5DY3A

Crystal structure of dbr2
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
379
structure length
374
Chain Sequence
KPTLFSAYKMGKFNLSHRVVLAPLTRCRAINAIPNEALVEYYRQRSTAGGFLITEGTMISPSSAGFPHVPGIFTKEQVEGWKKVVDAAHKEGAVIFCQLWHVGRASHQVYQPGGAAPISSTSKPISKKWEILLPDATYGTYPEPRPLAANEILEVVEDYRVAAINAIEAGFDGIEIHGAHGYLLDQFMKDGINDRTDEYGGSLENRCKFILQVVQAVSAAIGTDRVGIRISPAIDHTDAMDSDPRSLGLAVIERLNKLQFKLGSRLAYLHVTQPRYTADGHGQTGSEEEVAQLMKTWRGAYVGTFICCGGYTRELGLQAVAQGDADLVAFGRYFVSNPDLVLRLKLNAPLNRYDRATFYTHDPVVGYTDYPSLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Artemisinic aldehyde Delta(11(13)) reductase
publication title The Crystal structure of Dbr2
rcsb
source organism Artemisia annua
total genus 140
structure length 374
sequence length 379
ec nomenclature ec 1.3.1.92: Artemisinic aldehyde Delta(11(13)) reductase.
pdb deposition date 2015-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5dy3A00
1KTNA 1C29A 1ZNNA 5K4ZA 1WBJA 3ANYA 3GZ3A 3G3MA 2X1UA 1KM2A 1SSDA 3N34A 2TPSA 1NSJA 1Z48A 2B7PA 4XTDA 3LHTA 1HTIA 3M9YA 2GQ8A 1LOLA 5MHBA 2Y7GA 1SQ7A 5HWJA 5HR6A 3DFTA 1KA9F 3W1PA 3GDKA 4FNTA 4S1FA 3L5AA 1DKWA 1PIIA 4OBTA 3WK0A 3QQ1A 4AWSA 1C8VA 1JJKA 4LVGA 1N7KA 1HL2A 3NQ7A 1I2PA 2YW3A 3QM3A 1MEIA 3MBFA 3LB0A 4N9DA 3SZ8A 3CWNA 4Z0JA 1ZFJA 3ABRA 4IX0A 2QAFA 3IIZA 2Y7DA 2WOQA 3INPA 2DZPA 1QOPA 1WXJA 3NM3A 1LBFA 4XZ9A 4TU1A 2PURA 3W1AA 3SIZA 2ZZ3A 3O6DA 1P4CA 5E93A 4XBKA 3T4CA 4DQWA 1MEWA 2XN1A 4RX0A 3DFSA 5D03A 3H53A 3W2LA 4NJJA 2GQAA 3MHUA 1G7VA 4RXGA 4K39A 4UFKA 2NWRA 2NWSA 3KRUA 1TTPA 4LV4A 3A5VA 1FUYA 5LNVA 3THQA 2BZNA 4O14A 2R91A 3BGJA 5F2GA 1OFQA 2VELA 4AMAA 3LI0A 3BO9A 3HGOA 2FB3A 3STFA 1XBXA 2ABAA 2E6DA 3T44A 1KM4A 4AWUA 1FDZA 4JIPA 1HO4A 3G8EA 3TK7A 3T40A 2CLIA 1EUAA 4CLMA 4HN4A 2VC6A 1JUEA 3LRKA 1JR1A 3O6CA 2RDWA 1K3UA 5K9CA 3IVTA 1HUVA 1GTEA 3NQDA 1K7FA 2QUTA 3C56A 2V9DA 1SUXA 5CPMA 1FXPA 3G1DA 2YGYA 4JXCA 2YFNA 4WD0A 3C2VA 4QITA 1B4EA 1EA0A 2H8XA 3E02A 3SW6A 3G1HA 3FS2A 5BMWA 3P5ZA 3QF0A 4L4LA 3MHFA 3FFSA 3IIPA 4WOZA 4KFPA 1FWTA 1UB3A 2CZ5A 1JCLA 3ZS4A 3C0JA 3DFNA 4M7SA 1PS9A 1BTMA 1PHWA 1KFJA 4FHAA 4P61A 1XBYA 3GYEA 2ABBA 3N14A 3PAJA 3SJ3A 4UTWC 2DZXA 3M5VA 3OA3A 1TB3A 3NNTA 4UR8A 5KTLA 1L6WA 3W76A 3TW7A 3G1AA 1Q45A 4AXKA 2DZUA 3HOJA 4DEFA 4LU0A 3GDMA 2I9EA 3G0UA 2QKFA 2QCHA 3T55A 3HG2A 3DENA 4O11A 3LHVA 2F84A 2NX9A 3LBMA 4ZQPA 3W7JA 3U2OA 3NA8A 1R46A 3V1PA 2WNQA 5CZ0A 3GR7A 3OBKA 3W87A 3A22A 4O28A 3RF9A 4JX4A 3O8AA 2X2GA 3W70A 4YLWA 2Y6ZA 4HSOA 1SO6A 4JTLA 5KZMA 4AHQA 2VENA 3GXNA 2QCCA 4OGZA 4UFIA 2A85A 1KM5A 3W73A 1TV5A 1DQXA 3NQEA 3O06A 4O0KA 5K3VA 3GK0A 1WYIA 1IXPA 1X1ZA 5LNRA 4LUJA 3BGGA 2PCQA 2C0AA 3IGSA 1TSIA 1BKSA 3MW7A 1O95A 1TPUA 4O8RA 1SPQA 3VE9A 4K38A 2I14A 3DXIA 1IXOA 3AJXA 4MY8A 5AHNA 1H60A 4KFNA 2ZFAA 4M7TA 3TCEA 3MI6A 4BK9A 4JDBA 4UFMA 2DZTA 2G97A 3DKLA 5LKYA 1YXDA 5CPOA 4NX5A 4UC5A 3NZRA 1SO4A 5D2WA 3QW4B 3N3MA 2ZZ5A 3EWXA 2I1OA 4N4QA 4JTHA 1G4PA 1LLZA 4BI7A 3BLIA 1VPXA 3NYZA 5D37A 3WJXA 3DZ1A 1A5AA 2JKPA 1PV8A 1WV2A 4ZQRA 3CIXA 4RJEA 3MP5A 2VFGA 3G18A 3M44A 4HKPA 3A5FA 3LHZA 1QAPA 5AC8A 4M6PA 2WQPA 4MZYA 3BG9A 3GXPA 3ZWTA 2H3DA 5D33A 2C13A 2TMDA 3S1WA 4IMEA 3HGJA 4RXFA 3KX6A 3M43A 4DPPA 1S5VA 3DHDA 2A7PA 1V5XA 3EX4A 2V81A 2WSYA 3M5ZA 4PCFA 4W9TA 2VFFA 5J5DA 1WOBA 1M7OA 4A21A 1TJRA 2NX3A 5EPDA 3A21A 3S42A 3LHWA 2A21A 1SZNA 2HSAA 4BI6A 1VHNA 4MIMA 4UTIA 3LM7A 3PR2A 3W2MA 5KSWA 4K8HA 1ADOA 5LGXA 1TPC1 1G69A 4NT0A 1W56A 1H50A 1JUKA 1I2NA 1W5QA 2ZZ4A 3G22A 1LP6A 3BG5A 3S9YA 4O16A 5BNKA 1YDVA 4O1CA 3NEVA 5G2IA 4PODA 2FQIA 5FEXA 4YL2A 4E38A 3GNNA 3NQVA 2CZDA 3LCGA 5LZLA 5DBTA 2YR1A 2VFIA 3TSBA 3Q94A 3CU2A 1KLYA 1EPXA 3IGUA 5HULA 1OK4A 4EIVA 3E12A 3LRMA 4TX9A 4JN6A 4NUWA 2XFWA 3BLFA 5K9DA 1T99A 3SECA 4NNCA 3BW4A 4TMCA 1GVQA 3YPIA 3EWBX 3MYOA 1GPWA 1TPFA 3ZR4A 2C16A 1W5MA 3HG5A 5TBOA 4JD4A 5DN1A 3E49A 4DO6A 1G7UA 2QF7A 4R7JA 3IIVA 3KFTA 3UWVA 3W1NA 2FFCA 1OX5A 4LVAA 3KVJA 4UTHA 2QCLA 1GEQA 1RQEA 2QDGA 5A5WA 1F76A 1EB3A 1M7PA 1UUMA 3W9ZA 5EYWA 1H7PA 3E96A 2ALDA 1W5NA 3TSMA 3M47A 4CQ9A 3SSJA 5TIMA 3SR7A 3GDTA 3DU0A 1VGAA 2C19A 3BLEA 1PCKA 3QMSA 2E5CA 4C1LA 1K02A 5DLCA 1T96A 1YPIA 4NJIA 4UTJA 1VCVA 1O94A 3P62A 4AHPA 3DFQA 4NNAA 5CG7A 1ICPA 4GE8A 4NX0A 4IPIA 1AMKA 3W7DA 4S2BA 2H8ZA 4JDYA 4K37A 2V2HA 3S5OA 4QM1A 1AG1O 4DO5A 3R13A 1PL9A 1S3HA 2DP3A 5D04C 1VZWA 1JUBA 3VFLA 5HMSA 3QZEA 1QO2A 1TPWA 3EKZA 2PRMA 4ZQOA 1VR6A 4XBSA 3KXQA 5T26A 5LHFA 2NUYA 2GPTA 4YMZA 3STGA 2X1RA 3LHYA 5GVJA 1GJPA 2Q3RA 2BXVA 4IJBA 4ZZ9A 4O1DA 1LM1A 1ZCOA 5KZEA 4IOTA 4FIQA 4CNOA 1A5BA 2X1SA 3QYQA 1QPQA 2Y85A 4J9JA 2YDAA 4O1BA 1BWKA 1G4TA 5KMYA 4O1AA 1GVRA 3ATZA 1VLIA 1O4UA 1OX4B 1XKYA 3HBLA 1IXNA 3UY8A 2JGQA 3ZWSA 2HMCA 4WXZA 1OF8A 1MSSA 1B3OA 3GAYA 3I68A 2CLEA 2NV2A 2KZHA 3MO7A 3SGUA 1P1XA 4LV9A 4UMCA 1B57A 3QW3A 3B0VC 2ISWA 4PC8A 3GXTA 3B8DA 3W23A 3C4UA 2XN0A 3UQNA 1FWWA 1NF7A 4N9CA 3FA5A 1RVGA 4AAJA 3QSRA 2B0MA 1OYAA 4HPXA 1K8YA 3HGSA 3PSWA 1LOSA 4JS3A 2O7SA 2NXGA 3UZ5A 2J9YA 4HPJA 4LOCA 2RHGA 5C55A 1F74A 2OT1A 1OFDA 3BPWA 5KZDA 4EVZA 3EXSA 2QCDB 4M6VA 5H2ZA 4RZ4A 1NVMA 2TSYA 3DGRA 3CC1A 4MZ8A 1W5OA 3JS3A 5KINA 4JX5A 3QPYA 4N4PA 4KWWA 3GKFA 1OX6A 1OFAA 4FXRA 1F2JA 3W85A 3B0PA 1KM3A 1ME9A 3W1QA 4AEOA 1IXQA 1TPVA 3STCA 1SO5A 3W1XA 1Q6RA 4O53A 1XL9A 4JIQA 1QNVA 1RV8A 4H4IA 3NQAA 4LRTA 4MY9A 4IXHA 1H7RA 3W7CA 4HIBA 3WK2A 2QCGA 4UTTA 1IIGA 2W0UA 2H3BA 2Q3OA 3G24A 3KRSA 3UWWA 3CTLA 3QQ0A 2V0TA 3C3NA 1ZAHA 5U4NA 4DF0A 1VLWA 3W1TA 1KFEA 2GOUA 4OV9A 4N6FA 3WFAA 3W7NA 4A3UA 3FJLA 1H7NA 3M0ZA 1KTBA 2FDSA 3O16A 1WOAA 5DCBA 3LCWA 1Q3NA 1GG0A 2TRSA 5F2IA 3M6YA 1OX4A 3TNOA 2VEMA 3IIXA 2YFOA 5K4XA 4HNNA 3BK0A 1SW3A 1X1OA 2G95A 2V5LA 2VFEA 3PBVA 3LHUA 1F5ZA 3HPZA 2Y62A 5AC6A 1XCFA 1KBJA 2QCMA 3SY5A 1OFRA 2DZVA 1XDMA 3G1SA 3LDVA 1MEHA 3NL5A 5AYYA 2J88A 2Z2UA 3EWWA 1LRQA 3CIWA 4O4WA 4CQAA 2Q8ZA 4RZ5A 1YTKA 3NVTA 3P82A 5J5RA 1Z44A 3SFKA 3UXDA 2FB2A 4N6EA 4A29A 3A9IA 2A6NA 3GR8A 3RMJA 1GVFA 2QJGA 5IBXC 4MVAA 3OVPA 3I7SA 3B06A 1OFPA 5LSMA 3B0UX 4FX6M 3OVRA 3NQ8A 5L9FA 1TRIA 2ZZ6A 3M7WA 3THAA 4CNPA 4CNNA 3PG8A 2Y89A 3GAKA 2PRLA 3LERA 3I65A 1A53A 5D2YA 3SI9A 4B5NA 4UUIA 1H63A 3L5LA 4LC6A 2NXIA 2RFGA 3TDFA 1AW5A 3OHIA 3O15A 4A2RA 2P0OA 2C1HA 4OU1A 3S1UA 1FWRA 4EF9A 3L9CA 4Q32A 2CZEA 5AHMA 4LUIA 3GX9A 2VXNA 1J2WA 2F7FA 3BG3A 5K2ZA 5F1VA 4Z1DA 3S1XA 1W3TA 4JTKA 1GT8A 4UMAA 4XUGA 4PL1A 4MYAA 5CSSA 4NVTA 3TMQA 1R2TA 4O18A 5FF4A 3W7QA 3WJZA 3NGJA 3WJSA 3PWAA 3MBDA 2G96A 3M41A 3G3DA 5AHFA 2QJIA 3NG3A 2OT0A 2DORA 4HSNA 1QWGA 4GUHA 3W7OA 3G1FA 3MI3A 2OCZA 1QO5A 4KFOA 3QMRA 3HG3A 3IEBA 3UXAA 4DBDA 3UPWA 1HO1A 1WQ5A 3MUXA 4IMGA 4OV4A 3IIOA 3VNDA 3LCLA 3STEA 2B7OA 2A4AA 3NQFA 2W79A 2ZZ7A 5D2TA 2C18A 3TW6A 3CLMA 2R8WA 5H91A 3DFOA 3WK3A 3LGEA 4N9EA 2A2IA 3N9RA 4GNJA 1UBSA 2B4GA 2RDUA 4RR4A 3R5EA 4JICA 4NQ1A 2HS6A 1ZHAA 1VQTA 2V82A 2PE4A 5FEPA 2EHHA 3QEZA 1LBLA 1EWDA 1O5XA 1L9WA 3PBUA 2CLFA 4UFHA 4WXYA 3LXCA 4AHOA 4HNVA 2WNNA 3LLFA 4FNUA 1VHCA 1TTIA 4JNMA 3TIMA 3P80A 3UWYA 5LGZA 2H90A 1EP1A 3FYPA 2BLEA 3PUEA 4OE7A 1FWNA 1KM1A 2OMAA 2ISSA 2GVJA 4JTJA 5CSRA 3C2EA 2QCFA 2NLIA 4GRSA 3LLDA 3Q37A 1J5TA 3B03A 3W1UA 2JKAA 1W3IA 1X7FA 3WJWA 2BSLA 3WJYA 3R12A 4O50A 4PEKA 4U28A 4EOUA 2ZQ0A 3I7RA 4MFEA 3RLUA 2RKXA 4MLJA 4A2SA 1Z42A 4PH6A 3MI2A 1I8JA 1GTHA 4NZJA 3RLVA 1FXQA 4UCGA 2YYTA 1V7YA 3E9AA 3NQMA 4NJGA 2H6RA 1SZGA 3B04A 2ZA1A 1K7XA 1FDYA 3DI0A 1QPOA 2CFFA 1RR2A 1TYGA 3PUOA 2ATMA 1Q6LA 3N19B 1UUOA 4GUJA 1BEUA 3DBPA 2DZSA 3UZJA 1FCVA 3G1YA 3LCHA 2Z6JA 5DXXA 3ABOA 3W86A 1D3HA 3W74A 3IGXA 4IMFA 2QCEA 4LVFA 1VYPX 2IQTA 3O6YX 3KVKA 4JEQA 3EWYA 3PVFA 2PC4A 3TROA 2Z6IA 4OQVA 1U5JA 3CT7A 3F03K 5KITA 2WJZA 3QC3A 4WJEA 3LTYA 4L4MA 2ZA3A 1JCYA 4GUIA 3D0CA 3CHVA 1KLZA 4LW7A 4TR9A 4IQLA 4DBEA 3MP4A 5CKSA 5F4SA 1VH7A 3LV5A 1K8ZA 3TAKA 1M6JA 3GDRA 3M1ZA 3DKJA 4M6QA 3PBWA 2ZCGA 4O0ZA 3MHGA 1H1ZA 3I6RA 4WY0F 3S5ZA 5BOOA 4JYDA 2C14A 2GJNA 2A5HA 1A50A 2WO5A 2QEZA 3G0SA 4FO4A 3FLUA 2J6XA 3TQVA 3W2KA 5FF3A 4POCA 1DV7A 3RFAA 4UFJA 1HFBA 1ME8A 3W1MA 2NXHA 2CWNA 2FIQA 4ICNA 1X8FA 3NQ2A 3NDOA 1DL3A 1K7EA 2VEIA 4JGDA 1X6UA 5EL1A 2E1DA 1JCMP 2ZRZA 1ZALA 4RK8A 1JRCA 3M5YA 3CB8A 1H61A 4LWWA 2QJHA 2GQ9A 5AHLA 5CPLA 3N73A 4ALDA 1W31A 3T78A 4ADUA 4QNWA 3PY2A 3RK8A 1SZEA 1SU5A 1TREA 1QR7A 4UTMA 1LORA 1H62A 4KKXA 3G8RA 4WY0B 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1KTN A;  1ZNN A;  1WBJ A;  1TX0 A;  1FKX A;  2J7B A;  2X1U A;  4ZR8 A;  2TPS A;  4MMW A;  1VD6 A;  2ACU A;  1V77 A;  1LOL A;  5MHB A;  2Y7G A;  1HKK A;  5HR6 A;  4D71 A;  1JFH A;  3SRF A;  1UC5 A;  5D9N A;  3L5A A;  1DKW A;  1UWU A;  3WEM A;  3UF9 A;  1C8V A;  1JJK A;  3Q67 A;  1HL2 A;  3NQ7 A;  1I2P A;  1MEI A;  3MBF A;  2YBT A;  4R9X A;  3SZ8 A;  3ZT6 A;  1P0E A;  4Z0J A;  2YBU A;  4IFO A;  2QAF A;  3DEQ A;  3PUG A;  3IIZ A;  4LYP A;  1LBF A;  1IE7 C;  5E93 A;  3T4C A;  1BXB A;  2XN1 A;  5D03 A;  1JZ5 A;  1MRA A;  3H53 A;  3ANV A;  1RJP A;  3WQG A;  3ZXW A;  3MHU A;  2E9B A;  1QVB A;  3KRU A;  1TTP A;  1O7A A;  2YKK A;  4GZI A;  3V0U A;  3R0K A;  4Z2H A;  1HVQ A;  5F2G A;  4AMA A;  3HGO A;  4TX6 A;  1QHP A;  2VVS A;  3T44 A;  1KM4 A;  4A8L A;  1HO4 A;  3TK7 A;  1M7J A;  2FZN A;  2NQ9 A;  2CLI A;  1EUA A;  2VC6 A;  2XIB A;  2PWV A;  1CEO A;  3O6C A;  2WMF A;  5JH1 A;  3NZP A;  1HUV A;  1XLG A;  2V9D A;  2D2O A;  3T2Q A;  3VDA A;  4WD0 A;  1RAK A;  4AX7 A;  3S2C A;  2Q01 A;  2W27 A;  3G1H A; 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