5E93A

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with neq0071
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title Exploring Trypanosoma cruzi Dihydroorotate Dehydrogenase Active Site Plasticity for the Discovery of Potent and Selective Inhibitors with Trypanocidal Activity
rcsb
source organism Trypanosoma cruzi strain cl brener
total genus 110
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2015-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 5e93A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5e93A01
1GVOA 1H61A 4JY9A 8TIMA 3W2KA 3L9CA 2NX3A 3HGSA 1JUEA 3PF3A 4DF0A 3LCFA 4WY0B 1MEHA 2ISSA 2FB3A 3NQAA 4XUGA 1TMHA 4UFJA 3IGSA 1DL3A 3EX3A 3IIVA 4E2DA 3KVJA 1KTNA 3CWOX 1VRDA 3PVFA 4N9EA 5LNRA 1KM5A 3BPWA 3WJXA 1M7OA 4RKAA 1QPQA 2G95A 5C2XA 5SWUA 2CLHA 3N19B 1KFJA 1X7FA 3NQFA 5DBUA 5FF2A 4ZL1A 3I68A 3HB9A 3W7CA 1JUBA 1D3HA 1FDZA 2CLFA 5KSWA 3ABSA 1W1ZA 3INPA 1I8JA 2GJLA 1TV7A 3W7OA 3HPXA 3NPUA 3OEXA 4MFEA 3S5YA 3KFTA 1J5TA 1OX4B 1PV8A 1XUUA 1SFJA 2ZYFA 1A5CA 5HMSA 3V75A 5AC6A 1JCJA 4ZQOA 3HQ1A 3GIYA 3NQDA 1GVFA 3STFA 3BG5A 3TX9A 4HKPA 3P67A 2HS8A 3EXTA 4M5PA 2E77A 2CW6A 4MZ8A 4ZQCA 2WQPA 4CLMA 4C1KA 4R53A 4MUZA 1F76A 3NDOA 3GDKA 1T99A 2OZ0A 1PE1A 4JS3A 3LCLA 5F1VA 3W73A 1DKWA 1QPNA 2DU2A 1Q3NA 2YR1A 1ZY9A 5U4NA 1LZOA 3W7JA 5AC7A 5K9DA 3LI0A 4GBUA 4JN6A 4O28A 3NQ6A 1KTBA 4YLWA 3B4UA 1WXJA 3G1YA 1I2PA 3G0XA 3IIXA 4LV4A 1A5BA 2RDTA 3TJLA 3NPWA 4O19A 4KFNA 4P2VA 1KM6A 3T7VA 4GUGA 3TMLA 3GDLA 4LUIA 5CSRA 1SO6A 1GT8A 4FXRA 1OFDA 3ATZA 1PCWA 1QPRA 3C4UA 4FNUA 5AN7A 2OJPA 1P1XA 3NG3A 3I7QA 5CZJA 3WK1A 2V9DA 4XTIA 4ZQPA 2OX1A 1TIMA 4N4QA 1VCFA 1VHNA 5LNWA 2E1DA 1O94A 1GYLA 5IBXA 1VLWA 3ABRA 1XKYA 1LBFA 1VZWA 3G22A 5C54A 4L4LA 1WDWA 1DQXA 3P5YA 4POCA 5GVJA 3B04A 4AHOA 3BLIA 1GVSA 2E5BA 1IIHA 2CFFA 3FA5A 4OBTA 4RZ6A 2ZZ2A 4NNCA 1VH7A 4AWUA 3W74A 3MI6A 4NX5A 3VKJA 1JCLA 3VCRA 2ZZ1A 3HMJG 2QCLA 3OVQA 4N9BA 3C0JA 4UXDA 5DLCA 4N4PA 2FTPA 3MP3A 4O14A 4O0ZA 2ZFAA 3O15A 2CZDA 1QO5A 3VE9A 1PS9A 1V7YA 2WSRA 4UFIA 1LROA 3W1XA 4NZFA 5EKYA 4GJ1A 1EUAA 2D73A 3QW3A 5FEXA 4OE7A 2CU0A 1M7PA 4M7SA 2FPVA 3CIXA 1KM0A 4NUWA 5HWMA 1OK4A 1X8FA 5LGZA 3ANYA 4TMCA 1GWJA 3LI1A 4ADSA 2VFGA 3N34A 1SO4A 5LZLA 1I2OA 5AHFA 3F1QA 3MBFA 2YZRA 1RZMA 4ORMA 2A2IA 1W3TA 3IIPA 4HIBA 4YWIA 2X30A 5I3GA 4TX9A 5DY3A 2FDSA 2CLKA 1VYSX 4FHAA 4EIVA 1Q45A 5CPOA 3BW2A 3M41A 5EY5A 3L5LA 1XBVA 1TV8A 2E5CA 3L66A 5D2YA 1F6PA 3GYEA 1LLWA 5F2LA 3UWWA 1VYPX 4Y8FA 3IIOA 4YL2A 1LRNA 4A29A 5G2IA 3I7RA 3LHZA 4L4MA 3YPIA 3EX2A 3PSWA 5K4XA 2Q8LA 1K03A 1N55A 5D2WA 1D9EA 5MHBA 2CZFA 2Z0IA 5DCDA 1FWWA 4N6EA 3W7QA 3NXFA 3ZS4A 2ZRVA 3QRHA 3W1UA 4UTKA 1EPXA 5DN1A 1G4SA 1OG0A 1B3OA 3NVTA 2WSQA 2ZRXA 3A21A 5C55A 2W0UA 2WJZA 1RQBA 3W7NA 3O6CA 4JGDA 1IIGA 2YFOA 3W7IA 5K9CA 3FEMA 4S1FA 1JCYA 1GPWA 2QCFA 3ELFA 1QDSA 4FIQA 5AYYA 1KLZA 2FB2A 1K7FA 3L0NA 2Y63A 4GE8A 4BI7A 3A24A 1AL7A 4JTEA 1OX5A 1CI1A 1MXSA 4NT0A 4JIQA 1VHCA 4M6QA 5L6UA 4DO5A 3LB0A 4XKYA 2V30A 5LKYA 1UB3A 4U28A 3CHVA 4JDYA 2A4AA 1EIXA 3N2MA 5G4WA 3FKRA 3NPXA 3T78A 3G1AA 5C5YA 3P81A 5I3FA 4DPPA 4JYDA 4LWWA 4DBDA 4LS0A 5U7SA 3SGUA 4HSNA 4GC4A 2Z6IA 4YMZA 2B7NA 2QR6A 3B05A 3FYPA 4WD0A 1TSIA 3A23A 2ZRYA 3F03K 4IXHA 2I14A 1EEPA 4GUJA 1ZFJA 2RFGA 5EMUA 5C6MA 1QOQA 5BMXA 3H55A 4HNVA 3UPBA 1GTEA 3MI2A 2VEIA 1X1OA 1YXYA 2YYUA 1TRIA 1ZJIA 3TSDA 5HWNA 1VS1A 4MJMA 5HQEA 4B5NA 1TPVA 5KITA 1LRTA 1TPB1 4EF8A 1PHWA 1G7UA 4FB7A 2GQ8A 1LRQA 3HPSA 2GJNA 1QAPA 5F1UA 3R89A 3PS7A 3KVLA 1OFEA 2ZTJA 1LP6A 1SPQA 3BG9A 2W6RA 3S6DA 3HBLA 2VEMA 2EHHA 2OT1A 3U6WA 1KA9F 3WJYA 3KOFA 3KVKA 1HG3A 4ZQNA 3CM4A 4ZVJA 1FCVA 1H7OA 3KRZA 3W87A 1W5PA 4ADTA 3GX9A 4FIRA 4O16A 1AMKA 2YFNA 3TDFA 1DORA 1TO3A 2WNNA 3N9RA 3L21A 1ML1A 3M47A 2CZ5A 1O4UA 4MOZA 2BSLA 2BZNA 1FBAA 2E6FA 4AEOA 3R5EA 5FF7A 2KZHA 5A8GA 3W9ZA 1YTEA 3STCA 5LHEA 1TJRA 4O18A 1LLZA 1EX5A 2JGQA 1VC4A 2ZZ6A 2DJXA 1OFOA 4JX4A 2TYSA 2WV8A 4Y9AA 1KM4A 5D38A 3NL3A 3W7LA 3LRKA 2ZA2A 2QCGA 4WUIA 1W3NA 2X16A 3L65A 2CLEA 1KV5A 3OHIA 1YXDA 2QUVA 3M7WA 1XFBA 3LHYA 4JY8A 1YDNA 3SR7A 4PCFA 3PG8A 5J5RA 1L9WA 1S5WA 4M19A 3DU0A 5AFDA 3GAKA 2ZZ4A 4X3ZA 5DBTA 1IXPA 1Q6RA 2R94A 3DH7A 1TPDA 4IMCA 2XFWA 3G1XA 1F73A 3TFCA 3NL2A 1KBJA 5IBXC 4XWUA 2CLLA 3DFNA 2ZTKA 5E0KA 2VEKA 4Z1DA 3W7DA 3CIWA 3PB0A 4LVDA 2Q3RA 1TTJA 2Y62A 3IEBA 3WJWA 3DBPA 1OVDA 3MBDA 3P8JA 4R34A 3A5VA 4MY9A 2YW4A 2QUUA 1THFD 2NV2A 3TFXA 4NJGA 3EWXA 3QM3A 3P82A 4WOZA 3L5AA 4UTUA 1VJIA 5F2IA 3UXDA 2E6DA 3RK8A 3OG3A 1K02A 4JTFA 4O1AA 3LXAA 4WJEA 4AHQA 3BV4A 2FPTA 5T26A 1OFBA 3G1HA 3NQ7A 3NQCA 1PCKA 1OX6A 3MHFA 3VI2A 3P74A 2Y7EA 3GNDA 2V2HA 2A7RA 4MY8A 3D0CA 3S5NA 1OHLA 2BWGA 1EP3A 1W0MA 3PBUA 4FO4A 4MYXA 5AHLA 3P61A 3LM7A 3LBCA 3GAYA 4I7VA 3S0CA 3TV8A 4JIPA 3KAOA 4UFHA 3GXNA 5HINA 1OABA 4UMAA 1RR2A 5E1QA 3W7KA 2V0TA 1V5XA 3G0SA 3W85A 4S2BA 1VLIA 1G4PA 5AHNA 1H5YA 2Z2UA 2ISWA 3TA6A 2QCDA 1GVQA 3LCHA 2CZEA 2B7OA 1ZENA 2GQ9A 1WA3A 3NO5A 4IXXA 4CQ9A 3O16A 5DY2A 3H54A 5BOOA 4R7JA 4JEQA 2GPTA 3HGRA 4K6AA 3UD6A 2WNQA 4BI5A 3JS3A 3ABQA 3QSRA 1NFBA 1C8VA 3TW6A 4UUIA 1PVNA 2YYTA 2C1HA 4MZ1A 4DO6A 3MO7A 2W79A 2E68A 3C8FA 3TQKA 2DZSA 2ZA1A 3HPZA 1FY6A 4OT7A 5KTLA 3R13A 2A0NA 2PRLA 3NL6A 3G0UA 2YX0A 2NV1A 1H63A 1IXQA 2QEZA 3C2RA 4JX6A 3SJ3A 3QYQA 1R2SA 1LOQA 3NEVA 3LHUA 4H4IA 3GLCA 3BO9A 2WSYA 4O0KA 3C2OA 1SUXA 4Q33A 5FF3A 1S5VA 5CZ0A 3LCXA 3PULA 5ABTA 1Z48A 1G67A 2AAMA 4QNWA 3VFLA 1UUOA 2HS6A 3PBYA 4EOUA 4WXZA 1ME7A 3UWZA 5CZSA 2A85A 4GWEA 4JTJA 3TU9A 3L5MA 3NYZA 3PSVA 2VOMA 2IQTA 4HN4A 3EX4A 5CGQA 3HIJA 2B4GA 4AMAA 2OT0A 4GNJA 3M5YA 2Y70A 4CCDA 1KFLA 4NX0A 1LBMA 2ZCGA 1ME9A 3S1WA 1TV5A 3GKFA 2A1YA 5FEPA 1KFEA 1DHPA 1H7RA 2HSAA 2TPSA 3DI0A 2ZDRA 4MLJA 1KBIA 3QSTA 1IXNA 5K4ZA 4UC5A 3DFQA 1XBYA 3W2JA 1FWSA 3PG9A 4N02A 4D2JA 4AVFA 1D3GA 1CX9A 3BK0A 4QISA 1XUZA 2QF7A 3N2XA 2GOUA 4HNTA 3TROA 1ZCOA 1J4EA 1XBXA 4KFPA 3K30A 1H62A 3TCEA 4FX6M 3DFPA 3LRLA 4K7VA 2WNZA 4N9DA 2RDWA 2RH9A 2EPHA 3P8IA 4GUFA 3UY7A 3Q2DA 2A7PA 4K7YA 4UNKA 4IMFA 2V2CA 3MUXA 3KX6A 3W86A 3W2UA 2NX1A 3GDTA 3M5XA 3UXAA 3LXBA 4H3DA 3W7GA 4IJBA 2CLMA 1Q6LA 3W88A 2CLOA 5HUOA 3QF0A 4XQ6A 3JRKA 4IMDA 3MHUA 4BF9A 3W2MA 1H7PA 1MEIA 1O5KA 3T40A 3HF3A 2QCHA 4WX2A 3QPZA 7TIMA 3MJYA 3UWVA 3G3DA 3PAJA 4UCGA 4TIMA 1SZGA 4UTMA 1TPC1 5G2HA 3HOJA 3TR2A 3A5FA 1OFQA 2PRMA 5FI8A 5I3HA 3GXTA 3M16A 3KVMA 3W07A 5K2ZA 2Y89A 4RCXA 3S1UA 2GQAA 1SQ7A 3UY8A 4PC8A 3FLUA 1DJQA 1VQTA 2H8ZA 3UWYA 1SZNA 4DXVA 3C2VA 5AOUA 3G1FA 5HJLA 3KRSA 3NQMA 5IM51 2Q8ZA 1TQJA 3P60A 3H53A 3QH2A 3B03A 3G18A 4LS2A 2X1UA 4UMBA 5F2GA 3PBWA 1JR1A 1GVRA 1OF6A 4Z0SA 4JTSA 3NZ1A 1G4TA 1OJXA 3C2EA 4Z08A 3E0IA 6TIMA 2WKJA 1N7KA 4HSOA 5EL1A 3N14A 1L6SA 5HUPA 1HTIA 2A6NA 3QQ1A 1EUNA 3N9SA 4WY0A 1L6YA 1CW2A 5AB3A 3L67A 1WYIA 3TQVA 1I2QA 3T4CA 4CQ8A 2DJLA 3NZRA 1YPIA 2OMAA 1ONRA 3IIZA 3S5OA 4RXFA 3TKFA 3W71A 4ORIA 5E93A 3UWQA 5AHIA 2C15A 3GNNA 2NWSA 4IMEA 5K9XA 3E02A 1NAL1 4IX2A 2CWNA 2B0MA 2ALDA 1HO4A 4NQ1A 2C6QA 2LLEA 1VCVA 3W1LA 2J9YA 1SFLA 2EGZA 3RU6A 2PC4A 2BXVA 3G3MA 3PWAA 1KM2A 1GQNA 5F4XA 4QM1A 4HT3A 3IRDA 2C16A 1XC4A 2VC6A 1VPXA 3QQ0A 1ZALA 1O60A 1G4EA 3ABOA 3W7PA 4TO8A 4BI6A 2WOQA 1TPEA 3S8HA 4GRSA 2QJHA 4NXSA 1Z44A 3C3NA 3BW3A 4PTNA 1FDJA 3M1ZA 3DAQA 3FIGA 4H6KA 5DCEA 2NXHA 1YLVA 2I9EA 4LC6A 3HO8A 4LRTA 1U5JA 1UCWA 1KW1A 2G5WA 1M6JA 4MKNA 1SSDA 2EKCA 1O95A 4LVBA 3RLVA 1VYRA 3CQ0A 3PUEA 3SECA 4UIOA 3S1VA 1WBJA 3W7EA 3LLFA 1LDCA 2ZZ5A 3S5ZA 2VFDA 1C9DA 3FJ6A 3MP4A 4OQVA 3WK3A 3EKZA 1T0OA 3HGOA 2X2GA 2F84A 6ALDA 2JK2A 1MSSA 2O7QA 2J9XA 1W3IA 4Z1AA 5AYZA 2AGKA 5TBOA 1YDVA 2VXNA 4JXCA 4U4MA 1F05A 2H8XA 3S9YA 1YYAA 1QPOA 4IPIA 3EXRA 3BGGA 5D32A 5LNSA 2GVJA 3W1MA 1WQ5A 3LHWA 2YW3A 2NUYA 5EPDA 2QDHA 1QNVA 1JRBA 4O53A 3Q37A 3IGXA 4JDBA 1B4KA 3EWWA 3NR0A 1H51A 1K7EA 4UR7A 3W72A 4DPQA 4DEFA 2VFFA 3U8GA 2H3DA 4A21A 4LVGA 1PHQA 3WK0A 3EB2A 4AB4A 5LNVA 5FEWA 4LV9A 4AXKA 1NEYA 3P5ZA 2Y7DA 1K3UA 4G1KA 3W3OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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