The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
48
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sequence length |
238
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structure length |
235
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Chain Sequence |
SSGLVPRGSHMTEGTIKTSKYEIIAIFREELRKRTEIEIFFNNTSIITQLTRVDFAEFHIQTHRKIPSGHKIRFLLHSDSGKIEFNAALTKHDNDKGIRYAFSLPECLQVVQRRRDPRFRLRHEHDFYCRGRHKNGENYLFDIKDISDGGCALMTKTPNLKFLSHNALLKNAVLMLAEYGEITIDLVVKNVIVITLDNANEESESYYQISCQFKFRHLDDQRRIEKILLDLILEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Dna binding protein
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| molecule keywords |
Klebsiella pneumoniae genome assembly NOVST
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| publication title |
The PilZ domain of MrkH represents a novel DNA binding motif
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Klebsiella pneumoniae
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| total genus |
48
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| structure length |
235
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| sequence length |
238
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-02 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | predicted glycosyltransferase like domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YLN A; 3KYF A; 4XRN A; 5EJ1 A; 4RT0 A; 5EIY A; 4RT1 A; 5EJL A; 5KGO A; 4FOU C; 1YWU A; 5EJZ A; 4P02 A; 2RDE A; 5KEC A; 4P00 A; 3CNR A; 2GJG A; 2L74 A; 3KYG A; 4F48 B; 5KED A; 4I86 A; 4HG6 A; 3DSG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2IPQ X; 1UVU H; 1W2K H; 2FIR H; 3BN9 A; 4LZ1 H; 1GI0 A; 1QRZ A; 3MO9 A; 4F55 A; 3A7V A; 1HLT H; 3W1E A; 3KF2 A; 4ISO A; 1W0J D; 3ZZB A; 4I33 A; 3U69 H; 1LHC H; 1TGC A; 1IQH A; 2SGD E; 3UNR A; 4X2Y A; 1UVO A; 1QJ1 B; 2J5U A; 1KDQ B; 4I31 A; 1BMM H; 1NC6 A; 3GYL B; 2V35 A; 4AFZ A; 2BVR H; 1GCT C; 1COW D; 3G01 A; 4X8T H; 1AZ8 A; 1O3D A; 1ELF A; 2GV7 A; 1G3C A; 1GHB G; 3RC5 A; 4NSV A; 2PSX A; 2AFQ B; 4NCY A; 1MKW K; 4ABB A; 3LPR A; 4MTB A; 2TGP Z; 4X1Q U; 1NES E; 1YY3 A; 1O31 A; 1QBV H; 1AO5 A; 1DSU A; 5DJ7 A; 2ZO3 H; 5FX6 A; 1DM4 B; 4YTA A; 2ALV A; 2V3M A; 1OS8 A; 2ZEB A; 4OS4 A; 4UE7 H; 5C5O A; 2F83 A; 1CGJ E; 2D26 C; 1H8D H; 1QA7 A; 1QB6 A; 4K5Z A; 5EPY A; 1TPA E; 3UQO A; 4RKO B; 3S9A A; 1OKX A; 2IOT A; 1C2E A; 1UTM A; 3IWM A; 1NO9 H; 1ZGV A; 3V12 A; 4DOQ A; 1SHY A; 4FOU C; 4H6S B; 3SI4 H; 3S69 A; 1IQL A; 3P95 A; 4KGA A; 4NSY A; 2XC4 A; 4DY7 B; 1GGD B; 3H5C B; 2KCA A; 3TGJ E; 1GJ4 H; 2VGC C; 1NFU A; 3PRO A; 3ZZ5 A; 1SQT A; 3Q3K A; 1EAX A; 2FYR A; 1YP9 A; 3HK3 B; 4YZU A; 4X6O A; 4O3T A; 1CGH A; 4ABD A; 1S6F A; 1SG8 B; 3TJN A; 2VIN A; 5FPS A; 4O97 A; 2CN0 H; 4ABI A; 2EI7 A; 3ZYD A; 4KEL A; 1K0H A; 4RKJ B; 1O3G A; 2XTT B; 4IC6 A; 2K0Q A; 2PKA B; 4TSF D; 2OC7 A; 3LC3 A; 1C1R A; 1F5L A; 1THP B; 2BDG A; 1ZYO A; 2WPD D; 1QJ6 B; 3ZV8 A; 1NBM E; 3JZ2 B; 4MNW A; 1SGP E; 2P8O B; 2RG3 A; 1YPE H; 1Y3V A; 4CBN A; 5ETX A; 1GJA B; 2STA E; 2WPK S; 3LGI A; 2ZU3 A; 2P3F H; 1XUK A; 1TAL A; 2QCY A; 3EDX B; 1YGC H; 5A0C A; 4B6E A; 1OHH D; 4MNV A; 3SU0 A; 1WYK A; 3E0N B; 1AU8 A; 1W0K D; 2QE7 D; 2BD7 A; 1V2K T; 1TAW A; 1D9I A; 3SQE E; 3UWJ H; 1QB9 A; 3OFN D; 5A8X A; 3T29 A; 4MPV A; 1O30 A; 3P8N A; 1EZQ A; 4GHT A; 3SNA A; 1ZPB A; 1HRT H; 2FOD A; 2ODQ A; 1Y8T A; 3S7H B; 5IYT A; 1RRK A; 6LPR A; 3ODF A; 3P92 A; 1C2G A; 1O2J A; 3R0F A; 4ISN A; 3D65 E; 1OWJ A; 3VEQ B; 1TBR H; 2KAI B; 2ANW A; 3MTY A; 4X1N U; 1MD8 A; 1T8L A; 1TA2 A; 2C8Y B; 1GBI A; 3NCL A; 1HIA B; 3MMG A; 5AF9 H; 5C1X A; 1HAP H; 3MOC A; 1T8O A; 2TGD A; 2Z94 A; 3RXG A; 1V2R T; 1BBR H; 1DUA A; 2KCY A; 2FOC A; 3RXS A; 3DFL A; 1TRY A; 3VFE A; 1GI4 A; 6CHA C; 1O2H A; 2AMQ A; 4FU9 A; 3UNS A; 2WV5 A; 3N7D A; 2GP9 B; 4YO9 A; 5BPE A; 3MNS A; 4ZRO A; 5LGO A; 1F0T A; 2QYI A; 3FP7 E; 1JOU B; 3ZVF A; 1C1W H; 1NM6 A; 1QCP A; 3SNC A; 2ZGC A; 4OS6 A; 3DSO A; 1A1R A; 3GCT F; 2Y5H A; 3RXH A; 1C5O H; 1EX3 A; 3SUF A; 1GBM A; 2JDI D; 3P17 H; 1EP6 A; 4SGB E; 1BML A; 2ZEC A; 4TWW A; 4DT7 B; 1BZX E; 2C3S A; 2EA3 A; 2UUY A; 3RXU A; 3SBK A; 2QC2 A; 4WWY A; 3N7O A; 2BD3 A; 1GBA A; 1W14 U; 4JYV H; 3RM2 H; 5T6F A; 4I8L A; 1CA8 B; 4DGJ A; 1QL8 A; 4ZKO U; 2PW8 H; 4FUC A; 5HIY A; 1V2Q T; 5HMA A; 4NA7 A; 1O0D H; 1DST A; 1SPJ A; 1V2T T; 1GVK B; 3MH7 A; 2A2Q H; 4OS1 A; 1O2T A; 4X0W U; 2UUK B; 2FI5 E; 4X8S H; 1GI2 A; 5A09 A; 1DLK B; 1ZSJ A; 1Z6E A; 5C1Y A; 3SV9 A; 4WF8 A; 2F43 B; 3ZZC A; 4AYY B; 3GIS B; 4YM9 A; 3UPE A; 1SSX A; 3BEF B; 3E16 B; 1L1N A; 1P03 A; 1SGF G; 3FOA A; 2BX4 A; 4GCH G; 3ZZ4 A; 1HXF H; 1GI5 A; 2FI3 E; 1UTP A; 4X6N A; 3LGU A; 1BBR K; 4YOI A; 1EQ9 A; 2FZZ A; 3NZI A; 1CT4 E; 5FPY A; 2FX4 A; 2STB E; 3ZVB A; 2GZ9 A; 1OOK B; 1P2M A; 3PB1 E; 2L74 A; 2O8L A; 1FAK H; 2FOM B; 1EPT C; 3U8O H; 1W0Z U; 4IMQ A; 4XBC A; 4ACA A; 2D8W A; 5DP7 A; 5EW1 H; 3A7X A; 1EPT A; 4M9F A; 1LHF H; 4CHA C; 1BJV A; 5T6D A; 1ZZZ A; 2FOH A; 3RU4 E; 3SV6 A; 4XBD A; 3RXA A; 1ZMN A; 3E3T A; 1IQM A; 1YLD A; 4ABF A; 3CP7 A; 2D1J A; 1MU8 B; 1T8M A; 2A1D B; 3SJK A; 1C2I A; 1VCQ A; 1O33 A; 4J2Y B; 4CRB A; 3A89 A; 1KLJ H; 4WXV A; 1ZSL A; 4NZL A; 1DFP A; 3QX5 H; 2R2W U; 4JK6 A; 3TH4 H; 1GHW H; 1ABJ H; 2IPH A; 1TQ0 B; 3VG8 A; 2BZ6 H; 2AIP A; 3N99 A; 3DSP A; 3BIU H; 4I8K A; 1NPM A; 2O8M A; 2XXL A; 3M61 U; 3A7Y A; 4E7R G; 5JB9 S; 2PP6 A; 3RXV A; 3MWI U; 2BQ7 B; 1VIT G; 4ZHL U; 3TH3 H; 1GHA G; 5DPA A; 3IG6 B; 1AVX A; 5DGJ A; 1ZML A; 1MCV A; 1Q31 A; 5K7R A; 2Z3C A; 2H9T H; 2BHG A; 1LPZ B; 2YMS D; 2CGA A; 5G4B A; 3M3V A; 3A7W A; 1BMA A; 2GD4 B; 1Q3X A; 3RXI A; 5EJ1 A; 3M3S A; 5FCR A; 1F2S E; 2M2A A; 3H7T A; 2F3C E; 1ZHP A; 5JB8 S; 1HAY B; 2ZDV H; 3ATL A; 4OS5 A; 4GSO A; 1NRS H; 3PWB A; 1BRC E; 1A5G H; 1VZQ H; 4A7I B; 1G3D A; 2ZU5 A; 3ZZ7 A; 2Y5G A; 3S0N A; 1GJC B; 1SMF E; 1IQE A; 1DE7 H; 1GG6 B; 5ESB A; 2GCT C; 4UFD H; 2HVX A; 1BTH H; 4EST E; 1GBE A; 4R0I A; 1H9H E; 1MH0 A; 3C1K A; 1GJ8 B; 1EAU A; 2FOE A; 1OPH B; 3C27 B; 2FMJ A; 3P8F A; 3NXP A; 3ZVD A; 2KCP A; 2ZDK A; 1PQ5 A; 1XKB C; 1K1L A; 4MPX A; 4BAH B; 9LPR A; 1O2M A; 2ZGB H; 3GY6 A; 4KTU A; 4Y11 E; 2GKV E; 2ZI2 H; 1LHD H; 2ZPR A; 2TPI Z; 2OD3 B; 2FLR H; 1QR3 E; 1Z1I A; 1A61 H; 4ZAE A; 3GY8 A; 3EA8 A; 3VGC C; 1IQN A; 5HKK D; 1D4P B; 1VGC C; 1K28 D; 1FJS A; 2CF8 H; 2JKH A; 1W7X H; 2A31 A; 1W0Y H; 3OEE D; 5EQR A; 3A85 A; 3AAU A; 1P2J A; 4CRF A; 1HAO H; 2NU3 E; 3LH3 A; 1GI7 B; 5E2P A; 4O3U A; 1BT7 A; 2IJO B; 3VB7 A; 1H8H D; 1LPG B; 2RA3 A; 2W7S A; 3UR9 A; 2PUQ H; 3KEE A; 3F0P A; 3WWB A; 1A3B H; 2EC9 H; 4B75 A; 5FL7 D; 3D49 H; 1VJ9 U; 1QIX B; 1P09 A; 1KMH B; 1C1U H; 3BG4 C; 2LPR A; 1UCY H; 2OC1 A; 1GMD G; 1WDI A; 5C5N A; 1ZLR A; 1F92 A; 1LCY A; 1AMH A; 3MNC A; 3SGA E; 4CRA A; 4B76 A; 4B1T A; 1OYQ A; 2VWN A; 3KN2 A; 1DDJ A; 3FAN A; 2VH0 A; 1TNH A; 3PMJ A; 1CBW B; 1P2Q A; 1DIT H; 1TE0 A; 5TJX A; 1M9U A; 4D76 A; 3TU7 H; 4LXB H; 1OWH A; 1O32 A; 3LH1 A; 3V13 A; 1C5V A; 2GDD A; 4AX9 H; 1MAX A; 4A1T A; 1WTG H; 2ZQ2 A; 2XCF A; 2PSY A; 5DP3 A; 4Y8Y A; 1IQK A; 1RTL A; 1HAX B; 3JZ1 B; 4Y6D A; 1J17 T; 3FFG A; 1QL7 A; 1TNL A; 1UTL M; 1C5Q A; 1ZOM A; 2Z6B D; 1AKS B; 1TB6 H; 2FOG A; 2JH6 D; 3GCO A; 4Q4L A; 1HNE E; 1CHO G; 1C2D A; 2PFE A; 4B6F A; 1DVA H; 3OU0 A; 3PMH B; 4IN2 A; 3Q76 A; 5EU8 A; 3AAS A; 4NA9 H; 3T26 A; 2TGT A; 1NY2 2; 1MBQ A; 1YCP M; 1TAB E; 5FPT A; 2EI6 A; 1GVL A; 4XFQ A; 3ZZ3 A; 3EQ0 H; 1A7S A; 1O5G H; 3P8G A; 4ISH H; 4ZHA A; 1HJ9 A; 4JZE H; 2P94 A; 2ZHQ H; 1UCY K; 3T2N A; 1O3L A; 4H42 U; 1ELE E; 4PRO A; 3SZN A; 3U1I B; 1K1P A; 4AYV B; 1SLW B; 3URE A; 1C5Y B; 2QXI A; 2H9H A; 1P2I A; 2QXH A; 4IC5 A; 1N1L A; 4FU7 A; 2CJI A; 2BLW A; 1BQY A; 2BY8 X; 2CHA C; 1GL0 E; 1Z8I B; 5EJL A; 2YMS B; 4IN1 A; 3EE0 B; 5JDU B; 3DA9 B; 5CHA C; 1D3D B; 1DS2 E; 2JET C; 2VIP A; 3LGW A; 3TGI E; 1GMC F; 1B0F A; 2F9P A; 4ISL A; 1GBL A; 2ZNK H; 4UFE H; 1AFE H; 1EAT A; 3EGK H; 1GJ7 B; 2BM2 A; 1W10 U; 5JBB S; 1T4V H; 1V2M T; 3KYF A; 3PV2 A; 1CA0 C; 1HAH H; 2Z3D A; 4YLQ H; 1G36 A; 3GYM A; 5CHB A; 3BTD E; 1P04 A; 2JIZ D; 4B71 A; 5L2Y H; 1DX5 M; 1C2M A; 2OIN A; 5A0A E; 1TMB H; 3B8J A; 3AAV A; 2C8X B; 3SI3 H; 1EP5 A; 2ZCH P; 4WH6 A; 1EJA A; 4BTT B; 2ZG0 H; 4VGC C; 2BDB A; 1VIT F; 3T25 A; 3K9X B; 4OGY A; 3A8C A; 5CDF E; 1HAI H; 2RFK C; 1OP0 A; 3IIT A; 2ZWL H; 3RXP A; 1WOF A; 3OTP A; 1JWT A; 2GV6 A; 1MU6 B; 1WSS H; 3ATM A; 1QFK H; 1BB0 B; 1TA6 A; 4O9V A; 2ZF0 H; 1LKB A; 5F6M A; 3PMA B; 1FPH H; 2WSS D; 1H8I H; 1AIX H; 3TK5 A; 4Y10 E; 3L3T A; 4FVB A; 1WV7 H; 5C67 A; 3SUD A; 4WME A; 1N8O B; 1O38 A; 1C9T A; 2UUF B; 1BRU P; 3QZR A; 3GS9 A; 1O5D H; 4WY3 A; 2P93 A; 1P0S H; 1DWC H; 1YKT A; 1DWE H; 5DP9 A; 1BBR E; 5DN6 D; 3S7K B; 1Y5U T; 1NZQ H; 1P12 E; 3K65 B; 1FPC H; 2ALP A; 1X7A C; 3KL6 A; 3RXJ A; 1NN6 A; 2Q1J A; 2WHX A; 1GDU A; 1SQO A; 4NFF A; 5C0T A; 5EPN A; 1XUF A; 2OQU A; 2XWB I; 2PTC E; 1O5A B; 1PPE E; 1Z8G A; 1ARC A; 3GCH C; 2UWP A; 1H8E D; 3VB4 A; 1VR1 H; 1AN1 E; 1KLI H; 1E34 B; 1SVP A; 5EGM A; 2QF4 A; 4AGK A; 4BTI B; 4YT6 H; 5GJ4 B; 1NT1 A; 2H5C A; 2Z9I A; 2AGI X; 1NRN H; 3TH2 H; 1RTF B; 1WBG B; 5AFZ H; 1ELG A; 1B5G H; 1G37 A; 3SJ9 A; 2PGQ B; 2OUA A; 1OWI A; 3RMM H; 4CRC A; 1YPH C; 2FOB A; 1AB9 B; 2NU2 E; 1G2M A; 4TY6 A; 1YCP H; 3FP6 E; 2AS9 A; 4Z1M D; 1GMD F; 3MU0 A; 3O8R A; 1LVY A; 4A6L A; 3EAJ A; 4CR9 A; 2ZDN A; 5BRR E; 2R2M B; 2A4O A; 1XXF A; 3STJ A; 3M3T A; 4NIX A; 1XUH A; 3A80 A; 3WWF A; 4NIY A; 3SND A; 4BAM B; 1MTN C; 2A5A A; 4RT1 A; 3GDV A; 5HIZ A; 1IQG A; 1O3B A; 2GMT C; 4CBO A; 1WQS A; 1SQA A; 2K8I A; 4SGA E; 4Y8Z A; 3HPT B; 1FIZ A; 3RXL A; 4ZXY H; 1E36 B; 2R3Y A; 2ZZU H; 1T31 A; 4DW2 U; 5DP8 A; 1TGB A; 5A8Z A; 3SNE A; 3M5L A; 3MNX A; 1LQD B; 1PYT C; 1QY6 A; 2FTM A; 3RXT A; 2XND D; 1HJA B; 2O9Q A; 1CO7 E; 4HGC A; 3OSY A; 3A7Z A; 3LGV A; 2P95 A; 1TLD A; 3SUE A; 2WUC A; 5I46 H; 2ZA5 A; 5F53 A; 3MFJ A; 2J94 A; 5JBC S; 3GOV B; 1CVW H; 5JYI A; 1Q2W A; 1NRP H; 4ABG A; 1DXW A; 5HYO A; 2PTN A; 1BTU A; 1PPB H; 3ATW A; 1TON A; 4AZ2 B; 3BTW E; 3SHA H; 3SNB A; 3KYG A; 2OC0 A; 1CHO F; 4Q63 A; 1V2O T; 3LJO A; 3RMO H; 3EST A; 1E79 D; 3M7U A; 1PPG E; 3UOP A; 5EXN A; 1PFX C; 1AFQ B; 5F8X A; 2V6N A; 1TMU H; 3OY6 U; 1B0E A; 1IHS H; 1A5I A; 4WH8 A; 1JRS A; 3A7T A; 1BHX B; 4ZKS U; 4ABE A; 3ZV9 A; 3F9E A; 2IJD 1; 3FVF B; 2VU8 E; 1TRM A; 3LU9 B; 1GMH F; 1ELD E; 1LMW B; 3SZE A; 1YCP K; 4NWL A; 3PM3 A; 1JXP A; 1O2Y A; 2BVS H; 2QV1 A; 1KYN A; 3ZIA D; 8KME 2; 1UJ1 A; 4ABJ A; 2GT8 A; 1O5E H; 7EST E; 2ZDM A; 2ZGJ A; 1YPH E; 1QGF A; 2W7U A; 4ZUH A; 2V0B A; 4K69 A; 1V3X A; 1MTV A; 5E8E H; 1BMF D; 3OAA D; 1U6Q A; 2A7H A; 3UR6 A; 3A86 A; 3BTM E; 4Y76 A; 4I32 A; 1BHX F; 1MTU A; 2ZKS A; 4AB9 A; 4Z6A H; 1FV9 A; 3RLW H; 1SR5 C; 1DWB H; 1C2J A; 1E35 B; 1F7Z A; 1YYY 1; 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