  1QR7 A;  4H9M A;  4BA0 A;  4HZ7 A;  5CLT A;  3VIG A;  3WQ8 A;  3CM4 A;  4I9J A;  2D2O A;  4F9D A;  1XRT A;  1C9W A;  1J0H A;  1SO5 A;  1XIJ A;  4ZQP A;  2QV5 A;  2NQZ A;  1GVR A;  2CLL A;  5DXY A;  4IJB A;  1JXJ A;  1FWC C;  4GI8 A;  1B1Y A;  4GGB A;  1QK0 A;  4YS1 A;  4AIE A;  4J3T A;  2QPS A;  1SZN A;  5LNR A;  1GKP A;  2DJX A;  5CZT A;  3ITX A;  4JHZ A;  5DML A;  4AIU A;  1M04 A;  4N9B A;  4TTU A;  2OOD A;  2OR2 A;  1IWP A;  1T96 A;  4A8I A;  3GB6 A;  4U10 A;  1UA3 A;  1HP4 A;  4MWA C;  2YJQ A;  1RVK A;  1X6N A;  2XZ9 A;  1U1H A;  3MSY A;  4QLJ A;  2PD9 A;  4JTQ A;  5CJN A;  4HHL A;  2I7G A;  4AZI A;  3LSC A;  4QE1 A;  1GTH A;  3N2B A;  1N82 A;  1YMY A;  2NW0 A;  3ZR5 A;  3TOY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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