5EH8A

Human carbonic anhydrase ii in complex with ligand
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Native State Mass Spectrometry, Surface Plasmon Resonance, and X-ray Crystallography Correlate Strongly as a Fragment Screening Combination.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5eh8A00
2VVAX 3IBNA 5JDVB 2FOQA 4ZX0A 1H4NA 4M2RA 5FL4A 1BNTA 1FSNA 1HEAA 3M40A 5DRSA 4HBAA 1YDBA 5FLTA 3T84A 1FQLA 4LU3A 2HKKA 2HOCA 5G01A 1EOUA 4M2UA 1ZFQA 4ZWYA 4Q9YA 1G54A 1BNNA 1HVAA 4Q7PA 4Q6DA 3SAXA 2QOAA 2CABA 3DV7A 5JGTB 4QTLA 4Q78A 5DSNA 4KNMA 2ZNCA 2NN7A 5DSJA 1CCUA 3MNUA 3M5TA 5JG5B 5DSKA 5JQTA 1J9WA 4Q87A 1XEVA 2NWOA 2NNVA 3M5SA 1FQRA 1RJ6A 3NI5A 1RZAA 1CNCA 4E3DA 2FNKA 2NXTA 4QEFA 1ZSCA 3V3FA 3RZ5A 1CAYA 3CZVA 1BNUA 3S78B 3DCCA 3TVOX 5AMGA 3C7PA 4QSJA 3DD0A 3OIMA 4FRCA 3KLDB 3M3XA 5E5RA 3P5AA 5EH8A 3VBDA 1CVAA 1G0FA 1G45A 3DA2A 2NXSA 1HECA 5FNJA 3M2YA 4PYYA 4ITOA 3DVDA 3DAZA 5FDIA 2AX2A 3IBUA 3OYQA 3R16A 4FL7A 4JS6A 5CLUA 2POWA 5SZ2A 5AMLA 1DCBA 2FMZA 3F7BA 5DOHA 3KKXA 1G48A 4KP8A 1CNWA 1BCDA 3W6HA 1I90A 3P44A 1LUGA 3U3AX 1H9NA 4E49A 3DVBA 1IF9A 4QJMA 3GZ0A 4L5VA 1JD0A 2OSFA 3L14A 1CNXA 1LG5A 3D93A 3JXFA 4JSZA 1CIMA 4ZWZA 3CA2A 3B4FA 5E2SA 2HFWA 3M04A 4KP5A 1FR7A 4WW6A 1ZSBA 8CA2A 3MHMA 3M2ZA 1CAJA 5EZTX 6CA2A 4QJXA 5FNKA 1Y7WA 1XPZA 2HNCA 3M67A 2WD2A 5BRVA 1RZEA 1IF5A 4QSIA 4YWPA 5SZ4A 4Y0JA 3HKNA 1UGCA 1TBTX 4Z0QA 4XZ5A 1I9QA 4YXOA 5FNGA 4RUXA 1TEQX 4Q99A 3MNKA 1RAZA 3T5UA 1KWQA 1FSQA 4CNVA 4CQ0A 5E28A 3HLJA 4MDLA 1Z93A 3K2FA 4UOVA 1FR4A 4BF6A 3V2MA 1BNQA 1ZGFA 3HS4A 3EFIA 1G6VA 5JEHB 4LP6A 4RIVA 2NNSA 3D8WA 3M1KA 2VVBX 5DOGA 1AZMA 4CA2A 4Z1NA 1BV3A 4YX4A 2FW4A 5G0BA 3DBUA 5DSLA 4QK1A 4XFWA 4QJOA 4YXUA 1JCZA 5EH7A 4QSBA 4R59A 1G0EA 5FLPA 4Q7SA 3T5ZA 5JQ0A 2FNNA 5EHWA 4QY3A 2HD6A 1OKNA 2NMXA 2X7SA 3V3GB 1T9NA 3KONA 4RIUA 3IEOA 3OIKA 1IF8A 4Q81A 4QJ0A 3FE4A 2WEGA 3S75B 1ZE8A 3N0NA 5A25A 2Q1QA 3CAJA 3MNHA 1CAOA 5A6HA 1CVCA 2X7TA 1CANA 4N16A 3S77B 5G03A 2FOUA 3W6IA 5DSIA 5FLRA 3IAIA 1I9LA 1BN4A 4Z1KA 1RAYA 1RZDA 3CYUA 4Z1EA 5DSOA 5EKMA 3IGPA 1OKLA 5FNIA 3IBIA 4MTYA 1ZSAA 4WR7A 3V2JA 3M98A 3UYNA 1FQMA 4RUZA 3MHOA 1Z9YA 3OILA 3JXGA 3UYQA 1ZFKA 1ZH9A 3F7UA 5E2NA 3S74B 4MO8A 2NN1A 4KNJA 3P5LA 3DD8A 3DCWA 1CALA 4X5SA 3T82A 4KNIA 1HCBA 5FL5A 4M2VA 5FLOA 1CRMA 4Q83A 3S72B 2CA2A 3M2XA 4Q90A 3U45X 2CBAA 5SZ6A 3MNJA 4YYTA 4XIXA 4ZAOA 3RZ0B 4TWLA 1CVBA 3MHLA 4COQA 3V3JA 3QYKA 3F8EA 1CNHA 4C3TA 2FOYA 2EZ7A 4QIZA 2W2JA 1YDAA 4FU5A 3P58A 1CA3A 3HKTA 5G0CA 4HEZA 1ZGEA 1TTMA 2FOSA 3OKUA 1FQNA 1I9NA 5BNLA 4K0SA 5SZ7A 3TVNX 3S9TA 3LXEA 1G46A 1UGFA 4Q6EA 5DSRA 1RZCA 1V9IC 3M96A 3FW3A 2NXRA 1YO1A 1I8ZA 4KUYA 4JSAA 4KV0A 5HPJA 3P55A 4E3HA 4FIKA 3V5GA 4MLXA 4MLTA 4K13A 3M1QA 3V7XA 1FSRA 4MDMA 3S97A 4CNWA 3S76A 5E2KA 2EU3A 2EU2A 1IF4A 1G1DA 3D9ZA 1THKA 3M5EA 4KNNA 1YDDA 4YGFA 1YO0A 2ABEA 3MNIA 4IWZA 1I91A 3TMJA 1CINA 4Q49A 1JV0A 5FNLA 1CNGA 1CA2A 4Q7WA 3OKVA 4PQ7A 3P3HA 4QSAA 3T83A 1F2WA 1CCTA 3DC3A 5FLQA 1CVEA 1CNKA 4JSSA 4KUVA 4QIYA 5CACA 3FFPX 1AVNA 4YGLA 1IF7A 4BCWA 2WEJA 3HFPA 4QK3A 3M1JA 3KWAA 5LMDA 4XE1A 1LG6A 5EIJA 1CAIA 1HUGA 3RG4A 4YXIA 1TEUX 1TG9A 4K0TA 3Q31A 2FNMA 3ML2A 2QO8A 4WW8A 1OKMA 3S73B 4CACA 4ZWIA 1DMXA 4FVOA 4QJWA 1UGGA 2POUA 1V9EA 4E4AA 4Q09A 4Q8ZA 3NB5A 1G53A 5JEPB 2WD3A 1BICA 1ZNCA 3KIGA 4HEWA 4L5UA 4BF1A 4Z1JA 4N0XB 1HEDA 3U47A 5EOIA 4CNXA 4K1QA 1BN1A 3RJ7A 1KEQA 5JESB 1UGEA 3M1WA 7CA2A 3S8XA 1BZMA 4JSWA 4DZ7A 1MOOA 3ML5A 4Q0LA 4WUPA 1CAHA 1G3ZA 4ZWXA 4QJPA 5EKHA 2X7UA 1TE3X 4G7AA 4HT0A 3RYXB 4E3FA 1H9QA 1KOQA 4Q7VA 5DSPA 3KOIA 3MMFA 5FNMA 1I9MA 2POVA 4FPTA 4E5QA 3PJJA 5DSQA 4ITPA 3SBHA 3D92A 4M2WA 3RYZA 4XIWA 1DCAA 3OY0A 2H15A 3B1BA 3BETA 3ZNCA 3F4XA 2H4NA 5BRUA 3V3IB 3KS3A 1CVHA 1XQ0A 1HUHA 1G52A 1I9OA 3HKUA 3JXHC 4MDGA 2O4ZA 5EHEA 3M14A 4RH2A 3MYQA 5E2MA 4HU1A 3RYYA 2F14A 5DSMA 5BYIA 1Z97A 2WEHA 4HT2A 3DVCA 2NNGA 1BN3A 3K34A 4RFDA 1CAMA 1KOPA 3PYKA 1RJ5A 4G0CA 3MHIA 2CBDA 12CAA 1AM6A 1DMYA 4RFCA 4YGJA 4CNRA 5JG3B 5J8ZA 3RYVB 4YGKA 4Q07A 4PXXA 1YO2A 5SZ5A 3BL1A 3NJ9A 2Q1BA 3D0NA 1LZVA 4ETQC 5CA2A 3V3HB 1CRAA 1CNYA 4RN4A 2NNOA 2FMGA 1KWRA 4Q8XA 3N3JA 3RLDA 3R17B 5SZ3A 3P3JA 1IF6A 3DC9A 1UGBA 4FVNA 1CVDA 5CJFA 2CBCA 2CBEA 3MHCA 1CNBA 1CVFA 3BL0A 4KUWA 1A42A 9CA2A 5FDCA 5EKJA 1TB0X 5C8IA 4Q8YA 3N2PA 4E9OX 2NWZA 4RUYA 3ZP9A 1LGDA 3SBIA 4QK2A 1CCSA 2CBBA 3HKQA 2QP6A 4L5WA 3RYJB 2HL4A 3KNEA 3MZCA 4WL4A 4PZHA 4E3GA 2GEHA 4GL1X 1G4OA 5FL6A 5FNHA 3T85A 2OSMA 3MWOA 2FOVA 1UGDA 2NWYA 4HF3A 1RZBA 3RZ8A 4TWMA 1OQ5A 1I9PA 3N4BA 3OYSA 1TG3A 1HEBA 3MDZA 3PO6A 4KAPA 1TH9A 2ILIA 4K0ZA 4IDRX 2NWPA 5SZ0A 3RZ1B 1YDCA 5EHVA 5IPZA 4Q06A 4DZ9A 5E2RA 1UGAA 4PYXA 4YGNA 3K7KA 1CILA 1BNWA 1URTA 4LHIA 4R5BA 3U7CA 2AW1A 1BNMA 1CAKA 5DVXA 5AMDA 3RZ7A 3M2NA 3KOKA 1CAZA 1CZMA 3RG3A 1HCAA 2Q38A 3IBLA 4R5AA 2WEOA 4ILXA 5L6KA 4Q08A 5SZ1A 4WUQA 3EFTA 5EH5A 3DCSA 1FLJA 5E5UA 1CNIA 2GD8A 3P4VA 1MUAA 4ZX1A 3S71B 5L3OA 1CNJA 1XEGA 5JGSB 3SAPA 3MNAA 4HEYA 4YHAA 4YVYA 5BRWA 5JEGB 1BNVA 1G4JA 3RGEA 5FLSA 2IT4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VVA X;  3IBN A;  5JDV B;  2FOQ A;  4ZX0 A;  1H4N A;  4M2R A;  5FL4 A;  1BNT A;  1FSN A;  1HEA A;  3M40 A;  5DRS A;  4HBA A;  1YDB A;  5FLT A;  3T84 A;  1FQL A;  4LU3 A;  2HKK A;  2HOC A;  5G01 A;  1EOU A;  4M2U A;  1ZFQ A;  4ZWY A;  4Q9Y A;  1G54 A;  1BNN A;  1HVA A;  4Q7P A;  4Q6D A;  3SAX A;  2QOA A;  2CAB A;  3DV7 A;  5JGT B;  4QTL A;  4Q78 A;  5DSN A;  4KNM A;  2ZNC A;  2NN7 A;  5DSJ A;  1CCU A;  3MNU A;  3M5T A;  5JG5 B;  5DSK A;  5JQT A;  1J9W A;  4Q87 A;  1XEV A;  2NWO A;  2NNV A;  3M5S A;  1FQR A;  1RJ6 A;  3NI5 A;  1RZA A;  1CNC A;  4E3D A;  2FNK A;  2NXT A;  4QEF A;  1ZSC A;  3V3F A;  3RZ5 A;  1CAY A;  3CZV A;  1BNU A;  3S78 B;  3DCC A;  3TVO X;  5AMG A;  3C7P A;  4QSJ A;  3DD0 A;  3OIM A;  4FRC A;  3KLD B;  3M3X A;  5E5R A;  3P5A A;  5EH8 A;  3VBD A;  1CVA A;  1G0F A;  1G45 A;  3DA2 A;  2NXS A;  1HEC A;  5FNJ A;  3M2Y A;  4PYY A;  4ITO A;  3DVD A;  3DAZ A;  5FDI A;  2AX2 A;  3IBU A;  3OYQ A;  3R16 A;  4FL7 A;  4JS6 A;  5CLU A;  2POW A;  5SZ2 A;  5AML A;  1DCB A;  2FMZ A;  3F7B A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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